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Cloning, Expression of Crocus sativus Phytoene Desaturase Gene and Preparation of Antiserum against It
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作者 BaiJie MiaoChen XuYing TangLin WangZhi-tao ChenFang 《Wuhan University Journal of Natural Sciences》 EI CAS 2004年第2期252-258,共7页
A 2 149 bp full length phytoene desaturase (PDS) cDNA was first cloned from saffron (Crocus sativus L.) stigma using RT-PCR technique and a rapid amplification of cDNA end (RACE) strategy. The cDNA has an open reading... A 2 149 bp full length phytoene desaturase (PDS) cDNA was first cloned from saffron (Crocus sativus L.) stigma using RT-PCR technique and a rapid amplification of cDNA end (RACE) strategy. The cDNA has an open reading frame of 1 697 bp, which encodes a polypeptide of 565 amino acids. The coding region of the cDNA was inserted into a prokaryotic expression vector pET-21a(+) and over-expressed inE. coli BL21 (DE3). The fusion proteins were found largely in an insoluble inclusion bodies. The purified fusion protein was used to immunize rabbits to obtain polyclonal antiserum with titer of 1×105. Western blot analysis by using this particular antiserum showed that the higher expression level of PDS in mature stigma than in leaves and stamen, and the higher expression level of PDS in mature stigma than in young stigma. Key words saffron - carotenoids - phytoene desaturase - gene expression - antiserum - Western blot CLC number Q 781 - Q 786 Foundation item: Supported by the Doctoral Foundation of the Ministry of Education, P. R. China and the Young Science Foundation of Sichuan University (Grant 0020405505012)Biography: Bai Jie (1968-), female, Ph. D candidate, research direction: plant developmental biology and reproductive engineering. 展开更多
关键词 SAFFRON carotenoids phytoene desaturase gene expression ANTISERUM Western blot
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辣椒CaDXS和CaPDS基因沉默的表型比较
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作者 张鑫 桂敏 +2 位作者 刘弟 张金峰 刘雅婷 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期125-131,共7页
