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SPP1、DEC1、C1QTNF6蛋白与口腔鳞状细胞癌患者临床病理指标及预后的关系
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作者 付勇青 徐三会 +1 位作者 赵岩 王丽丽 《癌变.畸变.突变》 CAS 2024年第2期107-111,117,共6页
目的:探讨口腔鳞状细胞癌患者血清重组人分泌型磷蛋白1(SPP1)、软骨分化的表达基因1(DEC1)和补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白6(C1QTNF6)的表达水平与其临床病理指标及预后的关系。方法:免疫组织化学染色法和电化学发光免疫分析法检测88例... 目的:探讨口腔鳞状细胞癌患者血清重组人分泌型磷蛋白1(SPP1)、软骨分化的表达基因1(DEC1)和补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白6(C1QTNF6)的表达水平与其临床病理指标及预后的关系。方法:免疫组织化学染色法和电化学发光免疫分析法检测88例口腔鳞状细胞癌患者癌组织和血清中SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白的表达水平;Pearson相关性分析和Kaplan-Meier生存分析法分析患者血清SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白表达水平与其临床病理指标的相关性和对患者预后的影响。多因素Cox回归法分析影响口腔鳞状细胞癌患者预后的危险因素。结果:免疫组织化学染色结果显示口腔鳞状细胞癌患者癌组织中SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白的阳性表达率较癌旁组织分别增加了1.94、2.98和2.35倍(P<0.05或P<0.01);电化学发光免疫分析法结果显示口腔鳞状细胞癌患者血清SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白表达水平较正常人分别上调了8.61、6.20和4.03倍(P<0.05或P<0.01);Pearson相关性分析结果显示患者血清SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白表达水平与患者发生多灶嗜神经侵犯、肿瘤浸润程度、淋巴结转移、较高的TNM分期呈正相关(P<0.05);Kaplan-Meier生存分析结果显示,血清SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白高表达水平的口腔鳞状细胞癌患者总生存率低;多因素Cox回归分析结果表明多灶嗜神经侵犯、肿瘤高浸润度、淋巴结转移和高的TNM分期是影响预后的危险因素(P<0.05)。结论:口腔鳞状细胞癌患者癌组织和血清中SPP1、DEC1和C1QTNF6蛋白表达水平升高,且与患者发生多灶嗜神经侵犯、肿瘤浸润和淋巴结转移、较高的TNM分期呈正相关,而与患者预后呈负相关。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 重组人分泌型磷蛋白1 软骨分化的表达基因1 补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白6 预后
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不同基因突变的急性髓系白血病患者的疗效及预后研究进展 被引量:4
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作者 刘洋 刘述川 《现代肿瘤医学》 CAS 北大核心 2023年第22期4284-4289,共6页
急性髓系白血病(AML)是一组起源于造血干细胞的血液系统恶性肿瘤。近年来细胞遗传学改变被认为是AML患者重要的独立预后因素。FLT3、NPM1、RUNX1及WT1基因突变已成为重要的危险分层评价指标。其中FLT3-ITD突变可导致白血病细胞增殖失控... 急性髓系白血病(AML)是一组起源于造血干细胞的血液系统恶性肿瘤。近年来细胞遗传学改变被认为是AML患者重要的独立预后因素。FLT3、NPM1、RUNX1及WT1基因突变已成为重要的危险分层评价指标。其中FLT3-ITD突变可导致白血病细胞增殖失控,是独立预后不良因素。NPM1突变预示着更好的预后,可考虑选择全反式维甲酸和砷剂联合治疗、抗CD33单抗、放线菌素等治疗。RUNX1基因突变是近年来在髓系肿瘤中发现的热点突变,在初发核型正常AML中频发,与短的总体生存时间及不成熟的细胞形态有关,被认为是维持AML生存所必需的肿瘤抑制因子。WT1基因为调节造血和凋亡的肿瘤抑制基因,表达高低可能与临床缓解和复发有关,可作为潜在的预后因素和特异性免疫治疗的新靶点。复发时用定量PCR方法检测NPM1突变较WT1更具优势。本文就以上分子标志作一综述。旨在寻找潜在的基因靶点,为开发精准治疗AML的新型基因靶向药物提供参考。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 FMS样酪氨酸激酶3基因 核磷蛋白基因 Runt相关转录因子基因 Wilms肿瘤1基因
