期刊文献+
共找到1,605篇文章
< 1 2 81 >
每页显示 20 50 100
KRT18与mRNA及长链非编码RNA互作调控椎间盘髓核细胞损伤的机制
1
作者 刘钟元 李扬 张志文 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第2期312-321,共10页
背景:椎间盘中差异表达的RNA结合蛋白在椎间盘退变中发挥着关键作用,其中RNA结合蛋白KRT18水平的降低与椎间盘退行性病变相关,但其在椎间盘髓核细胞中的具体作用尚未完全确定。目的:探讨KRT18与mRNA及长链非编码RNA结合互作对椎间盘髓... 背景:椎间盘中差异表达的RNA结合蛋白在椎间盘退变中发挥着关键作用,其中RNA结合蛋白KRT18水平的降低与椎间盘退行性病变相关,但其在椎间盘髓核细胞中的具体作用尚未完全确定。目的:探讨KRT18与mRNA及长链非编码RNA结合互作对椎间盘髓核细胞的影响及机制。方法:对因腰部骨折或椎间盘退行性病变而接受椎间融合术的患者进行人体髓核组织取样获得正常髓核细胞和退变髓核细胞,并进行iRIP-seq、功能富集分析以及DNA微阵列分析,随后根据分析结果在髓核细胞中敲低KRT18,通过蛋白免疫印迹及qRt-PCR在蛋白和RNA水平检测相关基因水平的表达。结果与结论:通过iRIP-seq分析发现GUAAUC和AGCCUC序列中存在大量的KRT18结合位点,表明KRT18可参与调控RNA的转录、翻译、稳定性或在细胞信号传导途径中发挥作用。其能够与成熟的mRNA稳定结合,其中表达较高的基因包括CRLF1及IGFBP4等,同时与其结合的长链非编码RNA的峰值基因包括SNHG25、SNHG12、NEAT1、USP32、EIF4A2和CDH4,这些基因多涉及细胞凋亡、炎症等多种生物过程,并且能介导细胞外基质代谢的相关通路,KRT18能够调控它们的稳定性、转运、翻译、剪接等多个方面的功能,进而影响基因的表达和细胞功能。实验结果验证了在髓核细胞中敲低KRT18,细胞外基质代谢水平被抑制出现失衡,导致体外椎间盘退变。该研究首次从KRT18与mRNA及长链非编码RNA结合的角度探讨其调控机制,并推测了KRT18在椎间盘退变发病机制中的潜在功能,为今后KRT18关键功能的研究奠定了基础。 展开更多
关键词 椎间盘退行性变 rna结合蛋白 KRT18 iRIP-seq mrna 长链非编码rna
下载PDF
参芪复方对糖尿病GK大鼠肝脏组织mRNA、lncRNA表达谱的影响
2
作者 刘桠 张翕宇 +2 位作者 谢春光 徐刚 彭思涵 《中华中医药学刊》 CAS 北大核心 2024年第1期46-51,I0008-I0012,共11页
目的应用全转录组测序与实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术,探索参芪复方调控糖尿病GK大鼠肝脏信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的机制研究。方法采... 目的应用全转录组测序与实时聚合酶链锁反应(Real-time polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术,探索参芪复方调控糖尿病GK大鼠肝脏信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的机制研究。方法采用高脂高糖饲料建立2型糖尿病模型,将GK大鼠随机分为模型组、参芪复方组和西药组。另将10只Wistar大鼠设为空白组,予普通饲料喂养。参芪复方组大鼠予参芪复方浸膏灌胃,西药组予西格列汀混悬液灌胃,模型组及空白组灌服生理盐水。干预12周,每周检测空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)。运用HE染色法观察大鼠肝脏组织病理形态,在空白组、模型组和参芪复方组中每组随机选取4只大鼠进行全转录组测序,构建mRNA、lncRNA差异表达谱,分析差异基因生物学功能,并进行RT-qPCR验证。结果与空白组相比,糖尿病GK大鼠FBG显著升高(P<0.05),模型组大鼠肝脏可见肝细胞排列紊乱,边界模糊,出现弥漫空泡状改变,呈中度脂肪变性,伴见炎性浸润、弥漫水肿;与模型组相比,参芪复方组大鼠FBG在12周时明显降低(P<0.05),肝脏组织排列较整齐,脂质沉积、细胞水肿及炎细胞浸润明显减轻。全转录组结果显示,与空白组相比,模型组大鼠mRNA、lncRNA表达谱存在显著差异,决定了糖尿病大鼠生理病理上的差异表现。参芪复方可广泛调控mRNA、lncRNA的差异表达,富集分析显示参芪复方通过调控多条内分泌系统及代谢过程相关信号通路改善糖尿病,包括胰岛素分泌、非酒精性脂肪性肝病、胆固醇代谢、鞘脂代谢、胰岛素抵抗等信号通路。RT-qPCR结果显示,基因Irf1、Trim30、Tmcc3、Insig1与转录组结果一致,转录组准确性较高。结论参芪复方发挥调节血糖及改善肝脏脂质沉积、水肿的作用,可能与广泛调控mRNA、lncRNA的差异表达有关。 展开更多
关键词 参芪复方 2型糖尿病 长链非编码rna(lncrna) 信使rna(mrna)
下载PDF
基于RNA-seq不明原因复发性流产绒毛组织mRNA基因差异性表达研究
3
作者 杨丽 杨静 +2 位作者 叶尔登切切克 韩锐 腊晓琳 《国际妇产科学杂志》 CAS 2024年第3期322-328,341,共8页
目的:构建不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)孕妇绒毛组织的mRNA差异性表达谱并进行功能分析,为阐明URSA的发生发展机制提供依据。方法:收集2022年3月于新疆医科大学第一附属医院妇科门诊收治的4例U... 目的:构建不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)孕妇绒毛组织的mRNA差异性表达谱并进行功能分析,为阐明URSA的发生发展机制提供依据。方法:收集2022年3月于新疆医科大学第一附属医院妇科门诊收治的4例URSA(试验组)和4例选择性终止妊娠孕妇(对照组)的绒毛组织样本。应用转录组测序技术(RNA-seq)筛选2组差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其进行GO功能注释、KEGG通路分析及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,进一步研究差异表达mRNA的功能,并筛选出URSA的关键基因。结果:RNA-seq分析共筛选出3350个DEGs,其中上调基因2259个,下调基因1091个。通过PPI网络分析,筛选出与URSA有关的前10个关键基因:TYROBP、CD74、GH1、GH2、STAT5A、HLA-DRA、STAT5B、HLA-DRB1、CISH和HLA-A。通过GO和KEGG生物学功能分析,发现差异性表达的mRNA参与到多种白细胞分化相关免疫反应通路和同种异体免疫应答等生物学过程。结论:利用RNA-seq获得的URSA的mRNA差异性表达谱,筛选出可能与URSA有关的关键基因及生物学通路,为进一步研究URSA的发病机制和诊疗靶点提供了理论依据。 展开更多
