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分子对接在筛选抗宫颈癌药物中的研究进展
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作者 王丹 张文艳 +6 位作者 罗仁洁 陈元静 韩雪 曲波 冯石芳 聂夏子 刘会玲 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期955-960,共6页
宫颈癌是最常见的妇科恶性肿瘤之一,在淋巴结转移和远处转移的情况下,五年生存率显著下降,因此研发新型抗宫颈癌药物对于治疗宫颈癌有重大的意义。分子对接技术是计算机辅助药物设计技术中最常用的研究方法之一,在筛选药物有效成分、发... 宫颈癌是最常见的妇科恶性肿瘤之一,在淋巴结转移和远处转移的情况下,五年生存率显著下降,因此研发新型抗宫颈癌药物对于治疗宫颈癌有重大的意义。分子对接技术是计算机辅助药物设计技术中最常用的研究方法之一,在筛选药物有效成分、发现药物作用于肿瘤的靶点以及探索抗肿瘤药物的作用机制中被广泛应用。本文将分子对接技术在抗宫颈癌药物筛选、抗肿瘤靶标确定方面以及抗宫颈癌作用机制等方面作一综述,为筛选抗宫颈癌药物及新药研发提供更充分的理论依据。 展开更多
关键词 宫颈癌 分子对接 虚拟筛选 靶标蛋白 作用机制
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Claudin18.2分子特征概述及其作为治疗靶点在胃癌中的研究进展
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作者 王桂慧 廖海燕 +3 位作者 何媚 靳枫 王树滨 高静 《肿瘤综合治疗电子杂志》 2024年第2期146-154,共9页
作为紧密连接蛋白(Claudin,CLDN)家族成员之一,Claudin18.2(CLDN18.2)在正常情况下仅在正常胃黏膜上皮细胞中表达,以维持细胞正常功能。但在异常情况下,CLDN18.2在包括胃癌在内的多种恶性肿瘤中呈高表达状态,使其成为治疗前景非常高的... 作为紧密连接蛋白(Claudin,CLDN)家族成员之一,Claudin18.2(CLDN18.2)在正常情况下仅在正常胃黏膜上皮细胞中表达,以维持细胞正常功能。但在异常情况下,CLDN18.2在包括胃癌在内的多种恶性肿瘤中呈高表达状态,使其成为治疗前景非常高的新靶点。目前,靶向CLDN18.2的抗肿瘤新药研发如火如荼,药物类型和治疗策略呈现多样化。本文旨在概述CLDN18.2的分子特征,并对胃癌中靶向CLDN18.2的新药/新技术研发现状进行梳理,包括单克隆抗体、双特异性抗体、抗体药物偶联物、嵌合抗原受体T细胞免疫疗法、纳米抗体等。 展开更多
关键词 胃癌 紧密连接蛋白 Claudin18.2(CLDN18.2) 分子特征 治疗靶点
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芳香烯胺酮类化合物的合成与抗肿瘤活性分析
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作者 王滔 周英 +2 位作者 董张超 石洋 潘博文 《合成化学》 CAS 2024年第8期685-695,共11页
随着人口增长和老龄化严重,全球癌症治疗负担也在同步增加,为获得具有更优性质的潜在抗肿瘤药物,设计、合成了12个烯胺酮类化合物(3a~3l)。化合物结构通过^(1)H NMR进行确证,接着采用Schr dingers Maestro软件将目标产物与抗肿瘤有关的... 随着人口增长和老龄化严重,全球癌症治疗负担也在同步增加,为获得具有更优性质的潜在抗肿瘤药物,设计、合成了12个烯胺酮类化合物(3a~3l)。化合物结构通过^(1)H NMR进行确证,接着采用Schr dingers Maestro软件将目标产物与抗肿瘤有关的8个靶蛋白进行分子对接预测其活性,并通过MTT(噻唑蓝)实验进行验证。对接结果通过Discovery Studio软件进行可视化分析,进一步明确其结合模式。结果表明:大多数化合物的产率良好至优,目标产物与8种蛋白均有不同程度的结合。目标化合物可通过Pi-Alkyl键、氢键和范德华力等多种分子间作用力与靶标蛋白活性位点附近的氨基酸残基结合,进而产生抗癌效应。其中,化合物3f与靶蛋白VEGFR2的对接效果最佳,普遍优于其他7个靶蛋白,具有较强的结合亲和力。此外,化合物3f对白血病细胞(K562)的抗增殖活性优于顺铂,化合物3b对宫颈癌细胞(Hela)的抗增殖活性优于顺铂。该研究可为基于靶点的抗肿瘤药物研发奠定一定的基础。 展开更多
关键词 烯胺酮 分子对接 抗肿瘤 靶蛋白 合成
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番茄斑萎病毒蛋白结构及其抑制剂作用机制研究进展
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作者 浦贤 李向阳 《农药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期625-636,772,共13页
