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拟南芥Nodulin MtN21家族At1 g0938基因功能的初步研究 被引量:7
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作者 孙书琦 张锐 郭三堆 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期429-434,共6页
拟南芥Nodulin MtN21蛋白家族含有1-2个DUF6结构域,具有内在膜蛋白的特性。推测该家族基因在小分子跨膜运输、信号转导和抗逆性等方面发挥作用。At1 g09380是拟南芥Nodulin MtN21基因家族成员。本研究通过PCR筛选获得At1 g09380对应的T-... 拟南芥Nodulin MtN21蛋白家族含有1-2个DUF6结构域,具有内在膜蛋白的特性。推测该家族基因在小分子跨膜运输、信号转导和抗逆性等方面发挥作用。At1 g09380是拟南芥Nodulin MtN21基因家族成员。本研究通过PCR筛选获得At1 g09380对应的T-DNA插入纯合子,并经RT-PCR鉴定该突变体为无效突变体。对突变体萌发和萌发后阶段进行盐胁迫和干旱胁迫分析,结果表明,At1 g09380突变体萌发后对NaCl和干旱胁迫敏感,证明该基因参与拟南芥的盐和干旱胁迫响应过程。同时还发现在长日照条件下突变体植株比野生型植株早开花7d左右。本文研究结果为进一步分析该基因的生物学功能打下基础。 展开更多
关键词 AT1 g09380 nodulin MtN21 NACL胁迫 干旱胁迫
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棉花nodulin—like基因及其启动子的结构特征和遗传表达
2
作者 任茂智 陈全家 +1 位作者 张锐 郭三堆 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2004年第12期1424-1433,共10页
用同尾酶反向PCR技术(Ⅱ-PCR)和快速分离目的基因cDNA 5’未知序列方法(RICUP)首次从陆地棉品种Y18(Gossypium arboreum L.Y18)中分离到nodulin—like基因的全长cDNA、DNA和启动子序列。结果表明,该基冈全长为2353bp,具有5个内含子和... 用同尾酶反向PCR技术(Ⅱ-PCR)和快速分离目的基因cDNA 5’未知序列方法(RICUP)首次从陆地棉品种Y18(Gossypium arboreum L.Y18)中分离到nodulin—like基因的全长cDNA、DNA和启动子序列。结果表明,该基冈全长为2353bp,具有5个内含子和6个外显子。cDNA全长1480bp,含有一个1125bp的ORF结构,编码375个氨基酸,在GenBanknr数据库巾没有与之同源的基因序列,在EST数据库中仅有一条733bp的亚洲棉纤维EST序列(GenBank登录号:BF271235)与之有92%的同源性。Nodulin—like基因的启动子全长1969bp,启动子区域具有Initiator、TATAbox、CAAT-like box和富含AT序列等启动子特征序列。Southern blot结果表明:该基冈在棉花基因组中有一个拷贝。Northern blot结果表明:该基因在棉花的蕾、花、纤维和铃壳等生殖器官中呈优势表达。本研究有望为改良棉花生殖器官的农艺性状提供靶基因,并为解决目前转基因抗虫棉“前期抗虫性强、后期抗虫性弱”这一生产实际问题提供有效的表达调控元件。 展开更多
关键词 nodulin—like基因 启动子 结构特征 遗传表达 棉花
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Specific Expression of a Novel Nodulin GmN479 Gene in the Infected Cells of Soybean (Glycine max) Nodules 被引量:1
3
作者 CHENG Xian-guo WANG Li +3 位作者 WANG He YU Guo-hong BAI You-lu LIU Meng-meng 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2011年第10期1512-1524,共13页
A novel nodulin gene, GmN479 genomic clone composing of 3 630 nucleotides was isolated from mature soybean nodules using GmN479 cDNA as a probe by subtractive hybridization procedure. GmN479 encodes 170 amino acids wi... A novel nodulin gene, GmN479 genomic clone composing of 3 630 nucleotides was isolated from mature soybean nodules using GmN479 cDNA as a probe by subtractive hybridization procedure. GmN479 encodes 170 amino acids with 2.09 kb nucleotides promoter region, and contains two important upstream promoter elements, one is a conserved cis-acting sequence motif 5′-AAAGAT-3′ controlling nodulin gene expression, and the other is typical CAAT boxes. GmN479 gene has a single zinc-finger C2H2 domain YSCAFCQRGFSNAQALLGGHMNIH and a conserved motif, QALGGHMN in the zinc-finger with a short leucine repeat in the LDLELRLGL motif closed to C-terminal. These two conserved motifs share respectively higher identity with those in the floral regulator SUPERMAN gene, indicating that GmN479 may function as a transcriptional regulator, and is a likely candidate for playing a