关键词 流产 习惯性 绒毛组织 rna 信使 转录组测序 免疫调节
下载PDF
Regulation of Gonadotropin-Releasing Hormone(GnRH)Secretion and mRNA Expression by Dopamine and cAMP Second Messenger Pathway in a GnRH Neuronal Cell Line
4
作者 K.L.Yu M.H.Tsang K.W.Dong 《中山大学学报论丛》 1995年第3期197-197,共1页
关键词 GnRH)Secretion and mrna Expression by Dopamine and cAMP Second messenger Pathway in a GnRH Neuronal Cell Line Regulation of Gonadotropin-Releasing Hormone
下载PDF
不同日龄白羽王鸽胸肌中lncRNA和mRNA功能分析
5
作者 张弛 刘超 +5 位作者 王一曼 苗冬枝 陈静 王莹 杨海明 王志跃 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期1827-1836,共10页
【目的】分析不同日龄乳鸽胸肌发育的差异长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA,确定影响乳鸽生长发育的关键候选基因,探究乳鸽生长发育的分子机制,为促进乳鸽生长发育的研究提供理论基础。【方法】乳鸽于1(D1)、7(D7)、14(D14)和25(D25)日龄分... 【目的】分析不同日龄乳鸽胸肌发育的差异长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA,确定影响乳鸽生长发育的关键候选基因,探究乳鸽生长发育的分子机制,为促进乳鸽生长发育的研究提供理论基础。【方法】乳鸽于1(D1)、7(D7)、14(D14)和25(D25)日龄分别称重,随后在D7和D25时进行屠宰,利用RNA-Seq技术对所选日龄白羽王鸽胸肌的lncRNA进行测序并预测其靶基因,构建lncRNA-mRNA互作网络,对筛选的差异表达lncRNA进行GO功能和KEGG通路富集分析,并利用实时荧光定量PCR验证测序结果的可靠性。【结果】乳鸽于7~14日龄日增重最快,25日龄乳鸽体重到达上市日龄。从构建的6个文库中共获得56421个lncRNAs和30208个mRNAs,其中2335个lncRNAs差异表达,靶向1553个mRNAs。lncRNA-mRNA调控网络显示,lncRNA与mRNA间存在相互调控。GO与KEGG分析结果显示,差异基因与GTpase活性等相关,差异lncRNAs及其靶基因主要富集在MAPK信号通路、骨骼肌组织发育、TGF-β信号通路、Notch信号通路等信号通路,关键lncRNAs可能通过这些信号通路调控乳鸽胸肌发育。其中LTCONS_00012834、LTCONS_00032767、LTCONS_00045211和LTCONS_00002003分别靶向XIRP 1、PITX 3、BMPR 1 B、MYLK 4基因,发挥关键作用。实时荧光定量结果与高通量测序结果趋势一致,说明测序数据的可靠性。【结论】本研究共获得了2335个差异表达lncRNAs和1553个mRNAs,4个差异表达lncRNAs:LTCONS_00032767、LTCONS_00012834、LTCONS_00002003、LTCONS_00045211分别靶向与骨骼肌发育相关基因PITX 3、XIRP 1、MYLK 4和BMPR 1 B,且这些基因受到多个lncRNA的调控。结果为阐明乳鸽胸肌生长发育的分子机制以及白羽王鸽的分子选育提供了理论基础。 展开更多
关键词 白羽王鸽 胸肌 长链非编码rna mrna
下载PDF
弱精子症患者精子lncRNA与mRNA基因表达特征分析
6
作者 石水波 罗龙华 +4 位作者 刘莲 黄学明 熊素萍 宋丹丹 李冬水 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2024年第9期782-788,共7页
目的:通过DNBSEQ平台测序技术构建文库,并以此来确定人类正常与弱精子症精子中lncRNA和mRNA的表达差异,并通过生物信息学方法分析其在弱精子症中的生物学意义。方法:将9份正常精液样本及9份弱精子症精液样本分组后,分离精子,提取总RNA,... 目的:通过DNBSEQ平台测序技术构建文库,并以此来确定人类正常与弱精子症精子中lncRNA和mRNA的表达差异,并通过生物信息学方法分析其在弱精子症中的生物学意义。方法:将9份正常精液样本及9份弱精子症精液样本分组后,分离精子,提取总RNA,通过DNBSEQ测序平台检测得到RNA-seq在精子中的表达情况,通过GO富集分析和KEGG通路分析,进一步分析其相关功能情况。结果:使用DNBSEQ平台检测,每组平均产出10.64G数据,共检测到282185个RNA,包含有107009个lncRNA,其中15157个lncRNA具有表达差异,2190个lncRNA表达上调,12967个表达下调;共检测到19514个mRNA,其中13736个mRNA具有表达差异,4995个mRNA表达上调,8741个mRNA表达下调。差异基因主要富集在精子细胞膜、离子通道的功能以及精子发育、受精相关的通路上。结论:通过对弱精子症与正常精子的测序分析,鉴别出差异表达的lncRNA和mRNA,可通过胞膜离子通道对精子功能进行调控,进而导致弱精子症的发生,可为弱精子症的进一步研究提供分子基础。 展开更多
关键词 长链非编码rna 弱精子症 rna测序 差异表达分析
下载PDF
妊娠期高血压病患者血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1水平表达与妊娠结局的关系
7
作者 侯书利 张金玲 +1 位作者 李燕 李晓晓 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第5期47-53,共7页
