黑麦重复家族成员pAW161(348 bp)的DNA序列分析

黑麦亚端部特异序列pAW161是黑麦350-480bp重复家族的一个成员。通过pAW161设计的特异引物获得的PCR扩增片段，已成功用于小麦外源转移材料的鉴定。在本研究中，用该引物从供试的分属4个种共7份黑麦材料中都扩增出一条清楚明亮的特异带纹，分别对扩增片段回收、克隆、测序。结果表明，它们的长度都为348bp，该序列简称为pAW161（348bp）。不同黑麦比较发现，该序列高度保守，同源性达到99．39％，可作为黑麦的亚端部特异序列pAW161的分子标记。该序列存在着6个SNP位点，都位于此序列的3’端的156bp序列中，而5’端的192bp的序列无变异；SNP变化在供试材料中不存在物种特异性。从结构上看，pAW161（348bp）是重复家族pSc200的380bp基本重复单元的两个头-尾串联重复序列的中间一段。