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Aberrant gene methylation in the peritoneal fluid is a risk factor predicting peritoneal recurrence in gastric cancer 被引量:20
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作者 Masatsugu Hiraki Yoshihiko Kitajima +4 位作者 Seiji Sato Jun Nakamura Kazuyoshi Hashiguchi Hirokazu Noshiro Kohji Miyazaki 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2010年第3期330-338,共9页
AIM:To investigate whether gene methylation in the peritoneal fluid (PF) predicts peritoneal recurrence in gastric cancer patients.METHODS: The gene methylation of CHFR (checkpoint with forkhead and ring finger domain... AIM:To investigate whether gene methylation in the peritoneal fluid (PF) predicts peritoneal recurrence in gastric cancer patients.METHODS: The gene methylation of CHFR (checkpoint with forkhead and ring finger domains), p16, RUNX3 (runt-related transcription factor 3), E-cadherin, hMLH1 (mutL homolog 1), ABCG2 (ATP-binding cassette, sub-family G, member 2) and BNIP3 (BCL2/adenovirus E1B 19 kDa interacting protein 3) were analyzed in 80 specimens of PF by quantitative methylation-specific polymerase chain reaction (PCR). Eighty patients were divided into 3 groups; Group A (n=35):the depth of cancer invasion was less than the muscularis propria; Group B (n=31): the depth of cancer invasion was beyond the muscularis propria. Both group A and B were diagnosed as no cancer cells in peritoneal cytology and histology; Group C (n=14): disseminated nodule was histologically diagnosed or cancer cells were cytologically defi ned in the peritoneal cavity.RESULTS: The positive rates of methylation in CHFR, E-cadherin and BNIP3 were significantly different among the 3 groups and increased in order of group A, B and C (0%,0% and 21% in CHFR, P<0.05; 20%, 45% and 50% in E-cadherin, P<0.05;26%,35% and 71% in BNIP3, P<0.05). In addition, the multigene methylation rate among CHFR, E-cadherin and BNIP3 was correlated with group A, B and C (9%,19% and 57%, P<0.001). Moreover, the prognosis was analyzed in group B, excluding 3 patients who underwent a non-curative resection. Two of the 5 patients with multigene methylation showed peritoneal recurrence after surgery, while those without or with a single gene methylation did not experience recurrence (P<0.05).CONCLUSION: This study suggested that gene methylation in the PF could detect occult neoplastic cells in the peritoneum and might be a risk factor for peritoneal metastasis. 展开更多
关键词 ASCITES DISSEMINATION Gastric cancer methylation Peritoneal fluid Quantitative methylation-specific polymerase chain reaction
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Aberrant promoter methylation of p16 in colorectal adenocarcinoma in North Indian patients 被引量:2
2
作者 Pooja Malhotra Rakesh Kochhar +2 位作者 Kim Vaiphei Jai Dev Wig Safrun Mahmood 《World Journal of Gastrointestinal Oncology》 SCIE CAS 2010年第7期295-303,共9页
