贝叶斯推论及其在百合目分子系统学中的应用

贝叶斯推论作为进化生物学的最新进展,在适用复杂模型、大型数据集、计算速度和结果容易解释等方面明显优于其它算法。本文简要介绍了贝叶斯推论原理及其在分子进化和系统发育研究中的重要性,并使用该方法对百合目主要类群的系统发育关系进行了重建。结果显示,百合目rbcL基因最适合的DNA进化模型为GTR+I+G,贝叶斯法与距离法和最大简约法构建的系统发育树拓扑结构相似,没有显著差异,但是分辨率和支持率明显比后者高。贝叶斯分析结果显示,百合目内划分的7个科,除Smilacaceae科外,其余各科均为高后验概率(PP=1·0)支持的单系类群;文中作者还对各科间的系统关系进行了探讨。

改性Pd/C催化对叔丁基α-甲基肉桂醛加氢制备铃兰醛

采用5%(质量分数,下同)Pd/C催化对叔丁基α-甲基肉桂醛(PTBMC)选择加氢制备铃兰醛,结果表明,K2CO3改性催化剂能加快反应速率,且铃兰醛的选择性显著提高。以K2CO3改性5%Pd/C为催化剂,甲醇为溶剂,底物初始浓度0.375 mol/L,在40℃,0.5 MPa的优化条件下反应80 min,PTBMC的转化率为100%,铃兰醛的选择性达98.5%。

百合目叶绿体rbcL基因核苷酸替代速率检测

分析了百合目主要类群叶绿体中编码核酮糖1,5二磷酸羧化氧化酶大亚基rbcL基因的42条序列,使用RRTree相对速率检测方法,详细研究rbcL基因在百合目7科间同义替代速率和非同义替代速率的变化.相对速率检测显示:百合目内秋水仙科(Colchicaceae)的同义替代速率和非同义替代速率均最快,金梅草科(Campynemat-aceae)同义替代速率最慢,百合科(Liliaceae)的非同义替代速率最慢,但在百合目各科间,无论同义替代速率还是非同义替代速率差异均不显著.

释百合科(广义)分类的沿革及对我国今后研究的展望

本文试图阐明近60年来一些作者对广义百合科所作的重大变革。广义百合科分类的变革不能不涉及其近缘科的分类,因此我们以Engler＆Prantl(1930)的Liliiflorae目中的族作为基本单位,列表以明Hutchinson(1934)、Dahlgren et al.(1985,包括G.Dahlgren,1989)、Takhtajan(1987)和Thorne(1992)各系统所作不同的处理。作者对Hutchinson的观点和其采用的分类特征作了较详细的介绍,因为他可能是对广义百合科作重大变革的第一个作者,而对Dahlgen et al.、Takhtajan和Thorne系统的介绍则较为简略。本文还讨论了科级范围大小的利弊,不同意有些作者仅仅将亚科或卫星类群都提升为科的作法。假如这种提升之后仍如原先的科保留于同一类群之中,而不作系统上的改变,则意义不大。本文对Hutchinson、Takhtajan和Dahlgren et al.(1985)的单子叶植物起源的假说也作了介绍。虽然Dahlgren et al.的见解未被大多数作者所接受,但他们的方法论值得注意。基于单子叶植物和双子叶植物的共性,他们假设出一个臆想的分类群,从这个臆想的分类群演进到一个单子叶植物祖先只需经过最少的步段。这样的一个单子叶植物祖先现在是不存在的,但最接近它的是现存的Trichopus(隶Trichopo-daceae,Dioscordales)。Trichopus肯定不是单子叶植物和双子叶?

日用香料铃兰醛的合成方法

综述了香料铃兰醛的合成方法 ,并提出了适合工业化生产合成路线。

药用植物华重楼(黑药花科)叶绿体全基因组研究（英文）

为探究华重楼(Paris polyphylla var.chinensis)的叶绿体基因组特征,利用叶绿体系统发育基因组学方法,对华重楼与其它百合目植物的叶绿体全基因组进行了比较。结果表明,华重楼的叶绿体全基因组长158307 bp,由4个区组成,包括2个反向重复区(IRA和IRB,27473 bp)、1个小单拷贝区(SSC,18175 bp)和1个大单拷贝区(LSC,85187 bp)。其叶绿体基因组有115个基因,包括81个编码蛋白质基因、30个转运RNA基因和4个核糖体RNA基因。11种百合目植物的叶绿体全基因组的基因组成和基因顺序相似。华重楼的cem A基因是假基因,其起始密码子后有多聚核苷酸poly(A)及CA双核苷酸重复序列,编码序列中出现多个终止密码子,且与北重楼(Paris verticillata)的cemA编码序列中的终止密码子位置不同。因此,华重楼叶绿体基因组比较保守;cemA结构及假基因化现象可能具有重要的进化与系统发育信息,其编码序列中的终止密码子可以区分华重楼和北重楼。

应用SuperTRI方法重建百合目的系统发育关系

SuperTRI是Ropiquet等(2009)发表的一种新的超树方法,可以通过合并所有系统发育信息来共同组建大的系统发育树。该方法克服了超矩阵法和传统超树法的一些限制,使提出的系统发育假说可信度更高,更具有统计说服力。本文应用SupperTRI方法重建了百合目(Liliales)主要类群的系统发育关系,并与超矩阵法的分析结果进行了比较。结果显示:(1)SuperTRI方法产生了与超矩阵法相似的拓扑结构,但节点支持率相对较低,其中再现性指数对评判分支的可信性更容易理解,在系统树图示方法上也更直观;(2)SuperTRI系统树证实百合科、菝葜科、垂花科和菝葜藤科为一单系分支;黑药花科为一独立分支;秋水仙科、六出花科、刺藤科为一单系分支,但这3个大分支间的关系未明;支持白玉簪科和金梅草科互为姐妹群,是百合目最基部类群。

合成香料铃兰醛的研制

铃兰醛是以甲苯为原料，由烃化、氧化、缩合和选择加氢等反应合成，收率达９６％。