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崇仁麻鸡mtDNA D-loop区遗传结构与遗传多样性分析
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作者 陈基 王水兴 +3 位作者 孔佰祥 陈树泓 赵少添 吴凌伟 《中国家禽》 北大核心 2023年第12期108-112,共5页
为研究崇仁麻鸡线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区遗传多样性和遗传结构,试验采用PCR产物直接测序的方法,测定崇仁麻mtDNA D-loop区的全序列,并与其他5个红色原鸡亚种进行系统进化关系分析。结果显示:30个样本的mtDNA D-loop... 为研究崇仁麻鸡线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区遗传多样性和遗传结构,试验采用PCR产物直接测序的方法,测定崇仁麻mtDNA D-loop区的全序列,并与其他5个红色原鸡亚种进行系统进化关系分析。结果显示:30个样本的mtDNA D-loop区序列长度范围为1231~1232 bp,共发现27个多态位点,单倍型多样性(Hd)、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异(K)数值分别为0.947、0.00689和8.476。群体中16种单倍型划分为A、B、C和E单倍型类群。研究表明,崇仁麻鸡具有较高的线粒体遗传多样性,可能来源于不同的母系。 展开更多
关键词 崇仁麻鸡 线粒体DNA D-loop 系统发育关系
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基于线粒体D-loop基因序列研究我国5种虾虎鱼类的系统进化关系 被引量:12
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作者 侯新远 祝斐 +6 位作者 张丽娟 尹绍武 胡亚丽 贾一何 李丽 汪亚媛 张国松 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2013年第1期1-7,共7页
利用PCR技术扩增河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)、鸭绿沙塘鳢(Odontobutis yaluensis)、中华沙塘鳢(Odontobutis sinensis)、葛氏鲈塘鳢(Perccottus glenii)及尖头塘鳢(Eleotris oxycephala)的线粒体D-loop区并测序,获得河川沙塘... 利用PCR技术扩增河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)、鸭绿沙塘鳢(Odontobutis yaluensis)、中华沙塘鳢(Odontobutis sinensis)、葛氏鲈塘鳢(Perccottus glenii)及尖头塘鳢(Eleotris oxycephala)的线粒体D-loop区并测序,获得河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢、中华沙塘鳢、葛氏鲈塘鳢及尖头塘鳢线粒体D-loop区全序列分别为853bp、853bp、1028bp、852bp、848bp,结合GenBank中平头沙塘鳢(Odontobutis platycephala)、刺盖塘鳢(Eleotris acanthopoma)、黑体塘鳢(Eleotris melanosoma)、褐塘鳢(Eleotris fusca)、中华乌塘鳢(Bostrychussinensis)、云斑尖塘鳢(Oxyeleotris marmorata)、溪鳢(Rhyacichthys aspro))等7种虾虎鱼类同源的D-loop区序列,分析了这12种虾虎鱼类的系统发育关系。所使用的同源序列长度为832~846bp,其中保守位点452个,变异位点405个,简约信息位点258个,单态位点145个,转换/颠换平均值为0.8。基于Kimura2-parameter模型的12种虾虎鱼类遗传距离范围为0.043~0.312,在Kimura2-parameter模型构建的邻接树和非加权配对法系统树中,河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢、中华沙塘鳢、平头沙塘鳢聚为一大支,刺盖塘鳢、黑体塘鳢、褐塘鳢、尖头塘鳢、溪鳢、葛氏鲈塘鳢聚为另一支。 展开更多
关键词 虾虎鱼类 D—loop 系统进化
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基于线粒体DNAD-loop区全序列分析藏鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究 被引量:12
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作者 贾晓旭 唐修君 +4 位作者 陆俊贤 顾荣 葛庆联 高玉时 苏一军 《东北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期32-36,共5页