AIM:To investigate p16 gene methylation and its expression in 30 patients with sporadic colorectal adenocarcinoma in a North Indian population. METHODS:Methylation specific polymerase chain reaction was used to detect... AIM:To investigate p16 gene methylation and its expression in 30 patients with sporadic colorectal adenocarcinoma in a North Indian population. METHODS:Methylation specific polymerase chain reaction was used to detect p16 gene methylation and immunohistochemistry was used to study the p16 expression in 30 sporadic colorectal tumors as well as adjoining and normal tissue specimens.RESULTS:Aberrant promoter methylation of p16 gene was detected in 12(40%)tumor specimens,whereas no promoter methylation was observed in adjoining and normal tissue.Immunohistochemistry showed expression of p16 protein in 26(86.6%)colorectal tumors whereas complete loss of expression was seen in 4(13.3%)and reduced expression was observed in 12(40%)tumors. In the adjoining mucosa,expression of p16 was in 11 (36.6%)whereas no clear positivity for p16 protein was seen in normal tissue.There was a significant difference in the expression of p16 protein in tumor tissue and adjoining mucosa(P<0.001).The methylation of the p16 gene had a significant effect on the expression of p16 protein(P=0.021).There was a significant association of methylation of p16 gene with the tumor size (P=0.015)and of the loss/reduced expression of p16 protein with the proximal site of the tumor(P=0.047). Promoter methylation and expression of p16 had no relation with the survival of the patients(P>0.05). CONCLUSION:Our study demonstrated that promoter hypermethylation of the p16 gene results in loss/reduced expression of p16 protein and this loss/reduced expression may contribute to tumor enlargement. 展开更多
关键词 methylation specific POLYMERASE chain reaction P16 methylation IMMUNOHISTOCHEMISTRY COLORECTAL cancer
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Demethylation of tumor necrosis factor-α converting enzyme promoter associated with high hepatitis B e antigen level in chronic hepatitis B
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作者 Zhen-Li Wang Shuai Gao +4 位作者 Xin-You Li Feng-Kai Sun Feng Li Yu-Chen Fan Kai Wang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2015年第27期8382-8388,共7页
AIM: To evaluate tumor necrosis factor-α converting enzyme(TACE) methylation status in patients with chronic hepatitis B(CHB).METHODS: Eighty patients with hepatitis B e antigen(HBe Ag)-positive CHB, 80 with HBe Ag-n... AIM: To evaluate tumor necrosis factor-α converting enzyme(TACE) methylation status in patients with chronic hepatitis B(CHB).METHODS: Eighty patients with hepatitis B e antigen(HBe Ag)-positive CHB, 80 with HBe Ag-negative CHB, and 40 healthy controls(HCs) were randomly enrolled in this study. Genomic DNA was extracted from peripheral blood mononuclear cells and methylation status of TACE