role in nodule-morphogenesis. Blotting data showed that GmN479 is a single copy presenting in the genome of soybean nodule, and its expression profile is similar to that of Lb-a, but it is different from that of ENOD2. GUS staining showed that GmN479 promoter just functions in the infected cells of nodules, indicating that the GmN479 is one of the truly symbiotically induced host genes, and belongs to a late nodulin gene. The expression pattern of GmN479 gene seems to imply that it may be closely related to the development of the nodule. In a sense, it may be a useful marker for identifying the development of the infected cell system in the nodules of soybean. 展开更多
关键词 nodulin GmN479 promoter soybean nodule transgenic plants
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生物信息方法分析大豆Nodulin家族蛋白
4
作者 王巍杰 柴文静 +1 位作者 杨文娇 侯瑛倩 《大豆科学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第1期39-44,共6页
为研究大豆Nodulin家族蛋白特性,在数据库Uniprot KB中下载大豆Nodulin蛋白序列,利用NCBI的BLAST程序进行同源序列比对筛选和Pfam数据库综合分析,确定14个大豆Nodulin家族蛋白,通过生物信息学方法对14个家族蛋白的基本理化性质、跨膜区... 为研究大豆Nodulin家族蛋白特性,在数据库Uniprot KB中下载大豆Nodulin蛋白序列,利用NCBI的BLAST程序进行同源序列比对筛选和Pfam数据库综合分析,确定14个大豆Nodulin家族蛋白,通过生物信息学方法对14个家族蛋白的基本理化性质、跨膜区域、模体、系统发育和蛋白结构等进行分析。结果显示:14条蛋白序列氨基酸数为72~116、理论等电点为9.94~11.59、分子质量为7 408.70~12 465.55、脂肪系数为85.94~114.12,除K7KNK4没有跨膜区外,其余13条Nodulin蛋白均有1~2跨膜区。二级结构主要由α螺旋和无规则卷曲组成,13个模体中模体1、模体2、模体3和模体4保守性强,系统发育进化树由6个分枝组成,分枝Ⅵ的A0A0B2P3C8、I1MWA0三维结构预测结果也相似。 展开更多
关键词 大豆 nodulin蛋白 模体 系统进化分析
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Nodulin 26-like intrinsic protein Cs NIP2;2 is a silicon influx transporter in Cucumis sativus L.
5
作者 DUAN Yao-ke SU Yan +2 位作者 HAN Rong SUN Hao GONG Hai-jun 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2022年第3期685-696,共12页
Nodulin 26-like intrinsic proteins(NIPs) are a family of channel-forming transmembrane proteins that function in the transport of water and other small molecules.Some NIPs can mediate silicon transport across plasma m... Nodulin 26-like intrinsic proteins(NIPs) are a family of channel-forming transmembrane proteins that function in the transport of water and other small molecules.Some NIPs can mediate silicon transport across plasma membranes and lead to silicon accumulation in plants,which is beneficial for the growth and development of plants.Cucumber is one of the most widely consumed vegetables;however,the functions of NIPs in this crop are still largely unknown.Here,we report the functional characteristics of Cs NIP2;2.It was found that Cs NIP2;2 is a tandem repeat of Cs NIP2;1,which had been demonstrated to be a silicon influx transporter gene.Cs NIP2;2 has a selectivity filter composed of cysteine,serine,glycine and arginine(CSGR),which is different from all previously characterized silicon influx transporters in higher plants at the second helix position.Xenopus laevis oocytes injected with Cs NIP2;2 c RNA demonstrated a higher uptake of silicon than the control,and the uptake remained unchanged under low temperature.Cs NIP2;2 was found to be expressed in the