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植物遗传转化中体细胞再生的分子机制及应用研究进展
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作者 李玉珠 余江弟 +3 位作者 丁菲菲 苗佳敏 白小明 师尚礼 《草业学报》 CSCD 北大核心 2024年第2期198-211,共14页
植物遗传转化是转基因技术及以此为基础的基因组编辑、功能基因组学研究和分子育种的关键。其中,物种和基因型差异往往是限制遗传转化效率和基因编辑技术广泛应用的主要瓶颈。随着再生芽发生和体胚发生的分子机制被逐渐探明,在愈伤组织... 植物遗传转化是转基因技术及以此为基础的基因组编辑、功能基因组学研究和分子育种的关键。其中,物种和基因型差异往往是限制遗传转化效率和基因编辑技术广泛应用的主要瓶颈。随着再生芽发生和体胚发生的分子机制被逐渐探明,在愈伤组织形成、增殖和再生过程中涉及生长素和细胞分裂素合成、响应和信号转导的生长及发育调节基因被用于提高遗传转化效率。本研究首先综述了植物遗传转化过程中体细胞再生的不同途径和方式,以及转化细胞以间接的器官发生方式和体胚发生方式再生的分子机制。然后重点讨论了与生长素和细胞分裂素有关的再生促进基因在提高再生效率,缩短转化时间,以及实现执拗型物种和基因型的遗传转化等方面的应用。最后总结了再生促进基因在转基因和基因编辑中的应用潜力和研究方向。 展开更多
关键词 遗传转化 再生 再生芽发生 体胚发生 再生促进基因
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高校遗传学课程思政教学提升研究与探索实践 被引量:1
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作者 王雁伟 任亚娟 +1 位作者 李振侠 艾鹏飞 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第9期1317-1328,共12页
理工科专业课程思政的实施需要密切关注思政元素的融入与专业课程内容的有机结合。遗传学课程专业性较强,课程思政的开展有其独特的方式方法,本文首先对当代大学生的特点进行探讨,并指出思政理念在当代大学教学中的必要性。针对遗传学... 理工科专业课程思政的实施需要密切关注思政元素的融入与专业课程内容的有机结合。遗传学课程专业性较强,课程思政的开展有其独特的方式方法,本文首先对当代大学生的特点进行探讨,并指出思政理念在当代大学教学中的必要性。针对遗传学课程特点以及遗传学课程思政建设现状,从教学团队建设、教学设计优化、思政元素挖掘和思政素材在课程内容有机融入四个方面对课程思政教学提升策略进行探究,并以笔者所在教学团队的实际教学情况为例,进行后续的教学评价和反思,收到了较为良好的效果,80%以上的学生认为,遗传学课程思政的实施提高了他们的学习兴趣和综合能力,且促进了专业课程的学习,学生总成绩平均提高约5.5%。以此抛砖引玉,为其他相关课程的课程思政建设提供启示,让课程思政为学生能力的提升和品格的优化保驾护航。 展开更多
关键词 遗传学 课程思政 教学提升 人才培养
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基于BP神经网络模型优化Fe_(1-x)O基氨合成催化剂 被引量:1
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作者 张书铭 刘化章 《化工进展》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第3期1302-1308,共7页
运用BP神经网络建立了助催化剂含量与催化剂活性之间的预测模型,对Fe_(1-x)O基氨合成催化剂的助催化剂进行优化。首先将前期实验数据整理归纳为含有3、4、5、6和7个助催化剂等5类催化剂,以助催化剂含量(体积分数)为输入变量,以425℃反... 运用BP神经网络建立了助催化剂含量与催化剂活性之间的预测模型,对Fe_(1-x)O基氨合成催化剂的助催化剂进行优化。首先将前期实验数据整理归纳为含有3、4、5、6和7个助催化剂等5类催化剂,以助催化剂含量(体积分数)为输入变量,以425℃反应器出口氨浓度(活性)为输出变量,对助催化剂进行优化。结果表明,BP神经网络预测模型拟合值均方误差最高为0.2784,预测值均方误差最高为0.1592,构建的BP神经网络模型准确度较高。在该模型的基础上,运用多种群遗传算法进行极值寻优,求解最优的催化剂配方,并进行实验验证。结果表明,根据优化结果制备5个样品的实验测定值与预测值的相对误差最高为2.88%,优化结果较为准确;含有7个助催化剂的催化剂活性最高为18.83%,比原样本的统计平均活性值(17.52%)高1.31%,相对提高7.48%,助催化剂含量优化取得满意的结果。 展开更多
关键词 Fe_(1-x)O 催化剂 助催化剂 神经网络 遗传算法 优化
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小黑杨Rubisco小亚基基因启动子的克隆及表达活性分析
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作者 曹佳玉 曹丽娜 +7 位作者 张俏艺 张双 胡志宝 赵唐锐 许志茹 李春明 全先奎 刘关君 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期625-633,共9页
核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco)是光合作用中决定碳同化速率的关键酶,其中小亚基(rbcS)是由核基因编码,并且主要在叶片中表达。利用RT-qPCR技术确定了小黑杨(Populus×xiaohei)叶片中高表达的Rubisco小亚基基因PxrbcS1和P... 核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco)是光合作用中决定碳同化速率的关键酶,其中小亚基(rbcS)是由核基因编码,并且主要在叶片中表达。利用RT-qPCR技术确定了小黑杨(Populus×xiaohei)叶片中高表达的Rubisco小亚基基因PxrbcS1和PxrbcS2基因,并克隆了其上游2 240、2 174 bp的启动子。对其进行启动子元件分析结果表明,PxrbcS1和PxrbcS2的启动子具有多个与光诱导表达相关的元件,例如G-box、MRE和Box4等元件。构建pBI-121-p PxrbcS1::GUS和pBI-121-p PxrbcS2::GUS植物表达载体并遗传转化84K杨(P. alba×P. glandulosa)。GUS组织化学染色以及qPCR表达分析表明PxrbcS1和PxrbcS2的启动子能够驱动GUS基因在84K杨叶片特异性高表达。总之,上述结果表明该研究成功地从小黑杨中克隆了具有叶片高表达活性的PxrbcS1和PxrbcS2的启动子,该启动子可应用到包括杨树在内的植物光合作用相关的基因功能研究以及提高植物光合作用的遗传操作中。 展开更多
关键词 杨树 Rubisco小亚基启动子 克隆 调控元件 遗传转化 GUS染色
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基于真核CMV启动子构建猪瘟病毒感染性cDNA克隆与病毒拯救