通过对藏鸡线粒体DNA(mt DNA)Dloop区全序列的测序和比对,结合Gen Bank已经测出Dloop区全序列的部分品种鸡的序列,探讨藏鸡的遗传多样性和母系起源。结果表明,藏鸡DNA(mt DNA)Dloop区全长1 231-1 232 bp、1 231 bp单倍型在859 bp处... 通过对藏鸡线粒体DNA(mt DNA)Dloop区全序列的测序和比对,结合Gen Bank已经测出Dloop区全序列的部分品种鸡的序列,探讨藏鸡的遗传多样性和母系起源。结果表明,藏鸡DNA(mt DNA)Dloop区全长1 231-1 232 bp、1 231 bp单倍型在859 bp处存在C碱基缺失。在20只个体中,共发现20处单核苷酸多态位点,7种单倍型。系统发育分析发现,藏鸡7种单倍型可以分为A、B、E三个分支。A分支与红色原鸡(Gallus gallus murghi)聚为一类,推测可能起源于红色原鸡的印度亚种分支,B和E与红色原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类,推测这两个分支可能起源于云南、缅甸附近地区的红色原鸡滇南亚种。研究从分子水平上为藏鸡的遗传资源保护和开发利用提供参考。 展开更多
关键词 藏鸡 线粒体DNA D-loop 系统发育关系 起源
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基于线粒体DNAD-loop区全序列分析大围山微型鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究 被引量:14
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作者 贾晓旭 唐修君 +4 位作者 陆俊贤 顾荣 葛庆联 高玉时 苏一军 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期656-660,共5页
[目的]探究大围山微型鸡的遗传多样性和起源。[方法]对30只大围山微型鸡线粒体DNA(mitochondrial genome,mt DNA)D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,并结合GenBank已登录红色原鸡的D-loop区全序列,运用现代生物信息学方法进行数据处理... [目的]探究大围山微型鸡的遗传多样性和起源。[方法]对30只大围山微型鸡线粒体DNA(mitochondrial genome,mt DNA)D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,并结合GenBank已登录红色原鸡的D-loop区全序列,运用现代生物信息学方法进行数据处理。[结果]试验结果表明:大围山微型鸡mt DNA D-loop区全长1 231~1 232 bp,1 231 bp单倍型在859 bp处存在C碱基缺失。核苷酸多样性(Pi)为0.004 43±0.000 14,单倍型多样性(Hd)为0.685±0.079,核苷酸平均差异数(K)为5.448。在30只个体中,共发现18处单核苷酸多态位点,6种单倍型。系统发育分析发现,6种单倍型可以分为A、B、D和E 4个分支,其中A和B为主要分支。A和B分支各有2种单倍型,D和E分支均只有1种单倍型。A和B分支与红色原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类。[结论]大围山微型鸡mt DNA D-loop区有丰富的多态性,并且有多个母系起源,红色原鸡滇南亚种在大围山微型鸡形成过程中贡献最大。 展开更多
关键词 大围山微型鸡 线粒体DNA D-loop 系统发育关系 起源
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山东猪种mtDNA D-loop区部分序列遗传多样性及系统进化研究 被引量:11
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作者 王继英 郭建凤 +3 位作者 孙守礼 王诚 张印 武英 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期792-799,共8页
为了解山东省猪种的遗传资源状况,阐明猪种间的亲缘关系,对山东省猪种(莱芜黑猪、大蒲莲黑猪、里岔黑猪、烟台黑猪、沂蒙黑猪、五莲黑猪、昌潍白猪和鲁烟白猪)及引进猪种(杜洛克、大约克和长白猪)共165个样本的mtDNA D-loop区部分... 为了解山东省猪种的遗传资源状况,阐明猪种间的亲缘关系,对山东省猪种(莱芜黑猪、大蒲莲黑猪、里岔黑猪、烟台黑猪、沂蒙黑猪、五莲黑猪、昌潍白猪和鲁烟白猪)及引进猪种(杜洛克、大约克和长白猪)共165个样本的mtDNA D-loop区部分序列(1102 bp)进行PCR扩增和序列测定,并采用现代生物信息学软件进行了数据处理分析,结果表明:山东各猪种之间遗传距离较小(0.0005~0.0046),远小于国外猪种杜洛克、长白与山东各猪种间的遗传距离(〉0.14),但大约克与山东各猪种的平均遗传距离较小(0.005)。构建的NJ分子系统进化树将所测样本分为2个独立的支系,第一支由山东各猪种和部分大约克构成,另一支全部为引进猪种。莱芜黑猪和大蒲莲黑猪在NJ系统树上分布集中,各自聚为一小类,其它6个猪种都很分散,说明莱芜黑猪和大蒲莲黑猪母源血统单一,其它6个猪种母源血统遗传复杂,彼此之间基因交流多。 展开更多
关键词 山东省猪种 MTDNA D-loop 遗传多样性 系统进化
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中国9个家驴品种mtDNA D-loop部分序列分析与系统进化研究 被引量:6
