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Exploring the effect of aggregation-induced emission on the excited state intramolecular proton transfer for a bis-imine derivative by quantum mechanics and our own n-layered integrated molecular orbital and molecular mechanics calculations
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作者 Huifang Zhao Chaofan Sun +2 位作者 Xiaochun Liu Hang Yin Ying Shi 《Chinese Physics B》 SCIE EI CAS CSCD 2019年第1期645-649,共5页
We theoretically investigate the excited state intramolecular proton transfer(ESIPT) behavior of the novel fluorophore bis-imine derivative molecule HNP which was designed based on the intersection of 1-(hydrazonometh... We theoretically investigate the excited state intramolecular proton transfer(ESIPT) behavior of the novel fluorophore bis-imine derivative molecule HNP which was designed based on the intersection of 1-(hydrazonomethyl)-naphthalene-2-ol and 1-pyrenecarboxaldehyde. Especially, the density functional theory(DFT) and time-dependent density functional theory(TDDFT) methods for HNP monomer are introduced. Moreover, the "our own n-layered integrated molecular orbital and molecular mechanics"(ONIOM) method(TDDFT:universal force field(UFF)) is used to reveal the aggregation-induced emission(AIE) effect on the ESIPT process for HNP in crystal. Our results confirm that the ESIPT process happens upon the photoexcitation for the HNP monomer and HNP in crystal, which is distinctly monitored by the optimized geometric structures and the potential energy curves. In addition, the results of potential energy curves reveal that the ESIPT process in HNP will be promoted by the AIE effect. Furthermore, the highest occupied molecular orbital(HOMO) and lowest unoccupied molecular orbital(LUMO) for the HNP monomer and HNP in crystal have been calculated. The calculation demonstrates that the electron density decrease of proton donor caused by excitation promotes the ESIPT process. In addition, we find that the variation of atomic dipole moment corrected Hirshfeld population(ADCH) charge for proton acceptor induced by the AIE effect facilitates the ESIPT process. The results will be expected to deepen the understanding of ESIPT dynamics for luminophore under the AIE effect and provide insight into future design of high-efficient AIE compounds. 展开更多
