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基于概率神经网络的中草药活性组分利尿性的QSAR研究(英文) 被引量:1
1
作者 吕文娟 薛春霞 +3 位作者 陈兴国 胡之德 刘满仓 范波涛 《兰州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期72-76,共5页
利用线性判别分析和概率神经网络,建立了预测中草药有效成分利尿性与其分子结构参数之间的 QSAR 模型.概率神经网络分类结果好,训练集、交互检验集和测试集的分类正确率均可达到100%.本文所用的概率神经网络结构简单、易于调试,研究... 利用线性判别分析和概率神经网络,建立了预测中草药有效成分利尿性与其分子结构参数之间的 QSAR 模型.概率神经网络分类结果好,训练集、交互检验集和测试集的分类正确率均可达到100%.本文所用的概率神经网络结构简单、易于调试,研究工作进一步明确了分子利尿性与其结构参数之间的关系,有助于利尿药物的选择与合成. 展开更多
关键词 qsar 利球性 中草药 分子结构参数
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中药毒性预测研究进展与思考 被引量:5
2
作者 沈磐 孙德志 +1 位作者 周维 高月 《中国药物警戒》 2023年第4期473-479,共7页
目的了解中药毒性预测研究现状,为全面深入认识中药毒性提供参考。方法基于文献检索和阅读,对近年来有关中药毒性预测思路和方法进行梳理、归纳和总结。结果根据不同的预测理念,中药毒性预测方法大致可分为3类:基于定量结构-活性关系、... 目的了解中药毒性预测研究现状,为全面深入认识中药毒性提供参考。方法基于文献检索和阅读,对近年来有关中药毒性预测思路和方法进行梳理、归纳和总结。结果根据不同的预测理念,中药毒性预测方法大致可分为3类:基于定量结构-活性关系、网络毒理学及传统中药药性理论的中药毒性预测方法,对中药毒性预测的发展及其在临床用药的指导作用提出了展望,提出“基于多元层面的中药全成分组复合毒性效应网络”的中药毒性预测理念,期望实现一体化中药毒性完整预测,有助于中药毒性的系统性研究和应用,为进一步认识中药毒性预测提供了思路。结论现有的中药毒性预测方法能够为“有毒”中药无毒用药方案的制定提供理论依据,对临床上的中药配伍减毒具有一定的参考。 展开更多
关键词 中药毒性预测 定量结构-活性关系 网络毒理学 中药药性理论
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具有抗癌活性的喜树碱类化合物的构效关系研究 被引量:6
3
作者 赵军 许旋 +1 位作者 罗一帆 刘展眉 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2003年第2期83-88,共6页
目的探寻喜树碱类似物的电子结构与抗癌活性的关系。方法应用分子力学MM+ 法、量子化学从头算法和AM 1法对 18个喜树碱类似物进行几何优化 ,计算了化合物的电子结构 ,并应用逐步回归方法探寻化合物量子化学指数和抗癌活性的关系。结果 ... 目的探寻喜树碱类似物的电子结构与抗癌活性的关系。方法应用分子力学MM+ 法、量子化学从头算法和AM 1法对 18个喜树碱类似物进行几何优化 ,计算了化合物的电子结构 ,并应用逐步回归方法探寻化合物量子化学指数和抗癌活性的关系。结果 (1)喜树碱类似物的logP与活性参数间呈抛物线关系 ;(2 )分子的logP及 2 0位碳原子电荷是影响化合物抗癌活性的重要因素 ;7位取代基的疏水参数logP2 对分子的logP影响很大 ;(3 )得到较显著的QSAR方程 :pIC50 =3 8 12 3 + 8 0 90 7logP -0 814 2 5 (logP) 2 -682 3 79QC2 0 。结论疏水性对喜树碱类似物的活性影响较大 ;D环及相连的羰基氧O2 3可能是与受体作用的活性中心 ; 展开更多
关键词 药物化学 构效关系 AMl量子化学方法 喜树碱类似物 抗癌活性
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CoW_(11)Ti/淀粉纳米复合物的合成与表征 被引量:2
4
作者 王晓红 王立敏 +1 位作者 李凤 刘景福 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2003年第12期2158-2160,共3页
