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鸡生长分化因子GDF-8 cDNA的克隆、表达及蛋白纯化 被引量:12
1
作者 杨威 王海霞 +2 位作者 陈岩 张勇 朱大海 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期460-462,共3页
Growth and Differentiation Factor-8(GDF-8) is a new member of TGF-β super-family.It has been shown that GDF-8 is specifically expressed in skeleton muscle in mouse and its function is to inhibit the growth of muscle ... Growth and Differentiation Factor-8(GDF-8) is a new member of TGF-β super-family.It has been shown that GDF-8 is specifically expressed in skeleton muscle in mouse and its function is to inhibit the growth of muscle cell,so it is named as Myostatin.Here,we amplified 3′half-length GDF-8 cDNA from chicken skeleton muscle by RT-PCR,and cloned it into the prokaryotic expression vector pTrcHisB,which was then transformed into E.coli Top10 cells.The recombinant 6×His-GDF-8 fusion protein expressed in the Top10 cells was purified by Ni+-Affinity Chromatography for future study. 展开更多
关键词 GDF-8 融合蛋白 表达 纯化 生长分化因子 鸡肉 cdna
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鸡CD4和CD8α基因cDNA的克隆及其真核表达质粒的构建 被引量:6
2
作者 胡青海 焦新安 +2 位作者 徐耀辉 潘志明 黄金林 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 2004年第4期56-60,共5页
用Trizol提取6周龄白莱航鸡胸腺组织的总RNA,再用Oligo-dT纤维素富集mRNA后,用RT-PCR分别扩增出鸡CD4和CD8α基因cDNA。PCR产物切胶回收后连入T载体,测序正确后再连入pcDNA3.1(+)。将重组质粒pcDNA3.1-CD4和pcDNA3.1-CD8分别转染COS-7细... 用Trizol提取6周龄白莱航鸡胸腺组织的总RNA,再用Oligo-dT纤维素富集mRNA后,用RT-PCR分别扩增出鸡CD4和CD8α基因cDNA。PCR产物切胶回收后连入T载体,测序正确后再连入pcDNA3.1(+)。将重组质粒pcDNA3.1-CD4和pcDNA3.1-CD8分别转染COS-7细胞,用已知的抗鸡CD4和CD8的单克隆抗体检测到转染细胞中CD4和CD8α分子的表达,这说明构建的真核表达质粒正确,为下一步用DNA免疫方法研制抗鸡CD4和CD8的单克隆抗体以及研究鸡CD4和CD8分子的结构和功能打下基础。 展开更多
关键词 CD4 CD8 cdna 克隆 真核表达 质粒
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鲤鱼白细胞介素-8全长cDNA的克隆、鉴定及其差异表达分析 被引量:1
3
作者 谭业平 孙晓义 +3 位作者 卢强 李莲瑞 邓洪宽 付宝权 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期667-671,共5页
用DD-RTPCR的方法获得差异显示片段A26,经地高辛标记作为探针对有丝分裂原刺激的鲤鱼外周血白细胞cDNA文库核酸杂交筛选,从0.8×104个重组噬菌体中,经过2轮筛选获得阳性克隆。序列分析表明该克隆含有1个大小为294bp编码98个氨基酸... 用DD-RTPCR的方法获得差异显示片段A26,经地高辛标记作为探针对有丝分裂原刺激的鲤鱼外周血白细胞cDNA文库核酸杂交筛选,从0.8×104个重组噬菌体中,经过2轮筛选获得阳性克隆。序列分析表明该克隆含有1个大小为294bp编码98个氨基酸的完整开放阅读框,氨基酸序列含有Chemokine-CXC功能结构域,前体中含有22个氨基酸组成的引导肽,氨基酸序列比对显示成熟白细胞介素-8(IL-8)多肽中第12、13和14构成CXC基序,但之前无ELR基序。系统发生分析其与荷兰鲤鱼亲缘关系最近,氨基酸序列的同源性达89%。分离培养鲤鱼外周血白细胞,在不同条件下经LPS、PHA和ConA刺激后,提取总RNA,根据鲤鱼IL-8全长cDNA序列和β-ac-tin序列设计引物,利用半定量反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法对鲤鱼外周血白细胞IL-8进行差异表达分析,结果显示,经有丝分裂原刺激后前期(4h)白细胞中IL-8的表达量明显增大,但随着时间推移(12、24h)并不一直比同期正常白细胞表达量大,表达量趋势成峰形图。 展开更多