关键词 time-dependent density functional theory(TDDFT) METHOD excited state intramolecular proton transfer(ESIPT) our own n-layered integrated MOLECULAR orbital and MOLECULAR mechanics(ONIOM) METHOD potential energy curves atomic dipole moment corrected Hirshfeld population(ADCH) charge
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金属氢化物中质子耦合电子转移反应的理论研究
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作者 刘晓云 但晓寒 史强 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE EI CAS CSCD 2024年第2期199-210,I0102,共13页
金属-氢配合物在多种催化反应中起着重要作用最近的研究表明,与吡啶基团共价连接的钨氢配合物可以发生协同的质子耦合电子转移反应.本文使用密度泛函理论和非绝热速率理论研究了该类弱氢键体系中的协同质子耦合电子转移反应.首先通过密... 金属-氢配合物在多种催化反应中起着重要作用最近的研究表明,与吡啶基团共价连接的钨氢配合物可以发生协同的质子耦合电子转移反应.本文使用密度泛函理论和非绝热速率理论研究了该类弱氢键体系中的协同质子耦合电子转移反应.首先通过密度泛函理论构建了金属-氢配合物质子自由度的二维势能面.然后求解薛定方程得到了波函数和振动能级,并用于分析各对振动态之间的跃迁速率和总的速率常数.结果表明,由于质子给体-受体之间距离的热涨落,即使在质子给体和受体之间仅存在弱氢键的情况下,协同质子耦合电子转移反应和总反应速率常数也可以得到显著增强. 展开更多
关键词 质子耦合电子转移 速率常数 密度泛函理论计算 非绝热 跃迁
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初探T1 mapping和APTw成像对慢性肾病的诊断价值 被引量:3
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作者 王悦 鞠烨 +3 位作者 卜欣淼 陈丽华 王楠 刘爱连 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期56-60,67,共6页
目的初探纵向弛豫时间定量成像(T1 mapping)和酰胺质子转移加权(amide proton transfer weighted,APTw)成像鉴别慢性肾病(chronic kidney disease,CKD)患者与健康人群的价值。材料与方法回顾性分析2019年8月至2020年10月行3.0 T MRI检查... 目的初探纵向弛豫时间定量成像(T1 mapping)和酰胺质子转移加权(amide proton transfer weighted,APTw)成像鉴别慢性肾病(chronic kidney disease,CKD)患者与健康人群的价值。材料与方法回顾性分析2019年8月至2020年10月行3.0 T MRI检查的CKD患者病例资料共21例(女6例,男15例),所有患者均经大连医科大学附属第一医院肾内科医师依据CKD临床实践指南确诊;同时收集24例健康志愿者临床资料作为对照组。将所有原始图像导入ISP工作站,生成伪彩图。由两名影像科诊断医师采用双盲法分别从肾的上极、中部、下极各选择一个层面并于皮质和髓质中分别放置感兴趣区(region of interest,ROI),面积约10~20 mm^(2),避开肾窦、大血管及肾周组织。测量所得皮髓质T1值与APT值应用SPSS 26.0软件进行统计学分析:应用组内相关系数(intra-class correlation coefficients,ICC)进行观察者间测量结果一致性检验;根据数据正态分布情况,采用独立样本t检验或Mann-Whitney U检验分析两组间参数值差异,P<0.05为差异具有统计学意义;采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线分析各参数诊断效能,根据最大约登指数得到相对应的阈值、敏感度和特异度,并计算曲线下面积(area under the curve,AUC)值。