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香菇乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶编码基因le-pyrG的克隆 被引量:2
1
作者 鲍大鹏 冯爱萍 +4 位作者 张美彦 谭琦 陈明杰 牛丽英 潘迎捷 《食用菌学报》 北大核心 2009年第2期13-16,共4页
通过巢式简并PCR和基因组步行技术从香菇(Lentinula edodes)单核体中克隆到乳清酸核苷-5′-单磷酸脱羧酶(orotidine-5’-monophosphate decarboxylase,OMPDC)的编码基因le-pyrG,长度为946bp。经生物信息学分析,香菇le-pyrG基因含有2个... 通过巢式简并PCR和基因组步行技术从香菇(Lentinula edodes)单核体中克隆到乳清酸核苷-5′-单磷酸脱羧酶(orotidine-5’-monophosphate decarboxylase,OMPDC)的编码基因le-pyrG,长度为946bp。经生物信息学分析,香菇le-pyrG基因含有2个长度分别为67bp和51bp的内含子,该基因可以编码1个含有275个氨基酸残基的蛋白质序列,该序列经比对分析显示与裂褶菌(Schizophyllum commne)和灰盖鬼伞(Coprinus cinereus)OMPDC序列的相同性分别为73%和70%,相似性分别为84%和83%。这是首次报道从栽培食用真菌中克隆出乳清酸核苷-5′-单磷酸脱羧酶编码基因的全序列。 展开更多
关键词 香菇 乳清酸核苷-5′-单磷酸脱羧酶 le-pyrg基因
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黑曲霉菌pyrG缺陷株的建立 被引量:5
2
作者 刘钟滨 David J.Jeenes David B.Archer 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2001年第3期15-16,共2页
运用紫外线照射致突变方法建立了黑曲霉菌ATCC 12 0 49,134 96和N40 2等 3种菌株的乳清酸核苷 5′ 磷酸脱羧酶基因 (pyrG)缺陷株。其中ATCC 134 96是一种蛋白酶缺陷株。含黑曲霉菌pyrG基因的重组质粒 pY 1.2可使它们发生转化 ,成为Pyr... 运用紫外线照射致突变方法建立了黑曲霉菌ATCC 12 0 49,134 96和N40 2等 3种菌株的乳清酸核苷 5′ 磷酸脱羧酶基因 (pyrG)缺陷株。其中ATCC 134 96是一种蛋白酶缺陷株。含黑曲霉菌pyrG基因的重组质粒 pY 1.2可使它们发生转化 ,成为Pyr+ ,转化效率约为 8~ 40转化子 / μgDNA。这些 展开更多
关键词 pyrg缺陷株 黑曲霉菌 基因转化系统
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Isolation of Trichoderma reesei pyrG Negative Mutant by UV Mutagenesis and Its Application in Transformation 被引量:6
3
作者 LONG Hao WANG Tian-hong ZHANG Ying-kuan 《Chemical Research in Chinese Universities》 SCIE CAS CSCD 2008年第5期565-569,共5页
Two uridine auxotrophic mutants of Trichoderma reesei were isolated by resistance to 5-fluoroorotic acid after UV mutagenesis. One mutant, called M23, was complemented with the Aspergillus niger pyrG gene carried by p... Two uridine auxotrophic mutants of Trichoderma reesei were isolated by resistance to 5-fluoroorotic acid after