基于隐Markov模型的RNA二级结构预测新方法

有效预测RNA二级结构是生物信息学中的重要研究领域.提出一种基于隐Markov模型预测RNA二级结构的新方法.首先,应用前后缀匹配算法快速找到所有可能(包括假结)的茎区,建立RNA-HMM,寻找最优的茎区组合方法,得到包含假结的RNA二级结构.实验结果表明,提出的新方法降低了计算复杂性,提高了预测的特异性和敏感性,具有较高的准确率,可以预测RNA的假结结构.

圆域B样条曲线的节点去除

在圆域算术的基础上,引入了圆域B样条曲线的概念,并讨论了它的一些基本性质.研究了圆域B样条曲线的节点去除问题,即用去除一个节点后的圆域B样条曲线包住原曲线,采用拟线性规划和最佳逼近2种方法,分别给出了该问题的解析解.

基于分裂状态的规范伪括号多项式计算方法

介绍了伪纽结理论的相关概念和主要结论,将计算纽结Kauffman多项式的方法推广到伪纽结的规范伪括号多项式,提出了一种基于伪纽结的全部分裂状态的规范伪括号多项式的计算方法.根据这一方法,计算了含有不同数目的伪交叉点的伪三叶结投影图的规范伪括号多项式,结果表明,它们是不等价的伪纽结,赋权解集不是伪纽结的完全不变量.