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Premature Stop Codon at Residue 101 within HIV-1 Rev Does Not Influence Viral Replication of Clade BC but Severely Reduces Viral Fitness of Clade B 被引量:1
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作者 Zheng Wang Xiaolin Ji +4 位作者 Yanling Hao Kunxue Hong Liying Ma Dan Li Yiming Shao 《Virologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2020年第2期181-190,共10页
HIV-1 Rev is an accessory protein that plays a key role in nuclear exportation,stabilization,and translation of the viral mRNAs.Rev of HIV-1 clade BC often shows a truncation of 16 AAs due to a premature stop codon at... HIV-1 Rev is an accessory protein that plays a key role in nuclear exportation,stabilization,and translation of the viral mRNAs.Rev of HIV-1 clade BC often shows a truncation of 16 AAs due to a premature stop codon at residue 101.This stop codon presents the highest frequency in clade BC and the lowest frequency in clade B.In order to discover the potential biological effect of this truncation on Rev activity and virus replication of clade BC,we constructed Rev expression vectors of clade BC with or without 16 AAs within C-terminal separately,and replaced the stop codon by Q in a CRF07_BC infectious clone.We found that 16 AAs truncation had no effect on expression and activity of Rev in clade BC.Also,the mutation from the stop codon to Q had no effect on virus replication of clade BC.Next,to investigate the effect of this truncation on Rev activity and replication capacity of clade B,Rev expression vectors of clade B carrying or lacking 16 AAs in C-terminal were constructed respectively,and residue Q at position 101 within Rev was substituted by the stop codon in a clade B infectious clone.It was found that 16 AAs truncation significantly down-regulated Rev expression and impaired clade B Rev activity.Furthermore,a Q-to-stop codon substitution within Rev significantly reduced viral replication fitness of clade B.These results indicate that the premature stop codon at residue 101 within Rev exerts diverse impact on viral replication among different HIV-1 clades. 展开更多
关键词 HIV-1 CRF_BC REV premature stop codon REPLICATION
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tRNA抑制子对转录因子NKX2.5提前终止密码子的通读 被引量:1
2
作者 欧阳平 刘远航 +6 位作者 黄志刚 齐小娟 倪倩 刘亚萍 宋仁生 李涛 吴柱国 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第4期367-373,共7页
人类NKX2.5基因(NK2 homeobox 5,NKX2.5)提前终止密码子(Premature termination codon,PTC)突变会引起房间隔缺损、房室传导阻滞等先天性心脏病。目前,已报道的NKX2.5 PTC突变有8个(E109X、Q149X、Q170X、Q187X、Q198X、Y256X、... 人类NKX2.5基因(NK2 homeobox 5,NKX2.5)提前终止密码子(Premature termination codon,PTC)突变会引起房间隔缺损、房室传导阻滞等先天性心脏病。目前,已报道的NKX2.5 PTC突变有8个(E109X、Q149X、Q170X、Q187X、Q198X、Y256X、Y259X和C264X)。为了检测tRNA抑制子是否对PTC突变诱导通读产生有功能的全长蛋白,文章将8个NKX2.5 PTC突变克隆到pcDNA3.1(-)载体,将NKX2.5全长和E109X、Q149X及C264X克隆到pEGFP-N1载体,形成NKX2.5-EGFP融合质粒。将NKX2.5-EGFP与对应的tRNA抑制子质粒分别或共转染后观察绿色荧光数量定性判断tRNA抑制子是否诱导通读。Western blotting检测通读后全长蛋白和截短蛋白表达并计算通读效率。Real-time PCR检测NKX2.5下游重要调控基因Cx43 mRNA的表达判断通读后蛋白功能。结果表明,文章成功构建了8个基于pcDNA3.1(-)的NKX2.5表达质粒、4个基于pEGFP-N1的质粒;tRNA抑制子tRNA am能有效通读Q149X、Q170X、Q187X和Q198X,且对后三者的通读效率均在50%以上;tRNA op能有效通读C264X,通读效率约50%左右;tRNA oc不能通读NKX2.5 PTC突变;各通读后样本Cx43 mRNA相对表达量增加7%~41.7%;tRNA am和tRNA op能有效通读NKX2.5 PTC突变,产生具有功能的全长蛋白,但tRNA抑制子对细胞的其他影响还不明确,有待于进一步观察。 展开更多