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作者 刘建斌 杨博辉 +3 位作者 郎侠 孙晓萍 郭健 程胜利 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2010年第3期1-6,共6页
本研究利用Dnasp4.10软件对中国9个家驴品种162个个体的mtDNA D-loop区385bp进行遗传多样性分析,共检测到32种单倍型35个核苷酸多态位点,其单倍型多样度为0.8137~0.9722,核苷酸多样度为0.0182~0.0270,表明我国家驴的遗传多态性丰富;利... 本研究利用Dnasp4.10软件对中国9个家驴品种162个个体的mtDNA D-loop区385bp进行遗传多样性分析,共检测到32种单倍型35个核苷酸多态位点,其单倍型多样度为0.8137~0.9722,核苷酸多样度为0.0182~0.0270,表明我国家驴的遗传多态性丰富;利用MEGA3.1软件采用邻接法与3个努比亚野驴、3个索马里野驴和6个亚洲野驴的序列构建NJ系统发育树,并进行系统进化分析。结果表明:我国家驴的母系起源是非洲野驴中的努比亚野驴和索马里野驴,亚洲野驴不是中国家驴的母系祖先。 展开更多
关键词 mtDNA D-loop 系统进化 遗传多样性 起源
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基于D-loop区序列分析的四川省三个地方鸡种遗传多样性及母系亲缘关系研究 被引量:11
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作者 蒋利 蒋小松 +5 位作者 熊斌 王康环 王海 刘光伟 任冰冰 徐亚欧 《中国家禽》 北大核心 2013年第18期10-14,共5页
为研究四川省少数民族地区泸宁鸡、米易鸡、草科鸡的遗传多样性及母系亲缘关系,通过PCR扩增、产物回收、测序的方法,获得各鸡种30个样本的mtDNA D-loop区的部分序列,利用DNAMAN、MEGA5、DnaSP、Network等生物信息学软件对测序结果进行... 为研究四川省少数民族地区泸宁鸡、米易鸡、草科鸡的遗传多样性及母系亲缘关系,通过PCR扩增、产物回收、测序的方法,获得各鸡种30个样本的mtDNA D-loop区的部分序列,利用DNAMAN、MEGA5、DnaSP、Network等生物信息学软件对测序结果进行分析。对90个个体mtDNA D-loop区589 bp的片段通过数据分析及聚类分析,构建了单倍型网络关系图及品种聚类图等。泸宁鸡、米易鸡、草科鸡具有较近的亲缘关系,推测3个地方鸡种起源于分布在印度支那半岛、泰国、苏门答腊的红原鸡Gallus gallus gallus亚种。 展开更多
关键词 遗传多样性 母系亲缘关系 mtDNA D—loop 地方鸡品种
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藏獒线粒体DNA D-loop区序列测定及其分类地位研究 被引量:4
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作者 李隐侠 李齐发 +5 位作者 刘振山 赵兴波 潘增祥 孙源荣 徐银学 谢庄 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期107-111,共5页
根据家犬线粒体基因组DNA序列设计引物,获得了藏獒(Tibetan mastiff)线粒体DNA D-loop区全序列,并以灰狼、郊狼作为外类群对藏獒、家犬亚种内6个大型家犬品种进行了系统发育分析。试验结果发现:藏獒线粒体DNA D-loop区序列全长1250 bp,... 根据家犬线粒体基因组DNA序列设计引物,获得了藏獒(Tibetan mastiff)线粒体DNA D-loop区全序列,并以灰狼、郊狼作为外类群对藏獒、家犬亚种内6个大型家犬品种进行了系统发育分析。试验结果发现:藏獒线粒体DNA D-loop区序列全长1250 bp,与家犬源序列的同源性为96.06%,其中有20个碱基缺失;系统发育分析发现藏獒、家犬亚种内6个大型家犬品种与灰狼聚为一大类,而郊狼自成一类,说明藏獒与其他家犬品种一样起源于灰狼,是家犬亚种内的一个品种,在分类地位上隶属于食肉目、犬科、犬属、狼种、家犬亚种;在家犬亚种内,藏獒与英国牧羊犬、兰伯格犬聚为一类,而德国牧羊犬与瑞典猎鹿犬、黑俄罗斯更犬聚在一起,再与圣伯纳犬聚为一类,从分子水平上验证了英国牧羊犬等大型犬可能含有藏獒血统的观点。 展开更多
关键词 藏獒 线粒体DNA D—loop 系统发育关系 起源 分类地位
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清远麻鸡mtDNA D-loop区遗传多样性分析 被引量:5
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作者 张静 贾晓旭 +5 位作者 陆俊贤 沈啸 唐修君 樊艳凤 葛庆联 高玉时 《中国家禽》 北大核心 2022年第2期24-28,共5页