【目的】沉默辣椒CaDXS和CaPDS基因,比较分析两者白化表型的差异,寻找新的辣椒沉默标记基因。【方法】利用双酶切克隆技术构建CaDXS和CaPDS基因的沉默载体;通过农杆菌介导转化侵染辣椒,观察辣椒的沉默表型;采用实时荧光定量PCR技术检测C... 【目的】沉默辣椒CaDXS和CaPDS基因,比较分析两者白化表型的差异,寻找新的辣椒沉默标记基因。【方法】利用双酶切克隆技术构建CaDXS和CaPDS基因的沉默载体;通过农杆菌介导转化侵染辣椒,观察辣椒的沉默表型;采用实时荧光定量PCR技术检测CaDXS和CaPDS基因的沉默效率。【结果】农杆菌浸润21 d后,沉默CaDXS基因的辣椒叶片出现褪绿症状,沉默CaPDS基因的辣椒叶片出现白化。农杆菌浸润30 d后,沉默CaDXS基因的辣椒叶片出现较为明显的白化;沉默CaPDS基因的辣椒叶片白化程度加剧,新叶近乎白化。与CaDXS基因相比,沉默CaPDS基因导致的辣椒白化表型更明显和高效。沉默组辣椒叶片中CaDXS和CaPDS基因的表达量均显著降低(P<0.05),沉默效率分别为86.80%和93.08%,表明辣椒CaDXS和CaPDS基因被成功沉默。【结论】CaDXS基因可以作为辣椒的沉默标记基因,但沉默CaPDS基因的辣椒白化表型出现更早且明显,因此,CaPDS基因比CaDXS基因更适合作为辣椒沉默标记基因。 展开更多
关键词 病毒诱导的基因沉默 八氢番茄红素脱氢酶 1-脱氧木酮糖-5-磷酸合酶 辣椒 标记基因 烟草脆裂病毒
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马铃薯PDS和ZDS基因的克隆与表达特性分析 被引量:1
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作者 石源睿 董海涛 +4 位作者 常璐 吕运韬 贾小云 张红梅 唐锐敏 《山西农业科学》 2023年第4期347-355,共9页
八氢番茄红素脱氢酶(Phytoene desaturase)和ζ-胡萝卜素脱氢酶(ζ-Carotene desaturase)是类胡萝卜素合成通路上的关键限速酶,影响植物体内类胡萝卜素的合成。为解析PDS和ZDS在马铃薯类胡萝卜素合成途径中的作用,为马铃薯类胡萝卜素合... 八氢番茄红素脱氢酶(Phytoene desaturase)和ζ-胡萝卜素脱氢酶(ζ-Carotene desaturase)是类胡萝卜素合成通路上的关键限速酶,影响植物体内类胡萝卜素的合成。为解析PDS和ZDS在马铃薯类胡萝卜素合成途径中的作用,为马铃薯类胡萝卜素合成的分子调控机理解析和新品种创制奠定基础,研究从黄心马铃薯晋薯16号品种中克隆PDS和ZDS基因,利用生物信息学工具对这2个基因及其所编码的蛋白序列进行分析,并对二者在不同组织内的表达模式进行定量检测。结果表明,克隆得到PDS和ZDS基因长度分别为1 752、1 767 bp,分别编码583、588个氨基酸;StPDS的分子质量为64.97 ku,理论等电点为6.41;StZDS的分子质量为64.73 ku,理论等电点8.51;PDS和ZDS均属于亲水性非跨膜蛋白。系统进化树分析表明,马铃薯晋薯16号的PDS和ZDS分别与番茄PDS和ZDS的同源性最高。通过测定3个不同马铃薯品种晋薯16号、红玫瑰2号和希森8号叶片和薯块中的类胡萝卜素含量,发现在同一组织中,红玫瑰2号的类胡萝卜素含量显著高于希森8号和晋薯16号,这一结果说明,StPDS和StZDS基因可能正向调控马铃薯块茎类胡萝卜素的积累;在同一品种中,类胡萝卜素含量较少的叶片中StPDS和StZDS基因表达量却远远高于块茎中基因的表达量,推测这2个基因可能参与叶片的光合作用。 展开更多
关键词 八氢番茄红素脱氢酶 ζ-胡萝卜素脱氢酶 类胡萝卜素 马铃薯 基因表达
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八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因分子进化特征 被引量:4
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作者 梁成伟 程江峰 +2 位作者 苏忠亮 梁琰 王帅 《青岛科技大学学报(自然科学版)》 CAS 2009年第5期408-411,共4页
对来自蓝藻、绿藻和高等植物中的pds基因用最大似然法进行了系统发育分析,来估算pds基因在进化过程中的正选择位点。通过位点模型和分支-位点模型分别对PDS不同位点和不同分支中的位点进行正选择作用的估算。结果发现,pds基因的适应性... 对来自蓝藻、绿藻和高等植物中的pds基因用最大似然法进行了系统发育分析,来估算pds基因在进化过程中的正选择位点。通过位点模型和分支-位点模型分别对PDS不同位点和不同分支中的位点进行正选择作用的估算。结果发现,pds基因的适应性进化主要发生在系统发育树的不同分支上。在绿藻分支中,有7.9%位点受到正选择作用;在高等植物分支中,有6.1%位点受到正选择作用;在蓝藻分支中,有2.6%位点受到正选择作用。这些正选择位点的识别,可以为PDS活性研究提供重要的线索。 展开更多
关键词 八氢番茄红素脱氢酶基因 PAML 正选择作用 基因进化
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桑树PDS基因VIGS转化体系的构建与鉴定 被引量:7
5
作者 李瑞雪 王钰婷 +3 位作者 胡飞 夏家凤 汪泰初 赵卫国 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第7期1432-1438,共7页
