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Error Searching System with Keyword Extraction and Keyword Fuzzy Matching
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作者 Fan Yang Zhenghong Dong Lihao Liu 《International Journal of Communications, Network and System Sciences》 2017年第5期219-226,共8页
This paper has proposed an error searching method to search the solutions of errors that occurred in the unified commanding platform mix-deployed software (UCPMD). Because those errors belong to different stages or ma... This paper has proposed an error searching method to search the solutions of errors that occurred in the unified commanding platform mix-deployed software (UCPMD). Because those errors belong to different stages or may be happened in different services, applications, IP ports, system software, or different versions of software, and those errors are also can be classified into different types. It is necessary to locate accurate reason that cause an error as well as find out its solution. The proposed error searching system applies Chinese keyword extraction and Chinese fuzzy matching between keywords, which considers the processed keywords as the index to find out the solutions of errors. Besides, the error searching system had made correspondence among errors, reasons, and solutions, and put them to different categories in terms of their characteristics, such that it is easy to manage, search, and use. Among others, we have added specialized thesaurus as the index of keywords, which enriches and completes the searching results. Because of the proposed error searching system evolves keyword extraction and keyword fuzzy matching technologies;it is more accurate to find out user-interested solutions. 展开更多
关键词 database Design SEARCH Engine Extraction Fuzzy matchING
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常见医学真菌DNA条形码BLAST数据库的建立 被引量:2
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作者 刘沐桑 张莉莉 +3 位作者 吕桂霞 沈永年 胡素泉 刘维达 《中国麻风皮肤病杂志》 2015年第7期401-404,共4页
目的:构建我国重要医学真菌DNA条形码BLAST数据库。方法:对28种医学真菌的ITS-rDNA序列(DNA条形码)进行测定和汇总,并使用NCBI提供的数据库工具将汇总的序列构建成DNA条形码数据库。结果:构建的医学真菌DNA条形码数据库包括28种中国常... 目的:构建我国重要医学真菌DNA条形码BLAST数据库。方法:对28种医学真菌的ITS-rDNA序列(DNA条形码)进行测定和汇总,并使用NCBI提供的数据库工具将汇总的序列构建成DNA条形码数据库。结果:构建的医学真菌DNA条形码数据库包括28种中国常见医学真菌的DNA条形码序列,利用数据库对待测真菌标本的DNA条形码序列进行检索,能进一步确定真菌类型。结论:本实验构建的医学真菌DNA条形码数据库可以用于医学真菌的分子鉴别。 展开更多
