期刊文献+
共找到32篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
奶牛隐孢子虫Nested PCR-RFLP方法的建立及初步应用 被引量:2
1
作者 王权 陈永军 +4 位作者 袁耀明 李安平 蒋蔚 朱志宏 安立刚 《中国动物传染病学报》 CAS 2009年第3期65-72,共8页
为快速检测并准确鉴别奶牛隐孢子虫种,以隐孢子虫18S rRNA基因的特殊区域为基础,设计内、外引物,并根据软件分析确定相应的内切酶EcoT14I,采用Nested PCR-RFLP方法进行虫种种型鉴别分析。在Nested PCR两次PCR反应中,以微小隐孢子虫(Cryp... 为快速检测并准确鉴别奶牛隐孢子虫种,以隐孢子虫18S rRNA基因的特殊区域为基础,设计内、外引物,并根据软件分析确定相应的内切酶EcoT14I,采用Nested PCR-RFLP方法进行虫种种型鉴别分析。在Nested PCR两次PCR反应中,以微小隐孢子虫(Cryptosporidium parvum,C.p)和安氏隐孢子虫(Cryptosporidium andersoni,C.an)卵囊提取的DNA为模板,均能扩增出长约800bp和500bp的明亮条带,且特异性强,其他虫种不能扩增出条带,该方法最低可检测到5个卵囊/g粪便;对于由内引物扩增出的500bp的条带,C.an的PCR产物能被内切酶EcoT14I酶切,酶切后的片段分别为416bp和92bp,C.p的PCR产物不能被此酶酶切。用所建立的Nested PCR-RFLP法对上海奶牛389头和进口奶牛200头的共计589份粪样进行检测,Nested PCR的结果表明上海奶牛和进口奶牛的隐孢子虫阳性率分别为19.02%和3.5%,RFLP的结果表明上海奶牛感染的主要是C.p和C.an,进口奶牛感染的主要是C.p。研究结果表明,本研究建立的检测奶牛粪便中的隐孢子虫的Nested PCR-RFLP法,可用于奶牛隐孢子虫流行病学调查并有效鉴别奶牛隐孢子虫种。 展开更多
关键词 奶牛 隐孢子虫 巢式pcr-rflp
下载PDF
动物源性食品中弓形虫Nested PCR-RFLP分子检测技术的建立 被引量:7
2
作者 王权 王巧全 +4 位作者 潘淑娟 陈志强 陈永军 常小斌 李健 《中国兽医寄生虫病》 2007年第6期1-7,共7页
目的 为了建立一种快速、特异、灵敏检测动物源性食品中弓形虫的技术。方法根据原虫rDNA的部分序列,找出弓形虫和新孢子虫共同保守DNA片段,设计套式PCR两对引物,以Ultra Pure^TM基因组DNA快速提取试剂盒提取弓形虫和新孢子虫DNA为模... 目的 为了建立一种快速、特异、灵敏检测动物源性食品中弓形虫的技术。方法根据原虫rDNA的部分序列,找出弓形虫和新孢子虫共同保守DNA片段,设计套式PCR两对引物,以Ultra Pure^TM基因组DNA快速提取试剂盒提取弓形虫和新孢子虫DNA为模板,初步建立了检测两种虫体的NestedPCR技术。将纯化的Nested PCR产物成功地克隆到pGEM-T-easy载体中,经鉴定、测序并进行同源性分析。结果 Nested—PCR的外、内引物对两种虫体rDNA基因均能进行扩增,长度分别在800~900bp、400~500bp之间。内引物扩增DNA序列与公布的同种虫体DNA序列同源性较高,弓形虫和新孢子虫分别达99.1%、97.2%,但它们两者之间差异较大,同源性仅为86.6%。用软件寻找能区别两者基因序列差异的酶切位点,挑选内切酶进行RFLP实验,结果表明新孢子虫NestedPCR扩增片段能被Vspl酶切。同时进行该分子检测技术的特异性和敏感性试验,实验证明该NestedPCR能对弓形虫和新孢子虫rDNA基因进行特异性的扩增,而对其它原虫基因未能扩增出任何片段;该Nested-PCR能检测出100个弓形虫速殖子/g猪肉。结论 本实验建立NestedPCR检测方法不仅可用于检测动物性食品中弓形虫,而且能明确区分弓形虫和新孢子虫。 展开更多
关键词 弓形虫 新孢子虫 套式PCR 食品检测
下载PDF
五氯酚诱导斑马鱼p53基因点突变的nested PCR-RFLP分析
3
作者 李延 赵庆顺 尹大强 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2005年第3期357-360,共4页
