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Sequence Analysis of Mitochondrial DNA D-loop Region in Xinjiang Goose 被引量:1
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作者 邵勇钢 岳涛 +1 位作者 李建华 刘银凤 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2012年第11期2290-2292,2337,共4页
[Objective] The sequences of mitochondrial DNA D-loop region of Xinjiang Goose with three different colors of plumage were analyzed in order to study the genetic diversity of Xinjiang Goose, as well as the phylogeny a... [Objective] The sequences of mitochondrial DNA D-loop region of Xinjiang Goose with three different colors of plumage were analyzed in order to study the genetic diversity of Xinjiang Goose, as well as the phylogeny and evolution. [Method] Ten geese were selected randomly from the core populations of grey-, mosaic- and white-plumaged Xinjiang Goose respectively with a total number of thirty as experi- mental materials, of which the blood samples were collected from the largest vein under the wing (brachial vein) for DNA extraction. Sequences of mitochondrial DNA D-loop regions were determined using DNA sequencing technology to analyze the polymorphism. In addition, the genetic distances among different populations were estimated through the comparison with the reference sequences. [Resull] The con- tents of A, G, C and T nucleotides in the D-loop region of Xinjiang Goose were 28.85%, 17.05%, 25.38% and 28.72%, respectively. The average haplotype diversity and nucleotide diversity of Xinjiang Goose were 0.583 and 0.056. Xinjiang Goose and Greylag Goose were clustered into the same group. [Conclusion] The results showed that Xinjiang Geese with three different colors of plumage all descend from Greylag Goose (Anser anser). 展开更多
关键词 Xinjiang Goose Mitochondrial dna d-loop region Sequence analysis
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基于线粒体DNAD-loop区全序列分析大围山微型鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究 被引量:14
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作者 贾晓旭 唐修君 +4 位作者 陆俊贤 顾荣 葛庆联 高玉时 苏一军 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期656-660,共5页
[目的]探究大围山微型鸡的遗传多样性和起源。[方法]对30只大围山微型鸡线粒体DNA(mitochondrial genome,mt DNA)D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,并结合GenBank已登录红色原鸡的D-loop区全序列,运用现代生物信息学方法进行数据处理... [目的]探究大围山微型鸡的遗传多样性和起源。[方法]对30只大围山微型鸡线粒体DNA(mitochondrial genome,mt DNA)D-loop区全序列进行PCR扩增和测序,并结合GenBank已登录红色原鸡的D-loop区全序列,运用现代生物信息学方法进行数据处理。[结果]试验结果表明:大围山微型鸡mt DNA D-loop区全长1 231~1 232 bp,1 231 bp单倍型在859 bp处存在C碱基缺失。核苷酸多样性(Pi)为0.004 43±0.000 14,单倍型多样性(Hd)为0.685±0.079,核苷酸平均差异数(K)为5.448。在30只个体中,共发现18处单核苷酸多态位点,6种单倍型。系统发育分析发现,6种单倍型可以分为A、B、D和E 4个分支,其中A和B为主要分支。A和B分支各有2种单倍型,D和E分支均只有1种单倍型。A和B分支与红色原鸡滇南亚种(Gallus gallus spadiceus)聚为一类。[结论]大围山微型鸡mt DNA D-loop区有丰富的多态性,并且有多个母系起源,红色原鸡滇南亚种在大围山微型鸡形成过程中贡献最大。 展开更多
关键词 大围山微型鸡 线粒体dna d-loop 系统发育关系 起源
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藏系绵羊贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊线粒体DNA D-LOOP区遗传多样性研究 被引量:1
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作者 何孝凡 金红 +1 位作者 胡建 徐亚欧 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2013年第2期162-167,共6页
为探讨藏系绵羊贾洛类群的起源、进化和遗传多样性,通过对贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊三个群体51只绵羊的线粒体DNA D-LOOP区全序列进行测序分析.结果表明:51条序列长度范围为1032-1331bp,以1181bp为主(含4个75bp重复序列),A%+T%含... 为探讨藏系绵羊贾洛类群的起源、进化和遗传多样性,通过对贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊三个群体51只绵羊的线粒体DNA D-LOOP区全序列进行测序分析.结果表明:51条序列长度范围为1032-1331bp,以1181bp为主(含4个75bp重复序列),A%+T%含量大于G%+C%含量,贾洛类群与阿勒泰羊亲缘关系较近,三个绵羊群体有3个独立的母系起源,没有发现羱羊对臧系绵羊贾洛类群、阿勒泰羊、新疆细毛羊起源有贡献的证据. 展开更多
