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Vertex Cover Optimization Using a Novel Graph Decomposition Approach
1
作者 Abdul Manan Shahida Bashir Abdul Majid 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2022年第10期701-717,共17页
The minimum vertex cover problem(MVCP)is a well-known combinatorial optimization problem of graph theory.The MVCP is an NP(nondeterministic polynomial)complete problem and it has an exponential growing complexity with... The minimum vertex cover problem(MVCP)is a well-known combinatorial optimization problem of graph theory.The MVCP is an NP(nondeterministic polynomial)complete problem and it has an exponential growing complexity with respect to the size of a graph.No algorithm exits till date that can exactly solve the problem in a deterministic polynomial time scale.However,several algorithms are proposed that solve the problem approximately in a short polynomial time scale.Such algorithms are useful for large size graphs,for which exact solution of MVCP is impossible with current computational resources.The MVCP has a wide range of applications in the fields like bioinformatics,biochemistry,circuit design,electrical engineering,data aggregation,networking,internet traffic monitoring,pattern recognition,marketing and franchising etc.This work aims to solve the MVCP approximately by a novel graph decomposition approach.The decomposition of the graph yields a subgraph that contains edges shared by triangular edge structures.A subgraph is covered to yield a subgraph that forms one or more Hamiltonian cycles or paths.In order to reduce complexity of the algorithm a new strategy is also proposed.The reduction strategy can be used for any algorithm solving MVCP.Based on the graph decomposition and the reduction strategy,two algorithms are formulated to approximately solve the MVCP.These algorithms are tested using well known standard benchmark graphs.The key feature of the results is a good approximate error ratio and improvement in optimum vertex cover values for few graphs. 展开更多