番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus,TSWV)基因组可编码RdRp、NSm、NSs、Gc、Gn和N等多种蛋白,目前,相关研究主要集中在植物(番茄和辣椒)对TSWV的抗病基因(Sw-5b和Tsw)所介导的抗性以及药剂对TSWV N蛋白的抑制作用。TSWV蛋白具有... 番茄斑萎病毒(tomato spotted wilt virus,TSWV)基因组可编码RdRp、NSm、NSs、Gc、Gn和N等多种蛋白,目前,相关研究主要集中在植物(番茄和辣椒)对TSWV的抗病基因(Sw-5b和Tsw)所介导的抗性以及药剂对TSWV N蛋白的抑制作用。TSWV蛋白具有作为药剂分子靶标的潜力,但关于TSWV蛋白与药剂的作用机制尚未见系统、全面的研究报道。本文从结构生物学的角度出发,详细介绍了目前已经被解析的TSWV病毒蛋白三维结构,并通过AlphaFold2模型预测了尚未被解析的4种TSWV蛋白结构;同时,综述了TSWV抗性基因和TSWV抑制剂在植物保护领域的研究应用进展。以宁南霉素、盐酸吗啉胍和利巴韦林等药剂为例,分析其可能作用于TSWV蛋白的分子机理,并预测了这些药剂与TSWV蛋白可能的作用位点,旨在为后续深入挖掘和探索新型抗TSWV药剂提供理论依据。 展开更多
关键词 番茄斑萎病毒 蛋白结构 靶标 分子机制 作用位点
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新型BTK-PROTAC分子的设计、合成及生物活性评价
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作者 葛子豪 周卯 +2 位作者 查永骏 白海云 钟利 《合成化学》 CAS 2024年第6期534-541,共8页
蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)技术在新药研发领域越来越受到重视。基于NX-5948的靶蛋白配体(Warhead)结构,采用5-氟吲哚代替吡嗪胺的思路进行改造,成功合成化合物A。为研究不同连接子(Linker)和E3配体对蛋白降解活性的影响,成功设计合成... 蛋白降解靶向嵌合体(PROTAC)技术在新药研发领域越来越受到重视。基于NX-5948的靶蛋白配体(Warhead)结构,采用5-氟吲哚代替吡嗪胺的思路进行改造,成功合成化合物A。为研究不同连接子(Linker)和E3配体对蛋白降解活性的影响,成功设计合成了化合物B~F,化合物A~F结构均经^(1)H NMR和MS表征。通过蛋白质免疫印迹法(Western blot,WB)分别测定目标化合物布鲁顿酪氨酸激酶(BTK)的降解活性。结果表明:化合物A、C、D、E、F都有近似于NX-5948的蛋白降解活性,其半数降解浓度(DC_(50))小于1 nM;并且所有目标化合物24 h最大降解程度(D_(max))均略优于NX-5948,为进一步化合物改造提供结构依据。 展开更多
关键词 蛋白降解靶向嵌合体 布鲁顿酪氨酸激酶 蛋白降解 合成 分子设计
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Targeted therapy of gastrointestinal stromal tumours 被引量:15
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作者 Ashish Jakhetiya Pankaj Kumar Garg +3 位作者 Gaurav Prakash Jyoti Sharma Rambha Pandey Durgatosh Pandey 《World Journal of Gastrointestinal Surgery》 SCIE CAS 2016年第5期345-352,共8页
Gastrointestinal stromal tumours(GISTs) are mesen-chymal neoplasms originating in the gastrointestinal tract, usually in the stomach or the small intestine, and rarely elsewhere in the abdomen. The malignant potential... Gastrointestinal stromal tumours(GISTs) are mesen-chymal neoplasms originating in the gastrointestinal tract, usually in the stomach or the small intestine, and rarely elsewhere in the abdomen. The malignant potential of GISTs is variable ranging from small lesions with a benign behaviour to fatal sarcomas. The majo-rity of the tumours stain positively for the CD-117(KIT) and discovered on GIST-1(DOG-1 or anoctamin 1) expression, and they are characterized by the presence of a driver kinase-activating mutation in either KIT or platelet-derived growth factor receptor α. Although surgery is the primary modality of treatment, almost half of the patients have disease recurrence following surgery, which highlights the need for an effective adjuvant therapy. Traditionally, GISTs are considered chemotherapy and radiotherapy resistant. With the advent of targeted therapy(tyrosine kinase inhibitors), there has been a paradigm shift in the management of GISTs in the last decade. We present a comprehensive review of targeted therapy in the management of GISTs. 展开更多
