湖南省不同宿主犬弓首蛔虫线粒体pcox1和pnad1基因序列遗传变异的研究

为探究湖南省不同宿主来源犬弓首蛔虫的种内遗传变异情况,本研究利用PCR法对14株分离自湖南省部分地区不同宿主(犬和狼)源犬弓首蛔虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位I(nad1)基因部分序列(pnad1)进行PCR扩增与测序,分析该两个序列的同源性,并用pcox1和pnad1基因序列分别构建不同宿主源犬弓首蛔虫与其他蛔虫的种系发育树。结果显示,本研究获得的犬和狼源弓首蛔虫分离株pcox1和pnad1基因序列大小分别为442 bp和527 bp,其种内遗传变异率分别为0~1.7%和0.2%~2.2%,与已知不同宿主源(犬、人、狐狸等)弓首蛔虫分离株对应核苷酸序列同源性分别为94.6%~99.5%(pcox1)和98.4%~99.2%(pnad1);检测到二者的单倍型分别为13个和12个,单倍型多样性分别为0.989和0.967,核苷酸多样性分别为0.01675和0.00509。基于两种基因构建系统发育树的分析结果一致,本研究获得的14个不同宿主来源犬弓首蛔虫分离株与GenBank已有犬弓首蛔虫分离株位于同一分支,与猫弓首蛔虫和马来西亚弓首蛔虫分离株距离较近,与其他蛔虫所属分支距离较远。本研究结果表明,不同宿主源犬弓首蛔虫湖南分离株遗传变异程度较低,且pcox1基因较pnad1基因序列更适合作为犬弓首蛔虫分离株遗传变异研究的分子标记。本研究为不同宿主源弓首蛔虫的分子流行病学调查及种群遗传学研究奠定了基础。

基于cox1基因的棕熊锡兰钩虫分子鉴定与种系发育分析

本次研究旨在利用线粒体细胞色素I(cox1)部分基因(pcox1)对长沙市动物园棕熊粪便分离的钩虫进行种类鉴定,并分析其基因多态性。用PCR技术扩增从棕熊粪便分离的钩虫长沙分离株的pcox1基因,并对其基因序列进行分析。结果显示7条钩虫分离株的pcox1序列片段大小均为423 bp,种内遗传差异为0.0%~0.5%,与GenBank中收录的锡兰钩虫(Ancylostoma ceylanicum)分离株同源性为93.8%~94.8%,与其他钩虫(犬钩虫、巴西钩虫、十二指肠钩虫、猫钩虫和美洲钩虫等)序列相似性低于88.7%;系统发育分析显示,本次研究获得的棕熊钩虫分离株与已知锡兰钩虫聚为一支,与其他钩虫相隔较远。结果表明,长沙市动物园棕熊粪便分离的钩虫为锡兰钩虫,线粒体pcox1基因在锡兰钩虫种内相对保守,与其他钩虫种类序列差异较大,可以作为熊锡兰钩虫分子鉴定及遗传变异研究。

湖南省怀化地区山羊胰阔盘吸虫线粒体pcox1基因和核糖体18S rRNA基因序列遗传变异研究

目的了解湖南省怀化地区山羊体内分离的胰阔盘吸虫遗传变异情况。方法应用PCR技术对分离自湖南怀化地区山羊体内的18株胰阔盘吸虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶亚基I基因部分序列(pcox1)和核糖体18S rRNA基因进行扩增,对扩增产物进行测序并进行遗传变异和系统发育分析。结果分离自湖南怀化地区山羊体内的18株胰阔盘吸虫分离株pcox1和18S rRNA基因序列长度分别为430 bp和1 857 bp,分别存在14个和35个变异位点,种内遗传差异分别为0~1.4%和0~0.8%;与GenBank数据库中收录的胰阔盘吸虫中国株基因序列同源性最高,分别为99.0%~99.8%和99.5%~99.8%。基于两种基因构建的系统发育树分析结果一致,本研究获得的18株胰阔盘吸虫分离株与GenBank数据库中已知胰阔盘吸虫分离株聚为同一分支,与支睾阔盘吸虫等阔盘属吸虫相隔较近,与其他吸虫所属分支相隔较远。结论湖南省怀化地区山羊源胰阔盘吸虫分离株遗传变异度较低,线粒体pcox1基因和核糖体18S rRNA基因均适合作为羊源胰阔盘吸虫遗传变异研究的分子标记。

云南宾川地区牛羊片形吸虫感染调查及分子鉴定

目的对云南宾川地区爆发人体片形吸虫病的村落进行牛羊的片形吸虫感染调查和检测,为当地片形吸虫病的研究提供数据。方法采用尼龙袋集卵法收集牛羊粪便中的虫卵,进行镜检。对检出的样本进行PCR扩增和测序;用MP法、NJ法及ML法进行种系发育分析。结果从134(28.63%)头牛和27(25.23%)头羊中查到了片形吸虫的虫卵,对所检到的虫卵进行线粒体pcox1基因的扩增和测序,比对后发现所检样本主要为肝片吸虫和大片吸虫两个种。采用MP法、NJ法及ML法进行种系发育分析表明,宾川地区牛羊感染的片形吸虫虫种主要为肝片吸虫和大片吸虫两种。结论宾川地区牛羊片形吸虫感染严重,云南宾川为肝片形吸虫及大片形吸虫混合感染地区,当地政府应重视该病的防治。