UV mutagenesis. One mutant, called M23, was complemented with the Aspergillus niger pyrG gene carried by plasmid pAB4-1. A mutated pyrG gene of M23 was cloned and DNA sequencing analysis indicated that a cytosine was inserted into the 934―939 oligo dC position of the pyrG coding region, resulted in a frameshift mutation. Transformation efficiency was approximately 200―300 transformants per microgram of DNA with plasmid pAB4-1. Stable transformants were obtained by monosporic culture and showed to be prototroph after successive propagation. Vitreoscilla hemoglobin expression plasmid pUCVHb was cotransformed with plasmid pAB4-1 and attained a transformation efficiency of 71.8% or of 26.1% with pAN7-1. Southern blot analysis of the transformants demonstrated that plasmid pUCVHb was integrated into the chromosomal DNA. The experimental results demonstrated that the pyrG-based system was more efficient and timesaving than the conventional hygromycin B resistance-based transformation system. 展开更多
关键词 Trichoderma reesei UV mutagenesis pyrg negative strain pyrg-based transformation system
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pyrG基因缺失对黑曲霉中赭曲霉毒素A生物合成的影响 被引量:2
4
作者 胡朝江 张艺格 +5 位作者 张智慧 牛志鹏 吕扬勇 翟焕趁 魏闪 胡元森 《河南工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2022年第4期1-8,共8页
黑曲霉在食品工业中广泛应用,但近年来发现该菌群可产生赭曲霉毒素A(OTA)等强致癌真菌毒素,对食品安全造成严重威胁。为了研究黑曲霉中OTA合成调控机理,构建了乳清酸核苷-5′-磷酸脱羧酶基因pyrG缺失菌株及回补菌株,利用HPLC-FLD检测该... 黑曲霉在食品工业中广泛应用,但近年来发现该菌群可产生赭曲霉毒素A(OTA)等强致癌真菌毒素,对食品安全造成严重威胁。为了研究黑曲霉中OTA合成调控机理,构建了乳清酸核苷-5′-磷酸脱羧酶基因pyrG缺失菌株及回补菌株,利用HPLC-FLD检测该基因对OTA生物合成的影响,通过添加不同浓度尿嘧啶核苷及荧光定量PCR,初步探索该基因调控OTA合成的机理,并检测玉米粒上该基因缺失菌株中OTA含量的变化。结果表明:与野生型菌株及回补菌株相比,pyrG基因缺失菌株OTA含量分别降低77.8%和75.7%;该基因调控OTA合成不依赖尿嘧啶核苷的浓度;与野生型菌株相比,pyrG基因缺失菌株OTA合成基因簇中基因pks、p450、nrps、hal和bZIP基因的表达水平分别下调52.0%、36.0%、84.0%、46.0%、74.0%,与回补菌株相比,分别下调55.7%、42.1%、85.1%、50.3%、76.0%;pyrG基因缺失后导致玉米粒上的黑曲霉菌株几乎不产生OTA。pyrG基因缺失影响黑曲霉中OTA合成基因pks、p450、nrps、hal及bZIP的表达,从而降低了OTA的合成水平。 展开更多
