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进口锦鲤暴发病病原的nested-PCR鉴定 被引量:59
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作者 刘荭 史秀杰 +1 位作者 高隆英 江育林 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期414-418,共5页
为了查明锦鲤暴发性疾病的病因 ,将患病锦鲤的脑、肝、脾和肾等组织悬液接种到CO、CK和EPC等鱼类细胞系中培养 ,均未发现细胞病变 ;从病灶中取样进行病原菌的分离和培养 ,证明锦鲤有副溶血弧菌和嗜水气单胞菌的感染。制备锦鲤疱疹病毒 (... 为了查明锦鲤暴发性疾病的病因 ,将患病锦鲤的脑、肝、脾和肾等组织悬液接种到CO、CK和EPC等鱼类细胞系中培养 ,均未发现细胞病变 ;从病灶中取样进行病原菌的分离和培养 ,证明锦鲤有副溶血弧菌和嗜水气单胞菌的感染。制备锦鲤疱疹病毒 (KHV)的 2对引物KHV9/ 5F和KHV9/ 5R ,KHV1和KHV2 ,用嵌套式聚合酶链式反应 (nested -PCR)在脑和脾脏组织的抽提物中扩增出长度为 4 12bp的特异性的DNA片段。将该片段的nested -PCR扩增产物纯化后 ,克隆、测序。用NCBI -Blast软件将测序结果在Genebank中进行搜寻、比较 ,结果发现与注册号为AF4 1180 3的KHV基因序列的一部分片段有 99%的同源性。因此初步判断这次锦鲤暴发性疾病是由KHV引起的 。 展开更多
关键词 锦鲤 暴发病 病原 nested-pcr鉴定 嵌套式聚合酶链式反应
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nested-PCR试剂盒检测牛精液中的布鲁氏菌DNA 被引量:6
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作者 曹小安 邱昌庆 +2 位作者 周继章 蔺国珍 郑福英 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第2期137-139,共3页
目的布鲁氏菌是兼性细胞内寄生菌,能够在吞噬细胞内长期存活并繁殖,引起家畜流产和人的波浪热。根据病原性和感染宿主的不同将布鲁氏菌分为六个种,能否快速、有效地从各种病料中检出布鲁氏菌,对及时控制布鲁氏菌在家畜中的传播和预防对... 目的布鲁氏菌是兼性细胞内寄生菌,能够在吞噬细胞内长期存活并繁殖,引起家畜流产和人的波浪热。根据病原性和感染宿主的不同将布鲁氏菌分为六个种,能否快速、有效地从各种病料中检出布鲁氏菌,对及时控制布鲁氏菌在家畜中的传播和预防对人的感染十分重要。方法2006年6月,宁夏某公司奶牛场工作人员送检3份奶牛冻干精液,用巢式PCR检测出其中的2份为布鲁氏菌感染阳性,这年8月,重复取这2头种公牛的冻精、鲜精复查。结果用本方法检测全部为布鲁氏菌感染阳性。结论这是国内首次用巢式聚合酶链反应(nested-PCR)试剂盒从送检的牛精液中检出了布鲁氏菌DNA片段。 展开更多
关键词 布鲁氏菌 nested-pcr 牛精液 检测
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Nested-PCR检测种传番茄细菌性溃疡病菌 被引量:6
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作者 闵现华 刘箐 +6 位作者 韩跃武 文朝慧 王军平 刘姝彤 刘雅莉 宋蕤 施颖波 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期28-31,共4页
利用番茄溃疡病菌特异性引物对纯菌液、模拟带菌种子及自然感染种子提取液分别进行Direct-PCR和Nested-PCR检测。结果在纯菌液中,Direct-PCR的检测灵敏度为105cfu/mL,Nested-PCR为102cfu/mL;在模拟带菌种子提取液中,Direct-PCR的检测灵... 利用番茄溃疡病菌特异性引物对纯菌液、模拟带菌种子及自然感染种子提取液分别进行Direct-PCR和Nested-PCR检测。结果在纯菌液中,Direct-PCR的检测灵敏度为105cfu/mL,Nested-PCR为102cfu/mL;在模拟带菌种子提取液中,Direct-PCR的检测灵敏度为107cfu/mL,Nested-PCR为104cfu/mL;在自然感染种子提取液中,稀释104倍后Nested-PCR仍然可以检出。建立的番茄种子Nested-PCR检测技术,无需经过核酸提取步骤,可以在8 h内完成整个检测过程,方便快捷,成本低廉,可作为番茄种子带菌的常规检测方法。 展开更多
关键词 番茄溃疡病 番茄种子 Direct-PCR nested-pcr
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应用套入式聚合酶链反应(Nested-PCR)检测蓝舌病病毒的研究 被引量:4