关键词 GASTROINTESTINAL TUMORS molecular targetED therapy protein KINASE INHIBITORS IMATINIB Survival
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Evolution of breast cancer therapeutics: Breast tumour kinase's role in breast cancer and hope for breast tumour kinase targeted therapy 被引量:1
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作者 Haroon A Hussain Amanda J Harvey 《World Journal of Clinical Oncology》 CAS 2014年第3期299-310,共12页
There have been significant improvements in the detection and treatment of breast cancer in recent decades. However, there is still a need to develop more effective therapeutic techniques that are patient specific wit... There have been significant improvements in the detection and treatment of breast cancer in recent decades. However, there is still a need to develop more effective therapeutic techniques that are patient specific with reduced toxicity leading to further increases in patients' overall survival; the ongoing progress in understanding recurrence, resistant and spread also needs to be maintained. Better understanding of breast cancer pathology, molecular biology and progression as well as identification of some of the underlying factors involved in breast cancer tumourgenesis and metastasis has led to the identification of novel therapeutic targets. Over a number of years interest has risen in breast tumour kinase(Brk) also known as protein tyrosine kinase 6; the research field has grown and Brk has been described as a desirable therapeutic target in relation to tyrosine kinase inhibition as well as disruption of its kinase independent activity. This review will outline the current "state of play" with respect to targeted therapy for breast cancer, as well as discussing Brk's role in the processes underlying tumour development and metas-tasis and its potential as a therapeutic target in breast cancer. 展开更多
关键词 BREAST TUMOUR KINASE protein TYROSINE KINASE 6 BREAST neoplasms targeted molecular therapy Intracellular signaling peptides and proteins protein KINASE inhibitors