目的分析妊娠期高血压疾病(hypertensive disorder complicating pregnancy,HDCP)患者血清DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA)尿路上皮癌胚抗原1(ur... 目的分析妊娠期高血压疾病(hypertensive disorder complicating pregnancy,HDCP)患者血清DNA甲基转移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)信使RNA(messenger RNA,mRNA)、长链非编码RNA(long non-codingRNA,LncRNA)尿路上皮癌胚抗原1(urothelial carcinoembryonic antigen 1,UCA1)水平与妊娠结局的关系。方法选取2021年3月~2023年8月在邯郸市妇幼保健院诊治的HDCP患者195例为病例组、健康妊娠孕妇195例为对照组。收集所有孕妇临床资料并检测分娩前1天生化指标;荧光定量PCR法检测血清DNMT1 mRNA,LncRNA UCA1水平;根据病情将病例组分为妊娠期高血压(pregnancy induced hypertension,PIH)组、轻度子痫前期(preeclampsia,PE)组、重度PE组;根据HDCP患者分娩时不良妊娠结局情况分为妊娠结局良好组和妊娠结局不良组;比较对照组和病例组临床资料和生化指标、血清DNMT1 mRNA,LncRNA UCA1水平;比较不同严重程度HDCP患者血清DNMT1mRNA和LncRNA UCA1水平;比较不同妊娠结局HDCP患者临床资料和生化指标、血清DNMT1 mRNA和LncRNAUCA1水平;分析HDCP患者血清DNMT1 mRNA与LncRNA UCA1的相关性,影响HDCP患者妊娠结局的因素,血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1对HDCP患者发生不良妊娠结局的预测价值。结果与对照组比较,病例组收缩压、舒张压、白细胞计数水平明显升高,血清DNMT1 mRNA(0.72±0.18 vs 1.00±0.04),LncRNA UCA1(0.61±0.16vs 1.00±0.02)水平明显降低,差异具有统计学意义(t=40.651,32.595,7.837,21.205,33.775,均P<0.001);PIH组、轻度PE组、重度PE组血清DNMT1 mRNA(0.85±0.20,0.74±0.18,0.50±0.15),LncRNA UCA1(0.77±0.18,0.58±0.16,0.43±0.13)水平依次降低,差异具有统计学意义(F=52.687,64.030,均P<0.001);HDCP患者血清DNMT1 mRNA与LncRNA UCA1呈正相关(r=0.582,P<0.001);与妊娠结局良好组比较,妊娠结局不良组HDCP严重程度较高,收缩压、舒张压、白细胞计数水平明显升高,血清DNMT1 mRNA(0.80±0.20 vs 0.59±0.15),LncRNA UCA1(0.72±0.17 vs 0.43±0.14)水平明显降低,差异具有统计学意义(χ^(2)=18.386,t=2.615~12.290,均P<0.05);重度PE[OR(95%CI)=1.708(1.193~2.445)]、收缩压[OR(95%CI)=1.495(1.090~2.049)]、舒张压[OR(95%CI)=1.621(1.076~2.442)]是影响HDCP患者发生不良妊娠结局的危险因素,DNMT1 mRNA[OR(95%CI)=0.833(0.725~0.957)],LncRNA UCA1[OR(95%CI)=0.796(0.696~0.909)]是影响HDCP患者发生不良妊娠结局的保护因素(均P<0.05);DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1二者联合预测HDCP患者发生不良妊娠结局的曲线下面积(area under curve,AUC)大于DNMT1 mRNA及LncRNA UCA1单独预测的AUC(0.926 vs 0.832,0.844),差异具有统计学意义(Z=2.932,2.345,均P<0.05)。结论HDCP患者血清DNMT1 mRNA和LncRNA UCA1水平均较低,与病情程度、妊娠结局相关,DNMT1 mRNA联合LncRNA UCA1检测对不良妊娠结局有较佳预测效能。 展开更多
关键词 妊娠期高血压疾病 DNA甲基转移酶1信使rna 长链非编码rna尿路上皮癌胚抗原1 妊娠结局
下载PDF
基于生物信息学构建膀胱尿路上皮癌的ceRNA网络以及关键mRNA与免疫功能分析
8
作者 邵波 汪进 +5 位作者 万水 吴开秀 田申 杜沂宸 陈丹霞 马园园 《现代检验医学杂志》 CAS 2024年第1期29-35,66,共8页
目的构建膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)具有预后价值的内源竞争性核糖核酸(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,分析关键信使RNA(messenger RNA,mRNA)与免疫功能的关系。方法UCSC Xena数据库下载404例BLCA... 目的构建膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)具有预后价值的内源竞争性核糖核酸(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,分析关键信使RNA(messenger RNA,mRNA)与免疫功能的关系。方法UCSC Xena数据库下载404例BLCA患者和28例正常人的mRNA表达数据,通过差异分析筛选关键mRNA。ENCORI数据库中查找与关键mRNA结合的微小核糖核酸(micro RNA,miRNA)以及与miRNA结合的长链非编码核糖核酸(long non-coding RNA,LncRNA)。TCGA数据库下载miRNA和LncRNA的表达数据,对关键mRNA与所有miRNA以及mi RNA与所有LncRNA进行共表达分析,筛选出关键的miRNA和LncRNA。根据关键mRNA,miRNA和LncRNA在肿瘤患者和正常人之间表达量的差异进行生存分析,最后构建了ceRNA调控网络。借助TIMER 2.0数据库,分析关键mRNA与免疫细胞、免疫检查点(CD274,PDCD1,CTLA4)以及免疫细胞标记基因(immunomarker genes,IG)的相关性。结果筛选出关键mRNA*共22个,其中差异显著性最高的是脯氨酸3-羟化酶4(proline3-hydroxylase 4,P3H4)。在BLCA中,P3H4表达高,在高表达组患者的生存时间较短。以关键mRNA为中心环节,共筛选出33个miRNA和14个LncRNA。经过共表达分析和生存分析后,筛选出具有预后价值的关键miRNA和关键LncRNA分别为hsa-miR-151a-3p和MIR100HG。上述分析结果差异具有统计学意义(均Ρ<0.05)。综合以上结果,构建了包含1个mRNA,1个miRNA和1个LncRNA的ceRNA调控网络。免疫分析首次在BLCA肿瘤微环境中发现了与P3H4表达量呈显著正相关的双阳性T细胞。此外还有3种免疫细胞(肿瘤相关性中性粒细胞、肿瘤相关巨噬细胞、树突状细胞)、3个免疫检查点(CD274,PDCD1,CTLA4)以及15个IG与P3H4相关度显著,这些差异具有统计学意义(均Ρ<0.01)。结论该研究有助于揭示BLCA的进展机制,构建的ceRNA网络及免疫分析,可为BLCA患者的诊断、治疗、预测提供新的生物学靶点和方向。 展开更多
