基于农艺性状和分子标记的甘薯遗传多样性分析及指纹图谱构建

【目的】基于农艺性状和分子标记对福建甘薯品种进行遗传多样性分析及指纹图谱构建,为福建省甘薯育种亲本选配和遗传背景研究提供理论依据。【方法】以福建省育成及引进的24个甘薯品种为研究对象,对其农艺性状进行调查测定,利用筛选出的28条ISSR引物和27对SRAP引物进行遗传多样性分析,利用SPSS 26.0的组间联接法和平均欧式距离法进行农艺性状聚类分析;利用NTSYS-pc 2.1进行分子标记聚类分析。基于ISSR和SRAP扩增结果进行指纹图谱构建。【结果】农艺性状聚类分析结果显示,在欧氏距离为8时,24个甘薯品种被分为三大类:第Ⅰ类为泉薯76、泉薯12号和龙薯14号;第Ⅱ类包含徐紫薯2号、泉薯10号、莆薯20、福薯24号、莆紫薯18和福宁紫3号;其余15个品种归在第Ⅲ类。28条ISSR引物和27对SRAP引物分别扩增条带362和364条,多态性比率分别为78.73%和83.79%,部分引物多态率高达100.00%,平均等位基因数(Na)分别为1.7676和1.8307;平均有效等位基因数(Ne)分别为1.4071和1.4631,平均Nei’s基因多样性指数(H’)分别为0.2435和0.2730,平均Shannon’s信息指数(I)分别为0.3705和0.4124。基于ISSR分子标记,24个甘薯品种的遗传相似系数为0.674~0.851,在遗传相似系数0.728处可分为三大类:第Ⅰ类仅包含福宁紫3号,第Ⅱ类包含福薯24号、徐紫薯2号、莆薯20、莆薯53、莆紫薯18、莆紫薯3号、福薯404和莆薯16,其余15个品种归为第Ⅲ类。基于SRAP分子标记,24个甘薯品种的遗传相似系数为0.591~0.879,在遗传相似系数0.696处可分为三大类,第Ⅰ类仅包含泉薯76,第Ⅱ类包含莆紫薯18和徐紫薯2号,其余21个品种归为第Ⅲ类。引物UBC899可用于构建24份甘薯种质资源的指纹图谱。【结论】ISSR和SRAP分子标记的多态性检测效率较高,均适用于甘薯种质资源的遗传变异分析。24份供试甘薯材料遗传多样性较丰富,农艺性状聚类结果与分子标记聚类结果相似但又有明显差异,ISSR分子标记聚类结果与种质资源系谱更吻合,引物UBC899可用于供试甘薯品种区分。

杨树分子标记研究进展

该文介绍了在杨树育种中常用的三种分子标记 :RFLP ,RAPD和AFLP ,并综述了其在杨树指纹图谱、遗传图谱构建和数量性状基因定位等方面的研究进展 .

茶花品种SSR指纹图谱分型技术反应体系优化

建立茶花品种分子指纹图谱对茶花品种鉴别、品种选育和深入实施品种产权保护等具有重要意义。为筛选适用于茶花品种SSR指纹图谱构建的引物及其最优反应体系,采用梯度退火温度和正交试验设计的方法,对4对SSR引物反应条件进行了研究。结果表明,2对引物扩增出目的条带,其中引物MSCjaF25最适退火温度52.9℃,10mL体系中各组分含量为Mg2+1.2mmol/L、dNTPs0.2mmol/L、TaqDNA聚合酶0.5U、引物0.2mmol/L以及模板DNA40ng时图谱质量最优;引物MSCjaF37最适退火温度58.2℃,10mL体系中各组分含量为Mg2+0.8mmol/L、dNTPs0.1mmol/L、TaqDNA聚合酶1.0U、引物0.3mmol/L以及模板DNA40ng时,图谱质量最优。以12个茶花品种进行扩大试验证明,优化的体系重复性和稳定性良好。研究为茶花品种分子指纹图谱的构建奠定重要基础。进一步分析显示,全面开展茶花品种分子指纹图谱研究还面临着筛选更多通用SSR引物的挑战。