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基于生物信息学分析SPP2在肝癌发生过程中的作用
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作者 彭红华 刘杨 宋泽文 《中南大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期1779-1792,共14页
目的:分期一致的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者其预后可能不同,其分子生物学机制仍不明确。本研究旨在鉴定影响肝癌预后的关键核心基因。方法:在TCGA-LIHC和GSE14520数据集中,对HCC样本与正常样本、总生存期(overall surv... 目的:分期一致的肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者其预后可能不同,其分子生物学机制仍不明确。本研究旨在鉴定影响肝癌预后的关键核心基因。方法:在TCGA-LIHC和GSE14520数据集中,对HCC样本与正常样本、总生存期(overall survival,OS)长与OS短的患者进行差异表达基因分析。采用Kaplan-Meier法结合log-rank检验评价分泌型磷蛋白2(secreted phosphoprotein 2,SPP2)在HCC患者预后中的作用;基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)了解SPP2分层的HCC亚组间富集信号通路的差异;基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析预测SPP2可能参与的信号分子通路。结果:与正常组织相比,肿瘤组织中分泌的SPP2明显下调,且与长OS相比,短OS肿瘤样本中分泌的SPP2明显下调[表达倍数>2和伪发现率(false discovery rate,FDR)<0.05]。SPP2低表达与较差的临床病理特征相关,如血管侵犯(P=1.6e-05)、较差的肿瘤状态(合并肿瘤)(P=0.021)、较晚期的T期(T3或T4期)(P=4.5e-04)、较晚期的TNM期(Ⅲ 或Ⅳ期)(P=3.1e-04)、较差的预后(较短的生存期)(P=0.002)。基因富集分析表明SPP2可能参与了HCC的代谢稳态以及肝纤维化和肝硬化的发生、发展。结论:SPP2可能抑制肝纤维化和肝硬化的发展以及HCC的肿瘤发生,且SPP2类似物可能是预防肝硬化和肝细胞癌发生的潜在药物。 展开更多
关键词 分泌型磷蛋白2 肝细胞癌 基因集富集分析 肿瘤发生
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泛癌组织STIP1的表达与肿瘤免疫浸润及预后相关:基于生物信息学方法
4
作者 关深元 沈智勇 +2 位作者 林名岛 邓海军 方媛 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1179-1193,共15页
目的本研究旨在对压力诱导磷酸蛋白1(STIP1)进行泛癌分析,探讨其表达水平与肿瘤预后的关系及其在免疫学中的作用。方法使用生物信息学方法分析TCGA、TARGET和GTEx数据库,研究STIP1在各种类型肿瘤组织中的表达及预后价值;采用免疫组化检... 目的本研究旨在对压力诱导磷酸蛋白1(STIP1)进行泛癌分析,探讨其表达水平与肿瘤预后的关系及其在免疫学中的作用。方法使用生物信息学方法分析TCGA、TARGET和GTEx数据库,研究STIP1在各种类型肿瘤组织中的表达及预后价值;采用免疫组化检测STIP1在10例配对结直肠癌组织以及正常组织中的表达情况;STIP1与肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定(MSI)的关系进一步被揭示;使用MCPcounter、TIMER分析STIP1的表达与免疫细胞的浸润情况;分析STIP1与免疫调节因子的相关性;根据各肿瘤中STIP1的最优截断值,将样本分为高低表达组;使用蛋白互作网络分析鉴定与STIP1相关的蛋白;通过功能富集分析寻找STIP1可能参与的调节通路。结果与正常组织相比,STIP1在大多数肿瘤中高表达(P<0.05),以及免疫组化的结果显示其在结直肠癌组织中高表达。STIP1的表达水平与多种类型肿瘤的临床分期相关(P<0.05)。在部分肿瘤中,STIP1的表达上调与肿瘤患者的不良预后(总体生存期、疾病特异性生存期、无病生存期和无进展生存期)显著相关(P<0.05)。STIP1表达与多种肿瘤的肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、免疫浸润以及免疫调节相关因子显著相关(P<0.05)。蛋白互作网络分析提示STIP1相关的蛋白有热休克蛋白A家族成员4、热休克蛋白A家族成员8、热休克蛋白90α家族A类成员1等。KEGG富集分析提示在肝癌组织中STIP1高表达可能与戊酸盐代谢、色氨酸代谢、丁酸盐代谢等通路有关;HALLMARK富集分析提示在肝癌组织中STIP1高表达可能与胆汁酸代谢、脂肪酸代谢等有关。结论STIP1在多数肿瘤中表达上调,STIP1与部分肿瘤的临床分期、不良预后、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、免疫细胞浸润以及免疫调节因子相关。 展开更多