Using a reversed-phase microemulsion polymerization method, polyoxometalates(POMs) CoW 11Ti loaded starch nanoparticles were prepared and structurally characterized by elemental analyses, IR, UV-Vis and ESR spectrosco... Using a reversed-phase microemulsion polymerization method, polyoxometalates(POMs) CoW 11Ti loaded starch nanoparticles were prepared and structurally characterized by elemental analyses, IR, UV-Vis and ESR spectroscopy. The particle size of CoW 11Ti/starch was estimated by transmission electron microscope(TEM) and the size ranges by a 1000HSA MALVIRN Zetasizer instrument. The result shows that the polyoxometalate retained the parent structure after encapsulated by starch microspheres, which are able to enhance the stability and antitumoral activity of POMs and decrease the toxicity of POMs as well. 展开更多
关键词 多酸化合物 K6H2[CoW11TiO40]·12H2O 淀粉纳米粒子 载药体系 合成 表征 抗HIV病毒活性 抗肿瘤活性
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C-3取代喹诺酮衍生物抗肿瘤活性的二维定量构效关系 被引量:4
5
作者 林克江 尤启冬 刘智华 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2003年第6期316-319,共4页
目的研究 3位取代喹诺酮衍生物抗肿瘤活性的定量构效关系。方法采用Hansch方法经计算机模拟与统计分析 ,获得定量构效关系方程。结果 3位取代基的生成热、最大负电荷、特殊极性、logP和零阶价分子连接性指数与活性有良好的线性关系 ,并... 目的研究 3位取代喹诺酮衍生物抗肿瘤活性的定量构效关系。方法采用Hansch方法经计算机模拟与统计分析 ,获得定量构效关系方程。结果 3位取代基的生成热、最大负电荷、特殊极性、logP和零阶价分子连接性指数与活性有良好的线性关系 ,并提出 3位取代基的一些设计原则。结论获得较好的定量构效关系方程 。 展开更多
关键词 药物化学 构效关系 Hansch方法 抗肿瘤 喹诺酮
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卤代芳氧烷胺类α_1-肾上腺素受体拮抗剂的合成、生物活性及构效关系研究 被引量:3
6
作者 习保民 李华 +3 位作者 张斌 倪沛洲 夏霖 江振洲 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2005年第1期5-11,共7页
目的设计合成卤代苯氧烷胺类α1 肾上腺素受体 (α1 AR)拮抗剂并研究它们的降压活性及构效关系。方法根据苯氧烷胺类化合物DDPH的代谢物设计合成 12个卤代芳氧烷胺类化合物 ,以 2 ,6 二甲基苯酚为原料经多步反应得中间体卤代苯氧丙酮 ... 目的设计合成卤代苯氧烷胺类α1 肾上腺素受体 (α1 AR)拮抗剂并研究它们的降压活性及构效关系。方法根据苯氧烷胺类化合物DDPH的代谢物设计合成 12个卤代芳氧烷胺类化合物 ,以 2 ,6 二甲基苯酚为原料经多步反应得中间体卤代苯氧丙酮 ,再还原胺化得目标物 ,测试了目标化合物的降压活性 ,并用WHIM描述子进行构效关系研究。结果共合成 12个目标物 ,其结构经红外、质谱、核磁共振谱确证。药理实验显示 :12个目标物均具有一定的降压活性 ,化合物 3、10有较强的降压作用 ,但降压持续时间均比DDPH短。结论提高整个分子的对称性 ,或降低分子的取代基的复杂程度 ,对延长该类药物的降压时间是有利的。 展开更多
关键词 药物化学 制备 化学合成 α1-肾上腺索受体拮抗剂 qsar 降压活性
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多酸药物化学研究进展 被引量:3
7
作者 刘霞 熊宇迪 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期282-285,共4页
目的介绍近年来多酸药物化学的研究进展。方法查阅国内外文献进行归纳和总结。结果和结论多酸具有抗艾滋病、抗肿瘤、抗病毒以及抗糖尿病的作用,具有很大的研究开发潜力和良好的应用前景。
关键词 多酸 药物化学 进展
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非核苷类HIV-1逆转录酶抑制剂Ⅱ6-(1-萘甲基)胸腺嘧啶类化合物三维定量构效关系 被引量:8
8
作者 孟歌 陈芬儿 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2003年第5期254-259,共6页
