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山萘酚调控VPS9D1-AS1/miR-377-3p对人宫颈癌细胞系SiHa增殖和凋亡的影响
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作者 张禹鑫 朱紫薇 +1 位作者 张燕 胡玉红 《基础医学与临床》 2023年第7期1069-1078,共10页
目的探讨山萘酚调控长链非编码RNAVPS9D1反义RNA 1(VPS9D1-AS1)/miR-377-3p对人宫颈癌细胞系增殖和凋亡的影响。方法将人宫颈癌细胞系SiHa分为对照组、山萘酚低、中和高剂量组(5、10和20μmol/L山萘酚)、si-NC组(转染si-NC)、si-VPS9D1-... 目的探讨山萘酚调控长链非编码RNAVPS9D1反义RNA 1(VPS9D1-AS1)/miR-377-3p对人宫颈癌细胞系增殖和凋亡的影响。方法将人宫颈癌细胞系SiHa分为对照组、山萘酚低、中和高剂量组(5、10和20μmol/L山萘酚)、si-NC组(转染si-NC)、si-VPS9D1-AS1组(转染si-VPS9D1-AS1)、山萘酚+pcDNA-VPS9D1-AS1组(20 mg/L山萘酚+转染pcDNA-VPS9D1-AS1)、山萘酚+anti-miR-377-3p组(20 mg/L山萘酚+转染anti-miR-377-3p)。RT-qPCR、MTT法和集落形成实验分别测定VPS9D1-AS1、miR-377-3p表达、细胞活性和集落形成;流式细胞测量术、划痕试验、Transwell小室法和Western blot分别测定细胞凋亡、迁移、侵袭和Bax及Bcl-2表达;荧光素酶活性检测分析VPS9D1-AS1对miR-377-3p的靶向作用。结果与对照相比,低、中和高剂量山萘酚降低SiHa细胞中VPS9D1-AS1表达水平,集落形成数、细胞活性、Bcl-2蛋白表达水平、迁移距离和侵袭细胞数,且提高了miR-377-3p表达水平、凋亡率和Bax蛋白表达水平;作用均呈浓度依赖性(P<0.05)。SiHa细胞中沉默VPS9D1-AS1后,miR-377-3p表达水平、凋亡率和Bax蛋白表达水平高于si-NC组,且集落形成数、Bcl-2蛋白表达水平、细胞活性、迁移距离和侵袭细胞数低于si-NC组(P<0.05)。VPS9D1-AS1能靶向miR-377-3p。山萘酚处理的SiHa增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响能被过表达VPS9D1-AS1或抑制miR-377-3p所逆转。结论山萘酚通过靶向miR-377-3p下调VPS9D1-AS1,减轻宫颈癌细胞系增殖、迁移和侵袭,以及加速凋亡。 展开更多
关键词 宫颈癌 山萘酚 细胞生物行为 vpS9D1-AS1 miR-377-3p
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VPS13A在3T3-L1脂肪细胞分化过程中的表达及调控研究
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作者 刘瑾 黄昀 +5 位作者 李超普 张桐 潘锦堃 季学涛 张许 李仲 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2023年第8期1041-1046,共6页
目的:明确囊泡分选蛋白13A(vacuolar protein sorting 13 homolog A,VPS13A)在小鼠胚胎成纤维细胞(mouse embry-onic fibroblast cells,3T3-L1)分化过程中的表达水平;探索VPS13A对3T3-L1细胞的影响。方法:利用Western blot及Q-PCR法检测... 目的:明确囊泡分选蛋白13A(vacuolar protein sorting 13 homolog A,VPS13A)在小鼠胚胎成纤维细胞(mouse embry-onic fibroblast cells,3T3-L1)分化过程中的表达水平;探索VPS13A对3T3-L1细胞的影响。方法:利用Western blot及Q-PCR法检测3T3-L1细胞在分化过程中VPS13A的表达,利用CRISPR/Cas9系统构建VPS13A稳定敲降细胞系,Western blot和油红染色检测VPS13A敲降后对3T3-L1细胞分化的影响。结果:VPS13A的表达在3T3-L1分化过程的早期降低,在分化的后期升高。敲降VPS13A后,3T3-L1细胞中脂滴增多,参与调控脂肪细胞分化基因的表达水平升高。结论:在3T3-L1细胞中VPS13A的表达水平在分化过程中被调控,敲降VPS13A可以促进3T3-L1细胞的分化成熟。 展开更多
关键词 vpS13A 3T3-L1细胞 脂滴 脂肪细胞分化
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3株鸡传染性贫血病毒的分离鉴定、VP1基因遗传进化分析及致病性评价
3
作者 张亚 胡小飞 +6 位作者 段佳蕾 田辉 孙哲 霍环艳 薛景景 张盼涛 田克恭 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2023年第9期42-48,共7页