关键词 医学真菌 dna条形码 BLAST检索 数据库
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现阶段我国DNA数据库发展的几个关键问题 被引量:19
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作者 刘冰 《刑事技术》 2015年第4期318-323,共6页
经过15年发展,我国DNA数据库集聚了3000万以上的STR数据,在超过100万起案件中发挥了作用。随着Y-STR、SNP等新遗传标记被引入法庭科学领域,对DNA数据库的应用已不仅仅满足于传统的直接匹配和简单亲缘关系检索。现阶段我国DNA数据库究竟... 经过15年发展,我国DNA数据库集聚了3000万以上的STR数据,在超过100万起案件中发挥了作用。随着Y-STR、SNP等新遗传标记被引入法庭科学领域,对DNA数据库的应用已不仅仅满足于传统的直接匹配和简单亲缘关系检索。现阶段我国DNA数据库究竟该向何处发展,文章认为:(1)关于增加DNA数据库支持基因座数量的必要性已在法医遗传学领域达成共识,但常染色体STR基因座数量的增加必须以确定核心基因座为前提。(2)对于SNP等新型遗传标记的采用,DNA数据库应本着"善意期待"和"审慎观望"的态度,在数据库已经进入千万级容量的今天,采用SNP的可能性已经极低,未来能够对DNA数据库带来变革的,很可能是全基因组DNA测序。(3)复杂亲缘关系检索是DNA数据库人口覆盖率不足情况下的合理补充和必然选择,但应遵循严格的规则。(4)在没有通过严谨演绎推理构建起理论框架,特别是结果评价的数学模型之前,Y-STR数据库的应用还只是经验的而不是科学的。综上,作为千万级大容量DNA数据库,涉及发展方向、安全、稳定的根本性问题要慎重从事,用科学的方法思考、规划和推动工作的进行。 展开更多
关键词 法医遗传学 dna数据库 Y-STR数据库 核心基因座 SNP 个体识别 亲缘关系检索
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一种基于关键字树的DNA数据库搜索算法
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作者 邹权 郭茂祖 +1 位作者 刘扬 王春宇 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2009年第10期1944-1947,共4页
针对BLAST等软件在生物数据库中搜索DNA分子序列时,不能兼顾时间开销和搜索敏感性的问题,提出一种基于关键字树的多种子搜索算法。首先将查询序列分割成多个种子并将它们构建成一棵关键字树;然后利用Aho-Corasick算法在数据库中搜索,找... 针对BLAST等软件在生物数据库中搜索DNA分子序列时,不能兼顾时间开销和搜索敏感性的问题,提出一种基于关键字树的多种子搜索算法。首先将查询序列分割成多个种子并将它们构建成一棵关键字树;然后利用Aho-Corasick算法在数据库中搜索,找到每个种子的所有完全匹配;最后检查种子匹配密度大的区域,确定其是否是查询序列的近似出现。实验表明算法兼顾了时间开销和搜索的敏感性,而且能发现基因序列中的移位现象. 展开更多
关键词 dna数据库搜索 种子 关键字树 Aho—Corasick算法
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DNA混合基因分型与图像侦查的结合应用 被引量:1
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作者 邓少云 王瑞娟 王怀玉 《刑事技术》 2018年第1期74-76,共3页
目的通过对案件所获混合基因分型与图像侦查相结合,探讨类似案件侦破的经验和借鉴价值。方法对案件中9份检材进行DNA常染色体STR检验,选取有效混合基因型直接入库比对,结合图像侦查进行嫌疑人排查。结果案件中8号检材所得混合基因分型... 目的通过对案件所获混合基因分型与图像侦查相结合,探讨类似案件侦破的经验和借鉴价值。方法对案件中9份检材进行DNA常染色体STR检验,选取有效混合基因型直接入库比对,结合图像侦查进行嫌疑人排查。结果案件中8号检材所得混合基因分型比中嫌疑人,根据现场监控视频图像将其锁定。结论无法拆分的混合基因分型,可直接入库比对,再结合案件其他线索作嫌疑人排查,可以为案件侦破提供线索。 展开更多
关键词 混合基因分型 入库比对 图像侦查
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DNA数据库单亲随机匹配概率研究 被引量:1
6
作者 张智杰 吕德坚 《刑事技术》 2019年第6期545-547,共3页