关键词 Combinatorial optimization graph theory minimum vertex cover problem maximum independent set maximum degree greedy approach approximation algorithms benchmark instances
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最小连通顶点覆盖问题的降阶回溯算法
2
作者 曾宾 宁爱兵 +2 位作者 付振星 李之桥 张惠珍 《运筹与管理》 CSSCI CSCD 北大核心 2024年第3期28-34,共7页
本文从最小连通顶点覆盖问题的求解算法出发,提出一种基于该问题本身的数学性质的降阶回溯算法来求解。通过基于问题的数学性质来设计精确算法,不仅能够克服使用启发式算法求解该问题在一般情形下都无法求得最优解的缺点,也改善了该问... 本文从最小连通顶点覆盖问题的求解算法出发,提出一种基于该问题本身的数学性质的降阶回溯算法来求解。通过基于问题的数学性质来设计精确算法,不仅能够克服使用启发式算法求解该问题在一般情形下都无法求得最优解的缺点,也改善了该问题使用传统精确算法时最坏时间复杂度高的缺点。本文首先研究该问题的数学性质,部分数学性质可成批确定某些顶点在或不在最小连通顶点覆盖集中,从而降低该问题的规模,提高精确算法的求解速度。其次,在数学性质的基础上,设计出上下界子算法、降阶子算法、回溯子算法来求解该问题的最优解。最后,时间复杂度分析以及无线网络设计的实例分析表明,该算法不仅能求得该问题的最优解,且相对一般精确算法,本文算法的时间复杂度更低。 展开更多
关键词 最小连通顶点覆盖 上界子算法 下界子算法 回溯子算法
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基于多层网络控制的个体化癌症驱动基因识别方法
3
作者 张桐 张绍武 +1 位作者 李岩 谢明宇 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1711-1726,共16页
目的识别癌症驱动基因,特别是罕见或个体特异性癌症驱动基因,对精准肿瘤学至关重要。考虑到肿瘤间的高度异质性,最近有一些方法尝试在个体水平上识别癌症驱动基因。然而,这些方法大多是将多组学数据整合到单一生物分子网络(如基因调控... 目的识别癌症驱动基因,特别是罕见或个体特异性癌症驱动基因,对精准肿瘤学至关重要。考虑到肿瘤间的高度异质性,最近有一些方法尝试在个体水平上识别癌症驱动基因。然而,这些方法大多是将多组学数据整合到单一生物分子网络(如基因调控网络或蛋白质相互作用网络)中来识别癌症驱动基因,容易忽略不同网络所特有的重要相互作用信息。为了整合不同生物分子网络的相互作用数据,促进癌症驱动基因识别,迫切需要发展一种多层网络方法。方法本文提出了一种多层网络控制方法(PDGMN),利用多层网络识别个体化癌症驱动基因。首先,利用基因表达数据构建针对个体病人的个体化多层网络,其中包括蛋白质相互作用层和基因相互关联层。然后,整合突变数据,对个体化多层网络中的节点进行加权。最后,设计了一种加权最小顶点覆盖集识别算法,找到个体化多层网络中的最优驱动节点集,以提高个体化癌症驱动基因的识别效果。结果在三个TCGA癌症数据集上的实验结果表明,PDGMN在个体化驱动基因识别方面优于其他现有方法,并能有效识别个体病人的罕见癌症驱动基因。特别是,在不同生物分子网络上的实验结果表明,PDGMN能够捕获不同生物分子网络的独有特征,从而改进癌症驱动基因的识别结果。结论PDGMN能有效识别个体化癌症驱动基因,并从多层网络的视角,加深我们对癌症驱动基因识别的理解。本文所用的源代码和数据集可以从https://github.com/NWPU-903PR/PDGMN获取。 展开更多
关键词 多层生物分子网络 多层网络控制 个体化癌症驱动基因 个体化多层网络 最小节点覆盖集
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基于最小权覆盖的医药电商配送中心选址及区域覆盖优化研究
4
作者 李建红 丁秀好 +1 位作者 雷鸣颢 罗晓萌 《运筹与管理》 CSSCI CSCD 北大核心 2024年第4期7-13,共7页