将斑马鱼经50μg/L五氯酚(PCP)体内暴露染毒10d,提取肝脏基因组DNA,通过巢式PCR(nestedPCR)扩增包含斑马鱼p53基因外显子2,3,4及其间内含子2,3的片段,扩增产物分别用限制性内切酶NcoI、SacI、ScaI、BclI、NsiI、RsaI进行限制性片段长度... 将斑马鱼经50μg/L五氯酚(PCP)体内暴露染毒10d,提取肝脏基因组DNA,通过巢式PCR(nestedPCR)扩增包含斑马鱼p53基因外显子2,3,4及其间内含子2,3的片段,扩增产物分别用限制性内切酶NcoI、SacI、ScaI、BclI、NsiI、RsaI进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析,以检测目标片段在酶切位点上点突变的发生.检测了20条斑马鱼上述6个酶切位点上的共680个碱基,但均未检测到点突变.结果表明,如果PCP能够诱导斑马鱼p53基因点突变,则其碱基突变率小于1/680. 展开更多
关键词 P53基因 nested pcr-rflp 五氯酚 斑马鱼
下载PDF
小叶锦鸡儿根瘤菌的分离及其16S rDNA PCR-RFLP分析 被引量:7
4
作者 严雪瑞 陈文峰 +3 位作者 陈文新 傅俊范 薛彩云 隋新华 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期141-146,共6页
对辽宁地区与小叶锦鸡儿共生的根瘤菌资源进行了初步调查。采自5个不同地区样品的根瘤,通过分离、纯化、回接验证等试验共获得65株供试根瘤菌菌株。进一步选用4种限制性内切酶对供试根瘤菌进行了16S rDNA PCR-RFLP研究,结果表明其系统... 对辽宁地区与小叶锦鸡儿共生的根瘤菌资源进行了初步调查。采自5个不同地区样品的根瘤,通过分离、纯化、回接验证等试验共获得65株供试根瘤菌菌株。进一步选用4种限制性内切酶对供试根瘤菌进行了16S rDNA PCR-RFLP研究,结果表明其系统发育地位位于中慢生根瘤菌属(Mesorhizobiumspp.),并在96%相似性水平上分为5个不同的类群,分别由相应的rDNA图谱组合代表。丰富度及频度分析表明,组合15是辽宁省的优势群,组合18丰富度居第二位,但频度最高,也是辽宁省的主要类群。 展开更多
关键词 小叶锦鸡儿 根瘤菌 16S RDNA pcr- rflp 辽宁省
下载PDF
应用巢式PCR-RFLP方法鉴别我国常见的几种隐孢子虫 被引量:5
5
作者 李巍 张西臣 +3 位作者 李建华 李淑红 宫鹏涛 杨举 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期69-73,共5页
应用巢式聚合酶链反应(Nested PCR)—限制片段长度多态性(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)方法对微小隐孢子虫(Cryptosporidiumparvum)、安氏隐孢子虫(C.andersoni)、贝氏隐孢子虫(C.baileyi)和猪隐孢子虫(C.suis)的鉴... 应用巢式聚合酶链反应(Nested PCR)—限制片段长度多态性(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)方法对微小隐孢子虫(Cryptosporidiumparvum)、安氏隐孢子虫(C.andersoni)、贝氏隐孢子虫(C.baileyi)和猪隐孢子虫(C.suis)的鉴别进行了研究。结果显示:牛源C.parvum、羊源C.parvum、C.suis、C.andersoni和C.baileyi扩增产物片段大小分别为212,213,213,213,210 bp;扩增产物先后经TaqⅠ、BstUⅠ与MseⅠ酶切,根据酶切后形成的不同酶切图谱可以鉴别C.parvum、C.suis、C.andersoni和C.baileyi。该研究为我国隐孢子虫的分类和隐孢子虫病的分子流行病学调查提供了新的方法。 展开更多
关键词 隐孢子虫 巢式PCR—rflp 鉴别方法
下载PDF
18Sr RNA基因巢式PCR-RFLP分析两株牛源隐孢子虫分离株 被引量:5
6
作者 刘晖 袁忠英 +2 位作者 沈玉娟 冯耀宇 曹建平 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期115-118,共4页