目的模拟DNA数据库匹配,对出现的单亲二联体随机匹配概率进行计算,分析减少DNA数据库匹配中单亲二联体随机匹配出现的方法。方法在计算机上运用R软件包“DNAprofiles”和“DNAtools”模拟DNA数据库的建库与匹配,计算不同DNA数据库中单... 目的模拟DNA数据库匹配,对出现的单亲二联体随机匹配概率进行计算,分析减少DNA数据库匹配中单亲二联体随机匹配出现的方法。方法在计算机上运用R软件包“DNAprofiles”和“DNAtools”模拟DNA数据库的建库与匹配,计算不同DNA数据库中单亲二联体出现的随机匹配概率。结果随着模拟建库STR基因座数的不断增加,DNA数据库单亲二联体随机匹配概率不断下降。结论在DNA数据库实际操作中,单亲二联体需要作进一步检测以减少随机匹配带来的影响;进行DNA数据库和亲子关系判定所用的基因座应不少于23个。 展开更多
关键词 法医物证学 单亲二联体随机匹配概率 R软件 dna数据库
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数据存储结构与检索效率关系的研究——关于DNA数据存储结构与比对效率
7
作者 侯丛 马玉祥 刘彦明 《现代计算机》 2004年第1期6-9,共4页
数据库系统区别于其他系统的重要方面之一是DBMS具有有效地处理非常大量数据的能力,但随着数据量的增长,数据的检索速度日益捉襟见肘,如何提高数据的检索效率逐渐受到重视,特别是在一些特殊领域对数据的实时性要求较高的情况下,更需要... 数据库系统区别于其他系统的重要方面之一是DBMS具有有效地处理非常大量数据的能力,但随着数据量的增长,数据的检索速度日益捉襟见肘,如何提高数据的检索效率逐渐受到重视,特别是在一些特殊领域对数据的实时性要求较高的情况下,更需要快速的数据检索。本文正是基于此考虑,以DNA的数据存储为例,针对DNA数据的特点及实际比对的需要,通过具体的数据库实现技术,分析了存储结构对数据库访问速度的影响,在此基础上通过对几个具体方案的实际测试,给出了一个相对较优的数据库存储结构解决方案。 展开更多
关键词 数据库系统 数据存储结构 数据检索 DBMS 检索效率 dna
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AUTOMATIC SEARCHING OF CONTROL POINT IN NOAA AVHRR IMAGE
8
作者 Shu Ning Shi Huaxiang 《Geo-Spatial Information Science》 1999年第1期26-29,67,共5页
This paper discusses the approaches for automatical searching of control points in the NOAA AVHRR image on the basis of data rearrangement in the form of latitude and longitude grid. The vegetation index transformatio... This paper discusses the approaches for automatical searching of control points in the NOAA AVHRR image on the basis of data rearrangement in the form of latitude and longitude grid. The vegetation index transformation and multi-level matching strategies have been proven effective and successful as the experiments show while the control point database is established. 展开更多
关键词 control point database automatical searching grid IMAGE VEGETATION index transformation MULTI-LEVEL matching NOAA AVHRR IMAGE
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用基于移动均值的索引实现时间序列相似查询 被引量:4
9
作者 林子雨 杨冬青 王腾蛟 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2008年第9期2349-2361,共13页
提出了基于移动均值的索引来解决子序列匹配中的“ε-查询”问题:提出并证明了基于移动均值的缩距定理和缩距比关系定理,后者具有很好的“裁减”能力,可以在相似查询时淘汰大部分不符合条件的候选时间序列,从而达到快速相似查找的... 提出了基于移动均值的索引来解决子序列匹配中的“ε-查询”问题:提出并证明了基于移动均值的缩距定理和缩距比关系定理,后者具有很好的“裁减”能力,可以在相似查询时淘汰大部分不符合条件的候选时间序列,从而达到快速相似查找的目的引入了由Jagadish等人提出的BATON^*-树,并在此基础上适当修改,建立了MABI索引,极大地加快了相似查询过程;最后,在一个股票交易数据集上进行了实验,证明了MABI索引的良好性能. 展开更多