关键词 膀胱尿路上皮癌 信使核糖核酸 内源竞争性rna 免疫功能
下载PDF
IL-17 mRNA和PGE2 mRNA在口腔扁平苔藓患者中的表达水平及临床意义
9
作者 李阳 王珑 《检验医学与临床》 CAS 2024年第8期1103-1106,共4页
目的探讨白细胞介素17(IL-17)信使RNA(mRNA)和前列腺素E2(PGE2)mRNA在口腔扁平苔藓(OLP)患者中的表达水平及临床意义。方法选取2020年3月至2021年3月宁夏医科大学总医院口腔医院收治的35例OLP患者作为试验组,另选取同期在宁夏医科大学... 目的探讨白细胞介素17(IL-17)信使RNA(mRNA)和前列腺素E2(PGE2)mRNA在口腔扁平苔藓(OLP)患者中的表达水平及临床意义。方法选取2020年3月至2021年3月宁夏医科大学总医院口腔医院收治的35例OLP患者作为试验组,另选取同期在宁夏医科大学总医院口腔医院进行阻生牙拔除的20例患者作为对照组,根据组织是否糜烂,将试验组患者分为糜烂型OLP组和非糜烂型OLP组。检测并比较糜烂型OLP组和非糜烂型OLP组患者口腔黏膜病损组织及对照组患者口腔黏膜组织的IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平,并通过视觉模拟评分法(VAS)评估OLP患者的疼痛程度,比较不同疼痛程度的OLP患者IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平。采用Pearson相关分析OLP患者IL-17 mRNA与PGE2 mRNA表达水平的相关性。采用Spearman相关分析OLP患者IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平与疼痛程度的相关性。结果非糜烂型OLP组有19例患者,糜烂型OLP组有16例患者。糜烂型OLP组IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平均高于非糜烂型OLP组和对照组,且非糜烂型OLP组均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。试验组中无疼痛患者有5例,轻度疼痛患者有6例,中度疼痛患者有16例,重度疼痛患者有8例。无疼痛OLP患者IL-17 mRNA和PGE2 mRNA表达水平均低于轻度、中度、重度疼痛OLP患者,差异均有统计学意义(P<0.05)。Pearson相关分析结果显示,OLP患者IL-17 mRNA表达水平与PGE2 mRNA表达水平呈正相关(r=0.505,P=0.002)。Spearman相关分析结果显示,OLP患者IL-17 mRNA、PGE2 mRNA表达水平与疼痛程度均呈正相关(r=0.710、0.570,P<0.05)。结论IL-17 mRNA和PGE2 mRNA参与了OLP的发生、发展过程,并且其表达水平与OLP患者疼痛程度呈正相关。 展开更多
关键词 口腔扁平苔藓 白细胞介素17 前列腺素2 疼痛程度 信使rna
下载PDF
Comparison of gene expression between normalcolon mucosa and colon carcinoma by means of messenger RNA differential display 被引量:4
10
作者 Wang L Lu W +2 位作者 Chen YG Zhou XM Gu JR 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1999年第6期533-534,共2页
关键词 COLONIC MUCOSA COLONIC NEOPLASMS rna messenger gene expression
下载PDF
Significance of vascular endothelial growth factor messenger RNA expression in gastric cancer 被引量:16
11
作者 TAO Hou-Quan LIN Yan-Zhen WANG Rui-Nian 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第1期15-18,共4页
IM To study VEGF mRNA expression in gastric carcinoma and to clarify the association of its expression with the clinicopathologic features of the disease.METHODS In situ hybridization (ISH) and histochemistry were u... IM To study VEGF mRNA expression in gastric carcinoma and to clarify the association of its expression with the clinicopathologic features of the disease.METHODS In situ hybridization (ISH) and histochemistry were used to examine and analyze the expression of VEGF mRNA and antigen, and microvessel count (MVC) in 28 cases of gastric carcinomatous tissue in combination with clinical materials.RESULTS Ninteen of 28 gastric carcinomas were positive for VEGF mRNA. VEGF mRNA was mainly expressed in malignant cells and not in normal epithelium of gastric mucosa. Its expression was further increased in tumor cells adjacent to tumor necrosis zones, where stromal cells expressed VEGF mRNA occasionally. There was a close correlation between MVC and VEGF mRNA positivity (P<0005). High VEGF mRNA levels were significantly associated with serosal invasion, lymph node metastasis and TNM staging (P<005, respectively).CONCLUSION VEGF mRNA expression is associated with tumor invasion and metastasis by stimulating angiogenesis in gastric carcinoma.expression; endothelial growth factor. 