研究旨在通过线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区分子标记研究清远麻鸡的遗传多样性。试验通过PCR扩增和直接测序的方法对80只清远麻鸡的线粒体DNA D-loop区的全序列进行检测,并与红色原鸡进行系统进化分析。研究结果表明:清... 研究旨在通过线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)D-loop区分子标记研究清远麻鸡的遗传多样性。试验通过PCR扩增和直接测序的方法对80只清远麻鸡的线粒体DNA D-loop区的全序列进行检测,并与红色原鸡进行系统进化分析。研究结果表明:清远麻鸡mtDNA D-loop区序列长度在1231~1232 bp之间,单倍型多样性、核苷酸多样性和平均核苷酸差异分别为0.861、0.00606和7.456。80条序列共发现30个多态位点,定义了18种单倍型,归属可分为A、B、C、D和E 5个单倍型类群。清远麻鸡在mtDNA水平上具有很高的遗传多样性,有多个母系来源。研究结果为清远麻鸡种质资源遗传评估、有效保种和选育利用提供了理论依据。 展开更多
关键词 清远麻鸡 线粒体DNA D-loop 系统发育关系
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广西5个猪种和国外3个猪种mtDNA D-loop序列遗传多样性及进化分析 被引量:7
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作者 张冰 廖海洪 +2 位作者 农素群 马青艳 孙俊丽 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第7期1807-1815,共9页
为了比较广西猪种和国外3个猪种的遗传资源多样性和进化关系,利用文献报道的1对引物测定了广西5个地方猪种(巴马香猪、东山猪、桂中花猪、陆川猪、环江香猪)共85个样本的mtDNA D-loop序列,结合已报道的国外3个猪种(杜洛克猪、大约克猪... 为了比较广西猪种和国外3个猪种的遗传资源多样性和进化关系,利用文献报道的1对引物测定了广西5个地方猪种(巴马香猪、东山猪、桂中花猪、陆川猪、环江香猪)共85个样本的mtDNA D-loop序列,结合已报道的国外3个猪种(杜洛克猪、大约克猪和长白猪)的45条mtDNA D-loop序列,进行单倍型、遗传多样性和系统发育树分析。结果表明,8个群体样本的130条序列共定义38种单倍型;广西各猪种之间遗传距离较小,远小于其与国外猪种杜洛克猪、长白猪间的遗传距离;构建的NJ分子系统进化树将所分析样本分为2个独立的支系:一支包含了所有广西地方猪种和部分大约克猪的单倍型,另一支则全部是3个国外猪种的单倍型,广西猪种和3个国外猪种有着两个明显不同的母系起源。陆川猪在系统树上分布较为紧密,其他4个猪种都很分散,表明陆川猪母源血统单一,其他4个猪种母源血统遗传背景比较复杂,彼此之间有基因交流。广西猪种母系资源没有受到国外引进猪种资源的影响,在其开发利用中依然适合用作母本。 展开更多
关键词 广西猪种 国外猪种 线粒体DNA控制区 遗传多样性 系统进化
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河南地方猪mtDNA D-loop序列遗传多样性及系统进化分析 被引量:6
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作者 李新建 薛亚辉 +6 位作者 王明宇 段栋栋 刘贤 乔瑞敏 韩雪蕾 王克君 李秀领 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期452-461,共10页
为了解河南省地方猪种的遗传资源状况,探究猪种间的亲缘关系,对河南省地方猪种(南阳黑猪、确山黑猪、淮南猪、豫西黑猪)及2个参考猪种(莱芜黑猪、二花脸猪)和野猪共计282个样本的mtDNA D-loop序列进行PCR扩增及序列测定,并结合GenBank中... 为了解河南省地方猪种的遗传资源状况,探究猪种间的亲缘关系,对河南省地方猪种(南阳黑猪、确山黑猪、淮南猪、豫西黑猪)及2个参考猪种(莱芜黑猪、二花脸猪)和野猪共计282个样本的mtDNA D-loop序列进行PCR扩增及序列测定,并结合GenBank中3个国外猪种(杜洛克猪、长白猪、约克夏猪)的38条mtDNA D-loop序列,进行单倍型、遗传多样性、系统发育树、网络分析、歧点分布分析。结果表明,河南省地方猪4个品种共236条序列,定义了32种单倍型,单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.788~0.854、0.00156~0.00455。构建的NJ系统进化树将所有样本分为2个独立分支,一支包含所有河南各猪种和部分约克夏猪,另一支全部为引进猪种,表明河南地方猪和3个国外猪种具有2个明显不同的母系起源。网络中介图和歧点分布显示,在历史驯养过程中,整个河南地方猪群体曾经历过群体扩张事件。说明河南地方猪种具有较为丰富的遗传多样性,且彼此之间有一定的基因交流。 展开更多
关键词 河南地方猪 MTDNA D-loop 遗传多样性 系统进化
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中国地鼠线粒体D-loop基因的克隆及序列分析 被引量:2
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作者 宋国华 陈朝阳 +2 位作者 庞文彪 高继萍 岳文斌 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第2期126-129,共4页