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作者 马洪超 孙淑芳 +8 位作者 陶茂辉 尹燕博 郭福生 龚振华 蔡丽娟 蒋正军 丁有胜 黄运生 陈书琨 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期145-149,共5页
本实验建立了一种Nested PCR方法。应用该方法检测 5株标准株蓝舌病病毒 (T4、T10、T11、T16、T2 0 )和 5株国内蓝舌病病毒分离株 (CF4、AF6、Z1、H1、G14) ,检测结果均为阳性 ,而检测相关环状病毒 (EHD2、EHD6、Ibraki) ,检测结果均为... 本实验建立了一种Nested PCR方法。应用该方法检测 5株标准株蓝舌病病毒 (T4、T10、T11、T16、T2 0 )和 5株国内蓝舌病病毒分离株 (CF4、AF6、Z1、H1、G14) ,检测结果均为阳性 ,而检测相关环状病毒 (EHD2、EHD6、Ibraki) ,检测结果均为阴性。研究证明 ,此方法可检测到3 5fg的BTV—RNA ,灵敏度较高。该方法成功区分了蓝舌病病毒和相关环状病毒 ,比血清学方法更加优越 ,在临床检测方面具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 家畜 蓝舌病病毒 nested-pcr 检测方法
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用Nested-PCR检测广西黄皮与九里香黄龙病病原 被引量:5
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作者 邓崇岭 陈传武 +5 位作者 赵小龙 付慧敏 陈国平 白先进 娄兵海 吴礽超 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2010年第17期273-276,共4页
运用Nested-PCR技术对来自广西部分市、县的40个黄皮和九里香进行柑桔黄龙病(CitrusHuanglongbing,HLB)病原检测,结果表明:从部分黄皮和九里香样品抽提的DNA中,可扩增出一条特异性的400bp条带,说明广西种植的黄皮和九里香均可感染黄龙病... 运用Nested-PCR技术对来自广西部分市、县的40个黄皮和九里香进行柑桔黄龙病(CitrusHuanglongbing,HLB)病原检测,结果表明:从部分黄皮和九里香样品抽提的DNA中,可扩增出一条特异性的400bp条带,说明广西种植的黄皮和九里香均可感染黄龙病;在柑桔黄龙病疫区,黄皮和九里香黄龙病感染率分别为35.0%和40.0%,黄龙病感染率已相当高。为了减少柑桔黄龙病的发生,有利于对柑桔黄龙病进行综合防控,不宜在柑桔种植区栽种黄皮和九里香,铲除已感染黄龙病的植株。 展开更多
关键词 黄皮 九里香 黄龙病 nested-pcr
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应用nested-PCR对西安市乙肝病毒基因型的研究 被引量:3
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作者 王林川 陈葳 张阿丽 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期803-804,共2页
目的:研究西安市乙肝患者HBV基因型分布状况,初步建立适用于临床的HBV基因分型的方法。方法:对收集的360例乙肝患者血清样本,针对乙肝病毒基因型(A-H)前S1到S基因的保守序列设计出12条内外引物,采用nested-PCR进行2轮扩增,第2轮产物使用... 目的:研究西安市乙肝患者HBV基因型分布状况,初步建立适用于临床的HBV基因分型的方法。方法:对收集的360例乙肝患者血清样本,针对乙肝病毒基因型(A-H)前S1到S基因的保守序列设计出12条内外引物,采用nested-PCR进行2轮扩增,第2轮产物使用30 g/L琼脂糖进行电泳,根据片断大小进行基因分型。结果:分型成功348例,其中HBV B基因型87例(24.2%);C型233例(64.7%);B+C混合型2例(0.56%),未检出A、D、E、F、G、H型。结论:nested-PCR适用于临床HBV基因分型常规检测,通过该方法的检测表明西安市HBV感染者以C基因型为主,B型次之,其余基因型分布较少。 展开更多
关键词 西安 乙肝病毒 基因型 nested-pcr
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应用Nested-PCR技术检测人工感染绵羊蓝舌病病毒 被引量:1
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作者 马洪超 孙淑芳 +4 位作者 陶茂晖 尹燕博 郑文伯 蒋正军 蔡丽娟 《中国动物检疫》 CAS 2000年第12期20-22,共3页