三倍体毛白杨无性系的AFLP分子标记鉴定

利用AFLP标记技术采用MseⅠ+3/EcoRⅠ+2引物组合,对12个三倍体毛白杨和二倍体毛白杨无性系进行了分析鉴定.从38对引物组合中选出12对扩增条带较多的引物组合,多态性比例最高的是M--CAT/E--TC,多态性水平达到32.4%,最低的M--CTT/E--TT只有15.7%,证明供试材料之间的亲缘关系较近;UPGMA聚类分析结果与供试材料的系谱关系以及形态鉴别结果一致,表明凡亲本相同或形态差异小的无性系具有较高的相似系数;利用3个引物组合的8条多态性条带构建了12个供试材料的指纹图谱,可以作为三倍体毛白杨无性系鉴别以及品种保护的依据.

花生新品种汕油21种子纯度SSR标记鉴定体系的建立和应用

为探索花生品种纯度的分子标记鉴定方法,采用SSR标记构建不同花生品种的指纹图谱。结果表明:利用3对SSR标记引物构建20个花生品种的指纹图谱,该图谱可以将汕油21与其它19个花生品种进行区分,这些品种包括汕油162、汕油212、汕油31、汕油33、汕油71、粤油5号、粤油7号、粤油29、粤油32、汕油27、汕油523、粤油9号、粤油13、粤油14、粤油79、粤油114、J11、仲恺花1号和泉608等;以3对SSR引物对汕油21繁育种子60个样品进行种子纯度检测,共有2对标记引物检测到3个杂株样品,该种子批的纯度为95.0%。因此,利用SSR标记构建花生品种指纹图谱并应用于汕油21品种纯度鉴定是可行的。

美洲黑杨与大青杨杂种无性系分子鉴定

采用AFLP标记技术,利用EcoR I+2/Mse I+3引物组合对美洲黑杨与大青杨12个杂种无性系进行分子鉴定,结果表明,从32对引物组合中筛选出10对扩增条带较多的引物组合,扩增得到总条带数在7-52条之间,多态性条带数在2-28条之间,条带多态性比例分布范围为23.5%-41.6%,多态性条带数和多态性比例均较低,表明各个参试样品之间的亲缘关系较近;UPGMA聚类分析结果与12个无性系的系谱关系一致,表明亲本相同的无性系具有较高的相似系数;利用6个引物组合的9条多态性条带绘制了12个无性系的指纹图谱,为美洲黑杨与大青杨杂种无性系鉴定以及品种保护提供依据。

分子标记及其在林木遗传多样性研究中的应用

介绍了RFLP、RAPD、AFLP、SSR、ISSR等遗传标记技术的基本原理与特点.综述了DNA分子标记在林木遗传多样性研究、林木遗传资源研究、DNA指纹图谱研究和种质资源鉴定等方面的应用及前景.

SSR分子标记及其在农作物育种中的应用

在概述简单重复序列(SSR)标记的发现过程、结构特征、原理和方法、技术优缺点的基础上,详细介绍此技术在遗传多样性、DNA指纹库、遗传图谱构建和基因定位及分子标记辅助选择等研究上的应用情况,并分析了SSR技术在农作物育种领域的广阔应用前景。