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作者 关飞虎 王静 +6 位作者 宋亚芬 温立佳 田野 蒋颖 杨承槐 张辉 张乾义 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期561-567,607,共8页
为建立猪瘟病毒(CSFV)反向遗传操作系统,本研究将CSFV石门株(SM)全基因组克隆至pBAC11载体中,并采用重叠延伸PCR方法在病毒基因组5'端和3'端分别加入CMV真核启动子序列和RzBGH序列,并将其基因组nt2809的碱基C突变为T,将原有的Af... 为建立猪瘟病毒(CSFV)反向遗传操作系统,本研究将CSFV石门株(SM)全基因组克隆至pBAC11载体中,并采用重叠延伸PCR方法在病毒基因组5'端和3'端分别加入CMV真核启动子序列和RzBGH序列,并将其基因组nt2809的碱基C突变为T,将原有的AfeⅠ酶切位点突变消失作为拯救病毒的遗传标记。将构建的质粒转染PK-15细胞培养后,收集细胞上清盲传3代后通过RT-PCR扩增蛋白编码基因,并经间接免疫荧光试验(IFA)鉴定。RT-PCR鉴定结果显示扩增到CSFV特异性基因;IFA结果显示接种病毒的细胞出现绿色荧光。表明病毒拯救成功,将其命名为BAC-rSM。将BAC-rSM株在PK-15细胞中连续传18代,将第18代病毒经RT-PCR扩增E2基因,并对遗传标记的位点经Afe I酶切和鉴定,分析BAC-rSM病毒的遗传稳定性,结果显示第18代BAC-rSM株遗传标记稳定存在,表明拯救的病毒具有遗传稳定性。将BAC-rSM和SM株病毒分别以MOI 1感染PK-15细胞,在感染后不同时间点收获病毒并测定病毒滴度,结果显示BAC-rSM和SM株生长动力学特征基本一致。对第18代BAC-rSM株与SM株进行全基因组序列比对分析,利用在线软件npsa-prabi.ibcp.fr/对Erns和E2蛋白二级结构预测,采用荧光定量PCR(qPCR)对BAC-rSM和SM株感染PK-15细胞中IFN-βmRNA的转录水平。全基因测序比对分析结果显示,BAC-rSM株基因组共存在46个碱基突变,经预测其Erns和E2的突变导致各自的二级结构改变;qPCR检测结果显示,相对SM感染的PK-15细胞,BAC-rSM感染后8 h和24 h PK-15细胞中IFN-βmRNA的转录水平显著或极显著降低(P<0.05、P<0.01)。本研究建立了一种简单、操作方便的CSFV反向遗传操作系统的方法,为进一步开展CSFV的分子生物学、毒力决定因素、分子发病机制、疫苗开发和病毒与宿主相互作用的研究提供了新的技术方法。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 CMV启动子 感染性克隆 反向遗传操作系统
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表达增强型绿色荧光蛋白的C型禽偏肺病毒反向遗传系统的构建及优化
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作者 郭禹 程晶 +2 位作者 左玉柱 范京惠 姜海军 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期2091-2100,共10页
【目的】禽偏肺病毒(Avian metapneumovrus,aMPV)是副黏病毒科偏肺病毒属成员,其所造成的鸡肿头症和产蛋率下降对养殖业造成严重危害。为更好地预防aMPV并研究其发病机制,本研究将增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protei... 【目的】禽偏肺病毒(Avian metapneumovrus,aMPV)是副黏病毒科偏肺病毒属成员,其所造成的鸡肿头症和产蛋率下降对养殖业造成严重危害。为更好地预防aMPV并研究其发病机制,本研究将增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)插入C型aMPV(aMPV/C)基因组中,构建表达EGFP的重组aMPV,并使用不同的载体及启动子构建aMPV迷你基因组,来优化aMPV反向遗传操作系统(reverse genetic system,RGS)的构建。【方法】将EGFP插入pBluescript-aMPV RGS的P和M蛋白之间非编码区并进行拯救,观察绿色荧光蛋白的表达情况,同时测定重组病毒滴度及遗传稳定性。为优化RGS的构建,采用含有T7启动子的pBluescript SK(+)和含有T7、CMV启动子的pcDNA3.1两种载体构建aMPV迷你基因组。首先将aMPV/C基因组两端的先导区(leader)和尾随区(trailer)与EGFP的cDNA进行PCR扩增,并切胶回收;其次将各胶回收片段按照leader-EGFP-trailer的顺序进行无缝克隆连接,并测序验证;最后将连接完整的迷你基因组反向插入两个载体中,构建aMPV/C的迷你基因组(pBR-aMPV/C和pc-aMPV/C)。在拯救迷你基因组的试验中,将两个aMPV/C迷你基因组与3个表达N、P和L蛋白的质粒共转染到BHK-21细胞中,观察绿色荧光蛋白的表达情况。【结果】拯救的aMPV-EGFP重组病毒测序结果显示,EGFP已成功插入aMPV基因组中,并在前3代aMPV-EGFP重组病毒中稳定表达。aMPV-EGFP重组病毒滴度在感染96 h后达到105.5 TCID 50/mL。而pBR-aMPV/C和pc-aMPV/C两个重组质粒的测序结果也证明了含有EGFP的aMPV迷你基因组构建完成。将3个重组质粒分别与辅助质粒共转染至BHK-21细胞中,转染24 h后观察到细胞中绿色荧光蛋白表达,证明aMPV-EGFP重组病毒及pBR-aMPV/C和pc-aMPV/C两个aMPV迷你基因均都成功表达了EGFP。【结论】本研究成功构建了两个aMPV迷你基因组并拯救了aMPV-EGFP重组病毒,重组病毒具有良好的遗传稳定性。而CMV和T7作为aMPV/C RGS中的启动子时,二者的拯救效率相同。pBluescript SK(+)和pcDNA3.1均可用于aMPV/C RGS的构建,本研究为aMPV/C RGS的构建提供了多种方法。 展开更多
关键词 C型禽偏肺病毒 迷你基因组 反向遗传系统 CMV启动子 增强绿色荧光蛋白 T7启动子
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牙鲆GHR基因Promoter区微卫星序列多态性与生长性状关系的初步研究 被引量:10
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作者 倪静 尤锋 +5 位作者 于深辉 张培军 徐冬冬 吴志昊 文爱韵 徐永立 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期719-725,共7页
采用牙鲆GHR基因5’端Promoter区的1个微卫星标记,对胶南和日照2个牙鲆养殖群体进行了群体遗传多样性的研究,并探索该基因多态性位点与牙鲆生长性状之间的相关性。结果表明,2个群体在该座位的等位基因数为12和9个,有效等位基因数为6.26... 采用牙鲆GHR基因5’端Promoter区的1个微卫星标记,对胶南和日照2个牙鲆养殖群体进行了群体遗传多样性的研究,并探索该基因多态性位点与牙鲆生长性状之间的相关性。结果表明,2个群体在该座位的等位基因数为12和9个,有效等位基因数为6.26和5.04个,多态信息含量为0.84和0.80。2个群体该座位的Hardy-Weinberg遗传偏离指数均为正值,并没有显示出杂合子缺失,但各基因型分布频率都在一定程度上偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。连锁分析中发现,在胶南群体中,IM基因型对应的个体在全重、全长、体长、头长、体高和眼径形态学数据中均是最大的;在日照群体中,BC基因型对应的个体在全重、全长、体高、尾柄高、尾柄长和眼径数据中均是最大的;而CJ基因型对应的个体在体长和头长这两组数据中是最大的。该结果为研究GHR基因的变异对鱼类生长发育的影响及探索将该基因作为生长遗传标记的可行性奠定了实验基础。 展开更多