为了解国内鸡场鸡传染性贫血(CIA)的流行状况和鸡传染性贫血病毒(CIAV)的遗传变异规律,以期对CIA的传播流行和预警防控提供技术支持。本试验对2020年在3个省份疑似发生CIA的3个规模鸡场采集10份组织脏器样品,应用鸡胚进行病毒的分离培养... 为了解国内鸡场鸡传染性贫血(CIA)的流行状况和鸡传染性贫血病毒(CIAV)的遗传变异规律,以期对CIA的传播流行和预警防控提供技术支持。本试验对2020年在3个省份疑似发生CIA的3个规模鸡场采集10份组织脏器样品,应用鸡胚进行病毒的分离培养,并对培养物进行CIAV PCR检测,进而对CIAV阳性样本进行VP 1基因扩增和测序,应用Lasergene和MEGA 6.0软件,对获得的所有分离毒株结构蛋白VP 1基因序列与GenBank中CIAV参考毒株进行比对,构建系统发育进化树,同时对分离的CIAV毒株进行动物回归试验,评价其对鸡的致病性。结果显示,10份样品中3份为CIAV阳性,共分离到3株CIAV,分别命名为202006-NX-4-2、202006-SD-2-1和202006-JX-016。VP 1基因相似性分析显示,3株CIAV分离株核苷酸相似性介于97.7%~99.6%,且均与国内分离株具有较高同源性;氨基酸序列分析显示,3株CIAV分离株毒力相关位点均与国内强毒株GD-101株一致。遗传进化分析结果显示,3株分离株属于同一进化分支(Ⅱ分支),202006-SD-2-1株和202006-JX-016株与JL15120株进化关系最近,202006-NX-4-2株则与以国内强毒株GD-101株为代表的其他Ⅱ分支参考株进化关系最近。动物回归试验结果显示,3株CIAV均能够引起1日龄鸡发生严重的淋巴器官萎缩、骨髓黄化,为典型的高致病性病毒株特征。本试验结果为当前国内CIAV的流行、毒株的遗传变异分析及相关疫苗研发提供了参考依据。 展开更多
关键词 鸡传染性贫血病毒 分离培养 vp 1基因 进化分析 致病性
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两种二倍体野生花生ABI3/VP1的全基因组鉴定与分析
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作者 王江丽 张慧哲 王希胤 《华北理工大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第4期76-84,共9页
ABI3/VP1在植物生长发育过程中起重要调节作用。该研究以模式生物拟南芥为参考,在2个二倍体野生花生的全基因组序列中鉴定了ABI3/VP1基因家族成员,并用一系列生物信息学方法对其进行了系统发育、理化性质、二级结构预测、染色体定位及... ABI3/VP1在植物生长发育过程中起重要调节作用。该研究以模式生物拟南芥为参考,在2个二倍体野生花生的全基因组序列中鉴定了ABI3/VP1基因家族成员,并用一系列生物信息学方法对其进行了系统发育、理化性质、二级结构预测、染色体定位及启动子顺式作用元件分析。研究成功从花生基因组中鉴定出17个ABI3/VP1基因,这些基因不均匀地分布在11条染色体上。与拟南芥相比,花生的ABI3/VP1基因数量较多,可能由于两者祖先物种分歧时的基因丢失或加倍。系统发育分析表明,花生古老支中的许多基因与拟南芥有较近的亲缘关系。观察两个不同的花生种在三个亚家族中的分布,发现Adu和Aip两种在古老支中的基因数量相同,但在中间支和现代支中,Aip的基因数量明显小于Adu。这可能是由于地理差异或种间相关基因的差异。值得注意的是,Aip的相关基因从中间支到现代支经历了数量变化,推测这与基因的丢失或古老基因的加倍与进化有关。花生ABI3/VP1基因被推测参与多个信号通路,调控花生的生长发育过程和对环境刺激的响应。研究结果为后续开展花生ABI3/VP1基因调控脱落酸信号转导相关的研究提供了科学依据,对花生生长发育与果实成熟具有重要意义。 展开更多
关键词 二倍体花生 ABI3/vp1转录因子 基因组鉴定 生物信息学分析
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Two novel mutations in the VPS33B gene in a Chinese patient with arthrogryposis,renal dysfunction and cholestasis syndrome 1:A case report 被引量:1
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作者 Hui Yang Shuang-Zhu Lin +4 位作者 Shi-Hui Guan Wan-Qi Wang Jia-Yi Li Gui-Dan Yang Su-Li Zhang 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2022年第30期11016-11022,共7页