关键词 黑曲霉 赭曲霉毒素A pyrg OTA合成基因簇 玉米粒
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草菇Volvariella volvacea中乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶编码基因vv-pyrG的克隆和序列分析 被引量:1
5
作者 牛丽英 鲍大鹏 +1 位作者 陈明杰 谭琦 《上海农业学报》 CSCD 北大核心 2010年第1期33-37,共5页
运用简并PCR和基因组步行技术克隆常见食用菌草菇的乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶编码基因(vv-pyrG基因),并运用生物信息学和系统发育学的方法对所获得的基因进行了序列分析。结果显示:vv-pyrG基因的编码区长度为920 bp,含有2个长度分别... 运用简并PCR和基因组步行技术克隆常见食用菌草菇的乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶编码基因(vv-pyrG基因),并运用生物信息学和系统发育学的方法对所获得的基因进行了序列分析。结果显示:vv-pyrG基因的编码区长度为920 bp,含有2个长度分别为65 bp和54 bp的内含子,可以编码1个含有266个氨基酸残基的蛋白质序列。该氨基酸序列经比对分析,显示与裂褶菌(Schizophyllum commune)和灰盖鬼伞(Coprinus ci-nereus)的OMPDC序列的相同性分别为58%和64%,相似性分别为74%和78%。对24种真菌的OMPDC氨基酸序列进行系统发育分析表明,系统进化树中草菇与灰盖鬼伞、裂褶菌、双色蜡蘑(Laccaria bicolor)和白腐菌(Phanerochaete sordida)聚在一起,在节点上的支持率是97%。 展开更多
关键词 草菇 巢式简并PCR vv-pyrg基因 序列分析
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黑曲霉pyrG遗传转化系统的构建及应用 被引量:3
6
作者 胡江峰 刘舒雯 +3 位作者 杨焱 李林霖 李迎凯 张健 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期15-19,共5页
用于黑曲霉遗传操作的筛选标记基因非常有限,而基因改造往往涉及诸多基因的敲除或表达,有限的筛选标记基因难以满足需要。该文构建了以pyrG为筛选标记的黑曲霉遗传转化系统,并利用该系统使红色荧光蛋白rfp在黑曲霉中成功表达。首先,运... 用于黑曲霉遗传操作的筛选标记基因非常有限,而基因改造往往涉及诸多基因的敲除或表达,有限的筛选标记基因难以满足需要。该文构建了以pyrG为筛选标记的黑曲霉遗传转化系统,并利用该系统使红色荧光蛋白rfp在黑曲霉中成功表达。首先,运用同源重组原理完全敲除pyrG基因,在含有5-氟乳清酸和尿苷/尿嘧啶的培养基平板进行筛选,获得1株稳定遗传的尿苷/尿嘧啶营养缺陷型菌株黑曲霉ng-1。然后构建了以pyrG作为回补标记,以三磷酸甘油醛脱氢酶启动子gpdA来调节rfp基因表达的质粒,将质粒转入农杆菌AGL1并侵染黑曲霉菌株ng-1,成功获得了黑曲霉rfp表达菌株,表明pyrG筛选标记可成功用于黑曲霉的遗传转化。 展开更多
关键词 黑曲霉 pyrg 根癌农杆菌介导的转化法 筛选标记 红色荧光蛋白
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黄曲霉中pyrG筛选标记循环利用的方法 被引量:1
7
作者 聂鑫怡 薛杨 +2 位作者 王银春 丁霞飞 汪世华 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2021年第2期270-275,共6页