关键词 牙鲆 GHR基因5’端promoter 微卫星 遗传多样性 性状连锁分析
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TFAP2A对肾小球硬化相关基因ADCK4转录调控机制的研究
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作者 张小田 任献国 《天津医药》 CAS 2024年第5期449-453,共5页
目的探索细胞中TFAP2A对局灶节段性肾小球硬化(FSGS)相关基因含aarF结构域的激酶4(ADCK4)的转录调控机制及TFAP2A与ADCK4是否存在特定的结合区域。方法生物信息学分析肾小球硬化基因火山图,ADCK4及TFAP2A表达水平的关系。JASPAR数据库预... 目的探索细胞中TFAP2A对局灶节段性肾小球硬化(FSGS)相关基因含aarF结构域的激酶4(ADCK4)的转录调控机制及TFAP2A与ADCK4是否存在特定的结合区域。方法生物信息学分析肾小球硬化基因火山图,ADCK4及TFAP2A表达水平的关系。JASPAR数据库预测ADCK4基因转录起始位点-464 bp/+206 bp区域包含TFAP2A转录因子结合位点;TFAP2A siRNA浓度分别为5、10、15µmol/L,TFAP2A过表达质粒质量浓度分别为50、100、300µg/L,通过双萤光素酶报告基因实验验证TFAP2A对ADCK4基因启动子水平的调控作用。TFAP2A siRNA及TFAP2A过表达质粒转染细胞,实时荧光定量PCR检测TFAP2A、ADCK4 mRNA表达,蛋白免疫印迹实验检测TFAP2A、ADCK4蛋白表达。染色质免疫沉淀试验验证TFAP2A与ADCK4启动子的特定区域结合。结果生物信息学分析显示FSGS肾组织中RNA-Seq RNA表达上调的基因273个,表达下调的基因219个;ADCK4与TFAP2A表达水平呈正相关(P<0.01)。双萤光素酶报告基因实验证明TFAP2A siRNA浓度为10、15µmol/L的ADCK4启动子相对萤光素酶活性增强,TFAP2A过表达质粒质量浓度为100、300µg/L的ADCK4启动子萤光素酶活性降低(P<0.05)。与对照组相比,实验组ADCK4 mRNA和蛋白表达水平升高;过表达实验中,与对照组比较,实验组ADCK4 mRNA和蛋白表达水平降低(P<0.05)。染色质免疫沉淀试验发现TFAP2A能与ADCK4启动子的特定区域结合。结论转录因子TFAP2A负向调控ADCK4基因表达,增加了调控足细胞重要基因的转录因子成员。 展开更多
关键词 肾小球硬化症 局灶节段性 转录因子AP-2 启动区 遗传 转录调控 含aarF结构域的激酶4
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Expression Pattern of the Foreign Gene Regulated by the Tomato rbcS3A Promoter in Transgenic Tomato
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作者 徐晓霞 金烨 杨万年 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2013年第4期559-563,共5页
[Objective] This study aimed to reveal the expression pattern of foreign genes regulated by tomato rbcS3A promoter in transgenic tomato. [Method] Rubisco small subunit promoter rbcS3A was cloned by PCR, fused to the u... [Objective] This study aimed to reveal the expression pattern of foreign genes regulated by tomato rbcS3A promoter in transgenic tomato. [Method] Rubisco small subunit promoter rbcS3A was cloned by PCR, fused to the upstream of Gus coding region in a binary vector, and transformed into tomato plants mediated by Agrobacterium. Histochemical staining on PCR positive plants was performed to ana- lyze the expression pattern of the foreign gene regulated by the tomato rbcS3A pro- moter in transgenic tomato. [Result] A total of 15 positive plants were obtained, ac- counting for 33.3%. Histochemical staining showed that the expression level of Gus fusion gene was highest in mature leaf, lower in reproductive organs such as fruit, and not detected in seed. [Conclusion] More positive seedlings were obtained using the modified tissue culture method. Under the control of tomato rbcS3A promoter, exogenous gene highly expressed in transgenic plant leaves, but did not express in seeds and tomato pulp. 展开更多
关键词 Tomato rbcS3A promoter TOMATO Genetic transformation Gus staining
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Studies on Genetic Transformation of Fresh-cut Chrysanthemum Using DREB1A Promoted by Stress-induced Promoter rd29A 被引量:1