BACKGROUND The VPS33B(OMIM:608552)gene is located on chromosome 15q26.1.We found a female infant with autosomal recessive arthrogryposis,renal dysfunction and cholestasis syndrome 1(ARCS1)caused by mutation in VPS33B.... BACKGROUND The VPS33B(OMIM:608552)gene is located on chromosome 15q26.1.We found a female infant with autosomal recessive arthrogryposis,renal dysfunction and cholestasis syndrome 1(ARCS1)caused by mutation in VPS33B.The child was diagnosed with ARCS1(OMIM:208085)after the whole exome sequencing revealed two heterozygous mutations(c.96+1G>C,c.242delT)in the VPS33B gene.CASE SUMMARY We report a Chinese female infant with neonatal cholestasis disorder,who was eventually diagnosed with ARCS1 by genetic analysis.Genetic testing revealed two new mutations(c.96+1G>C and c.242delT)in VPS33B,which is the causal gene.The patient was compound heterozygous,and her parents were both heterozygous.CONCLUSION This study extends the mutational spectrum of the VPS33B gene to provide a molecular basis for the etiological diagnosis of ARCS1 and for genetic counseling of the family. 展开更多
关键词 Arthrogryposis renal dysfunction and cholestasis syndrome 1 vpS33B gene Children Heterozygous mutation Case report
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穗发芽率和发芽指数及STS标记Vp1B3在小麦抗穗发芽基因型鉴定中的应用 被引量:20
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作者 杨燕 张春利 +4 位作者 陈新民 夏兰芹 王德森 何中虎 于卓 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期577-582,共6页
为了筛选抗穗发芽品种(系)并了解其抗性机制,应用整穗发芽法和发芽指数鉴定了33份小麦新品系的穗发芽抗性,以红粒品种京冬8号和京9428作为抗穗发芽对照,以白粒品种京411和中优9507作为感穗发芽对照,并结合共显性STS标记Vp1B3对其基因型... 为了筛选抗穗发芽品种(系)并了解其抗性机制,应用整穗发芽法和发芽指数鉴定了33份小麦新品系的穗发芽抗性,以红粒品种京冬8号和京9428作为抗穗发芽对照,以白粒品种京411和中优9507作为感穗发芽对照,并结合共显性STS标记Vp1B3对其基因型进行检测。结果表明,穗发芽率(SGR)低于抗性对照京冬8号和京9428平均值(12.7%)的品系有7份,其中2份为白粒,5份为红粒。只有一份红粒品系CA0489的发芽指数(GI)低于抗性对照平均值(13.2%)。应用STS标记Vp1B3共扩增出849 bp、569 bp和652 bp三种片段,分别属于抗穗发芽基因型Vp1Bb和Vp1Bc及感穗发芽基因型Vp1Ba,其频率分别为3%、18%和79%。红粒抗穗发芽品系CA0489属于Vp1Bb基因型和红色种皮休眠型,CA0481属于Vp1Bc抗穗发芽基因型,另外三份红粒抗穗发芽品系的抗性机理还需要进一步研究;白粒抗穗发芽品系CA0509和CA0459的抗性为非Vp1B3类型,其抗性可能与穗部性状和颖壳抑制物有关。 展开更多
关键词 普通小麦 穗发芽 穗发芽率(SGR) 发芽指数(GI) STS标记vp1B3
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鹅细小病毒VP1与VP3非重叠序列的克隆与原核表达 被引量:9
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作者 布日额 王君伟 +3 位作者 吴金花 李勐 马广鹏 Ulrich Neumann 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2003年第10期3-6,共4页