关键词 STIP1 压力诱导磷酸蛋白1 免疫调节因子 泛癌分析
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番鸭源禽1型副粘病毒PX2/03株P基因的克隆及原核表达 被引量:4
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作者 傅光华 程龙飞 +2 位作者 施少华 彭春香 黄瑜 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第6期599-603,共5页
根据GenBank中水禽源1型副粘病毒(ZJ1)P基因序列设计2对引物,运用RT-PCR技术从1株雏番鸭源禽1型副粘病毒(PX2/03)的基因组中扩增出P全基因的cDNA.测序结果表明,P基因全长1441 nt,包含1个完整的开放阅读框架,编码395个氨基酸.与GenBank... 根据GenBank中水禽源1型副粘病毒(ZJ1)P基因序列设计2对引物,运用RT-PCR技术从1株雏番鸭源禽1型副粘病毒(PX2/03)的基因组中扩增出P全基因的cDNA.测序结果表明,P基因全长1441 nt,包含1个完整的开放阅读框架,编码395个氨基酸.与GenBank中已发表的P基因比对发现,该基因与近年来分离的鹅源禽1型副粘病毒分离株的亲缘关系很近.以分别含BamHⅠ、XhoⅠ的1对引物对该目的基因进行亚克隆后插入到pET32 a原核表达载体中,构建了pETP原核重组载体,将该重组载体转化入BL21(DE3)后,成功诱导表达了分子质量大小约为62 ku的P融合蛋白,经W estern b lotting检测证实表达产物具有免疫活性. 展开更多
关键词 禽1型副粘病毒 番鸭 P基因 克隆 原核表达
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我国分离的10株狂犬病病毒P和M蛋白基因序列分析 被引量:2
6
作者 解庭波 黄思佳 +3 位作者 明平刚 吴杰 徐葛林 严家新 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第3期226-229,236,共5页
目的探讨我国狂犬病病毒P、M蛋白基因序列的结构特点及变异情况。方法用RT-PCR方法从分离的10株具有代表性的狂犬病病毒中获得目的基因片段,测定核苷酸序列后,利用生物信息学软件分析核苷酸、氨基酸序列及其相关的功能位点并构建P、M蛋... 目的探讨我国狂犬病病毒P、M蛋白基因序列的结构特点及变异情况。方法用RT-PCR方法从分离的10株具有代表性的狂犬病病毒中获得目的基因片段,测定核苷酸序列后,利用生物信息学软件分析核苷酸、氨基酸序列及其相关的功能位点并构建P、M蛋白基因的系统发育树。结果 10株病毒P和M基因核苷酸序列同源性分别为85.9%~99.4%和89.5%~99.5%,推导出的氨基酸同源性分别为92.3%~100%和96.0%~99.5%。在核苷酸及氨基酸水平上,10株病毒与我国分离的街毒株HN10及CTN疫苗株的P、M基因同源性均明显高于国外其它疫苗株、标准攻击毒CVS株相应的同源性。系统发育分析表明,10株病毒与我国湖南街毒株、CTN疫苗株进化关系最近,而与研究中选取的其他毒株进化关系较远。氨基酸对位分析表明,与其它基因1型毒株相比,本研究中10株狂犬病病毒的P、M基因出现多处变异,但很少在功能区发生变异。结论分离的10株病毒属基因l型狂犬病病毒,与我国分离的街毒株及CTN疫苗株关系较近。 展开更多
关键词 狂犬病病毒 遗传特征 P基因 M基因
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人巨细胞病毒pp65基因疫苗的研制 被引量:3
7
作者 卜笑松 唐久来 +1 位作者 吴德 许晓燕 《实用儿科临床杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第10期740-742,共3页
目的探讨人巨细胞病毒(HCMV)基因疫苗的研制及其预防和治疗HCMV原发和再发感染的效果。方法应用聚合酶链式反应(PCR)扩增HCMVpp65基因全长、巨细胞病毒(CMV)启动子的上下游序列,转化至质粒并载体,测序;合成分泌肽基因,构建自制的含CMV... 目的探讨人巨细胞病毒(HCMV)基因疫苗的研制及其预防和治疗HCMV原发和再发感染的效果。方法应用聚合酶链式反应(PCR)扩增HCMVpp65基因全长、巨细胞病毒(CMV)启动子的上下游序列,转化至质粒并载体,测序;合成分泌肽基因,构建自制的含CMV启动子、pp65基因和分泌肽基因的pcDNA5.0转染载体,即HCMVpp65基因疫苗。将该载体疫苗通过脂质转染法转至中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,Western点杂交检测CHO细胞上清中pp65蛋白。结果克隆pp65基因全长测序结果与HCMVAD169株上的pp65标准序列比较:一致性为99.99%。构建了含有分泌肽、CMV启动子(含有增强子和内含子)和pp65全长pcDNA5.0的转染载体,即HCMV基因疫苗。转染至CHO细胞,其上清培养提取物Western点杂交阳性。结论含有分泌肽、CMV启动子和pp65cDNA的pcDNA5.0真核载体即粗制的HCMV基因疫苗可成功构建。 展开更多