关键词 相似查询 子序列匹配 移动均值 时间序列数据库
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有理区间的安全多方计算与应用 被引量:6
10
作者 窦家维 王文丽 +1 位作者 刘旭红 李顺东 《电子学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第9期2057-2062,共6页
本文研究了有理数与有理区间的位置关系以及两个有理区间位置关系的安全多方计算.它们已广泛应用于数据库匹配、定位搜索等领域,是保密科学计算的一个重要分支.但目前已有文献在解决有理数与有理区间的位置关系时提出的协议效率较低,且... 本文研究了有理数与有理区间的位置关系以及两个有理区间位置关系的安全多方计算.它们已广泛应用于数据库匹配、定位搜索等领域,是保密科学计算的一个重要分支.但目前已有文献在解决有理数与有理区间的位置关系时提出的协议效率较低,且两个有理区间位置关系问题的研究较为有限.针对这些问题,本文首先用多项式表示区间,将有理数与有理区间位置关系问题转化为整数向量的内积符号判定问题,设计了新的有理数与有理区间的保密计算协议.其次,以有理数与有理区间协议作为基础模块,设计了两个有理区间位置关系的保密计算协议.最后,理论分析及实验结果均表明本文方案是安全高效的,并给出了本文协议在有理数域上的百万富翁问题及计算几何问题的应用. 展开更多
关键词 密码学 安全多方计算 有理数 有理区间 数据库匹配 定位搜索 百万富翁问题 计算几何
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一种新颖的蛋白质序列与其串联质谱的匹配打分算法 被引量:1
11
作者 于长永 王国仁 +1 位作者 毛克明 翟文丹 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2010年第3期404-407,共4页
为了有效的利用蛋白质串联质谱数据,提高蛋白质鉴定的准确性,提出一种基于KNN的蛋白质序列与蛋白质串联质谱的匹配打分算法.蛋白质序列与蛋白质串联质谱的匹配打分是蛋白质数据库搜索鉴定过程中的关键技术.然而,现有的算法没有很好的利... 为了有效的利用蛋白质串联质谱数据,提高蛋白质鉴定的准确性,提出一种基于KNN的蛋白质序列与蛋白质串联质谱的匹配打分算法.蛋白质序列与蛋白质串联质谱的匹配打分是蛋白质数据库搜索鉴定过程中的关键技术.然而,现有的算法没有很好的利用蛋白质串联质谱中离子的强度信息.针对此问题,本文根据质谱中离子的类型给出了全体离子的一个合理的划分,进而抽象出一个高维的强度特征向量,在已知的高精度的数据集上建立了强度匹配知识集合,最后基于KNN技术构造了序列和质谱的匹配打分算法.实验结果表明,本文算法更加有效的利用了蛋白质串联质谱的结构信息,提高了蛋白质鉴定的准确性. 展开更多
关键词 蛋白质鉴定 串联质谱 数据库搜索 匹配打分
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携带双毒力基因的副溶血性弧菌tdh、trh基因分子特征研究 被引量:2
12
作者 王红 黄彦 +5 位作者 唐振柱 李秀桂 孙贵娟 吕素玲 黄立嵘 程国强 《应用预防医学》 2010年第5期257-259,共3页
目的了解广西境内海产品牡蛎中分离到的携带tdh和trh两种毒力基因的副溶血性弧菌GX21的基因分子特征,分析与各地副溶血性弧菌的相关性,探讨水产品中副溶血性弧菌流行趋势。方法将监测海产品牡蛎中分离到的一株携带两毒素基因的副溶血性... 目的了解广西境内海产品牡蛎中分离到的携带tdh和trh两种毒力基因的副溶血性弧菌GX21的基因分子特征,分析与各地副溶血性弧菌的相关性,探讨水产品中副溶血性弧菌流行趋势。方法将监测海产品牡蛎中分离到的一株携带两毒素基因的副溶血性弧菌应用双重PCR的方法检测该菌tdh和trh两种毒力基因。把扩增产物切胶纯化后测序,将测序序列在GenBank DNA序列数据库上BLAST比对,分析比较结果。结果两扩增产物tdh-A和trh-A的序列与GenBank数据库中的多个序列有极高的相似度,最高达99%,只有一个碱基的错配或一个gaps。结论扩增产物tdh-A为副溶血性弧菌GX21的tdh基因不完全cds,trh-A为副溶血性弧菌GX21的trh基因不完全cds。比对表明副溶血性弧菌GX21与日本学者在1994年公布的副溶血性弧菌(TH3766)有很高的同源性。 展开更多
关键词 副溶血性弧菌 毒力基因 GENBANK数据库 比对
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温州地区人群21个STR基因座的突变情况分析 被引量:2