根据鹅细小病毒 GPV H1株基因组核苷酸序列设计了一对引物 ,对其结构蛋白 VP1与 VP3非重叠核苷酸序列进行 PCR扩增 ,并克隆到表达性载体 p GEX- 6 p- 1,经酶切鉴定筛选出阳性克隆 ,并转化到大肠杆菌 BL 2 1(ED3) plys S进行原核表达 ,并... 根据鹅细小病毒 GPV H1株基因组核苷酸序列设计了一对引物 ,对其结构蛋白 VP1与 VP3非重叠核苷酸序列进行 PCR扩增 ,并克隆到表达性载体 p GEX- 6 p- 1,经酶切鉴定筛选出阳性克隆 ,并转化到大肠杆菌 BL 2 1(ED3) plys S进行原核表达 ,并用 SDS- PAGE鉴定 ,结果表明融合蛋白在表达性细菌 BL2 1中重获得了高效表达。 展开更多
关键词 细小病毒 vp1 vp3 非重叠序列 克隆 原核表达 基因组 核苷酸 结构蛋白 大肠杆菌
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柯萨奇B3病毒VP1基因在大肠杆菌中的表达 被引量:7
8
作者 刘哲伟 冯燕玲 +3 位作者 张霆 韩玉龙 马官福 张建成 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第1期35-41,共7页
本文通过融合柯萨奇B3病毒(CVB3))VP1基因与人凝血酌基因,仗CVB3的VP1在大肠杆菌中得到稳定的表达。经蛋白扫描仪等测定,表达的融合蛋白占菌体可溶性蛋白的11%左右。表达的VP1产物勺抗CVB3VP1单克隆... 本文通过融合柯萨奇B3病毒(CVB3))VP1基因与人凝血酌基因,仗CVB3的VP1在大肠杆菌中得到稳定的表达。经蛋白扫描仪等测定,表达的融合蛋白占菌体可溶性蛋白的11%左右。表达的VP1产物勺抗CVB3VP1单克隆抗体和小鼠抗CVB3血清产生较强的免疫反应,与天然的CVB3蛋白抗原性相同。应用无关单抗和载体质粒对照均呈现阴性反应。应用表达的VP1作为抗原,我们对临床部分急性病毒性心肌炎患者血清进行了特异性IgM免疫印迹法检测,其结果与组织培养的CVB3制备的蛋白抗原对患者血清的特异性IgM反应基本一致。采用基因上程方法制备CVB3抗原产最高,易纯化,免疫原性没有改变。故可以试用表达的VP1抗原代替目的有实验室感染危险的病毒培养及抗原制备方法,快速、特异地诊断CVB3感染。 展开更多
关键词 柯萨奇B3病毒 vp1基因 基因表达
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I型鸭肝炎病毒VP1、3D基因克隆及其在大肠杆菌中的表达 被引量:8
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作者 孔留五 罗玉均 +5 位作者 张桂红 陈建红 徐小芹 廖明 康艳梅 何逸民 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1068-1071,共4页
根据GenBank中的I型鸭肝炎病毒全基因序列设计了扩增I型鸭肝炎病毒VP1、3D基因的引物,用该特异性表达引物从I型鸭肝炎病毒cDNA模板中扩增得到目的基因VP1、3D,用相同的限制性内切酶酶切目的基因和表达载体pET32a后构建重组表达载体,转... 根据GenBank中的I型鸭肝炎病毒全基因序列设计了扩增I型鸭肝炎病毒VP1、3D基因的引物,用该特异性表达引物从I型鸭肝炎病毒cDNA模板中扩增得到目的基因VP1、3D,用相同的限制性内切酶酶切目的基因和表达载体pET32a后构建重组表达载体,转化宿主BL21(DE3),用不同浓度的IPTG诱导VP1、3D基因的表达,收集菌液进行SDS-PAGE电泳,Western-blotting分析蛋白免疫原性。结果表明,VP1、3D在大肠杆菌中表达量较高,表达产物的分子量约为48kD、68kD,并能被兔抗DHV-1血清所识别。I型鸭肝炎病毒VP1、3D蛋白在大肠杆菌中表达产物具有免疫原性。 展开更多
关键词 Ⅰ型鸭肝炎病毒 vp1基因 3D基因 克隆表达
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酵母双杂交技术筛选与CVB3 VP1直接作用的细胞蛋白 被引量:4
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作者 刘发娣 余克花 +5 位作者 罗达亚 徐秋芳 莫冰 罗军 刘晶星 黄孝天 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第10期991-995,共5页
