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萘降解质粒pND6-1中萘趋化基因nahY的克隆和核苷酸序列分析 被引量:5
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作者 蔡宝立 刘斌 +1 位作者 马琳 王学刚 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 2002年第6期662-665,共4页
假单胞菌 (Pseudomonas)ND6菌株的萘降解基因位于 10 2kb的质粒 pND6 1上 .以pUC18质粒为载体 ,制备了含有 1.5~ 3 .0kbpND6 1DNA随机片段的基因文库 .通过DNA测序和DNA序列的同源性分析 ,从基因文库中筛选出含有萘趋化基因nahY的克... 假单胞菌 (Pseudomonas)ND6菌株的萘降解基因位于 10 2kb的质粒 pND6 1上 .以pUC18质粒为载体 ,制备了含有 1.5~ 3 .0kbpND6 1DNA随机片段的基因文库 .通过DNA测序和DNA序列的同源性分析 ,从基因文库中筛选出含有萘趋化基因nahY的克隆 .nahY基因的大小为 16 17bp ,编码的萘趋化蛋白由 5 38个氨基酸组成 ,与假单胞菌G7菌株的nahY基因相比 ,核苷酸序列的同源性是 96 .7% ,编码的氨基酸序列的同源性是 95 % .图 4参 展开更多
关键词 萘降解质粒 pnd6-1 萘趋化基因 nahY 克隆 核苷酸序列分析 同源性分析 假单胞菌
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用实时定量PCR方法测定萘降解质粒pND6-1的拷贝数 被引量:1
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作者 李珊珊 李霞 +1 位作者 赵化冰 蔡宝立 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期109-112,共4页
Pseudomonas putida ND6是一个高效降解萘的菌株,含有101 858 bp的萘降解质粒pND6-1.用实时定量PCR方法测定了Pseudomonas putida ND6菌株中pND6-1的拷贝数为2.这是第一个测定分子大小超过100 kb的细菌大质粒拷贝数的报道.
关键词 PSEUDOMONAS PUTIDA ND6 pnd6-1 实时定量PCR 质粒拷贝数
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A novel salicylaldehyde dehydrogenase-NahV involved in catabolism of naphthalene from Pseudomonas putida ND6 被引量:2
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作者 ZHAO HuaBing LI YongJun +1 位作者 CHEN Wei CAI BaoLi 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2007年第14期1942-1948,共7页
A novel salicylaldehyde dehydrogenase involved in catabolism of naphthalene from Pseudomonas putida ND6, NahV, has been identified. NahV exhibited lower identity in amino acid sequence with the classic salicylaldehyde... A novel salicylaldehyde dehydrogenase involved in catabolism of naphthalene from Pseudomonas putida ND6, NahV, has been identified. NahV exhibited lower identity in amino acid sequence with the classic salicylaldehyde dehydrogenase, NahF, from P. putida ND6. This is the first report of an isofunctional enzyme of bacterial salicylaldehyde dehydrogenase. Comparison of Km and Vmax values of NahV and NahF demonstrated that NahF has a more efficient catalytic reaction than NahV, while NahV has much higher affinity for salicylaldehyde and NAD+. Both enzymes exhibited broad substrate speci- ficities and catalyzed the oxidation of salicylaldehyde, 5-chlorosalicylaldehyde, formaldehyde, m-nitrobenzaldehyde, o-nitrobenzaldehyde, o-methoxybenxaldehyde, glutaraldehyde, caprylic aldehyde, and glyoxal. However, the relative rates at which the substituted analogs are transformed differ considerably. NahV activity could be enhanced by Fe2+, Cu2+ and Zn2+; whereas NahF activity could only be stimulated by Fe2+. NahF is more stable than NahV at elevated temperatures. Dot-blot hybridization analyses showed that nahF-like genes occurred in all naphthalene-degradation bacteria isolated in this study, whereas nahV-like genes were present in only some naphthalene-degrading bacteria. 展开更多
关键词 水杨醛 异化作用 分解代谢 假单胞菌
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恶臭假单胞菌ND6菌株中与萘降解相关的新型水杨醛脱氢酶NahV
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作者 赵化冰 李永君 +1 位作者 陈威 蔡宝立 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第11期1257-1262,共6页
在大肠杆菌中表达了Pseudomonas putida ND6菌株中与萘降解有关的水杨醛脱氢酶同工酶NahV,并对其酶学性质进行了研究.结果表明,NahV与ND6菌株中经典的水杨醛脱氢酶NahF的氨基酸序列同源性较低,是一种新的水杨醛脱氢酶.对NahV和NahF的酶... 在大肠杆菌中表达了Pseudomonas putida ND6菌株中与萘降解有关的水杨醛脱氢酶同工酶NahV,并对其酶学性质进行了研究.结果表明,NahV与ND6菌株中经典的水杨醛脱氢酶NahF的氨基酸序列同源性较低,是一种新的水杨醛脱氢酶.对NahV和NahF的酶动力学研究结果表明,NahF具有更高的催化效率,而NahV对水杨醛和NAD+的亲和力更强.ND6菌株的NahV和NahF都有较宽的底物范围,可以催化水杨醛、5-氯水杨醛、甲醛、间硝基苯甲醛、邻硝基苯甲醛、邻甲氧基苯甲醛、戊二醛、辛醛和乙二醛的脱氢反应,但对不同底物的催化效率不同.Fe2+,Cu2+和Zn2+对NahV有激活作用,而NahF只能被Fe2+激活.NahF具有更好的热稳定性,在50℃保温30min仍有72.8%的酶活力,而NahV则丧失了88.8%的酶活力.DNA斑点杂交结果表明,类nahF基因在本研究检测的两种来源的萘降解细菌中都存在,而类nahV基因只存在于一种来源的萘降解细菌中. 展开更多
关键词 PSEUDOMONAS PUTIDA ND6萘降解质粒 pnd6-1 水杨醛脱氢酶 NahV DNA杂交
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