root,stem,lamina and petiole,and exogenous silicon treatment decreased its expression in the stem but not in other tissues.Transient expression of Cs NIP2;2-e GFP fusion sequence in onion epidermal cells showed that Cs NIP2;2 was localized to the cell nucleus,plasma membrane and an unknown structure inside the cell.The results suggest that Cs NIP2;2 is a silicon influx transporter in cucumber,and its subcellular localization and the selectivity filter are different from those of the previously characterized silicon influx transporters in other plants.These findings may be helpful for understanding the functions of NIPs in cucumber plants. 展开更多
关键词 cucumber(Cucumis sativus L.) nodulin 26-like intrinsic membrane protein(NIP) silicon influx transporter aromatic/arginine selectivity filter
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植物结瘤素基因响应逆境胁迫的研究进展
6
作者 曹丹芸 夏婧 +2 位作者 徐雅婷 党聪 薛大伟 《杭州师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第2期157-163,共7页
结瘤素基因最早在豆科植物与根瘤菌互作中发现,负责豆科植物根瘤器官的发生和固氮功能.随后发现结瘤素基因在非豆科植物的抗旱、耐盐、病原菌互作等过程中发挥了重要作用,表明该基因在植物应对生物和非生物胁迫时也具有重要功能.文章就... 结瘤素基因最早在豆科植物与根瘤菌互作中发现,负责豆科植物根瘤器官的发生和固氮功能.随后发现结瘤素基因在非豆科植物的抗旱、耐盐、病原菌互作等过程中发挥了重要作用,表明该基因在植物应对生物和非生物胁迫时也具有重要功能.文章就结瘤素基因的分类、在植物应对生物和非生物胁迫时的功能等方面进行综述,以期为结瘤素基因的功能研究提供理论基础,同时为植物抗生物和非生物胁迫基因的挖掘提供新思路. 展开更多
关键词 结瘤素基因 生物胁迫 非生物胁迫
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Functional Analysis of Nodulin-like Promoter in Transgenic Cotton Plants 被引量:3
7
作者 Mao-Zhi REN Quan-Jia CHEN +2 位作者 Li LI Rui ZHANG San-Dui GUO 《Journal of Integrative Plant Biology》 SCIE CAS CSCD 2005年第10期1254-1259,共6页
For the first time, a nodulin-like gene promoter was isolated from Gossypium hirsutum L. Guo Y 18 by means of inverse PCR. Three plant expression vectors were constructed for functional identification of the promoter.... For the first time, a nodulin-like gene promoter was isolated from Gossypium hirsutum L. Guo Y 18 by means of inverse PCR. Three plant expression vectors were constructed for functional identification of the promoter. These vectors were different only in promoter regions; three truncations of the nodulinlike promoter took the place of the CaMV35S promoter in the pBI 121 plant expression vector. Then, the three vectors were introduced into cotton plants via the pollen tube pathway. The expression patterns of the gus gene driven by nodulin-like promoter truncations were investigated in the offspring of transgenic cotton plants. Histochemical GUS staining and fluorescence quantitative analysis were performed to achieve this goal. The results showed that the nodulin-like promoter was a strong, highly reproductive organspecific promoter, which demonstrated a much higher driver activity than the CaMV35S promoter did in cotton reproductive organs, but relatively lower activity in vegetation. Identification of the speciality and strength-determining regions of the nodulin-like promoter was also undertaken. 展开更多
关键词 cotton plant functional identification nodulin-like promoter predominant expression reproductive organ.