结果两位观察者间测量结果一致性良好(ICC>0.75)。CKD组双肾皮质T1值和皮质APT值显著高于健康对照组(P<0.05);左肾皮质T1值鉴别CKD的AUC值为0.887,敏感度66.7%,特异度100.0%;左肾皮质APT值鉴别CKD的AUC值为0.966,敏感度95.2%,特异度95.8%;右肾皮质T1值鉴别CKD的AUC值为0.960,敏感度76.2%,特异度100.0%;右肾皮质APT值鉴别CKD的AUC值为0.921,敏感度85.7%,特异度91.7%。结论T1 mapping与APTw成像可无创有效鉴别CKD,基于二者的定量参数在一定程度上反映了单侧肾脏各自结构与功能的改变,有望为临床疾病诊断提供一定的参考价值。 展开更多
关键词 慢性肾病 T1 mapping 酰胺质子转移成像 磁共振成像 鉴别诊断
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基于激发态分子内质子转移过程的HBT-OMe分子检测HClO的荧光增强机理
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作者 刘晓军 杨雪 《物理学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2023年第11期185-190,共6页
采用密度泛函理论(DFT)和含时密度泛函理论(TDDFT)方法,基于连续介质模型,对HBT-OMe分子及其与HClO反应的产物基态和激发态结构及电荷分布等性质进行研究,优化构型结果表明,HBT-OMe分子不能发生质子转移过程而其产物分子则能发生.红外... 采用密度泛函理论(DFT)和含时密度泛函理论(TDDFT)方法,基于连续介质模型,对HBT-OMe分子及其与HClO反应的产物基态和激发态结构及电荷分布等性质进行研究,优化构型结果表明,HBT-OMe分子不能发生质子转移过程而其产物分子则能发生.红外振动光谱与分子共价作用分析进一步证实产物分子能发生质子转移过程.计算的前线分子轨道结果表明:HBT-OMe分子存在扭曲电荷转移(TICT)过程,最高已占据分子轨道(HOMO)和最低未占据分子轨道(LUMO)电荷密度重叠小导致HBT-OMe分子荧光强度弱,结合产物分子势能曲线发现,产物分子质子转移过程能抑制分子的TICT过程,从而使其荧光强度增强. 展开更多
关键词 激发态质子转移 含时密度泛函 次氯酸
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磁共振酰胺质子转移成像与表观扩散系数在膀胱癌术前病理分级评估中的应用
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作者 徐兴华 常玲玉 +4 位作者 吴广太 程连华 李淑祎 王芳 王青 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期97-102,共6页
目的研究酰胺质子转移(amide proton transfer,APT)成像与表观扩散系数(apparent diffusion coefficient,ADC)在膀胱癌术前组织学分级评估中的可行性。材料与方法回顾性分析了54例经手术病理证实为膀胱癌患者的影像资料,所有患者在术前... 目的研究酰胺质子转移(amide proton transfer,APT)成像与表观扩散系数(apparent diffusion coefficient,ADC)在膀胱癌术前组织学分级评估中的可行性。材料与方法回顾性分析了54例经手术病理证实为膀胱癌患者的影像资料,所有患者在术前接受了MRI检查。MRI扫描除常规序列外,另外包括APT及扩散加权成像(diffusion-weighted imaging,DWI)序列。由两位经验丰富的放射科医生独立测量病灶的APT及ADC值,采用独立样本t检验或Mann-Whitney U秩和检验比较不同级别肿瘤的各参数值之间的差异。然后采用受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线和DeLong检验分析APT、ADC及两者联合(APT+ADC)使用的诊断性能。结果低级别膀胱癌的APT值(1.42%±0.75%)低于高级别膀胱癌(2.99%±1.07%),差异具有统计学意义(P<0.01);低级别膀胱癌的ADC值[(1.44±0.27)×10^(-3)mm^(2)/s]高于高级别膀胱癌[(1.17±0.37)×10^(-3)mm^(2)/s],差异具有统计学意义(P=0.01)。APT值、ADC值及两者联合鉴别低级别膀胱癌和高级别膀胱癌的ROC曲线下面积(area under the curve,AUC)分别为0.80、0.76、0.94,ATP、ADC的AUC值与两者联合的AUC值之间差异具有统计学意义(P<0.05)。结论APT和ADC可作为膀胱癌术前预测组织学分级的指标,APT与ADC联合应用可显著提高诊断效能。 展开更多
