两种黄盖鲽线粒体DNA部分片段比较分析

比较分析了钝吻黄盖鲽和尖吻黄盖鲽线粒体基因组COI、Cytb基因以及D-loop片段总长度为1 373 bp的核苷酸序列,两种间共检测到107处核苷酸替换,蛋白质编码基因上的核苷酸替代主要是第三密码子位点上的同义替换。核苷酸组成分析结果表明:3个目的片段的鸟嘌呤(G)含量普遍较低,在两个蛋白编码基因第三密码子位点上表现得尤为明显。两种黄盖鲽在线粒体基因组不同片段上存在明显的遗传分化,核苷酸替代速率最快的是D-loop,COI和Cytb核苷酸替代速率基本一致。建议在进行黄盖鲽属鱼类分子系统发育研究时,应该针对不同研究目的选择合适的分子标记。基于Cytb基因片段序列的分析结果表明:钝吻黄盖鲽和尖吻黄盖鲽两种的分岐时间约为200万年,两种间的分化事件发生在更新世(Pleistocene)。

中国汉族冠心病患者乙醛脱氢酶2基因多态性与心肌梗死的相关性研究

目的:探讨汉族冠心病患者中乙醛脱氢酶2乙醛脱氢酶2(ALDH2)基因多态性与心肌梗死(MI)的相关性。方法:对231例冠心病患者采用多聚酶链反应分析ALDH2基因G487A多态性。并根据基因型分两组,ALDH2基因GG型组(n=145)和AA/AG型组(n=86),比较两组间MI发病率、心血管病传统危险因素和饮酒量等指标的差异,以评价MI的危险因素。结果:ALDH2基因AA/AG型组MI、糖尿病发病率明显高于GG型组,均有统计学意义(P<0.01)。采用多因素logistic回归调整年龄、性别、吸烟、心血管病家族史、总胆固醇、糖尿病后,发现AA/AG型是MI的独立危险因素(OR=3.42,P<0.01),而在回归分析中再引入高血压病这一自变量后,AA/AG型与MI的相关性下降(OR=3.03,P=0.03),进一步引入饮酒量和高密度脂蛋白(HDL-C)两个自变量后,ALDH2基因型与MI间不再存在相关性(P=0.23)。结论:ALDH2基因AA/AG型是MI的独立危险因素,其可能通过改变血压、饮酒量和HDL-C水平影响MI发病。

豆粕和花生粕部分替代鱼粉添加四种添加剂对凡纳滨对虾饲料表观消化率的影响

为节约鱼粉资源和降低饲料成本,提高凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)对豆粕和花生粕部分替代鱼粉饲料的消化利用率,在含22%豆粕、18%花生粕和23%鱼粉的基础饲料(G0)中分别添加0.212%包膜赖氨酸和0.084%包膜蛋氨酸(G1)、1%复合芽孢杆菌(G2)、0.04%植酸酶(G3)、0.62%核苷酸混合物(G4),以三氧化二钇为指示剂,研究凡纳滨对虾对饲料干物质、粗蛋白质、粗脂肪、磷、能量和氨基酸的表观消化率。结果显示,与基础组相比,添加组对虾的干物质和粗脂肪表观消化率显著升高(P<0.05),G2和G3粗蛋白质和磷的表观消化率显著升高(P<0.05),添加组能量的表观消化率分别升高14.8%、12.1%、9.4%和7.7%,但差异未达到显著水平(P>0.05)。各组中所有氨基酸(G1除甘氨酸和半胱氨酸外)的表观消化率基本高于85%,其中G1除苯丙氨酸、苏氨酸、蛋氨酸、脯氨酸和半胱氨酸外的氨基酸表观消化率无显著差异(P>0.05),G2所有氨基酸、G3除脯氨酸和酪氨酸外和G4除赖氨酸、精氨酸、丝氨酸和酪氨酸外的氨基酸表观消化率显著升高(P<0.05)。结果表明,豆粕和花生粕部分替代鱼粉饲料,分别添加包膜赖氨酸和蛋氨酸、复合芽孢杆菌、植酸酶、核苷酸混合物能提高凡纳滨对虾对饲料干物质和粗蛋白质、脂肪、磷、能量及氨基酸的表观消化率,其中以复合芽孢杆菌和植酸酶的作用效果最为显著。