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Comparison of protein patterns between Plasmodium falciparum mutant clone T9/94-M1-1(b3) induced by pyrimethamine and the original parent clone T9/94
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作者 Kanchana Rungsihirunrat Wanna Chaijaroenkul +3 位作者 Napapom Siripoon Aree Seugorn Sodsri Thaithong Kesara Na-Bangchang 《Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine》 SCIE CAS 2012年第1期66-69,共4页
Objective:To compare the protein patterns from the extracts of the mutant clone T9/94-M1-1(b3)induced by pyrimethamine,and the original parent clone T9/94 following separation of parasite extracts by two-dimensional e... Objective:To compare the protein patterns from the extracts of the mutant clone T9/94-M1-1(b3)induced by pyrimethamine,and the original parent clone T9/94 following separation of parasite extracts by two-dimensional electrophoresis(2-DE).Methods:Proteins were solubilized and separated according to their charges and sizes.The separated protein spots were then detected by silver staining and analyzed for protein density by the powerful image analysis software.Results:Differentially expressed protein patterns(up—or down-regulation)were separated from the extracts from the two clones.A total of 223 and 134 protein spots were detected from the extracts of T9/94 and T9/94-M1-1(b3)clones,respectively.Marked reduction in density of protein expression was observed with the extract from the mutant(resistant)clone compared with the parent(sensitive)clone.A total of 25 protein spots showed at least two-fold difference in density,some of which exhibited as high as ten-fold difference.Conclusions:These proteins may be the molecular targets of resistance of Plasmodium falciparum to pyrimethamine.Further study to identify the chemical structures of these proteins by mass spectrometry is required. 展开更多
关键词 PLASMODIUM FALCIPARUM PROTEOMICS PYRIMETHAMINE Drug resistance protein molecular target
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网络药理学--中医药研究开发的新技术 被引量:17
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作者 马伟 孙嘉莹 +2 位作者 任伟超 徐姣 刘秀波 《世界中医药》 CAS 2023年第3期412-415,共4页
目前单一靶点的药物难以对复杂疾病产生良好的疗效,而且中药的作用机制比较复杂,在临床上配伍使用时较难达到预期治疗效果。网络药理学为近年来发展的新兴学科,在系统生物学的基础上融合了多个学科的前沿技术和内容,揭示中药成分与相关... 目前单一靶点的药物难以对复杂疾病产生良好的疗效,而且中药的作用机制比较复杂,在临床上配伍使用时较难达到预期治疗效果。网络药理学为近年来发展的新兴学科,在系统生物学的基础上融合了多个学科的前沿技术和内容,揭示中药成分与相关靶点相互作用的机制,系统地、整体地揭示疾病与靶点蛋白、靶点蛋白与药物、药物与药物之间的关系,从网络层面的角度观察药物对疾病的影响,以不同以往的角度设计新的药物分子,研制新药。为了促进中医药的持续发展,网络药理学近年被广泛应用于中药领域,现综述网络药理学在中药领域的研究方法以及近几年的应用进展。 展开更多