关键词 膀胱癌 磁共振成像 酰胺质子转移成像 表观扩散系数 功能磁共振成像 病理分级
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酰胺质子转移加权成像在女性生殖系统的研究进展 被引量:2
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作者 刘新宇 何泳蓝 +2 位作者 薛华丹 李源 金征宇 《磁共振成像》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期198-202,共5页
酰胺质子转移加权(amide proton transfer-weighted, APTw)成像是化学交换饱和转移(chemical exchange saturation transfer, CEST)成像中的一种,其基于蛋白质和多肽链上的酰胺质子与游离水之间的质子交换来间接反映组织中的pH值和蛋白... 酰胺质子转移加权(amide proton transfer-weighted, APTw)成像是化学交换饱和转移(chemical exchange saturation transfer, CEST)成像中的一种,其基于蛋白质和多肽链上的酰胺质子与游离水之间的质子交换来间接反映组织中的pH值和蛋白质浓度。APTw成像作为一种无创的磁共振分子成像新技术,可以早期监测蛋白质浓度变化反映细胞异常增殖,以更早发现肿瘤,能够在子宫体、宫颈、卵巢病变中提供重要的影像学信息,为临床的诊断、危险分层及预后方面提供帮助,为临床治疗提供重要参考。本文主要阐述APTw成像在女性生殖系统的研究进展、发展前景及尚需解决的问题。 展开更多
关键词 女性生殖系统 子宫肿瘤 宫颈肿瘤 卵巢肿瘤 酰胺质子转移加权成像 磁共振成像 功能磁共振成像
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尿酸质子转移反应的理论研究I——分子内质子转移研究 被引量:7
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作者 陈文凯 陆春海 +1 位作者 许娇 杨迎春 《分子科学学报》 CAS CSCD 2002年第1期25-30,共6页
使用量子化学中的Hartree-Fock方法和密度泛函理论中的B3LYP方法 ,分别在 3- 2 1G 和 6 - 31G(d)水平上 ,计算了尿酸分子从三羰基异构体向三羟基异构体的转化 .结果表明 ,转化过程经历了单羟基和双羟基异构体 2种中间物和 3种过渡态时... 使用量子化学中的Hartree-Fock方法和密度泛函理论中的B3LYP方法 ,分别在 3- 2 1G 和 6 - 31G(d)水平上 ,计算了尿酸分子从三羰基异构体向三羟基异构体的转化 .结果表明 ,转化过程经历了单羟基和双羟基异构体 2种中间物和 3种过渡态时的分子内质子转移 (IPT) ,转移中的H原子和邻近的N ,O和C原子形成了具有四元环结构的过渡态 .随着IPT的进行 ,N—H键逐渐被削弱和断裂 ,O—H键则逐渐生成 .3个反应的活化能分别为 190 3kJ/mol,181 4kJ/mol和 2 4 9 9kJ/mol(B3LYP/ 6 - 31G(d) ) .较高的活化能表明在室温下 。 展开更多
关键词 尿酸 量子化学 分子内质子转移反应 密度泛函理论 互变异构 三羰基异构体 三羟基异构体
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水对5-氟尿嘧啶质子转移影响规律的研究 被引量:13
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作者 胡兴邦 李浩然 +1 位作者 梁婉春 韩世钧 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第9期952-956,共5页
采用密度泛函理论(DFT)B3LYP方法,在6-311++G(d,p)基组上研究了由质子转移引起的5-氟尿嘧啶(5-FU)的异构化反应.共研究了38个含水与不含水的构型,其中包括15个过渡态结构.研究发现,在5-氟尿嘧啶周围存在两类不同的区域,在其中一类区域中... 采用密度泛函理论(DFT)B3LYP方法,在6-311++G(d,p)基组上研究了由质子转移引起的5-氟尿嘧啶(5-FU)的异构化反应.共研究了38个含水与不含水的构型,其中包括15个过渡态结构.研究发现,在5-氟尿嘧啶周围存在两类不同的区域,在其中一类区域中,水分子能促进质子转移的发生;而在另一类区域中,水分子却能阻碍质子转移的发生.通过与尿嘧啶质子转移过程相比较,发现在各种情况下5-氟尿嘧啶异构化为烯醇式的几率均比尿嘧啶的大,在一定程度上解释了为什么5-氟尿嘧啶具有优良抗癌作用的同时具有一定的毒副作用. 展开更多
关键词 密度泛函理论 5-氟尿嘧啶 质子转移 异构化