【目的】建立桑树的病毒诱导基因沉默(VIGS)转化体系,为桑树功能基因的分析研究提供技术支持。【方法】以丰驰桑为试验材料,克隆含Bam H I和Xba I酶切位点的八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因片段,经Xba I和Bam H I双酶切后与烟草脆裂病毒(T... 【目的】建立桑树的病毒诱导基因沉默(VIGS)转化体系,为桑树功能基因的分析研究提供技术支持。【方法】以丰驰桑为试验材料,克隆含Bam H I和Xba I酶切位点的八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因片段,经Xba I和Bam H I双酶切后与烟草脆裂病毒(TRV)连接构建重组病毒载体p TRV2-PDS,转化农杆菌GV3101后通过压迫注射方式侵染桑树幼苗叶片。【结果】克隆获得的桑树PDS基因干扰片段346 bp,与改造后的TRV质粒连接可成功构建携带桑树PDS基因的重组病毒载体p TRV2-PDS。桑树叶片被侵染15 d后,接种重组病毒载体p TRV2-PDS桑树的第二轮真叶开始出现叶片白化现象,侵染20 d后,白化现象沿叶脉向四周逐渐扩散,叶片呈现明显的白化表型。实时荧光定量PCR检测结果显示,重组病毒载体p TRV2-PDS侵染的桑叶PDS基因相对表达量仅为阴性对照(p TRV2)的58%,二者差异极显著(P<0.01),表明桑树PDS基因表达被有效抑制。【结论】利用TRV构建的桑树VIGS体系能有效沉默PDS基因,使桑树叶片呈现明显的白化症状,即可用于后续的桑树功能基因鉴定。 展开更多
关键词 桑树 八氢番茄红素脱氢酶(pds) 病毒诱导的基因沉默(VIGS) 烟草脆裂病毒(TRV) 白化表型
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白菜型油菜八氢番茄红素脱氢酶基因PDS3的克隆与序列分析 被引量:3
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作者 薛蕾 闫贵欣 +3 位作者 伍晓明 高桂珍 陈碧云 许鲲 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第6期622-627,共6页
利用电子克隆技术,从数据库中找到与拟南芥高度同源的油菜EST序列,继而通过RT-PCR和RACE等方法,成功克隆了白菜型油菜八氢番茄红素脱氢酶(类胡萝卜素合成途径中的一个关键限速酶)基因PDS3的cDNA,命名为BrPDS3(GenBank登记号GQ200741)。c... 利用电子克隆技术,从数据库中找到与拟南芥高度同源的油菜EST序列,继而通过RT-PCR和RACE等方法,成功克隆了白菜型油菜八氢番茄红素脱氢酶(类胡萝卜素合成途径中的一个关键限速酶)基因PDS3的cDNA,命名为BrPDS3(GenBank登记号GQ200741)。cDNA序列全长1 940bp,其中包含114bp的5'前导序列和134bp的3'不翻译序列,编码区长度为1 692bp,编码63kD的蛋白。序列分析表明,BrPDS3蛋白与其他植物的PDS蛋白具有较高相似性;在系统进化树中,BrPDS3与甘蓝亲缘关系最近。根据全长cDNA序列设计引物,从白菜型油菜青油13号DNA中克隆得到BrPDS3基因的全长DNA,长度为3 911bp,ORF(开放阅读框)1 692bp,含有15个外显子和14个内含子。 展开更多
关键词 白菜型油菜 类胡萝卜素 八氢番茄红素脱氢酶基因Brpds3
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雨生红球藻八氢番茄红素脱氢酶pds基因上游序列的分离和分析 被引量:2
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作者 梁成伟 檀琮萍 +2 位作者 苏忠亮 魏魏 秦松 《海洋通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第6期46-50,共5页
在某些蓝藻、绿藻和高等植物中,八氢番茄红素脱氢酶是β-胡萝卜素合成过程中的一个关键酶之一,应用巢式PCR方法从雨生红球藻中克隆了八氢番茄红素脱氢酶基因约1kb的5’上游序列。通过生物信息学方法进行序列分析,发现pds基因上游序列中... 在某些蓝藻、绿藻和高等植物中,八氢番茄红素脱氢酶是β-胡萝卜素合成过程中的一个关键酶之一,应用巢式PCR方法从雨生红球藻中克隆了八氢番茄红素脱氢酶基因约1kb的5’上游序列。通过生物信息学方法进行序列分析,发现pds基因上游序列中包含了一些可能的顺式元件,如ABRE调控元件、C-repeat/DRE调控元件等。同时,构建了由pds-启动子控制报告基因的重组载体,并转化到雨生红球藻细胞中,进行了报告基因瞬间表达的检测。结果表明,克隆的pds启动子区域具有启动子活性,可以驱使报告基因进行瞬间表达。 展开更多
关键词 雨生红球藻 八氢番茄红素脱氢酶基因 启动子 瞬间表达
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刺萼龙葵PDS基因VIGS载体的构建 被引量:2