promoter was determined by methylation-specific polymerase chain reaction. The clinical and laboratory parameters were collected.RESULTS: One hundred and thirty of 160 patients with CHB(81.25%) and 38 of 40 HCs(95%) displayed TACE promoter methylation. The difference was significant(χ2 = 4.501, P < 0.05). TACE promoter methylation frequency in HBe Ag-positive CHB(58/80, 72.5%) was significantly lower than that in HBe Ag-negative CHB(72/80, 90%; χ2 = 8.041, P < 0.01) and HCs(χ2 = 8.438, P < 0.01). However, no significant difference was observed in the methylation frequency between HBe Agnegative CHB and HCs(χ2 = 0.873, P > 0.05). In the HBe Ag-positive group, TACE methylation frequency was significantly negatively correlated with HBe Ag(r =-0.602, P < 0.01), alanine aminotransferase(r =-0.461, P < 0.01) and aspartate aminotransferase(r =-0.329, P < 0.01). CONCLUSION: Patients with HBe Ag-positive CHB have aberrant demethylation of the TACE promoter, which may potentially serve as a biomarker for HBe Ag seroconversion. 展开更多
关键词 Tumor NECROSIS factor-α CONVERTING enzyme methylation Chronic hepatitis B methylation-specificpolymerase chain reaction Biomarker
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E-cadherin基因启动子区高甲基化与卵巢癌发生发展的相关性研究
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作者 左卫微 马国明 +1 位作者 王爱芹 薛书霞 《河北医药》 CAS 2023年第11期1668-1671,1675,共5页
目的探讨E-钙粘蛋白(E-cadherin)基因启动子区甲基化状态及其mRNA表达在卵巢癌发生发展中的作用。方法甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测E-cadherin基因启动子区在48例卵巢癌组织及48例正常卵巢组织中的甲基化状态,荧光实时定量PCR(qRT... 目的探讨E-钙粘蛋白(E-cadherin)基因启动子区甲基化状态及其mRNA表达在卵巢癌发生发展中的作用。方法甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测E-cadherin基因启动子区在48例卵巢癌组织及48例正常卵巢组织中的甲基化状态,荧光实时定量PCR(qRT-PCR)检测E-cadherin基因mRNA的表达情况。比较卵巢癌组织和正常卵巢组织中E-cadherin基因启动子区甲基化水平及其mRNA表达的差异情况,并分析它们与卵巢癌患者临床病理特征之间的关系。结果卵巢癌组织中E-cadherin基因启动子区甲基化阳性率显著高于正常卵巢组织(P<0.05),E-cadherin基因mRNA表达水平显著低于正常卵巢组织(P<0.05),且E-cadherin基因启动子区甲基化阳性的卵巢癌组织中E-cadherin mRNA表达量显著低于甲基化阴性的卵巢癌组织(P<0.05)。此外,卵巢癌组织中E-cadherin基因启动子区甲基化状态及其mRNA表达水平与卵巢癌患者的FIGO分期及淋巴结转移显著相关(P<0.05)。结论E-cadherin基因启动子区的高甲基化导致其表达下调可能在卵巢癌发生发展中起重要作用,E-cadherin基因甲基化状态有可能成为卵巢癌分子诊断和治疗的重要靶点。 展开更多
关键词 卵巢癌 甲基化 E-钙粘蛋白 甲基化特异性聚合酶链反应
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类风湿性关节炎患者外周血单个核细胞IL-10基因启动子甲基化状态研究 被引量:12
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作者 付丽红 丛斌 +6 位作者 甄艳凤 李淑瑾 马春玲 倪志宇 张国忠 左敏 姚玉霞 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1357-1361,共5页
白细胞介素-10(interleukin-10,IL-10)是在类风湿性关节炎中发挥重要免疫调节作用的细胞因子,其基因失活与已分化的Th1和Th2细胞染色质结构重塑有关。为了探讨IL-10基因启动子甲基化及基因失活在类风湿性关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA... 白细胞介素-10(interleukin-10,IL-10)是在类风湿性关节炎中发挥重要免疫调节作用的细胞因子,其基因失活与已分化的Th1和Th2细胞染色质结构重塑有关。为了探讨IL-10基因启动子甲基化及基因失活在类风湿性关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)发病和进展中的作用,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、酶联免疫吸附实验(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)及甲基化特异性聚合酶链反应(MSP),分别检测34例类风湿性关节炎患者和30例健康人外周血单个核细胞IL-10mRNA、蛋白表达水平及基因启动子甲基化状态。结果显示,病例组IL-10mRNA及蛋白表达均低于健康对照组,无统计学差异(P>0.05)。病例组甲基化率(85.29%)高于健康对照组(43.33%),具有统计学差异(χ2=12.439,P=0.000)。IL-10基因启动子甲基化状态与其mRNA表达呈显著负相关(r=?0.579,P=0.001),与所累关节数显著相关,但与血沉(ESR)、C反应蛋白(CRP)、类风湿因子(RF)、年龄均无相关性(P>0.05)。IL-10mRNA表达与年龄、所累关节数、ESR、CRP及RF均无相关性(P>0.05)。上述结果提示,启动子甲基化可能是IL-10基因失活的重要机制,IL-10基因异常高甲基化状态可能参与了RA的发生发展。 展开更多