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2-羟基吡啶质子转移异构化的理论研究 被引量:2
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作者 苑壮东 董燕 《曲阜师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2007年第3期85-88,共4页
采用量子化学中的密度泛函理论,在B3LYP/6-311++G**计算水平上,系统考察了在水、氨和甲醇分子辅助下,2-羟基吡啶醇式和酮式结构的质子转移异构化行为.结果表明:其醇式和酮式结构均能稳定存在,但后者在能量上稍占优势.3种分子参与的质子... 采用量子化学中的密度泛函理论,在B3LYP/6-311++G**计算水平上,系统考察了在水、氨和甲醇分子辅助下,2-羟基吡啶醇式和酮式结构的质子转移异构化行为.结果表明:其醇式和酮式结构均能稳定存在,但后者在能量上稍占优势.3种分子参与的质子转移反应均是按照协同机理进行的.它们的参与能够大大降低反应能垒,使得在动力学上难以发生的质子转移反应得以进行.其中甲醇的辅助效果最佳,其次为水和氨分子.另外,辅助分子和各种介质的溶剂效应均有利于酮式结构的稳定性,这与有关的研究吻合较好. 展开更多
关键词 2-羟基吡啶 辅助质子转移 密度泛函理论 醇式-酮式互变
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2-(2-羟基苯亚甲基胺)-4,6-二羟基-嘧啶的质子转移异构化反应 被引量:4
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作者 周子彦 刘敏 +3 位作者 苏忠民 谢玉忠 丁慎德 王华静 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2011年第9期2035-2042,共8页
为了探索2-(2-羟基苯亚甲基胺)-4,6-二羟基-嘧啶(M1)分子醇式和酮式结构互变异构化的反应机理, 利用密度泛函理论(DFT)方法, 在B3LYP/6-311+G(d, p)基组水平上, 对M1化合物异构化反应的势能面进行了研究, 在探讨各种可能的反应途径中, ... 为了探索2-(2-羟基苯亚甲基胺)-4,6-二羟基-嘧啶(M1)分子醇式和酮式结构互变异构化的反应机理, 利用密度泛函理论(DFT)方法, 在B3LYP/6-311+G(d, p)基组水平上, 对M1化合物异构化反应的势能面进行了研究, 在探讨各种可能的反应途径中, 发现单体至少有8种异构体和10种过渡态. 结果表明: 2-(2-羟基苯亚甲基胺)-6-羟基-4(3H)嘧啶酮(M6)不论是单体、与水形成的配合物, 还是二聚体, 比其相对应的异构体能量低, 表明在通常情况下是以M6形式稳定存在的; 在考察的可能反应途径中, 直接进行的分子内质子转移过程需要的活化自由能为143.8 kJ·mol-1, 水助催化时, 反应的活化自由能为38.9 kJ·mol-1, 二聚体双质子转移的活化自由能为0.6 kJ·mol-1, 二聚体双质子转移所需活化自由能最低, 在室温下就可以进行, 由此可见氢键在降低反应活化能方面起着重要的作用. 展开更多
关键词 2-(2-羟基苯亚甲基胺)-4 6-二羟基-嘧啶 密度泛函理论 互变异构 质子转移
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B型DNA中鸟嘌呤-胞嘧啶碱基对内双质子转移反应 被引量:2
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作者 林月霞 王红艳 +2 位作者 高思敏 吴颖曦 李汝虎 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2013年第6期1233-1239,共7页
采用ONIOM(M06-2X/6-31G*:PM3)方法研究了单个鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)碱基对和含GC碱基对的四种排序的DNA三聚体(dATGCAT,dGCGCGC,dTAGCTA,dCGGCCG)的双质子转移反应.通过分析其双质子转移方式、质子转移过程中各结构的能量和氢键变化,总结... 采用ONIOM(M06-2X/6-31G*:PM3)方法研究了单个鸟嘌呤-胞嘧啶(GC)碱基对和含GC碱基对的四种排序的DNA三聚体(dATGCAT,dGCGCGC,dTAGCTA,dCGGCCG)的双质子转移反应.通过分析其双质子转移方式、质子转移过程中各结构的能量和氢键变化,总结出环境因素对GC碱基对双质子转移机理的影响.气相中,dCGGCCG三聚体中发生分步双质子转移,其它四种模型中均发生协同双质子转移.分析发现质子转移方式受上下相邻碱基对的静电相互作用和质子接受位的质子亲和势影响,dATGCAT和dGCGCGC排序有助于质子H4a转移,而dTAGCTA和dCGGCCG排序有助于质子H1转移,胞嘧啶的N3位较高的质子亲和势有助于质子H1转移.水溶剂中,上下相邻碱基对的静电相互作用被减弱,水溶剂稳定了分步转移过程中的单质子转移产物,因此分步转移机理占据优势,五种模型中均出现分步双质子转移,在此过程中能量变化趋势相似.溶剂效应有利于单质子转移,却增加了双质子转移反应的反应能. 展开更多