实验采用6只绵羊分成3组,一组作为对照接种BHK21细胞上清液,另二组分别接种BTV10和中国分离株Z1株,攻毒定期采血提取抗原并提取病毒RNA,同时进行琼脂扩散试验、普通PCR、Nested-PCR试验。结果在整个... 实验采用6只绵羊分成3组,一组作为对照接种BHK21细胞上清液,另二组分别接种BTV10和中国分离株Z1株,攻毒定期采血提取抗原并提取病毒RNA,同时进行琼脂扩散试验、普通PCR、Nested-PCR试验。结果在整个攻毒期间,琼脂扩散方法检测不到抗原,普通 PCR方法只能在攻毒后 12 d~ 15 d测得抗原,而 Nested-PCR在攻毒后 6 d即可测得病毒 RNA,并且可一直持续到 30 d。试验证明, Nested- PCR方法是高度敏感的检测抗原的方法。在临床上能够较早地检出抗原,这对于及时采取有效措施,控制疾病流行具有积极的意义。 展开更多
关键词 nested-pcr技术 检测 人工感染 绵羊 蓝舌病病毒 琼脂扩散试验
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应用NESTED-PCR法检测细胞培养物中的支原体污染 被引量:2
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作者 张曦 滕峥 朱兆奎 《上海预防医学》 CAS 2002年第9期414-415,419,共3页
[目的 ] 研究细胞培养物中支原体污染的快速检测方法。  [方法 ] 引物选择各型支原体 16S和 2 3SrRNA处的共同保守区域 ,应用NESTED -PCR ,检测细胞培养物中的支原体污染。  [结果 ] NESTED -PCR能检测 6种常见的污染细胞培养物的... [目的 ] 研究细胞培养物中支原体污染的快速检测方法。  [方法 ] 引物选择各型支原体 16S和 2 3SrRNA处的共同保守区域 ,应用NESTED -PCR ,检测细胞培养物中的支原体污染。  [结果 ] NESTED -PCR能检测 6种常见的污染细胞培养物的支原体 ,扩增的片段分别在 3 60~ 5 0 0bp和 15 0~ 3 0 0bp ;NESTED -PCR检测敏感性比一步法高。  [结论 ] 应用NESTED -PCR检测细胞培养物中的支原体污染 ,具有快速、特异和敏感的特点。 展开更多
关键词 支原体 细胞培养物 nested-pcr
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RTP-CR和nested-PCR技术在猪瘟病毒检测中的应用 被引量:3
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作者 胡建和 王天有 +3 位作者 刘保国 李培庆 刘湘涛 谢庆阁 《甘肃畜牧兽医》 2003年第1期2-4,共3页
根据已发表的CSFV核苷酸序列 ,设计并合成CSFV特异性PCR引物对及nested PCR引物对。从待检猪脾脏、淋巴组织或实验感染的细胞培养物中提取总RNA ,用AMV反转录酶进行反转录后 ,进行PCR扩增 ,一扩产物再用nested PCR引物对进行二次扩增 ,... 根据已发表的CSFV核苷酸序列 ,设计并合成CSFV特异性PCR引物对及nested PCR引物对。从待检猪脾脏、淋巴组织或实验感染的细胞培养物中提取总RNA ,用AMV反转录酶进行反转录后 ,进行PCR扩增 ,一扩产物再用nested PCR引物对进行二次扩增 ,用琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。进一步将该片段纯化回收后 ,克隆到T载体并进行测序。测序结果同已知的CSFV、BVDV和BDV核苷酸序列进行同源性比较分析 ,既可快速、准确地区别于BVDV和BDV ,又可以确定CSFV的血清型。该方法可有效用于猪瘟的病理学和流行病学研究。 展开更多
关键词 RT-PCR nested-pcr技术 猪瘟 病毒检测 应用 同源性比较
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Nested-PCR在人间布鲁氏菌病早期快速诊断中的探讨 被引量:4
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作者 刘志国 王妙 +6 位作者 塔娜 李晓燕 尉瑞平 米景川 李丹 崔步云 李振军 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期188-192,共5页
目的探讨Nested-PCR在布鲁氏菌病(布病)患者早期快速诊断中的可行性。方法用Nested-PCR对布鲁氏菌标准菌株的19生物型、4个疫苗株(M5、A19、S2和104M)和有血清交叉反应的菌株(人苍白杆菌、大肠杆菌O∶157、小肠结肠炎耶尔森氏菌O∶9)进... 目的探讨Nested-PCR在布鲁氏菌病(布病)患者早期快速诊断中的可行性。方法用Nested-PCR对布鲁氏菌标准菌株的19生物型、4个疫苗株(M5、A19、S2和104M)和有血清交叉反应的菌株(人苍白杆菌、大肠杆菌O∶157、小肠结肠炎耶尔森氏菌O∶9)进行扩增,评价该方法的特异性;用Nested-PCR对倍比稀释的16M菌株DNA(100~10^(-7))进行扩增,评价该方法的分析敏感性。用Nested-PCR对临床采集的200份布病样本DNA进行检测,评价该方法在临床样本检测中的可行性。结果Nested-PCR能特异性的检出所有布鲁氏菌种,而与布鲁氏菌有血清学交叉反应的菌株和阴性对照未见扩增。试验表明该方法的分析敏感性至少为10-6(相当于43 fg/μL羊种布鲁氏菌DNA),明显高于BCSP31-PCR。该方法首轮引物的扩增阳性率为4.5%(9/200),次轮引物扩增的阳性率为75.5%(151/200),与血清学检测结果有较高的一致性。结论Nested-PCR可尝试用于布病患者的早期筛查,但尚需优化改进。 展开更多