关键词 人巨细胞病毒 PP65 基因疫苗 克隆 表达
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基于基因芯片的前列腺癌转移高表达基因SPP1的生物信息学分析 被引量:3
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作者 李铁求 滕伊漓 +3 位作者 邹亚光 杨宇 李琦 毛向明 《中华男科学杂志》 CAS CSCD 2014年第11期984-990,共7页
目的:利用生物信息学方法分析前列腺癌转移高表达基因SPP1以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:在公共基因芯片数据库(GEO)中下载前列腺癌转移相关基因芯片数据,利用BRB-Array Tools软件、protp... 目的:利用生物信息学方法分析前列腺癌转移高表达基因SPP1以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:在公共基因芯片数据库(GEO)中下载前列腺癌转移相关基因芯片数据,利用BRB-Array Tools软件、protparam、Motif Scan、Signal P4.0、TMHMM、Net Phos2.0、Predict Protein、GO、KEGG、STRING等生物信息学工具进行数据挖掘及生物信息学分析。结果:共筛选出前列腺癌转移共同差异基因73个,表达上调21个,表达下调52个(P<0.01),其中对前列腺癌转移高表达基因SPP1进行生物信息学分析发现,SPP1蛋白由314个氨基酸组成,该蛋白含有2个N-连接糖基化位点、8个酪蛋白激酶II磷酸化位点、3个PKC磷酸化位点,主要参与细胞外基质结合、骨化、成骨细胞分化、细胞黏附、PI3K-Akt信号通路、黏着斑、ECM受体相互作用、Toll样受体信号通路等分子功能和信号通路。结论:利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息,SPP1可能在前列腺癌转移中发挥重要作用,有望成为前列腺癌转移的早期诊断标志物和治疗的新靶点。 展开更多
关键词 SPP1基因 生物信息学 前列腺癌 转移相关基因 基因芯片
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PPP4R1基因与肿瘤相关性的生物信息学预测及在胃癌组织中的初步验证 被引量:1
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作者 徐兴兴 常文军 +5 位作者 翟羽佳 林丽萍 刘小康 马立业 张宏伟 曹广文 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期275-278,共4页
目的:应用生物信息学分析方法预测基因PPP4R1与胃癌发生和转移的关系,并采用RT-PCR进行验证。方法:利用基因功能模块原理,通过IntNetDB找到基因PPP4R1的伙伴基因,应用CFinder工具找其社团基因,Chilibot在线工具分析社团基因与肿瘤的关系... 目的:应用生物信息学分析方法预测基因PPP4R1与胃癌发生和转移的关系,并采用RT-PCR进行验证。方法:利用基因功能模块原理,通过IntNetDB找到基因PPP4R1的伙伴基因,应用CFinder工具找其社团基因,Chilibot在线工具分析社团基因与肿瘤的关系,继而推测PPP4R1与胃癌的联系。采用RT-PCR法检测18对分别来自同一患者的转移和原位肿瘤组织、12对分别来自同一患者的原位肿瘤和癌旁正常组织PPP4R1基因表达,对上述生物信息学分析的结果进行验证。结果:生物学分析结果表明,PPP4R1的社团基因有CTDSP2、PPP2R5E、CTDP1、CTDSP1、FLJ22405、MTMR4、PPP1CA、PPP1CB、PPP1CC、PPP2R2A、PPP2R5A、PPP2R5C、PPP3CC,其中与癌相关的基因有9个,与癌及转移相关的基因有2个。PCR验证结果表明:18例原位胃癌组织中有15例基因PPP4R1表达高于其对应的转移组织(P<0.01);12例正常组织有9例高于其对应的癌组织(P<0.01)。结论:基因PPP4R1可能与胃癌的发生和转移相关;生物信息学可能成为研究基因功能快速而有效的新方法。 展开更多
关键词 胃肿瘤 生物信息学 功能基因组学 磷蛋白磷酸酶 PPP4R1基因
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VASP在结肠癌组织中的表达及其对预后的影响 被引量:3