关键词 鲤鱼 IL-8 cdna克隆 鉴定 差异表达分析
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6A8 cDNA编码一种α-甘露糖苷酶 被引量:4
4
作者 史耕先 马凤蓉 +4 位作者 朱立平 张立新 赵方萄 刘音 王讯 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第6期439-443,共5页
目的 探讨6A8cDNA编码的蛋白质的性质。方法 依据ConA的配体是甘露糖,而α-甘露糖苷酶的作用是修剪细胞糖蛋白聚糖中甘露糖的原理,采用细胞免疫荧光染色法以及激光共聚焦显微镜观察经转染6A8cDNA正义或反义重组表达载体后,细胞结合Con... 目的 探讨6A8cDNA编码的蛋白质的性质。方法 依据ConA的配体是甘露糖,而α-甘露糖苷酶的作用是修剪细胞糖蛋白聚糖中甘露糖的原理,采用细胞免疫荧光染色法以及激光共聚焦显微镜观察经转染6A8cDNA正义或反义重组表达载体后,细胞结合ConA的强弱,验证6A8cDNA编码的蛋白质是否为一种α-甘露糖苷酶。结果 COS-7细胞和人鼻咽癌细胞株CNE-2L2转染pRc/CMV-正义6A8cDNA后与ConA结合减弱,而与单抗6A8染色增强;CNE-2L2细胞转染pRc/CMV-反义6A8cDNA后,与ConA结合增强,而与单抗6A8染色减弱。结论 6A8cDNA编码的蛋白质可能为一种α-甘露糖苷酶,它可被单抗6A8识别。 展开更多
关键词 6A8cdna α-甘露糖苷酶 ConA结合
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中国部分地方品种鸡CD4和CD8α基因cDNA的克隆与序列分析 被引量:1
5
作者 胡青海 焦新安 +2 位作者 潘志明 黄金林 殷月兰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期216-221,共6页
用Trizol分别提取4~6周龄白莱航鸡、狼山鸡、大骨鸡、北京油鸡、仙居鸡、茶花鸡、固始鸡和隐性白羽鸡胸腺细胞的总RNA,再用Oligo-dT纤维索富集mRNA后,用RT-PCR分别扩增出鸡CD4和cD8α基因cDNA。将PCR产物克隆进T载体后测序。序列分... 用Trizol分别提取4~6周龄白莱航鸡、狼山鸡、大骨鸡、北京油鸡、仙居鸡、茶花鸡、固始鸡和隐性白羽鸡胸腺细胞的总RNA,再用Oligo-dT纤维索富集mRNA后,用RT-PCR分别扩增出鸡CD4和cD8α基因cDNA。将PCR产物克隆进T载体后测序。序列分析显示不同品种鸡的CD4 cDNA序列完全一致;中国地方品种鸡与国外品种的白莱航鸡、RPL7系鸡在CD8α胞外区有6~13个氨基酸的差异,仙居鸡与其他5个中国地方品种鸡在CD8α胞外区有4~5个氨基酸的差异,狼山鸡、北京油鸡和隐性白羽鸡CD8α cDNA的核苷酸序列及推导的氨基酸序列完全一致。这些结果表明,中国地方品种鸡CD4基因序列高度保守;中国地方品种鸡与国外品种鸡的CD8α cDNA序列之间具有遗传多态性,而中国地方品种鸡之间CDSα cDNA序列遗传多态性低,为进一步研究CD4分子和CD8α链的结构和功能提供了条件。 展开更多
关键词 CD4 CD8Α cdna 克隆 序列分析
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转导反向6A8α-甘露糖苷酶cDNA对抗Fas抗体诱导Jurkat细胞凋亡的影响 被引量:3
6
作者 岳玮 史耕先 +2 位作者 王壮志 刘音 朱立平 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2001年第2期136-140,共5页