13
作者 林琳 蒋欢畅 +1 位作者 任苹 吴淑珍 《温州医科大学学报》 2022年第5期388-393,共6页
目的:观察和分析温州地区人群21个常染色体STR基因座的突变情况及其特征。方法:收集9418例支持亲权关系的亲权鉴定案件共21200个样本,采用AGCU EX22人类荧光标记STR复合扩增检测试剂进行扩增,比较各基因座的突变率和突变等位基因的亲代... 目的:观察和分析温州地区人群21个常染色体STR基因座的突变情况及其特征。方法:收集9418例支持亲权关系的亲权鉴定案件共21200个样本,采用AGCU EX22人类荧光标记STR复合扩增检测试剂进行扩增,比较各基因座的突变率和突变等位基因的亲代来源、片段大小、突变步数及重复单位的增减比例、方向的频次,分析突变各相关因素之间的相互关系。结果:9418例亲子鉴定中共发现314例突变,观察到319个突变事件;21个基因座中,观察到20个基因座发生突变,突变率为0.08‰~3.48‰,各基因座突变率间差异无统计学意义(χ^(2)=29.77,P>0.05);父源突变与母源突变的比例为4.78:1,父源等位基因发生突变的概率总体上大于母源等位基因发生突变的概率,差异有统计学意义(t=4.55,P<0.05);父源突变和母源突变出现重复单位增加、减少与不确定3种频次的差异无统计学意义(χ^(2)=0.28,P>0.05);一步突变与二步及以上突变中出现的重复单位增加、减少与不确定3种频次的差异具有统计学意义(χ^(2)=7.22,P<0.05);短、中、长片段等位基因突变出现的重复单位增加、减少与不确定3种频次的差异具有统计学意义(χ^(2)=26.81,P<0.05)。结论:常染色体STR基因座等位基因突变现象较为常见,在法医学亲权鉴定和DNA寻亲数据库建设中应引起注意。 展开更多
关键词 STR基因座 等位基因突变 温州地区人群 dna寻亲数据库
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一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法
14
作者 于长永 王国仁 +1 位作者 毛克明 翟文丹 《东北大学学报(自然科学版)》 EI CAS CSCD 北大核心 2009年第1期50-53,共4页
为了有效地利用蛋白质串联质谱数据,提高蛋白质鉴定的准确性,提出了一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法——ITPIA(information theory based protein identification algorithm)算法.针对多肽串联质谱质量低、噪音多等问题,ITPI... 为了有效地利用蛋白质串联质谱数据,提高蛋白质鉴定的准确性,提出了一种基于信息论的蛋白质数据库搜索鉴定算法——ITPIA(information theory based protein identification algorithm)算法.针对多肽串联质谱质量低、噪音多等问题,ITPIA算法利用了信息论中的熵理论提出了一种有效的实验串联质谱和多肽的理论质谱的匹配打分算法.该算法更大程度上从多肽串联质谱中获得蛋白质的结构信息.实验结果表明,ITPIA算法有效地提高了蛋白质鉴定的准确性. 展开更多
关键词 蛋白质鉴定 串联质谱 数据库搜索 信息论 匹配算法
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关系数据库关键字查询方法研究 被引量:3
15
作者 崔婉秋 李昕 +2 位作者 孟祥福 崔岩 王大伟 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2016年第12期2702-2707,共6页
数据库(DB)结合了信息检索(IR)技术便捷的查询形式,为用户在同样的信息平台上提供便利的获取信息的手段.一方面由数据库管理系统提供的复杂数据库工具,能够协助用户使用SQL语言查询结构化信息;另一方面信息检索技术允许用户使用基于得... 数据库(DB)结合了信息检索(IR)技术便捷的查询形式,为用户在同样的信息平台上提供便利的获取信息的手段.一方面由数据库管理系统提供的复杂数据库工具,能够协助用户使用SQL语言查询结构化信息;另一方面信息检索技术允许用户使用基于得分和等级的关键字方式搜索非结构化信息,在该过程中用户不需要了解任何数据库的模式信息.对现有典型的关系数据库上的关键字检索方法进行总结,主要针对模式图和数据图的两种模式进行归纳,详细分析了主要算法及改进,并比较了各种算法的优势和不足.通过对数据库中潜在的语义关系进行研究,给出了在语义匹配等方面的应用及面临的发展趋势. 展开更多
关键词 关系数据库 关键字查询 算法归纳 语义匹配
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家系排查中Y-STR突变分析 被引量:16
16
作者 李鸿雷 张旭 +4 位作者 孙辉 王占洪 张二伟 李万水 莫晓婷 《刑事技术》 2018年第6期501-504,共4页