关键词 中医药 网络药理学 新药开发 蛋白网络 分子互作 多靶点 网络模型 研究进展
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Research Progress of Heat Shock Protein 90 and Hepatocellular Carcinoma
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作者 Qiyu Jiang Xiongshan Shen 《International Journal of Clinical Medicine》 2020年第2期43-52,共10页
Heat shock protein (HSP) is a kind of protein that mainly acts as a molecular chaperone to participate in the synthesis and folding of proteins, maintain the spatial conformation of proteins and protect cells from dam... Heat shock protein (HSP) is a kind of protein that mainly acts as a molecular chaperone to participate in the synthesis and folding of proteins, maintain the spatial conformation of proteins and protect cells from damage and other important biological functions. HSP90 plays an important role in maintaining molecular chaperone structure, regulating cell cycle and apoptosis, coordinating hormone signal transduction and promoting wound healing. And HSP90 also plays an important role in the occurrence and progression of tumors. In recent years, HSP90 inhibitors have made some achievements in molecular targeted therapy for malignant tumors, but further research is needed in clinical application. In this paper, the research status of the relationship between hepatocellular carcinoma targeted by heat shock protein 90 was reviewed. 展开更多
关键词 LIVER Cancer Heat Shock protein 90 molecular CHAPERONE INHIBITOR targetED THERAPY
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TXNIP相关作用途径及在肿瘤中作用的研究进展
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作者 仇菊 欧朝阳 何爱琴 《医学综述》 CAS 2023年第18期3607-3614,共8页
恶性肿瘤严重威胁人类健康,在世界范围内发病率不断上升。随着基因组学和表观遗传学研究的进展,基因靶向治疗有望有效预防人类恶性肿瘤的发生和发展。因此,寻找新的靶基因对恶性肿瘤治疗的发展具有重要意义。硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXN... 恶性肿瘤严重威胁人类健康,在世界范围内发病率不断上升。随着基因组学和表观遗传学研究的进展,基因靶向治疗有望有效预防人类恶性肿瘤的发生和发展。因此,寻找新的靶基因对恶性肿瘤治疗的发展具有重要意义。硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)通过介导氧化应激抑制细胞增殖,从而诱导细胞凋亡。TXNIP的特性涉及细胞代谢和转录调节、凋亡和细胞死亡、炎症和肿瘤抑制。因此,TXNIP有望成为治疗不同恶性肿瘤的分子靶点。 展开更多
关键词 肿瘤 硫氧还蛋白相互作用蛋白 分子靶点
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ARL4C的生物功能及其与肿瘤的相关性
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作者 张培志 崔子连 +2 位作者 康维亭 韩荣雨 夏庆华 《泌尿外科杂志(电子版)》 2023年第1期82-87,共6页