目的18S rRNA巢式聚合酶链反应(Nested PCR)-限制片段长度多态性(restriction fragment length polymor-phism,RFLP)鉴定上海(简称SH-BOV)和徐州(简称XZ-BOV)两株牛源隐孢子虫。方法改良-抗酸染色确定感染隐孢子虫的上海株和徐州株牛粪... 目的18S rRNA巢式聚合酶链反应(Nested PCR)-限制片段长度多态性(restriction fragment length polymor-phism,RFLP)鉴定上海(简称SH-BOV)和徐州(简称XZ-BOV)两株牛源隐孢子虫。方法改良-抗酸染色确定感染隐孢子虫的上海株和徐州株牛粪,提取DNA后经18S rRNA基因巢式PCR扩增,扩增产物测序后用Blast和MEGA软件进行同源性和系统发育分析。同时扩增产物分别用SspⅠ和VspⅠ单酶切,且XZ-BOV扩增产物用DdeⅠ酶切后进行RFLP分析。结果通过18S rRNA基因分析,SH-BOV与1株巴西牛隐孢子虫Cryptospridiumbovis同源性为100%,种系发育树上两者在同一分支;XZ-BOV与安氏隐孢子虫C.andersoni同源性为99%,种系发育树上两者在同一分支。扩增产物分别用SspⅠ和VspⅠ单酶切后,可鉴别出SH-BOV为C.bovis,XZ-BOV为C.andersoni或C.muris。XZ-BOV扩增产物用DdeⅠ酶切后可鉴别出XZ-BOV为C.andersoni。结论上海株牛源隐孢子虫(SH-BOV)鉴定为牛隐孢子虫(C.bovis),徐州株牛源隐孢子虫(XZ-BOV)鉴定为安氏隐孢子虫(C.andersoni)。 展开更多
关键词 牛隐孢子虫 安氏隐孢子虫 18S RRNA基因 巢式PCR—rflp
下载PDF
水貂病毒性肠炎巢式PCR,PCR-RFLP联合诊断方法的建立 被引量:5
7
作者 易立 闫喜军 +4 位作者 罗彬 王建科 赵传芳 吴威 程世鹏 《经济动物学报》 CAS 2008年第4期204-208,共5页
根据水貂肠炎细小病毒的VP2基因序列设计4条特异性引物,建立了检测水貂肠炎细小病毒的巢式PCR方法。采用一次扩增的敏感性来检测5个TCID50/mL的细小病毒MEVB株,二次扩增的敏感性来检测0.05个TCID50/mL的细小病毒MEVB株。同时,利用该方... 根据水貂肠炎细小病毒的VP2基因序列设计4条特异性引物,建立了检测水貂肠炎细小病毒的巢式PCR方法。采用一次扩增的敏感性来检测5个TCID50/mL的细小病毒MEVB株,二次扩增的敏感性来检测0.05个TCID50/mL的细小病毒MEVB株。同时,利用该方法第一轮PCR产物酶切,能够区分犬细小病毒与水貂肠炎细小病毒,具有重要的实用价值和应用的前景。 展开更多
关键词 水貂肠炎细小病毒 巢式PCR pcr-rflp
下载PDF
应用巢式PCR-RFLP方法鉴别微小隐孢子虫、安氏隐孢子虫和火鸡隐孢子虫的研究 被引量:4
8
作者 姚龙泉 张西臣 +2 位作者 Lihua Xiao 李建华 尹继刚 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期446-449,共4页
应用巢式聚合酶链反应(NestedPCR)-限制片段长度多态性(restrictionfragmentlengthpolymor-phism,RFLP)方法对微小隐孢子虫(C.parvum)、安氏隐孢子虫(C.andersoni)和火鸡隐孢子虫(C.melea-grides)的鉴别进行了研究。结果显示C.parvumBO... 应用巢式聚合酶链反应(NestedPCR)-限制片段长度多态性(restrictionfragmentlengthpolymor-phism,RFLP)方法对微小隐孢子虫(C.parvum)、安氏隐孢子虫(C.andersoni)和火鸡隐孢子虫(C.melea-grides)的鉴别进行了研究。结果显示C.parvumBOCC2、C.andesoniBOCC2和C.meleagridesCHCC1扩增产物片段大小分别为830bp、828bp和828bp,扩增产物分别经VspⅠ酶切后形成3种不同的RFLP图谱,根据RFLP图谱可鉴别C.parvum、C.andersoni和C.meleagrides。本研究为我国隐孢子虫的分类和隐孢子虫病的分子流行病学研究打下了良好基础。 展开更多