关键词 tRNA抑制子 NKX2.5 提前终止密码子 通读 先天性心脏病
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NMD作用的顺式调控元件 被引量:1
3
作者 黄峙 周天鸿 郭宝江 《Acta Genetica Sinica》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第11期1321-1326,共6页
真核生物利用无义介导的mRNA降解 (nonsense mediatedmRNAdecay ,NMD) ,对含有提前终止密码子(prematureterminationcodons ,PTC)的异常转录产物进行快速清除 ,防止毒害性截短蛋白 (truncatedproteins)的产生 ,是真核生物重要的mRNA监... 真核生物利用无义介导的mRNA降解 (nonsense mediatedmRNAdecay ,NMD) ,对含有提前终止密码子(prematureterminationcodons ,PTC)的异常转录产物进行快速清除 ,防止毒害性截短蛋白 (truncatedproteins)的产生 ,是真核生物重要的mRNA监视机制。NMD作用的启动与多种顺式调控元件有关 ,它们包括 :提前终止密码子的标识 ;PTC下游特定位置的序列元件 ,在酵母细胞称为DSE (downstreamsequenceelement,DSE) ,在哺乳动物细胞主要为内含子剪接依赖性序列元件 (exon exonjunction ,EEJ) ;稳定作用元件 (stabilizerelements ,STE)对NMD作用的阻抑调节 ;以及其他与NMD作用相关的序列 ,如 poly(A)延长、5′ UTR的uORF(upstreamopenreadingframe ,uORF)和程序化核糖体移码 (programmed 1ribosomalframeshift, 1PRF)信号序列等。 展开更多
关键词 无义介导的mRNA降解 NMD 顺式调控元件 提前终止密码子(ptc) 截短蛋白
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NMD机制及其对人类遗传病的治疗意义 被引量:2
4
作者 胡建燃 李平 《生命科学研究》 CAS CSCD 2016年第6期535-541,共7页
无义介导的mRNA降解机制(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是真核细胞内重要的RNA质量监控机制,能够识别并降解含有提前终止子(premature termination codon,PTC)的mRNA,避免细胞内积累有害的截短蛋白质产物。同时,NMD机制还调控着大... 无义介导的mRNA降解机制(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是真核细胞内重要的RNA质量监控机制,能够识别并降解含有提前终止子(premature termination codon,PTC)的mRNA,避免细胞内积累有害的截短蛋白质产物。同时,NMD机制还调控着大量不含PTC的mRNA稳定性,影响其蛋白质产物的含量。现综述了NMD机制的底物、调控因子及其对人类遗传病治疗意义的最新研究进展。 展开更多
关键词 无义介导的mRNA降解机制(NMD) 真核生物细胞 提前终止子(ptc) 人类遗传病
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无义介导的mRNA降解机制及其在单基因遗传病中的作用 被引量:7
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作者 郭文婷 徐汪洋 顾鸣敏 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2012年第8期935-942,共8页
无义介导的mRNA降解(Nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是一种广泛存在于真核生物细胞中的mRNA质量监控机制。该机制通过识别和降解含有提前终止密码子(Premature translational-termination codon,PTC)的转录产物防止有潜在毒性的截... 无义介导的mRNA降解(Nonsense-mediated mRNA decay,NMD)是一种广泛存在于真核生物细胞中的mRNA质量监控机制。该机制通过识别和降解含有提前终止密码子(Premature translational-termination codon,PTC)的转录产物防止有潜在毒性的截短蛋白的产生。据估计,约1/3的遗传性疾病是由提前终止密码子引起的,而NMD作用通常会改变某些遗传病的临床症状或遗传方式。文章主要综述了人体细胞中NMD对底物的识别及其作用机制,并以几种单基因遗传病为例探讨其对这些疾病表型的影响,表明NMD作用机制的进一步揭示将有助于单基因遗传病发病机制的阐明及治疗方法的改进。 展开更多
关键词 无义介导的mRNA降解(NMD) 提前终止密码子(ptc) 截短蛋白 人类单基因遗传病
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无义介导的mRNA降解 被引量:8
6
作者 贾晓波 胡剑 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期115-120,共6页
