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基于mt DNA COI基因的新疆部分地区叶蝉的分子鉴定 被引量:1
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作者 张海燕 陈光辉 +2 位作者 古丽扎尔·阿不都克力木 张秀英 王玉涛 《中国农学通报》 2021年第36期119-129,共11页
研究旨在准确、高效鉴定识别叶蝉科昆虫,克服传统分类方法的不足,为有效防治提供依据。以新疆4种叶蝉若虫和2种叶蝉成虫为试材,基于mt DNA COI基因,通过PCR扩增、测序技术获得6种叶蝉的基因序列。结果表明:6个样本的COI序列A+T含量高于G... 研究旨在准确、高效鉴定识别叶蝉科昆虫,克服传统分类方法的不足,为有效防治提供依据。以新疆4种叶蝉若虫和2种叶蝉成虫为试材,基于mt DNA COI基因,通过PCR扩增、测序技术获得6种叶蝉的基因序列。结果表明:6个样本的COI序列A+T含量高于G+C,A/T碱基偏移明显,符合昆虫mt DNA碱基构成特点;6种叶蝉种间平均遗传距离为0.232,样本A、B、E种内平均遗传距离为0.0031,符合“10倍阈值定律”;样本A、B、E与数据库中相关叶蝉的序列相似度高于99%,与形态分类结果一致;6种叶蝉在系统发育树上位置清晰,分类明确,在各分类阶元间形成独立单系。获得6条COI基因序列可作为叶蝉快速鉴定的DNA条形码,其中4种若虫的基因序列为叶蝉科昆虫首次报道。 展开更多
关键词 新疆 叶蝉 mt dna coi基因 相似度 遗传距离 进化关系
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基于COI基因全长序列的假眼小绿叶蝉地理种群遗传分化研究 被引量:12
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作者 周宁宁 王梦馨 +3 位作者 崔林 潘铖 张新亭 韩宝瑜 《生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第23期6879-6889,共11页
假眼小绿叶蝉Empoasca vitis(Gthe)是我国大陆茶区分布最广、为害最重的茶树害虫,其种群世代重叠严重,数量大。从我国13个主要产茶省份各选出一个重点产茶县(市),采集假眼小绿叶蝉标本,首次扩增得到其线粒体CO I基因全长序列,并以此... 假眼小绿叶蝉Empoasca vitis(Gthe)是我国大陆茶区分布最广、为害最重的茶树害虫,其种群世代重叠严重,数量大。从我国13个主要产茶省份各选出一个重点产茶县(市),采集假眼小绿叶蝉标本,首次扩增得到其线粒体CO I基因全长序列,并以此探讨了假眼小绿叶蝉13个地理种群间的遗传多样性、分子变异、遗传分化程度及基因流水平。在13个地理种群中共得到了176条CO I基因序列,发现了113个变异位点,形成了105个CO I单倍型。总群体单倍型多样性Hd为0.9720,种群内单倍型多样性在0.804—1.000范围内,总群体和各种群的Tajima's D检验结果均不显著,说明茶园假眼小绿叶蝉的进化符合中性模型,种群数量较为稳定。AMOVA分子变异分析结果表明,茶园假眼小绿叶蝉的遗传分化主要来自于种群内部。Mantel检验显示各地理种群的遗传距离与地理距离之间不具有显著的相关性。总群体的遗传分化系数Gst为0.03652,固定系数Fst为0.10876,基因流Nm为4.097,表明地理种群间存在较频繁的基因交流,遗传差异较小。推测,20世纪90年代以来的省际之间频繁的茶树鲜叶贩运、异地茶苗的大批量调拨等因素促进了假眼小绿叶蝉的长距离迁移,加强了不同种群间的基因交流。 展开更多
关键词 假眼小绿叶蝉 线粒体coi 遗传分化 基因流
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基于线粒体COI基因序列的内蒙古沙葱萤叶甲种群遗传多样性及遗传分化 被引量:4
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作者 张鹏飞 周晓榕 +2 位作者 庞保平 谭瑶 田帅 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2017年第2期332-341,共10页