原文传递
三叶青早期结瘤类基因ThENODL1及ThENODL2的克隆及表达分析
8
作者 赵刚 武思梦 +3 位作者 张悦 黄舒琪 蔡红 闻静 《生命科学研究》 CAS 2023年第1期23-30,41,共9页
近年来的研究显示,早期结瘤类(early nodulin-like, ENODL)基因在植物地下储藏器官的形成与发育中起到关键作用。课题组前期研究发现,一些早期结瘤类基因在三叶青块根初始发育期及膨大期高丰度表达。本研究克隆了两个三叶青(Tetrastigma... 近年来的研究显示,早期结瘤类(early nodulin-like, ENODL)基因在植物地下储藏器官的形成与发育中起到关键作用。课题组前期研究发现,一些早期结瘤类基因在三叶青块根初始发育期及膨大期高丰度表达。本研究克隆了两个三叶青(Tetrastigma hemsleyanum Diels et Gilg)的早期结瘤类基因ThENODL1与ThENODL2的cDNA,初步的生物信息学分析表明, ThENODL1的开放阅读框长度为528 bp,编码175个氨基酸, ThENODL2的开放阅码框长度为651 bp,编码217个氨基酸, ThENODL1与ThENODL2都具有水稻早期结瘤类基因(OsENODL1_like)保守域,并具备早期结瘤类基因的基本分子结构特征。相对荧光定量分析显示, ThENODL1的cDNA表达量在块根中显著高于其他器官且在块根的初始发育阶段及膨大期显著提高, ThENODL2的cDNA在块根中的表达量最低且在块根发育的不同时期无显著差异。大肠杆菌原核表达体系的验证结果显示,所克隆的ThENODL1与ThENODL2的cDNA均可表达出与预期大小相符的蛋白质。本研究为进一步明确ThENODL基因在块根发育中的功能提供了基本分子生物学参考依据。 展开更多
关键词 三叶青 早期结瘤类基因 块根发育 原核表达
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水稻中结瘤素基因的同源基因研究 被引量:5
9
作者 王彦章 俞冠翘 朱家壁 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期202-208,共7页
以核酸数据库中检索到的75个豆科植物结瘤素基因作为探针,应用生物信息学方法对水稻基因组进行扫描分析。在水稻基因组中发现有31个与结瘤素基因具有同源性的基因,与相应的结瘤素基因比对,它们的氨基酸序列一致性至少在35%以上。这表明... 以核酸数据库中检索到的75个豆科植物结瘤素基因作为探针,应用生物信息学方法对水稻基因组进行扫描分析。在水稻基因组中发现有31个与结瘤素基因具有同源性的基因,与相应的结瘤素基因比对,它们的氨基酸序列一致性至少在35%以上。这表明在水稻基因组中广泛存在豆科植物结瘤素基因的同源基因。豆科植物结瘤素基因enod40、蔗糖合成酶基因和Rab基因与水稻中对应的同源基因比较分析表明,它们属于直向同源基因,可能来自于共同的祖先基因,在长期进化过程中豆科植物结瘤素基因受根瘤器官形成的需求而发生变异。然而,另有44个豆科结瘤素基因在水稻基因组中未显示有同源性基因的存在,这些结瘤素基因在豆科植物与根瘤菌建立共生过程中起着重要的作用。推测可能是由于水稻中缺少了这些豆科结瘤素基因,导致水稻不能结瘤固氮。 展开更多
关键词 结瘤 基因研究 水稻基因组 豆科植物 同源基因 enod40 核酸数据库 生物信息学 氨基酸序列 Rab基因 合成酶基因 扫描分析 器官形成 进化过程 同源性 一致性 分析表 性基因 根瘤菌 探针 祖先 共生 固氮
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豆科植物共生结瘤的分子基础和调控研究进展 被引量:29
10
作者 丑敏霞 魏新元 《植物生态学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第7期876-888,共13页
豆科植物与根瘤菌共生互作的结果导致了一个新的植物器官——根瘤的形成,根瘤菌生活在根瘤中,它们具有将氮气转化为能被植物同化的氨的能力。该文阐述了根瘤的形成过程和类型,并主要以模式豆科植物蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)和日本... 豆科植物与根瘤菌共生互作的结果导致了一个新的植物器官——根瘤的形成,根瘤菌生活在根瘤中,它们具有将氮气转化为能被植物同化的氨的能力。该文阐述了根瘤的形成过程和类型,并主要以模式豆科植物蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)和日本百脉根(Lotus japonicus)为例,对近年来共生结瘤过程中宿主植物对根瘤菌结瘤因子的识别和信号传递、侵入线形成和固氮的分子基础,以及宿主植物对根瘤形成的自主调控机制、环境中氮素营养对结瘤的影响研究进行了综述,指出当前豆科植物与根瘤菌共生互作研究存在的问题,并对今后的研究方向作了分析与展望。 展开更多