关键词 布病 nested-pcr 早期诊断
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沃柑黄龙病亚洲种Nested-PCR检测与调查分析 被引量:1
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作者 刘福平 王茜 +5 位作者 陈东奎 陈香玲 廖惠红 汪妮娜 黄宏明 黄其椿 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期101-107,共7页
【目的】探究沃柑感染黄龙病的田间症状表现及各症状与感染黄龙病的相关性,为种植者尽早鉴别黄龙病树和及时做好黄龙病防控工作提供参考依据。【方法】从广西不同地区沃柑果园采集沃柑黄龙病疑似样品,对样品按症状分类并记录,用试剂盒... 【目的】探究沃柑感染黄龙病的田间症状表现及各症状与感染黄龙病的相关性,为种植者尽早鉴别黄龙病树和及时做好黄龙病防控工作提供参考依据。【方法】从广西不同地区沃柑果园采集沃柑黄龙病疑似样品,对样品按症状分类并记录,用试剂盒法提取叶脉和果柱基因组DNA,采用黄龙病亚洲种的16S r DNA特异引物f D1/fD2和OI1/OI2进行巢式PCR(Nested-PCR)扩增,扩增结果在1%琼脂糖凝胶电泳上检测,统计不同症状样品的阳性率。【结果】收集的214份黄龙病疑似样品中,不同症状样品均检出黄龙病亚洲种病原菌,检出阳性率表现为典型红鼻子果=斑驳黄化叶>果蒂稍红果>均匀黄化叶>叶脉黄化叶>僵果>缺锌黄化叶>其他黄化叶>正常叶。各症状类型与感染黄龙病均存在相关性,但存在差异,其中,典型红鼻子果和斑驳黄化叶阳性率均为100.0%,与感染黄龙病相关性最大;其次果蒂稍红果阳性率为90.9%,与感染黄龙病相关性很大;夏、秋梢均匀黄化叶阳性率为46.5%,与感染黄龙病相关性大。沃柑感染黄龙病后症状复杂,大多出现两种以上复合症状,结果树最初症状为出现果蒂稍红果,落果较多,未结果树以夏、秋梢黄化居多,根系容易受损;正常叶阳性率达16.7%,说明沃柑感染黄龙病早期不易显症。【结论】沃柑出现典型红鼻子果和斑驳黄化叶,可田间诊断为黄龙病树;出现果蒂稍红果,并严重落果,基本可田间诊断为黄龙病树;夏、秋梢均匀黄化黄龙病检出率高,但确诊还需与其他疑似症状(叶脉黄化叶、僵果、缺锌黄化叶、其他黄化叶和正常叶)一样通过PCR进一步检测。Nested-PCR检测技术灵敏性高,可作为沃柑感染黄龙病的早期鉴定技术。 展开更多
关键词 沃柑 黄龙病病原 nested-pcr检测 调查分析
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柑橘黄龙病nested-PCR检测技术在柑橘苗木生产中的应用 被引量:12
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作者 陈传武 白先进 +4 位作者 赵小龙 付慧敏 邓崇岭 吴礽超 王明召 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期91-93,共3页
柑橘黄龙病(huanglongbing,HLB)是柑橘生产上的一种毁灭性病害。本研究以柑橘叶脉为材料,采用nes-ted-PCR技术对广西部分柑橘苗圃苗木进行了黄龙病检测。结果表明,nested-PCR技术不仅可以检测已经表现症状的苗木样品,还可以检测出带病... 柑橘黄龙病(huanglongbing,HLB)是柑橘生产上的一种毁灭性病害。本研究以柑橘叶脉为材料,采用nes-ted-PCR技术对广西部分柑橘苗圃苗木进行了黄龙病检测。结果表明,nested-PCR技术不仅可以检测已经表现症状的苗木样品,还可以检测出带病但不显症的苗木样品。2007年共检测柑橘苗木样品1 950个,2008年共检测样品1 480个,黄龙病苗木检出率分别为10.31%和6.22%。本研究对及早控制带病苗木的传播,繁育柑橘无病毒苗木具有重要的意义。 展开更多
关键词 柑橘 黄龙病 nested-pcr 苗木
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用nested-PCR方法快速检测鲑鱼肾杆菌 被引量:5
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作者 刘荭 高隆英 +1 位作者 史秀杰 江育林 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期453-458,共6页