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作者 Haiquan HUANG Qing DUAN +4 位作者 Ting JIANG Xinyu DENG Jingjing FEI Jun XU Meijuan HUANG 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2014年第2期7-9,共3页
In this study, DERB1A transcription factor and stress-induced promoter rd29A were isolated respectively and amplified from Arabidopsis thaliana, se- quenced and analyzed by DNAsis. In addition, the stress-induced prom... In this study, DERB1A transcription factor and stress-induced promoter rd29A were isolated respectively and amplified from Arabidopsis thaliana, se- quenced and analyzed by DNAsis. In addition, the stress-induced promoter rd29A was utilized to construct the plant expression vector of DERB1A, which was transformed into Agrobacterium tumefaciens. Furthermore, the transgenic regeneration system of fresh-cut chrysanthemum from callus to plantlets was established successfully. On this basis, chrysanthemum leaf-disc explants were genetically transformed with Agrobacterium-mediated method. Two positive transgenie plantlets were obtained in vitro. Based on PCR detection, DREB1A transcription factor was integrated into chrysanthemum genome, which laid the foundation for breeding new transgenie cultivars of fresh-cut chrysanthemum with high comprehensive stress resistance, good cmalitv and high field. 展开更多
关键词 DREB1A transcription factor Stress-induced promoter rd29A Fresh-cut chrysanthemum Genetic transformation
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GFAP promoter directs lacZ expression specifically in a rat hepatic stellate cell line 被引量:4
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作者 Gunter Maubach Michelle Chin Chia Lim 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2006年第5期723-730,共8页
AIM: The GFAP was traditionally considered to be a biomarker for neural gila (mainly astrocytes and nonmyelinating Schwann cells). Genetically, a 2.2-kb human GFAP promoter has been successfully used to target astr... AIM: The GFAP was traditionally considered to be a biomarker for neural gila (mainly astrocytes and nonmyelinating Schwann cells). Genetically, a 2.2-kb human GFAP promoter has been successfully used to target astrocytes in vitro and in vivo. More recently, GFAP was also established as one of the several makers for identifying hepatic stellate cells (HSC). In this project, possible application of the same 2.2-kb human GFAP promoter for targeting HSC was investigated. METHODS: The GFAP-lacZ transgene was transfected into various cell lines (HSC, hepatocyte, and other nonHSC cell types). The transgene expression specificity was determined by X-gal staining of the β-galactosidase activity. And the responsiveness of the transgene was tested with a typical pro-fibrotic cytokine TGF-β1. The expression of endogenous GFAP gene was assessed by real-time RT-PCR, providing a reference for the transgene expression. RESULTS: The results demonstrated for the first time that the 2.2 kb hGFAP promoter was not only capable of directing HSC-specific expression, but also responding to a known pro-fibrogenic cytokine TGF-β1 by upregulation in a doseand time-dependent manner, similar to the endogenous GFAP. CONCLUSION: In conclusion, these findings suggested novel utilities for using the GFAP promoter to specifically manipulate HSC for therapeutic purpose. 展开更多
