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表皮葡萄球菌SarA对atlE、lipA和zinC基因表达调控的研究 被引量:3
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作者 王海蛟 范长胜 +4 位作者 辛及娣 陶菊红 苑兴卉 高山峨 梁国新 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第2期180-186,共7页
表皮葡萄球菌(Staphylococcusepidermids)是一种条件致病菌,SarA(StaphylococcalaccessoryregulatorA)是该菌中一个全局性调控因子,它控制着细胞中许多与毒性相关的基因表达.报道了SarA在转录水平直接调控atlE、lipA和zinC基因的表达.RT... 表皮葡萄球菌(Staphylococcusepidermids)是一种条件致病菌,SarA(StaphylococcalaccessoryregulatorA)是该菌中一个全局性调控因子,它控制着细胞中许多与毒性相关的基因表达.报道了SarA在转录水平直接调控atlE、lipA和zinC基因的表达.RT-PCR和lacZ报告基因的分析结果显示,在表皮葡萄球菌ATCC35984中,SarA对atlE(自溶酶基因)表达起负调控作用,而对lipA(脂肪酶基因)和zinC(膜相关锌金属蛋白酶基因)的表达则有正调控作用.生物信息学分析表明,SarA控制atlE,lipA和zinC3种基因表达可能是通过与被调控基因上游的特定DNA序列的结合来实现的,该DNA结合区保守并富含AT碱基.根据已报道的金黄色葡萄球菌中SarA的结合位点序列,利用Omiga软件分析并推测了SarA结合atlE,lipA和zinC的可能区域.基于SarA是一种多功能的毒素相关调控因子,结果提示,SarA能调控众多因子,可以作为防治表皮葡萄球菌感染的一个药物筛选靶点. 展开更多
关键词 SARA 自溶酶基因(atLE) 脂肪酶基因(lipa) 膜相关锌金属蛋白酶基因(zinC) 基因调控 表皮葡萄球菌
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Wolman病临床及LIPA基因突变1例
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作者 朱燕凤 张婷 +5 位作者 陈扬 林凯 陆铸今 王晓红 俞蕙 陆国平 《中国循证儿科杂志》 CSCD 2013年第1期55-59,共5页
目的探讨Wolman病的临床特点及分子诊断的意义。方法对1例符合Wolman病临床表现的患儿进行白细胞溶酶体酸性脂酶LIPA基因测序,分析其突变的类型。结果约5月龄女婴,发现"皮肤黄染10余天,加重伴发热3d"入院。查体见肝脾显著肿大... 目的探讨Wolman病的临床特点及分子诊断的意义。方法对1例符合Wolman病临床表现的患儿进行白细胞溶酶体酸性脂酶LIPA基因测序,分析其突变的类型。结果约5月龄女婴,发现"皮肤黄染10余天,加重伴发热3d"入院。查体见肝脾显著肿大,黄疸。实验室检查提示贫血,肝功能衰竭,高三酰甘油血症;X线胸腹片和腹部增强CT均提示特征性双侧肾上腺增大和广泛钙化。骨髓涂片可见海蓝色泡沫状组织细胞,PAS染色提示脂质沉积。DNA测序显示,LIPA基因编码区第7外显子上发生c.796G>T,p.G266*的纯合无义突变,导致266位甘氨酸(GGA)突变为终止密码(TGA)(p.G266*),致溶酶体酸性脂酶缺失。结论 Wolman病婴儿期起病,以显著肝脾肿大、特征性双侧肾上腺增大和广泛钙化、高三酰甘油血症为特征,相应的酶学分析和LIPA基因检测均可确诊Wolman病。 展开更多
关键词 Wolman病 溶酶体酸性脂酶 lipa基因突变 肝脾大 肾上腺钙化
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Wolman Disease in Bulgarian Patients: Selective Genetic Screening in Two Presumable Endemic Regions
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作者 Angelina Mandadzhieva Daniela Avdzhieva-Tzavella +6 位作者 Tihomir Todorov Savina Tincheva Vanya Sinigerska Mariya Ivanova Alexey Savov Vanyo Mitev Albena Todorova 《American Journal of Molecular Biology》 2017年第4期169-175,共7页
Wolman disease is a rare autosomal recessive disorder caused by mutations in the LIPA gene (10q23.31). The LIPA gene encodes lysosomal acid lipase (LAL), which plays a key role in hydrolysis of the cholesteryl esters ... Wolman disease is a rare autosomal recessive disorder caused by mutations in the LIPA gene (10q23.31). The LIPA gene encodes lysosomal acid lipase (LAL), which plays a key role in hydrolysis