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基于伪氨基酸组成和多标记最近邻算法的抗菌肽功能类型预测
1
作者
王晓
杨鹏鹏
+1 位作者
王榕
李辉
《郑州轻工业学院学报(自然科学版)》
CAS
2015年第5期85-87,共3页
针对多数已有的计算方法无法同时预测抗菌肽的多种功能类型的问题,提出一种基于伪氨基酸组成和多标记最近邻算法的抗菌肽功能类型预测的系统方法:采用伪氨基酸组成抽取抗菌肽序列的特征向量,并且引入多标记最近邻算法作为预测引擎,同时...
针对多数已有的计算方法无法同时预测抗菌肽的多种功能类型的问题,提出一种基于伪氨基酸组成和多标记最近邻算法的抗菌肽功能类型预测的系统方法:采用伪氨基酸组成抽取抗菌肽序列的特征向量,并且引入多标记最近邻算法作为预测引擎,同时预测抗菌肽的多种功能类型.实验结果表明,本方法显著地提高了预测性能,为该领域的进一步研究提供了一个有用的工具.
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关键词
抗菌肽
伪氨基酸组成
多标记分类
多标记最近邻算法
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职称材料
题名
基于伪氨基酸组成和多标记最近邻算法的抗菌肽功能类型预测
1
作者
王晓
杨鹏鹏
王榕
李辉
机构
郑州轻工业学院计算机与通信工程学院
出处
《郑州轻工业学院学报(自然科学版)》
CAS
2015年第5期85-87,共3页
基金
国家自然科学基金项目(61402422)
河南省教育厅科学技术研究重点项目(14A520063)
郑州轻工业学院博士科研基金资助项目(2013BSJJ082)
文摘
针对多数已有的计算方法无法同时预测抗菌肽的多种功能类型的问题,提出一种基于伪氨基酸组成和多标记最近邻算法的抗菌肽功能类型预测的系统方法:采用伪氨基酸组成抽取抗菌肽序列的特征向量,并且引入多标记最近邻算法作为预测引擎,同时预测抗菌肽的多种功能类型.实验结果表明,本方法显著地提高了预测性能,为该领域的进一步研究提供了一个有用的工具.
关键词
抗菌肽
伪氨基酸组成
多标记分类
多标记最近邻算法
Keywords
antimicrobial peptide
pseudo amino acid composition(Pse AAC)
multi-label
classification
multi-label k-nearest neighbor(mlknn) algorithm
分类号
TP273 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
O811.4 [理学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于伪氨基酸组成和多标记最近邻算法的抗菌肽功能类型预测
王晓
杨鹏鹏
王榕
李辉
《郑州轻工业学院学报(自然科学版)》
CAS
2015
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