癌症是目前威胁人类健康的最常见的疾病之一。越来越多的证据表明,癌症是一种人类基因组疾病。因此,探究导致癌症的相关基因及其发病机制成为目前癌症治疗研究的热点。ADP-核糖基化因子4c(ADP-ribosylation factor-like 4c,ARL4C)属于... 癌症是目前威胁人类健康的最常见的疾病之一。越来越多的证据表明,癌症是一种人类基因组疾病。因此,探究导致癌症的相关基因及其发病机制成为目前癌症治疗研究的热点。ADP-核糖基化因子4c(ADP-ribosylation factor-like 4c,ARL4C)属于三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)结合蛋白家族,在1999年由Jacobs等首次从人膀胱上皮细胞中检测到该分子cDNA的全长编码序列。本文概述了ARL4C分子结构及生物学功能,同时总结了其在肺癌、结直肠癌、胃癌、胰腺癌、原发性人胶质母细胞瘤、卵巢癌、肾癌等肿瘤中的研究进展。希望通过本文的概述,能够为研究ARL4C与癌症的发生、发展的相关性及相关信号通路提供思路,进而为肿瘤的治疗提供新的靶点以及预后标记物。 展开更多
关键词 ARL4C 分子生物学 肿瘤 靶向治疗
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新型Hsp90/HDAC双靶点抑制剂对乳腺癌细胞MDA-MB-231增殖、侵袭和迁移的影响及其机制
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作者 高笑 吴清兰 +5 位作者 邓林 宋军莹 张丽 栾业鹏 张金平 侯琳 《精准医学杂志》 2023年第3期249-253,共5页
目的 研究新型热休克蛋白90(Hsp90)/组蛋白去乙酰化酶(HDAC)双靶点抑制剂FXX-W-12-4对乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响及其机制。方法 采用CCK-8实验检测FXX-W-12-4对MDA-MB-231细胞活力的影响,并计算其半致死浓度(IC50... 目的 研究新型热休克蛋白90(Hsp90)/组蛋白去乙酰化酶(HDAC)双靶点抑制剂FXX-W-12-4对乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响及其机制。方法 采用CCK-8实验检测FXX-W-12-4对MDA-MB-231细胞活力的影响,并计算其半致死浓度(IC50)作为后续实验中浓度设定的参考值。以IC50值为依据,在MDA-MB-231细胞中分别加入终浓度为0、100、200、300 nmol/L的FXX-W-12-4(分别设为A、B、C、D组),采用划痕实验、Transwell实验分别检测FXX-W-12-4对各组MDA-MB-231细胞侵袭以及迁移能力的影响。采用Western Blot实验检测各组MDA-MB-231细胞中ac-H3、Hsp70等蛋白的相对表达量。结果 CCK-8实验结果显示,随着FXX-W-12-4浓度的升高,MDA-MB-231细胞活力逐渐下降(F=2 663.00,P<0.05)。划痕实验结果显示,与A组相比,B~D组MDA-MB-231细胞在第12、24、48小时时迁移能力均明显降低(F=86.47~212.59,P<0.05)。Transwell实验结果显示,与A组相比,随着FXX-W-12-4浓度的升高,B~D组MDA-MB-231细胞的侵袭能力均受到了抑制(F=68.67,P<0.05)。Western Blot检测结果显示,与A组比较,随着FXX-W-12-4浓度的增加,B~D组MDA-MB-231细胞中ac-H3、Hsp70蛋白相对表达量显著性增高(F=645.60、1 017.00,P<0.05),而p-Akt、p-mTOR蛋白表达量显著性下降(F=480.30、14.32,P<0.05)。结论 新型Hsp90/HDAC双靶点抑制剂FXX-W-12-4可有效抑制乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖、侵袭和迁移,其抑制作用可能是通过调节Akt/mTOR通路实现的。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 细胞增殖 细胞运动 肿瘤浸润 HSP90热休克蛋白质类 组蛋白脱乙酰基酶抑制剂 分子靶向治疗
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BRAF突变及其靶向治疗在儿童脑胶质瘤中的应用与挑战
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作者 陈志华 纪新婷 顾硕 《临床小儿外科杂志》 CAS CSCD 2023年第7期601-606,共6页
胶质瘤是儿童以及青少年最常见的脑肿瘤,常规治疗方法往往无法延长患者无进展生存期,部分难治性、复发性、无法手术治疗的胶质瘤患者5年生存率仅10%左右。研究发现,部分胶质瘤患者存在B型迅速加速性纤维肉瘤(B-type rapidly accelerated... 胶质瘤是儿童以及青少年最常见的脑肿瘤,常规治疗方法往往无法延长患者无进展生存期,部分难治性、复发性、无法手术治疗的胶质瘤患者5年生存率仅10%左右。研究发现,部分胶质瘤患者存在B型迅速加速性纤维肉瘤(B-type rapidly accelerated fibrosarcoma,BRAF)基因突变,这为BRAF靶向治疗提供了一定契机,也使BRAF靶向治疗在脑胶质瘤中的应用成为研究热点。多项国际多中心临床试验结果表明,单用或联合使用BRAF抑制剂和细胞外信号调控激酶(extracellular signal-regulated kinase,MEK)抑制剂能显著延长儿童脑胶质瘤患者的无进展生存期,其治疗效果已获得广泛认可。多种BRAF抑制剂已获得美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)的批准用于治疗复杂、难治性、复发性胶质瘤,司美替尼作为MEK1/MEK2的强效抑制剂,可显著延长神经纤维瘤1(Neurofibromin 1,NF1)基因相关低级别胶质瘤(pediatric low-grade glioma,PLGG)的无进展生存期,该药已于2020年获美国FDA批准用于NF1突变的神经纤维瘤病患儿,2023年5月中国国家药监局也批准了该药用于中国市场。目前仍有多种BRAF抑制剂处于临床试验阶段。本文介绍了BRAF突变概况及其在儿童脑胶质瘤中的突变特征,同时总结BRAF靶向治疗在儿童脑胶质瘤中的临床试验成果,并对其不良反应和耐药问题进行评述。 展开更多