关键词 promoter Regions (genetics) Animals Base Sequence Cell Line DNA Recombinant Gene Expression Glial Fibrillary Acidic Protein HEPATOCYTES Humans Lac Operon RNA Messenger Rats TRANSFECTION Transforming Growth Factor beta Transforming Growth Factor beta1
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A novel constitutive promoter and its downstream 5′ UTR derived from cotton(Gossypium spp.) drive high-level gene expression in stem and leaf tissues
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作者 SUN Bao SUN Guo-qing +2 位作者 MENG Zhi-gang ZHANG Rui GUO San-dui 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2016年第4期755-762,共8页
The development of genetically modified crops requires new promoters and regulatory regions to achieve high gene ex- pression and/or tissue-specific expression patterns in plants. To obtain promoter sequences of plant... The development of genetically modified crops requires new promoters and regulatory regions to achieve high gene ex- pression and/or tissue-specific expression patterns in plants. To obtain promoter sequences of plants with new properties, we analyzed the expression traits of the cotton (Gossypium hirsutum) translation elongation factor 1A gene family. The results showed that the GhEF1A8 gene is highly expressed in different organs of cotton plants, and showed much higher transcript levels in stems and leaves. Its promoter (GhEFIA1.7) and the 5" untranslated region (5" UTR), comprising a regulatory region named PGhEFIA8, were isolated from cotton and studied in stably transformed tobacco plants. The regulatory region sequences were fused to the 13-glucuronidase (GUS) reporter gene to characterize its expression pattern in tobacco. Histochemical and fiuorometric GUS activity assays demonstrated that PGhEF1A8 could direct GUS gene expression in all tissues and organs in transgenic tobacco, including leaves, stems, flowers, and roots. The level of GUS activity in the leaves and stems was significantly higher than in cauliflower mosaic virus (CaMV) 35S promoter::GUS plants, but as same as CaMV 35S promoter::GUS plants in flower and root tissues. GUS expression levels decreased 2-10-fold when the 5" UTR was absent from PGhEF1A8. Deletion analysis of the PGhEFIA8 sequence showed that the region -647 to -323 might possess negative elements that repress transgene expression in tobacco plants. The results suggested that the GhEFIA8 regulation region may represent a practical choice to direct high-level constitutive expression of transgenes and could be a valuable new tool in plant genetic engineering. 展开更多
关键词 Gossypium hirsutum plant genetic engineering qPCR promoter 5" untranslated region histochemistry fluorometry GUS
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CASP8 promoter polymorphism,mRNA expression and risk of prostate cancer among Chinese men
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作者 Guangbo Fu Jialin Tang +6 位作者 Meilin Wang Chao Qin Fu Yan Qi Ding Changjun Yn Xinru Wang Zhengdong Zhang 《The Journal of Biomedical Research》 CAS 2011年第2期128-134,共7页