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作者 宋胜江 孙利敏 +1 位作者 徐定银 陈震 《实用肿瘤杂志》 CAS 2016年第1期48-52,共5页
目的探讨血管扩张刺激磷蛋白(vasodilator stimulated phosphoprotein,VASP)在结肠癌中的表达及对预后的影响。方法收集手术切除的60例结肠癌组织及对应癌旁组织,采用免疫组织化学法检测VASP蛋白的表达情况。随访3年,采用χ2检验分析V... 目的探讨血管扩张刺激磷蛋白(vasodilator stimulated phosphoprotein,VASP)在结肠癌中的表达及对预后的影响。方法收集手术切除的60例结肠癌组织及对应癌旁组织,采用免疫组织化学法检测VASP蛋白的表达情况。随访3年,采用χ2检验分析VASP蛋白与临床病理资料间的相关性,Kaplan-Meier生存曲线分析VASP蛋白表达对患者预后的影响。结果 VASP在结肠癌组织中表达水平高于对应癌旁组织(P〈0.05)。结肠癌组织中VASP蛋白阳性表达与肿瘤直径增大(≥5 cm)、淋巴结转移及高TNM分期(Ⅲ~Ⅳ期)呈正相关(均P〈0.05)。VASP蛋白阳性表达的患者3年总生存率及无瘤生存率均低于VASP蛋白表达阴性患者(均P〈0.05)。Cox多因素回归分析证实,VASP阳性表达是结肠癌患者不良预后的独立危险因素之一(P〈0.05)。结论 VASP在结肠癌组织中表达上调,高水平VASP蛋白表达与肿瘤恶性临床病理特征及不良预后有关,VASP可能成为结肠癌患者诊断和预后评价的有效分子标志物。 展开更多
关键词 结肠肿瘤/病理学 磷蛋白类/代谢 淋巴转移 基因表达 预后 免疫组织化学
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11株新城疫病毒广西分离株P基因的克隆和序列分析 被引量:1
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作者 刘加波 谢芝勋 +3 位作者 唐小飞 庞耀珊 邓显文 谢志勤 《畜牧与兽医》 北大核心 2007年第8期16-19,共4页
根据基因库的新城疫病毒(NDV)的磷蛋白(P)基因序列设计了1对特异性引物,应用RT-PCR技术对11个NDV广西分离株的P基因进行RT-PCR扩增和序列测定,P基因阅读框的核苷酸序列全长均为1188bp,编码395个氨基酸。核苷酸及氨基酸全序列比较分析,... 根据基因库的新城疫病毒(NDV)的磷蛋白(P)基因序列设计了1对特异性引物,应用RT-PCR技术对11个NDV广西分离株的P基因进行RT-PCR扩增和序列测定,P基因阅读框的核苷酸序列全长均为1188bp,编码395个氨基酸。核苷酸及氨基酸全序列比较分析,结果表明:11个NDV广西分离株与10个参考株的核苷酸序列同源性为81.2%~97.8%,氨基酸同源性为78.8%~97.0%。 展开更多
关键词 新城疫病毒 磷蛋白(P)基因 克隆 序列分析
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慢病毒介导的GOLPH3基因沉默对人胃癌SGC-7901细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响 被引量:2
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作者 苏婷 赖铭裕 农云翠 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期815-819,共5页
目的:通过体外实验探讨沉默高尔基体磷蛋白3(Golgi phosphoprotein 3,GOLPH3)基因对胃癌SGC-7901细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响。方法:将携带GOLPH3 shRNA的慢病毒载体转染SGC-7901细胞,建立稳定沉默GOLPH3的细胞株LV-GOLPH3-RNAi,分... 目的:通过体外实验探讨沉默高尔基体磷蛋白3(Golgi phosphoprotein 3,GOLPH3)基因对胃癌SGC-7901细胞增殖、侵袭和迁移能力的影响。方法:将携带GOLPH3 shRNA的慢病毒载体转染SGC-7901细胞,建立稳定沉默GOLPH3的细胞株LV-GOLPH3-RNAi,分别用实时荧光定量PCR和Western blotting技术检测GOLPH3mRNA和蛋白的表达。MTT法检测细胞增殖力,Transwell迁移和侵袭实验分别检测细胞的迁移力和侵袭力。结果:稳定沉默GOLPH3的细胞株构建成功;GOLPH3 mRNA和蛋白表达水平明显降低(P<0.05)。与scrambled组和空白对照组相比,转染后LV-GOLPH3-RNAi组细胞的增殖力受到抑制(P<0.05),迁移力(56.7±1.5 vs 186.0±3.4、183.3±4.2,P<0.05)和侵袭力(33.5±3.0 vs 85.0±3.9、83.1±4.4,P<0.05)也明显受到抑制。结论:沉默GOLPH3基因的表达可抑制人胃癌SGC-7901细胞的增殖力、迁移力和侵袭力,提示GOLPH3有可能成为潜在的肿瘤标志物和独立的预后因子。 展开更多