配送中心选址及区域划分是物流配送过程中的关键环节,直接决定了配送时效及配送成本,在当今电子商务领域显得尤为重要。本文针对国内医药电商企业,提出了一种考虑药品配送时效的配送中心选址策略;随后建立该问题的整数规划模型,采用最... 配送中心选址及区域划分是物流配送过程中的关键环节,直接决定了配送时效及配送成本,在当今电子商务领域显得尤为重要。本文针对国内医药电商企业,提出了一种考虑药品配送时效的配送中心选址策略;随后建立该问题的整数规划模型,采用最小权顶点覆盖方法描述问题,并通过优先队列分支限界算法对此模型进行求解,得出最优选址结果;最后按最小运费原则将被重复覆盖区域进行再划分,得到配送中心选址及区域划分最终方案。本文基于上述策略为国内某头部医药电商企业提供了两种选址方案:保留企业原有配送中心并确定新配送中心选址点(改进选址方案)和从企业所有需求节点中重新为配送中心选址(重选址方案),并使用企业真实销量和物流数据进行算例分析。 展开更多
关键词 配送中心选址 区域划分 最小权顶点覆盖 优先队列分支限界算法
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基于边权的最小权重3路顶点覆盖算法
5
作者 范鼎 刘春颜 +1 位作者 李洋 赵蕴龙 《应用科技》 CAS 2024年第4期69-74,共6页
城际仓储选址通常可以转化为顶点覆盖问题,顶点覆盖问题是一种经典的NP难问题。针对最小权重3路顶点覆盖问题,设计了基于边权和顶点度的贪心策略,构建了1个两阶段的最小权重3路顶点覆盖算法。通过与2种较优的最小权重3路顶点覆盖算法进... 城际仓储选址通常可以转化为顶点覆盖问题,顶点覆盖问题是一种经典的NP难问题。针对最小权重3路顶点覆盖问题,设计了基于边权和顶点度的贪心策略,构建了1个两阶段的最小权重3路顶点覆盖算法。通过与2种较优的最小权重3路顶点覆盖算法进行对比实验分析可知,本文提出的算法在城际物流仓储选址问题中具有较好的效果,最小权重和分别减少了3.34和1.13个百分点。 展开更多
关键词 顶点覆盖 3路顶点覆盖 最小权重3路顶点覆盖 组合优化 图论 边权策略 物流建仓 贪心策略
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求图的最小顶点覆盖集的一个近似算法 被引量:8
6
作者 闫兴篡 殷建平 +1 位作者 蔡志平 刘湘辉 《哈尔滨工业大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1131-1135,共5页
已有的求图的最小顶点覆盖集近似算法或者近似比较高,或者为降低时间复杂度限制了图的规模.根据顶点的度分析了图的局部结构特征,提出了悬挂链、封闭链和稠部等重要概念,并在这些概念的基础上提出了相应的3个伪最小覆盖点选取启发式策略... 已有的求图的最小顶点覆盖集近似算法或者近似比较高,或者为降低时间复杂度限制了图的规模.根据顶点的度分析了图的局部结构特征,提出了悬挂链、封闭链和稠部等重要概念,并在这些概念的基础上提出了相应的3个伪最小覆盖点选取启发式策略.运用这些伪最小覆盖点选取启发式策略设计了一个近似算法.该算法不限制图的规模,时间复杂度为O(|V|2),近似比为4/3,接近已知的可能的近似比下界1.1666,低于2005年认为最低的近似比1.361.与同类算法相比,该算法设计思路清晰,容易理解,易于编程实现,执行效果好,是图的最小顶点覆盖集问题的近似算法的一个重要补充. 展开更多
关键词 最小顶点覆盖集 近似算法 近似比 运行时间 NP难问题
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最小顶点覆盖快速降阶算法 被引量:9
7
作者 宁爱兵 马良 熊小华 《小型微型计算机系统》 CSCD 北大核心 2008年第7期1282-1285,共4页
通过定义判别函数来判别顶点覆盖作用的优劣,得出一个把顶点加入到最小顶点覆盖集的一般化规则,并得出该规则在多种具体情况下的应用定理,在此基础上给出了一个快速降阶算法,该算法能确定某些顶点应该在最小顶点覆盖中,某些顶点不应该... 通过定义判别函数来判别顶点覆盖作用的优劣,得出一个把顶点加入到最小顶点覆盖集的一般化规则,并得出该规则在多种具体情况下的应用定理,在此基础上给出了一个快速降阶算法,该算法能确定某些顶点应该在最小顶点覆盖中,某些顶点不应该在最小顶点覆盖中,达到降低原问题的规模和求解难度的目的.该算法既可以单独使用,又可以与算法结合来达到更好的结果,文中还给出了应用实例及其分析. 展开更多
关键词 最小顶点覆盖问题 降阶算法 完全图
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图论中的DNA计算模型 被引量:7
8
作者 殷志祥 张家秀 《系统工程与电子技术》 EI CSCD 北大核心 2007年第7期1159-1163,共5页