关键词 豆科植物 根瘤形成 结瘤素基因 信号传递 共生固氮
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豆血红蛋白的研究进展 被引量:15
11
作者 赵亚兰 尉亚辉 《西北植物学报》 CAS CSCD 2000年第4期684-689,共6页
简要介绍了豆血红蛋白的制备分析方法和基本特征及生物学功能 ,概括了其生物合成的机理 ,并初步归纳了近年来有关豆血红蛋白研究方面的主要趋势。
关键词 豆血红蛋白 脱辅基蛋白 生物合成 生物固氮
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豌豆早期结瘤素基因ENOD12A的克隆及与PsLectin基因双元表达载体的构建 被引量:4
12
作者 王洪伟 张兴国 +3 位作者 黎林 孙士群 秦淑丽 苏承刚 《西南师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期202-205,共4页
采用PrimStar HS DNA聚合酶从豌豆基因组DNA中扩增出了豌豆早期结瘤素基因PsENOD12A.序列分析结果表明,所克隆的基因与GenBank公布的序列仅相差1个碱基,但推导的氨基酸序列没有改变.将PsENOD12A基因和豌豆凝集素基因psl重组进了双元表... 采用PrimStar HS DNA聚合酶从豌豆基因组DNA中扩增出了豌豆早期结瘤素基因PsENOD12A.序列分析结果表明,所克隆的基因与GenBank公布的序列仅相差1个碱基,但推导的氨基酸序列没有改变.将PsENOD12A基因和豌豆凝集素基因psl重组进了双元表达载体. 展开更多
关键词 豌豆 早期结瘤素基因 凝集素基因 双元表达载体
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豌豆早期结瘤素基因PsSYM10的克隆及其表达载体的构建 被引量:3
13
作者 谢玉会 田婷婷 +2 位作者 黄国栋 苏承刚 张兴国 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期69-72,共4页
采用Pri mStar HS DNA聚合酶从豌豆基因组DNA中扩增出了豌豆早期结瘤素基因PsSYM10.序列分析结果表明,所克隆的基因与GenBank公布的同源基因在碱基和氨基酸序列上的相似性分别为98.6%和99.7%.将PsSYM10基因与结瘤相关基因PsENOD12、凝... 采用Pri mStar HS DNA聚合酶从豌豆基因组DNA中扩增出了豌豆早期结瘤素基因PsSYM10.序列分析结果表明,所克隆的基因与GenBank公布的同源基因在碱基和氨基酸序列上的相似性分别为98.6%和99.7%.将PsSYM10基因与结瘤相关基因PsENOD12、凝集素基因PsLectin串联组合,构建成了双元表达载体. 展开更多
关键词 豌豆 早期结瘤素基因PsSYM10 PsENOD12A 凝集素基因PsLectin双元表达栽体
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拟南芥类结瘤素基因At1g01070的生物信息学分析 被引量:2
14
作者 王丽 袁园园 +3 位作者 赵盼盼 常卫东 王俐锋 王林嵩 《河南师范大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2017年第3期58-64,共7页
