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secY和nusA基因在泡桐丛枝植原体亚组分类中的应用
1
作者
张磊
韩翔
+2 位作者
李正男
吴云锋
韩崇选
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2012年第11期91-96,共6页
【目的】利用分子生物学方法分析泡桐丛枝植原体转运蛋白secY基因及转录延伸因子nusA基因,从亚组水平上确定陕西泡桐丛枝植原体的分类地位。【方法】采集陕西杨凌、彬县、旬邑、永寿、周至和宝鸡等6个泡桐栽培区的泡桐丛枝样品,提取病...
【目的】利用分子生物学方法分析泡桐丛枝植原体转运蛋白secY基因及转录延伸因子nusA基因,从亚组水平上确定陕西泡桐丛枝植原体的分类地位。【方法】采集陕西杨凌、彬县、旬邑、永寿、周至和宝鸡等6个泡桐栽培区的泡桐丛枝样品,提取病样总核酸;设计引物对secY-F/R和nusA-F/R,对泡桐丛枝植原体secY、nusA基因进行PCR扩增及核苷酸序列测定与系统发育分析。【结果】获得了泡桐丛枝病植原体secY基因序列的全长,大小为1 358bp,编码414个氨基酸;获得了部分nusA基因序列,大小为946bp,编码315个氨基酸。序列同源性分析结果表明,陕西各县区泡桐丛枝植原体的secY、nusA基因序列均一致。一致性分析和系统发育分析表明,陕西泡桐丛枝植原体与台湾泡桐丛枝植原体的亲缘关系最近,secY、nusA基因序列的同源性分别为99.9%和99.6%。【结论】首次报道了泡桐丛枝植原体转运蛋白secY基因及转录延伸因子nusA基因的序列,并以其作为分类标准,将陕西泡桐丛枝植原体归属到16SrⅠ-D亚组。
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关键词
泡桐丛枝植原体
secY基因
nusa
基因
序列分析
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题名
secY和nusA基因在泡桐丛枝植原体亚组分类中的应用
1
作者
张磊
韩翔
李正男
吴云锋
韩崇选
机构
西北农林科技大学林学院
西北农林科技大学理学院
西北农林科技大学植物保护学院
出处
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2012年第11期91-96,共6页
基金
林业公益性行业科研专项(201004003-4)
教育部长江学者和创新团队发展计划项目
文摘
【目的】利用分子生物学方法分析泡桐丛枝植原体转运蛋白secY基因及转录延伸因子nusA基因,从亚组水平上确定陕西泡桐丛枝植原体的分类地位。【方法】采集陕西杨凌、彬县、旬邑、永寿、周至和宝鸡等6个泡桐栽培区的泡桐丛枝样品,提取病样总核酸;设计引物对secY-F/R和nusA-F/R,对泡桐丛枝植原体secY、nusA基因进行PCR扩增及核苷酸序列测定与系统发育分析。【结果】获得了泡桐丛枝病植原体secY基因序列的全长,大小为1 358bp,编码414个氨基酸;获得了部分nusA基因序列,大小为946bp,编码315个氨基酸。序列同源性分析结果表明,陕西各县区泡桐丛枝植原体的secY、nusA基因序列均一致。一致性分析和系统发育分析表明,陕西泡桐丛枝植原体与台湾泡桐丛枝植原体的亲缘关系最近,secY、nusA基因序列的同源性分别为99.9%和99.6%。【结论】首次报道了泡桐丛枝植原体转运蛋白secY基因及转录延伸因子nusA基因的序列,并以其作为分类标准,将陕西泡桐丛枝植原体归属到16SrⅠ-D亚组。
关键词
泡桐丛枝植原体
secY基因
nusa
基因
序列分析
Keywords
paulownia witches'broom phytoplasma
secY
gene
nusa gene
sequence analysis
分类号
S432.42 [农业科学—植物病理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
secY和nusA基因在泡桐丛枝植原体亚组分类中的应用
张磊
韩翔
李正男
吴云锋
韩崇选
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》
CSCD
北大核心
2012
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