贵州三个主要民族人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性分析

目的:了解贵州汉族、苗族、布依族人群肿瘤坏死因子α(Tumour necrosis factor alpha,TNF-α)基因启动子区的基因多态性。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和序列特异性引物-聚合酶链反应(SSP-PCR)方法,对贵州汉族、苗族、布依族人群中TNF-α基因启动子区已知的5个多态性位点进行基因分型检测,并用统计学方法分析各位点基因型、等位基因频率和单倍型及其组间差异。结果:贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238(G,96%;A,4.0%)、-308(G,92%;A,8%)、-857(C,65.0%;T,35.0%)、-863(C,80.0%;A,20.0%)、-1031(T,48.0%;C,52.0%),其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC和GG-GG-TT-CC-TC为主,分别占32.0%和28.0%;苗族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238(G,85.0%;A,15.0%)、-308(G,94.0%;A,6.0%)、-857(C,74.0%;T,26.0%)、-863(C,96.0%;A,4.0%)、-1031(T,50.0%;C,50.0%),其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC和GG-GG-TT-CC-TC为主,分别占50.0%和24.0%;布依族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238(G,86.0%;A,14.0%)、-308(G,92.0%;A,8.0%)、-857(C,89.0%;T,11.0%)、-863(C,84.0%;A,16.0%)、-1031(T,50.0%;C,50.0%),其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC占54.0%,AA-GG-CC-CC-TC和GG-GG-CC-AA-TC各占12%。结论:贵州汉族、苗族、布依族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性具有独特的特征,这为TNF-α基因多态性与疾病的相关性研究提供了基础资料。

尘螨变应原Der f1核酸序列测定及其分子进化分析

目的:对尘螨主要变应原Der f1进行核酸序列测定,探讨其系统进化信息。方法:根据Genbank公布的Der f1基因序列设计引物,巢式PCR扩增Der f1的cDNA,纯化、回收、克隆至pMD19-T simple后进行序列测定,序列比对后用Clustal W 1.83构建分子进化树。结果:成功扩增出Der f1的cDNA片段,测序表明该基因含ORF1个,长度966bp,与参考序列同源性达99.9%。该变应原具半胱氨酸蛋白酶活性,与果蝇进化关系最远,与梅氏嗜霉螨进化关系最近。结论:成功获得了尘螨变应原Der f1基因片段,根据其编码的氨基酸序列构建出的系统进化树与形态学分类不一致。

海南汉族、黎族人群纤维蛋白原基因9个核苷酸多态性及单体型的比较研究

目的研究海南汉族、黎族人群体纤维蛋白原基因αTaqⅠ、βBclⅠG/A、βHinfⅠA/C、β448G/A、βBsmAⅠG/C、β+1689T/G、β-148C/T、β-249C/T、β-455G/A9个位点的等位基因频率、连锁不平衡关系及单体型。方法从末梢血提取316名海南汉族个体和182名海南黎族个体的DNA标本,用PCR-RFLP法及测序法分析多态性和确定基因型,用EH+程序分析核苷酸多态性的连锁不平衡关系及单体型,用χ2检验分析人群间的等位基因频率及单体型频率的差异。结果纤维蛋白原基因αTaqⅠ、βBclⅠG/A、βHinfⅠA/C、β448G/A、βBsmAⅠG/C、β+1689T/G、β-148C/T、β-249C/T、β-455G/A的稀有等位基因频率在汉族人群中分别为0·429、0·255、0·128、0·255、0·302、0·267、0·282、0·468、0·274,在黎族人群中分别为0·312、0·363、0·150、0·344、0·328、0·350、0·331、0·626、0·350。海南汉族人群和黎族人群αTaqⅠ、βBclⅠG/A、β448G/A、β+1689T/G、β-249C/T、β-455G/A5个位点的稀有等位基因频率分布存在统计学差异(P<0·01)。黎族人群9个位点两两之间的连锁不平衡的紧密程度比汉族人群高。部分单体型的分布在两个人群之间的分布存在统计学差异。结论海南汉族、黎族人群纤维蛋白原基因的某些多态性及单体型的频率存在差异。