关键词 微小隐孢子虫 安氏隐孢子虫 火鸡隐孢子虫 巢式pcr-rflp
下载PDF
巢式PCR-RFLP法检测奶牛隐孢子虫及虫种鉴定 被引量:6
9
作者 曾晓华 陈铁桥 +2 位作者 王权 李建 李安平 《畜牧与兽医》 北大核心 2008年第4期15-18,共4页
采进口奶牛粪样200份,收集每份样品中的卵囊液,采用巢式PCR检测隐孢子虫(Cryptosporidium)18S rRNA基因,并用RFLP进行虫种鉴定,将目的片段克隆到pEGM-T easy vector,测序并进行同源性分析以进一步佐证虫种鉴定结果。结果表明,进口奶牛... 采进口奶牛粪样200份,收集每份样品中的卵囊液,采用巢式PCR检测隐孢子虫(Cryptosporidium)18S rRNA基因,并用RFLP进行虫种鉴定,将目的片段克隆到pEGM-T easy vector,测序并进行同源性分析以进一步佐证虫种鉴定结果。结果表明,进口奶牛隐孢子虫阳性率为3.5%(7/200),514bp的目的片段不能被EcoT14 Ⅰ酶切。测序分析表明,获得的18S rRNA基因序列与NCBI上公布的微小隐孢子虫(C.parvum)相应序列同源性高达99.4%~100%,与安氏隐孢子虫(C.andersoni)同源性仅为91.1%。说明进口牛粪样中检测出的隐孢子虫为微小隐孢子虫。 展开更多
关键词 隐孢子虫 巢式pcr-rflp 奶牛粪便
下载PDF
隐孢子虫SSU rRNA基因的巢式PCR-RFLP分析 被引量:8
10
作者 姚龙泉 张西臣 +3 位作者 Lihua Xiao 吴涛 李建华 尹继刚 《中国寄生虫病防治杂志》 CSCD 2004年第6期321-325,共5页
目的 建立用巢式聚合酶链反应 (NestedPCR) 限制片段长度多态性 (Restrictionfragmentlength polymor phism ,RFLP)检测、鉴别微小隐孢子虫 (Cryptospordium parvum)和安氏隐孢子虫 (C .andersoni)的方法。  方法 用巢式PCR技术扩... 目的 建立用巢式聚合酶链反应 (NestedPCR) 限制片段长度多态性 (Restrictionfragmentlength polymor phism ,RFLP)检测、鉴别微小隐孢子虫 (Cryptospordium parvum)和安氏隐孢子虫 (C .andersoni)的方法。  方法 用巢式PCR技术扩增长春市人和牛粪便中C .parvum与C .andersoni的Small SubunitrRNA (SSUrRNA)部分基因 ,并克隆和测序。扩增产物分别用SspⅠ和VspⅠ单酶切 ,进行RFLP分析 ,并与GenBank上的 17株隐孢子虫相应序列进行对比分析和系统发育分析。 结果 C .parvumHCC1、C .parvumBOCC1和C .andersoniBOCC1扩增产物片段大小分别为 83 0bp、83 0bp和 82 8bp ,经SspⅠ和VspⅠ分别单酶切后形成 2种不同的RFLP图谱 ,根据RFLP图谱可鉴别C .parvum与C .andersoni。序列分析结果显示 ,C .parvumHCC1与国外牛源C .parvumBOH 6、C .parvumGCH1、鹿源C .parvumDR1相应序列同源性均为 99.3 % ;C .parvumBOCC1与国外牛源C .parvumBOH6、C .parvumGCH1、鹿源C .parvumDR1相应序列同源性均为 99.5 % ;C .andersoniBOCC1与国外C .andersoni相应序列同源性为 99.9%。系统发育分析结果显示 ,隐孢子虫虫种形成了 2个群 ,1个群包括C .parvum、C .baileyi、C .meleagridis、C .felis和C .wrairi,另 1个群包括C . 展开更多
关键词 微小隐孢子虫 安氏隐孢子虫 SSU RRNA基因 巢式pcr-rflp
下载PDF
生防菌BC2000、BC2001的16S rRNA PCR-RFLP图谱分析 被引量:2
11
作者 宋铁英 包晓东 +2 位作者 宋亚娜 林智敏 郑伟文 《福建农业学报》 CAS 2003年第4期264-267,共4页