为解决黄曲霉遗传转化操作过程中遗传筛选标记受限及传统URA3/pyrG环出系统存在重复序列残留的问题,以具有尿嘧啶营养缺陷的黄曲霉CA14PTs(Δku70ΔpyrG)菌株为出发菌,利用pyrG筛选标记构建表达HA-SumO的重组菌株GHS(pyrG+),再通过重叠... 为解决黄曲霉遗传转化操作过程中遗传筛选标记受限及传统URA3/pyrG环出系统存在重复序列残留的问题,以具有尿嘧啶营养缺陷的黄曲霉CA14PTs(Δku70ΔpyrG)菌株为出发菌,利用pyrG筛选标记构建表达HA-SumO的重组菌株GHS(pyrG+),再通过重叠PCR法构建包含GHS(pyrG+)基因组中pyrG整合位点上、下游片段的融合片段,导入GHS(pyrG+)菌株原生质体,利用DNA同源重组和5-氟乳清酸(5-FOA)的负筛选剔除pyrG筛选标记,重新获得具有尿嘧啶营养缺陷的重组菌株GHS(pyrG-).通过测序分析,确认GHS(pyrG-)重组菌株基因组中的pyrG筛选标记已被剔除且无其他序列残留.免疫杂交分析结果表明,剔除pyrG筛选标记不影响重组菌株的蛋白表达模式. 展开更多
关键词 pyrg遗传筛选标记 循环利用 不依赖同向重复序列 黄曲霉
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橙色红曲菌pyrG缺陷株的筛选及鉴定
8
作者 王伯华 许杨 李燕萍 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第28期15500-15502,共3页
[目的]筛选和鉴定橙色红曲菌pyrG缺陷株。[方法]以橙色红曲菌AS3.4384(Monascus aurantiacus)为出发菌株,运用紫外照射致基因突变,随后对尿嘧啶依赖型菌株的pyrG基因进行测序比对,筛选pyrG基因突变株,最后用含有米曲霉pyrG基因的pAOP互... [目的]筛选和鉴定橙色红曲菌pyrG缺陷株。[方法]以橙色红曲菌AS3.4384(Monascus aurantiacus)为出发菌株,运用紫外照射致基因突变,随后对尿嘧啶依赖型菌株的pyrG基因进行测序比对,筛选pyrG基因突变株,最后用含有米曲霉pyrG基因的pAOP互补质粒对其进行基因转化试验。[结果]经紫外诱变得到一株尿嘧啶依赖型的5-FOA抗性菌株UM28。扩增其pyrG基因并进行测序,发现UM28的pyrG基因在核苷酸序列+220bp的位置发生了突变,进而导致氨基酸水平上Pro→Ser的突变,造成了乳清苷-5'-磷酸脱羧酶的失活。UM28通过基因转化能够接受含有米曲霉pyrG基因的互补质粒恢复野生表型,且回复突变率低于10-8,能够用于红曲菌同源转化系统的构建。[结论]获得了一株红曲菌pyrG基因缺陷株UM28,它可被用作基因工程的受体菌。 展开更多
关键词 红曲茵 pyrg缺陷株 紫外诱变 同源转化系统
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利用CRISPR/Cas 9编辑红曲霉pyrG基因对其次生代谢的影响 被引量:3
9
作者 唐光甫 桂艳玲 +1 位作者 满海乔 赵杰宏 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第8期198-205,共8页
为研究红曲霉pyrG基因对其次生代谢的影响,通过农杆菌介导遗传转化获得了转Cas 9基因的红曲霉底盘菌株,然后设计并体外转录合成pyrG基因的定向编辑sgRNA,对底盘菌株的原生质体遗传转化,经5-FOA抗性筛选、PCR扩增、T7EI酶切和测序验证,获... 为研究红曲霉pyrG基因对其次生代谢的影响,通过农杆菌介导遗传转化获得了转Cas 9基因的红曲霉底盘菌株,然后设计并体外转录合成pyrG基因的定向编辑sgRNA,对底盘菌株的原生质体遗传转化,经5-FOA抗性筛选、PCR扩增、T7EI酶切和测序验证,获得pyrG基因定向编辑的红曲霉4个菌株,其中2株单碱基缺失,2株2碱基缺失。比较分析表明,野生型红曲霉在添加尿嘧啶核苷的培养基中会极显著增加洛伐他汀含量,并极显著降低桔霉素含量,而经CRISPR/Cas 9失活pyrG的变异菌株与野生型相比,洛伐他汀和桔霉素含量明显增加。表明尿嘧啶核苷合成关键酶基因pyrG和外源尿嘧啶核苷对红曲霉的次生代谢有协同调控作用,为红曲霉功能基因研究和次生代谢调控提供参考。 展开更多
关键词 CRISPR/Cas 9 紫色红曲霉 pyrg变异株 原生质体 底盘菌株
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pyrG基因的克隆表达及CTPS的活性测定 被引量:1
10