Caspase-8 (CASPS) plays a key role in apoptosis. We examined by genotyping whether the -652 six-nucleotide insertion-deletion (6N ins/del) polymorphism in the CASP8 promoter region was associated with prostate can... Caspase-8 (CASPS) plays a key role in apoptosis. We examined by genotyping whether the -652 six-nucleotide insertion-deletion (6N ins/del) polymorphism in the CASP8 promoter region was associated with prostate cancer risk in a hospital-based case-control study of 406 Chinese prostate cancer patients and 408 age-matched cancerfree controls. Additionally, 23 prostate cancer tissues were analyzed for CASP8 mRNA expression. We found a significantly decreased prostate cancer risk for the 6N ins/del genotype [adjusted odds ratio (OR)=0.68; 95% confidence interval (C/)=0.51-0.92] and del/del genotype (OR=0.34; 95% CI=0.19-0.63) compared with the ins/ins genotype. The 6N del allele was associated dose-dependently with decreased prostate cancer risk (Ptrend = 0.001). RT-PCR showed that individuals with the 6N del allele had lower CASP8 mRNA levels than those with the ins/ ins genotype (P = 0.024). These findings suggested that the CASPS-652 6N ins/del polymorphism may affect the susceptibility to prostate cancer and reduce prostate cancer risk among Chinese men. 展开更多
关键词 CASPASE-8 promoter polymorphism genetic variation prostate cancer
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Correlation between Serotonin Transporter Promoter Gene Polymorphism and PTSD in Children
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作者 Juncheng Guo Min Guo +3 位作者 Ping Huang Yijun Yang Xiangling Jiang Weidong Cen 《International Journal of Clinical Medicine》 2019年第5期336-344,共9页
Objective: To study the association between post-traumatic stress disorder (PTSD) and serotonin transporter promoter (5-HTTLPR) gene polymorphism in Han children in Hainan;to explore the genetic mechanism of PTSD in c... Objective: To study the association between post-traumatic stress disorder (PTSD) and serotonin transporter promoter (5-HTTLPR) gene polymorphism in Han children in Hainan;to explore the genetic mechanism of PTSD in children. Methods: 50 patients with post-traumatic stress disorder and healthy children in Han nationality in Hainan were selected. Detection of 5-HTTLPR gene polymorphism by polymerase chain reaction (PCR) and amplified fragment length polymorphism, the genotype and allele frequencies were analyzed using a case-control association analysis method. Results: There were 4, 14 and 32 cases of LL, SL and SS in the post-traumatic stress disorder group of Hainan Han children, and 13, 20 and 17 cases in the control group. From the perspective of gene frequency, the L gene of post-traumatic stress disorder appeared 22.0%, and S appeared 78.0%. In the control group, L appeared 46.0%, and S appeared 54.0%. There were significant differences in genotype and gene frequency (P Conclusion: The 5-HTTLPR gene polymorphism in Hainan Han children may be associated with post-traumatic stress disorder. 展开更多
关键词 POST-TRAUMATIC Stress Disorder Genetic Polymorphism A SEROTONIN TRANSPORTER promoter genetics
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Evaluation of Uncertainty in Measuring the Content of CaM V35S Promoter in Genetically Modified Soybean,GTS40-3-2,by Real-time Quantitative PCR
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作者 Dong WANG Jun SONG +5 位作者 Ling'an GUO Shaorong LEI Wenjuan LIU Lijuan CHANG Quan YIN Fuli ZHANG 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2015年第1期23-26,30,共5页