关键词 类风湿性关节炎 白细胞介素-10 甲基化特异性聚合酶链反应
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p16基因高甲基化在胃癌发展中的作用 被引量:15
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作者 刘文天 焦焕利 +2 位作者 杨玉龙 王栋 张维铭 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2007年第26期2839-2843,共5页
目的:通过检测胃癌、癌前病变和正常对照组中p16基因启动子区CpG岛甲基化水平及其表达,并结合临床病理资料,分析他们在胃癌发生、发展中的作用.方法:用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation-specific PCR,MSP)检测41例胃癌组织、40例... 目的:通过检测胃癌、癌前病变和正常对照组中p16基因启动子区CpG岛甲基化水平及其表达,并结合临床病理资料,分析他们在胃癌发生、发展中的作用.方法:用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation-specific PCR,MSP)检测41例胃癌组织、40例癌前病变组织和38例正常对照组织中p16基因启动子5′CpG岛甲基化;应用免疫组化检测基因的蛋白表达.结果:胃癌组织中p16基因甲基化阳性率为56.1%(23/41),癌前病变组织中为17.5%(7/40),而正常对照组织中为2.6%(1/38),前组与后两组之间的差异有显著性(P<0.05).胃癌组织中p16基因表达阳性率为51.2%,癌前病变组织中为90.0%,正常对照组织中为100.0%,前组与后两组之间的差异有显著性(P<0.05).低分化型胃癌组织中的p16基因甲基化阳性率明显高于高分化型(81.3%vs 40.0%,P<0.05).有淋巴结转移的胃癌组织中,p16基因甲基化阳性率与无转移组的差异有显著性(81.0%vs 30.0%,P<0.05).浸润深达浆膜层的胃癌组织中,甲基化阳性率与未达浆膜层组无统计学差异(60.0%vs 52.4%,P>0.05).胃癌组织中p16基因甲基化阳性组的蛋白表达阳性率显著低于甲基化阴性组(26.1%vs 83.3%,P<0.01).结论:胃癌组织中存在有p16基因启动子5′CpG岛高甲基化,并导致其基因表达率显著低于正常对照及癌前病变组织.p16基因的高甲基化与胃癌分化程度、淋巴结转移相关.p16基因甲基化的发生,从正常、癌前病变到胃癌有逐渐增加的趋势,提示其基因CpG岛高甲基化有可能作为诊断早期胃癌的一项较为敏感的指标. 展开更多
关键词 胃癌 癌前病变 DNA甲基化 P16基因 甲基化特异性聚合酶链反应 免疫组化
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巢式MSP法检测恶性血液病细胞株p16基因启动子甲基化状态的研究 被引量:13
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作者 周华蓉 沈建箴 +3 位作者 付海英 叶宝国 范丽萍 林福安 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 2006年第2期375-378,共4页
本研究应用改进的甲基化特异性PCR(MSP)法,即巢式甲基化特异性PCR法检测6种肿瘤细胞株p16基因启动子的甲基化状态效率,探讨其在筛选p16基因启动子高甲基化的肿瘤细胞株,及将其作为研究基因甲基化与表达关系的理想细胞模型中的应用。6种... 本研究应用改进的甲基化特异性PCR(MSP)法,即巢式甲基化特异性PCR法检测6种肿瘤细胞株p16基因启动子的甲基化状态效率,探讨其在筛选p16基因启动子高甲基化的肿瘤细胞株,及将其作为研究基因甲基化与表达关系的理想细胞模型中的应用。6种肿瘤细胞株基因组DNA经碱变性后以亚硫酸盐修饰,再用巢式甲基化特异性聚合酶链反应扩增,分析检测其p16启动子区CpG岛的甲基化状态。结果表明:CA46、U266都有不同程度的p16基因启动子区甲基化,而Molt4、K562、HL-60、Jurkat的p16基因启动子区均未甲基化。结论:用巢式甲基化特异性PCR可以准确的检测出恶性血液病细胞株p16基因的甲基化状态,方法简单,灵敏且重复性强,可以广泛用于筛选各种p16基因启动子区甲基化的恶性血液病细胞株以及恶性血液病诊断。 展开更多
关键词 巢式甲基化特异性聚合酶链反应 恶性血液病细胞株 P16基因 基因甲基化
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血浆RNF180启动子甲基化及其蛋白表达在胃癌诊断中的价值 被引量:7
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作者 张学松 张谢 +4 位作者 孙蓓蕾 宋毓飞 陆宏娜 王丹萍 黄志刚 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2014年第22期1432-1436,共5页