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作者 王旭 王新果 +2 位作者 张朝贤 黄红娟 魏守辉 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期137-141,共5页
病毒诱导的基因沉默(VIGS)是通过插入目的基因片段的重组病毒来抑制植物内源基因表达的遗传技术,主要用于基因的功能分析。茄科植物刺萼龙葵(Solanum rostratum)是一种外来恶性杂草,研究证实,在农杆菌GV3101介导下,刺萼龙葵的八氢番茄... 病毒诱导的基因沉默(VIGS)是通过插入目的基因片段的重组病毒来抑制植物内源基因表达的遗传技术,主要用于基因的功能分析。茄科植物刺萼龙葵(Solanum rostratum)是一种外来恶性杂草,研究证实,在农杆菌GV3101介导下,刺萼龙葵的八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因能被部分沉默,导致叶片和花朵出现白化表型。半定量RT-PCR检测显示,被侵染叶片和花朵的mRNA显著降解。VIGS沉默体系的建立可适用于研究刺萼龙葵的部分功能基因,有助于深入了解其生长发育调控的分子机制。 展开更多
关键词 刺萼龙葵 八氢番茄红素脱氢酶 病毒诱导基因沉默 烟草脆裂病毒
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番木瓜pds基因时空表达的荧光定量PCR分析 被引量:5
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作者 高新征 言普 +1 位作者 沈文涛 周鹏 《广西农业科学》 CSCD 2009年第6期610-613,共4页
以番木瓜黄果肉品种Dwarf solo和红果肉品种Sunrise solo为材料,利用实时荧光定量PCR技术,对2个番木瓜品种的不同组织器官以及果实发育成熟过程中5个时期的八氢番茄红素脱氢酶基因(pds)表达进行分析。结果表明,在2个番木瓜品种的果实、... 以番木瓜黄果肉品种Dwarf solo和红果肉品种Sunrise solo为材料,利用实时荧光定量PCR技术,对2个番木瓜品种的不同组织器官以及果实发育成熟过程中5个时期的八氢番茄红素脱氢酶基因(pds)表达进行分析。结果表明,在2个番木瓜品种的果实、花、叶片中,pds在转录水平上均有表达,但不同组织部位pds表达量存在差异,在成熟果实中最高,其次为花、叶;在2个番木瓜品种的果实成熟过程中,pds的表达逐渐增加,以在红果中的增加变化更为明显,且pds在红果肉中的表达量高于黄果肉。因此,pds基因可能在调控番木瓜果肉颜色形成中起重要作用。今后将对番木瓜果实中psy、zds、lcy-e等基因的表达进行分析,以全面研究番木瓜类胡萝卜素合成及果肉颜色形成的机理。 展开更多
关键词 番木瓜 八氢番茄红素脱氢酶基因 基因表达 荧光定量PCR
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魔芋PDS基因VIGS载体的构建及其功能鉴定 被引量:1
10
作者 王自布 黄燕芬 曹剑峰 《农业科学》 2018年第4期384-389,共6页
本文采用PCR技术从魔芋中克隆了番茄红素脱氢酶(PDS)基因部分序列,该片段长度450 bp,分析表明该基因片段与烟草中PDS序列同源性为77%。经过双酶切构建了p TRV-PDS的VIGS载体,转入农杆菌浸染魔芋,感染的组培苗魔芋植株叶片出现白化表型,... 本文采用PCR技术从魔芋中克隆了番茄红素脱氢酶(PDS)基因部分序列,该片段长度450 bp,分析表明该基因片段与烟草中PDS序列同源性为77%。经过双酶切构建了p TRV-PDS的VIGS载体,转入农杆菌浸染魔芋,感染的组培苗魔芋植株叶片出现白化表型,定量PCR结果表明魔芋PDS基因的mRNA丰度出现下调且下调了10%。 展开更多
关键词 病毒诱导基因沉默(VIGS) 烟草脆裂病毒 番茄红素脱氢酶
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超表达牛奶子EutPDS提高番茄果实番茄红素含量 被引量:4
11
作者 程珍霞 胡海涛 +3 位作者 杨莉 王长春 郭卫东 杨玲 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2017年第1期62-69,共8页