35份甘蔗种质的遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

【目的】利用SRAP分子标记分析35份甘蔗种质的遗传多样性,并构建其DNA指纹图谱,为甘蔗种质资源的分子鉴定提供技术支持。【方法】以凉蔗系列(26份)为主的35个甘蔗品种(系)为供试材料,利用SRAP分子标记的8条正向引物和14条反向引物随机组成112对引物组合,从中筛选出核心引物对35份甘蔗材料进行遗传多样性分析,并利用POPGENE 1.32计算各材料间的Nei’s遗传相似系数,使用Ntsyspc 2.1 UPGMA方法进行聚类分析,并构建DNA指纹图谱。【结果】从112对引物组合中筛选出4对核心引物组合(Me3/Em8、Me4/Em8、Me5/Em8和Me6/Em2),利用其从35份甘蔗材料中共扩增出102条条带,平均每对引物的扩增条带数、多态性条带数和多态性比率分别为25.5条、21条和81.20%,各引物组合扩增的条带数为21~30条,多态性比率为61.90%~96.55%。根据Nei’s遗传相似系数,在遗传相似系数为0.751时,可将35份甘蔗材料分为五大类,26个凉蔗系列品种(系)(除凉蔗07-54外)均归在I类和II类,说明凉蔗系列的亲缘关系较近;桂糖73-167和农垦2号分别被单独归为一类,说明这两个品种(系)间及与其他品种(系)间的亲缘关系较远;I类中除凉蔗系列之外,还包括粤糖91-976和ROC16,说明这两个品种(系)有可能是I类中凉蔗系列的杂交亲本或存在血缘关系;II类中除凉蔗系列外,还包括B8、ROC22、ROC24和ROC10,说明这4个品种(系)的亲缘关系较近,ROC系列可能存在II类中凉蔗系列的亲本。利用这4对核心引物组合构建的DNA指纹图谱均可将35份甘蔗材料鉴别开。【结论】35份甘蔗材料的遗传多样性丰富,构建的DNA指纹图谱可用于甘蔗品种(系)鉴定。

分子标记在澳洲坚果遗传育种中的应用研究进展

分子标记技术是一种能够提高作物育种效率的有效工具,目前在澳洲坚果遗传育种等方面已广泛应用。本文综合阐述了分子标记技术在澳洲坚果种质资源的遗传多样性分析、DNA分子指纹图谱构建、遗传连锁图谱构建等方面的研究进展,并分析了其在澳洲坚果中的应用前景。

新疆主栽骨干棉花品种指纹图谱构建及纯度鉴定

[目的]构建新疆主栽骨干棉花品种的指纹图谱,分析棉花品种纯度,为棉花品种提供分子鉴定依据。[方法]以典型代表性的新疆北疆早熟棉花主推骨干棉花品种为材料,利用SSR分子标记技术从1000多对SSR引物中筛选出稳定性好、多态性高的25对核心引物构建指纹图谱,从核心引物中筛选10对引物作为标记,分析4个棉花品种的纯度。[结果]检测到等位基因数70个,每个标记检测到的等位基因数介于2~7个,平均2.8个;引物多态信息量(PIC)值介于0.1690~0.8729,平均值为0.6883;利用4个特征引物将4个棉花品种一次性完全区分开,构建供试品种的指纹图谱;利用10对引物检测4个品种的纯度,新陆早6号纯度变化范围85%~100%,系62纯度变化范围95%~100%。[结论]构建了4个棉花品种的指纹图谱及鉴定纯度,系62号纯度最高,为99.5%,新陆早6号纯度最低,为92.0%。

茶花品种ISSR指纹图谱反应体系建立与优化

以30个茶花品种为试材,采用5因素4水平正交实验以及单因素优化试验方法,研究Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶浓度和模板DNA浓度对ISSR-PCR指纹图谱条带清晰度的影响,以进行茶花品种ISSR-PCR反应体系优化及引物筛选。结果表明:茶花品种ISSR-PCR最适扩增条件为25μL反应体系中,Mg2+3.0mmol/L、dNTPs 0.2mmol/L、引物0.3mmol/L、Taq DNA聚合酶0.5U、模板DNA 80ng以及52.1℃退火温度;试验从100个ISSR引物中筛选出12个适用引物;并对12个ISSR引物的多态性和稳定性进行了检验。

中药多糖质量控制体系初探

中药多糖的质量控制对确保其有效性和安全性至关重要,然而多糖结构的复杂性导致多糖质控标准研究进展缓慢。建立中药多糖类产品质控体系,既是对已上市产品质量的保证,更是多糖类新药研发的关键前提。本文对中药多糖质量标准现状、研究现状进行了总结,同时对一些新的研究思路,如多元指纹图谱和糖谱法进行介绍。在此基础上提出了目前中药多糖质控体系亟需解决的问题,旨在为中药多糖质量控制体系的建立提供参考。