目的:探讨血浆RNF180基因启动子甲基化及其蛋白表达在胃癌临床诊断中的价值。方法:采用甲基化特异性PCR法(MSP)和ELISA法检测各组患者血浆中RNF180甲基化状态和RNF180蛋白表达情况,并分别将其与各临床病理指标进行统计学分析。结果:MSP... 目的:探讨血浆RNF180基因启动子甲基化及其蛋白表达在胃癌临床诊断中的价值。方法:采用甲基化特异性PCR法(MSP)和ELISA法检测各组患者血浆中RNF180甲基化状态和RNF180蛋白表达情况,并分别将其与各临床病理指标进行统计学分析。结果:MSP结果显示胃癌患者血浆中RNF180基因启动子甲基化率为62.75%,健康者为21.88%,其差异具有统计学意义(P<0.01)。RNF180甲基化阳性率与肿瘤大小、临床分期、分化程度、淋巴结转移以及远处转移密切相关(P<0.05)。ELISA结果显示胃癌血浆RNF180蛋白水平(23.22±1.36)μg/m L明显低于对照健康组(34.25±2.44)μg/m L,差异具有统计学意义(P<0.01)。胃癌血浆RNF180蛋白表达水平与临床病理特征无统计学意义(P>0.05)。结论:胃癌患者血浆RNF180基因表达存在高甲基化率,而RNF180蛋白表达明显下降,提示血浆RNF180基因甲基化可作为一种微创的检测方法在临床胃癌诊断中有潜在的应用价值。 展开更多
关键词 RNFl80基因 甲基化 胃癌 血浆 甲基化特异性PCR
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宫颈癌组织中FHIT基因5'端CpG岛甲基化及其与基因失活的关系 被引量:20
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作者 史惠蓉 吴庆华 +1 位作者 索振河 Jahn M Nesland 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第1期7-11,共5页
背景与目的:脆性组氨酸三联基因(fragile histidine triad gene,FHIT)作为抑癌基因与多种实体瘤的发生有关,并在多种肿瘤中因甲基化而失活。本研究拟探讨宫颈癌组织中FHIT基因5'端CpG岛甲基化状况及其与基因失活的关系。方法:采用... 背景与目的:脆性组氨酸三联基因(fragile histidine triad gene,FHIT)作为抑癌基因与多种实体瘤的发生有关,并在多种肿瘤中因甲基化而失活。本研究拟探讨宫颈癌组织中FHIT基因5'端CpG岛甲基化状况及其与基因失活的关系。方法:采用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation鄄specificPCR,MSP)和免疫组织化学法分别检测10例正常宫颈鳞状上皮、40例宫颈癌组织中FHIT基因5'端CpG岛的甲基化发生状况和FHIT蛋白表达情况。结果:(1)正常宫颈鳞状上皮组织中未发现存在FHIT基因甲基化状态,而宫颈癌组织中FHIT基因5'端CpG岛的甲基化率为40.0%(16/40);(2)临床Ⅱ期宫颈癌病例中FHIT基因甲基化的发生率为56.5%(13/23),明显高于Ⅰ期的14.3%(2/14)(P<0.05);(3)宫颈癌组织中存在FHIT蛋白表达降低或缺失,阳性率仅为30.0%(12/40),显著低于正常宫颈组织的100.0%(10/10)(P<0.05)。结论:FHIT基因5'端CpG岛甲基化是宫颈癌中该基因失活的机制之一,可能与宫颈癌的发生发展有关。 展开更多
关键词 宫颈肿瘤 FHIT基因 甲基化 甲基化特异性PCR 免疫组织化学
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巢式PCR法在燃煤型砷中毒患者p16基因启动区的异常甲基化检测中的应用 被引量:5
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作者 刘清 苏丽琴 +3 位作者 程义斌 康家琦 顾珩 金银龙 《环境与健康杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第7期487-489,共3页
目的检测燃煤型砷中毒(地砷病)患者p16基因启动区的异常甲基化情况,探讨p16基因启动区的异常甲基化在地砷病癌变中的作用。方法采用巢式甲基化特异性PCR法(nMSP)对117例地砷病患者(参考地方性砷中毒诊断标准将其分为轻度中毒组、中度中... 目的检测燃煤型砷中毒(地砷病)患者p16基因启动区的异常甲基化情况,探讨p16基因启动区的异常甲基化在地砷病癌变中的作用。方法采用巢式甲基化特异性PCR法(nMSP)对117例地砷病患者(参考地方性砷中毒诊断标准将其分为轻度中毒组、中度中毒组、重度中毒组)、63例内对照人群和70例外对照人群p16基因启动区的甲基化情况进行了检测。结果砷中毒病例组甲基化阳性率为39.32%,内对照组阳性率为12.70%,外对照组阳性率为4.29%;其中病例组中轻度、中度和重度组阳性率分别为24.00%,48.89%和54.55%。病例组与外对照组和内对照组比较,差异有统计学意义(P<0.01)。外对照组、内对照组、轻度、中度和重度砷中毒组甲基化阳性率经趋势χ2检验,差异有统计学意义(P<0.01)。结论p16基因启动区的异常甲基化在地砷病人的癌变过程可能起重要作用。 展开更多
关键词 砷中毒 p16基因 DNA甲基化 巢式甲基化特异性PCR
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高发区食管癌患者p16基因甲基化及其表达的比较研究 被引量:5
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作者 宋长山 谭家驹 +3 位作者 崔金环 郭校锡 徐致祥 杨光 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2007年第8期570-574,共5页
目的:比较p16基因甲基化在食管癌高发区河南林州(北方组)和广东揭阳(南方组)之间的异同,探讨p16基因甲基化在不同气候环境条件下的两地食管鳞癌(ESCC)发生中的作用。方法:采用甲基化特异性PCR方法(MSP)分别检测两地食管癌组织、癌旁组... 目的:比较p16基因甲基化在食管癌高发区河南林州(北方组)和广东揭阳(南方组)之间的异同,探讨p16基因甲基化在不同气候环境条件下的两地食管鳞癌(ESCC)发生中的作用。方法:采用甲基化特异性PCR方法(MSP)分别检测两地食管癌组织、癌旁组织和切缘组织p16基因启动子区域CpG岛甲基化状态。采用EnVision免疫组化法检测两地食管癌组织及癌旁组织的p16蛋白的表达。结果:南方组75例标本中,食管癌组织、癌旁组织和切缘组织p16基因甲基化率分别为41.3%(31/75)、13.3%(10/75)和6.67%(5/75);癌组织和癌旁组织p16蛋白的阳性表达率分别为29.3%(22/75)和56.7%(17/30);31例p16基因甲基化阳性标本中有2例(6.4%)检测到p16蛋白的表达,而44例p16基因甲基化阴性标本中有20例(45.5%)检测到p16蛋白的表达。北方组65例标本中,食管癌组织、癌旁组织、切缘组织p16基因甲基化率分别为52.3%(34/65)、16.9%(11/65)和7.69%(5/65);食管癌组织和癌旁组织p16蛋白的阳性表达率分别为32.3%(21/65)和66.7%(20/30);34例p16基因甲基化阳性标本中有4例(11.8%)检测到p16蛋白的表达,而31例p16基因甲基化阴性标本中有17例(54.8%)检测到p16基因的表达。两地组内癌组织p16甲基化率均显著高于癌旁组织和切缘组织,p16蛋白表达与p16基因甲基化呈负相关(P<0.01)。两地同类组织比较p16甲基化率和p16蛋白表达率均无显著性差异(P>0.05)。结论:p16基因异常甲基化后功能失活可能是南、北两地食管癌癌变过程的重要事件,在我国南北环境气候条件不同的两地高发区食管癌的发生中均起着重要的作用。本研究为环境因素和p16基因功能之间的生物学关联在食管癌的发生中提供了一定的证据。 展开更多