ADCY2基因单核苷酸多态性与持续性变应性鼻炎的关联研究

目的探讨腺苷酸环化酶2(ADCY2)基因单核苷酸多态性(SNPs)与苏皖地区汉族人群由尘螨致敏的持续性变应性鼻炎(PER)的遗传相关性。方法采用病例-对照研究,共纳入571例尘螨致敏的PER患者和677例健康对照者。采集所有受试者外周静脉血进行血清总Ig E和特异性Ig E测定,同时EDTA存储管采集抗凝血以提取DNA。预测、筛选ADCY2基因内含子区5个SNPs位点,进行基因分型。结果校正年龄、性别后,ADCY2基因rs1864071位点的基因型频数在病例组和对照组的差异有统计学意义,且该位点在病例组和对照组中的相加模型(OR=1.226,95%CI=1.045-1.439;P=0.013)及显性模型(OR=1.343,95%CI=1.039-1.736;P=0.024)发生PER的风险明显增加。结论在苏皖汉族人群中,ADCY2基因rs1864071位点与PER显著关联,该基因可能影响尘螨致敏PER的遗传易感性。

日本脑炎ML-17两个变异株的基因组序列及突变分析(英文)

目的鉴别日本脑炎疫苗株ML-17的两个大宽变异株（ML-17L2和ML-17L4）的存在，并通过全基因组序列测定分析引起斑形和毒力改变的基因突变。方法首先对疫苗株ML-17在传代过程中出现的多斑ML-17sh的两个大宽变异株进行纯化和鉴定，再对两个大斑变异株进行全基因组序列测定和全编码氨基酸序列推导。并与小斑疫苗株ML-17及其大斑亲代野毒株JaOH0566的全核苷酸序列和全编码氨基酸序列进行比较，分析引起宽形改变的基因突变。并应用小白鼠试验检查ML-17变异前后的神经侵袭力和毒力变化。结果全基因组序列分析显示两个大斑变异株的核苷酸总数均为10977个，与ML-17和JaOH0566相比较，分剐有33和34个核苷酸变异散在分布于ML-17L2和ML-17L4的全基因组中，其中又分别有12和13个核苷酸导致了氨基酸的改变。在ML-17L2和ML-17L4的衣壳蛋白区没有氨基酸变异，但在包膜蛋白区各有一个氨基酸变异；在5’端非编码区没有核苷酸变异，但在3’端非编码区有3～4个核苷酸变异，且各增加了一个额外的10699核苷酸。ML-17和ML-17sh的小鼠LD50分别为大于1×10^6FFU和481FFU。变异后毒力明显增强。结论发生在两个大斑变异株的第5非结构蛋白区和其它区的氨基酸返祖变异（变回与JaOH0566相同）和新变异，可能引起了宽彤的改变；而全部5个氨基酸返祖变异和2—3个氨基酸新变异可能与其毒力改变有关。本次研究为ML-17L2和ML-17L4的斑形和毒力改变提供了分子遗传学基础。

SLC22A1 rs628031基因多态性与二甲双胍不良反应的关系

目的本研究旨在观察SLC22A1 rs628031基因多态性与二甲双胍不良反应之间的关系。方法前瞻性研究93例接受单用二甲双胍口服降糖治疗的初诊2型糖尿病患者。从患者外周血白细胞中提取DNA,应用单碱基延伸法进行基因分型,并分析基因多态性与不同剂量二甲双胍不良反应的关系。结果 rs628031基因多态性与二甲双胍不良反应的发生,差异无统计学意义(P=0.062)。在药物剂量亚组分析中,rs628031 GA/AA基因型的患者接受单用高剂量二甲双胍口服降糖治疗后,发生不良反应的比率明显增高(85.7%vs.14.3%,P=0.015),但是,在低剂量组中,组间比较差异无统计学意义(P=0.605)。结论本研究结果提示SLC22A1 rs628031基因多态性与高剂量二甲双胍的不良反应发生有关。