目的进一步研究6-(1-萘甲基)取代胸腺嘧啶类(HEPT)HIV-1逆转录酶抑制剂的构效关系。方法利用比较分子力场分析方法(CoMFA)对14个新合成的6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物进行三维定量构效关系研究;对化合物与HIV-1逆转录酶的非底物结合部分(... 目的进一步研究6-(1-萘甲基)取代胸腺嘧啶类(HEPT)HIV-1逆转录酶抑制剂的构效关系。方法利用比较分子力场分析方法(CoMFA)对14个新合成的6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物进行三维定量构效关系研究;对化合物与HIV-1逆转录酶的非底物结合部分(NNBP)作用情况进行了对接(Dock)研究;并建立了回归方程。结果用模型预测了2个6-(1-萘甲基)取代HEPT类化合物的-logEC50值,结果得以验证。空间立体效应占85.7%,静电立场效应占14.3%。结论对接结果显示:在NNBP中,化合物以蝴蝶双翅形的构象伸展开来,并以芳环与结合腔表面的芳香性氨基酸残基产生疏水性相互作用。6-位引入(1-萘甲基)可显著提高化合物的生物活性,空间效应是影响活性的主要因素,此模型可为进一步的结构优化提供理论指导。 展开更多
关键词 药物化学 构效关系 比较分子力场分析 Dock分析 6-(1-萘甲基)取代HEPT类似物 HIV-1逆转录酶抑制剂
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嘧啶类CDK1激酶抑制剂的三维定量构效关系 被引量:2
9
作者 罗海彬 陈国文 +3 位作者 邵咏贤 李哲 刘明 刘培庆 《深圳大学学报(理工版)》 EI CAS 北大核心 2012年第5期438-443,共6页
1型细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent kinase 1,CDK1)在人体内是有效的抗癌作用靶标.使用三维定量构效关系研究方法,包括比较分子场分析法(comparative molecular field analysis,CoM-FA)和比较分子相似性指数分析法(comparativ... 1型细胞周期蛋白依赖性激酶(cyclin-dependent kinase 1,CDK1)在人体内是有效的抗癌作用靶标.使用三维定量构效关系研究方法,包括比较分子场分析法(comparative molecular field analysis,CoM-FA)和比较分子相似性指数分析法(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA),分析23个CDK1激酶抑制剂的分子结构与生物活性之间的定量关系.相对其他类型电荷,当训练集加载Gasteiger-Huckel电荷时,CoMFA获得一个最优的三维定量构效关系模型,其交叉验证系数q2为0.668,非交叉验证相关系数R2为0.941,表明模型具有较好的预测能力.使用测试集交叉验证说明该模型稳定可靠,模型中立体场贡献率为69.8%,静电场贡献率为30.2%. 展开更多
关键词 药物化学 药物分子设计 三维定量构效关系 1型细胞周期蛋白依赖性激酶 抑制剂 肿瘤治疗
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电负性及其对Anderson型多酸抗肿瘤活性的表达
10
作者 向明礼 赵志刚 +3 位作者 刘彤 刘兴利 肖慎修 袁支润 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第4期411-416,共6页
简要回顾了电负性的发展历史。根据电负性是指分子中原子吸引电子趋势的概念和抗肿瘤多酸的电子得失氧化—还原机制,提出了多酸抗肿瘤活性与多酸的电负性者之间存在内在联系的假定。用基于Mulliken电负性标度的加权调和平均电负性,对And... 简要回顾了电负性的发展历史。根据电负性是指分子中原子吸引电子趋势的概念和抗肿瘤多酸的电子得失氧化—还原机制,提出了多酸抗肿瘤活性与多酸的电负性者之间存在内在联系的假定。用基于Mulliken电负性标度的加权调和平均电负性,对Anderson型抗肿瘤多酸的基团电负性进行了计算。结果表明,用一、二级结构的基团电负性数据,可以表达Anderson型多酸的抗肿瘤活性。 展开更多
关键词 Anderson型多酸抗肿瘤 基团电负性 构效关系 多酸药物
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多酸药物研究进展
11
作者 向明礼 赵志刚 +3 位作者 袁支润 肖慎修 刘兴利 刘彤 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2003年第3期288-297,共10页
简要介绍了多酸、多酸结构类型、多酸药物的研究内容与研究意义;回顾了近代多酸药物研究的历史;对抗HIV、抗肿瘤多酸药物的研究,从代表性药物的发现、机理研究到构效关系等方面作了重点评述;指出了未来多酸药物研究工作的主要领域。
关键词 多酸药物 研究进展 抗HIV 抗肿瘤
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中药保健食品原料肝毒性预测研究
12
