QTL mapping for yield components of Brassica napus L. using double haploid and immortalized F_2 populations

Effective silique number per plant(ESN), seeds per silique(SS), thousand seeds weight(TSW), silique length(SL) and silique density(SD) are important seed yield potential determinant traits in rapeseed(Brassica napus L.), which are controlled by quantitative trait loci(QTL). Mapping QTL to delimited chromosomal region offers an effective method for genetic dissection of these traits. A set of 96 double haploid(DH) lines were developed by crossing 2 Brassica napus lines R1 and R2, and an immortalized F_2(IF_2) population containing 124 combinations was developed by crossing those DH lines. DH populations were planted at 2 locations for 2 years and IF_2 populations were planted in 2 locations for 1 year. Based on the established 2,217.2 cM length high density genetic map, 42 QTLs were identified, with 26 QTLs detected repeatedly in different environments or populations, including 8 for SL, 7 for TSW, 4 for ESN, 4 for SS and 3 for SD. Among these identified QTLs, 3, 4, 1, 1 and 3 QTLs were considered as major QTLs for SL, TSW, ESN, SS and SD, respectively. In addition, 2 QTLs on A9 chromosome which control multiple traits were identified. These results warrant further study of fine mapping for yield and yield components.

腌制剂及冲洗工艺对宣威火腿滋味的影响

以宣威火腿为研究对象,探讨3种腌制剂及2种冲洗工艺对其滋味特征的影响。通过钠离子含量、水分含量、水分活度、氨基酸、核苷酸、肽分子质量分布和电子舌分析不同宣威火腿滋味化合物和滋味属性的差异。结果表明,海藻碘盐腌制且高压水枪冲洗的火腿钠离子含量最高,为6.61 g/100 g;氯化钠腌制且清水浸泡冲洗的火腿中氨基酸含量最高,为961.96 mg/100 g;海藻碘盐腌制且高压水枪冲洗的火腿中核苷酸含量最高,为493.38 mg/100 g;分子质量分布分析表明,清水浸泡冲洗的火腿中小分子肽(<1000 Da)含量最多;电子舌分析发现高压水枪冲洗的火腿鲜味和咸味显著高于清水浸泡处理的火腿;主成分分析发现,高压水枪冲洗的条件下海藻碘盐和氯化钠腌制的宣威火腿在鲜味、咸味和丰富度上更加接近,该研究在阐明不同腌制剂及冲洗工艺对宣威火腿滋味影响的前提下,为提升宣威火腿的品质及其工业化提供了理论依据及技术支撑。

不同熬制工艺对“佛跳墙”营养成分及风味物质的影响

通过理化指标分析、游离氨基酸与呈味核苷酸含量测定及电子舌、气相色谱-离子迁移色谱(gas chromatography-ion mobility spectrometry,GC-IMS)等技术,采用主成分分析等方法对传统和现代熬制工艺下两种“佛跳墙”的营养成分和风味物质进行研究。结果表明,不同熬制工艺对“佛跳墙”的脂肪含量存在显著影响(P<0.05);传统工艺熬制的“佛跳墙”中呈味核苷酸能更好地与鲜味氨基酸结合,呈现更好的鲜味;通过电子舌技术分析得出两种熬制工艺的“佛跳墙”主要在苦味和涩味上有差异;GC-IMS研究结果表明,传统工艺较现代工艺熬制的“佛跳墙”的挥发性风味物质更丰富;结合主成分分析发现,两种熬制工艺中挥发性物质组成存在较大差异。该研究可为“佛跳墙”产品开发及应用提供一定理论参考。

