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长苞铁杉nrDNA内转录间隔区及5.8 S的二级结构分析研究
被引量:
5
1
作者
阚显照
乔才元
+1 位作者
高卉
朱国萍
《激光生物学报》
CAS
CSCD
2007年第3期327-333,共7页
核糖体RNA及相邻区域的二级结构研究,作为一个重要的工具,已在一些分类等级上被应用于系统发育的分析。以长苞铁杉为实验材料,通过克隆、测序,利用最小自由能原理预测nrDNA内转录间隔区及5.8S转录本的二级结构,分析它们的结构特点,探讨...
核糖体RNA及相邻区域的二级结构研究,作为一个重要的工具,已在一些分类等级上被应用于系统发育的分析。以长苞铁杉为实验材料,通过克隆、测序,利用最小自由能原理预测nrDNA内转录间隔区及5.8S转录本的二级结构,分析它们的结构特点,探讨假基因化拷贝与功能拷贝结构上的差异。分析结果表明:(1)ITS1区的二级结构主要由几个延展的发夹结构组成,配对的亚重复单位在松科植物特有的保守序列处有部分重叠,未配对的亚重复单位通常能自身折叠,保守序列的部分碱基出现在发夹结构的环中;(2)假基因化拷贝二级结构的自由能比正常拷贝高;(3)与正常拷贝的二级结构相比,假基因化拷贝在进化速率很低的5.8S功能区发生较大的变异,且在5.8 S末端没有和26 S连接配对。
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关键词
二级结构
长苞铁杉
核rRNA
内转录间隔区
5.8
S
RRNA
假基因
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职称材料
题名
长苞铁杉nrDNA内转录间隔区及5.8 S的二级结构分析研究
被引量:
5
1
作者
阚显照
乔才元
高卉
朱国萍
机构
中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室
出处
《激光生物学报》
CAS
CSCD
2007年第3期327-333,共7页
基金
国家自然科学基金(30500300)
教育部科学技术研究重点项目(206066)
安徽省引进海外留学人才基金(2005Z032)
文摘
核糖体RNA及相邻区域的二级结构研究,作为一个重要的工具,已在一些分类等级上被应用于系统发育的分析。以长苞铁杉为实验材料,通过克隆、测序,利用最小自由能原理预测nrDNA内转录间隔区及5.8S转录本的二级结构,分析它们的结构特点,探讨假基因化拷贝与功能拷贝结构上的差异。分析结果表明:(1)ITS1区的二级结构主要由几个延展的发夹结构组成,配对的亚重复单位在松科植物特有的保守序列处有部分重叠,未配对的亚重复单位通常能自身折叠,保守序列的部分碱基出现在发夹结构的环中;(2)假基因化拷贝二级结构的自由能比正常拷贝高;(3)与正常拷贝的二级结构相比,假基因化拷贝在进化速率很低的5.8S功能区发生较大的变异,且在5.8 S末端没有和26 S连接配对。
关键词
二级结构
长苞铁杉
核rRNA
内转录间隔区
5.8
S
RRNA
假基因
Keywords
secondary structure
Nothotsuga longibracteata
nrrna
internal transcribed spacer, 5.8 S RNA, pseudogene
分类号
Q349.55 [生物学—遗传学]
Q949.66 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
长苞铁杉nrDNA内转录间隔区及5.8 S的二级结构分析研究
阚显照
乔才元
高卉
朱国萍
《激光生物学报》
CAS
CSCD
2007
5
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职称材料
已选择
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参考文献
引证文献
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