关键词 贾洛类群 线粒体dna D—LOOP区 全序列 遗传多样性
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沙鳅亚科鱼类线粒体DNA控制区结构分析及系统发育关系的研究 被引量:41
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作者 唐琼英 刘焕章 +1 位作者 杨秀平 熊邦喜 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第6期645-653,共9页
对沙鳅亚科鱼类3属14个代表种的线粒体DNA控制区序列的结构进行了分析。通过与鲤形目鱼类的控制区序列进行比较,将沙鳅亚科鱼类的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区三个区域。同时识别了沙鳅亚科中一系列保守序列,并给出了... 对沙鳅亚科鱼类3属14个代表种的线粒体DNA控制区序列的结构进行了分析。通过与鲤形目鱼类的控制区序列进行比较,将沙鳅亚科鱼类的控制区分为终止序列区、中央保守区和保守序列区三个区域。同时识别了沙鳅亚科中一系列保守序列,并给出了它们的一般形式。以胭脂鱼为外类群,对比条鳅亚科、花鳅亚科、以及平鳍鳅科的代表性种类,采用NJ、MP和ML法构建沙鳅亚科的分子系统树。分子系统发育分析表明,沙鳅亚科为一单系,包括3个属:沙鳅属、副沙鳅属和薄鳅属,各属均构成单系。根据分子系统学、形态学的结果及地理分布推断,沙鳅亚科中沙鳅属可能为最为原始的属,副沙鳅属其次,而薄鳅属最特化。 展开更多
关键词 沙鳅亚科 线粒体dna 控制区 系统发育
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线粒体高变区多聚C-stretch序列长度多态性 被引量:3
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作者 托娅 刘清波 李生斌 《法医学杂志》 CAS CSCD 2007年第2期123-126,共4页
目的研究线粒体高变区多聚C-stretch序列长度多态性,并探讨其在法医学个体识别中的价值。方法针对线粒体高变区nt16180及nt310两个位点采用文献报道引物,应用直接测序技术研究其等位基因分布及频率。结果两对引物扩增长度分别为807bp和9... 目的研究线粒体高变区多聚C-stretch序列长度多态性,并探讨其在法医学个体识别中的价值。方法针对线粒体高变区nt16180及nt310两个位点采用文献报道引物,应用直接测序技术研究其等位基因分布及频率。结果两对引物扩增长度分别为807bp和962bp,nt16180位点检测到7种基因型,其中AAAACCCCCTCCCC基因型占87.72%,AAAACCCCCCCCCCCCC基因型在汉族人群中首次报道;nt310检测到7种基因型,其中CCCCCCCCTCCCCCC基因型占60.53%;联合两个位点共检测出15种单倍型,GD值为0.6309,其中AAAACCCCCTCCCC-CCCCCCCCTCCCCCC检测出66条,达到57.89%。结论为线粒体控制区DNA在法医学领域中的应用提供基础数据,证实了线粒体nt16180位点和nt310位点单倍型在线粒体DNA鉴定中有较好的应用价值。 展开更多
关键词 线粒体dna 高变区 多聚C 序列长度多态性 测序 法医学 个体识别
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中国皮划艇、举重运动员线粒体高变区Ⅱ同质序列多态性分析 被引量:1
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作者 高晓嶙 常芸 +3 位作者 刘爱杰 董生辉 庞高兴 廉贺群 《中国运动医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期261-265,共5页
目的:通过对线粒体基因(mtDNA)高变区Ⅱ(HVR-Ⅱ)作序列多态性分析,探讨与人类运动能力相关的基因标记及其分子机制。方法:受试者均为中国汉人,其中皮划艇运动员123人,举重运动员70人,对照组132人。通过特异性扩增mtDNAHVR-Ⅱ片段并测序... 目的:通过对线粒体基因(mtDNA)高变区Ⅱ(HVR-Ⅱ)作序列多态性分析,探讨与人类运动能力相关的基因标记及其分子机制。方法:受试者均为中国汉人,其中皮划艇运动员123人,举重运动员70人,对照组132人。通过特异性扩增mtDNAHVR-Ⅱ片段并测序,分析其序列多态性变化。结果与结论:中国皮划艇、举重运动员和普通汉人对照的mtDNAHVR-Ⅱ具有很高序列多样性,遗传变异性大,遗传多样性丰富。3组人群mtDNAHVR-Ⅱ同质性序列多态性无显著性差异,并具有共同特征:(1)碱基替换频率高于重排频率,碱基替换以转换为主,碱基转换中以嘌呤转换为主,嘌呤转换中以A-G频率最高;(2)重排以碱基插入为主,其中插入C频率最高,其次为CC;(3)3组人群mtDNAHVR-Ⅱ与HVR-Ⅰ具有相似的碱基替换频率。在HVR-Ⅱ中,np73位点的A-G多态性频率具有明显的种族和地域差异。 展开更多
关键词 运动能力 线粒体基因 高变区Ⅱ 同质 序列多态性
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急性白血病线粒体D—loop区微卫星D310和D16184不稳定性研究 被引量:4
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作者 陈明 周永安 +6 位作者 马云霞 苏丽萍 张景萍 张全斌 王钰 郭珍平 王鹏飞 《白血病.淋巴瘤》 CAS 2011年第1期15-17,22,共4页
目的探讨线粒体D—loop区微卫星(MSI)D310和D16184在急性白血病(AL)中的不稳定性:方法采用反转录聚合酶链一单链构象多态性分忻(PCR—SSCI,)法筛选100例初诊末治及治疗的AI.患者D—loop区H、1—1和HV-2。对迁移异常者进行测序... 目的探讨线粒体D—loop区微卫星(MSI)D310和D16184在急性白血病(AL)中的不稳定性:方法采用反转录聚合酶链一单链构象多态性分忻(PCR—SSCI,)法筛选100例初诊末治及治疗的AI.患者D—loop区H、1—1和HV-2。对迁移异常者进行测序,结果与剑桥标准序列(rCRS)和mtDB数据库进行比对,分析其突变情况。比较各组组中D310和D16184的突变率:结果100例AL患者中,D310总突变49例(49.0%),未治疗组40例中突变13例(32.5%),治疗组60例中突变36例(60.0%),治疗组高于未治疗组(P〈0.05);D16184总突变32例(32.0%),未治疗组突变8例(20.0%),治疗组为24例(40.0%),治疗组高于末治疗组(P〈O.05)。结论D310和D16184在AL中存在较高的突变率和多种突变类型,具有较强的不稳守件:化疗可能增强微可足的不静帝忡. 展开更多
关键词 白血病 急性 dna 线粒体 D—loop区 微卫星不稳定性
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