【目的】牛奶子果实中富含番茄红素,八氢番茄红素脱氢酶(PDS)是番茄红素生物合成上游的重要酶。特异性超表达牛奶子Eut PDS基因(Gen Bank登录号:GQ254067),以期提高番茄果实中的番茄红素含量。【方法】通过RT-PCR方法从牛奶子果实中分离... 【目的】牛奶子果实中富含番茄红素,八氢番茄红素脱氢酶(PDS)是番茄红素生物合成上游的重要酶。特异性超表达牛奶子Eut PDS基因(Gen Bank登录号:GQ254067),以期提高番茄果实中的番茄红素含量。【方法】通过RT-PCR方法从牛奶子果实中分离EutPDS基因cDNA及基因组全长,Southern杂交分析基因的拷贝数,专用软件分析此基因及蛋白结构。采用番茄2A11启动子构建果实特异性超表达载体,转化根瘤农杆菌GV3101后,借助农杆菌介导的叶盘法转化至‘中蔬四号’番茄。半定量RT-PCR检测转基因植株果实EutPDS基因的表达,高效液相色谱仪、实时定量PCR分别用于分析转基因番茄果实主要类胡萝卜素组分含量和内源类胡萝卜素代谢相关基因表达的变化。【结果】从牛奶子中克隆的EutPDS基因长度为1 920 bp,含有1 749 bp ORF。其基因组序列无内含子,单拷贝。EutPDS编码1个582个氨基酸的蛋白,该蛋白与其他植物PDS有很高的同源性,具有典型的二核苷酸结合域、类胡萝卜素结合域。采用农杆菌介导方法转化番茄叶盘,PCR检测,潮霉素筛选,成功获得了2个EutPDS转基因番茄株系,其果实颜色较对照更红。半定量分析显示外源EutPDS基因在转基因番茄果实中超表达,实时定量PCR分析表明番茄红素生物合成上游2个内源基因Sl PSY和Sl ZDS受影响显著上调,同时1个下游基因Sl LCY-e的表达则显著下调,使得转基因番茄果实中番茄红素含量为野生型的2倍,但β-胡萝卜素含量无显著变化。【结论】在番茄果实中特异性超表达牛奶子EutPDS基因可有效促进番茄果实中番茄红素的合成和积累。 展开更多
关键词 牛奶子 番茄 番茄红素 八氢番茄红素脱氢酶基因(pds) 载体构建 遗传转化
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金鱼草AmPDS基因克隆及调节类胡萝卜素合成功能分析 被引量:8
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作者 韩嘉宁 邵慧慧 +1 位作者 胡增辉 冷平生 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期193-201,共9页
八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素进行生物合成途径中的关键酶。为了深入探究金鱼草PDS基因的功能,该研究以‘马里兰’金鱼草(Antirrhinum majus‘Maryland True Pink’)为材料,对其PDS基因(AmPDS)全长序列及... 八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素进行生物合成途径中的关键酶。为了深入探究金鱼草PDS基因的功能,该研究以‘马里兰’金鱼草(Antirrhinum majus‘Maryland True Pink’)为材料,对其PDS基因(AmPDS)全长序列及蛋白结构进行分析,并克隆了AmPDS基因片段;采用qRT-PCR技术检测AmPDS基因在不同时期及部位的相对表达水平,利用VIGS技术验证AmPDS基因功能,用紫外分光法测定叶片中各类色素含量。结果显示:(1)成功克隆AmPDS基因片段(500 bp);AmPDS基因cDNA全长1743 bp,编码580个氨基酸;其蛋白分子量为64.75 kD,理论等电点6.66;同源比对分析显示AmPDS基因与芝麻(Sesamum indicum)的序列相似性最高。(2)qRT-PCR分析表明,AmPDS基因在全株均有表达,且在全盛期花朵的上瓣和叶片中表达量最高。(3)构建pTRV2-AmPDS载体,建立了金鱼草的VIGS沉默体系,AmPDS基因沉默效率约为53%,与阴性对照相比叶片中各类色素含量均显著降低。研究认为,AmPDS基因是金鱼草类胡萝卜素生物合成途径中的关键基因,可作为金鱼草VIGS沉默体系的指示基因,为后续研究金鱼草其他基因功能奠定基础。 展开更多
关键词 金鱼草 八氢番茄红素脱氢酶 基因沉默 白化现象 类胡萝卜素
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利用VIGS技术在本氏烟中沉默枸杞PDS同源基因的研究 被引量:1
13
作者 曲玲 李彦龙 +6 位作者 焦恩宁 赵建华 秦垦 尹跃 周旋 安巍 曹有龙 《宁夏农林科技》 2021年第2期25-30,F0002,共7页
【目的】本项研究旨在通过建立一个异源VIGS体系,为枸杞重要性状相关基因的功能鉴定提供前期信息。【方法】从枸杞叶片中克隆获得409 bp长的八氢番茄红素脱饱和酶基因(phytoene desaturase,PDS)的编码区片段,构建入基于烟草脆裂病毒的V... 【目的】本项研究旨在通过建立一个异源VIGS体系,为枸杞重要性状相关基因的功能鉴定提供前期信息。【方法】从枸杞叶片中克隆获得409 bp长的八氢番茄红素脱饱和酶基因(phytoene desaturase,PDS)的编码区片段,构建入基于烟草脆裂病毒的VIGS空载体中,通过农杆菌介导的侵润接种,将重组的病毒沉默载体pTRV2-PDS转入本氏烟中。【结果】本氏烟幼苗被侵染接种后,沉默处理植株的叶片呈现整叶白化的表型,而阴性对照植株叶片一直未出现变白的症状,qRT-PCR检测表明,接种17 d后,与阴性对照植株相比,沉默处理植株PDS基因的表达显著地被抑制(P<0.05),说明枸杞PDS基因的同源基因在本氏烟中得到了有效沉默。【结论】该VIGS体系的构建,可用于对枸杞部分基因功能的快速初步鉴定和筛选,旨在提高枸杞基因功能研究的效率。 展开更多
