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副干酪乳杆菌prcA基因克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
王洋
葛菁萍
+1 位作者
由田
平文祥
《中国农学通报》
CSCD
2014年第18期259-263,共5页
旨在了解副干酪乳杆菌prcA基因的结构和功能,探明prcA基因与副干酪乳杆菌拟群体效应相关基因—自诱导肽编码基因之间的联系。通过PCR方法对副干酪乳杆菌中prcA进行扩增,并通过生物信息学方法对该基因的核苷酸组成、蛋白质构象等方面进...
旨在了解副干酪乳杆菌prcA基因的结构和功能,探明prcA基因与副干酪乳杆菌拟群体效应相关基因—自诱导肽编码基因之间的联系。通过PCR方法对副干酪乳杆菌中prcA进行扩增,并通过生物信息学方法对该基因的核苷酸组成、蛋白质构象等方面进行预测和分析。克隆得到的prcA基因全长为416 bp,包括一个138 bp的开放阅读框,编码45个氨基酸,蛋白分子量为5326.83 Da,等电点为4.85,是一种稳定蛋白,不含跨膜区,蛋白质的二级结构以α-螺旋、不规则卷曲和延伸主链组成,亚细胞定位预测显示该蛋白主要位于细胞外;prcA基因为副干酪乳杆菌拟群体效应相关基因—自诱导肽编码基因,负责细菌素生成的调控。
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关键词
副干酪乳杆菌
prca
基因
生物信息学
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职称材料
纯红细胞再生障碍性贫血临床特点与RPS19、RPL5、RPL11基因突变之多中心研究
被引量:
3
2
作者
廖雪莲
蒋莎义
+3 位作者
蒋慧
何海龙
陈力军
谢晓恬
《同济大学学报(医学版)》
CAS
2015年第6期36-39,45,共5页
目的通过对纯红细胞再生障碍性贫血的临床回顾与RPS19、RPL5、RPL11基因突变的检测,分析比较先天性纯红细胞再生障碍性贫血与获得性纯红细胞再生障碍性贫血的临床异同和RPS19、RPL5和RPL11基因突变情况。方法 20例来自多中心的儿童纯红...
目的通过对纯红细胞再生障碍性贫血的临床回顾与RPS19、RPL5、RPL11基因突变的检测,分析比较先天性纯红细胞再生障碍性贫血与获得性纯红细胞再生障碍性贫血的临床异同和RPS19、RPL5和RPL11基因突变情况。方法 20例来自多中心的儿童纯红细胞再生障碍性贫血,先天性14例,获得性6例,分析临床资料并比较两组发病年龄、外周血细胞计数和对治疗的反应。Sanger双脱氧链终止法对患儿RPS19、RPL5和RPL11基因测序。结果先天性纯红细胞再生障碍性贫血42.8%伴有先天畸形,与获得性纯红细胞再生障碍性贫血比较,网织红细胞较低(P<0.05),外周血WBC、HGB和PLT无差异。激素治疗有效率分别是:先天性78.6%、获得性100%(P<0.05)。先天性纯红再障7.1%检出RPS19点突变,获得性纯红再障未发现RPS19突变。先天性纯红再障和获得性纯红再障RPL5和RPL11基因均未发现突变。结论先天性纯红再障42.8%合并畸形,网织红细胞均低于获得性纯红再障,RPS19突变率低于国外文献报道。RPS19突变可能与先天性纯红再障有关。获得性纯红再障发病与RPS19、RPL5和RPL11基因异常可能无关。
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关键词
纯红细胞再生障碍性贫血
核糖体蛋白基因
基因突变
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职称材料
题名
副干酪乳杆菌prcA基因克隆及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
王洋
葛菁萍
由田
平文祥
机构
微生物黑龙江省高校重点实验室
出处
《中国农学通报》
CSCD
2014年第18期259-263,共5页
基金
国家自然科学基金"副干酪乳杆菌HD1.7细菌素的产生与菌群密度之间的生态学效应关系的研究"(31070446)