关键词 密度泛函理论 DNA三聚体 质子转移 静电相互作用 质子亲和势
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5-卤代尿嘧啶质子转移异构化的密度泛函理论和拉曼光谱实验 被引量:2
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作者 王雅琼 张树强 郑旭明 《浙江理工大学学报(自然科学版)》 2007年第1期88-93,共6页
采用量子化学中的密度泛函理论,在6-31C(d)计算水平上,考察了5-卤代尿嘧啶(5-XU,其中X=F,Cl,Br,Ⅰ)的质子转移异构化反应的7种可能途径、相关异构体和过渡态的结构,以及质子转移异构化的势能面,并对5-碘尿嘧啶和尿嘧啶的拉... 采用量子化学中的密度泛函理论,在6-31C(d)计算水平上,考察了5-卤代尿嘧啶(5-XU,其中X=F,Cl,Br,Ⅰ)的质子转移异构化反应的7种可能途径、相关异构体和过渡态的结构,以及质子转移异构化的势能面,并对5-碘尿嘧啶和尿嘧啶的拉曼光谱频率进行了讨论。研究表明,取代基X的吸电子能力对5-卤代尿嘧啶各质子转移异构体的稳定性和某一步的质子转移异构化能垒的大小几乎没有影响,尽管各步质子转移异构化反应能垒之间有明显的差异,如第一步的质子转移异构化能垒最大,约为188~214kJ·mol^-1,第二步其次,约为158~171kJ·mol^-1,第三步最小,约为145~155kJ·mol^-1。获取了5-碘嘧啶和尿嘧啶的傅立叶拉曼光谱。拉曼光谱显示,碘对尿嘧啶的5位氢的取代明显改变了尿嘧啶的C4-C5/C5-C5伸缩振动、C4—O10伸缩振动和N3-H9弯曲振动的拉曼活性.袁明光或电磁场对C4-O10和N3—H9局部的电子云分布产生重要影响。 展开更多
关键词 质子转移 5-卤代尿嘧啶 密度泛函理论 过渡态 傅立叶变换拉曼
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用解析函数拟合NH3复合分子中质子转移势能的理论研究
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作者 王荣顺 潘秀梅 +1 位作者 苏忠民 SCHEINER Steve 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2001年第12期2056-2062,共7页
采用量子化学ab initio(4-31G基组)方法,计算了NH3复合分子(H3N…H+…NH3)中的质子转移势能,氢键长度和取向的变化都没有影响它的双势阱特征,长度越长、分子主轴偏离氢键键轴越大,双势阱间能垒越高.采用最小二乘法拟合上述ab initio计... 采用量子化学ab initio(4-31G基组)方法,计算了NH3复合分子(H3N…H+…NH3)中的质子转移势能,氢键长度和取向的变化都没有影响它的双势阱特征,长度越长、分子主轴偏离氢键键轴越大,双势阱间能垒越高.采用最小二乘法拟合上述ab initio计算结果,找到了理想的解析函数,从而扩大其适用范围.针对体系的对称性和非对称性,我们改进了φ4函数和Morse函数,从而使拟合结果得到了明显提高,拟合相关系数最高达0.999. 展开更多
关键词 质子迁移 解析函数 NH3复合分子 ab INITIO 氢键 拟合 氨分子 量子化学 势能 势能曲线
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醇水催化7-羟基喹啉质子迁移过程的反应机理研究 被引量:1
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作者 谭英雄 李来才 《四川师范大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期556-559,共4页
用量子化学B3LYP方法在6-311G*基组水平上研究了7-羟基喹啉二水和二甲醇复合物分子间的相互作用和水助及醇助催化质子迁移反应,优化得到了反应物、过渡态和生成物的几何结构,结果表明,在水助及醇助催化质子迁移过程中,3个氢原子都参与... 用量子化学B3LYP方法在6-311G*基组水平上研究了7-羟基喹啉二水和二甲醇复合物分子间的相互作用和水助及醇助催化质子迁移反应,优化得到了反应物、过渡态和生成物的几何结构,结果表明,在水助及醇助催化质子迁移过程中,3个氢原子都参与了迁移过程,醇助催化质子迁移反应途径在甲醇溶液中的活化能垒比水助催化质子迁移反应低,在甲醇溶液中的反应比在水溶液中的反应更容易. 展开更多