类结瘤素基因在非结瘤植物生长发育中承担着重要的功能,但仅少数基因的功能被鉴定.本研究对拟南芥类结瘤素MtN21(Medicago truncatula NODULIN 21)家族成员At1g01070进行了生物信息学分析及亚细胞定位验证.结果表明,At1g01070有两种可... 类结瘤素基因在非结瘤植物生长发育中承担着重要的功能,但仅少数基因的功能被鉴定.本研究对拟南芥类结瘤素MtN21(Medicago truncatula NODULIN 21)家族成员At1g01070进行了生物信息学分析及亚细胞定位验证.结果表明,At1g01070有两种可变剪切体,编码两种蛋白At1g01070.1和At1g01070.2,前者比后者在N端多47个氨基酸,它们的分子量分别为40KD和35KD,等电点分别为9.2和8.9;均含有2个MtN21蛋白的特征结构域EamA(药物/代谢物转运结构域),At1g01070.1比At1g01070.2多一个PLN00411结构域,且其靠近N端的EamA结构域较后者长;三级结构均由7个α-螺旋和一些不规则卷曲组成,分别含有10个和8个疏水跨膜区,均含13个磷酸化修饰位点,亚细胞定位预测主要定位在质膜;进化上,与琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)亲缘关系最近;亚细胞定位结果显示At1g01070.1定位在质膜,与预测结果一致.推测At1g01070在植物体内可能参与物质运输. 展开更多
关键词 类结瘤素基因 At1g01070 MtN21 生物信息学分析 亚细胞定位
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新型植物生长调节物质——激素性多肽的研究进展 被引量:17
15
作者 沈世华 朱至清 《植物学通报》 CSCD 1999年第6期648-652,641,共6页
多肽是生物体内一种非常重要的物质 ,它以信号的形式调控着生物的生活周期。在动物、细菌、真菌上作为激素、信息素和生长因子已进行了广泛的研究。然而 ,在植物上 1 991年才首次报道名叫系统素的伤害信号物质的内生多肽。最近 ,已从植... 多肽是生物体内一种非常重要的物质 ,它以信号的形式调控着生物的生活周期。在动物、细菌、真菌上作为激素、信息素和生长因子已进行了广泛的研究。然而 ,在植物上 1 991年才首次报道名叫系统素的伤害信号物质的内生多肽。最近 ,已从植物中分离出多种肽性植物生长调节因子。本文简要介绍系统素、早期结瘤素、植物硫素、豆胰岛素等四种激素性多肽的发现与分离 ,以及其结构与生理作用。 展开更多
关键词 植物激素性多肽 系统素 生长调节物质
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与棉纤维发育相关基因GhSAMS、GhNLP的克隆、鉴定与定位 被引量:1
16
作者 张燕洁 朱一超 +1 位作者 郭旺珍 张天真 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期2581-2588,共8页
【目的】克隆陆地棉纤维伸长发育相关的基因,并做初步功能验证。【方法】以陆地棉李氏超短纤维突变体Li1li1自交后代野生型li1li1和超短纤维突变体Li1li1开花后4d的胚珠纤维复合体为探针,通过基因芯片筛选优质材料7235棉纤维伸长、次生... 【目的】克隆陆地棉纤维伸长发育相关的基因,并做初步功能验证。【方法】以陆地棉李氏超短纤维突变体Li1li1自交后代野生型li1li1和超短纤维突变体Li1li1开花后4d的胚珠纤维复合体为探针,通过基因芯片筛选优质材料7235棉纤维伸长、次生壁加厚不同发育时期混合cDNA文库,分离出两个在两种材料中差异表达的cDNA序列。【结果】测序结果表明,两个cDNA均为完整的基因序列,分别命名为GhSAMS(GenBank登录号:EF643509),GhNLP(GenBank登录号:EF643508)。RT-PCR分析表明:开花后4d,GhSAMS、GhNLP在陆地棉李氏野生型li1li1纤维中的表达量低于无纤维突变Li1li1。Southern杂交结果表明两个基因在陆地棉基因组中都存在少数拷贝。利用本实验室陆地棉遗传标准系TM-1和海岛棉海7124培育的140个BC1作图群体,将GhSAMS和GhNLP分别定位在染色体14(D2)和19(D5)上。【结论】克隆了两个棉纤维伸长发育相关基因GhSAMS和GhNLP,推测其高表达阻止纤维伸长生长,为进一步分析功能和用于分子育种打下基础。 展开更多
关键词 陆地棉 基因芯片 S-腺苷甲硫氨酸合成酶 结瘤素
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生物固氮的研究现状初探 被引量:8
17
作者 黎林 《韶关学院学报》 2009年第3期88-91,共4页
初步探索了生物固氮目前的研究进展,并着重研究了豆科植物根毛与根瘤菌接触到最后形成成熟的可以固氮的根瘤组织的途径,为将来把非豆科植物,特别是禾谷类农作物转变为固氮植物的可行性提供参考.