基于生化反应机理的DNA计算模型受到科学领域内许多不同学科学者们的关注。DNA计算已经形成国际科学前沿领域内研究的一个新的热点。主要介绍了近几年国内关于图论的DNA计算模型研究的现状及研究进展。分析了图论的DNA计算模型中存在的... 基于生化反应机理的DNA计算模型受到科学领域内许多不同学科学者们的关注。DNA计算已经形成国际科学前沿领域内研究的一个新的热点。主要介绍了近几年国内关于图论的DNA计算模型研究的现状及研究进展。分析了图论的DNA计算模型中存在的问题。指出未来国内DNA计算研究的重点可以在三个方面:解的检测,降低空间复杂度,生化实验研究。 展开更多
关键词 DNA计算 图论 最大团 最小顶点覆盖 赋权图
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基于最小点覆盖和反馈点集的社交网络影响最大化算法 被引量:7
9
作者 许宇光 潘惊治 谢惠扬 《电子与信息学报》 EI CSCD 北大核心 2016年第4期795-802,共8页
社交网络中的影响最大化问题是指在特定的传播模型下,如何寻找k个最具影响力的节点使得在该模型下社交网络中被影响的节点最多,信息传播的范围最广。该问题是一个优化问题,并且已经被证明是NP-难的。考虑到图的最小点覆盖和反馈点集中... 社交网络中的影响最大化问题是指在特定的传播模型下,如何寻找k个最具影响力的节点使得在该模型下社交网络中被影响的节点最多,信息传播的范围最广。该问题是一个优化问题,并且已经被证明是NP-难的。考虑到图的最小点覆盖和反馈点集中的顶点对图的连通性影响较大,该文提出一种基于最小点覆盖和反馈点集的社交网络影响最大化算法(Minimum Vertex Covering and Feedback Vertex Set,MVCFVS),并给出了具体的仿真实验和分析。实验结果表明,与最新的算法比较,该算法得到的节点集在多种模型下都具有优异的传播效果,例如在独立级联模型和加权级联模型中超过当前最好的算法,并且还具有更快的收敛速度。 展开更多
关键词 社交网络 影响最大化 传播模型 最小点覆盖 反馈点集
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基于BP方程算法的多机型机组恢复时空网络模型 被引量:4
10
作者 张青 马永秀 +1 位作者 杨正全 陈增强 《中国民航大学学报》 CAS 2017年第5期30-35,共6页
航空公司工作中的一个重要部分就是不正常机组排班恢复,为减少机组排班不正常对航班运行计划的影响,以航空公司资源浪费最小为优化目标,在分析不正常机组排班要满足的客观约束条件下,建立了多机型不正常机组排班恢复的时空网络数学模型... 航空公司工作中的一个重要部分就是不正常机组排班恢复,为减少机组排班不正常对航班运行计划的影响,以航空公司资源浪费最小为优化目标,在分析不正常机组排班要满足的客观约束条件下,建立了多机型不正常机组排班恢复的时空网络数学模型,并针对国内某航空公司的实际运营数据运用该模型进行实例分析,利用最小顶点覆盖(MDS)和BP方程法求解。结果表明:用MDS和BP方程法不仅加速了机组排班恢复的时间,更增加了机组排班恢复的鲁棒性。该方法利用完全相关结构,当遇到某些突发情况时,机组排班能自动随之调整,操作起来方法简便,适用面广,并且系统性强,便于普及和推广。 展开更多
关键词 BP方程 最小顶点覆盖 机组排班恢复 能量函数 时空网络模型
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基于混合优化算法的网络流量有效测量点选择 被引量:4
11
作者 葛洪伟 彭震宇 岳海兵 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2009年第4期1480-1483,1486,共5页
提出一种基于禁忌搜索和蚁群算法的求解最小弱顶点覆盖问题的混合优化算法,用于解决网络流量有效测量点的选择问题。仿真结果表明,比较现有算法,本算法能够找到更小的弱顶点覆盖集,且具有更好的可扩展性和实用性。
关键词 蚁群优化算法 禁忌搜索算法 最小弱顶点覆盖
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基于最短路算法的最小点覆盖问题 被引量:3
12
作者 寇磊 崔笑川 陈京荣 《兰州交通大学学报》 CAS 2015年第4期157-159,165,共4页
基于经典的最短路算法——Dijkstra算法,以最短路路长的最大值为标准,按照一定原则选择点覆盖的顶点,得出了最小点覆盖问题的一个近似算法,其时间复杂性为O(n3).最后给出了一个近似比为1.067的算例,阐释了算法的实现过程及有效性.