近年来,将Y-STR检验法引进到侦查学领域,创立的"Y-STR家系排查法"已经成为了破案的新手段。但是,在父子相传的过程中,会发生Y-STR的突变,导致同一家系相关男性亲属的分型存在差异,亲缘关系越远,则Y-STR分型不一致的概率则越... 近年来,将Y-STR检验法引进到侦查学领域,创立的"Y-STR家系排查法"已经成为了破案的新手段。但是,在父子相传的过程中,会发生Y-STR的突变,导致同一家系相关男性亲属的分型存在差异,亲缘关系越远,则Y-STR分型不一致的概率则越大。一旦排查比中与现场物证Y-STR分型相似的个体,很难准确判断其家系是否为犯罪嫌疑人所在家系。本文以家系排查中出现4个Y-STR基因座突变的案件为例,探讨家系排查中数据分析方法和原则。 展开更多
关键词 法医遗传 家系排查 Y-STR突变率 dna数据库 Y染色体
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不完整STR分型的价值挖掘 被引量:5
17
作者 陈静 苑美青 +3 位作者 谢群 徐秀兰 徐珍 李万水 《刑事技术》 2015年第5期376-378,共3页
清晰的DNA图谱对于认定犯罪嫌疑人具有决定性的证据作用。然而在实际检验中,经常得到不完整DNA图谱或混合图谱,相关案件因无法查询比对而长期搁置成为"冷案"。本文从这一难题出发,结合混合样品人工拆分和"全国公安机关DN... 清晰的DNA图谱对于认定犯罪嫌疑人具有决定性的证据作用。然而在实际检验中,经常得到不完整DNA图谱或混合图谱,相关案件因无法查询比对而长期搁置成为"冷案"。本文从这一难题出发,结合混合样品人工拆分和"全国公安机关DNA数据库快速协查平台",对2011年的未破积案进行梳理,为21起未破案件中的19起查拆分出有价值的DNA分型,并成功告破两起命案。通过深度挖掘不完整STR分型的潜在利用价值,大大提高了"休眠"DNA信息的使用效率,为形成破案模式的新常态提供了思路和借鉴。 展开更多
关键词 法医遗传学 不完整STR分型 混合分型 拆分 数据库检索
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多条件动态数据查询和控制方法
18
作者 严晖 《电脑学习》 2003年第2期42-44,共3页
通过具体的实例,介绍了如何利用VFP实现多条件动态数据查询,提供了用于多条件操作控件的控制和数据匹配的解决方案。
关键词 多条件动态数据查询 控制方法 数据库 VISUALFOXPRO 数据匹配 数据管理系统
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质谱匹配概率方法及结果可靠性评价 被引量:3
19
作者 殷龙彪 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 1992年第2期137-143,共7页
质谱匹配概率方法不仅能提供纯样品的分析结果,而且也能区分混合物中的成分。因而为大大提高对质谱数据的分析能力提供了可能性,并扩大了它在有机物鉴定方面的应用。本文介绍该方法作环境空气中有机物质谱分析及与综合控制系统资料的比... 质谱匹配概率方法不仅能提供纯样品的分析结果,而且也能区分混合物中的成分。因而为大大提高对质谱数据的分析能力提供了可能性,并扩大了它在有机物鉴定方面的应用。本文介绍该方法作环境空气中有机物质谱分析及与综合控制系统资料的比较,并以美国标准局的标准参考数据库作比较。 展开更多
关键词 质谱 匹配概率检索 质谱库
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DNA家系搜索的现状及展望
20
作者 郭瑜鑫 张星茹 +4 位作者 王禹 毛坤云 杭美洋 季观庆 朱波峰 《中国法医学杂志》 CSCD 2023年第5期481-485,共5页
DNA家系搜索是一种基于DNA信息的遗传学分析方法,为明确家族关系、识别未知遗骸、解决冷案及辨认失踪人员等民事和刑事侦查提供有力线索。近年来,随着DNA检测技术及分析方法的不断进步和广泛应用,DNA家系搜索在法医学、人类遗传学等领... DNA家系搜索是一种基于DNA信息的遗传学分析方法,为明确家族关系、识别未知遗骸、解决冷案及辨认失踪人员等民事和刑事侦查提供有力线索。近年来,随着DNA检测技术及分析方法的不断进步和广泛应用,DNA家系搜索在法医学、人类遗传学等领域中备受关注。与此同时,DNA家系搜索也面临着伦理和技术等方面的挑战。本文归纳了多种类型遗传标记在DNA家系搜索中的应用,梳理了进行DNA家系搜索时依据的相关DNA数据库建立现状及制度规范,讨论了DNA样本的获取、数据分析与隐私保护等问题,同时提出了未来DNA家系搜索的发展方向与挑战。在技术方法上,需要针对DNA数据的多样性和复杂性进行更加精准的分析和解读;在伦理方面,需要建立更加完善的隐私保护制度与措施,确保个人信息的保密性和安全性。 展开更多
关键词 dna家系搜索 dna数据库 制度规范
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