关键词 SGC-7901细胞 高尔基磷蛋白3 基因沉默 肿瘤侵袭 肿瘤转移
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STIP1基因沉默对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响 被引量:1
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作者 朱鹏 刘琮 +4 位作者 李博 赵晨 周涛 周鹏飞 张兵 《南昌大学学报(医学版)》 CAS 2020年第1期17-21,共5页
目的探讨磷酸化应激诱导蛋白1基因沉默(si-STIP1)对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法体外培养人成骨细胞(hFOB1.19细胞)和人骨肉瘤细胞系(U2OS、MG63和SaoS-2细胞),采用实时定量PCR和蛋白印迹法测定磷酸化应激诱导蛋白1(STIP1)... 目的探讨磷酸化应激诱导蛋白1基因沉默(si-STIP1)对骨肉瘤细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法体外培养人成骨细胞(hFOB1.19细胞)和人骨肉瘤细胞系(U2OS、MG63和SaoS-2细胞),采用实时定量PCR和蛋白印迹法测定磷酸化应激诱导蛋白1(STIP1)在各细胞中的表达水平。si-STIP1及阴性对照(si-NC)转染U2OS细胞48 h,采用CCK-8法测定细胞增殖,Transwell实验测定细胞迁移和侵袭,采用蛋白印迹测定细胞MMP2和MMP9及IGF1R/PI3K/AKT信号通路蛋白的表达。结果与hFOB1.19细胞相比,U2OS、MG63和SaoS-2细胞的STIP1基因和蛋白表达水平均显著上调(P<0.05)。与si-NC组相比,si-STIP1组U2OS细胞的增殖活性、迁移率、侵袭率均显著降低(均P<0.05),MMP2、MMP9、p-IGF1R、p-PI3K和p-AKT蛋白表达水平均显著下调(P<0.05)。结论STIP1基因沉默抑制骨肉瘤细胞增殖、侵袭和迁移,其可能机制是通过调控IGF1R/PI3K/AKT信号通路实现。 展开更多
关键词 磷酸化应激诱导蛋白1 基因沉默 骨肉瘤 增殖 迁移 侵袭 IGF1R/PI3K/AKT信号通路
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人分泌磷蛋白2基因的克隆、原核表达与活性检测 被引量:1
14
作者 刘建玲 康雪莲 +4 位作者 董辉 王嘉颖 曹琳 徐晓晶 金维荣 《生物学杂志》 CAS CSCD 2010年第3期20-23,47,共5页
提取人肝癌组织RNA,通过RT-PCR扩增人SPP2成熟蛋白编码区基因并克隆至原核表达载体pET-22b(+),将测序正确的质粒转化大肠杆菌BL2l(DE3),IPTG诱导重组蛋白表达,用Ni-NTA柱进行纯化,SDS-PAGE电泳及Western blot检测并证实目的蛋白的表达,... 提取人肝癌组织RNA,通过RT-PCR扩增人SPP2成熟蛋白编码区基因并克隆至原核表达载体pET-22b(+),将测序正确的质粒转化大肠杆菌BL2l(DE3),IPTG诱导重组蛋白表达,用Ni-NTA柱进行纯化,SDS-PAGE电泳及Western blot检测并证实目的蛋白的表达,通过重组蛋白对木瓜蛋白酶的抑制作用验证其生物学活性。重组质粒测序和酶切结果显示SPP2成熟蛋白基因已成功克隆到pET-22b(+)。IPTG诱导重组菌后有25kDa大小的目的蛋白表达。优化诱导表达条件,获得可溶性表达的目的蛋白,纯化后纯度达90%,western blot表明其具有His标签抗原活性。重组SPP2成熟蛋白可抑制木瓜蛋白酶的水解作用(酪蛋白为底物),重量抑制比为1∶3.1,抑制比活性为2511U/mg。 展开更多
关键词 分泌磷蛋白2 基因克隆 原核表达 纯化 生物活性
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人巨细胞病毒150kd磷蛋白抗原决定簇DNA编码区段在大肠杆菌中表达 被引量:1
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作者 王朝晖 唐泽嫒 张义正 《华西医科大学学报》 CSCD 1993年第4期364-368,共5页
分离重组质粒pHCY1中编码人巨细胞病毒(HCMV)150kd磷蛋白抗原决定簇DNA片段(HVYP片段),将该片段插入经PstⅠ酶切的质粒pUC8 lacZ基因启动子下游,选择正向插入和相位相同的重组质粒pUHVYP1,转化入大肠杆菌JM107,阳性克隆经IPTG诱导,菌体... 分离重组质粒pHCY1中编码人巨细胞病毒(HCMV)150kd磷蛋白抗原决定簇DNA片段(HVYP片段),将该片段插入经PstⅠ酶切的质粒pUC8 lacZ基因启动子下游,选择正向插入和相位相同的重组质粒pUHVYP1,转化入大肠杆菌JM107,阳性克隆经IPTG诱导,菌体蛋白经12%SDS-PAGE,有一分子量约为44~45kd融合蛋白条带出现。Western blot及ELISA检测显示抗HCMV-IgG和IgM阳性血清能与表达产物发生特异性识别反应,特异性IgM抗体捕获法进一步证实该表达产物具有抗原性。 展开更多