国家自然科学基金"拮抗菌株对副干酪乳杆菌产细菌素的影响及关键蛋白质的筛选"国际合作项目(31210103026)
+4 种基金
国家自然科学基金"表达IBDV主要保护性抗原的重要杆状病毒构建及其作为疫苗的免疫效果研究"(31270143)
国家自然科学基金"菌群演替与温水沤麻系统关键酶产生菌代谢组学特征的耦合机制"(31270534)
黑龙江大学高层次人才(创新团队)支持计划"功能微生物选育及其产物应用"(Hdtd2010-17)
黑龙江省科技厅"农业微生物发酵技术"科技创新团队
黑龙江省高等学校科技创新团队(农业微生物发酵技术)
文摘
旨在了解副干酪乳杆菌prcA基因的结构和功能,探明prcA基因与副干酪乳杆菌拟群体效应相关基因—自诱导肽编码基因之间的联系。通过PCR方法对副干酪乳杆菌中prcA进行扩增,并通过生物信息学方法对该基因的核苷酸组成、蛋白质构象等方面进行预测和分析。克隆得到的prcA基因全长为416 bp,包括一个138 bp的开放阅读框,编码45个氨基酸,蛋白分子量为5326.83 Da,等电点为4.85,是一种稳定蛋白,不含跨膜区,蛋白质的二级结构以α-螺旋、不规则卷曲和延伸主链组成,亚细胞定位预测显示该蛋白主要位于细胞外;prcA基因为副干酪乳杆菌拟群体效应相关基因—自诱导肽编码基因,负责细菌素生成的调控。
关键词
副干酪乳杆菌
prca
基因
生物信息学
Keywords
Lactobacillus paracasei
prca gene
bioinformaties
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
纯红细胞再生障碍性贫血临床特点与RPS19、RPL5、RPL11基因突变之多中心研究
被引量:
3
2
作者
廖雪莲
蒋莎义
蒋慧
何海龙
陈力军
谢晓恬
机构
上海交通大学附属儿童医院血液/肿瘤科
苏州儿童医院血液科
山东省儿童医院血液科
同济大学附属同济医院儿科
出处
《同济大学学报(医学版)》
CAS
2015年第6期36-39,45,共5页
基金
上海交通大学自然科学基金(13XJ10069)
文摘
目的通过对纯红细胞再生障碍性贫血的临床回顾与RPS19、RPL5、RPL11基因突变的检测,分析比较先天性纯红细胞再生障碍性贫血与获得性纯红细胞再生障碍性贫血的临床异同和RPS19、RPL5和RPL11基因突变情况。方法 20例来自多中心的儿童纯红细胞再生障碍性贫血,先天性14例,获得性6例,分析临床资料并比较两组发病年龄、外周血细胞计数和对治疗的反应。Sanger双脱氧链终止法对患儿RPS19、RPL5和RPL11基因测序。结果先天性纯红细胞再生障碍性贫血42.8%伴有先天畸形,与获得性纯红细胞再生障碍性贫血比较,网织红细胞较低(P<0.05),外周血WBC、HGB和PLT无差异。激素治疗有效率分别是:先天性78.6%、获得性100%(P<0.05)。先天性纯红再障7.1%检出RPS19点突变,获得性纯红再障未发现RPS19突变。先天性纯红再障和获得性纯红再障RPL5和RPL11基因均未发现突变。结论先天性纯红再障42.8%合并畸形,网织红细胞均低于获得性纯红再障,RPS19突变率低于国外文献报道。RPS19突变可能与先天性纯红再障有关。获得性纯红再障发病与RPS19、RPL5和RPL11基因异常可能无关。
关键词
纯红细胞再生障碍性贫血
核糖体蛋白基因
基因突变
Keywords
Diamond-Blackfan Anemia(DBA)
Pure Red Cell Aplasia(
prca
)
gene
Mutation
RPS19
RPL5
RPL11
分类号
R725.5 [医药卫生—儿科]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
副干酪乳杆菌prcA基因克隆及生物信息学分析
王洋
葛菁萍
由田
平文祥
《中国农学通报》
CSCD
2014
2
下载PDF
职称材料
2
纯红细胞再生障碍性贫血临床特点与RPS19、RPL5、RPL11基因突变之多中心研究
廖雪莲
蒋莎义
蒋慧
何海龙
陈力军
谢晓恬
《同济大学学报(医学版)》
CAS
2015
3
下载PDF
职称材料
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