关键词 原癌基因蛋白质B-raf 突变 弥漫性内生型桥脑胶质瘤 分子靶向治疗 外科手术 儿童
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基于反向分子对接技术的异鼠李素靶标的预测 被引量:6
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作者 崔明超 陈少军 +4 位作者 崔文 董珂 江海龙 周海滨 凌庆枝 《中国药房》 CAS 北大核心 2016年第28期3921-3924,共4页
目的:利用反向分子对接技术对异鼠李素的潜在靶标进行预测。方法:采用id Target软件对蛋白质数据库中异鼠李素的潜在靶标进行筛选,利用Py Rx 0.8软件中的autodock vina模块对筛选的结果进行分子对接验证。结果:异鼠李素与硫氧还蛋白还原... 目的:利用反向分子对接技术对异鼠李素的潜在靶标进行预测。方法:采用id Target软件对蛋白质数据库中异鼠李素的潜在靶标进行筛选,利用Py Rx 0.8软件中的autodock vina模块对筛选的结果进行分子对接验证。结果:异鼠李素与硫氧还蛋白还原酶1、凝血酶、二氢叶酸还原酶、核受体ROR-α等4种靶蛋白的结合较好,其结合能(ΔGpred)分别为-11.7、-10.34、-10.11、-10.07kcal/mol;分子对接验证结果显示,异鼠李素与4种靶蛋白核心氨基酸具有静电作用力、氢键、范德华力等相互作用。结论:硫氧还蛋白还原酶1、凝血酶、二氢叶酸还原酶、核受体ROR-α可能是异鼠李素的潜在靶标。 展开更多
关键词 异鼠李素 反向分子对接 靶蛋白 硫氧还蛋白还原酶1 凝血酶 二氢叶酸还原酶 核受体ROR-α 相互作用
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川芎中抗血栓活性成分的计算机虚拟筛选研究 被引量:31
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作者 刘福和 陈少军 倪文娟 《中国药房》 CAS 北大核心 2017年第16期2182-2186,共5页
目的:运用计算机辅助药物设计寻找川芎抗血栓活性成分。方法:以"血栓症"为关键词,从治疗靶蛋白数据库中搜索筛选川芎抗血栓靶蛋白;再从蛋白质数据库中查询目标靶蛋白并下载其三维结构,采用蛋白质预处理工具确定活性区域中心坐... 目的:运用计算机辅助药物设计寻找川芎抗血栓活性成分。方法:以"血栓症"为关键词,从治疗靶蛋白数据库中搜索筛选川芎抗血栓靶蛋白;再从蛋白质数据库中查询目标靶蛋白并下载其三维结构,采用蛋白质预处理工具确定活性区域中心坐标,应用PyRx和Discovery Studio Visualizer软件对从台湾中医药资料库下载的247个川芎小分子与靶蛋白进行分子对接,通过结合能筛选出活性成分并分析结合作用力。结果:筛选出4个活性成分即新绿原酸、1-H-苯并咪唑-2-胺、3,8-二羟基酰内酯、川芎三萜,其分别与凝血酶、抗凝血酶Ⅲ、凝血因子Ⅹa、血栓调节蛋白具有较高结合活性,结合能分别为-6.1、-4.5、-7.7、-8.6 k J/mol;分析结果显示范德华力、静电作用力在对接中发挥着重要作用。结论:新绿原酸、1-H-苯并咪唑-2-胺、3,8-二羟基酰内酯、川芎三萜可能是中药川芎抗血栓的活性成分。 展开更多
关键词 血栓症 川芎 计算机辅助药物设计 虚拟筛选 靶蛋白 分子对接 活性成分
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大柴胡汤治疗结石性胆囊炎的网络药理学研究及分子对接验证 被引量:17
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作者 张涛 周春宇 +5 位作者 杨成城 张少辉 门斯烨 钱嘉惠 马亦湘 安佳琳 《世界中医药》 CAS 2022年第1期62-69,76,共9页
目的:基于网络药理学和分子对接的方法探讨大柴胡汤治疗胆囊炎(Cholecystitis)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索相关文献获得大柴胡汤所含中药的主要化学成分,收集其相对应的靶点;胆囊炎疾病靶点来源于G... 目的:基于网络药理学和分子对接的方法探讨大柴胡汤治疗胆囊炎(Cholecystitis)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索相关文献获得大柴胡汤所含中药的主要化学成分,收集其相对应的靶点;胆囊炎疾病靶点来源于GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、PharmGkb数据库。