沙葱萤叶甲Galeruca daurica(Joannis)是一种近年来在内蒙古草原上猖獗发生为害的新害虫,为明确内蒙古沙葱萤叶甲不同地理种群间的遗传多样性及遗传分化,本研究测定了内蒙古8个地理种群的197头沙葱萤叶甲的线粒体COI基因417 bp序列,利用... 沙葱萤叶甲Galeruca daurica(Joannis)是一种近年来在内蒙古草原上猖獗发生为害的新害虫,为明确内蒙古沙葱萤叶甲不同地理种群间的遗传多样性及遗传分化,本研究测定了内蒙古8个地理种群的197头沙葱萤叶甲的线粒体COI基因417 bp序列,利用Dna SP 5.0、Arlequin 3.11和Network 4.6.1.0等软件对沙葱萤叶甲种群间的遗传多样性、遗传分化、分子变异等进行分析。在所分析的197个COI序列中,共有43个变异位点和62个单倍型,其中2个单倍型为各种群共享,每个种群具有3个及以上的独享单倍型。总种群的单倍型多态度指数Hd为0.9466,不同地理种群单倍型多态度Hd在0.8889-0.9600。总群体固定系数Fst为0.0315,基因流Nm为15.37。中性检验结果不显著(Tajima's D=-1.6300,0.10>P>0.05),说明内蒙古沙葱萤叶甲在较近的历史时期内没有出现种群扩张现象。分子变异分析(AMOVA)结果表明,沙葱萤叶甲的遗传分化主要来自种群内部(96.34%),而种群间未发生明显的遗传分化。各种群间遗传分化程度与地理距离无显著相关性。不同地理种群的单倍型在中介网络图上散布在不同的分布群中,未形成明显的地理分布格局。结果表明沙葱萤叶甲不同地理种群遗传多样性高,基因交流程度高,遗传分化不明显且与地理距离无显著相关性。 展开更多
关键词 沙葱萤叶甲 线粒体coi 遗传多样性 遗传分化 基因流 单倍型
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A Rapid Identification Method of Bactrocera cilifera (Hendel) with Species-Specific Primers(SS-COI)
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作者 Zhen Huang Qiongxia Guo 《Plant Diseases and Pests》 CAS 2021年第2期33-37,共5页
[Objective]The paper was to establish a rapid identification method of Bactrocera cilifera(Hendel)with species-specific primers(SS-COI).[Method]Using B.cilifera(Hendel)as the positive control,and 19 species of fruit f... [Objective]The paper was to establish a rapid identification method of Bactrocera cilifera(Hendel)with species-specific primers(SS-COI).[Method]Using B.cilifera(Hendel)as the positive control,and 19 species of fruit flies such as B.diaphora(Coquillett)and B.dorsalis(Hendel)as the negative controls,a pair of species-specific primers,YF290 and YR511,were designed and screened for accurate identification of B.cilifera,based on mitochondrial DNA COI sequence.[Result]The PCR products were amplified and detected by electrophoresis.Only a clear and single band was observed at about 222 bp in the positive control,while no bands were found in the other negative controls.[Conclusion]The established rapid identification method with species-specific primers(SS-COI)is of great practical significance for rapid identification of fruit flies intercepted from import and export fruits and vegetables at ports,and for rapid clearance and early warning of import fruits and vegetables at ports. 展开更多
关键词 Bactrocera cilifera(Hendel) Species-specific primers Species-specific PCR(SS-PCR) mt dna coi Rapid identification
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利用物种特异性PCR技术快速鉴定南瓜实蝇 被引量:2
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作者 黄振 侯有明 +1 位作者 郭琼霞 陈韶萍 《福建农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期215-220,共6页