关键词 最小点覆盖问题 DIJKSTRA算法 近似算法 时间复杂性
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一种混合化学反应优化算法求解最小顶点覆盖问题 被引量:1
13
作者 郑光勇 徐雨明 +1 位作者 李肯立 孙士兵 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2016年第9期2669-2672,共4页
最小顶点覆盖问题是组合最优化问题,在实际应用中有较广泛的应用,是一个NP难问题。针对最小顶点覆盖问题给出了一种混合化学反应优化求解算法。首先根据无向图的邻接矩阵表示法,设计了参与化学反应的分子编码和目标函数;同时把贪心算法... 最小顶点覆盖问题是组合最优化问题,在实际应用中有较广泛的应用,是一个NP难问题。针对最小顶点覆盖问题给出了一种混合化学反应优化求解算法。首先根据无向图的邻接矩阵表示法,设计了参与化学反应的分子编码和目标函数;同时把贪心算法思想创造性地融入到化学反应优化算法的四个重要反应算子中,以加快局部较优解的搜索过程;最后通过模拟化学反应中分子势能趋于稳定的过程,在问题的解空间中搜索其最优解。模拟实验结果表明,该算法对于求解无向图的最小顶点覆盖问题是有效的,并且在求解效率等方面有一定的改善。 展开更多
关键词 最小顶点覆盖问题 组合优化 无向图 化学反应优化 贪心算法
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一种基于链暗示技术的二分图受约束最小点覆盖问题的近似算法 被引量:1
14
作者 许小双 王建新 +1 位作者 刘云龙 陈建二 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2007年第6期270-273,282,共5页
二分图受约束最小点覆盖问题作为一个NP-完全问题,无法在多项式时间内得到最优解,除非P=NP。基于此,本文提出了一种基于链暗示技术的二分图受约束最小点覆盖问题的近似算法,具体为:当二分图受约束最小点覆盖问题实例中存在满足约束条件... 二分图受约束最小点覆盖问题作为一个NP-完全问题,无法在多项式时间内得到最优解,除非P=NP。基于此,本文提出了一种基于链暗示技术的二分图受约束最小点覆盖问题的近似算法,具体为:当二分图受约束最小点覆盖问题实例中存在满足约束条件的最小点覆盖(ku,kl)时,对任意给定的近似率δ=1+ε>1,一定可以找到一个受约束近似点覆盖(ku,kl),对应的近似率为max{ku/ku,kl/kl}≤1+ε,整个近似算法的运行时间复杂度为O(22/ε)。显然,它是二分图受约束最小点覆盖问题的一个多项式时间近似方案(polynomial time approximation scheme,PTAS算法)。 展开更多
关键词 二分图的受约束最小点覆盖 近似算法 参数计算 PTAS算法
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图的最小顶点覆盖的粘贴DNA计算模型 被引量:3
15
作者 聂晓艳 耿俊 汤建钢 《首都师范大学学报(自然科学版)》 2013年第1期7-12,共6页
本文在对经典粘贴模型以及全信息化的粘贴DNA计算模型的基本方法进行充分讨论的基础上,提出一种用粘贴DNA计算模型解决图的最小顶点覆盖问题的新方案,将数学问题的求解同并行生物操作有效结合.