本试验根据已知相近物种动物基因序列设计引物,PCR扩增获得中国地鼠线粒体D-loop基因序列。采用DNAS-tar软件计算序列碱基组成,分析遗传变异情况。用MEGA 4.1软件计算物种间遗传距离,采用邻接法(NJ)、最小进化法(ME)构建系统进化树。结... 本试验根据已知相近物种动物基因序列设计引物,PCR扩增获得中国地鼠线粒体D-loop基因序列。采用DNAS-tar软件计算序列碱基组成,分析遗传变异情况。用MEGA 4.1软件计算物种间遗传距离,采用邻接法(NJ)、最小进化法(ME)构建系统进化树。结果表明,中国地鼠线粒体D-loop区序列全长为867bp,碱基A、T、C、G的含量分别为29.53%、31.49%、26.07%、12.92%,中国地鼠与啮齿类动物有相似的碱基组成。系统进化树结果显示,中国地鼠与金黄地鼠亲缘关系较近,与大鼠的关系最远,与传统的分类相一致。所获得的中国地鼠D-loop基因可作为种间遗传变异研究的标记,研究结果为进一步研究中国地鼠的群体遗传结构奠定了基础。 展开更多
关键词 中国地鼠 线粒体DNA D-loop基因 进化分析
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晋南驴mtDNA D-loop区部分序列系统进化分析与体型测定 被引量:4
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作者 李慧锋 赵婧微 +5 位作者 陈员玉 程俐芬 曹宁贤 解建平 靳鲁柱 李武峰 《山西农业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2020年第4期121-128,共8页
[目的]晋南驴是中国优良的中大型地方良种。随着社会经济的发展,这一种质资源的规模已经大为减小。为保护晋南驴种质资源,急需对晋南驴进行系统化分析与测定。[方法]本研究以晋南驴为研究对象,测定了试验驴群的身高、体长、胸围和管围... [目的]晋南驴是中国优良的中大型地方良种。随着社会经济的发展,这一种质资源的规模已经大为减小。为保护晋南驴种质资源,急需对晋南驴进行系统化分析与测定。[方法]本研究以晋南驴为研究对象,测定了试验驴群的身高、体长、胸围和管围等体型性状,并就晋南驴每一个体mtDNA D-loop保守区480 bp的片段进行测序,并使用ClustalX和Dnasp5.10等软件分析了驴群的变异情况。[结果]该驴群mtDNA D-loop区核苷酸多样度为0.02707;核苷酸多态位点97个,多态位点比例为20.21%。共检测到54种单倍型,单倍型多样度为0.867,单倍型比例为54.55%,采用邻近归并法构建的系统发育树分析结果显示该群体的亲缘关系主要分为两支。[结论]晋南驴遗传多样性较为丰富,但该晋南驴群体在亲缘关系上有一定的分化,说明该驴群有一定的混杂,急需开展相应的晋南驴保种工作。 展开更多
关键词 晋南驴 mtDNA D-loop 亲缘关系 遗传多样性
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牛线粒体D-loop的序列分析及进化关系 被引量:2
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作者 黄秉周 徐公瑾 +2 位作者 金松哲 李宁 金海国 《延边大学农学学报》 2004年第4期233-240,260,共9页
牦牛存在两处10 bp和7 bp的缺失.10个品种的20条D-loop序列中共有18种单倍型,共检测到164个突变位点,346个突变碱基,其中转换突变235个,颠换突变55个,插入和缺失突变56个.基于聚类分析显示本试验所检测的黄牛中除了鲁西黄牛以外都起源... 牦牛存在两处10 bp和7 bp的缺失.10个品种的20条D-loop序列中共有18种单倍型,共检测到164个突变位点,346个突变碱基,其中转换突变235个,颠换突变55个,插入和缺失突变56个.基于聚类分析显示本试验所检测的黄牛中除了鲁西黄牛以外都起源于欧洲原牛,鲁西黄牛来源于两个母系,一个是欧洲原牛,另一个是瘤牛型原牛.牦牛与黄牛起源于不同的母系. 展开更多
关键词 线粒体D-loop 序列分析 进化关系
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Disharmonious Ventricular Relationship and Topology for the Given Atrioventricular Connections.Contemporary Diagnostic Approach Using 3D Modeling and Printing
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作者 Shi-Joon Yoo Ankavipar Saprungruang +1 位作者 Christopher Z.Lam Robert H.Anderson 《Congenital Heart Disease》 SCIE 2022年第5期495-504,共10页