尿调蛋白基因和天津地区汉族糖尿病肾病的相关性

目的探讨尿调蛋白（uromodulin，UMOD）基因多态性与天津地区汉族人群糖尿病肾病fdiabetickidneydisease）的关系。方法选取健康对照者（NC）90例、2型糖尿病患者（T2DM）210例和DKD患者280例（GFR90ml／min组105例，60ml／mim≤GFR〈90ml／min组84例，GFR〈60ml/min组9l例），利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析法（PCR—RFLP）进行UMOD基因rs13333226位点多态性检测。结果NC组、T2DM组和DKD组患者的AA、AG、GG3种基因型频率分别为27．8％、58．9％、13_3％，41．0％、48．6％、10．5％和54-3％、36．1％、9．6％；G等位基因频率分别为42．8％、34．8％和27．7％。NC组与DKD组间、T2DM组与DKD组间在基因型分布上的差异有统计学意义（P〈0．05）。Logistic回归分析显示，UMOD基因的G等位基因是DKD的独立保护因素（B=-0．248，Wald=8．012，P=0．021，OR=0．780，95％CI 0．612～0．968）。结论UMOD基因rs13333226G等位基因可能是天津地区汉族人群DKD的独立保护因素。

VEGF基因及KDR基因多态性与妊娠期高血压病的相关性研究

目的探讨VEGF基因rs699974位点和KDR基因rs2071559、rs1531289位点,与中国北方妇女妊娠期高血压疾病(HDCP)遗传易感性的关系。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分型技术(PCR-RFLP)对164例中国北方地区妊娠期高血压病人和114例正常对照病人。结果 VEGF基因rs699974位点和KDR基因rs2071559、rs1531289位点中,病例组与对照组比较,P值均大于0.05,提示3个位点均无统计学意义。结论 VEGF基因rs699974位点和KDR基因rs2071559、rs1531289位点多态性与东北地区妇女HDCP遗传易感性可能无关。

蛋白激酶Cγ亚型基因多态性与重性抑郁障碍的关联性

目的探讨蛋白激酶Cγ亚型（PKCγ）基因多态性rs3745406与重性抑郁障碍及其症状表型的关联性。方法用《DSM-Ⅳ轴Ⅰ障碍用临床定式检查病人版》筛查收集2005年5月至2008年3月在山西医科大学第一医院精神卫生科的门诊或住院部的确诊的中国汉族重性抑郁症患者453例，包括首发重性抑郁障碍（80．67％）和部分复发患者（19．33％）；采用汉密顿抑郁量表（HAMD）评定病例组症状表型；应用聚合酶链式反应技术（PCR）扩增目的DNA片段，对PCR产物直接测序，检测研究对象rs3745406位点的多态性；使用UNPHASED软件进行等位基因，基因型分析、数量性状分析。结果（1）研究样本的基因型分布符合Hardy—Weiberg平衡（r=1．46，P=0．25）。（2）基因型分布和等位基因频率在重性抑郁障碍患者组和对照组之间差异无统计学意义（P〉0．05）。（3）PKCγ基因rs3745406位点等位基因与汉密顿抑郁量表（HAMD）自杀临床表型存在明显相关性（χ^2=4．746，P=0．0360）。结论PKCγ基因rs3745406多态性与重性抑郁障碍无明显相关，但与重性抑郁障碍的自杀症状存在显著相关性。

UCA1表达水平及其启动子区域rs7255437单核苷酸多态性与结直肠癌的关系

目的探讨长链非编码RNA尿路上皮癌胚抗原1(UCA1)表达水平及其启动子区域的单核苷酸多态性与结直肠癌发生发展的关系,为其作为结直肠癌风险的分子标志物提供依据。方法分别纳入507例原发性结直肠癌患者和503例健康志愿者为病例组和对照组,采集血液检测UCA1 rs7255437位点单核苷酸多态性,分析UCA1 rs7255437多态性与结直肠癌发病的关联。采用生物信息学方法验证UCA1表达与rs7255437多态性及结直肠癌发病的关联。结果与rs7255437 CC基因携带者相比,CT和TT基因型携带者发生结直肠癌的风险均升高,但差异均无统计学意义(P>0.05);与rs7255437 CC基因携带者相比,TT基因携带者发生晚期结直肠癌的风险降低67%(P<0.05)。生物信息学分析结果显示,在正常横结肠组织和小肠组织中,CT和TT基因携带者UCA1表达水平均高于CC基因携带者;结直肠癌晚期患者肠癌组织中UCA1表达水平高于结直肠癌早期患者(P<0.05)。结论 UCA1表达水平及其启动子区域rs7255437单核苷酸多态性作为结直肠癌风险的分子标志物具有一定潜力,但有待于基于自然人群的大样本前瞻性队列研究以及功能学研究进一步验证。