用梯形DNA电泳与Gimsa染色研究人T细胞瘤细胞株Jurkat在转导编码人 6A8α 甘露糖苷酶基因的反向cDNA后 ,对抗Fas抗体诱导凋亡敏感性的变化 ,并用间接免疫荧光染色 (流式细胞仪 )检测细胞表面Fas分子的表达。结果表明 ,抗Fas抗体诱导细胞... 用梯形DNA电泳与Gimsa染色研究人T细胞瘤细胞株Jurkat在转导编码人 6A8α 甘露糖苷酶基因的反向cDNA后 ,对抗Fas抗体诱导凋亡敏感性的变化 ,并用间接免疫荧光染色 (流式细胞仪 )检测细胞表面Fas分子的表达。结果表明 ,抗Fas抗体诱导细胞 2 4h后 ,野生型及转导空载载体的Jurkat细胞出现明显的梯形DNA ,两者之间无明显差异 ,但转导反向 6A8cDNA的细胞未见明显的梯形DNA。Gimsa染色结果显示转导反向 6A8cDNA的Ju rkat细胞中凋亡细胞数明显减少 ,而转导空载载体则无影响。Jurkat细胞为Fas(CD95 ,Apo 1)全阳性细胞 ,转导反向 6A8cDNA或空载载体对Fas表达阳性率与Fas表达强度无明显影响。以上结果提示 ,转导编码 6A8α 甘露糖苷酶基因的反向cDNA使人T细胞株Jurkat对抗人Fas抗体诱导的凋亡作用产生耐受。 展开更多
关键词 细胞凋亡 反向6A8cdna 反向6A8α-甘露糖苷酶 抗Fas抗体 JURKAT细胞
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暗纹东方鲀CD8α全长cDNA的克隆及序列分析 被引量:2
7
作者 杜建 邵爱华 朱江 《江苏农业科学》 CSCD 北大核心 2009年第5期23-27,共5页
根据红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)的CD8α序列设计引物,用RACE技术克隆并测定了暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)CD8α全长cDNA序列,经序列比对两者同源性为97%。序列分析显示657 nt的开放读码框编码218个氨基酸残基的跨膜糖蛋白的前... 根据红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)的CD8α序列设计引物,用RACE技术克隆并测定了暗纹东方鲀(Takifugu fasciatus)CD8α全长cDNA序列,经序列比对两者同源性为97%。序列分析显示657 nt的开放读码框编码218个氨基酸残基的跨膜糖蛋白的前体蛋白,蛋白结构预测包括信号肽区、免疫球蛋白样结构域区、茎区、跨膜区和胞浆区。对其中胞外的免疫球蛋白样结构域区和茎区进行了原核表达,表达产物为22 ku左右的重组蛋白。 展开更多
关键词 暗纹东方鲀 CD8 αcdna 序列分析 原核表达
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草鱼(Ctenopharyngodon idellus)成纤维细胞生长因子8的cDNA克隆及特征分析
8
作者 孙翰昌 丁诗华 +3 位作者 方平 张芬 李云 刁晓明 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2009年第5期13-17,共5页
以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为实验对象,利用RACE技术克隆了草鱼成纤维细胞成长因子8(Fibro-blast Growth Factor8,FGF8)cDNA序列。实验结果显示,草鱼FGF8 cDNA序列长度为887 bp,其中5′-非翻译区长100 bp,3′-非翻译区长157 bp,... 以草鱼(Ctenopharyngodon idellus)为实验对象,利用RACE技术克隆了草鱼成纤维细胞成长因子8(Fibro-blast Growth Factor8,FGF8)cDNA序列。实验结果显示,草鱼FGF8 cDNA序列长度为887 bp,其中5′-非翻译区长100 bp,3′-非翻译区长157 bp,开放阅读框(ORF)633 bp,编码210个氨基酸的前体蛋白,包含22个氨基酸的信号肽和188个氨基酸的成熟肽。利用已知的FGF8序列绘制系统发育树,发现草鱼与两种鲤科鱼(班马鱼、墨西哥脂鲤)聚为一簇,显示亲缘关系很近,而与其它脊椎动物如两栖类、鸟类、哺乳类的亲缘关系则相对较远,这与形态分类学的结果一致。此外,还通过生物信息学分析,揭示了草鱼FGF8的分子结构特征。 展开更多
关键词 草鱼(Ctenopharyngodon idellus) 成纤维细胞成长因子8 cdna克隆 特征分析
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Development of an Improved DNA-launched Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus Reverse Genetics System
9
作者 刘长龙 李燕华 袁世山 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2010年第6期32-36,共5页