云南省不同产地美味牛肝菌主要滋味品质评价

目的基于美味牛肝菌(Boletusedulis)主要滋味物质(包括游离氨基酸和呈味核苷酸)的含量差异,对云南省不同产地美味牛肝菌的主要滋味品质进行评价。方法采用高效液相色谱法(highperformanceliquid chromatography,HPLC)对云南省8个不同产地美味牛肝菌中的17种游离氨基酸和6种呈味核苷酸进行定量分析,并结合多元统计分析及滋味活性值(taste activity value,TAV)、等鲜浓度值(equivalent umami concentration,EUC)对不同产地美味牛肝菌主要滋味成分含量进行分析及风味评估。结果不同产地美味牛肝菌游离氨基酸和呈味核苷酸含量均存在一定差异,游离氨基酸总含量最高的是南涧美味牛肝菌,为(9.684±0.301)g/100g,最低是易门美味牛肝菌,为(4.593±0.186)g/100g,各产地游离氨基酸含量均呈现为甜味氨基酸总量>苦味氨基酸总量>鲜味氨基酸总量;而呈味核苷酸含量最低的是通海美味牛肝菌,仅为(273.116±7.218)μg/g,最高为泸沽湖美味牛肝菌,达到了(1722.803±16.476)μg/g,8个产地含量最高的呈味核苷酸均为5’-黄苷酸。另外,南涧产地美味牛肝菌主要滋味物质含量最高,且在滋味评估中,滋味活性值和等鲜浓度值远高于其他产地,分别为135.46 mg/g和47.59 g MSG/100 g。结论云南省不同产地美味牛肝菌主要滋味成分含量差异较大,综合比较得出南涧产地美味牛肝菌的滋味较为浓郁,研究结果可为美味牛肝菌风味物质的深入研究及风味基料的开发提供一定的参考。

基于全基因组重测序的杏鲍菇菌株遗传多样性与性状分析

【目的】通过分析20份杏鲍菇菌株的遗传多样性和菌丝、子实体的性状,为新型分子标记在杏鲍菇资源保护利用方面提供一定的基础,也为后续主要性状基因的准确定位、杂交育种、表型预测提供理论依据。【方法】以20株全国不同地区收集到的杏鲍菇菌株作为试验菌株,对其进行全基因组重测序,将分析得到的SNP位点作为标记进行遗传多样性分析,并测定其菌丝在PDA培养皿上的生长速度、产量、子实体长度、菌盖直径、菌柄长度、菌柄直径、子实体硬度、子实体脆度、子实体咀嚼性和子实体胶着性,随后对10项性状指标进行主成分分析,将各项性状指标与遗传多样性结果进行联合分析,评价二者的相关性。【结果】当遗传距离大于0.08时,20份杏鲍菇菌株分为6个类群,每个类群的菌株的性状与其他类群相比均有一定的差异且类群内菌株性状比较接近。其中类群Ⅴ所含菌株数量最多,包含13份菌株,且各项性状指标最为突出;其次是类群Ⅱ包含3份菌株,其余几个类群都只包含1个菌株,不同类群之间性状均有差异,类群内差异很小。【结论】国内不同地区的杏鲍菇菌株在遗传多样性、菌丝生长速度、子实体性状和质构方面均有差异,其中各项性状比较优异且均衡的杏鲍菇菌株聚类在类群Ⅴ,说明杏鲍菇中SNP标记与子实体性状有很强的相关性。在育种实践中,可以通过SNP标记预测菌株的性状,以遗传距离比较远、个别性状比较突出的菌株作为亲本进行杂交育种,大大减少育种周期,提高育种效率与精度。

胶红酵母(Rhodotorula mucilaginosa)营养成分分析(英文)

为分析胶红酵母(Rhodotorula mucilaginosa)的营养水平,评价其作为饲料原料的营养价值和开发前景,对其常规营养成分、氨基酸、脂肪酸、β-胡萝卜素、维生素E、核苷酸和虾青素含量进行了测定。结果显示,胶红酵母的粗蛋白、粗脂肪、总糖、灰分的质量分数分别为49.2%、1.5%、22.3%和7.9%。共检出16种常见的氨基酸,包括7种人体必需氨基酸,占氨基酸总量的36.77%。检出6种脂肪酸,分别为十四酸、十六酸、十八酸、油酸、亚油酸和亚麻酸,含量分别为0.29%、8.64%、5.41%、35.38%、28.97%和21.31%。β-胡萝卜素、维生素E、核苷酸和虾青素的含量分别为1.40、172.00、170.00、1.00mg/kg。结果表明,胶红酵母的营养价值较高,是较好的饲料原料,可用作鱼粉等蛋白源的替代物,具有很好的市场前景和开发潜力。