关键词 7-羟基喹啉 密度泛函理论 质子迁移 过渡态
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羟基加成反应对A-T碱基对结构和质子转移过程的影响 被引量:2
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作者 史俊友 董丽花 刘永军 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第12期3329-3336,共8页
应用密度泛函理论在B3LYP/6-31++G(d,p)//B3LYP/6-31G(d,p)水平上对羟基化碱基对A-T的结构进行了研究,经计算共得到8种稳定的羟基化加成产物,其能量的相对顺序为8OHA-T<A-T6OH<A-T5OH<2OHA-T<4OHA-T<5OHA-T<A-T2OH<... 应用密度泛函理论在B3LYP/6-31++G(d,p)//B3LYP/6-31G(d,p)水平上对羟基化碱基对A-T的结构进行了研究,经计算共得到8种稳定的羟基化加成产物,其能量的相对顺序为8OHA-T<A-T6OH<A-T5OH<2OHA-T<4OHA-T<5OHA-T<A-T2OH<A-T4OH(数字表示羟基加成进攻的原子在腺嘌呤或胸腺嘧啶中的编号),这与其加成反应前后结构变化的大小密切相关.当羟基对腺嘌呤端进行加成时,A-T间的相互作用能略有增加,而当羟基对胸腺嘧啶进行加成时,A-T之间的相互作用能略有减小.另外,还以能量较低的加成产物8OHA-T和A-T6OH为例对羟基化碱基对中A和T之间的质子转移过程进行了研究,结果表明羟基化产物中A与T之间的质子转移机理由未加成前的分步双质子转移变为协同双质子转移,且其势垒低于未加成的A-T发生第一步(决速步骤)质子转移的势垒. 展开更多
关键词 密度泛函理论 碱基对 羟基化 质子转移 单电子占据轨道
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用可解的六次势研究9-羟基苯嵌萘酮的基态能级劈裂 被引量:1
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作者 刘海英 丁世良 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2002年第5期941-943,共3页
质子转移(PT)得到了理论和实验方面广泛的研究[1~10], 9-羟基苯嵌萘酮(9-HPO)是一个典型体系. 在荧光光谱中, 观测到氘化的9-HPO的基态能级劈裂, 结合其它光谱和X射线衍射数据, 提出用四次函数V(R)=A(R4-BR2)作为势能函数[1].
关键词 9-羟基苯嵌萘酮 基态能级劈裂 质子转移 隧道效应 可解势函数 双势阱模型
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5,10-CH^+-THF简化模型转移一碳单元反应机理的计算研究
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作者 戚传松 徐磊 +1 位作者 李巍 王芸娜 《北京石油化工学院学报》 2008年第2期7-10,共4页
生物体内嘌呤、嘧啶、胸苷酸等的合成以及细胞的代谢过程都伴随有一碳单元转移反应。在这类反应中,四氢叶酸是一碳单元的载体同时又是甲基化的直接甲基元。选择四氢叶酸的模型化合物与邻苯二胺的反应作为研究对象,从理论上研究了一碳单... 生物体内嘌呤、嘧啶、胸苷酸等的合成以及细胞的代谢过程都伴随有一碳单元转移反应。在这类反应中,四氢叶酸是一碳单元的载体同时又是甲基化的直接甲基元。选择四氢叶酸的模型化合物与邻苯二胺的反应作为研究对象,从理论上研究了一碳单元的转移过程,探讨了该反应的反应过程、反应机理和能量变化。研究发现四氢叶酸模型化合物与邻苯二胺依次经过质子转移、键断裂、新键的形成、质子转移以及二胺基的消除等多个步骤,完成了一碳单元转移反应。由能量变化可以得出一碳单元转移过程中质子转移为限速步骤,与实验上所得结论一致。得到了比较详细的一碳单元转移机理。 展开更多
关键词 一碳单元 理论计算 质子转移 密度泛函
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9-羟基苯嵌萘酮的基态能级劈裂的理论研究
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作者 刘海英 丁世良 李艳 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2004年第2期309-312,共4页