关键词 DNA计算 粘贴模型 最小顶点覆盖问题
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一种增量式约简方法求解最小顶点覆盖问题 被引量:2
16
作者 占善华 谢小军 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2018年第12期3685-3688,共4页
最小顶点覆盖问题是一个应用很广泛的NP难题,针对该问题给出一种增量式属性约简方法。首先将最小顶点覆盖问题转换为一个决策表的最小属性约简问题;利用增量式属性约简思想,随着图中边数的增多,提出一种更新最小顶点覆盖的增量式属性约... 最小顶点覆盖问题是一个应用很广泛的NP难题,针对该问题给出一种增量式属性约简方法。首先将最小顶点覆盖问题转换为一个决策表的最小属性约简问题;利用增量式属性约简思想,随着图中边数的增多,提出一种更新最小顶点覆盖的增量式属性约简算法;该算法时间复杂度低于计算整个图的最小顶点覆盖的时间复杂度,同时针对大规模图问题,可随着边的增加动态更新最小顶点覆盖,因此降低了属性约简的方法求解最小顶点覆盖问题的运行时间。实验结果表明了该算法的可行性和有效性。 展开更多
关键词 增量式约简 最小顶点覆盖 最小属性约简 大规模图
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关于近似二部图边覆盖染色的一个充分条件 被引量:1
17
作者 王纪辉 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第1期21-23,共3页
设G是一个简单图,其顶点集为V(G)而边集为E(G).S E(G)称为G的一个边覆盖,如果由S导出的子图是G的一个生成子图.G的边覆盖色数χc′(G)是E(G)所能划分成的最大边覆盖数.已知δ-1χc′(G)δ,由此将χc′(G)=δ的图称为CⅠ类图,否则称为C... 设G是一个简单图,其顶点集为V(G)而边集为E(G).S E(G)称为G的一个边覆盖,如果由S导出的子图是G的一个生成子图.G的边覆盖色数χc′(G)是E(G)所能划分成的最大边覆盖数.已知δ-1χc′(G)δ,由此将χc′(G)=δ的图称为CⅠ类图,否则称为CⅡ类图.显然,图的边覆盖染色分类问题是NP-完全的.给出了近似二部图是CⅠ类图的一个充分条件,而且该条件中的下界是最好的. 展开更多
关键词 近似二部图 边覆盖染色 最小度顶点 边覆盖色数
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一类边覆盖临界图的构造 被引量:1
18
作者 王纪辉 张苏梅 吕乙婷 《曲阜师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2007年第1期32-34,共3页
在图的边覆盖染色中边覆盖临界图的构造问题一直是研究的热点和难题.给出了一类边覆盖临界图的构造方法.对于任意给定的最小度δ,利用该方法可以构造出相应的一类边覆盖临界图.
关键词 边覆盖临界图 边覆盖染色 最小度顶点
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广义Petersen图的最小点覆盖集 被引量:1
19
作者 郑文萍 郭炳 杨贵 《山西师范大学学报(自然科学版)》 2014年第1期1-6,共6页
点覆盖问题是一个著名的NP完全问题.本文对广义Petersen图P(n,2)的精确最小点覆盖数进行研究,讨论并证明了广义Petersen图P(n,2)的最小点覆盖数,给出了最小点覆盖集的构造方法.
关键词 最小点覆盖集 点覆盖数 广义PETERSEN图
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边覆盖临界图的一些性质 被引量:3
20
作者 宋慧敏 刘桂真 《数学进展》 CSCD 北大核心 2004年第1期96-102,共7页
设G是一个简单图,其顶点集为V(c)而边集为E(G),S(?)E(G)称为G的一个覆盖,如果由S导出的子图为G的一个生成子图. G的边覆盖色数xc'(G)是E(G)所能划分成的最大边覆盖数.已知δ-1≤xc'(G)≤δ,由此将xc'(G):δ的图称为CI类图,... 设G是一个简单图,其顶点集为V(c)而边集为E(G),S(?)E(G)称为G的一个覆盖,如果由S导出的子图为G的一个生成子图. G的边覆盖色数xc'(G)是E(G)所能划分成的最大边覆盖数.已知δ-1≤xc'(G)≤δ,由此将xc'(G):δ的图称为CI类图,否则称为CII类图.若G是连通CII类图,且G不是完全图,对任意的u,v∈V(G),e=uv(?)E(G),都有xc'(G+e)>xc'(G)成立,则称G为边覆盖临界的.本文研究了边覆盖临界图的一些性质.即若G为边覆盖临界图,则对任意的u,v∈V(G),若e=uv(?)E(G),总存在W∈{u,v},有d(w)≤2δ-2,且ω至少与max{d(w)-δ+1,3d(ω)-4δ+4}个最小度顶点相邻. 展开更多
关键词 边覆盖临界图 简单图 完全图 CII类图 色数
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