[Objective] This study was to improve the virus replication efficiency of full length infectious cDNA clones by making use of the ribozyme's self incision property.[Method] By employing three-step PCR,HDV ribozyme(H... [Objective] This study was to improve the virus replication efficiency of full length infectious cDNA clones by making use of the ribozyme's self incision property.[Method] By employing three-step PCR,HDV ribozyme(HdvRz)cDNA was isolated,and cloned into the downstream flanking the genome of the porcine reproductive and respiratory syndrome virus,and into which the bovine growth hormone polyadenylation sequence(BGH)was inserted via enzyme digestion and ligation,yielding pAPRRS-HB.The newly constructed pAPRRS-HB was used to transfect MARC-145 cells,in which the N protein and non-structural protein(nsp2)were determined by indirect immunofluorescence assay after 72 h of expression;meanwhile the virus titer of cell supernatant was tested using TCID50 assay.[Result] pAPRRS-HB containing complete infectious PRRSV cDNA has been successfully developed,and it performed about 10-fold higher virus rescue rate than pAPRRS without the engineered ribozyme element.[Conclusion] The results laid a foundation for revealing the structure and function of PRRSV gene. 展开更多
关键词 porcine reproductive and respiratory syndrome virus Full-length cdna clone HDV ribozyme DNA-launched transfection
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以DNA聚合酶链反应筛选cDNA文库及人白细胞介素-8全编码区cDNA的钓出
10
作者 于永利 杨贵贞 乌垠 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1992年第4期198-200,共3页
本文采用人酸性纤维母细胞生长因子特异性引物,尝试了以 DNA 聚合酶链反应筛选 cDNA文库的方法.运用该法从人皮肤纤维母细胞 cDNA 文库和 PMA 刺激的 U_(927)细胞 cDNA 文库中分别钓出了人白细胞介素8(IL-8)全编码区 cDNA。
关键词 DNA 聚合酶链反应 cdna文库
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海鲈核糖体蛋白L8cDNA的克隆与进化分析(英文) 被引量:3
11
作者 丛潇 邵占涛 +3 位作者 袁金铎 王友政 杨桂文 安利国 《现代生物医学进展》 CAS 2008年第5期858-861,共4页
本文构建了海鲈(Lateolabrax japonicus)头肾全长cDNA文库。PCR方法扩增得到海鲈的核糖体蛋白L8基因,全长848bp,编码257个氨基酸,含有L2及L2-C两个保守区。进化分析结果表明,以L8为参照的进化鉴定结果同经典的分子生物学标准18s鉴定结... 本文构建了海鲈(Lateolabrax japonicus)头肾全长cDNA文库。PCR方法扩增得到海鲈的核糖体蛋白L8基因,全长848bp,编码257个氨基酸,含有L2及L2-C两个保守区。进化分析结果表明,以L8为参照的进化鉴定结果同经典的分子生物学标准18s鉴定结果十分相似,因此核糖体蛋白L8基因可以作为鉴定物种进化程度的新标准。 展开更多
关键词 核糖体蛋白L8 鲈鱼 cdna文库 进化标准
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银狐Gdf8基因cDNA的克隆与序列分析
12