关键词 食管癌 P16基因 DNA甲基化 甲基化特异性PCR
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新疆伊犁地区维吾尔、汉族不同人群变应性鼻炎患者IL-4基因甲基化比较研究 被引量:6
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作者 马青平 刘福太 +5 位作者 杨清 姜孝芳 娄重章 张清泉 穆尼热.穆合塔尔 高丽 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期886-889,共4页
目的探讨IL-4基因启动子区甲基化在维吾尔、汉族两个民族变应性鼻炎(AR)患者中的差异。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP),病例组维吾尔族、汉族AR患者各31例,健康对照组维吾尔族、汉族各31例,检测其外周血IL-4基因甲基化状态。结... 目的探讨IL-4基因启动子区甲基化在维吾尔、汉族两个民族变应性鼻炎(AR)患者中的差异。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP),病例组维吾尔族、汉族AR患者各31例,健康对照组维吾尔族、汉族各31例,检测其外周血IL-4基因甲基化状态。结果维吾尔族、汉族AR患者IL-4甲基化率均高于健康对照组,有统计学意义(P<0.05);维吾尔族、汉族AR患者IL-4甲基化率相比较,无统计学差异(P>0.05)。维吾尔族、汉族健康对照组未甲基化率相比较,有统计学差异(P<0.01)。结论 IL-4基因高甲基化是导致AR患病的一个重要原因.汉族人群比维吾尔族易患AR。 展开更多
关键词 变应性鼻炎 白细胞介素-4 甲基化特异性聚合酶链反应
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ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A基因启动子的甲基化状态可能与3种乳腺癌细胞株对5-FU的敏感性相关 被引量:5
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作者 蔡飏 孙晋枫 +9 位作者 黄朝晖 余坚 何英华 戴信兰 周小羽 徐慧莉 顾峻 张红宇 胡夕春 朱景德 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期20-25,共6页
目的:寻找与乳腺癌细胞株间药物敏感性差异相关的基因启动子CpG岛甲基化异常,为DNA甲基化异常作为临床化疗敏感性预测手段提供依据。方法:用MTT法测定3种乳腺癌细胞株(Bcap-37、T47D和ZR-75-30)对9种化疗药物(紫杉醇、紫杉特尔、长春瑞... 目的:寻找与乳腺癌细胞株间药物敏感性差异相关的基因启动子CpG岛甲基化异常,为DNA甲基化异常作为临床化疗敏感性预测手段提供依据。方法:用MTT法测定3种乳腺癌细胞株(Bcap-37、T47D和ZR-75-30)对9种化疗药物(紫杉醇、紫杉特尔、长春瑞宾、5-氟尿嘧啶(5-FU)、双氟去氧胞苷、表阿霉素、丝裂霉素、依立替康和顺铂)的敏感性;同时用甲基化特异性PCR检测23个基因在3种乳腺癌细胞株中的甲基化状态。结果:受试的3种乳腺癌细胞株仅对5-FU的敏感性有明显差异。其中Bcap-37(IC50:317.386μg/mL)对5-FU相对耐药,而ZR-75-30(IC50:6.676μg/mL)和T47D(IC50:73.076μg/mL)对5-FU相对敏感。23个基因中,有6个基因:ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A在敏感和耐药细胞株中的甲基化状态有差异。其中ABCC8、CHFR和BMP3B在5-FU耐药细胞株中呈相对高甲基化状态,而LOX、PRSS21和RASSF1A则在对5-FU敏感的细胞株中呈相对高甲基化状态。结论:本研究所发现的6个基因的甲基化状态可能与乳腺癌细胞株对5-FU化疗敏感性相关,为下一步进行临床评估和机制探讨提供了依据。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 细胞系 DNA甲基化 抗药性 甲基化特异性聚合酶链反应
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甘蓝型油菜抗苯磺隆突变体ALS基因分析与SNP标记 被引量:17
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作者 孙妍妍 曲高平 +3 位作者 黄谦心 吕金洋 郭媛 胡胜武 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期589-595,共7页
为筛选新型甘蓝型油菜抗苯磺隆除草剂的等位基因特异分子标记,以EMS诱变的甘蓝型油菜中双9号M2群体(约30 000单株)为材料,通过苯磺隆喷药处理筛选到3株抗除草剂突变体(分别记为K1、K4、K5)。利用PCR技术克隆到抗性突变体相应的Bn ALS1、... 为筛选新型甘蓝型油菜抗苯磺隆除草剂的等位基因特异分子标记,以EMS诱变的甘蓝型油菜中双9号M2群体(约30 000单株)为材料,通过苯磺隆喷药处理筛选到3株抗除草剂突变体(分别记为K1、K4、K5)。利用PCR技术克隆到抗性突变体相应的Bn ALS1、Bn ALS2、Bn ALS3基因,序列分析结果表明,K1和K4的Bn ALS3基因序列发生碱基突变,其中第+535位C碱基突变为T,导致其编码的Bn ALS3蛋白第197位氨基酸由Pro突变为Ser;而K5的Bn ALS1基因序列第+544位C突变为T,导致其编码的Bn ALS1蛋白发生了Pro197Ser的改变(均以拟南芥ALS氨基酸序列为准)。其中K5抗性位点Bn ALS1∶Pro197Ser的改变属于首次报道。基于突变的基因序列设计了8对等位基因特异性PCR引物组合,有6对能用于区分抗性突变体和野生型材料,其中可检测K5的Bn ALS1基因SNP位点的引物有2对,可检测K1、K4突变体Bn ALS3基因SNP位点的引物有4对。 展开更多