展开更多
关键词 stomach neoplasms rna messenger neoplasm metastasis GENE
下载PDF
Expression of alpha-fetoprotein messenger RNA in BEL-7404 human hepatoma cells and effect of L-4-oxalysine on the expression 被引量:3
12
作者 WANG XingWang and XU BinKeywords oxalysine liver neoplasms +5 位作者 fetoprotein tumor cell, cultured RNA, messenger gene expression in situ hybridization immunohistochemistry 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第4期22-25,共4页
AIM To investigate alpha-fetoprotein (AFP) mRNA expression in BEL-7404 human hepatoma cells and the effect of L-4-oxalysine (OXL) on the expression.METHODS BEl-7404 human hepatoma cells were maintained in RPMI 1640 me... AIM To investigate alpha-fetoprotein (AFP) mRNA expression in BEL-7404 human hepatoma cells and the effect of L-4-oxalysine (OXL) on the expression.METHODS BEl-7404 human hepatoma cells were maintained in RPMI 1640 media. Human AFP cDNA probe was labelled with digoxigenin-11-dUTP by the random primer labelling method. The expression of AFP mRNA in Bel-7404 cells was determined by an in situ hybridization technique with digoxigenin-labelled human AFP cDNA probe. The positive intensities of AFP mRNA in cells were analyzed by microspectrophotometer and expressed as absorbance at 470nm. For the experiment with OXL, cells were incubated with various concentrations of the agent for 72h.RESULTS Essentially all the hepatoma cells contained AFP mRNA in the cytoplasm, although in various amounts. The specificity of the hybridization reaction was confirmed by control experiments in which the use of RNase-treated BEL-7404 cells, non-AFP-producing cells (HL-60 human leukemia cells) or a nonspecific cDNA probe resulted in negative hybridization. When the cells were treated with OXL (25, 50mg/L), the content of AFP mRNA in the cytoplasm was decreased with the inhibition percentages of 34.3% and 70.1%, respectively (P<0.05).CONCLUSION AFP mRNA was expressed in BEL-7404 human hepatoma cells and OXL suppressed AFP mRNA expression in the cells. 展开更多
关键词 fetoprotein HEPATOMA rna messenger
下载PDF
胃癌预后标志物circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络生物信息学分析
13
作者 黄馨仪 周锦涛 蒋晨杉 《医学分子生物学杂志》 CAS 2024年第4期366-373,共8页