作者 刘阳 白素英 +4 位作者 李和平 刘志平 张立明 贾学渊 牛黎明 《东北林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期29-31,共3页
根据已报道的犬科狗的Gdf8基因cDNA编码序列设计一对引物,利用RT-PCR技术扩增银狐的Gdf8基因cDNA的编码序列,将PCR产物连接到质粒pMD18-T载体上,然后转化到JM109大肠杆菌中,得到阳性克隆,同时进行序列的测定和分析。测序结果与已报道的G... 根据已报道的犬科狗的Gdf8基因cDNA编码序列设计一对引物,利用RT-PCR技术扩增银狐的Gdf8基因cDNA的编码序列,将PCR产物连接到质粒pMD18-T载体上,然后转化到JM109大肠杆菌中,得到阳性克隆,同时进行序列的测定和分析。测序结果与已报道的Gdf8基因cDNA编码序列的大小相同,为1128bp。该序列与狗的同源性为99.2%,仅有9个核苷酸差异,推断的氨基酸序列仅有3个差异。 展开更多
关键词 生长分化因子8基因 银狐 cdna编码序列
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IL-8在强直性脊柱炎活动期的表达与意义 被引量:16
13
作者 李天旺 古洁若 +2 位作者 赵丽珂 黄烽 余得恩 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期479-481,共3页
目的 探讨趋化因子IL 8在强直性脊柱炎(AS)活动期的表达及意义。方法 通过cDNA微阵列及RT PCR技术检测活动期AS患者和对照组 [健康志愿者、类风湿关节炎 (RA)及膝关节外伤患者]的外周血、关节液中单个核细胞和滑膜细胞IL 8的表达 ,比... 目的 探讨趋化因子IL 8在强直性脊柱炎(AS)活动期的表达及意义。方法 通过cDNA微阵列及RT PCR技术检测活动期AS患者和对照组 [健康志愿者、类风湿关节炎 (RA)及膝关节外伤患者]的外周血、关节液中单个核细胞和滑膜细胞IL 8的表达 ,比较AS患者组与各对照组IL 8表达情况的差异。结果 在活动期AS患者外周血单个核细胞 (PBMC)或关节液单个核细胞 (SFMC)中IL 8的表达均明显高于健康志愿者PBMC中的表达 ,在RA患者PBMC中IL 8的表达亦高于健康志愿者PBMC中的表达 ,关节滑膜细胞IL 8的表达水平在AS患者也明显高于膝关节外伤患者。结论 IL 8在活动期AS中存在高表达 ,可能是AS的一种重要的炎症介质 。 展开更多
关键词 脊柱炎 强直性 白细胞介素8 cdna微阵列技术
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甜菜夜蛾肠粘蛋白cDNA基因的分子克隆与序列分析 被引量:13
14
作者 张霞 李国勋 郭巍 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期3898-3904,共7页
【目的】围食膜(peritrophic membrane,PM)是衬托于昆虫中肠内的一种无脊椎动物特有的几丁质—蛋白复合结构,它能够促进食物消化,保护消化道免受微生物入侵。昆虫肠粘蛋白(ⅡM)是其重要组分之一。因此,作为中肠防御系统的PM已成为害虫... 【目的】围食膜(peritrophic membrane,PM)是衬托于昆虫中肠内的一种无脊椎动物特有的几丁质—蛋白复合结构,它能够促进食物消化,保护消化道免受微生物入侵。昆虫肠粘蛋白(ⅡM)是其重要组分之一。因此,作为中肠防御系统的PM已成为害虫生物防治的新靶标。分离和鉴定甜菜夜蛾肠粘蛋白基因cDNA。【方法】以甜菜夜蛾(Spodoptera exigua)中肠为材料,依据stratagene公司试剂盒方法,构建甜菜夜蛾中肠cDNA表达文库。依据现代免疫学原理,利用粉纹夜蛾肠粘蛋白特异性多克隆抗体(anti-ⅡMantiserum)筛选该文库。【结果】cDNA表达文库滴度为8.51×106pfu/ml,重组率为99.97%。筛选文库得到一个编码甜菜夜蛾肠粘蛋白的cDNA克隆SeⅡM-8。核酸序列分析显示,该cDNA长为2234bp,在polyA末端上游24bp处有一个多聚腺苷酸信号序列AAATTA。最长读码框(ORF)编码714个氨基酸,与粘虫肠粘蛋白(Mamestra configurata intestinal mucin)序列相似性为42%。结构域分析表明,它具有5个几丁质结合功能域;一个富含苏氨酸类粘蛋白结构域,重复序列为TTTQAPTTT,高度O-联糖基化;一个天冬氨酸富集区,序列DDDKPGCNGNCPE重复达12次,该区域在已知的昆虫肠粘蛋白中属首次发现。与已知肠粘蛋白比较,推测其5′端还应包括信号肽序列和几丁质结合功能域的未知序列。SeⅡM-8基因在GenBank登录号为EU047712。【结论】从本研究构建的高质量甜菜夜蛾中肠cDNA表达文库中筛选得到一个新的围食膜蛋白基因SeⅡM-8。 展开更多
关键词 甜菜夜蛾 中肠 cdna表达文库 昆虫肠粘蛋白 SeⅡM-8