关键词 枸杞 八氢番茄红素脱饱和酶基因(pds) 病毒诱导基因沉默(VIGS) 本氏烟
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Establishment and Verification of An Efficient Virus-induced Gene Silencing System in Forsythia 被引量:6
14
作者 Jianshuang Shen Weijia Si +5 位作者 Yutong Wu Yang Xu Jia Wang Tangren Cheng Qixiang Zhang Huitang Pan 《Horticultural Plant Journal》 SCIE CSCD 2021年第1期81-88,共8页
To understand the functional identification of large-scale genomic sequences in Forsythia,tobacco rattle virus(TRV)-mediated virus-induced gene silencing(VIGS),suitable for the plant,was explored in this study.The res... To understand the functional identification of large-scale genomic sequences in Forsythia,tobacco rattle virus(TRV)-mediated virus-induced gene silencing(VIGS),suitable for the plant,was explored in this study.The results showed that the TRV-mediated VIGS system could be successfully used in Forsythia for silencing the reporter gene FsPDS(Forsythia phytoene desaturase)using stem infiltration and leaf infiltrationmethods.All the treated plants were pruned below the injection site after 7–15 d infection;the FsPDS was silenced and typical photobleaching symptoms were observed in newly sprouted leaves at the whole-plant level.Meanwhile,this system has been successfully tested and verified through virus detection and qRT-PCR analysis.After the optimization,Forsythia magnesium chelatase subunit H(FsChlH)was silenced successfully in Forsythia using this system,resulting in yellow leaveswith decreased chlorophyll content.The system was stable,highly efficient and had greater rapidity and convenience,which made it suitable to study the function of genes related to physiological pathways such as growth and development,and metabolic regulation in Forsythia. 展开更多
关键词 FORSYTHIA Virus-induced gene silencing phytoene desaturase TRV whole-plant level
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基于PDS基因的番茄VIGS高效沉默体系的优化 被引量:2
15
作者 郭燕 刘志达 +4 位作者 康立茹 包婷婷 杨旭 赵君 张之为 《作物杂志》 北大核心 2023年第2期46-50,共5页