外源核苷酸对异育银鲫幼鱼生长性能和体成分的影响

以异育银鲫幼鱼为试验对象,研究不同水平外源核苷酸对其生长性能的影响。结果表明,基础饲料中添加0.05%外源核苷酸能显著提高异育银鲫幼鱼的增重率和特定生长率(P<0.05),降低饵料系数(P<0.05);同时3个试验组的鱼体粗脂肪含量和肝胰脏指数显著低于对照组(P<0.05)。

大黄鱼成鱼养殖阶段滋味物质分析

以深水网箱养殖大黄鱼为对象,比较在成鱼养殖三个阶段(2016年7月、2016年10月和2017年1月)大黄鱼背部肌肉电子舌电位变化、游离氨基酸和呈味核苷酸差异,探究深水网箱养殖对大黄鱼风味的提升作用。结果表明,电子舌能有效区分成鱼养殖不同阶段大黄鱼的味感差异,鲜味和丰富性均在次年1月份有较大电位变化值;养殖大黄鱼甜味氨基酸(sweetaminoacid,SAA)含量在三个阶段养殖期间呈上升趋势,鲜味氨基酸(umami amino acids,UAA)和苦味氨基酸(bitter amino acids,BAA)含量在10月份达到最高;养殖大黄鱼呈味核苷酸受养殖时间影响波动较大,肌苷酸(inosinicacid,IMP)、腺苷酸(adenosine monophosphate,AMP)和鸟苷酸(guanosine monophosphate,GMP)均在次年1月份达到最高,养殖至次年1月份时大黄鱼IMP的滋味活性值(taste activity values,TAV)值大于1,对养殖大黄鱼滋味贡献最大;味精当量(equivalent umami concentration,EUC)综合评价表明,养殖至次年1月份时大黄鱼EUC值最高,鲜味较强,风味品质改善。综上,深水网箱养殖对大黄鱼滋味品质具有提升作用,转移至深水网箱至次年1月时滋味最佳,可为养殖大黄鱼品质改良与滋味提升提供一定基础。

GST-Pi三位点等位基因组合分布与难治性癫痫的相关性

目的:探索谷胱苷肽S-转移酶Pi(GST-Pi)基因3个位点(Ile105Val,Ala114Val,Asp147Tyr)的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNP)的基因组合分布与难治性癫痫的相关性.方法:采用等位基因特异性引物PCR技术对非难治性癫痫组、难治性癫痫组、正常组进行GST-Pi3个位点SNPs的检测.结果:正常组与癫痫组(包括难治性和非难治性两组)3个位点中单个位点的基因型构成在两组间差异均有统计学意义(P<0.0001).从组合基因来分析,两个位点均变异的癫痫组20例(21.74%)高于正常组10例(2.17%),差异有统计学意义(P<0.0001);3个位点均变异的癫痫组68例(78.91%)高于正常组3例(6.52%),非难治性癫痫组41例(83.67%)高于难治性癫痫组27例(62.79%),差异均有统计学意义(P<0.0001).结论:GST-Pi基因变异尤其是多个位点变异的人群易患癫痫,而多个位点变异的患者不易发展成难治性癫痫.

沙虫干呈味及功能性成分研究

对沙虫干抽提物成分的组成进行的研究结果表明 :游离氨基酸含量 w为 10 .3% ,占抽提物含氮物质的 77.9%。抽提物组成中 ,呈甘味的 Gly(3.2 % )、Ala(2 .5% )和呈鲜味的 IMP(0 .2 7% )、Glu(0 .2 5% )、琥珀酸 (0 .35% )等成分同沙虫干独特的风味有关 ,Na+ 、Cl-等无机离子也同其呈味相关。此外 ,牛磺酸含量 w高达 3.2 % ,是富含牛磺酸的一种海洋生物 ;精氨酸的含量 w亦较高 ,为 1.2 %。