In the last issue,two case reports separately present examples of the extremely rare and complex congenital heart diseases that show concordant atrioventricular connections to the L-looped ventricles in the presence o... In the last issue,two case reports separately present examples of the extremely rare and complex congenital heart diseases that show concordant atrioventricular connections to the L-looped ventricles in the presence of situs solitus.Both cases highlight that the relationship between the two ventricles within the ventricular mass is not always harmonious with the given atrioventricular connection.Such disharmony between the connections and relationships requires careful assessment of the three basic facets of cardiac building blocks,namely their morphology,the relationship of their component parts,and their connections with the adjacent segments.3D imaging and printing can now facilitate an otherwise difficult diagnosis in such complex situations.Rotation of either the 3D images or the models permit accurate assessment of the ventricular topologic pattern by creating the right ventricular en-face septal view,thus facilitating placement of the observer’s hands.As we now emphasize,an alternative approach,which might prove more attractive to imagers,is to rotate the ventricular mass to provide the ventricular apical view,thus permitting determination of the ventricular relationship without using the hands. 展开更多
关键词 Segmental approach disharmony between connection and relationship ventricular loop pattern ventricular topology juxtaposition of atrial appendages 3D modeling 3D printing
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大渡河理县高原鳅体长体重关系、遗传多样性和分化水平 被引量:1
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作者 赖见生 陈叶雨 +7 位作者 颜涛 林珏 黄颖颖 赵凤麒 陈永胜 周启红 刘晓欢 何斌 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2023年第11期2544-2552,共9页
【目的】为研究理县高原鳅不同地理种群的遗传多样性和群体结构,进一步利用理县高原鳅的遗传种质资源并对其野生群体进行保护,获取长江流域理县高原鳅种群结构信息。【方法】对大渡河理县高原鳅体重和体长组成、体长-体重关系进行研究,... 【目的】为研究理县高原鳅不同地理种群的遗传多样性和群体结构,进一步利用理县高原鳅的遗传种质资源并对其野生群体进行保护,获取长江流域理县高原鳅种群结构信息。【方法】对大渡河理县高原鳅体重和体长组成、体长-体重关系进行研究,并利用线粒体DNA控制区D⁃loop序列,对理县高原鳅4个地理种群共117个个体进行遗传结构变异分析。【结果】理县高原鳅体重和体长的回归方程为y=0.0123x2.9734,b值为2.9734,接近3,表明目前理县高原鳅生长状态良好。利用线粒体分子标记,在4个种群个体中共扩增获得878 bp的D⁃loop同源序列,包含28个单倍型和32个多态性位点,4个种群之间无共享单倍型。4个理县高原鳅群体的单倍型多样度在0.637~0.921,核苷酸多样性在0.00091~0.00570。通过分析遗传距离发现,金川县和丹巴县、泸定县和石棉县之间的理县高原鳅群体未发生遗传分化,而泸定县与金川县或丹巴县、石棉县与金川县或丹巴县之间的理县高原鳅群体均存在显著的遗传分化。通过构建NJ进化树发现,117个理县高原鳅个体在进化树上形成2个独立分支,与各地理种群的遗传分化结果一致。【结论】建议将大渡河金川县和丹巴县理县高原鳅种群作为一个整体进行管理和保护,石棉县和泸定县也作为一个整体进行管理和保护,而金川县和丹巴县、石棉县和泸定县的种群建议分开管理和保护。 展开更多
关键词 理县高原鳅 体长体重关系 遗传多样性 D⁃loop