目的以CVB3VP1为诱饵蛋白,筛选与CVB3VP1直接作用的人心脏cDNA文库基因,并对阳性cDNA克隆进行初步分析和鉴定。方法酵母双杂交技术筛选人心脏cDNA文库;经阳性克隆的表型确定、PCR扩增cDNA插入片段和Alu I酶切等试验将阳性克隆归类,并进... 目的以CVB3VP1为诱饵蛋白,筛选与CVB3VP1直接作用的人心脏cDNA文库基因,并对阳性cDNA克隆进行初步分析和鉴定。方法酵母双杂交技术筛选人心脏cDNA文库;经阳性克隆的表型确定、PCR扩增cDNA插入片段和Alu I酶切等试验将阳性克隆归类,并进行测序和同源性比对分析;α-半乳糖苷酶活性定量分析VP1与各阳性蛋白之间相互作用的强弱。结果在人心脏cDNA文库中筛选到5个阳性克隆,分别为:MNAT1(CAK装配因子),GOLGA2(高尔基体基质蛋白GM130),PHR1(视网膜PH结构域蛋白1),LDB1(LI M结构域结合蛋白1),NADH脱氢酶亚单位4。将筛选的GOLGA2cDNA新序列提交给NCBI GenBank数据库,获得Accession Number:AY823636;α-半乳糖苷酶定量分析试验进一步证明了MNAT1、GOLGA2、PHR1和LDB1等4个基因与VP1均有较强的相互作用。结论本研究成功地运用了酵母双杂交技术,以CVB3VP1为诱饵蛋白,从人心脏cDNA文库中获得5种不同类别的阳性基因:MNAT1、GOLGA2、PHR1、LDB1和NADH脱氢酶亚单位4。 展开更多
关键词 酵母双杂交 柯萨奇病毒 CVB3 vp1
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免疫途径和佐剂对CVB3VP1蛋白免疫效果的影响 被引量:4
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作者 温婵 高志云 +5 位作者 蓝佳明 闫立景 揣侠 李嘉 李伟 王永祥 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第10期1086-1089,共4页
目的:观察不同免疫途径和佐剂类型对柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus group B type 3,CVB3)衣壳蛋白VP1免疫效果的影响。方法:将原核表达质粒pET-his/VP1转入E.coli BL21(DE3)pLysS中,用异丙基-1-硫代-β呋喃半乳糖苷(IPTG)诱导CVB3VP... 目的:观察不同免疫途径和佐剂类型对柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus group B type 3,CVB3)衣壳蛋白VP1免疫效果的影响。方法:将原核表达质粒pET-his/VP1转入E.coli BL21(DE3)pLysS中,用异丙基-1-硫代-β呋喃半乳糖苷(IPTG)诱导CVB3VP1蛋白的表达并进行纯化。首先采用不同的免疫途径(皮下,腹腔,肌肉)用VP1蛋白免疫小鼠,每组12只。然后另取小鼠分为PBS组和不同佐剂组(氢氧化铝、弗氏佐剂、Montanide ISA720),每组18只,采用肌肉注射途径免疫。每次每只小鼠注射50μg,共免疫3次,间隔3周。用ELISA和微量中和试验检测血清特异性IgG抗体和中和抗体。用CCK-8法检测淋巴细胞增殖活性和CTL杀伤活性。用致死量的CVB3攻击后,检测血中病毒的滴度并观察小鼠的存活状况。结果:在大肠杆菌中成功表达CVB3VP1蛋白。三种免疫途径比较,肌肉注射组血清中和抗体和特异性IgG抗体的水平明显高于其他组(P<0.01)。采用肌肉注射免疫时,弗氏佐剂组Montanide ISA 720佐剂组的体液免疫和细胞免疫应答的水平明显高于氢氧化铝组(P<0.05);但血中病毒的滴度低于氢氧化铝组(P<0.05)。弗氏佐剂组小鼠的生存率好于氢氧化铝组(P<0.05)。结论:采用肌肉注射途径,并联合弗氏佐剂或Montanide ISA 720佐剂可以使CVB3VP1免疫获得较好的免疫效果。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B组3 衣壳蛋白vp1 佐剂 免疫途径 小鼠
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5株口蹄疫病毒VP1和3A基因的序列分析 被引量:4
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作者 石庆伟 冯嘉萍 +5 位作者 陈耀 白小磊 崔甜甜 崔进 王林川 张桂红 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期609-613,共5页
为了解广东地区口蹄疫病毒(FMDV)遗传进化情况,本研究从广东采集5份疑似FMDV感染病料,对样品进行RT-PCR扩增,经克隆测序后,对FMDVs基因序列比对和遗传进化分析。鉴定结果显示,这些病料样品中2份为O型FMDV感染,3份为A型FMDV感染。2个FMD... 为了解广东地区口蹄疫病毒(FMDV)遗传进化情况,本研究从广东采集5份疑似FMDV感染病料,对样品进行RT-PCR扩增,经克隆测序后,对FMDVs基因序列比对和遗传进化分析。鉴定结果显示,这些病料样品中2份为O型FMDV感染,3份为A型FMDV感染。2个FMDV O型样品中VP1基因的全长均为639 bp,编码213个氨基酸,3A基因的全长均为459 bp,编码153个氨基酸;3个FMDV A型样品中VP1基因的全长均为636 bp,编码212个氨基酸。3A基因的全长均为459 bp,编码153个氨基酸;与国内外分离的O/A型病毒株VP1基因核苷酸序列相比较发现,2个O型病毒VP1基因与O/BY/CHA/2010株核苷酸序列相似性最高(95.0%),均属于耿马谱系FMDV(属ESA基因型);3个A型病毒VP1基因与A/GDMM/CHA/2013株核苷酸序列相似性最高(99.2%),均属于Asia型FMDV。本研究通过对FMDV遗传进化分析为我国FMDV流行病学的研究提供了基础数据,同时对临床上不同型疫苗的选择提供依据。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 vp1基因 3A基因 RT-PCR