补体成分2基因上rs9332739与年龄相关性黄斑变性的相关性研究

目的探讨补体成分2(C2)基因上单核苷酸多态性(SNP)rs9332739与晚期年龄相关性黄斑变性(AMD)的相关性。方法研究对象为上海地区204名晚期AMD患者和352名健康对照组人群,采集静脉血样并用标准酚氯仿法提取DNA;选取补体成分2(C2)基因上SNP rs9332739,采用Taq Man基因分型技术进行该SNP位点基因分型;应用Fisher精确检验、卡方检验和logistic回归检验,分析rs9332739与晚期AMD的相关性。结果 SNP rs9332739的次要等位基因C,在晚期AMD组与对照组比较的比值比(OR)为1.61,P=0.55,无统计学意义;rs9332739基因型(CG/GG/CC)在加性模型和显性模型中,经年龄以及性别校正后,P=0.89,无统计学意义;rs9332739三种基因型在晚期AMD两种表现型干性AMD和湿性AMD的比较中,没有统计学上的显著性差异(P=0.51)。结论 C2基因上SNP位点rs9332739的次要型等位基因C不是中国汉族人群晚期AMD发病的危险因素,基因型与AMD的发病无明显相关性;rs9332739在中国汉族人群中可能不是晚期AMD的主要遗传标记物,需要更大样本量做进一步验证研究。

东亚人群族源推断SNP Panel分析

目的研发东亚人群中具有较高个体识别率及族源分析能力的SNP Panal。方法以耶鲁大学KIDD教授建立的55个SNP Panel和加利福尼亚大学戴维斯分校SELDIN教授建立的128个SNP Panel,共计170个SNP Panel(简称170 SNP Panel)为基础,收集其在东亚人群中的检测数据,计算SNP位点的遗传学参数,结合热图分析结果筛选出适合东亚人群的SNP位点,并检测部分藏族及汉族人群样本,运用STRUCTURE软件、主成分分析、热图分析等方法分析其用于族源推断的可能性。结果筛选出45个SNP组成的Panel(简称45 SNP Panel),其中SNP位点的遗传学参数平均值优于170 SNP Panel,与170 SNP Panel具有相同的族源分析及推断能力。结论在族源推断信息上,45 SNP Panel完全可以替代170 SNP Panel,达到相同的族源分析及推断能力。而在遗传学参数上,在东亚人群中45 SNP Panel优于170 SNP Panel,体现了其潜在的重要法医学应用价值。

不同干燥方式对杏鲍菇滋味成分的影响研究

比较冷冻干燥(freeze drying,FD)、热风干燥(hot air drying,HAD)、中短波红外干燥(short-and medium-wave infrared drying,ID)和微波真空干燥(microwave vacuum drying,MVD)4种干燥方式对杏鲍菇滋味成分的影响。结果表明,与新鲜杏鲍菇相比,干燥对杏鲍菇滋味成分的影响较大。ID处理的杏鲍菇中可溶性糖总含量最高,MVD处理的杏鲍菇中海藻糖含量最高(328.10 mg/g dw);除FD外,HAD、ID及MVD处理的杏鲍菇中5′-腺苷酸(5′-adenosine monophosphate,5′-AMP)、5′-鸟苷酸(5′-guanosine monophosphate,5′-GMP)、5′-肌苷酸(5′-inosine monophosphate,5′-IMP),谷氨酸含量都有所升高,说明温度地升高有助于鲜味物质地生成;此外,4种干燥方式处理的杏鲍菇中有机酸总含量、柠檬酸、琥珀酸含量有所上升;MVD处理的杏鲍菇鲜味浓度最大,味精当量(equivalent umami concentration,EUC)值为302.15 g MSG/100 g,其次是HAD、ID,FD处理的杏鲍菇鲜味浓度低于新鲜杏鲍菇,其EUC值最低。

