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基于DNA序列信息的核小体位点预测
1
作者
舒展
《信息技术》
2017年第8期173-176,共4页
核小体位点参与很多细胞活动并且在调控细胞进程中起重要作用,核小体位点的精确定位对生物医学和药物学有重大意义。该文结合机器学习算法和DNA序列信息建立一个新的核小体位点预测模型,目的是为了更快更精确地预测核小体位点。实验中使...
核小体位点参与很多细胞活动并且在调控细胞进程中起重要作用,核小体位点的精确定位对生物医学和药物学有重大意义。该文结合机器学习算法和DNA序列信息建立一个新的核小体位点预测模型,目的是为了更快更精确地预测核小体位点。实验中使用K间隔核酸对组成特征和位置特异性核苷酸偏好特征将DNA序列进行编码,然后使用支持向量机对模型进行训练和分类预测。最后将该方法和目前主流的核小体位点预测模型在相同的数据集上做Jackknife测试,实验结果证明了该方法提高了核小体位点预测的正确率。
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关键词
DNA序列
K间隔核酸对组成特征
位置特异性核苷酸偏好特征
支持向量机
Jackknife测试
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职称材料
题名
基于DNA序列信息的核小体位点预测
1
作者
舒展
机构
南京理工大学计算机科学与工程学院
出处
《信息技术》
2017年第8期173-176,共4页
文摘
核小体位点参与很多细胞活动并且在调控细胞进程中起重要作用,核小体位点的精确定位对生物医学和药物学有重大意义。该文结合机器学习算法和DNA序列信息建立一个新的核小体位点预测模型,目的是为了更快更精确地预测核小体位点。实验中使用K间隔核酸对组成特征和位置特异性核苷酸偏好特征将DNA序列进行编码,然后使用支持向量机对模型进行训练和分类预测。最后将该方法和目前主流的核小体位点预测模型在相同的数据集上做Jackknife测试,实验结果证明了该方法提高了核小体位点预测的正确率。
关键词
DNA序列
K间隔核酸对组成特征
位置特异性核苷酸偏好特征
支持向量机
Jackknife测试
Keywords
DNA sequences
k-spaced nucleic acid pairs
feature
position-specific nucleotide propensity feature
suport vector machine
Jackknife test
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
Q523 [生物学—生物化学]
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作者
出处
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1
基于DNA序列信息的核小体位点预测
舒展
《信息技术》
2017
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