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鹅细小病毒VP1-VP3非重叠区基因的克隆与序列分析 被引量:7
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作者 王志强 刘力威 +5 位作者 杨旭东 李洪彬 黄芳芳 邹跃 陈亮 黄宇翔 《中国家禽》 北大核心 2011年第19期28-30,35,共4页
通过克隆鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)分离株VP1-VP3非重叠区基因,并对其进行序列分析,为鹅细小病毒感染与疫苗免疫的鉴别诊断奠定理论基础。进行鹅胚病毒增殖,收集尿囊液,提取基因组,参考发表的B株序列,设计合成一对引物,经PCR扩... 通过克隆鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)分离株VP1-VP3非重叠区基因,并对其进行序列分析,为鹅细小病毒感染与疫苗免疫的鉴别诊断奠定理论基础。进行鹅胚病毒增殖,收集尿囊液,提取基因组,参考发表的B株序列,设计合成一对引物,经PCR扩增,克隆VP1-VP3基因,筛选阳性克隆,对其进行序列测定及同源性分析。结果表明,克隆的基因片段为901 bp,VP1-VP3基因共594 bp,编码198个氨基酸;弱毒株之间亲缘关系很近,核苷酸同源性99.5%~100%, 氨基酸同源性98.5%~100%; 强毒株与B株亲缘关系较近, 核苷酸同源性96.6%,氨基酸同源性97.5%;弱毒株与强毒株亲缘关系较远,核苷酸同源性92%~93%,氨基酸同源性96%~97.5%;弱毒株与B株亲缘关系最远,核苷酸同源性92.5%~93%,氨基酸同源性93.9%~95.5%。说明强毒株与弱毒株之间核苷酸序列存在差异。 展开更多
关键词 鹅细小病毒 vp1-vp3非重叠区基因 克隆 序列分析
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穗发芽抗性STS标记Vp1B3在中国小麦微核心种质中的检测 被引量:4
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作者 冯继明 张海萍 +3 位作者 常成 殷波 司红起 马传喜 《分子植物育种》 CAS CSCD 2008年第6期1075-1079,共5页
小麦在临近收获前发生穗发芽,不仅劣化小麦加工品质,而且降低小麦产量。提高小麦穗发芽抗性水平是小麦育种工作的重要目标之一。本实验以258份中国小麦微核心种质为试材,利用已报道的小麦穗发芽抗性标记Vp1B3对其进行多态性检测,以了解... 小麦在临近收获前发生穗发芽,不仅劣化小麦加工品质,而且降低小麦产量。提高小麦穗发芽抗性水平是小麦育种工作的重要目标之一。本实验以258份中国小麦微核心种质为试材,利用已报道的小麦穗发芽抗性标记Vp1B3对其进行多态性检测,以了解该抗性标记在中国小麦微核心种质中的分布规律,寻找新的等位变异类型,并结合部分品种的发芽指数,分析不同等位变异类型与穗发芽抗性之间的关系。结果表明:检测的258份供试材料中,a带型(13.9%)、c带型(41.1%)和e带型(34.5%)等3种带型为主要扩增带型,占总变异类型的89.5%;b、d、f带型为本研究所发现的新的等位变异类型,占总变异类型的2.4%。此外,杂合带型以及无扩增产物的分别占总变异类型的3.5%和4.6%。对选取的部分穗发芽抗性不同的材料进行统计分析,结果显示,c带型品种的发芽指数(GI,47.9%)明显高于a带型(GI,22.6%)和e带型(GI,24.3%)的品种,但c带型的品种中也存在GI值较低的高抗穗发芽品种,而a带型和e带型的品种中同时也出现了GI值较高的感穗发芽品种,说明小麦穗发芽的遗传机制比较复杂,其抗性不仅仅受Vp1B3基因控制,而是多种因素共同作用的结果。 展开更多
关键词 小麦 微核心种质 穗发芽 STS标记 vp1B3
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口蹄疫O/China/99毒株在不同宿主系传代的3A和VP1基因变异研究 被引量:3
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作者 张永光 吕建亮 +7 位作者 王永录 方玉珍 蒋守田 张维德 刘湘涛 潘丽 刘力宽 裴仉福 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期338-346,共9页