关键词 油菜 抗除草剂突变体 苯磺隆 乙酰乳酸合成酶 等位基因特异PCR 单核苷酸多态性
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非小细胞肺癌患者血浆TIMP-3、p16基因甲基化的检测及其临床意义 被引量:4
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作者 李超 宋超 +3 位作者 胡海亮 于在诚 金永堂 薛绍礼 《安徽医科大学学报》 CAS 北大核心 2013年第9期1088-1091,共4页
目的检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织与血浆中组织金属蛋白酶抑制因子-3(TIMP-3)、p16基因甲基化状态,研究血浆中两种基因的检测及联合检测在NSCLC筛查和鉴别诊断中的意义。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)技术,检测110例NSCL... 目的检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织与血浆中组织金属蛋白酶抑制因子-3(TIMP-3)、p16基因甲基化状态,研究血浆中两种基因的检测及联合检测在NSCLC筛查和鉴别诊断中的意义。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)技术,检测110例NSCLC患者癌组织、癌旁组织和外周血血浆TIMP-3、p16基因的甲基化状态,并对110例正常对照组血浆样品进行同样检测,比较各组检测结果。结果患者癌组织中TIMP-3、p16、联合检测的基因甲基化率分别高于癌旁组织(P<0.01);外周血血浆中TIMP-3、p16、联合检测基因甲基化率分别高于正常对照组血浆(P<0.01);血浆中TIMP-3、p16和联合检测的基因甲基化检出率与NSCLC临床分期、临床分类以及病理类型的对比差异均无统计学意义。结论对患者外周血浆TIMP-3、p16基因甲基化的联合检测可提高肺癌的检出率,为肺癌的筛查和鉴别诊断提供有价值的参考信息。 展开更多
关键词 TIMP-3 P16 非小细胞肺癌 甲基化 甲基化特异性聚合酶链反应
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3种结肠癌细胞株中DLC-1基因的表达及其启动子区的甲基化状态研究 被引量:5
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作者 金月玲 田小强 +1 位作者 商延芳 黄培林 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2008年第1期6-10,共5页
目的:研究候选抑癌基因DLC-1在结肠癌细胞株中的表达及其启动子区的甲基化状态,初步探讨结肠癌细胞株DLC-1基因表达水平与其启动子区甲基化的相关性。方法:采用RT-PCR技术分别检测DLC-1基因在人结肠癌细胞株CaCo-2、HT-29和LoVo中的表... 目的:研究候选抑癌基因DLC-1在结肠癌细胞株中的表达及其启动子区的甲基化状态,初步探讨结肠癌细胞株DLC-1基因表达水平与其启动子区甲基化的相关性。方法:采用RT-PCR技术分别检测DLC-1基因在人结肠癌细胞株CaCo-2、HT-29和LoVo中的表达水平;应用甲基化特异性PCR(MSP)方法和亚硫酸氢盐修饰DNA测序检测启动子区域甲基化状态;分别用0、5、10μmol.L-1浓度的去甲基化药物5氮杂胞苷处理DLC-1基因启动子区域高甲基化状态细胞后,再检测DLC-1基因mRNA表达水平。结果:人结肠癌细胞株CaCo-2和LoVo中DLC-1 mRNA呈阳性表达,HT-29中的表达呈阴性表达;CaCo-2和LoVo细胞DLC-1基因启动子区域未发生甲基化,而HT-29出现启动子区高甲基化状态;经5氮杂胞苷药物干预后,HT-29结肠癌细胞的DLC-1基因表达明显增强。结论:结肠癌细胞株HT-29中DLC-1基因表达沉默与启动子区高甲基化状态有关。 展开更多
关键词 DLC-1基因 甲基化 结肠癌细胞株 甲基化特异性PCR
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新疆哈萨克族和汉族食管癌患者FHIT基因甲基化及其与预后的关系 被引量:9
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作者 李磊 邓彦超 +1 位作者 赵燕 陈艳 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2012年第2期132-135,共4页
目的:探讨和比较新疆哈萨克族和汉族食管癌患者FHIT基因甲基化状态及其与食管癌发生及预后之间的关系。方法:采用甲基化特异性PCR法(methvlation-specific polymerase chain reaction,MSF)测定哈、汉两民族共71例食管癌及癌旁组织标本F... 目的:探讨和比较新疆哈萨克族和汉族食管癌患者FHIT基因甲基化状态及其与食管癌发生及预后之间的关系。方法:采用甲基化特异性PCR法(methvlation-specific polymerase chain reaction,MSF)测定哈、汉两民族共71例食管癌及癌旁组织标本FHIT基因启动子区甲基化状况,建立Cox回归模型分析临床病理指标及FHIT基因甲基化水平等因素与预后的关系。结果:36例哈族食管癌患者癌组织和癌旁组织的FHIT基因启动子甲基化率分别为58.3%和19.4%,35例汉族食管癌患者癌组织和癌旁组织的FHIT基因启动子甲基化率分别为51.4%和14.3%,两民族癌组织FHIT基因的甲基化率均明显高于癌旁组织(P<0.01);哈、汉民族食管癌患者癌组织之间、癌旁组织之间FHIT基因启动子甲基化率无显著性差异(P>0.05)。预后因素分析表明肿瘤浸润程度、TNM分期、淋巴结转移区域数是影响哈、汉民族食管癌预后的独立危险因素,女性性别是保护因素。结论:FHIT基因启动子区甲基化状态与新疆哈族、汉族食管癌的发生有密切的关系,但可能与食管癌预后无关。 展开更多
关键词 哈萨克族 汉族 食管癌 FHIT基因 甲基化特异性PCR