of the cholesteryl esters and triglycerides. Two unrelated families from Bulgaria were referred for genetic testing with clinical diagnosis Wolman disease. Sanger sequencing of all coding exons and exon-intron boundaries of the LIPA gene was performed. The index patients were found to be homozygous for two different mutations in the LIPA gene: a missense mutation, c.260G > T, p.Gly87Val, which affects the enzyme active site and a splice-site change, c.822+1G > A, which most probably destroys the enzyme polypeptide chain. These two completely different types of mutations along the LIPA gene resulted in a very similar phenotype involving liver, kidney, gastrointestinal, muscle and blood disturbances. As consanguinity is not typical for the Bulgarian population, a possible explanation of the homozygosity could be presence of endemic regions for given mutations. To check this hypothesis, selective screening for these mutations was performed in two presumable endemic regions in Bulgaria. Altogether, 100 newborns were screened for p.Gly87Val mutation and the detected carrier frequency was about 1% (1/100), while in the group of 100 newborns screened for the c.822 + 1G > A mutation the detected carrier frequency was 2% (2/100). The results indicate a high recurrence risk of Wolman disease in these particular Bulgarian regions of about 1:10000. These findings are from crucial importance for the inhabitants of the corresponding parts of Bulgaria. They may benefit from early genetic testing and adequate genetic counselling during family planning. 展开更多
关键词 Wolman Disease lipa gene LYSOSOMAL Acid lipaSE MUTATIONS SELECTIVE Screening
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枯草芽孢杆菌脂肪酶表达质粒的构建及其表达
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作者 杜文新 张萌 班睿 《化学与生物工程》 CAS 2007年第8期52-55,共4页
以枯草芽孢杆菌168(B.subtilis168)染色体为模板PCR扩增出P43启动子,与大肠杆菌-枯草杆菌穿梭质粒pUBC19相连得到表达载体pUBC-P43,然后将枯草芽孢杆菌脂肪酶基因lipA克隆到载体pUBC-P43启动子下游,得到重组质粒pUBCPL并转化B.subtilisT... 以枯草芽孢杆菌168(B.subtilis168)染色体为模板PCR扩增出P43启动子,与大肠杆菌-枯草杆菌穿梭质粒pUBC19相连得到表达载体pUBC-P43,然后将枯草芽孢杆菌脂肪酶基因lipA克隆到载体pUBC-P43启动子下游,得到重组质粒pUBCPL并转化B.subtilisTZ10。经中性红油脂平板、酶切和PCR方法鉴定得到重组菌TZ10/pUBCPL。宿主菌TZ10是B.subtilisDB104染色体缺失了lipA基因后获得。重组菌经初步发酵,以橄榄油为底物测定发酵上清液最高脂肪酶活力为49.1 U.L-1,而相应菌株DB104发酵最高酶活力仅为11.4 U.L-1。 展开更多
关键词 脂肪酶 lipa基因 重组质粒 枯草芽孢杆菌 基因表达
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DNA测序与线性反向探针杂交法检测HBV P基因耐药突变的比较
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作者 姜丽丽 王平忠 +3 位作者 张野 黄长形 连建奇 白雪帆 《实用肝脏病杂志》 CAS 2009年第3期179-183,213,共6页