利用RT-PCR法扩增了经不同宿主系(乳鼠、BHK21细胞、PK15细胞)连传不同代次的口蹄疫O/China/99毒株的3A和VP1基因,并进行了核苷酸和氨基酸序列分析。结果表明,该毒株经不同宿主系传至90代后,VP1基因未发生大的变异,主要抗原位点也较稳定... 利用RT-PCR法扩增了经不同宿主系(乳鼠、BHK21细胞、PK15细胞)连传不同代次的口蹄疫O/China/99毒株的3A和VP1基因,并进行了核苷酸和氨基酸序列分析。结果表明,该毒株经不同宿主系传至90代后,VP1基因未发生大的变异,主要抗原位点也较稳定;而非结构蛋白3A基因却在不同宿主和代次发生突变缺失;经BHK21细胞传代后未发生缺失;经PK15细胞传代,在70~90代之间在第254~313位出现缺失;经乳鼠传代,在60~70代之间在第265~300位发生缺失,并在以后的90代毒中仍在此位缺失。这与代表性猪源流行毒O/YUN/TAW/97和O/HKN/21/70的3A基因在第276~305位发生缺失有相同之处。 展开更多
关键词 宿主 细胞 乳鼠 vp1基因 毒株 PK 非结构蛋白3 传代 代次 口蹄疫
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柯萨奇B3病毒VP1基因在原核中的表达及其临床意义 被引量:4
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作者 毕胜利 曲萌 +1 位作者 陈廷友 宋玉国 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第9期847-850,856,共5页
目的:研究柯萨奇B3病毒(CVB3)VP1基因在大肠杆菌中的表达及其临床意义。方法:将柯萨奇B3病毒中国分离株VP1基因克隆入PQE-30载体,转导入大肠杆菌(Ml5)中,使CVB3的VP1基因在大肠杆菌中得到稳定的表达,采用NAT亲和方法纯化,间接ELISA方法... 目的:研究柯萨奇B3病毒(CVB3)VP1基因在大肠杆菌中的表达及其临床意义。方法:将柯萨奇B3病毒中国分离株VP1基因克隆入PQE-30载体,转导入大肠杆菌(Ml5)中,使CVB3的VP1基因在大肠杆菌中得到稳定的表达,采用NAT亲和方法纯化,间接ELISA方法做免疫学活性鉴定。结果:表达的VP1产物与抗柯萨奇B3病毒的兔抗CVB3(多克隆抗体)血清产生较强的免疫反应,与天然的CVB3蛋白抗原(病毒组织培养抗原)的抗原性近似。应用无关兔抗体对照呈阴性反应。应用表达的VP1产物作为抗原,对临床急性病毒性心肌炎患者血清进行了特异性IgM酶联免疫吸附试验检测,其结果与组织培养的CVB3制备的细胞蛋白抗原对上述患者血清的特异性IgM检测结果基本一致。结论:采用基因工程方法制备出的CVB3-VP1蛋白抗原产量高,纯化后免疫反应原性基本没有变化。试用表达CVB3的VP1基因工程抗原代替目前实验用有感染危险的病毒培养抗原的方法,快速、特异地检出CVB3的感染,为急性心肌炎的早期诊断和及时的临床治疗提供可靠的实验室诊断指标。 展开更多
关键词 柯萨奇B3病毒(CVB3) vp1基因 基因表达
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柯萨奇病毒B组3型VP1基因真核表达重组质粒的构建及免疫效果 被引量:5
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作者 倪志宇 王永祥 +1 位作者 金玉怀 金世香 《河北医科大学学报》 CAS 2002年第3期133-136,共4页
目的构建柯萨奇病毒B组 3型 (CoxsackievirusesgroupB3,CVB3)VP1基因的真核表达重组质粒pcDNA3/VP1,并观察它对小鼠的免疫保护作用。方法从CVB3感染细胞中扩增出VP1片段 ,构建真核表达重组质粒 pcDNA3/VP1,经大量扩增纯化后 ,肌内注射免... 目的构建柯萨奇病毒B组 3型 (CoxsackievirusesgroupB3,CVB3)VP1基因的真核表达重组质粒pcDNA3/VP1,并观察它对小鼠的免疫保护作用。方法从CVB3感染细胞中扩增出VP1片段 ,构建真核表达重组质粒 pcDNA3/VP1,经大量扩增纯化后 ,肌内注射免疫BALB/c小鼠 ,每次免疫后的第 6天 ,断尾取血检测CVB3中和抗体 ;3次免疫后用致死量 (10 0 0TCID50 )的CVB3感染小鼠 ,观察 pcDNA/VP1对小鼠的免疫保护作用。 结果pcDNA3/VP1重组质粒免疫小鼠后 ,能诱导机体产生中和抗体 ,各次免疫后抗体滴度分别为 <1∶5 ,1∶5 .7和1∶34.8;用致死量CVB3感染小鼠 ,pcDNA3/VP1重组质粒免疫组、pcDNA3质粒对照组及生理盐水对照组生存率分别为 30 %、2 0 %及 15 % ,3组小鼠生存率无明显差异 (P >0 .0 5 )。结论 pcDNA3/VP1重组质粒在小鼠体内能够表达并能诱导机体产生中和抗体 ,抗体滴度随免疫次数增加 。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒B组3 vp1基因 真核表达 重组质粒 构建 免疫效果
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穗发芽相关基因Vp1B3不同等位变异在山东小麦中的分布与演变 被引量:2