海产鲜味物质及海产品特征滋味的研究进展

素有"海鲜"之称的海产品,以其味道鲜美而备受人们的喜爱。迄今为止,人类所发现的氨基酸、核苷酸、有机酸三类鲜味物质在海产品中都广泛存在,这是海产品鲜味形成的共同物质基础。然而,不同的海产品又呈现出各具特色的特征滋味,这主要归因于各鲜味物质的不同比例以及多种呈味物质的存在。总结了主要海产鲜味物质的研究概况,综述了贝、鱼、虾、蟹等典型海产品特征滋味及其构成的研究进展。并在此基础上预测了今后海产鲜味物质的研究与开发趋势。

泥鳅(♀)×大鳞副泥鳅(♂)正交F1代肌肉营养成分分析

【目的】为探究属间杂交对泥鳅肌肉品质的改良效果,对4个F1代泥鳅的肌肉营养成分以及滋味特征进行测定与分析。【方法】以泥鳅自交F1代(M)、大鳞副泥鳅自交F1代(P)、大鳞副泥鳅(♀)×泥鳅(♂)反交F1代(PM)为对照组,对泥鳅(♀)×大鳞副泥鳅(♂)正交F1代(MP)新鲜肌肉中的常规营养成分、氨基酸及核苷酸进行测定与评价分析,【结果】(1)MP粗蛋白质含量分别高于PM、P、M 3个,但差异均不显著(P>0.05);MP的粗脂肪含量低于P、M(P>0.05),显著低于PM(P<0.05);(2)在4个F1代泥鳅的肌肉总氨基酸含量中,雌性与雄性个体存在差异,雌性依次为MF(41.15 mg/g)、MPF(54.95 mg/g)、PMF(55.60 mg/g)、PF(59.89 mg/g),雄性依次为MM(48.44 mg/g)、PMM(53.23 mg/g)、MPM(53.95 mg/g)、PM(58.35 mg/g),表明雌性MP组合肌肉总氨基酸含量高于M低于PM、P,雄性MP组合肌肉总氨基酸含量高于M、PM,低于P;(3)结合氨基酸评分AAS和化学评分CS可以看出,每个组合的蛋氨酸(Met)数值皆为最小值,表明蛋氨酸为4个F1代泥鳅的共同第一限制性氨基酸;(4)呈味核苷酸与游离氨基酸TAV结果显示,仅MPM与MPF的赖氨酸(Lys)的TAV大于1,对呈味具有显著贡献。【结论】综上所述,2个属间杂交F1代(MP与PM)的基本营养成分、总氨基酸含量等均处于2个自交F1代的(M与P)中间,MP营养价值、滋味优于M,接近于PM,劣于P,为泥鳅肌肉品质提升策略及其新品种选育可提供参考依据。

贵州省汉族人群类风湿关节炎患者TRAF1/C5基因多态性研究

目的探讨肿瘤坏死因子受体相关因子1（TRAF1）/补体5（C5）单核苷酸多态性与类风湿关节炎（RA）的相关性。方法提取300例RA患者（RA组）和300例健康者DNA（对照组）,实时荧光定量PCR方法检测TRAF1/C5基因rs3761847和rs10818488的单核苷酸多态性。结果 TRAF1/C5存在基因多态性,但RA组与对照组比较基因多态性位点的单倍体基因型和等位基因频率的差异均无统计学意义（P〉0.05）。连锁不平衡分析发现rs3761847与rs10818488之间存在强连锁不平衡。rs3761847位点A等位基因与类风湿因子（RF）阴性（P=0.001,OR=0.57,95%CI：0.41~0.79）,抗CCP抗体（抗-CCP）阴性（P=0.001,OR=0.51,95%CI：0.35~0.76）及抗Sa抗体阴性均相关（P=0.02,OR=0.72,95%CI：0.55~0.94）;rs10818488位点G等位基因仅与RF阳性相关（P=0.01,OR=1.40,95%CI：1.09~1.81）。结论 TRAF1/C5基因多态性可能与贵州汉族人群RA的遗传易感性无关。