[ Objective ] This study aimed to investigate the major contributors to the measurement uncertainty in quantitative analysis of genetically modified ingreclients and improve the quality of quantitative detection of ge... [ Objective ] This study aimed to investigate the major contributors to the measurement uncertainty in quantitative analysis of genetically modified ingreclients and improve the quality of quantitative detection of genetically modified components. [ Method] The content of CaMV35S promoter (parameter) in GTS40- 3-2 soybean powder samples was measured to estimate the measurement uncertainty preliminarily. [ Result] Type A uncertainty (uA) ' type B uncertainty (uB) and combined standard uncertainty (Uc) were 0.0 004, 0.002 and 0.002, respectively. At a confidence level ofp = 95% and freedom degree of Voff = 3 251, coverage factor k = 1.96, expanded uncertainty U = 0.004. The final measurement result was C = 0.028 ± 0. 004, which was dose to the conventional true value (0.03). Thus, the measurement uncertainty was relatively small, indicating a high quality of measurement. In this study, uncertainty evaluation indicated that the deviation of micro liquid transfer made the greatest contribution to the measurement uncertainty. [ Cludusion ] The deviation of micro liquid transfer should be reduced to im- prove the quality of measurement. 展开更多
关键词 Genetically modified soybean GTS40-3 -2) Content of CaM-V35S promoter UNCERTAINTY EVALUATION
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大麦醇溶蛋白启动子HorD的克隆及其种子特异性表达分析
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作者 刘宝龙 姜燕燕 +2 位作者 曹东 常砚梓 李云 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1234-1240,共7页
种子特异性启动子的克隆和功能分析不仅有助于阐明作物种子发育和胚乳特异性基因的表达调控机制,也是进行作物品质改良和种子生物反应器在内的植物基因工程改造的基础。本研究从大麦品种Golden pormise中克隆到大麦胚乳特异性启动子HorD... 种子特异性启动子的克隆和功能分析不仅有助于阐明作物种子发育和胚乳特异性基因的表达调控机制,也是进行作物品质改良和种子生物反应器在内的植物基因工程改造的基础。本研究从大麦品种Golden pormise中克隆到大麦胚乳特异性启动子HorD,生物信息学分析表明,其具备启动子的基本元件,如A-box、TATA-box、CAAT-box等,此外还含有胚乳特异性表达所需要的元件Prolamin-box。为验证HorD启动子的表达特性,以pU1300载体为骨架,将HorD启动子和新型冠状病毒(SARA-CoV-2)刺突蛋白基因LPS通过双酶切连接的方式构建表达载体phorD-LPS,并利用农杆菌介导的遗传转化试验验证其种子表达特性。结果表明,HorD启动子能驱动LPS基因在转基因大麦各组织中表达,但在根、茎、叶及颖壳中表达量较低,在种子中表达量较高。这说明HorD启动子可以驱动外源目的基因在大麦种子中特异高效表达。 展开更多
关键词 大麦 HorD启动子 顺式作用元件 遗传转化
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BDNF基因多态性与脑卒中认知障碍遗传易感性的相关性
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作者 胡国艳 谭锻玲 +2 位作者 李雨晴 江惠珍 杨欣 《分子诊断与治疗杂志》 2023年第12期2219-2223,共5页
目的探讨BDNF基因启动子序列单核苷酸多态性(SNP)与脑卒中后认知障碍(PSCI)的相关性。方法采用病例-对照研究方法,选取2020年5月至2021年5月广州医科大学附属第五医院的124例PSCI患者和80例急性缺血性脑卒中患者的BDNF基因启动子采用聚... 目的探讨BDNF基因启动子序列单核苷酸多态性(SNP)与脑卒中后认知障碍(PSCI)的相关性。方法采用病例-对照研究方法,选取2020年5月至2021年5月广州医科大学附属第五医院的124例PSCI患者和80例急性缺血性脑卒中患者的BDNF基因启动子采用聚合酶链反应扩增片段并测序,结合DNA测序后的序列及SNP位点比对后进行统计和分析。Hardy-Weinberg遗传平衡检验后,采用χ^(2)检验和t检验进行相关分析。Logistic回归对多种危险因素以及2个SNP位点与PSCI遗传易感性进行关联性分析。结果PSCI组中吸烟史、HDLC、CRP均明显高于对照组,差异有统计学意义(P均<0.05);PSCI组中ALP明显低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);两组LDL-C、TG水平比较,差异无统计学意义(P>0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示吸烟史、HDL-C、CRP是PSCI的独立危险因素,而糖尿病、ALP是PSCI的保护因素。Hardy-Weinberg(HWE)平衡检验结果表明rs6265、rs7103411位点均符合HWE平衡(P>0.05),所选取样本具有良好的代表性。rs6265中3种基因型在两组中的差异无统计学意义(P>0.05),A和G等位基因频率在两组中比较,差异无统计学意义(P>0.05);rs7103411的3种基因型在两组中的比较,差异无统计学意义(P>0.05),C和T等位基因频率在两组中比较,差异无统计学意义(P>0.05)。Logistic回归分析显示,仅有rs6265的AG基因型与PSCI间存在关联,是PSCI的独立危险因素,可明显增加PSCI的患病风险。结论BDNF基因启动子SNP可能与PSCI遗传易感性相关,rs6265的AG基因型可能是PSCI的遗传危险因素。 展开更多