运用细菌通用16S rRNA特异的引物对,将生防菌BC2000、BC2001和对照菌株用6种内切酶进行PCR—RFLP扩增分析。结果表明,内切酶Hin6I、CfoI的酶切可把7种菌分成4组:A组为BC2000、BC2001;B组为圆褐固氮菌;C组为荧光假单胞菌;D组为拮抗菌LB2... 运用细菌通用16S rRNA特异的引物对,将生防菌BC2000、BC2001和对照菌株用6种内切酶进行PCR—RFLP扩增分析。结果表明,内切酶Hin6I、CfoI的酶切可把7种菌分成4组:A组为BC2000、BC2001;B组为圆褐固氮菌;C组为荧光假单胞菌;D组为拮抗菌LB2、LB3、Apb。内切酶Hin6I、CfoI的酶切图谱谱带清晰,差别明显,可作为生防菌BC2000、BC2001的分子标记图谱。 展开更多
关键词 细菌 BC2000 BC2001 菌株 内切酶 pcr- rflp 酶切图谱 分子标记图谱 16S RRNA基因 根结线虫 生物防治 番茄
下载PDF
应用PCR-RFLP和巢式PCR检测黄瓜尖镰孢菌 被引量:7
12
作者 陈微 李永刚 文景芝 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期209-214,共6页
以3株黄瓜尖镰孢菌(Fusarium oxysporum f. sp. cucumarinum)、23株镰孢菌属(Fusarium spp.)真菌和分离自土壤的20株真菌、6株细菌和7株放线菌为材料,采用化学裂解法提取总DNA,进行PCR-RFLP和巢式PCR检测,试验证明PCR-RFLP程序不能完全... 以3株黄瓜尖镰孢菌(Fusarium oxysporum f. sp. cucumarinum)、23株镰孢菌属(Fusarium spp.)真菌和分离自土壤的20株真菌、6株细菌和7株放线菌为材料,采用化学裂解法提取总DNA,进行PCR-RFLP和巢式PCR检测,试验证明PCR-RFLP程序不能完全区分Fusarium属内不同种,而巢式PCR对黄瓜尖镰孢菌具有特异性。运用优化的PCR-RFLP和巢式PCR检测程序对染病黄瓜组织进行了检测,结果表明,两种方法均可在接种发病早期(未显症时)检测出黄瓜枯萎病菌,PCR-RFLP在感病品种接种后3d即可检测到病原菌,而巢式PCR在接种后5d才能检测到病原菌。 展开更多
关键词 黄瓜枯萎病 黄瓜尖镰孢菌 PCR—rflp 巢式PCR
下载PDF
拓扑异构酶II基因区PCR-RFLP法鉴别常见皮肤癣菌
13
作者 谭志建 何甘霖 +1 位作者 丁娟 李家文 《中国麻风皮肤病杂志》 2006年第2期114-116,共3页
目的:探讨拓扑异构酶Ⅱ基因区PCR~RFLP法鉴别常见皮肤癣菌的可行性。方法:用真菌拓扑异构酶Ⅱ基因区通用引物dPsD1、dPsD2,先后对6种34株临床常见皮肤癣菌和2株白念珠菌以及4株曲霉的DNA进行巢式PCR(nested PER)扩增,扩增后的阳... 目的:探讨拓扑异构酶Ⅱ基因区PCR~RFLP法鉴别常见皮肤癣菌的可行性。方法:用真菌拓扑异构酶Ⅱ基因区通用引物dPsD1、dPsD2,先后对6种34株临床常见皮肤癣菌和2株白念珠菌以及4株曲霉的DNA进行巢式PCR(nested PER)扩增,扩增后的阳性产物分别用限制性内切酶HincⅡ和HinfⅠ酶切,进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析,根据结果来鉴定皮肤癣菌并在种的水平上区分这6种常见皮肤癣菌。结果:通用引物dPsD1对6种皮肤癣菌均能扩增出3390bp、dPsD2能扩增出2380bp的片段,而白念珠菌和曲霉则未见阳性扩增条带。扩增出的产物分别经HincⅡ和HinfⅠ酶切后表现为58—1670bp长短不等的片段组合,根据这些特异性条带谱可以区分这6种临床常见皮肤癣菌。结论:拓扑异构酶Ⅱ基因区的巢式PCR—RFLP方法,是鉴定和区分常见皮肤癣菌的有效方法。 展开更多
关键词 皮肤癣菌 拓扑异构酶 巢式PCR rflp Ⅱ基因区 PCR—rflp
下载PDF
长白山四种赤杨丛枝菌根真菌侵染多样性的巢式PCR-RFLP分析 被引量:5
14
作者 董甜 张惠文 +1 位作者 张粤 何兴元 《应用生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期1796-1800,共5页