当γ,μ满足一定条件时 ,六次函数 V( R,γ) =C[R6 +2γR4 +(γ2 +μ) R2 ]的图像是双势阱 ,可用来描述质子转移 ,且其相应的 Schrodinger方程有解析解 .用此势函数结合一维双势阱模型及变分法 ,并用 B3 P86密度泛函方法在 6-3 1 1 G... 当γ,μ满足一定条件时 ,六次函数 V( R,γ) =C[R6 +2γR4 +(γ2 +μ) R2 ]的图像是双势阱 ,可用来描述质子转移 ,且其相应的 Schrodinger方程有解析解 .用此势函数结合一维双势阱模型及变分法 ,并用 B3 P86密度泛函方法在 6-3 1 1 G水平下计算了该分子的平衡态和过渡态的构型及能量 ,研究了 9-羟基苯嵌萘酮的基态能级劈裂 ,与其它理论值相比 ,所得计算结果 [ΔH( 0 ) =86.1 3 cm- 1 展开更多
关键词 9-羟基苯嵌萘酮 基态能级劈裂 质子转移 可解势函数 双势阱模型 分子行为
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ESIPT和TICT荧光发射的电子结构特征及发射能计算 被引量:17
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作者 王溢磊 吴国是 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第4期552-560,共9页
采用含时密度泛函理论(TDDFT)与单激发组态相互作用(CIS)相结合的计算方案对八种结构相似的水杨酰苯胺衍生物及其类似物第一激发单重态(S1)进行考察,证实它们的荧光发射分属分子内质子转移(ESIPT)和分子扭转-电荷转移(TICT)两种不同机... 采用含时密度泛函理论(TDDFT)与单激发组态相互作用(CIS)相结合的计算方案对八种结构相似的水杨酰苯胺衍生物及其类似物第一激发单重态(S1)进行考察,证实它们的荧光发射分属分子内质子转移(ESIPT)和分子扭转-电荷转移(TICT)两种不同机制且结论与已知实验事实相符.ESIPT发光的化合物在电子跃迁前后无明显的电荷转移发生,发射能计算的适用泛函是OLYP和BLYP等无Hartree-Fock(HF)交换成分的纯泛函;TICT发光的化合物在电子跃迁前后发生明显的电荷转移,其适用泛函为含约37%HF交换成分的混合型泛函(例如mPW1B95和MPW1K).按上述原则来选择适用泛函,即可在TDDFT/6-31G(d)//CIS/3-21G(d)理论水平上正确预测水杨酰苯胺衍生物和类似物的发射能,平均精度可达0.2eV.兼具质子转移与电荷转移双反应通道的化合物,两者的竞争遵从能量最小原理,结果使荧光发射仅选择其中一个通道进行.泛函的选择只与实际发生的反应有关,与并未实际发生的反应通道无关.附加的八个算例进一步表明,此成功的计算方案可望推广应用于其它类型的ESIPT和TICT荧光有机物. 展开更多
关键词 荧光发射能 含时密度泛函理论 Hartree-Fock交换成分 水杨酰苯胺 质子转移 电荷转移
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SWCNT(8,8)与水复合环境对α-Ala的质子从季碳向羰基氧迁移的催化机理
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作者 张新 于卓 闫红彦 《白城师范学院学报》 2016年第8期25-30,共6页
用量子力学与分子力学组合的ONIOM(MP2/6-311++G(3df,3pd):UFF)//ONIOM(CAM-B3LYP/6-31+G(d,p):UFF)方法,研究了标题反应的机理.分子结构计算表明:Sα-Ala·2H2O@SWCNT(8,8)和Sα-Ala·3H2O@SWCNT(8,8)中,季碳与其上面氢的键长... 用量子力学与分子力学组合的ONIOM(MP2/6-311++G(3df,3pd):UFF)//ONIOM(CAM-B3LYP/6-31+G(d,p):UFF)方法,研究了标题反应的机理.分子结构计算表明:Sα-Ala·2H2O@SWCNT(8,8)和Sα-Ala·3H2O@SWCNT(8,8)中,季碳与其上面氢的键长分别是0.11055和0.11100(nm),比Sα-Ala·1H2O@SWCNT(8,8)的季碳与其上面氢的键长0.10991nm明显长;环形过渡态TS1·2H2O@SWCNT(8,8)和TS1·3H2O@SWCNT(8,8)的氢键键角比TS1·1H2O@SWCNT(8,8)的明显增大.势能面计算发现:在SWCNT(8,8)内以1个、2个和3个H2O分子为氢转移媒介,α-Ala的质子从季碳向羰基氧迁移的能垒是208.6、160.9和154.4(k J·mol-1).比α-Ala限域在SWCNT(8,8)内质子从季碳向羰基氧迁移的能垒322.7 k J·mol-1大幅降低.结果表明:SWCNT(8,8)与水的复合环境对α-Ala的质子从季碳向羰基氧迁移具有较好的催化作用. 展开更多
关键词 纳米管 Α-丙氨酸 质子迁移 ONIOM方法 密度泛函 过渡态
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