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湖南省不同宿主犬弓首蛔虫线粒体pcox1和pnad1基因序列遗传变异的研究 被引量:5
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作者 谢雯琴 唐伟 +3 位作者 王先坤 邱启官 龚腾芳 刘伟 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第11期1223-1227,共5页
为探究湖南省不同宿主来源犬弓首蛔虫的种内遗传变异情况,本研究利用PCR法对14株分离自湖南省部分地区不同宿主(犬和狼)源犬弓首蛔虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位I(... 为探究湖南省不同宿主来源犬弓首蛔虫的种内遗传变异情况,本研究利用PCR法对14株分离自湖南省部分地区不同宿主(犬和狼)源犬弓首蛔虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚单位I(nad1)基因部分序列(pnad1)进行PCR扩增与测序,分析该两个序列的同源性,并用pcox1和pnad1基因序列分别构建不同宿主源犬弓首蛔虫与其他蛔虫的种系发育树。结果显示,本研究获得的犬和狼源弓首蛔虫分离株pcox1和pnad1基因序列大小分别为442 bp和527 bp,其种内遗传变异率分别为0~1.7%和0.2%~2.2%,与已知不同宿主源(犬、人、狐狸等)弓首蛔虫分离株对应核苷酸序列同源性分别为94.6%~99.5%(pcox1)和98.4%~99.2%(pnad1);检测到二者的单倍型分别为13个和12个,单倍型多样性分别为0.989和0.967,核苷酸多样性分别为0.01675和0.00509。基于两种基因构建系统发育树的分析结果一致,本研究获得的14个不同宿主来源犬弓首蛔虫分离株与GenBank已有犬弓首蛔虫分离株位于同一分支,与猫弓首蛔虫和马来西亚弓首蛔虫分离株距离较近,与其他蛔虫所属分支距离较远。本研究结果表明,不同宿主源犬弓首蛔虫湖南分离株遗传变异程度较低,且pcox1基因较pnad1基因序列更适合作为犬弓首蛔虫分离株遗传变异研究的分子标记。本研究为不同宿主源弓首蛔虫的分子流行病学调查及种群遗传学研究奠定了基础。 展开更多
关键词 不同宿主 犬弓首蛔虫 pcox1基因 pnad1基因 遗传变异
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甘肃省酒泉市狐狸源和犬源狮弓蛔虫线粒体pnad1和pnad5基因序列遗传变异研究 被引量:1
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作者 张建明 赵文昌 《中国血吸虫病防治杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期518-521,共4页
目的 探究甘肃省酒泉市不同宿主源狮弓蛔虫基因遗传变异。方法 应用PCR技术对甘肃省酒泉地区采集的11株分离自家犬、狐狸和宠物犬的狮弓蛔虫分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第1亚基部分序列基因(partial nicotinamide adenine d... 目的 探究甘肃省酒泉市不同宿主源狮弓蛔虫基因遗传变异。方法 应用PCR技术对甘肃省酒泉地区采集的11株分离自家犬、狐狸和宠物犬的狮弓蛔虫分离株线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第1亚基部分序列基因(partial nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 1, pnad1)和烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶第5亚基部分序列基因(partial nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase subunit 5, pnad5)进行基因扩增,并对PCR扩增产物进行测序,分析其遗传变异。结果 获得的犬源和狐狸源狮弓蛔虫分离株pnad1和pnad5基因序列大小分别为530 bp和550 bp,不同分离株间核苷酸序列同源性分别为99.4%~100.0%和99.5%~99.8%,与已知狮弓蛔虫分离株对应序列同源性分别为99.2%~99.9%和99.1%~99.9%;分别检测到19个和24个遗传变异位点,单倍型分别为10和9个,单倍型多样性分别为0.982和0.964,核苷酸多样性分别为0.039 4和0.034 2。基于两种基因序列构建的遗传进化树结果基本一致:11株不同宿主分离株与已知狮弓蛔虫分离株位于同一分支,且为随机分布;与犬弓首蛔虫所属分支相隔较近,与其他蛔虫所属分支相距较远。结论 甘肃省酒泉市不同宿主来源狮弓蛔虫分离株pnad1和pnad5基因遗传变异较小,pnad1基因较pnad5基因更适合作为分子标记用于分析狮弓蛔虫遗传变异。 展开更多
关键词 狮弓蛔虫 pnad5 pnad1 狐狸 遗传变异
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前后盘吸虫梅花鹿源分离株的种类鉴定及遗传进化分析 被引量:3
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作者 简永利 涂宜强 +1 位作者 高永安 宋军科 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期665-670,共6页
旨在研究温州地区的梅花鹿源前后盘吸虫的种类和遗传进化,利用形态学和分子生物学方法,对虫体样本进行染色显微镜观察及pcox1和pnad1序列的PCR扩增和序列分析。形态学鉴定结果表明,前后盘吸虫梅花鹿源分离株在外部形态、大小以及内部组... 旨在研究温州地区的梅花鹿源前后盘吸虫的种类和遗传进化,利用形态学和分子生物学方法,对虫体样本进行染色显微镜观察及pcox1和pnad1序列的PCR扩增和序列分析。形态学鉴定结果表明,前后盘吸虫梅花鹿源分离株在外部形态、大小以及内部组织器官与鹿前后盘吸虫(Paramphistomum cervi)相近。序列比较分析结果表明,3株前后盘吸虫梅花鹿源分离株样本的pcox1和pnad1序列完全一致,扩增产物长度分别为446和505bp,与GenBank中鹿前后盘吸虫(KT198987)同源性最高,分别为98.2%和97.7%。遗传进化分析表明,3株前后盘吸虫梅花鹿源分离株与鹿前后盘吸虫位于同一分支。表明,分离的虫株在形态学和遗传进化分析上均与鹿前后盘吸虫具有高度的一致性,提示获得的前后盘吸虫梅花鹿源分离株为鹿前后盘吸虫。 展开更多
关键词 鹿前后盘吸虫 形态 pcox1 pnad1 遗传进化分析
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河北保定地区羊多头蚴和犬多头带绦虫的调查与鉴定 被引量:1
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作者 于合宅 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2017年第6期18-20,共3页
为了解河北省山羊多头蚴和犬多头带绦虫的感染情况,本研究对河北省涞源县、阜平县和易县的山羊和犬进行绦蚴虫感染情况调查,并通过PCR技术对多头蚴与多头带绦虫分离株线粒体pnad1基因部分序列进行扩增与分析,确定多头蚴和多头带绦虫之... 为了解河北省山羊多头蚴和犬多头带绦虫的感染情况,本研究对河北省涞源县、阜平县和易县的山羊和犬进行绦蚴虫感染情况调查,并通过PCR技术对多头蚴与多头带绦虫分离株线粒体pnad1基因部分序列进行扩增与分析,确定多头蚴和多头带绦虫之间的种系发育关系。结果显示,调查区域山羊多头蚴与犬多头带绦虫感染率分别为2.38%和15.33%,通过DNAStar软件分析,所获得多头蚴和多头带绦虫分离株分别与四川多头带绦虫分离株的相似性分别为98.9%~99.5%和99.5%~99.8%,确定羊多头蚴为犬多头带绦虫的幼虫。 展开更多
关键词 多头蚴 多头带绦虫 调查 pnad1基因 鉴定
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