作者 叶雯 徐旭东 《药物生物技术》 CAS CSCD 2007年第4期245-248,共4页
为提高乳清酸到三磷酸胞苷(CTp)的转化效率,克隆并表达了编码CTP合成酶(CTPS)的基因pyrG。根据Genbank的资料,设计了pyrG的引物,经PCR扩增、酶切后,将pyrG插入到表达载体pET-28a中,构建了重组质粒pET28a-pyrG,然后转化到大肠杆菌BL21(D... 为提高乳清酸到三磷酸胞苷(CTp)的转化效率,克隆并表达了编码CTP合成酶(CTPS)的基因pyrG。根据Genbank的资料,设计了pyrG的引物,经PCR扩增、酶切后,将pyrG插入到表达载体pET-28a中,构建了重组质粒pET28a-pyrG,然后转化到大肠杆菌BL21(DE3)中,乳糖诱导表达后,经SDS-PAGE对表达产物进行分子量鉴定。分离纯化后,对表达产物CTPS进行活性测定,并对转化工艺进行初步研究。结果:构建的工程菌产生了一种相对分子质量在60.0k的蛋白,该蛋白显示出CTPS的活性,并且可以转化乳清酸为CTP。 展开更多
关键词 三磷酸胞苷合成酶基因 克隆表达 酶活测定 三磷酸胞苷合成
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Cloning of le-pyrG, an Orotidine-5'-monophosphate Decarboxylase Encoding Gene from Lentinula edodes 被引量:1
11
作者 BAO Dapeng FENG Aiping +4 位作者 ZHANG Meiyan TAN Qi CHEN Mingjie NIU Liying PAN Yingjie 《食用菌学报》 北大核心 2009年第2期17-20,共4页
关键词 食用菌 栽培技术 基因 克隆技术
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米曲霉RIB40高效同源重组和尿苷/尿嘧啶营养缺陷型菌株的构建 被引量:4
12
作者 高育青 张豪杰 +2 位作者 张丹凤 潘裕添 张峰 《食品工业科技》 CAS 北大核心 2023年第1期200-207,共8页
目的:以米曲霉RIB40为出发菌株,构建具有高同源重组效率的营养缺陷型菌株。方法:首先通过同源重组技术和5-氟乳清酸(5-Fluoroorotic Acid,5-FOA)对尿苷/尿嘧啶营养缺陷的筛选作用,获得AopyrG基因缺失的米曲霉RIB40。然后利用烟曲霉Afpyr... 目的:以米曲霉RIB40为出发菌株,构建具有高同源重组效率的营养缺陷型菌株。方法:首先通过同源重组技术和5-氟乳清酸(5-Fluoroorotic Acid,5-FOA)对尿苷/尿嘧啶营养缺陷的筛选作用,获得AopyrG基因缺失的米曲霉RIB40。然后利用烟曲霉AfpyrG基因替换Aoku70得到ΔAoku70敲除菌株,再通过5-FOA的筛选作用使得ΔAoku70菌株基因组发生自身环化,丢失AfpyrG基因。最后为了检验ΔAoku70ΔAopyrG菌株的可用性,将编码红色荧光蛋白的mCherry基因敲入至双突变菌株的组蛋白H2B基因上,并通过激光共聚焦显微镜观察红色荧光蛋白质的亚细胞定位。结果:通过AopyrG和Aoku70的双基因敲除,获得了高同源重组效率的营养缺陷型菌株ΔAoku70ΔAopyrG。用激光共聚焦观察到红色荧光蛋白定位于细胞核,表明ΔAoku70ΔAopyrG菌株可用于米曲霉的基因改造。结论:ΔAoku70ΔAopyrG菌株可作为一个高同源重组效率的营养缺陷型出发菌株用于今后米曲霉RIB40的遗传改良。 展开更多
关键词 米曲霉 RIB40 尿苷/尿嘧啶营养缺陷型 pyrg KU70 荧光定位
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米曲霉3.042尿苷/尿嘧啶营养缺陷型遗传转化体系的构建 被引量:5
13
作者 毕付提 史亚楠 +3 位作者 张久祎 王静然 薛鲜丽 王德培 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2021年第3期189-195,共7页