描述了用嵌套式聚合酶链式反应(nested PCR)快速检测鲑鱼细菌性肾病病原鲑鱼肾杆菌的方法。以BKDR和BKDF为引物,扩增鲑肾杆菌编码57kDa主要可溶性蛋白基因中501bp的DNA片段,再用引物BKDR2和BKDF2扩增其中长度为314bp的DNA片段。用其它1... 描述了用嵌套式聚合酶链式反应(nested PCR)快速检测鲑鱼细菌性肾病病原鲑鱼肾杆菌的方法。以BKDR和BKDF为引物,扩增鲑肾杆菌编码57kDa主要可溶性蛋白基因中501bp的DNA片段,再用引物BKDR2和BKDF2扩增其中长度为314bp的DNA片段。用其它15种常见鱼类致病菌验证这两组引物的特异性,结果没有非特异性的DNA片段被扩增出来。用酚抽提法和煮沸加冻融的方法获得的细菌裂解产物,PCR检测的灵敏度均可达到1.8×103CFU·mL-1,用Nested PCR进一步扩增PCR扩增的产物,检测灵敏度可再提高100倍。检测鲑鱼肾杆菌菌悬液与鲟卵的混合物,结果表明,该方法能准确、可靠、快速地检测鲑肾杆菌。 展开更多
关键词 nested-pcr方法 细菌性肾病 鲑鱼肾杆菌 嵌套式聚合酶链式反应 检测方法
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Prevalence of human herpesvirus 8 infection in patients undergoing hemodialysis using nested-PCR
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作者 Somayeh Shokri Shahab Mahmoudvand +3 位作者 Manoochehr Makvandi Toran Shahani AliSamadi Heshmatollah Shahbazian 《Journal of Acute Disease》 2019年第6期250-254,共5页
Objective:To study the prevalence of HHV-8 infection in patients undergoing hemodialysis.Methods:In this study,blood samples of 89 patients undergoing hemodialysis were collected.DNA was extracted from peripheral bloo... Objective:To study the prevalence of HHV-8 infection in patients undergoing hemodialysis.Methods:In this study,blood samples of 89 patients undergoing hemodialysis were collected.DNA was extracted from peripheral blood mononuclear cells and HHV-8 DNA was evaluated by nested-PCR.Results:Of total 89 patients,51(57.3%)were males and 38(42.7%)were females.The patients'age ranged from 24 to 90 years and the mean age was(57.5±1.4)years.HHV-8 DNA was found in 9 of 89(10.1%)peripheral blood mononuclear cell samples,8/51(15.7%)in males and 1/38(2.6%)in females(P=0.07).All patients who were positive for HHV8-DNA were more than 50 years old.Conclusions:This study shows high prevalence of HHV-8.Since hemodialysis patients are candidates for kidney transplantation and due to the possibility of HHV8-reactivation and its serious complications in immunocompromised patients,routine screening for detection of the virus should be implemented for all hemodialysis patients. 展开更多
关键词 Human HERPESVIRUS 8 HEMODIALYSIS PATIENTS nested-pcr
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安祖花细菌性疫病的Nested-PCR检测 被引量:3
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作者 孟鹤 金茂勇 +5 位作者 肖橘清 张宝珠 明军 袁素霞 刘春 张宁 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期2017-2022,共6页