采集中国吉林长白山不同海拔的4种赤杨根须样本,利用巢式PCR-RFLP方法检测丛枝菌根真菌(AMF)对样品的侵染情况,PCR结果经限制性内切酶分析.结果表明,赤杨根内AMF存在丰富的基因多样性.AMF的侵染有从宿主混乱性向宿主专一性发展的趋势.... 采集中国吉林长白山不同海拔的4种赤杨根须样本,利用巢式PCR-RFLP方法检测丛枝菌根真菌(AMF)对样品的侵染情况,PCR结果经限制性内切酶分析.结果表明,赤杨根内AMF存在丰富的基因多样性.AMF的侵染有从宿主混乱性向宿主专一性发展的趋势.东北赤杨AMF的宿主专一性水平最强,球囊霉属已成为东北赤杨的优势侵染类群;其余3种赤杨的AMF则出现宿主混乱现象.宿主因素比海拔因素对AMF侵染有更重要的影响. 展开更多
关键词 赤杨 巢式pcr-rflp 丛枝菌根真菌(AMF) 多样性 长白山
下载PDF
Clinical Identification of Common Species of Dermatophytes by PCR and PCR-RFLP
15
作者 丁娟 李家文 +1 位作者 刘志香 谭志建 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2004年第6期642-644,共3页
Summary: To find a fast and efficient way of identifying seven common dermatophytes in clinical practice, we used the techniques of polymerase chain reaction (PCR) and PCR-restriction fragment length polymorphism (RFL... Summary: To find a fast and efficient way of identifying seven common dermatophytes in clinical practice, we used the techniques of polymerase chain reaction (PCR) and PCR-restriction fragment length polymorphism (RFLP) targeting TopoisomeraseⅡgene. The DNA of 7 dermatophytes, along with Candida albicans, Aspergillus terreus and Aspergillus flavus were amplified by consensus primer dPsD1. They were then subjected to a second PCR with primers dPsD2 and species-specific primers PsT and PsME separately. 6 of the products generated by dPsD2 were digested with restriction enzyme HincⅡ. DNA fragments of 3390 bp and 2380 bp was amplified by using consensus primer dPsD1 and dPsD2 from the genomic DNA of each dermatophyte species separately. By combining the results of the two species-specific primer sets (PsT and PsME), all species of dermatophyte yielded unique sizes-set of PCR products expect for T. mentagrophytes and T. tonsurans. From the restriction profiles of HincⅡ, 6 of the 7 dermatophytoses were diagnosed to species level including T. mentagrophytes and T. tonsurans. By combining the results of the PCR and PCR-RFLP, the 7 common dermatophytes can be identified to species level. It is conclude that the multiplex PCR and PCR-RFLP identification targeting the DNA topoisomerase Ⅱ gene is rapid and efficient. 展开更多
