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基于线粒体COI基因序列的黄胫小车蝗不同地理种群的遗传分化及基因流分析
被引量:
23
1
作者
孙嵬
张柱亭
+4 位作者
董辉
钱海涛
石玉
谢丽娜
丛斌
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期907-916,共10页
黄胫小车蝗OedaleusinfernalisSaussure是一种在我国分布广泛、对农牧业生产危害严重的经济害虫。本文对黄胫小车蝗10个地理种群的线粒体COI基因序列进行测序和分析,利用DnaSP5.0和Arlequin3.5.1.2软件对该蝗虫种群问的遗传多样性...
黄胫小车蝗OedaleusinfernalisSaussure是一种在我国分布广泛、对农牧业生产危害严重的经济害虫。本文对黄胫小车蝗10个地理种群的线粒体COI基因序列进行测序和分析,利用DnaSP5.0和Arlequin3.5.1.2软件对该蝗虫种群问的遗传多样性、遗传分化程度、基因流水平及分子变异进行了分析,建立了单倍型贝叶斯系统发育进化树和单倍型网络图。结果表明:在所分析的144个序列样本中,共检测到21种单倍型,其中1种单倍型为10个地理种群所共享。总群体的单倍型多样性指数为0.653,各地理种群单倍型多样度范围在0.423~0.790之间。总群体和各种群的Tajima’sD检验结果皆不显著,说明该种害虫在较近的历史上未经历群体扩张。总群体的遗传分化系数Gst为0.04436,固定系数Fst为0.05255,基因流Nm为9.01。AMOVA分子方差分析结果表明,黄胫小车蝗的遗传分化主要来自种群内部,种群间的遗传变异水平较低。各地理种群的遗传距离的大小与其地理距离间没有显著的相关性。贝叶斯系统发育进化树与单倍型网络图显示,黄胫小车蝗各地理种群中的单倍型散布在不同的分布群中,分布格局较为混杂,未形成明显的系统地理结构。研究结果揭示,黄胫小车蝗各种群间的基因交流并未受到地理距离的影响。
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关键词
黄胫小车蝗
地理种群
线粒体COI基因
单倍型
遗传分化
基因流
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职称材料
题名
基于线粒体COI基因序列的黄胫小车蝗不同地理种群的遗传分化及基因流分析
被引量:
23
1
作者
孙嵬
张柱亭
董辉
钱海涛
石玉
谢丽娜
丛斌
机构
沈阳农业大学植物保护学院
出处
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第8期907-916,共10页
基金
国家公益性行业(农业)科研专项(201003079)
文摘
黄胫小车蝗OedaleusinfernalisSaussure是一种在我国分布广泛、对农牧业生产危害严重的经济害虫。本文对黄胫小车蝗10个地理种群的线粒体COI基因序列进行测序和分析,利用DnaSP5.0和Arlequin3.5.1.2软件对该蝗虫种群问的遗传多样性、遗传分化程度、基因流水平及分子变异进行了分析,建立了单倍型贝叶斯系统发育进化树和单倍型网络图。结果表明:在所分析的144个序列样本中,共检测到21种单倍型,其中1种单倍型为10个地理种群所共享。总群体的单倍型多样性指数为0.653,各地理种群单倍型多样度范围在0.423~0.790之间。总群体和各种群的Tajima’sD检验结果皆不显著,说明该种害虫在较近的历史上未经历群体扩张。总群体的遗传分化系数Gst为0.04436,固定系数Fst为0.05255,基因流Nm为9.01。AMOVA分子方差分析结果表明,黄胫小车蝗的遗传分化主要来自种群内部,种群间的遗传变异水平较低。各地理种群的遗传距离的大小与其地理距离间没有显著的相关性。贝叶斯系统发育进化树与单倍型网络图显示,黄胫小车蝗各地理种群中的单倍型散布在不同的分布群中,分布格局较为混杂,未形成明显的系统地理结构。研究结果揭示,黄胫小车蝗各种群间的基因交流并未受到地理距离的影响。
关键词
黄胫小车蝗
地理种群
线粒体COI基因
单倍型
遗传分化
基因流
Keywords
Oedaleus infernalis
geographic population
mtdna c0i gene
haplotype
gene
ticdifferentiation
gene
flow
分类号
Q968 [生物学—昆虫学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于线粒体COI基因序列的黄胫小车蝗不同地理种群的遗传分化及基因流分析
孙嵬
张柱亭
董辉
钱海涛
石玉
谢丽娜
丛斌
《昆虫学报》
CAS
CSCD
北大核心
2013
23
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