关键词 巨细胞病毒 磷蛋白 重组 基因表达
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小鼠牙本质磷蛋白cDNA的克隆和部分序列分析
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作者 江卫民 史俊南 +2 位作者 郝建军 费俭 赵大为 《牙体牙髓牙周病学杂志》 CAS 1999年第3期214-216,共3页
目的:克隆小鼠牙本质磷蛋白(DPP)cDNA。方法:用异硫氰酸胍一步法从小鼠牙胚组织中抽提总RNA,用oligo(dt) 作引物逆转录合成牙胚cDNA,然后利用PCR 方法,从cDNA 中扩增出小鼠DPPcDNA基因片段... 目的:克隆小鼠牙本质磷蛋白(DPP)cDNA。方法:用异硫氰酸胍一步法从小鼠牙胚组织中抽提总RNA,用oligo(dt) 作引物逆转录合成牙胚cDNA,然后利用PCR 方法,从cDNA 中扩增出小鼠DPPcDNA基因片段( 约1 .6kb),将所得基因片段插入pBluescript 质粒载体,转化到大肠杆菌XL1 - Blue 后挑选阳性克隆,提取重组质粒DNA,通过酶切分析和核苷酸序列分析鉴定阳性克隆。结果:酶切图谱和部分序列分析结果与国外文献报道一致。结论:克隆到小鼠DPPcDNA 基因片段。 展开更多
关键词 牙本质 磷蛋白 聚合酶链反应 基因克隆 序列分析
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STIP1调控EGR1表达并促进胃癌细胞DNA损伤修复 被引量:2
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作者 李全营 唐红娜 +1 位作者 秦长江 翟二涛 《消化肿瘤杂志(电子版)》 2022年第1期14-20,共7页
目的探讨应激诱导磷酸化蛋白1(STIP1)表达对于胃癌化疗抵抗的影响,并进一步探讨其潜在机制。方法构建STIP1过表达及敲低胃癌细胞系后,应用CCK-8、单克隆形成等实验检测胃癌细胞对5-氟尿嘧啶及顺铂、奥沙利铂的敏感性;并对过表达STIP1的... 目的探讨应激诱导磷酸化蛋白1(STIP1)表达对于胃癌化疗抵抗的影响,并进一步探讨其潜在机制。方法构建STIP1过表达及敲低胃癌细胞系后,应用CCK-8、单克隆形成等实验检测胃癌细胞对5-氟尿嘧啶及顺铂、奥沙利铂的敏感性;并对过表达STIP1的胃癌细胞系进行RNA测序并验证获得STIP1所调控的下游分子及信号通路;最后应用免疫荧光、免疫印迹等方法检测STIP1对胃癌细胞化疗抵抗的影响是否依赖于其下游分子。结果STIP1过表达可显著增强胃癌细胞对于5-氟尿嘧啶及顺铂、奥沙利铂等细胞毒性药物的抵抗作用;并可促进化疗抵抗相关基因的表达;RNA表达谱测序发现STIP1可能促进重组修复相关信号通路的活化,而免疫印迹及qPCR等检测证实STIP1过表达可促进该通路相关基因的表达;免疫荧光检测进一步证实STIP1表达可影响5-氟尿嘧啶诱导的DNA损伤的重组修复能力;而应用重组修复抑制剂干预胃癌细胞后。免疫荧光检测获得STIP1表达对于5-氟尿嘧啶所诱导的胃癌细胞DNA损伤的影响主要是通过影响其同源重组修复途径。对于其下游机制的探索,通过生物信息学分析、免疫印迹、qPCR及免疫荧光,证实STIP1可调控EGR1表达进一步影响5-氟尿嘧啶所诱导的DNA损伤重组修复。结论STIP1调控EGR1表达影响胃癌细胞DNA损伤修复,进而促进其化疗抵抗。 展开更多
关键词 应激诱导磷酸化蛋白1 早期生长反应基因1 DNA损伤修复 胃癌
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新城疫病毒分离株P基因的分子特性和遗传进化 被引量:2
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作者 梁俊文 田夫林 +3 位作者 黄兵 兰邹然 孙圣福 庄文忠 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2009年第1期49-55,共7页
【目的】探讨新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)磷蛋白基因(P基因)的分子进化特点,为科学防控新城疫(Newcastle disease,ND)提供依据。【方法】对1997~2007年国内分离的13个NDV毒株的P基因进行扩增测序,与15个已发表... 【目的】探讨新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)磷蛋白基因(P基因)的分子进化特点,为科学防控新城疫(Newcastle disease,ND)提供依据。【方法】对1997~2007年国内分离的13个NDV毒株的P基因进行扩增测序,与15个已发表的国内外不同时期的NDV毒株P基因进行核苷酸和推导的氨基酸遗传变异分析及分子特性研究。【结果】国内NDV分离株P基因核苷酸和P蛋白氨基酸高度同源,同源性分别为93.9%~99.8%和93.4%~99.2%。国内NDV毒株与LaSota、Clone30和F48E9等P基因核苷酸和P蛋白氨基酸同源性分别为82.2%~87.7%,81.3%~83.8%;与国外毒株则分别为82.1%~90.2%,81.1%~90.7%。氨基酸序列分析表明,我国毒株具有独特的氨基酸位点。分子进化分析表明,NDVP基因中核苷酸同义替代率高于非同义替代率。【结论】国内分离NDV毒株P蛋白遗传距离较近,而与LaSota、Clone30、F48E9以及国外毒株遗传距离较远,有一定的地域性。NDVP基因以净化选择的方式进化。 展开更多