米曲霉对潮霉素等多种抗生素不敏感,对其基因改造有一定困难。该研究以米曲霉3.042为出发菌株,建立pyrG筛选标记遗传转化体系。首先,分别运用紫外诱变法和左右臂同源重组法破坏米曲霉自身的pyrG基因,在含有5-氟乳清酸和尿苷/尿嘧啶的培... 米曲霉对潮霉素等多种抗生素不敏感,对其基因改造有一定困难。该研究以米曲霉3.042为出发菌株,建立pyrG筛选标记遗传转化体系。首先,分别运用紫外诱变法和左右臂同源重组法破坏米曲霉自身的pyrG基因,在含有5-氟乳清酸和尿苷/尿嘧啶的培养基平板进行筛选,最终两种方法分别获得性状稳定的尿苷/尿嘧啶营养缺陷型突变株米曲霉O11和米曲霉g-1。随后以缺陷型突变株为出发菌株,利用农杆菌转化法转入包含pyrG回补标记的质粒,其中米曲霉g-1突变株获得原养型的回补菌株,紫外诱变法获得的缺陷型突变菌株米曲霉O11未能恢复为原养型。研究表明米曲霉3.042 pyrG基因大片段缺失的缺陷型菌株,可直接以自身pyrG基因作为选择标记进行遗传改造。 展开更多
关键词 米曲霉3.042 尿苷/尿嘧啶营养缺陷型 紫外诱变 根癌农杆菌介导的转化法 pyrg
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橙色红曲菌乳清苷-5'-磷酸脱羧酶基因的克隆
14
作者 王伯华 许杨 李燕萍 《食品工业科技》 CAS CSCD 北大核心 2010年第11期172-174,共3页
根据已报道的真菌乳清苷-5′-磷酸脱羧酶(pyrG)氨基酸序列,采用CODEHOP策略设计简并引物,从橙色红曲菌(Monascus aurantiacus)的基因组DNA中克隆得到pyrG基因片段。然后运用PCR法筛选橙色红曲菌Fosmid文库,获得了pyrG基因全长(GenBank... 根据已报道的真菌乳清苷-5′-磷酸脱羧酶(pyrG)氨基酸序列,采用CODEHOP策略设计简并引物,从橙色红曲菌(Monascus aurantiacus)的基因组DNA中克隆得到pyrG基因片段。然后运用PCR法筛选橙色红曲菌Fosmid文库,获得了pyrG基因全长(GenBank登录号:GU723506)。经过blastx比较发现,橙色红曲菌pyrG基因与AspergillusflavusNRRL3357的氨基酸序列同源性最高,达到81%。该基因能够作为筛选标记应用于橙色红曲菌同源转化系统。 展开更多
关键词 橙色红曲菌 简并引物 pyrg基因 基因克隆
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米曲霉AS3.800基因工程转化体系的构建 被引量:1
15
作者 陈发忠 廖东庆 +2 位作者 李晓明 蒙健宗 黄日波 《轻工科技》 2013年第6期5-8,共4页
采用紫外突变结合砂芯漏斗过滤筛选,得到米曲霉双重营养缺陷型突变菌株AS3.800(niaD-,pyrG-)。应用生物信息学软件辅助分析米曲霉基因,了解转录调控元件。通过PCR技术成功地从米曲霉AS3.800总DNA中分别扩增niaD、pyrG基因表达框(express... 采用紫外突变结合砂芯漏斗过滤筛选,得到米曲霉双重营养缺陷型突变菌株AS3.800(niaD-,pyrG-)。应用生物信息学软件辅助分析米曲霉基因,了解转录调控元件。通过PCR技术成功地从米曲霉AS3.800总DNA中分别扩增niaD、pyrG基因表达框(expression cassette),构建筛选标记质粒pUCniaD和pUCpyrG,并尝试原生质体转化AS3.800(niaD-,pyrG-)。 展开更多
关键词 米曲霉 niaD pyrg 缺陷型 原生质体
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三孢布拉氏霉乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶基因的PCR扩增与序列分析
16
作者 高建峰 宋冬林 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第5期419-423,共5页