香菇柄中5'-核苷酸的酶法提取及组成分析

为了提高香菇柄中5'-核苷酸的提取得率和提高香菇柄的附加值,研究以香菇柄为原料,通过单因素实验研究了纤维素酶加酶量、液固比、酶解温度、酶解时间、pH值对5'-核苷酸得率的影响,并采用正交试验对纤维素酶酶解提取5'-核苷酸工艺进行优化,最后利用高效液相色谱法(HPLC)对提取得到的5'-核苷酸组成进行分析。结果表明,在单因素实验结果基础上,通过正交试验优化,纤维素酶酶解提取香菇柄中5'-核苷酸的优化,工艺参数为:液固比(m L∶g)20∶1,加酶量0.8%,酶解温度40℃,pH值5.4,酶解时间4 h,此时5'-核苷酸得率为4.08 mg·g-1,与HPLC检测结果(4.57 mg·g-1)相近。纤维素酶酶解提取香菇柄5'-核苷酸由5'-鸟苷酸、5'-尿苷酸、5'-胞苷酸、5'-腺苷酸、5'-肌苷酸、5'-黄苷酸组成,其中呈鲜味核苷酸占5'-核苷酸的62.63%。

基于并行独立成分分析方法研究精神分裂症的影像遗传学特征

近年来影像遗传学领域的发展,为精神分裂症的研究开启了新的方向。该文运用并行独立成分分析方法处理63个受试者的fMRI数据和SNP数据,通过在两种数据类型之间增加约束项,提取与精神分裂症相关的独立成分。研究结果显示,一个fMRI成分和一个SNP成分之间的相关性最大,fMRI成分主要包括楔前叶、舌回、楔叶脑区,SNPs主要在CHRNA7和DISC1等基因中。同时,该fMRI成分和SNP成分在精神分裂症患者和对照组的混合系数上有显著差异,P值分别为0.0009和0.0014。该文运用一种分析影像遗传学的新方法,来识别与精神分裂症相关的大脑功能和遗传信息之间的相互关系,为精神分裂症的辅助诊断提供了帮助。

具有遗传性疾病和性状的遗传位点分析

为便于进行数据分析,首先将数据中的位点信息由原来字母编码方式转换为数值编码的方式,根据位点的编码信息和患病信息,采用Logistic回归的方法,找出某种疾病最有可能的一个或几个致病位点,同时采用显著性检验进一步对建立的模型进行检验,证明了建立结果的合理性。此外,通过主成分分析,从原有的300个主成分中取出了225个主成分尽可能多地反映原来基因变量的信息,再通过主成分Logistic回归分析找出与疾病最有可能相关的一个或几个基因。最后,采用典型相关分析找出与相关性状有关联的基因位点。

慢性阻塞性肺疾病患者血维生素D水平及其维生素D结合蛋白基因多态性的相关性研究

目的 探讨湖北地区慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者维生素D水平及其维生素D结合蛋白（GC）基因多态性.方法 对250例受检者（116例吸烟COPD患者和134例健康吸烟者）进行问卷调查,收集相关资料（吸烟史、维生素D摄入、并发症等）;ELISA法检测受试者血清25-羟基维生素D（25-OHD）水平,通过Taqman探针实时荧光定量PCR对GC基因（rs4588位点和rs7041位点）进行分型;并进行肺功能检测.结果 吸烟COPD者25-OHD水平较健康吸烟者低（36.58 nmol/L比43.80 nmol/L,P＜0.001）.25-OHD水平吸烟COPD者第1秒用力呼气容积（FEV1）占预计值百分比≥80％者为39.43 nmol/L,FEV1占预计值百分比＞50％～80％者为35.32 nmol/L,FEV1占预计值百分比＞30％～50％者为32.21 nmol/L,FEV1占预计值百分比＜30％者为26.25 nmol/L（P＜ 0.01）.25-OHD水平与肺功能呈正相关（r2 =1.911,P＜0.000 1）.GC基因rs7041位点的TT型与25-OHD水平和COPD易感性存在关联（P＜0.01;OR =2.140,95％ CI1.157～3.959,P=0.015）.结论 吸烟COPD者易患维生素D缺乏,且COPD气流受限程度与维生素D水平呈负相关.GC基因rs7041位点的TT型与25-OHD水平和COPD易感性密切相关,可能成为COPD易感性筛查的候选突变位点.