作者 雷蕾 张广平 +4 位作者 杨乐 李晗 李小阳 叶祖光 王晰 《中国现代中药》 CAS 2022年第12期2302-2308,共7页
目的:开发一种更优的评估中药肝毒性的方法,为中药保健食品原料安全性评价提供参考。方法:基于国际公开构建肝毒性定量构效关系(QSAR)模型训练集数据,形成训练集。使用Discovery Studio 4.5对训练集进行主成分分析和聚类分析,针对每一... 目的:开发一种更优的评估中药肝毒性的方法,为中药保健食品原料安全性评价提供参考。方法:基于国际公开构建肝毒性定量构效关系(QSAR)模型训练集数据,形成训练集。使用Discovery Studio 4.5对训练集进行主成分分析和聚类分析,针对每一类使用朴素贝叶斯(NB)、逻辑回归(LR)、邻近算法(KNN)等9种机器学习的方法构建QSAR模型,并利用交叉验证方法对模型构建方法进行评估。最后使用最优类模型对113种中药保健食品原料包含的783个成分进行了预测,根据多模型加权平均概率筛选出肝毒性成分占比较大的中药。结果:根据对训练集化合物的分析,可以看出第3类模型的准确率为85%~91%,高于现有报道的中药成分肝毒性预测模型。对中药保健食品原料成分的分析发现肝毒性化合物48个、不具有肝毒性的化合物735个,肝毒性预测概率为0.15~0.30,说明中药保健食品原料肝毒性普遍较低。预测肝毒性成分所占比例较高的中药有茜草、番泻叶、当归、大黄、丹参、厚朴、川芎、桑枝、桑白皮、五味子等。结论:对训练集预先聚类,提高QSAR模型准确率,为中药安全性评价的方法学研究提供了新思路,为中药保健食品原料成分进一步研究提供重要参考。 展开更多
关键词 定量构效关系 肝毒性 中药保健食品 化学成分
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缬草醇衍生物定量构效关系模型的构建及其在镇静活性筛选中的应用
13
作者 李栢林 张振学 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期361-365,共5页
目的建立2种缬草醇型倍半萜镇静活性与其结构定量构效关系的模型,试图对从北缬草中分离得到的多种缬草醇型倍半萜的镇静活性进行预测。方法采用比较分子力场方法建立两种模型分子(CoMFA Model 1及CoMFA Mode 2)研究缬草醇型倍半萜的三... 目的建立2种缬草醇型倍半萜镇静活性与其结构定量构效关系的模型,试图对从北缬草中分离得到的多种缬草醇型倍半萜的镇静活性进行预测。方法采用比较分子力场方法建立两种模型分子(CoMFA Model 1及CoMFA Mode 2)研究缬草醇型倍半萜的三维定量构效关系。结果根据建立的三维定量构效关系模型预测了由北缬草中分离出来的6个愈创木烷单体化合物的镇静活性,该结果与体内实验的实测结果有较好的一致性。结论建立的CoMFA Mode1 1及CoMFAMode1 2具有较好的预测能力,具有一定的可信度。 展开更多
关键词 药物化学 定量构效关系 镇静活性 北缬草 愈创木烷 比较分子力场
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改进的Reed分子参数及其对多酸抗肿瘤活性的表达 被引量:1
14
作者 邓小强 卢云 +2 位作者 袁支润 肖慎修 向明礼 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2008年第2期312-316,共5页
根据Klopman和Iczqowski等关于"原子的一些性质在分子中仍然得以保留"的研究结果,运用Sanderson电负性均衡原理,并借用Ichikawa加权调和平均电负性模型和Parr等的离子电负性计算公式,将密度泛函理论离散变分方法对抗肿瘤多酸... 根据Klopman和Iczqowski等关于"原子的一些性质在分子中仍然得以保留"的研究结果,运用Sanderson电负性均衡原理,并借用Ichikawa加权调和平均电负性模型和Parr等的离子电负性计算公式,将密度泛函理论离散变分方法对抗肿瘤多酸的计算结果融入Reed分子参数计算中,建立了包含研究对象三维构象信息的Reed分子参数计算新方法.用该法计算得到的抗肿瘤多酸阴离子的分子片参数,能恰当地与Anderson型和Linqvist型多酸的抗肿瘤活性关联. 展开更多
关键词 电负性 基团电负性 抗肿瘤多酸 构效关系研究
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双膦酸盐类化合物的研究进展 被引量:5
15
作者 徐广宇 谢毓元 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2004年第3期182-186,共5页
双膦酸盐类化合物是防治骨代谢疾病的重要药物 ,本文对双膦酸盐类药物的临床应用、构效关系、作用机制进行了综述 。
关键词 药物化学 综述 双膦酸盐 临床应用 构效关系 分子作用机制 法呢基焦磷酸酯合成酶
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多酸化合物的药学应用进展 被引量:1
16
作者 骆昱晖 杨菲菲 张宏 《常州大学学报(自然科学版)》 CAS 2014年第4期23-29,共7页