关键词 生物固氮 根瘤菌 结瘤基因
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枳早期结瘤素样基因PtBCP1的克隆和分析
18
作者 姚利晓 马园园 +5 位作者 李凤龙 许兰珍 雷天刚 彭爱红 何永睿 陈善春 《安徽农业科学》 CAS 2012年第33期16102-16106,共5页
[目的]克隆枳早期结瘤素样基因PtBCP1并对其序列进行分析。[方法]以枳消减文库中的C28 EST为种子序列进行电子克隆,据此设计引物进行PCR,以获得枳早期结瘤素样基因PtBCP1的全长cDNA和DNA序列,并对获得的序列进行生物信息学分析。[结果]P... [目的]克隆枳早期结瘤素样基因PtBCP1并对其序列进行分析。[方法]以枳消减文库中的C28 EST为种子序列进行电子克隆,据此设计引物进行PCR,以获得枳早期结瘤素样基因PtBCP1的全长cDNA和DNA序列,并对获得的序列进行生物信息学分析。[结果]PtBCP1基因由2个外显子和1个内含子组成,在枳幼苗根中的表达量是叶中的140倍,该基因编码的蛋白含131个氨基酸残基,预测分子量为14.0 kD,理论等电点为8.75,具有N端信号肽和PCLD(PFMD:PF02298)功能域,但无完整的铜离子结合位点,属于早期结瘤素样蛋白。[结论]为进一步研究PtBCP1基因的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 早期结瘤素样基因 克隆
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蜡梅结瘤素基因CpNOD的克隆与表达分析 被引量:5
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作者 王喆 汤玲 +1 位作者 眭顺照 李明扬 《西南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期20-26,共7页
根据已构建的蜡梅cDNA文库中得到的片段,通过cDNA末端克隆得到了一个早期结瘤素基因,命名为Cp-NOD(GenBank登录号:JQ622290),该基因cDNA序列全长611个碱基,包含一个71bp 5-UTR区,一个333bp的开放阅读框ORF和一个207bp的3-UTR区,该... 根据已构建的蜡梅cDNA文库中得到的片段,通过cDNA末端克隆得到了一个早期结瘤素基因,命名为Cp-NOD(GenBank登录号:JQ622290),该基因cDNA序列全长611个碱基,包含一个71bp 5-UTR区,一个333bp的开放阅读框ORF和一个207bp的3-UTR区,该基因由111个氨基酸组成,其中丙氨酸组分为多,占18.2%,序列比对分析表明,CpNOD具有典型的蛋白质家族ENOD93特征,属于ENOD93家族早期结瘤素蛋白.实时荧光定量PCR表达检测显示,CpNOD在蜡梅根、茎、花器中都有表达,其中以花中瓣表达最高;在花的不同阶段表达结果是从萌动期、花蕾期、盛开期到衰败期,表达量呈正相关,以衰败期表达量最高.转录表达分析结果推测,CpNOD在蜡梅的开花生理和氮元素响应方面起着积极作用. 展开更多
关键词 蜡梅 结瘤素早期蛋白基因 克隆 基因表达
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橡胶树NIPs通道蛋白的生物功能分析 被引量:1
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作者 史翔宇 龙翔宇 +3 位作者 方永军 阳江华 肖小虎 秦云霞 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第8期2126-2133,共8页
根瘤素26-like内在蛋白(nodulin 26-like intrinsic proteins,NIPs)是水通道蛋白(aquaporin protein,AQP)中一个植物特有的亚类,主要定位在质膜或内质网膜上,负责转运不带电荷的类金属溶质如硼、甘油、尿素、硅、砷、H2O2、NH3等,在植... 根瘤素26-like内在蛋白(nodulin 26-like intrinsic proteins,NIPs)是水通道蛋白(aquaporin protein,AQP)中一个植物特有的亚类,主要定位在质膜或内质网膜上,负责转运不带电荷的类金属溶质如硼、甘油、尿素、硅、砷、H2O2、NH3等,在植物营养获取或胁迫应答过程中发挥着重要作用。本研究以拟南芥NIPs序列为参照,利用多种生物信息学软件,对橡胶树7个HbNIPs的基因结构、蛋白理化性质、聚类分析、组织表达及割胶处理的应答进行综合分析。根据分析结果可以初步推断:7个HbNIPs应是有功能的转运蛋白,它们不但具有AQP典型的跨膜结构域(4~6个),保守的NPA基序和关键的ar/R筛选氨基酸,而且从聚类的结果可以推断它们具有转运硼酸、尿素和乳酸的功能。另外,从其启动子调控元件、表达分析和翻译后修饰分析可知,它们的活性及表达具有受发育阶段、多种激素和磷酸化修饰的严谨调控。该初步结果有助于进一步研究橡胶树NIP家族基因的功能及其在橡胶树创新育种中的应用。 展开更多
关键词 橡胶树 根瘤素26-like内在蛋白 水通道蛋白 类金属元素
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