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Complete Sequence of Yak Mitochondrial D-loop Region and Its Taxonomic Status in Bovinae
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作者 LI Qi-fa LI Yin-xia +4 位作者 DONG Li-yan ZHAO Xing-bo PAN Zeng-xiang LI Ning XIE Zhuang 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第S1期18-22,共5页
Primers based upon the mitochondrial genome sequences of Bos taurus were used to amplify and sequence the complete mitochondrial D-loop region of Jiulong yak(Poephagus grunniens).The results showed that the length of ... Primers based upon the mitochondrial genome sequences of Bos taurus were used to amplify and sequence the complete mitochondrial D-loop region of Jiulong yak(Poephagus grunniens).The results showed that the length of D-loop was 893 bp,with 87.4%homology to the Bos taurus D-loop sequence;there were 17 bp deletion.Using Ovis aries as an outgroup,the phylogeny of representative species of Bovinae(P.grunniens,P.mutus,Bos taurus,Bos indicus,Bison bison,Bison bonasus,and Bubalus bubalis)was analyzed.Among Bovinae,the sequence divergence between P.grunniens,P.mutus and American bison(Bison bison)was 6.2%-6.8%,which was less than that of Bos taurus and Bos indicus within Bos(10.0%-11.3%).Phylogenetic analysis found that P.grunniens,P.mutus and Bison bison clustered first of all,indicating there was higher genetic comparability among them than to that of Bos.Combining data from paleontology,morphology,and molecular biology,the present analysis supports the argument that Poephagus grunniens and Poephagus mutus should be classified as a distinct genus in Bovinae,that is Poephagus. 展开更多
关键词 Bovinae Poephagus yak(Poephagus grunniens) D-loop PHYLOGENETIC relationship TAXONOMIC STATUS
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Phylogenetic and morphometric relationships between two species of genus Auxis from the South China Sea and Java Sea
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作者 HABIB Ahasan 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2016年第10期76-82,共7页
This study was aimed at examining the phylogenetic and morphometric relationship of frigate tuna(Auxis thazard) and bullet tuna(Auxis rochei) using mt DNA D-loop(control) region sequences and truss measurements,... This study was aimed at examining the phylogenetic and morphometric relationship of frigate tuna(Auxis thazard) and bullet tuna(Auxis rochei) using mt DNA D-loop(control) region sequences and truss