介绍了多金属氧酸盐化学的发展过程,综述了多酸化合物的药学应用进展,包括其在抗艾滋病(HIV)、抗肿瘤、抗病毒等方面的研究情况。同时,展望了未来多酸药学应用研究的主要领域及亟需解决的关键问题。
关键词 多金属氧酸盐 药物化学 抗艾滋病 抗肿瘤 抗病毒
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3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物的三维定量构效关系(比较分子力场分析)研究(英文) 被引量:1
17
作者 郑剑斌 闻韧 +1 位作者 罗小民 蒋华良 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2004年第4期197-201,208,共6页
目的研究 3 哌啶甲酸和四氢烟酸的 4 ,4 二芳基 3 丁烯衍生物结构和对γ 氨基丁酸摄取抑制活性之间的关系。方法使用三维定量构效关系 (3D QSAR)———比较分子场分析 (CoMFA)方法进行构效关系研究。结果交叉验证系数q2和非交叉验证系... 目的研究 3 哌啶甲酸和四氢烟酸的 4 ,4 二芳基 3 丁烯衍生物结构和对γ 氨基丁酸摄取抑制活性之间的关系。方法使用三维定量构效关系 (3D QSAR)———比较分子场分析 (CoMFA)方法进行构效关系研究。结果交叉验证系数q2和非交叉验证系数r2 分别为 0 72 6和 0 986 ,方差比F为 117 5 6 2 ,标准估计误差 (SEE)为 0 0 6 2。结论这些数值表明所得的CoMFA模型有实际意义 ,并且对 3 哌啶甲酸和四氢烟酸的 4 ,4 二芳基 3 丁烯衍生物抑制活性具有较好的预测能力。 展开更多
关键词 药物化学 三维定量构效关系 比较分子场分析 3-哌啶甲酸衍生物 四氢烟酸衍生物 GABA摄取抑制剂
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吡咯烷类基质金属蛋白酶-2抑制剂的比较分子力场分析
18
作者 尹文刚 徐文方 李亚林 《中国药物化学杂志》 CAS CSCD 2005年第5期277-281,共5页
目的通过CoMFA方法来获得吡咯烷类基质金属蛋白酶-2(MMP-2)抑制剂的三维定量构效关系。方法应用FlexX对接方法与构象系统搜索程序来确定MMP-2抑制剂的可能活性构象,并以此活性构象为模板构建28个小分子化合物的三维结构,最后运用CoMFA... 目的通过CoMFA方法来获得吡咯烷类基质金属蛋白酶-2(MMP-2)抑制剂的三维定量构效关系。方法应用FlexX对接方法与构象系统搜索程序来确定MMP-2抑制剂的可能活性构象,并以此活性构象为模板构建28个小分子化合物的三维结构,最后运用CoMFA方法对MMP-2进行定量构效关系研究。结果CoMFA方法建立了定量构效关系模型,交叉验证系数q2=0.803,回归系数r2=0.989,F=293.663,SEE=0.076。结论该模型具有可靠性和可预测性,该模型的建立为吡咯烷类基质金属蛋白酶抑制剂的结构优化提供了理论支持。 展开更多
关键词 药物化学 定量构效关系 COMFA MMP-2抑制剂 吡咯烷衍生物
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多金属氧酸盐及其衍生物在药物方面的研究进展 被引量:2
19
作者 甄如月 朱莉 《南华大学学报(自然科学版)》 2020年第2期90-96,共7页
多酸和基于多酸的化合物由于其特殊结构和性能,成为非常有前途的金属药物。讨论了多酸及其衍生物,特别是多酸基有机无机杂化物在抗肿瘤、抗病毒和抗细菌方面的研究进展。
关键词 多金属氧酸盐 药物活性 抗肿瘤 抗病毒 抗细菌
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中草药重要成分的QSAR预测毒性数据库的建立 被引量:12
20
作者 高雅 姚碧云 周宗灿 《毒理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期399-401,共3页
研究建立的中草药重要成分的QSAR预测毒性数据库,共包括984个中草药重要成分。数据库分为4个子库:基本化学信息子库,化学结构式图子库,毒性实验数据子库和毒性QSAR预测数据子库。研究利用多种公开的和商业QSAR预测软件,预测多个终点:经... 研究建立的中草药重要成分的QSAR预测毒性数据库,共包括984个中草药重要成分。数据库分为4个子库:基本化学信息子库,化学结构式图子库,毒性实验数据子库和毒性QSAR预测数据子库。研究利用多种公开的和商业QSAR预测软件,预测多个终点:经口急性毒性、慢性毒性、致癌性(遗传毒性和非遗传毒性)、致突变性(Ames试验和骨髓微核试验)、发育毒性及毒理学关注阈值(TTC)。研究将对中草药成分的毒性QSAR预测进行可靠性评价。研究将对中草药成分的毒性预测方法进行探索,以促进中草药的毒性识别和中药现代化。 展开更多
关键词 中草药 qsar 毒性预测 数据库
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