无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作为真核细胞中重要RNA监控机制,识别并降解开放阅读框中含有提前终止密码子(premature termination codon,PTC)的mRNA,以避免因截短的蛋白产物积累对细胞造成毒害.NMD还调控正常... 无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay,NMD)作为真核细胞中重要RNA监控机制,识别并降解开放阅读框中含有提前终止密码子(premature termination codon,PTC)的mRNA,以避免因截短的蛋白产物积累对细胞造成毒害.NMD还调控正常生理基因的表达,暗示其在真核细胞中扮演重要角色.NMD途径的关键是PTC的识别.本文通过3种模型来分别阐述发现于哺乳动物、酵母等不同有机体的识别机制.通常由NMD因子UPF1(up-frameshift)等被招募至含PTC的mRNA上,借助这些因子组装形成"功能复合体"并激活降解.但目前对于PTC识别后的过程仍认识有限,本文通过综述NMD途径的分子机制以更好地理解其生物学意义. 展开更多
关键词 提前终止密码子(ptc) 外显子连接复合体(EJC) 上游移码蛋白(UPF)
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NMD逃逸机制及其在疾病治疗中的应用
7
作者 程苗苗 曹延延 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期354-362,共9页
无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay, NMD)是指在病理或正常生理情况下mRNA上出现了提前终止密码子(premature termination codon, PTC),从而导致mRNA降解。它是一种广泛存在的mRNA质量监控机制。近年来,在多种疾病中发... 无义介导的mRNA降解(nonsense-mediated mRNA decay, NMD)是指在病理或正常生理情况下mRNA上出现了提前终止密码子(premature termination codon, PTC),从而导致mRNA降解。它是一种广泛存在的mRNA质量监控机制。近年来,在多种疾病中发现某些PTC并未触发NMD,这种现象被称为NMD逃逸(NMD escape),然而其确切机制尚不十分清楚。目前公认的两个学说为:(1) PTC通读,即蛋白的翻译可以顺利通过PTC直至正常的终止密码子,产生全长蛋白;(2)翻译的重新启动,即蛋白翻译在PTC下游的潜在起始点重新开始直至终止密码子,产生N端截短蛋白。目前,通过利用PTC通读,越来越多的药物或小分子已被成功用于无义变异相关疾病的治疗。本文主要综述了NMD逃逸的机制及其在疾病治疗中的应用和进展,以期为进一步了解NMD逃逸及其相关应用概况提供参考。 展开更多
关键词 NMD逃逸 无义突变 提前终止密码子 ptc通读
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FBN1基因钙结合转化生长因子结构域终止突变基因型表型研究 被引量:1
8
作者 张琳 张莹 +2 位作者 范鹏 杨坤璂 周宪梁 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2018年第3期2513-2516,共4页
目的报道一个马凡综合征家系的临床特征和致病基因筛查结果,同时探索FBN1基因表皮生长因子结构域终止突变和临床表型间的关系。方法研究纳入1个马凡综合征家系,经询问病史及检查,并对其基因组DNA进行了FBN1基因测序。结合既往研究的数... 目的报道一个马凡综合征家系的临床特征和致病基因筛查结果,同时探索FBN1基因表皮生长因子结构域终止突变和临床表型间的关系。方法研究纳入1个马凡综合征家系,经询问病史及检查,并对其基因组DNA进行了FBN1基因测序。结合既往研究的数据进行了FBN1基因钙结合表皮生长因子结构域终止突变的基因型与表型关联分析。结果在马凡综合征先证者及其家系成员中发现FBN1基因8号表皮生长因子结构域(cb EGF-like#08)移码突变p.Glu768Valfs X6,c.2302_2309del GAATGTGT。结合以往研究报道的基因型-表型分析发现,发生于FBN1基因8号表皮生长因子结构域的终止(PTC)突变,100%携带者有心血管系统累及(5/5),80.0%的携带者有骨骼系统的异常累及(4/5)。结论研究报道了MFS家系的一个新的致病移码突变Glu768Valfs X6,携带者容易出现主动脉夹层及主动脉瘤。基因型表型分析发现,发生于FBN1基因钙结合表皮生长因子结构域的终止突变更容易出现主动脉根部扩张及主动脉夹层等严重心血管系统表型。这些发现对马凡综合征的诊断和治疗有重要意义。 展开更多
关键词 马凡综合征 FBN1基因 基因型-表型分析 终止突变
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马凡综合征FBN1基因突变及基因型表型关联研究 被引量:4
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作者 张莹 张琳 +3 位作者 高凌根 杨坤璂 杨延坤 周宪梁 《中国分子心脏病学杂志》 CAS 2016年第4期1792-1796,共5页
目的本研究报道了一个马凡综合征家系的临床特征和致病基因筛查结果,同时探索了FBN1基因突变和临床表型间的关系。方法研究纳入1个MFS家系,经询问病史及检查,并对其基因组DNA进行了FBN1测序。结合既往研究的数据进行了基因型与表型关联... 目的本研究报道了一个马凡综合征家系的临床特征和致病基因筛查结果,同时探索了FBN1基因突变和临床表型间的关系。方法研究纳入1个MFS家系,经询问病史及检查,并对其基因组DNA进行了FBN1测序。结合既往研究的数据进行了基因型与表型关联分析。结果在先证者及家系成员中发现FBN1终止突变p.R565X,c.1693C>T。基因型-表型分析发现,100%携带者有心血管系统累及(9/9),88.9%的携带者有骨骼系统的异常累及(8/9)。结论本研究报道了MFS家系的致病突变R565X。携带者容易出现心血管和骨骼病变,进行氯沙坦治疗可以延缓主动脉病变的进展。这些发现对马凡综合征的诊断和治疗有重要意义。 展开更多
关键词 马凡综合征 FBN1基因 基因型-表型分析 终止突变
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