根据对卷枝毛霉Mucor circinelloides、布氏须霉PPhycomyces blakesleeanu、雪白根霉Rhizopus niveu、少根根霉Rhizo pus arrhizus和微小根毛霉Rhizomucor pusillus的乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶基因核酸序列的同源性分析,在第3个... 根据对卷枝毛霉Mucor circinelloides、布氏须霉PPhycomyces blakesleeanu、雪白根霉Rhizopus niveu、少根根霉Rhizo pus arrhizus和微小根毛霉Rhizomucor pusillus的乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶基因核酸序列的同源性分析,在第3个外显子内根据卷枝毛霉基因序列设计1对引物,以三孢布拉氏霉Blakeslea trispora基因组DNA为模板进行PCR扩增,得到1个长度约为500 bp的产物。经过同源性分析证明该产物为三孢布拉氏霉乳清酸核苷-5'-单磷酸脱羧酶基因片段。在此基础上,采用抑制性PCR扩增技术,进行染色体步行,分别克隆染色体上相邻的DNA片段,测定了基因的全序列,并对该序列进行了分析。结果表明:在外显子区域核酸序列与卷枝毛霉、少根根霉和微小根毛霉的同源率分别为82%,81%和79%。 展开更多
关键词 三孢布拉氏霉 乳清酸核苷-5’-单磷酸脱羧酶 基因 PCR 核酸 同源性 染色体 DNA 类胡萝卜素
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香菇中CRISPR/Cas9基因编辑体系的构建
17
作者 付阳 宋春艳 +6 位作者 董晶晶 刘建雨 姜宁 章炉军 于海龙 尚晓冬 谭琦 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期23-39,共17页
香菇Lentinula edodes是世界第二大食药用菌,具有较高的食用、药用、经济和生态学研究价值,探索其本身具备优良性状的调控机制,同时对可能参与其中的功能基因进行反义遗传学研究是十分必要的。本研究对已知的功能基因利用CRISPR/Cas9基... 香菇Lentinula edodes是世界第二大食药用菌,具有较高的食用、药用、经济和生态学研究价值,探索其本身具备优良性状的调控机制,同时对可能参与其中的功能基因进行反义遗传学研究是十分必要的。本研究对已知的功能基因利用CRISPR/Cas9基因编辑技术进行编辑,确定该技术能在香菇中工作。预测并筛选出一个香菇U6snRNA启动子,以乳清苷-5'-磷酸脱羧酶编码基因pyrG为目的基因设计CRISPR/Cas9技术的重要工作元件sgRNA,对异源cas9基因依据香菇基因组密码子偏好性进行优化,构建了一个同时携带sgRNA和cas9基因的双元表达载体。利用农杆菌介导的香菇菌丝遗传转化技术将该载体转入香菇单核体中对pyrG基因进行编辑,成功获得pyrG基因发生碱基缺失的香菇单核体突变株,经功能筛选后确定其为尿嘧啶营养缺陷型单核体菌株。本研究成功构建了一个能同时表达CRISPR/Cas9技术重要组件的双元表达载体,证明了CRISPR/Cas9能够在香菇中发挥编辑目的基因的功能,为进一步开展香菇重要功能基因的研究奠定了良好的基础。 展开更多
关键词 香菇 CRISPR/Cas9基因编辑技术 pyrg基因 尿嘧啶营养缺陷型 功能基因
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金针菇尿嘧啶营养缺陷型菌株的筛选与分子鉴定 被引量:5
18
作者 卢绪志 万佳宁 +3 位作者 茅文俊 杨瑞恒 王瑞娟 鲍大鹏 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第3期495-503,共9页
选用对5–氟乳清酸(5-FOA)敏感的金针菇单核菌株‘DG1-1’作为供试菌株,对其原生质体采用功率为10 W的紫外光进行垂直距离15 cm照射12 s的诱变处理,利用含有5-FOA和尿嘧啶的筛选培养基筛选获得了3株稳定的尿嘧啶营养缺陷型突变菌株‘NG1... 选用对5–氟乳清酸(5-FOA)敏感的金针菇单核菌株‘DG1-1’作为供试菌株,对其原生质体采用功率为10 W的紫外光进行垂直距离15 cm照射12 s的诱变处理,利用含有5-FOA和尿嘧啶的筛选培养基筛选获得了3株稳定的尿嘧啶营养缺陷型突变菌株‘NG1-65’、‘NG1-92’和‘NG1-95’。通过对尿嘧啶合成代谢路径中的pyrF和pyrG基因的分子检测发现,‘NG1-65’菌株的pyr F基因第39位和40位碱基之间插入T,‘NG1-92’菌株的pyrG基因第236位碱基T突变为C,‘NG1-95’菌株的pyrF基因第104位碱基C突变为T,这些插入突变和点突变可能导致基因编码的蛋白功能失去活性,产生尿嘧啶营养缺陷型。金针菇尿嘧啶缺陷型菌株可以为金针菇遗传转化体系的构建提供材料。 展开更多