关键词 DERMATOPHYTE TOPOISOMERASE nested PCR Multiplex PCR rflp
下载PDF
从我国20种感病植物中扩增植原体16SrDNA片段及其RFLP分析 被引量:25
16
作者 邱并生 李横虹 +1 位作者 史春霖 金开璇 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 1998年第6期67-74,共8页
本研究收集了20种感染植原体的植物材料,从患病材料和相应健康植物组织中提取总DNA用作PCR模板,选择两对通用引物进行巢式PCR,扩增植原体的16SrDNA片段,回收扩增产物,通过限制性酶切片段长度多态性(RFLP)... 本研究收集了20种感染植原体的植物材料,从患病材料和相应健康植物组织中提取总DNA用作PCR模板,选择两对通用引物进行巢式PCR,扩增植原体的16SrDNA片段,回收扩增产物,通过限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析进行分类。20种患病植物材料中的植原体有13种属于翠菊黄化种,2种属于白腊树黄化种,3种属于花生丛枝种,2种属于三叶草丛生种。 展开更多
关键词 植原体 16SrDNAW 巢式PCR RLFP
下载PDF
应用巢式RT-PCR结合RFLP、SSCP对山东肾综合征出血热病人血清中HV基因检测和分型研究 被引量:4
17
作者 刘运喜 赵仲堂 +6 位作者 许晓群 李健 高媛 江佳富 张景兰 杨占清 曹务春 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第7期624-628,共5页
目的探讨山东肾综合征出血热重疫区病人血清中HV分子生物学特征,同时寻找准确、简便、迅速的HV检测与分型方法,从而为制定防治决策提供科学根据。方法从山东肾综合征出血热重疫区临沂市费县收集病人早期血清,应用巢式RT-PCR对病人血清中... 目的探讨山东肾综合征出血热重疫区病人血清中HV分子生物学特征,同时寻找准确、简便、迅速的HV检测与分型方法,从而为制定防治决策提供科学根据。方法从山东肾综合征出血热重疫区临沂市费县收集病人早期血清,应用巢式RT-PCR对病人血清中的HV进行基因扩增,采用RFLP、SSCP分型,并进行序列测定与分析。结果48份临床和ELISA检测确诊的HFRS病人血清经巢式RT-PCR扩增后,41份阳性,阳性率85.42%。41份阳性标本巢式RT-PCR产物经HindIII、HinfI酶切后,呈现2种不同的RFLP图谱:33份显示与R22株相似的酶切图谱,应属SEOV型;另外8份显示出与HTN76-118株相似的图谱,属HTNV型,这8份HTNV型标本均为10-12月间收集的病人血清。41份阳性标本巢式RT-PCR产物经SSCP分析,亦呈现2种不同的图谱:33份具有与R22株相似的SSCP图谱,应属SEOV型;而另8份则与HTN76-118株具有相似的SSCP图谱,属HTNV型。对部分扩增产物序列采用系统进化树分析也得出类似的结果:sdp1、sdp2、sdp3与HTN型76-118株亲缘关系相近,属同一簇,而sdp22、sdp37与SEOV型Z37、R22株亲缘关系相近,属另外一簇,这与RFLP和SSCP获得的结果相一致。结论山东肾综合征出血热重疫区病人基因型以SEOV型为主,但在秋冬季节也存在HTNV型。巢式RT-PCR结合RFLP、SSCP法可对HV准确分型,而且简便、迅速,适合于大规模流行病学调查。 展开更多
关键词 HV 巢式RT-PCR rflp SSCP 序列分析 基因型
下载PDF
樱桃带化病组织中植物菌原体16SrDNAPCR扩增及其产物RFLP分析 被引量:3
18
作者 李横虹 邱并生 +3 位作者 史春霖 金开璇 周琦 黄习军 《林业科学研究》 CSCD 北大核心 1997年第5期478-481,共4页