目的建立和优化扩增慢性乙型肝炎患者血清HBV P基因的PCR方法,比较DNA测序法与线性反向探针杂交法检测HBV基因突变情况,并对耐药相关基因突变及其意义进行分析。方法采用巢式PCR法扩增93例慢性乙型肝炎患者血清HBV P基因反转录酶区,对PC... 目的建立和优化扩增慢性乙型肝炎患者血清HBV P基因的PCR方法,比较DNA测序法与线性反向探针杂交法检测HBV基因突变情况,并对耐药相关基因突变及其意义进行分析。方法采用巢式PCR法扩增93例慢性乙型肝炎患者血清HBV P基因反转录酶区,对PCR产物进行DNA测序,采用Bioedit6.0.5、SeqmanTMⅡ、EditSeq TM和Me-gAlign软件分析结果;同时随机抽取40份血清进行线性反向探针杂交,比较两者的检测结果,并对11个已知耐药相关突变位点进行分析。结果在93份标本中DNA序列测定法检测到碱基突变113个,其中与LAM相关突变50份(53.78%),与ADV相关突变6份(6.46%),与LdT相关突变3份(3.23%),与ETV相关突变3份(3.23%);在40份血清中与线性反向探针杂交检测结果一致的突变为87.5%(35/40),氨基酸位点一致为98.0%(431/440)。此外,还检测到V84I、S85C、A181S、L229W、N238T等与耐药相关的突变位点。结论应用线性反向探针杂交检测虽然比较快捷,但其价格昂贵且只能检测已知常见的变异位点;建立在巢式PCR基础上的DNA序列测定法敏感性与线性反向探针杂交法相当,两者检测结果有较高的符合率,但似可检出更多的耐药相关突变。 展开更多
关键词 慢性乙型肝炎 乙型肝炎病毒 核苷/酸类药物 耐药性突变 DNA序列测定 线性反向探针杂交
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二步法黑曲霉脂肪酶基因lipA的全基因合成及其在毕赤酵母中的高效表达 被引量:7
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作者 杨江科 严翔翔 +2 位作者 张正平 江雪青 闫云君 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期381-387,共7页
黑曲霉脂肪酶是重要的工业用酶,在食品、制药等领域具有广泛的用途。获得黑曲霉脂肪酶高效表达的基因工程菌是该脂肪酶规模化应用的前提。通过全基因合成对目的基因进行分子改造和人工组建是实现基因高效表达和体外分子进化的有效手段... 黑曲霉脂肪酶是重要的工业用酶,在食品、制药等领域具有广泛的用途。获得黑曲霉脂肪酶高效表达的基因工程菌是该脂肪酶规模化应用的前提。通过全基因合成对目的基因进行分子改造和人工组建是实现基因高效表达和体外分子进化的有效手段。本研究主要针对一步法长片段基因合成中复杂结构的非特异性配对和过多的PCR引入碱基错配等问题,采用二步法(组装PCR和酶切-酶连)合成了黑曲霉脂肪酶基因lipA。首先在DNA2.0和Gene2Oliga软件辅助下对lipA基因密码子及RNA二级结构进行优化并引入ClaI(237位)和PstI(475位)酶切位点;通过组装PCR分别合成lipA基因的各片段F1(237bp)、F2(238bp)和F3(422bp);通过该基因内的ClaI和PstI限制性酶切位点连接成完整的全长lipA基因。本方法有效地降低了长片段合成过程中寡核苷酸片段的非特异性配对、复杂的二级结构以及碱基突变对DNA合成的影响,提高了长片段合成的成功率。经密码子优化后的脂肪酶基因(lipA-syn)在毕赤酵母GS115中经诱导表达72h后,发酵液酶活达176.0U/mL,蛋白质含量为143.7mg/L,较出发基因分别提高了10.8倍和5.6倍。实现了该基因的高效表达,并为产酶参数的优化和酶的规模化制备奠定了基础。 展开更多
关键词 黑曲霉脂肪酶基因lipa 全基因合成 二步法 毕赤酵母 高效表达
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溶酶体酸脂酶基因变异与冠心病风险的关联研究
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作者 徐延路 柯晓 +2 位作者 惠汝太 李莉 郑欣馨 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2020年第4期3497-3500,共4页
目的在中国人群中验证溶酶体酸脂酶(LAL)基因变异性与冠心病遗传易感性。方法对经冠状动脉造影确诊的568个冠心病病例和430个正常对照的人群,采用PCR-LDR法对rs1412444进行基因分型。按照显性模式、隐性模式和加性模式进行关联分析,探讨... 目的在中国人群中验证溶酶体酸脂酶(LAL)基因变异性与冠心病遗传易感性。方法对经冠状动脉造影确诊的568个冠心病病例和430个正常对照的人群,采用PCR-LDR法对rs1412444进行基因分型。按照显性模式、隐性模式和加性模式进行关联分析,探讨rs1412444变异与冠心病风险的关联。结果rs1412444基因型变异与冠心病的易感性密切相关。与携带G基因型相比,携带A等位基因能够显著增加冠心病的发病风险。经校正传统危险因素后,LIPA-rs1412444 A等位基因携带者与野生型G等位基因携带者相比,仍显示冠心病易感性增加(显性模式:OR=1.37,95%CI:1.01-1.88,P=0.046;加性模式:OR=1.30,95%CI:1.02-1.65,P=0.032)。结论LIPA基因多态性位点rs1412444可能是预测冠心病发病的新遗传标记,溶酶体酸脂酶可能在冠心病的发病中起到重要的调节作用。 展开更多
关键词 溶酶体酸脂酶 基因 单核苷酸多态性 脂质代谢 冠心病
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