关键词 新城疫病毒 P蛋白 P基因
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新城疫病毒V4株NP和P基因及其间隔区序列的克隆与分析 被引量:1
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作者 刘芳宁 闫丽辉 +2 位作者 曹殿军 刘培欣 杨增岐 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2006年第3期11-15,共5页
采用RT-PCR技术克隆了新城疫病毒(NDV)V4株长约4 200 bp的核苷酸序列,并进行了序列测定与分析。结果表明,该序列中包含有NDV V4株NP基因编码区、NP和P基因间隔区以及P基因的全部核苷酸序列。NDV V4株NP和P基因与其他8个NDV毒株相应部分... 采用RT-PCR技术克隆了新城疫病毒(NDV)V4株长约4 200 bp的核苷酸序列,并进行了序列测定与分析。结果表明,该序列中包含有NDV V4株NP基因编码区、NP和P基因间隔区以及P基因的全部核苷酸序列。NDV V4株NP和P基因与其他8个NDV毒株相应部分进行同源性比较,与Quuesland V4株的同源性最高。NDV V4株NP和P基因间隔区序列与其他13株NDV毒株相应部分的比较结果表明,F48E9等强毒株较La sota等弱毒、无毒毒株和试验用V4株在这个区域多了6个碱基,这6个碱基插入的位置在La sota等弱毒、无毒毒株全基因组序列的1647-1648 nt处;参比的14株NDV在这个区域的同源性为63.9%-100%,弱毒株之间的同源性较高,弱毒株与强毒株之间及强毒株之间的同源性差异较大。 展开更多
关键词 新城疫病毒 NP基因 P基因 NP和P基因间隔区序列 克隆 序列分析
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高尔基体磷蛋白3在结直肠癌组织中表达及其对结直肠癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响 被引量:8
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作者 刘师宏 汪威 穆小松 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期461-468,共8页
目的分析高尔基体磷蛋白3(GOLPH3)在结直肠癌组织中的表达情况,及其对结直肠癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法收集术前未经放、化疗治疗,经手术切除患者的结直肠癌组织及其相应的癌旁组织(40例);采用免疫组织化学法检测组织中GOLPH3... 目的分析高尔基体磷蛋白3(GOLPH3)在结直肠癌组织中的表达情况,及其对结直肠癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法收集术前未经放、化疗治疗,经手术切除患者的结直肠癌组织及其相应的癌旁组织(40例);采用免疫组织化学法检测组织中GOLPH3的表达,分析GOLPH3与结直肠癌临床病理特征的关系;构建稳定沉默GOLPH3的结直肠癌细胞株,并设立阴性对照组和空白对照组,Western blotting法检测3组细胞中GOLPH3蛋白的表达,MTT法检测3组细胞的增殖活性,Transwell实验分别检测3组细胞的侵袭和迁移能力。结果 GOLPH3在癌组织中主要为阳性表达,且阳性表达率(65.0%)显著高于癌旁组织(35.0%)(P<0.05);GOLPH3在TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期、浸润深度≥2 cm、中低分化及有淋巴结转移的癌组织中的阳性表达率明显高于TNM分期Ⅰ~Ⅱ期、浸润深度<2 cm、高分化及无淋巴结转移的癌组织(P<0.05)。与阴性对照组和空白对照组比,基因沉默组GOLPH3蛋白表达量、细胞增殖活性、侵袭能力及迁移能力均明显降低(P<0.05)。结论 GOLPH3在结直肠癌组织中高表达,其表达与肿瘤分期、侵袭深度、分化程度及淋巴结转移有关,抑制GOLPH3基因表达可下调GOLPH3蛋白表达,抑制结直肠癌细胞增殖、侵袭和迁移。 展开更多
关键词 结直肠癌 高尔基体磷蛋白3 基因沉默 细胞增殖 免疫组织化学
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