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猪肥胖基因cDNA的克隆与分析 被引量:52
15
作者 戴茹娟 李宁 吴常信 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2000年第4期290-297,共8页
肥胖基因(ob)是近年刚被克隆的新基因,该基因产物Leptin是反映体内脂肪含量和调节 体重的重要信号因子。首次报道猪ob基因全长序列,并对不同物种ob基因的同源性进行了比 较。以λ Uni-ZAPTM为载体构建了猪脂... 肥胖基因(ob)是近年刚被克隆的新基因,该基因产物Leptin是反映体内脂肪含量和调节 体重的重要信号因子。首次报道猪ob基因全长序列,并对不同物种ob基因的同源性进行了比 较。以λ Uni-ZAPTM为载体构建了猪脂肪cDNA文库,根据已知的人和鼠ob基因序列设计PCR 引物,利用PCR法筛选猪脂肪cDNA文库,并用RT-PCR从脂肪RNA中扩增的366bp猪ob基 因片段作探针,获得了全长3 277bp的猪ob基因cDNA的克隆和序列。 ob基因序列在不同的物 种之间具有很强的保守性。猪与人和鼠ob基因编码区核苷酸序列的同源性分别为88.5%和 84.7%;猪ob基因编码的Leptin蛋白氨基酸序列和人、鼠Leptin蛋白的同源性分别为86.0%和 83.4%。RT-PCR分析表明:猪ob基因不仅在脂肪组织中大量表达,而且在肝脏、心脏、脾脏、肾 脏、肌肉组织中也有微量表达。表明猪ob基因的表达调控与人和鼠可能存在差异。 展开更多
关键词 OB基因 Leptin蛋白 基因克隆 序列分析 脂肪
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猪Follistatin cDNA克隆及在大肠杆菌中的表达 被引量:8
16
作者 何新 齐冰 +3 位作者 何立千 陈永福 刘桂生 陈清轩 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期677-681,共5页
提取猪卵巢总RNA,用RT-PCR方法克隆了猪FollistatincDNA的完整开放阅读框,长1038bp。将FollistatincDNA连接到原核表达载体pGEX-4T-3中,转化大肠杆菌BL21(DE3),以IPTG诱导,进行了GST-FS融合蛋白表达。用SDS-PAGE和Western杂交检测,结果... 提取猪卵巢总RNA,用RT-PCR方法克隆了猪FollistatincDNA的完整开放阅读框,长1038bp。将FollistatincDNA连接到原核表达载体pGEX-4T-3中,转化大肠杆菌BL21(DE3),以IPTG诱导,进行了GST-FS融合蛋白表达。用SDS-PAGE和Western杂交检测,结果显示在63kD处有特异性表达蛋白。 展开更多
关键词 RT-PCR 猪Follistatin cdna 原核表达
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猪CTSD全长cDNA的克隆和表达分析 被引量:7
17
作者 梅盈洁 李加琪 +5 位作者 陈瑶生 李晓筠 朱良瑞 凌飞 王翀 张豪 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期432-436,共5页
以人CTSD mRNA全长序列为基序,在db EST库中搜索同源性大于80%、重叠大于40个碱基的猪EST下载经Seqman软件装配后,利用RT-PCR扩增到猪CTSD基因部分cDNA序列,进一步通过RACE技术获得cDNA全长(GenBank登录号为DQ018727),猪CTSD基因cDNA... 以人CTSD mRNA全长序列为基序,在db EST库中搜索同源性大于80%、重叠大于40个碱基的猪EST下载经Seqman软件装配后,利用RT-PCR扩增到猪CTSD基因部分cDNA序列,进一步通过RACE技术获得cDNA全长(GenBank登录号为DQ018727),猪CTSD基因cDNA全长2032 bp包括93 bp 5′UTR区、706 bp 3′UTR区和1 233bp ORF,编码410个氨基酸残基。其编码区与人、鼠、牛、羊CTSD编码区同源性分别为87.9%、78.2%、86.6%和85.0%,其氨基酸序列与人、鼠、牛、羊氨基酸序列同源性分别为86.6%、80.1%、86.0%和84.7%。疏水性分析和信号肽预测发现猪CTSD氨基酸序列存在至少7个疏水性区域,信号肽位点为第1-20个氨基酸残基。在NCBI进行Blast P搜索结果显示猪CTSD氨基酸结构中含有Asn(Asparagine,天门冬酰胺)结构域,与天冬氨酸蛋白酶3D结构同源性高达99.7%,具有真核生物天冬氨酸蛋白酶的典型结构。以猪多组织RNA池为模板,以1026 bp部分cDNA序列作为杂交探针进行Northern杂交,得到一条2000 bp左右特异条带,从而验证了RACE产物为全长cDNA并揭示该基因只有一个转录本。为了研究猪CTSD基因在体内不同组织内表达的特点,采用半定量RT-PCR对CTSD基因在猪10个组织中的表达进行研究,结果表明在10个组织中均有表达,且表达量与-βactin内参接近。 展开更多