病毒诱导的基因沉默(VIGS)具有独特优势,被广泛应用于基因功能验证。高效基因沉默体系的建立和优化是对目标基因功能进行研究的前提和基础。以番茄品种money maker和携带八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因序列的TRV病毒载体为材料,研究了农... 病毒诱导的基因沉默(VIGS)具有独特优势,被广泛应用于基因功能验证。高效基因沉默体系的建立和优化是对目标基因功能进行研究的前提和基础。以番茄品种money maker和携带八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因序列的TRV病毒载体为材料,研究了农杆菌不同OD值、不同侵染方法以及侵染后不同培养温度对PDS基因沉默株率的影响。结果表明,农杆菌OD值分别为0.50、1.00和1.50时,PDS基因的沉默株率分别为5%、13%和6%;当农杆菌OD值为1.0时,采用注射法、真空浸润法和注射处理24h后再进行真空浸润后的PDS基因沉默株率分别为13%、30%和15%;侵染后的培养温度对于基因沉默株率也有显著影响,在25℃时的沉默株率为13%,22℃时沉默株率达到46%。以上研究表明,农杆菌OD值为1.00时,注射24h后再进行真空浸润,接种后植株在22℃下生长能够提高番茄目标基因的沉默株率。 展开更多
关键词 番茄 病毒诱导的基因沉默 八氢番茄红素脱氢酶基因 沉默株率 优化
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油棕病毒诱导的基因沉默体系的建立及优化 被引量:1
16
作者 李萌晗 王威 +1 位作者 邹积鑫 李东栋 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期259-264,共6页
为开展油棕油脂代谢调控相关基因鉴定研究,以油棕八氢番茄红素脱氢酶基因(phytoene desaturase gene,PDS)作为报告基因,探索以病毒载体TRV为载体在油棕胚状体上应用病毒诱导基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)的可能性,并对... 为开展油棕油脂代谢调控相关基因鉴定研究,以油棕八氢番茄红素脱氢酶基因(phytoene desaturase gene,PDS)作为报告基因,探索以病毒载体TRV为载体在油棕胚状体上应用病毒诱导基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)的可能性,并对油棕胚状体VIGS体系的相关参数进行优化。结果显示:以EHA105为菌种、侵染菌液OD_(600)=0.5、侵染时间5 min、乙酰丁香酮(AS)质量浓度20 mg/L、共培养48 h、侵染后培养时间为12 d能取得最佳的基因沉默效果。在此基础上,利用优化后的VIGS体系对油棕二酰甘油酰基转移酶基因(diacylglycerol acyltransferase gene,DGAT)进行沉默,取得了预期的基因沉默效果。 展开更多
关键词 油棕 胚状体 病毒诱导的基因沉默体系 遗传转化 八氢番茄红素脱氢酶
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李坏死环斑病毒诱导的桃PpPDS沉默体系的优化及验证 被引量:1
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作者 潘佳佳 张东梅 +4 位作者 孟建 高苏南 朱凯杰 刘军伟 李国怀 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期1587-1600,共14页
病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)是在桃(Prunus persica)上进行基因沉默的主要手段,现有VIGS体系效率较低,亟待开发针对桃的高效沉默体系。以桃八氢番茄红素脱氢酶(Phytoene desaturase)基因PpPDS为指示基因,探... 病毒诱导的基因沉默(virus-induced gene silencing,VIGS)是在桃(Prunus persica)上进行基因沉默的主要手段,现有VIGS体系效率较低,亟待开发针对桃的高效沉默体系。以桃八氢番茄红素脱氢酶(Phytoene desaturase)基因PpPDS为指示基因,探究不同侵染方式、病毒载体、温度、接种苗龄和菌液浓度对桃叶片VIGS效率的影响。结果表明,在侵染方式上,叶片注射是有效的方式;李坏死环斑病毒(Prunus necrotic ring spot virus,PNRSV)载体(pCaRNA1/2和pCaRNA3)优于烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)改造后的TRV载体(pTRV1和pTRV2);温度为22℃左右PpPDS的沉默效率较高;苗龄为5~6片完全展开叶的桃苗沉默效率较高,达到85%;菌液浓度为OD600=1.0时沉默效率较高。以优化好的VIGS体系参数,选择桃叶绿素合成基因(PpGluTR和PpPOR)为目标基因进行验证,结果显示PpGluTR和PpPOR的表达均被显著抑制,叶片颜色变化明显。这些结果表明优化的VIGS体系稳定性好且沉默效率高,可用于桃基因功能的研究。 展开更多
关键词 病毒诱导的基因沉默 李坏死环斑病毒 八氢番茄红素脱氢酶 叶绿素合成基因
原文传递
三角褐指藻八氢番茄红素脱氢酶1-2基因启动子克隆和表达分析
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作者 吕娇 龚一富 +2 位作者 章丽 吴欣 王何瑜 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期870-879,共10页