关键词 金针菇 尿嘧啶营养缺陷型 pyrF基因 pyrg基因
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植物乳杆菌及其近缘种部分看家基因的系统发育分析 被引量:2
19
作者 乌日拉嘎 徐海燕 +6 位作者 宋宇琴 冯淑贞 孙志宏 斯琴巴特尔 包英姝 张和平 孟和毕力格 《现代食品科技》 EI CAS 北大核心 2017年第1期100-105,共6页
本文研究了16S rRNA基因、pheS和pyr G部分基因序列对Lactobacillus plantarum(L.plantarum)及其近缘种的区分能力,采用分离自酸面团、酸牛奶和泡菜中的10株L.plantarum为研究对象,以其看家基因pheS和pyr G部分基因序列作为分子标记,结... 本文研究了16S rRNA基因、pheS和pyr G部分基因序列对Lactobacillus plantarum(L.plantarum)及其近缘种的区分能力,采用分离自酸面团、酸牛奶和泡菜中的10株L.plantarum为研究对象,以其看家基因pheS和pyr G部分基因序列作为分子标记,结合已上传至Gene Bank的近缘种的相应序列构建系统发育树并与以16S rRNA基因构建的系统发育树进行比较。结果表明:基于16S rRNA基因序列不能区分L.plantarum及其近缘种,而看家基因pheS和pyr G部分基因序列能够很好的区分植物乳杆菌种及其近缘种,其中,pheS在植物乳杆菌种内分型时相较于pyr G基因效果更好,以及将pheS和pyr G部分基因序列串联使用后,试验菌株与参考菌株的分类关系更加明晰,因此,联合基因(pheS-pyr G)可作为16S rRNA基因的辅助工具用于L.plantarum及近缘种和植物乳杆菌种内分型的快速分类鉴定。 展开更多
关键词 植物乳杆菌 系统发育分析 16S RRNA基因
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草酸青霉可重复利用筛选标记5'氟乳清酸的构建 被引量:1
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作者 苏丹 凌小翠 +1 位作者 秦秀林 冯家勋 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2021年第2期713-719,共7页
草酸青霉是纤维素酶高产真菌,也是科学研究的重要真菌之一。借助基因工程技术手段对工业真菌进行分子改造,可以有效提高菌株在工业生产中的经济效益,对工业菌株进行基因改造需要大量的筛选标记,目前草酸青霉中可用的筛选标记较少,因此... 草酸青霉是纤维素酶高产真菌,也是科学研究的重要真菌之一。借助基因工程技术手段对工业真菌进行分子改造,可以有效提高菌株在工业生产中的经济效益,对工业菌株进行基因改造需要大量的筛选标记,目前草酸青霉中可用的筛选标记较少,因此需要构建一个草酸青霉可重复利用筛选标记转化系统。本研究构建以乳清酸核苷-5’-磷酸脱羧酶基因(pyrG)作为选择标记,以草酸青霉pyrG缺失菌株为宿主菌构建转化系统。首先,构建了含有草酸青霉pyrG表达框及其终止子TT1重复序列的可重复利用pyrG筛选标记。然后,以pyrG筛选标记作为选择标记,以草酸青霉pyrG缺失菌株△ku70△pyrG(pyrG::kan)为受体菌株,敲除△ku70△pyrG(pyrG::kan)菌株中的kan基因,获得菌株△ku70△kan(kan::R-pyrG)。最后,利用筛选标记中的pyrG终止子重复序列发生自我剪切,利用氟乳清酸(5-FOA)的筛选,获得pyrG缺失,kan抗性基因缺失菌株△ku70△R-pyrG。本研究成功建立以pyrG为筛选标记,草酸青霉pyrG缺失菌株为受体菌的可重复利用筛选系统。 展开更多
关键词 草酸青霉 无筛选标记系统 pyrg 反向筛选
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