目的构建胃癌(gastric cancer,GC)中与预后相关的circRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,探究诊治靶点。方法从GEO、TCGA数据库中获得GC中差异表达的circRNAs(circular RNA,circRNA)及相关miRNAs(mi... 目的构建胃癌(gastric cancer,GC)中与预后相关的circRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络,探究诊治靶点。方法从GEO、TCGA数据库中获得GC中差异表达的circRNAs(circular RNA,circRNA)及相关miRNAs(microRNA,miRNA)、mRNAs,利用Cytoscape构建circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,关注差异表达mRNAs功能,确定枢纽基因,最终通过Kaplan-Meier生存分析确定其预后价值。结果ceRNA网络由差异表达的2个circRNAs、5个miRNAs和349个mRNAs组成。功能富集分析提示差异mRNAs在“肌肉系统发育”、“金属离子跨膜转运蛋白活性”、“突触膜”和“钙信号通路”等方面和通路显著富集。构建了包含125个节点和165条边的PPI网络,并鉴定出10个枢纽基因,生存分析提示低ADAR1D或PTGFR表达可能导致GC患者预后不良。结论成功构建了与GC预后相关的circRNA-miRNA-mRNA ceRNA调控网络,确定了hsa_circ_0001190/hsa-miR-7-5p/ADRA1D和hsa_circ_0036287/hsa-miR-3127-5p/PTGFR两个在GC中具有潜在预后价值的轴,为GC的靶向诊治与研究提供新的依据。 展开更多
关键词 环状rna 胃癌 竞争性内源rna mrna 预后
下载PDF
精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA筛选及核心竞争性内源RNA网络构建
14
作者 王艺梦 邰旭光 +3 位作者 李小龙 刘鹏 王越 祁冬冬 《山东医药》 CAS 2024年第33期30-34,共5页
目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研... 目的筛选精神分裂症患者外周血中差异表达的circRNA、miRNA、mRNA,并构建核心竞争性内源RNA(ceRNA)网络,解析精神分裂症发生发展的分子机制。方法精神分裂症患者6例记为精神分裂症组,同期体检健康的人群4例记为健康对照组。采集两组研究对象的外周血,提取总RNA后构建cDNA文库并进行高通量测序,采用R软件筛选精神分裂症患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA。采用miRanda和qTar数据库共同预测与差异表达miRNA相互作用的circRNA和mRNA,与差异表达的circRNA、mRNA取交集后,采用R软件构建差异表达的ceRNA网络。基于DAVID数据库对精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA进行GO和KEGG富集分析。采用string数据库构建精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中差异mRNA之间的PPI网络,选用cytoscape软件中cytoHubba插件筛选影响精神分裂症发生发展的核心mRNA,选择与核心mRNA存在相互作用关系的miRNA和circRNA构建精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络。结果相比健康对照组,精神分裂症组患者外周血中差异表达circRNA、miRNA、mRNA分别为31、213、2624个。构建了由差异表达的5个circRNA、4个miRNA和57个mRNA组成的ceRNA网络。精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA主要参与化学刺激的感官知觉、多细胞生物生长的负调控等生物过程,涉及泛素-泛素连接酶活性、鸟苷酸结合、酶结合等分子功能,以及细胞质、肌动蛋白细胞骨架、轴突末端等细胞成分,ceRNA网络中mRNA显著富集于NF-κB信号通路、PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、泛素介导的蛋白水解等代谢通路。构建的精神分裂症患者差异表达ceRNA网络中mRNA PPI网络共包含23个节点和22条边,筛选获得影响精神分裂症发生发展的2个核心mRNA为BRCA1、GNAS。构建的精神分裂症患者外周血中差异表达的核心ceRNA网络包含5个节点和4条边。5个节点中包含2个核心mRNA:BRCA1、GNAS,1个miRNA:hsa-miR-502-5p,2个circRNA:hsa_circ_0001423、hsa_circ_0008494。4条边分别为hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/BRCA1、hsa_circ_0001423/hsa-miR-502-5p/GNAS、hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/BRCA1和hsa_circ_0008494/hsa-miR-502-5p/GNAS。结论与健康对照人群相比,精神分裂症患者外周血中有差异表达的circRNA 31个、miRNA 213个、mRNA 2624个,最终构建了包含5个节点和4条边的核心ceRNA网络。 展开更多
关键词 精神分裂症 circrna-mirna-mrna网络 竞争性内源rna网络 环状rna 微小rna 信使rna
下载PDF
mRNA疫苗制备技术在甲型流感病毒疫苗研究中的应用
15
作者 张民秀 谢芝勋 +6 位作者 李孟 罗思思 谢丽基 谢志勤 李丹 阮志华 王粲 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第12期16-22,28,共8页
禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)、H1N1和H3N2亚型人流感病毒(Influenza virus,IV)均属于甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)。IAV含有多种亚型,毒株变异快,因此IAV疫苗株需要根据当年的优势毒株进行相应的调整,这给疫苗的研... 禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)、H1N1和H3N2亚型人流感病毒(Influenza virus,IV)均属于甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)。IAV含有多种亚型,毒株变异快,因此IAV疫苗株需要根据当年的优势毒株进行相应的调整,这给疫苗的研制和生产带来巨大挑战。信使核糖核酸(messenger RNA,mRNA)疫苗制备工艺简单、生产时间短且容易规模化生产,在疾病预防方面具有广阔的应用前景。笔者对mRNA疫苗的种类、优化策略和IAV mRNA疫苗的研究现状进行了综述,旨在为IAV mRNA疫苗的研发提供理论参考。 展开更多