根据基因库中已发表的安祖花细菌性疫病致病菌粉黛黄单胞杆菌(Xanthomonas campestris pv.dieffenbachiae)基因序列设计引物XcF1/XcR1、XcF2/XcR2,通过扩增条件优化,建立了安祖花细菌性疫病的Nested-PCR检测方法,可以直接从感染细菌性... 根据基因库中已发表的安祖花细菌性疫病致病菌粉黛黄单胞杆菌(Xanthomonas campestris pv.dieffenbachiae)基因序列设计引物XcF1/XcR1、XcF2/XcR2,通过扩增条件优化,建立了安祖花细菌性疫病的Nested-PCR检测方法,可以直接从感染细菌性疫病的安祖花组织DNA中扩增出1条343bp的特异性条带。分析表明该序列完全存在于GenBank登录的Xanthomonas campestris pv.dieffenbachiae序列X70380.1中。通过对安祖花植株进行Nested-PCR扩增,在植株不同部位均检测到了343bp的特异性条带,且病原菌在植株中分布不均匀,其中老叶叶柄中扩增强度最高,根茎连接处、老叶、嫩叶柄、嫩叶、佛焰苞柄扩增强度次之,根、佛焰苞和花序中扩增最弱。 展开更多
关键词 安祖花 细菌性疫病 粉黛黄单胞杆菌 nested-pcr
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Nested-PCR assay for detection of Schistosoma japonicum infection in domestic animals 被引量:4
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作者 Xin Zhang Chuan-Chuan He +11 位作者 Jin-Ming Liu Hao Li Ke Lu Zhi-Qiang Fu Chuan-Gang Zhu Yi-Ping Liu Lai-Bao Tong De-bao Zhou Li Zha Yang Hong Ya-Mei Jin Jiao-Jiao Lin 《Infectious Diseases of Poverty》 SCIE 2017年第1期754-760,共7页
Background:Schistosomiasis japonica is a common zoonosis.Domestic animals are the primary source of infection and play an important role in disease transmission.The prevalence and infectivity of this disease in domest... Background:Schistosomiasis japonica is a common zoonosis.Domestic animals are the primary source of infection and play an important role in disease transmission.The prevalence and infectivity of this disease in domestic animals in China have significantly decreased and,for this reason,diagnostics with a higher sensitivity have become increasingly necessary.It was reported that polymerase chain reaction(PCR)-based methods could be used to detect schistosome infection in humans and animals and presented a high sensitivity and specificity.The present study aimed to develop a PCR-based method for detection of Schistosoma japonicum infection in domestic animals.Methods:A specific nested-PCR assay was developed to detect S.japonicum infection in domestic animals via amplification of a 231-bp DNA fragment of retrotransposon SjR2.The developed assay was first used in sera and dry blood filter paper(DBFP)from goats and buffaloes at different time points of infection.Then,78 DBFPs from 39 artificially-infected bovines at 14 and 28 days post-infection and 42 DBFPs from schistosome-negative bovines from the city of Huangshan in the Anhui province were used to evaluate the diagnostic validity.Furthermore,this assay was used to detect S.japonicum