关键词 溶酶体组织蛋白酶D 电子克隆 快速扩增cdna末端 全长cdna
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猪生长激素cDNA的全序列分析 被引量:9
18
作者 齐顺章 王辛中 +4 位作者 周顺伍 贾锋 王华岩 夏立 李娟 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 1989年第1期35-39,共5页
本文报道了两个猪生长激素cDNA的全序列分析的结果。猪生长激素cDNA是我们由猪垂体mRNA经过反向转录、克隆和筛选后获得的。文中还将这两个序列与Seeburg等(1983)报道的序列以及Vize等(1987)报道的猪基因组生长激素基因的序列进行了比... 本文报道了两个猪生长激素cDNA的全序列分析的结果。猪生长激素cDNA是我们由猪垂体mRNA经过反向转录、克隆和筛选后获得的。文中还将这两个序列与Seeburg等(1983)报道的序列以及Vize等(1987)报道的猪基因组生长激素基因的序列进行了比较和讨论。 展开更多
关键词 猪生长激素 cdna序列
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猪生长激素cDNA克隆及在大肠杆菌中的表达 被引量:4
19
作者 白俊杰 叶星 +2 位作者 李新辉 简清 罗建仁 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期99-102,共4页
用逆转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)方法 ,从猪脑垂体总RNA中扩增出编码猪生长激素 (GH)成熟肽基因序列 ,定向克隆至质粒pUC18。序列分析表明 ,克隆的猪GHcDNA长 5 73bp ,不含信号肽序列 ,并在该序列之前加入一起始密码子ATG。将猪GHcDN... 用逆转录 聚合酶链式反应 (RT PCR)方法 ,从猪脑垂体总RNA中扩增出编码猪生长激素 (GH)成熟肽基因序列 ,定向克隆至质粒pUC18。序列分析表明 ,克隆的猪GHcDNA长 5 73bp ,不含信号肽序列 ,并在该序列之前加入一起始密码子ATG。将猪GHcDNA定向克隆至原核表达载体pBV2 2 0 ,构建成重组猪GH基因表达载体pBVpGH7。SDS PAGE和薄层扫描分析表明 :经 42℃诱导 ,pBVpGH7在大肠杆菌中可表达一分子量约 2 2 0 0 0的特异蛋白 ,表达量约占细胞总蛋白的 2 0 .5 %。 展开更多
关键词 生长激素cdna 基因克隆 大肠杆菌表达 鱼用饲料添加剂 促生长作用 RT-PCR
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鲫鱼(Carassius auratus)slc7A8基因分子特征及表达分析 被引量:3
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作者 熊钢 刘臻 +4 位作者 王晓清 鲁双庆 张建社 谢帝芝 罗小华 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期935-940,共6页
采用RT-PCR和RACE技术克隆鲫鱼slc7A8基因的全长cDNA序列,对基因序列用生物软件对基因进行生物信息分析,用Real-time PCR方法检测基因在组织中的mRNA表达丰度。结果表明,鲫鱼slc7A8cDNA全长为2709bp,包含195bp的5′UCR序列,921bp的3′UC... 采用RT-PCR和RACE技术克隆鲫鱼slc7A8基因的全长cDNA序列,对基因序列用生物软件对基因进行生物信息分析,用Real-time PCR方法检测基因在组织中的mRNA表达丰度。结果表明,鲫鱼slc7A8cDNA全长为2709bp,包含195bp的5′UCR序列,921bp的3′UCR序列,1593bp开放阅读框,编码530个氨基酸序列;鲫鱼与斑马鱼基因同源性和编码氨基酸同源性分别为88.9%和95.5%,而与其他动物分别在70.1%-74.8%和80.6%-82.1%之间;预测编码蛋白的分子量为57719.84,等电点为4.8,对其结构预测显示该蛋白具有与哺乳动物十分相似的12个螺旋跨膜结构,跨膜区氨基酸高度保守,不同动物间的同源性都在92.2%以上;Real-time PCR检测鲫鱼组织中的mRNA表达丰度高低顺序为前肠、中肠、脑、后肠、肌肉、肾、鳃、心、肝脏。 展开更多
关键词 鲫鱼 slc7A8 cdna 分子特征 slc7A8 mRNA表达丰度
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