关键词 甲型流感病毒(IAV) 禽流感病毒(AIV) 信使核糖核酸(mrna) 非复制型mrna(Nr mrna) 自我扩增型mrna(Sa mrna) 疫苗
下载PDF
红景天苷通过miRNA-mRNA信号轴抑制肿瘤的机制
16
作者 吴枭雄 张振东 王小平 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期810-817,共8页
随着中医药的快速发展和红景天苷(salidroside,sal)的多种抗癌效应不断被发现,已经sal可通过诱导细胞凋亡和自噬,调节细胞周期和肿瘤微环境,调控癌症相关信号通路及信号分子等来抑制肿瘤增殖、侵袭和迁移。微RNA(microRNA,miRNA)-mRNA... 随着中医药的快速发展和红景天苷(salidroside,sal)的多种抗癌效应不断被发现,已经sal可通过诱导细胞凋亡和自噬,调节细胞周期和肿瘤微环境,调控癌症相关信号通路及信号分子等来抑制肿瘤增殖、侵袭和迁移。微RNA(microRNA,miRNA)-mRNA信号轴也可通过改变miRNA的表达来调控靶m RNA的表达,从而影响癌细胞的生长周期、增殖、代谢等。研究表明sal可以通过调控miRNA-mRNA信号轴影响多种恶性肿瘤的发生和发展,如抑制肺癌、胃癌和鼻咽癌等的进展,且sal抑癌时具有明显的时间及剂量依赖性。总结近年来sal调控miRNA-mRNA信号轴抑制肿瘤的具体机制,可为肿瘤的防治研究提供新的理论依据、诊断和治疗思路。 展开更多
关键词 肿瘤 红景天苷 rna mrna 信号通路
下载PDF
lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA在胃癌组织中的表达及临床意义
17
作者 王锋 董昌正 +2 位作者 唐思锋 赵伟 张启文 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第4期683-689,共7页
目的:探究胃癌(GC)组织中长链非编码RNA HOXC反义RNA1(lncRNA HOXC-AS1)、胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)mRNA表达水平与患者临床病理特征及术后5年内生存的关系。方法:选取我院2015年5月至2018年4月收治的GC患者139例,手术... 目的:探究胃癌(GC)组织中长链非编码RNA HOXC反义RNA1(lncRNA HOXC-AS1)、胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白2(IGF2BP2)mRNA表达水平与患者临床病理特征及术后5年内生存的关系。方法:选取我院2015年5月至2018年4月收治的GC患者139例,手术收集GC组织及癌旁组织。荧光定量PCR法检测lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达。对GC患者进行术后随访5年,记录GC患者生存情况,分为生存组88例,死亡组51例。比较GC组织和癌旁组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达水平、不同临床病理特征患者GC组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达情况、生存组和死亡组临床病理特征和GC组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达水平。分析GC组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达水平的相关性、GC组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达情况与术后5年生存的关系、影响GC患者术后5年内生存的危险因素。结果:与癌旁组织相比,GC组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达水平均显著升高(P<0.05);GC组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达水平呈正相关(P<0.05);GC组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达水平与淋巴结转移、TNM分期、肿瘤分化程度相关(P<0.05);lncRNA HOXC-AS1高表达组、IGF2BP2 mRNA高表达组患者术后5年总生存率分别显著低于lncRNA HOXC-AS1低表达组、IGF2BP2 mRNA低表达组(P<0.05);生存组和死亡组淋巴结转移、TNM分期、肿瘤分化程度比较差异有统计学意义(P<0.05);死亡组患者GC组织中lncRNA HOXC-AS1和IGF2BP2 mRNA表达水平显著高于生存组(P<0.05);TNM分期为III期、肿瘤低分化、lncRNA HOXC-AS1高表达、IGF2BP2 mRNA高表达是影响GC患者术后5年内生存的独立危险因素(P<0.05)。结论:GC患者癌组织中lncRNA HOXC-AS1及IGF2BP2 mRNA表达水平均显著升高,且术后5年内死亡的GC患者较存活患者更高,二者与淋巴结转移、TNM分期、肿瘤分化程度密切相关,二者高表达是影响GC患者术后5年内生存的独立危险因素。 展开更多
关键词 胃癌 长链非编码rna HOXC反义rna1 胰岛素样生长因子2 mrna结合蛋白2 术后5年内生存
下载PDF
Characteristics of long-distance mobile mRNAs from shoot to root in grafted plant species
18
作者 Mengmeng Fu Zhen Xu +7 位作者 Huaying Ma Yifan Hao Ji Tian Yi Wang Xinzhong Zhang Xuefeng Xu Zhenhai Han Ting Wu 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CAS CSCD 2024年第1期25-37,共13页