infection in domestic animals in Dongzhi and Wangjiang counties.Results:The expected PCR product was detected in eggs and adult worms of S.japonicum and blood samples from S.japonicum-infected goats and water buffaloes,but not from Fasciola and Haemonchus contortus worms.The nested-PCR assay could detect the target S.japonicum DNA in DBFPs from goats and buffaloes after day 3 post-infection.The sensitivity in buffaloes at 14 and 28 days post-infection was 92.30%(36/39)and 100%(39/39),respectively.The specificity was 97.60%(41/42).The positivity rates in Dongzhi and Wangjiang counties were 6.00%and 8.00%in bovines and 22.00%and 16.67%in goats,respectively.The positivity rates in goats in both counties were higher than those in bovines with a significant difference in Dongzhi County but not in Wangjiang County(P<0.05 and P=0.23,respectively).Conclusions:Our results suggest that the developed nested-PCR assay may be used for the diagnosis of S.japonicum infection in domestic animals,and the control of S.japonicum infection in goats should be paid more attention. 展开更多
关键词 SCHISTOSOMIASIS Domestic animals nested-pcr DIAGNOSIS
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黄檗根围丛枝菌根(AM)真菌的分离与分子鉴定 被引量:26
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作者 蔡柏岩 接伟光 +1 位作者 葛菁萍 阎秀峰 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期884-893,共10页
从东北林业大学林场采集黄檗Phellodendron amurense根系及根围土壤,采用形态学和分子生物学方法对分离得到的丛枝菌根(arbuscular mycorrhiza,AM)真菌孢子进行了分类鉴定。依据AM真菌孢子形态特征鉴定出黄檗根围土壤中存在4种AM真菌:... 从东北林业大学林场采集黄檗Phellodendron amurense根系及根围土壤,采用形态学和分子生物学方法对分离得到的丛枝菌根(arbuscular mycorrhiza,AM)真菌孢子进行了分类鉴定。依据AM真菌孢子形态特征鉴定出黄檗根围土壤中存在4种AM真菌:根内球囊霉Glomus intraradices,摩西球囊霉Glomus mosseae,美丽盾孢囊霉Scutellospora calospora和变形球囊霉Glomus versiforme,而应用nested-PCR技术从黄檗根内只检测到了G.intraradices,G.mosseae和Scu.calospora,表明G.versiforme未侵染黄檗根系。 展开更多
关键词 25SrDNA nested-pcr 系统发育分析
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2015-2016年云南省疟疾实验室诊断质量及影响因素分析 被引量:7
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作者 邓艳 董莹 +2 位作者 徐艳春 毛祥华 陈梦妮 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期337-342,共6页