八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素合成的关键酶,在光合生物的类胡萝卜素代谢调控中发挥了重要的作用。本研究根据三角褐指藻基因组数据库,克隆三角褐指藻PDS1和PDS2基因启动子序列,采用启动子缺失技术研究启动... 八氢番茄红素脱氢酶(phytoene desaturase,PDS)是类胡萝卜素合成的关键酶,在光合生物的类胡萝卜素代谢调控中发挥了重要的作用。本研究根据三角褐指藻基因组数据库,克隆三角褐指藻PDS1和PDS2基因启动子序列,采用启动子缺失技术研究启动子活性,利用Plant CARE预测三角褐指藻PDS1和PDS2启动子顺式作用元件,采用qRT-PCR技术检测三角褐指藻PDS1和PDS2基因在不同胁迫下的相对表达量。结果表明,三角褐指藻PDS1和PDS2基因启动子全长分别为2000 bp和920 bp,不同长度的5′端缺失后启动子均能驱动绿色荧光蛋白表达,具有较强启动子活性。Plant CARE分析结果表明,三角褐指藻PDS1和PDS2基因启动子中均含有与光照和植物激素响应有关的顺式作用元件。光照和植物激素胁迫处理结果表明,三角褐指藻PDS1基因受光合诱导因子(photosynthetic induction factor,PIF)的诱导表达,但在其他因子处理下表达均显著下降(P<0.05)或无显著性差异。三角褐指藻PDS2基因在PIF、红光、茉莉酸甲酯、乙酰水杨酸和脱落酸胁迫下均表达上调(P<0.05),在光合作用抑制剂二氯苯基二甲脲(dichlorophenyl dimethylurea,DCMU)、黄光和蓝光胁迫下显著下调(P<0.05)。三角褐指藻PDS2基因在不同处理下的基因表达和岩藻黄素含量呈显著的正相关关系(r=0.8551,P<0.01),说明PDS2基因可能是三角褐指藻岩藻黄素合成的关键基因。本研究揭示了三角褐指藻的PDS基因参与光系统和植物激素胁迫应答的新功能,为进一步研究岩藻黄素调控机制提供了一定的理论基础。 展开更多
关键词 八氢番茄红素脱氢酶 启动子 岩藻黄素 三角褐指藻
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基于三角梅的病毒诱导基因沉默体系的建立与优化
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作者 刘珍银 段郅臻 +2 位作者 彭婷 王童欣 王健 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第7期123-130,共8页
三角梅是紫茉莉科灌木,具有较高的观赏价值,是研究花色叶色调控的理想材料。建立快速高效的基因验证体系,是三角梅基因功能研究的关键。以三角梅‘金心双色’品种为材料,选用八氢番茄红素脱氢酶基因(PDS)为指示基因,探索不同接种部位和... 三角梅是紫茉莉科灌木,具有较高的观赏价值,是研究花色叶色调控的理想材料。建立快速高效的基因验证体系,是三角梅基因功能研究的关键。以三角梅‘金心双色’品种为材料,选用八氢番茄红素脱氢酶基因(PDS)为指示基因,探索不同接种部位和基因片段长度对烟草脆裂病毒(TRV)诱导三角梅叶片内源PDS mRNA沉默效果的影响,建立适用于三角梅的病毒诱导基因沉默体系(VIGS)。结果表明,摩擦注射嫩叶法相比顶端嫩茎沉默效果更明显;基因沉默片段长度在336 bp和457 bp均可诱导PDS基因沉默,后者效果更加明显。初步构建了三角梅VIGS体系,为后续基因功能研究提供了技术参考。 展开更多
关键词 三角梅 八氢番茄红素脱氢酶 烟草脆裂病毒 基因沉默
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草莓八氢番茄红素脱氢酶基因pds的克隆及特征分析 被引量:13
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作者 朱海生 李永平 +1 位作者 温庆放 林珲 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期55-60,共6页
采用RT-PCR和RACE技术从草莓果实中克隆到草莓类胡萝卜素合成途径中关键基因pds,该cDNA全长2043bp,具有一个1704bp的完整开放阅读框(ORF),编码568个氨基酸。序列分析表明,pds编码的氨基酸序列与其它植物的PDS蛋白有很高的相似性。系统... 采用RT-PCR和RACE技术从草莓果实中克隆到草莓类胡萝卜素合成途径中关键基因pds,该cDNA全长2043bp,具有一个1704bp的完整开放阅读框(ORF),编码568个氨基酸。序列分析表明,pds编码的氨基酸序列与其它植物的PDS蛋白有很高的相似性。系统进化树分析显示,草莓PDS与杏的PDS蛋白亲缘关系比较近。原核表达结果表明pds基因在大肠杆菌中获得高效表达。利用半定量RT-PCR技术进行组织表达模式分析发现,pds基因在草莓的花、叶片和果实中均有表达,表达量为红果>粉红果>白果>花>青果>叶。 展开更多
关键词 草莓 八氢番茄红素合成酶 类胡萝卜素 基因克隆
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