樱桃带化病是从以色列引种樱桃园中发现的新病害。本文报道了按照检测植物菌原体(phytoplasma)的方法提取DNA,扩增患病植株中植物菌原体的16SrDNA片段,证明樱桃带化病中有植物菌原体存在,并对此扩增片段进行... 樱桃带化病是从以色列引种樱桃园中发现的新病害。本文报道了按照检测植物菌原体(phytoplasma)的方法提取DNA,扩增患病植株中植物菌原体的16SrDNA片段,证明樱桃带化病中有植物菌原体存在,并对此扩增片段进行限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析。根据RFLP分析结果,参照Lee,I.M.等的文献资料,对本次樱桃带化病病原进行鉴定与分类,初步定为Ⅶ类。 展开更多
关键词 樱桃 带化病 植物菌原体 rflp 分析
下载PDF
套式PCR检测恶性疟原虫Pfcrt基因76号编码多态性及RFLP分析 被引量:3
19
作者 董莹 张再兴 Adagu IS 《实用寄生虫病杂志》 2001年第3期104-107,共4页
目的检测恶性疟原虫氯喹抗性转运基因 ( Pfcrt) 76编码多态性及其用该多态性显示恶性疟原虫对氯喹反应性进行评价。方法用套式 PCR/RFLP技术检测现场采集的滤纸血滴上恶性疟原虫 crt基因 76编码的赖氨酸野生型多态性及苏氨酸突变型多态... 目的检测恶性疟原虫氯喹抗性转运基因 ( Pfcrt) 76编码多态性及其用该多态性显示恶性疟原虫对氯喹反应性进行评价。方法用套式 PCR/RFLP技术检测现场采集的滤纸血滴上恶性疟原虫 crt基因 76编码的赖氨酸野生型多态性及苏氨酸突变型多态性 ,并对恶性疟原虫的氯喹反应性进行体内法测定。结果 34份滤纸血样中 ,32份的恶性疟原虫 crt基因 76号编码为苏氨酸 (突变型 ) ,突变型比例为 94 .1 2 % ;34份血样中 2 1份做氯喹抗性体内观察 ,该 2 1个病例中 1 4份血样恶性疟原虫 crt基因 76号编码为突变型 ,体内法观察同样显示恶性疟原虫对氯喹有抗性 ,两种方法显示恶性疟原虫对氯喹有抗性的符合率为 66.67%。结论套式 PCR/RFLP检测 Pfcrt基因 76号编码多态性 ,其方法简便、快速 ,但其多态性对氯喹反应性的提示尚需进一步评价。 展开更多
关键词 Pfcrt基因 套式PCR/rflp 抗性 突变 疟原虫
下载PDF
禽传染性支气管炎病毒纤突蛋白S_1基因的RFLP与序列比较分析
20
作者 李华 杨汉春 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第S4期124-130,共7页
利用反转录一套式聚合酶链式反应技术从北京地区禽传染性支气管炎病毒(IBV)分离株 BJ_1、BJ_2、BJ_3株中成功扩增出1054bp 纤突蛋白高变区。利用限制性内切酶 Sin Ⅰ和 Pst Ⅰ的酶切分析证实了RT-nested PCR 的特异性,结合计算机酶切位... 利用反转录一套式聚合酶链式反应技术从北京地区禽传染性支气管炎病毒(IBV)分离株 BJ_1、BJ_2、BJ_3株中成功扩增出1054bp 纤突蛋白高变区。利用限制性内切酶 Sin Ⅰ和 Pst Ⅰ的酶切分析证实了RT-nested PCR 的特异性,结合计算机酶切位点分析图谱进行理论 RFLP 分析。将三段 S_1基因分别克隆到pUC19质粒中,获得重组质粒 pUC IBV S_1-BJ_1、pUC IBV S_1-BJ_2、pUC IBV S_1-BJ_3。利用双脱氧链终止法对三个重组质粒进行双向测序,获得三株分离株 S_1基因高变区的序列。将得到的三个序列与标准株 M_(41),Beaudette 株和疫苗株 H_(120)及广东地方分离株 D_(41)株进行核酸序列同源性比较分析。结果表明,三株分离株核酸碱基序列和氨基酸序列与 M_(41)株的同源性比与 H_(120)株和 Beandette 株的同源性高。本研究对于进一步深入探讨禽传染性支气管炎病毒(IBV)分子变异机制研究奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 禽传染性支气管炎病毒 S1基因 反转录一套式聚合酶链式反应 rflp 序列比较分析
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部