结合Cytoscape 3.8.0构建药物-核心靶点-有效成分网络、靶标蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用Bioconductor中的R包对核心靶标进行基因本体(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:获得大柴胡汤活性成分151个,药物靶点260个;疾病靶点485个;交集基因55个;PPI网络分析发现,核心蛋白涉及TNF-α、CCK、EGFR、AKT1、VEGFA;GO富集分析得到2307个GO条目。大柴胡汤包含细胞组分92个,生物过程2126个,分子功能89个,主要有受体配体活性、细胞因子活性、细胞因子受体结合、磷酸酶结合等;KEGG通路富集分析发现大柴胡汤主要涉及AGE-RAGE信号通路、白细胞介素-17信号通路以及HIF-1信号通路等。结论:通过网络药理学分析发现,大柴胡汤多成分、多靶点调控机体,通过多途径起到治疗结石性胆囊炎的作用。 展开更多
关键词 大柴胡汤 胆囊炎 网络药理学 靶点 蛋白 信号通路 分子对接
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凋亡抑制蛋白家族与肿瘤治疗的研究进展 被引量:5
18
作者 王晓红 符立梧 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期103-107,共5页
关键词 细胞凋亡 凋亡抑制蛋白家族 调控 分子靶点
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雷公藤红素药理作用分子靶点的研究进展 被引量:10
19
作者 丁海鹏 李相鹏 +4 位作者 张伟 丁宁 王鹏 李国强 李英霞 《中国药理学与毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期570-576,共7页
雷公藤红素是从传统中药雷公藤中提取分离得到的一种醌甲基三萜,具有抗炎、免疫抑制及抗肿瘤等药理活性。雷公藤红素几个特殊的分子靶点大多会抑制IKK-NF-κB信号通路,包括:①抑制IKKα/β激酶;②失活热休克蛋白90的分子伴侣蛋白细胞分... 雷公藤红素是从传统中药雷公藤中提取分离得到的一种醌甲基三萜,具有抗炎、免疫抑制及抗肿瘤等药理活性。雷公藤红素几个特殊的分子靶点大多会抑制IKK-NF-κB信号通路,包括:①抑制IKKα/β激酶;②失活热休克蛋白90的分子伴侣蛋白细胞分裂周期蛋白37及P23;③抑制蛋白酶体的功能;④激活热激因子1诱导热休克蛋白反应;⑤影响肿瘤细胞的增殖;⑥影响细胞凋亡;⑦影响丝裂原活化蛋白激酶;⑧影响Akt/mTOR信号级联;⑨影响血管生成和转移;⑩抗炎作用。本文对其药理作用分子靶点研究进展做一综述。 展开更多
关键词 雷公藤红素 药理作用 分子靶点 NF-ΚB 热休克蛋白90 细胞分裂周期蛋白 P23
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黄芪桂枝五物汤治疗骨关节炎网络药理学及分子对接技术分析 被引量:14
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作者 韩杰 章晓云 +5 位作者 陈日兰 张驰 廖子龙 陈跃平 陈锋 廖建钊 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2021年第14期2224-2230,共7页
背景:研究证明,黄芪桂枝五物汤可通过抑制血管新生减少软骨损伤,促进软骨修复,延缓病情发展,但其作用机制尚不明确。目的:采用网络药理学方法及分子对接技术探讨黄芪桂枝五物汤治疗骨关节炎的分子机制。方法:通过TCMSP数据库筛选黄芪桂... 背景:研究证明,黄芪桂枝五物汤可通过抑制血管新生减少软骨损伤,促进软骨修复,延缓病情发展,但其作用机制尚不明确。目的:采用网络药理学方法及分子对接技术探讨黄芪桂枝五物汤治疗骨关节炎的分子机制。方法:通过TCMSP数据库筛选黄芪桂枝五物汤的活性成分及对应靶点,同时检索OMIM、GeneCards、TTD数据库获取治疗骨关节炎的相关靶点,然后将药物预测靶点与疾病靶点进行交集得到黄芪桂枝五物汤治疗骨关节炎的靶点。接着,利用STRING数据库结合Cytoscape软件构建黄芪桂枝五物汤治疗骨关节炎的"单味药-活性成分-作用靶点"网络和蛋白质相互作用网络,并使用David数据库对黄芪桂枝五物汤治疗骨关节炎的作用靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,最后运用PyMOL等软件对黄芪桂枝五物汤的关键活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果与结论:①筛选得到63个黄芪桂枝五物汤的化合物和217个相关靶点,与治疗骨关节炎的靶点取交集后得到130个黄芪桂枝五物汤治疗骨关节炎的靶点,主要涉及AGE-RAGE信号通路、MAPK信号通路、核因子κB信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、白细胞介素17信号通路等,可能通过对脂多糖的反应、对细菌来源分子的反应、对营养水平的反应、氧化应激反应等功能发挥治疗骨关节炎的作用;②蛋白互作分析提示JUN、AKT1、HSP90AA1、血管内皮生长因子A、白细胞介素6为蛋白互作网络中的核心靶点,共实现了5个关键活性成分与5个关键靶点的分子对接;③结果说明,黄芪桂枝五物汤通过多成分、多靶点、多通路调控的特点发挥治疗骨关节炎的作用。 展开更多
关键词 骨关节炎 网络药理学 靶点 分子对接 黄芪 桂枝 蛋白 因子
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