关键词 脑卒中后认知障碍 BDNF基因启动子 基因多态性 遗传易感性
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植物中组织特异性启动子的研究进展 被引量:4
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作者 陈建琦 赵明珠 +1 位作者 王义 张美萍 《北方园艺》 CAS 北大核心 2023年第19期128-134,共7页
启动子是位于基因编码区上游的基因开关,它开启和关闭基因的功能活性,并含有特定的顺式作用元件,这些元件是参与转录启动和调控的蛋白质的结合靶标。组成型启动子的使用会对非靶标生物或生态系统造成不利影响,而组织特异性启动子能够提... 启动子是位于基因编码区上游的基因开关,它开启和关闭基因的功能活性,并含有特定的顺式作用元件,这些元件是参与转录启动和调控的蛋白质的结合靶标。组成型启动子的使用会对非靶标生物或生态系统造成不利影响,而组织特异性启动子能够提供获得更多机会参与控制基因表达,并将不利影响降到最低。基于启动子在表达部位的特异性,综述了植物中新鉴定的根、花、种子、果实、维管束和绿色组织特异性启动子的研究进展,指出了组织特异性启动子研究目前存在的问题,并对其未来研究方向提出了展望,以期为植物的遗传改良提供参考依据。 展开更多
关键词 组织特异性 启动子 植物基因工程 瞬时表达 转基因植物
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垫状卷柏SpLEA1基因克隆及干旱胁迫下的表达分析 被引量:1
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作者 周璇 高鹏华 鄢波 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期347-356,共10页
晚期胚胎发育丰富蛋白(late embryogenesis abundant,LEA),广泛存在于生物体内,与植物抗逆性密切相关,可在干旱胁迫下保护植物细胞,减少植物损伤。垫状卷柏(Selaginella pulvinata)是一种在干旱胁迫下生存能力极强的蕨类植物,具有很强... 晚期胚胎发育丰富蛋白(late embryogenesis abundant,LEA),广泛存在于生物体内,与植物抗逆性密切相关,可在干旱胁迫下保护植物细胞,减少植物损伤。垫状卷柏(Selaginella pulvinata)是一种在干旱胁迫下生存能力极强的蕨类植物,具有很强的恢复能力。为探究垫状卷柏SpLEA 1基因在耐旱植物中的分子机制与表达特征,该研究以高耐旱性植物垫状卷柏为实验材料,基于转录组测序结果,采用RT-PCR技术获得SpLEA 1基因cDNA序列,采用HiTail-PCR技术获得启动子序列,利用生物信息学对序列进行了分析,并采用qRT-PCR技术分析了SpLEA 1基因在干旱胁迫下的表达模式。结果表明:(1)垫状卷柏SpLEA 1全长为476 bp,开放阅读框(ORF)为279 bp,共编码92个氨基酸,通过在线工具预测到蛋白分子量为9491.46 Da,等电点为5.45,蛋白结构预测分析表明该蛋白为亲水性蛋白,含有10个磷酸化位点,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。(2)预测到SpLEA1蛋白的保守结构域为Lea-5,来源于LEA1家族。基于系统发生树和遗传距离矩阵,发现垫状卷柏SpLEA1与来自鹰嘴豆(Cicer arietinum)和红车轴草(Trifolium pratense)的Lea-5蛋白同源性较高。(3)对启动子序列进行顺式作用元件的预测分析发现SpLEA 1基因启动子含有5类激素响应元件和与干旱胁迫响应有关的功能元件。(4)在自然干旱处理下SpLEA 1基因表达上调,并在12 h时达到峰值,在24 h干旱后进行复水处理,表达量显著下调。综上所述,SpLEA 1基因在垫状卷柏中很可能参与了干旱胁迫响应机制的相关调控。该结果为进一步研究垫状卷柏SpLEA 1基因在干旱胁迫下的功能及其表达调控机制提供了参考。 展开更多
关键词 垫状卷柏 SpLEA1 基因克隆 启动子克隆 表达分析
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卵巢癌组织中PCDH8、TSLC1基因启动子甲基化状态及其与患者预后的关系
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作者 王蕊 刘阳 邓云静 《医学临床研究》 CAS 2023年第2期209-212,共4页
【目的】探讨卵巢癌组织中原钙黏蛋白8(PCDH8)、肺癌抑癌基因1(TSLC1)基因启动子甲基化状态及其与患者预后的关系。【方法】回顾性分析2017年5月至2018年5月在本院行手术治疗的104例卵巢癌患者的临床资料,对所有患者术后均随访36个月,... 【目的】探讨卵巢癌组织中原钙黏蛋白8(PCDH8)、肺癌抑癌基因1(TSLC1)基因启动子甲基化状态及其与患者预后的关系。【方法】回顾性分析2017年5月至2018年5月在本院行手术治疗的104例卵巢癌患者的临床资料,对所有患者术后均随访36个月,将随访期间出现病灶转移及复发、死亡的患者纳入预后不良组(n=60),余下的纳入预后良好组(n=44)。甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)检测所有患者卵巢癌组织中PCDH8、TSLC1基因启动子甲基化状态,单因素分析和多因素分析卵巢癌患者预后不良的影响因素。【结果】预后不良组患者卵巢癌组织中PCDH8基因启动子、TSLC1基因甲基化率分别为80.00%(48/60)、58.33%(35/60),显著高于预后良好组患者的36.36%(16/44)、18.18%(8/44),差异有统计学意义(χ^(2)=20.422、16.875,P<0.05)。预后不良组FIGO分期、淋巴结有无转移、分化程度、PCDH8基因启动子甲基化状态、TSLC1基因启动子甲基化状态与预后良好组比较,差异有统计学意义(P<0.05)。FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期、淋巴结有转移、分化程度G3、PCDH8基因启动子甲基化状态阳性、TSLC1基因启动子甲基化状态阳性均是卵巢癌患者预后不良的危险因素(P<0.05)。【结论】预后不良的卵巢癌患者癌组织中PCDH8、TSLC1基因启动子甲基化阳性率明显高于预后良好患者,PCDH8、TSLC1基因启动子甲基化状态与其预后显著相关,二者均可评估卵巢癌患者预后。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤/病理学 卵巢肿瘤/遗传学 细胞粘附分子1 启动区 遗传学 DNA甲基化
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