目的对云南省2015-2016年网报疟疾病例的实验室诊断质量和影响因素进行分析。方法收集云南省2015-2016年疟疾网报病例,使用显微镜检法和nested-PCR法对样本进行疟原虫诊断核实。计算收样率、符合率、病例就诊所需时间和血片制作评分,利... 目的对云南省2015-2016年网报疟疾病例的实验室诊断质量和影响因素进行分析。方法收集云南省2015-2016年疟疾网报病例,使用显微镜检法和nested-PCR法对样本进行疟原虫诊断核实。计算收样率、符合率、病例就诊所需时间和血片制作评分,利用卡方检验、单因素方差分析对率或均数的差异进行统计分析,分析网报病例质量;利用单因素Logistic回归对影响病例诊断质量的因素进行分析。结果 2015-2016全省疟疾网报病例的收样率为92.15%,收样覆盖全省15个州市。疟疾病例发病到就诊所需要的平均时间为(5.1±6.6)d。全省2015和2016年疟疾网报病例检测与省级疟疾参比诊断实验室镜检和nested-PCR检测阳性的符合率分别为97.1%,95.1%,95.1%,95.1%;虫种检测符合率分别为93.1%,92.3%,91.3%和91.3%。位于边境地区的报告单位诊断水平较高,乡镇卫生院对虫种的诊断结果较为准确,省级疟疾诊断参比实验室较其他报告单位更易检出恶性疟和间日疟的混合感染。全省各级报告单位的血涂片制作平均分为79.18±8.84,且2016年的平均得分高于2015年。单因素Logistic回归结果表明,疟疾病例发病到就诊所需的时间,报告单位的类型及报告单位是否位于边境地区都影响疟疾病例诊断的质量。结论 2015-2016年云南省疟疾网报病例的诊断质量总体较高,各级诊断水平比较稳定。但是,在消除疟疾阶段,应该探讨以防治带动培训,以培训促进提高为目的的多种方式结合的疟疾防治手段,重视持续加强和保持各地各级疾病防治部门对疟疾的综合防治能力。 展开更多
关键词 疟疾 网报病例 血片 镜检 nested-pcr
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小儿急性淋巴细胞白血病IgH和Vδ_2Dδ_3基因重排的研究 被引量:7
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作者 林雯 金润铭 +3 位作者 刘勤 何美娟 王平 费洪宝 《中国当代儿科杂志》 CAS CSCD 1999年第2期65-68,共4页
目的探讨IgH和Vδ2Dδ3基因重排在初诊儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中的分布频率及其在中枢神经系统白血病(CNSL)早期诊断与脑脊液(CSF)微量残留病(MRD)监测中的意义。方法对初诊ALL患者的骨髓标本及不... 目的探讨IgH和Vδ2Dδ3基因重排在初诊儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)中的分布频率及其在中枢神经系统白血病(CNSL)早期诊断与脑脊液(CSF)微量残留病(MRD)监测中的意义。方法对初诊ALL患者的骨髓标本及不同病期CSF标本采用聚合酶链反应(PCR)检测IgH基因重排和巢式聚合酶链反应(Nested-PCR)检测Vδ2Dδ3基因重排。结果32份ALL患者骨髓标本中有23份存在克隆特异性IgH基因重排和/或Vδ2Dδ3基因重排。在骨髓标本存在异常基因重排的诱导缓解治疗期患儿的23份CSF中,9份检出Vδ2Dδ3基因重排,4份检出IgH基因重排。而完全缓解期患儿的37份CSF中,3份检出IgH基因重排,7份检出Vδ2Dδ3基因重排。结论在所检初诊ALL患者的骨髓标本中,IgH重排片段的阳性检出率为47%,Vδ2Dδ3基因的阳性检出率为38%;ALL患者脑脊液中IgH和Vδ2Dδ3基因重排的PCR动态监测较CSF常规、生化及细胞学检测更灵敏,更有助于CNSL的早期诊断,对CNSL的预防及预后的判断有指导意义。 展开更多
关键词 基因重排 CSF 骨髓 患者 初诊 CNSL 检出 标本 分布频率 nested-pcr
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极端干旱区胡杨根围丛枝菌根真菌的分离与鉴定 被引量:9
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作者 杨玉海 陈亚宁 +2 位作者 蔡柏岩 接伟光 吕东英 《干旱区地理》 CSCD 北大核心 2012年第2期260-266,共7页
以极端干旱区塔里木河下游处于干旱胁迫下的天然胡杨为研究对象,采用传统形态鉴定法和分子生物技术,研究了胡杨根围土壤中丛枝菌根真菌。结果表明:处于干旱胁迫下的胡杨根围土壤中丛枝菌根真菌孢子密度较低,且孢子种类单一,经形态鉴定... 以极端干旱区塔里木河下游处于干旱胁迫下的天然胡杨为研究对象,采用传统形态鉴定法和分子生物技术,研究了胡杨根围土壤中丛枝菌根真菌。结果表明:处于干旱胁迫下的胡杨根围土壤中丛枝菌根真菌孢子密度较低,且孢子种类单一,经形态鉴定和分子生物学鉴定,孢子为球囊霉属的摩西球囊霉Glomus mosseae(T.H.Nicolson&Gerd.),孢子在土壤中单生、根内生或孢子果内形成;圆形,近圆形,直径150~220μm,浅黄色至黄褐色;孢壁3层,L1和L2无色透明,L3浅黄至黄褐色。连孢菌丝单根,连点漏斗状。胡杨根系内存在丛枝菌根真菌的泡囊结构,分子检测表明摩西球囊霉Glomus mosseae与胡杨根系形成共生关系,但是胡杨根系的菌根侵染率及根系的菌根侵染强度均不高。 展开更多
关键词 丛枝菌根(AM) nested-pcr 多样性 胡杨
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