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散发性乳腺癌中BRCA1基因甲基化状态与其mRNA表达水平的相关研究 被引量:8
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作者 吴琍 曹伟红 +2 位作者 陈庆峰 郑玲莉 吴艳艳 《外科理论与实践》 2011年第6期576-580,共5页
目的:探讨山东半岛地区散发性乳腺癌中BRCA1基因异常甲基化状态及其与mRNA表达的关系,进而研究其BRCA1基因异常的表观遗传学作用。方法:用甲基化特异性PCR和RT-PCR等方法研究乳腺癌组织、癌旁正常组织及乳腺良性肿瘤中BRCA1基因启动子... 目的:探讨山东半岛地区散发性乳腺癌中BRCA1基因异常甲基化状态及其与mRNA表达的关系,进而研究其BRCA1基因异常的表观遗传学作用。方法:用甲基化特异性PCR和RT-PCR等方法研究乳腺癌组织、癌旁正常组织及乳腺良性肿瘤中BRCA1基因启动子甲基化状态及其mRNA表达水平。结果:在30例散发性乳腺癌中,BRCA1基因甲基化率为43%,BRCA1 mRNA表达下降率为33%。在13例BRCA1发生甲基化的癌组织标本中,BRCA1 mRNA的表达下降率为55%,而在17例BRCA1未发生甲基化的癌组织中,BRCA1 mRNA的表达下降率为18%。在肿瘤分级中,T3分级病人的肿瘤组织中BRCA1甲基化率(74%)和mRNA表达下降率(54%),均分别高于T1+T2分级病人肿瘤组织的BRCA1甲基化率(26%)和mRNA表达下降率(30%);有淋巴结转移病人的肿瘤组织中,BRCA1甲基化率(61%)和mRNA表达下降率(46%),均分别高于无淋巴结转移的甲基化率(17%)和mRNA表达下降率(16%)。结论:BRCA1基因表观遗传学改变是其mRNA表达下降乃至失活的重要原因,且与散发性乳腺癌的恶性程度及淋巴结转移的发生密切相关。 展开更多
关键词 BRCA1基因 DNA甲基化 逆转录-聚合酶链反应 甲基化特异性 散发性乳腺癌
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雌激素受体α基因甲基化与缺血性卒中的相关性研究 被引量:3
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作者 徐营营 周晓艳 +3 位作者 谢兆宏 许顺良 于君 毕建忠 《中国动脉硬化杂志》 CAS 北大核心 2015年第10期1021-1025,共5页
目的 DNA甲基化作为一种主要的表观遗传修饰模式,与许多疾病的发生及发展相关。而关于缺血性卒中病人基因甲基化方面的研究较少。本研究主要探讨人雌激素受体α(ER-α)基因启动子区甲基化状态与缺血性卒中的相关性。方法入选83例缺血性... 目的 DNA甲基化作为一种主要的表观遗传修饰模式,与许多疾病的发生及发展相关。而关于缺血性卒中病人基因甲基化方面的研究较少。本研究主要探讨人雌激素受体α(ER-α)基因启动子区甲基化状态与缺血性卒中的相关性。方法入选83例缺血性卒中患者和94例对照者,所有患者记录梗死灶大小,行NIHSS评分及Barthel指数评定。行颈动脉彩色超声及颅脑磁共振血管造影的患者,计算Crouse积分及斑块指数,评估颅内动脉硬化程度。所有研究对象均抽取清晨空腹静脉血,采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测静脉血ER-α基因启动子区甲基化状态。结果缺血性卒中组ER-α基因启动子区甲基化检出率较对照组升高(42.2%比19.1%,P<0.05)。有52例患者行颈动脉彩色超声检查,完全甲基化组、部分甲基化组及非甲基化组间颈动脉内膜中膜厚度、Crouse积分及斑块指数存在差异(P<0.05)。有57例患者行颅脑磁共振血管造影检查,非动脉硬化组、动脉硬化组、动脉狭窄组及动脉闭塞组甲基化检出率有升高趋势(分别为40.9%、42.9%、52.4%、57.1%),但差异无统计学意义(P>0.05)。根据梗死灶大小分为小梗死组、中等梗死组和大梗死组,甲基化检出率依次增高(分别为32.8%、56.3%、77.8%),差异有统计学意义(P<0.05)。完全甲基化组、部分甲基化组及非甲基化组间NIHSS评分和Barthel指数存在差异(P<0.05)。结论缺血性卒中患者ER-α基因启动子区甲基化程度较对照组升高,其与颈动脉硬化程度、梗死灶大小、神经功能缺损严重程度等相关。 展开更多
关键词 雌激素受体Α 基因 甲基化 缺血性卒中 甲基化特异性聚合酶链反应
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结直肠癌C-erbB-2基因启动子CpG岛甲基化状态及其与C-erbB-2蛋白表达的关系 被引量:3
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作者 金中淦 袁亚 +2 位作者 陆青 杨惠黎 朱晴晖 《检验医学》 CAS 北大核心 2008年第6期594-599,共6页
目的了解结直肠癌组织C-erbB-2基因启动子区CpG岛甲基化状态、C-erbB-2蛋白表达水平及两者之间的关系。方法取经病理确诊的43例结直肠癌组织和相应癌旁组织,分别用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)和免疫组织化学法(IHC)检测C-erbB-2启动... 目的了解结直肠癌组织C-erbB-2基因启动子区CpG岛甲基化状态、C-erbB-2蛋白表达水平及两者之间的关系。方法取经病理确诊的43例结直肠癌组织和相应癌旁组织,分别用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)和免疫组织化学法(IHC)检测C-erbB-2启动子区CpG岛的甲基化和C-erbB-2蛋白表达水平。结果癌组织和癌旁组织中C-erbB-2启动子区CpG岛甲基化率分别为44.2%和74.4%,差异具有统计学意义(P=0.004)。癌组织和癌旁组织中C-erbB-2蛋白过度表达率分别为67.4%和27.9%,差异具有统计学意义(P=0.000)。C-erbB-2蛋白表达水平与肿瘤分期相关。结直肠癌组织C-erbB-2启动子区CpG岛甲基化状态与C-erbB-2蛋白表达水平呈显著相关(r=0.331,P=0.03)。结论结直肠癌中C-erbB-2基因启动子区CpG岛的低甲基化可能在C-erbB-2蛋白过度表达中起一定作用,有望成为有用的肿瘤分子诊断标记和治疗靶点。 展开更多
关键词 C-ERBB-2基因 CPG岛 甲基化 甲基化特异性聚合酶链反应 免疫组织化学 结直肠癌
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