measurements,respectively. Maximum-likelihood(ML) tree and median-joining network showed that haplotypes from Auxis populations grouped separately. Discriminant function analyses and non-metric multidimensional scaling of morphometric data showed that bullet and frigate tuna were differed mainly with respect to truss measurements on the anterior region, suggesting adaptation to different diets available in different environments. Historic demographic analyses of sequence data showed that both bullet and frigate tuna had not undergone a significant sudden population expansion recently. Non-significant value of Tajimas' s D and Fu's F_S were indicated an effective large and stable population size for longer period of both species in South China Sea and Java Sea species. This study gives first report on the complementary relationship between morphometric and genetic analysis in stock discrimination of genus Auxis. 展开更多
关键词 phylogenetic relationship mtDNA D-loop morphometric analysis Auxis thazard Auxis rochei
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信号楼内功能性接地与保护性接地基准点研究 被引量:1
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作者 谢宝军 吴歆彦 +1 位作者 王学林 刘立峰 《铁道通信信号》 2023年第7期35-39,共5页
针对目前铁路信号楼内电子信息设备接地采用的“共地不共线”方案,通过理论计算和数据分析,研究不同类型接地线之间环路感应高电压对电子信息设备的影响,接地线长度与干扰波长频率的谐振关系,以及不同保护性接地方式下的人体接触危险电... 针对目前铁路信号楼内电子信息设备接地采用的“共地不共线”方案,通过理论计算和数据分析,研究不同类型接地线之间环路感应高电压对电子信息设备的影响,接地线长度与干扰波长频率的谐振关系,以及不同保护性接地方式下的人体接触危险电压,提出了电子信息设备功能性接地和保护性接地的基准点,为信号楼内设备接地和等电位连接总体技术方案研究提供理论基础。 展开更多
关键词 信号楼 接地 环路感应 谐振关系 接触电压 基准点
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锁相环对锁相环型并网变换器有功/无功电流激励-内电势幅值/频率响应关系的影响机制研究
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作者 龚轩 袁小明 胡家兵 《中国电机工程学报》 EI CSCD 北大核心 2023年第10期3904-3915,共12页
新能源发电大规模接入电力系统使其出现了区别于传统电力系统的电流控制时间尺度的电压/频率动态现象。系统安全稳定运行所需的相对稳定的电压/频率水平与功率传输水平要求变换器并网设备具备基于端口功率调节内电势幅值/频率的机制。... 新能源发电大规模接入电力系统使其出现了区别于传统电力系统的电流控制时间尺度的电压/频率动态现象。系统安全稳定运行所需的相对稳定的电压/频率水平与功率传输水平要求变换器并网设备具备基于端口功率调节内电势幅值/频率的机制。电网端电压状态检测的锁相控制方式复杂化了该调节机制,并为理解系统电压/频率动态过程机理带来障碍。然而,现有研究多直接基于物理连接关系对锁相环型并网设备进行数学描述,未能意识到功率激励-内电势幅值/频率响应关系是设备在系统动态过程中角色的一般化描述,更未能建立锁相控制方式对此激励–响应关系的影响机制认识。为此,文中以锁相环型并网变换器电流控制时间尺度为对象,基于其在系统闭环因果动态过程中行为的认识揭示设备内电势幅值/频率独立受有功/无功电流调节的机制。然后,基于不平衡有功/无功电流及其独立决定的锁相误差分别经电流控制器与锁相环共同建立内电势矢量过程的认识,阐明内电势矢量旋转运动的形成机制与内电势频率调节的锁相影响机制。最后,进一步初步说明变换器设备在系统电流控制时间尺度频率动态过程中的角色。 展开更多
关键词 变换器并网设备 电流控制时间尺度 锁相环 有功/无功电流 内电势幅值/频率 激励–响应关系
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