【目的】快速鉴定我国进境植物检疫性害虫南瓜实蝇Bactrocera tau(Walker),防止该虫传入扩散。【方法】基于物种特异性PCR(SS-PCR)技术,选取20种形态近似的常见实蝇,将南瓜实蝇作为阳性对照,提取基因组DNA模板,选用mt DNA COⅠ序列,检... 【目的】快速鉴定我国进境植物检疫性害虫南瓜实蝇Bactrocera tau(Walker),防止该虫传入扩散。【方法】基于物种特异性PCR(SS-PCR)技术,选取20种形态近似的常见实蝇,将南瓜实蝇作为阳性对照,提取基因组DNA模板,选用mt DNA COⅠ序列,检查同源系列,设计筛选1对可快速准确鉴定南瓜实蝇的种特异性引物NF404和NR610,并进行PCR检测和验证,建立一种利用种特异性引物的快速鉴定方法。【结果】南瓜实蝇在207 bp的位置扩增出一条清晰且单一的目标条带,其余果实蝇未见条带。将截获的南瓜实蝇与其同亚属的近缘种具条实蝇、瓜实蝇的不同虫态和成虫部分虫体组织的虫样,采用本实验室建立的SS-PCR鉴定方法进行验证,结果一致。【结论】建立的南瓜实蝇的SS-PCR鉴定方法种特异性和稳定性强,能快速鉴定目标种类,解决口岸进境果蔬中截获实蝇幼虫、蛹等不同虫态和残体难于快速鉴定问题。 展开更多
关键词 南瓜实蝇 mt dna coi 种特异性引物 物种特异性PCR(SS-PCR) 快速鉴定
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DNA条形码技术在农林入侵害虫鉴定与溯源研究中的应用 被引量:5
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作者 王玉生 万方浩 张桂芬 《中国科学:生命科学》 CSCD 北大核心 2016年第5期596-612,共17页
快速准确识别鉴定昆虫的方法在植物检疫中具有重要意义.长期以来,基于形态特征的入侵害虫鉴定研究由于经常遇到诸如幼期(包括卵、幼虫/若虫、蛹/前蛹/拟蛹),隐存种、复合种以及样本受损等情况,致使物种的快速准确鉴定陷入举步维艰的境地... 快速准确识别鉴定昆虫的方法在植物检疫中具有重要意义.长期以来,基于形态特征的入侵害虫鉴定研究由于经常遇到诸如幼期(包括卵、幼虫/若虫、蛹/前蛹/拟蛹),隐存种、复合种以及样本受损等情况,致使物种的快速准确鉴定陷入举步维艰的境地.DNA条形码技术的发展为上述问题的解决提供了新契机,已成为昆虫分类鉴定、植物及其产品的产地检疫和调运检疫以及出入境检验检疫中备受关注的一种新兴技术.本文以重大农林害虫类群介壳虫类、蓟马类、粉虱类和实蝇类等为例,简要介绍DNA条形码技术在农林入侵害虫鉴定和溯源研究中的应用,并对DNA条形码技术的进一步完善进行了探讨和展望. 展开更多
关键词 入侵害虫 dna条形码技术 线粒体coi基因 物种鉴定 溯源研究
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采用DNA条形码技术对厦门海域鱼卵、仔稚鱼种类的鉴定 被引量:27
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作者 周美玉 陈骁 杨圣云 《海洋环境科学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第1期120-125,135,共7页
以厦门海域采集到的鱼卵、仔稚鱼为研究对象。首先根据形态学特征将其分为2种类型鱼卵和3种类型仔稚鱼,然后应用DNA条形码技术分析鉴定得到3个鱼卵种类和4个仔稚鱼种类。其中,6种鉴定到种的水平,分别为汉氏棱鳀(Thryssa hamiltonii)鱼... 以厦门海域采集到的鱼卵、仔稚鱼为研究对象。首先根据形态学特征将其分为2种类型鱼卵和3种类型仔稚鱼,然后应用DNA条形码技术分析鉴定得到3个鱼卵种类和4个仔稚鱼种类。其中,6种鉴定到种的水平,分别为汉氏棱鳀(Thryssa hamiltonii)鱼卵、颈带鲾(Nuchequula nuchalis)鱼卵、纹缟鰕虎鱼(Tridentiger trigonocephalus)仔鱼、髭缟鰕虎鱼(Tridentiger barbatus)仔鱼、斑鰶(Konosirus punctatus)仔鱼和鲬(Platycephalus indicus)稚鱼;1种鉴定到属,即双边鱼属(Ambassis sp.)鱼卵。研究结果表明,将鱼卵、仔稚鱼鉴定到种的水平,绝大多数都需要借助于形态学之外的手段,尤其是形态特征表现相近的鱼卵。而DNA条形码技术采用自动化和标准化应用系统,能有效地对形态特征相似的鱼卵、仔稚鱼进行种类鉴定,具有准确性高、重复性好、人为误差少等优点,已成为传统形态学物种鉴定的强有力补充,在鱼类生物多样性研究中具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 鱼卵 仔稚鱼 mtcoi序列 dna条形码
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