Thousands of long-distance mobile mRNAs were identified from different grafting systems,based on high-throughput sequencing technology.Moreover,the long-distance delivery of RNAs was proved to involve multiple mechani... Thousands of long-distance mobile mRNAs were identified from different grafting systems,based on high-throughput sequencing technology.Moreover,the long-distance delivery of RNAs was proved to involve multiple mechanisms.Here,we analyzed the homology,motif,and tRNA-like structure(TLS)of long-distance mobile mRNAs identified by RNA-seq as well as the RNA-binding protein(RBP)in nine grafting combinations including Arabidopsis thaliana,Vitis vinifera,Cucumis sativus,Citrullus lanatus,Nicotiana benthamiana,Malus domestica,Pyrus spp.,Glycine max and Phaseolus vulgaris.Although several mRNAs were found to be shared in herbaceous,woody,and related species,the vast majority of long-distance mobile mRNAs were species-specific.Four non-specific movement-related motifs were identified,while the TLS was not necessary for mRNA long distance mobility.In addition,we found that RBPs were conserved among herbaceous and woody plants as well as related species.This paper reports a further in-depth analysis of the endogenous mechanisms by which the species-specific transportable m RNAs were selected by bioinformatics,in order to provide insights for future research on long-distance mobile mRNAs. 展开更多
关键词 Grafting combination Long-distance mobile mrna TLS rna binding proteins
下载PDF
结核病mRNA疫苗的研制策略与展望
19
作者 杨静 肖丽娟 方谭玮 《中国防痨杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期590-595,共6页
应对危害全球人类健康的重大传染性疾病——结核病流行的严峻挑战,迫切需要研制出有效的新型结核病疫苗。虽然目前开展了多种类型的新型结核病疫苗的研制,且一些疫苗已进入临床试验研究,但至今仍未能获得可以替代传统卡介苗(BCG)的更为... 应对危害全球人类健康的重大传染性疾病——结核病流行的严峻挑战,迫切需要研制出有效的新型结核病疫苗。虽然目前开展了多种类型的新型结核病疫苗的研制,且一些疫苗已进入临床试验研究,但至今仍未能获得可以替代传统卡介苗(BCG)的更为有效的新型疫苗。随着mRNA疫苗研制技术的突破,其研发周期短、高效、安全和生产成本低等优点,使其成为一个非常有前景的疫苗研发新方向。笔者主要就mRNA疫苗的技术原理、优势、制备技术,以及结核病mRNA疫苗的研制策略和现状等方面的研究进展进行综述,以期为结核病mRNA疫苗的研制提供参考。 展开更多
关键词 分枝杆菌 结核 rna 细菌 rna 信使 疫苗 灭活 策略 实验性 综述
下载PDF
基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA
20
作者 伊力亚斯·艾萨 阿米娜·苏建和 付瑾 《广西医学》 CAS 2024年第2期284-291,共8页
目的基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA,从而基于分子层面探讨高原病潜在的发病机制。方法(1)在GEO数据库获取与高原病相关的miRNA表达谱芯片(GSE90500数据集)和mRNA表达谱芯片(GSE29977... 目的基于GEO数据库联合分析高原病患者外周血差异表达miRNA及其上游转录因子和下游mRNA,从而基于分子层面探讨高原病潜在的发病机制。方法(1)在GEO数据库获取与高原病相关的miRNA表达谱芯片(GSE90500数据集)和mRNA表达谱芯片(GSE29977数据集),再采用R语言3.6软件limma程序包筛选差异表达miRNA和差异表达mRNA。(2)利用FunRich软件预测差异表达miRNA的下游靶基因(mRNA)和上游转录因子,并对上游转录因子进行功能富集分析。使用R语言3.6软件、DAVID数据库对下游靶基因分别进行功能和通路富集分析。(3)对GSE29977数据集的差异表达mRNA与差异表达miRNA下游靶基因取交集,并根据miRNA及其靶基因的表达关系,筛选miRNA-mRNA调控轴。结果(1)共筛选出14个差异表达miRNA及其385个下游靶基因、123个上游转录因子。差异表达miRNA主要富集的转录因子包括EGR1、RREB1、MYF5和MEF2A。(2)上游转录因子涉及的生物学过程主要包括信号转导、核酸代谢的调节、脂肪酸代谢、糖代谢、细胞因子和趋化因子介导的信号通路、细胞周期等。下游靶基因富集的生物学过程主要包括转录调控、心肌细胞增殖、血管生成和染色质重塑等,富集的信号通路主要包括PD-L1表达和PD-1免疫检查点通路、细胞衰老、MTOR信号通路、MAPK信号通路及PI3K/AKT信号通路等。(3)共筛选得到443个差异表达mRNA,与差异表达miRNA的下游靶基因取交集后获得与高原病相关的5个核心mRNA,并构建出hsa-miR-155-5p-MYO1D调控轴。结论高原病中存在多个差异表达的miRNA,其上游转录因子EGR1、RREB1、MYF5、MEF2A可能是参与调控下游靶基因转录的核心因子;差异表达miRNA的上游转录因子和下游靶基因可能通过调控基因转录、细胞增殖与凋亡、炎症过程等生物学过程,共同参与高原病的发生、发展。hsa-miR-155-5p与下游靶基因MYO1D之间的调控关系可能在高原病的发生、发展中发挥重要的作用。 展开更多
关键词 高原病 微小rna 信使rna 转录因子 调控轴 分子机制
下载PDF
上一页 1 2 81 下一页 到第
使用帮助 返回顶部