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作者 郭凤芝 梁伟光 +3 位作者 樊庆琦 黄承彦 高庆荣 李根英 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期575-578,共4页
为了探讨穗发芽相关基因Vp1B3不同等位变异在山东小麦中的分布与演变规律,利用Vp1B3的功能标记对山东小麦385份农家品种、101份历史品种和25份当前主栽品种进行鉴定。结果表明,Vp1B3的不同等位变异在不同历史时期的山东小麦中具有不同... 为了探讨穗发芽相关基因Vp1B3不同等位变异在山东小麦中的分布与演变规律,利用Vp1B3的功能标记对山东小麦385份农家品种、101份历史品种和25份当前主栽品种进行鉴定。结果表明,Vp1B3的不同等位变异在不同历史时期的山东小麦中具有不同的分布特点:25份当前主栽品种中有17份含有抗穗发芽类型的等位变异(Vp1B3b、Vp1B3c),占68.0%;101份历史品种中抗穗发芽的类型有58份,占57.4%;而385份农家品种中只有100份属于抗穗发芽类型,仅占26.0%。在山东省四大麦区的地方品种中Vp1B3的等位基因分布规律亦不同:在胶东丘陵晚熟麦区及鲁西北平原冬性、半冬性、晚熟麦区的地方品种中抗穗发芽类型所占比例较小,分别为16.2%和9.9%;在鲁中山丘川半冬性、冬性中熟麦区和鲁西南平原湖洼半冬性早熟麦区的地方品种中抗穗发芽类型所占比例相对较大,分别为44.7%和37.8%。 展开更多
关键词 山东小麦 穗发芽 vp1B3 等位变异
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利用SUMO表达系统高效表达猪O型口蹄疫病毒VP0、VP1、VP3基因 被引量:3
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作者 宋妮 温永俊 +1 位作者 王凤雪 武华 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2013年第9期61-65,共5页
根据GenBank中公布的猪O型口蹄疫病毒(foot and mouth disease virus,FMDV)全基因合成了FMDV结构蛋白前体蛋白P1基因,同时设计了扩增FMDV结构蛋白VP0、VP1和VP3基因的引物。以P1基因为模板,分别经PCR扩增获得FMDV VP0、VP1和VP3基因。... 根据GenBank中公布的猪O型口蹄疫病毒(foot and mouth disease virus,FMDV)全基因合成了FMDV结构蛋白前体蛋白P1基因,同时设计了扩增FMDV结构蛋白VP0、VP1和VP3基因的引物。以P1基因为模板,分别经PCR扩增获得FMDV VP0、VP1和VP3基因。扩增产物克隆于Blunt载体中,酶切后将目的片段连接到原核表达载体SUMO中,构建重组表达质粒SUMO-VP0、SUMO-VP1和SUMO-VP3,将重组质粒转化大肠杆菌BL21(DE3)plysS进行诱导表达。经SDS-PAGE电泳可见融合蛋白均获得高效表达,融合蛋白表观分子质量分别约为55、48和40 ku。在IPTG浓度为1.0 mmol/L,温度为37℃,诱导5 h时融合蛋白表达量最大。Western blotting结果表明,融合蛋白均可被FMDV阳性血清识别,反应原性良好。 展开更多
关键词 猪O型口蹄疫病毒 vp0、vp1vp3基因 SUMO 高效表达
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鹅细小病毒VP1-VP3非重叠序列地高辛探针的制备和应用 被引量:2
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作者 布日额 王君伟 +2 位作者 吴金花 马波 Ulrich Neumann 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2005年第1期7-10,共4页
根据 GPV H1株核苷酸序列 ,设计了扩增 VP1- VP3基因非重叠序列的 1对引物 ,对其结构蛋白 VP1与 VP3非重叠核苷酸序列进行 PCR扩增 ,将 PCR产物纯化、回收后制备出 GPV VP1- VP3基因 DIG标记核酸探针 ,其标记效率达到0 .1pg/μl。特异... 根据 GPV H1株核苷酸序列 ,设计了扩增 VP1- VP3基因非重叠序列的 1对引物 ,对其结构蛋白 VP1与 VP3非重叠核苷酸序列进行 PCR扩增 ,将 PCR产物纯化、回收后制备出 GPV VP1- VP3基因 DIG标记核酸探针 ,其标记效率达到0 .1pg/μl。特异性检测结果表明 ,该探针能与 GPV不同毒株核酸发生特异性杂交 ,而与对照的 DPV、GPMV等病毒的核酸杂交反应均为阴性 ;敏感性检测结果表明该探针对 GPV的最低检出量为 0 .0 32 ng。上述试验结果表明该探针可以用于 展开更多
关键词 vp1 地高辛 探针 vp3基因 特异性检测 阴性 临床 鹅细小病毒 病料 核苷酸序列
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