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WOMBAT—A tool for mixed model analyses in quantitative genetics by restricted maximum likelihood (REML) 被引量:44
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作者 MEYER Karin 《Journal of Zhejiang University-Science B(Biomedicine & Biotechnology)》 SCIE CAS CSCD 2007年第11期815-821,共7页
WOMBAT is a software package for quantitative genetic analyses of continuous traits, fitting a linear, mixed model; estimates of covariance components and the resulting genetic parameters are obtained by restricted ma... WOMBAT is a software package for quantitative genetic analyses of continuous traits, fitting a linear, mixed model; estimates of covariance components and the resulting genetic parameters are obtained by restricted maximum likelihood. A wide range of models, comprising numerous traits, multiple fixed and random effects, selected genetic covariance structures, random regression models and reduced rank estimation are accommodated. WOMBAT employs up-to-date numerical and computational methods. Together with the use of efficient compilers, this generates fast executable programs, suitable for large scale analyses. Use of WOMBAT is illustrated for a bivariate analysis. The package consists of the executable program, available for LINUX and WINDOWS environments, manual and a set of worked example, and can be downloaded free of charge from http://agbu. une.edu.au/-kmeyer/wombat.html 展开更多
关键词 SOFTWARE Variance components Genetic parameters Mixed model restricted maximum likelihood
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Stochastic Restricted Maximum Likelihood Estimator in Logistic Regression Model 被引量:2
2
作者 Varathan Nagarajah Pushpakanthie Wijekoon 《Open Journal of Statistics》 2015年第7期837-851,共15页
In the presence of multicollinearity in logistic regression, the variance of the Maximum Likelihood Estimator (MLE) becomes inflated. Siray et al. (2015) [1] proposed a restricted Liu estimator in logistic regression ... In the presence of multicollinearity in logistic regression, the variance of the Maximum Likelihood Estimator (MLE) becomes inflated. Siray et al. (2015) [1] proposed a restricted Liu estimator in logistic regression model with exact linear restrictions. However, there are some situations, where the linear restrictions are stochastic. In this paper, we propose a Stochastic Restricted Maximum Likelihood Estimator (SRMLE) for the logistic regression model with stochastic linear restrictions to overcome this issue. Moreover, a Monte Carlo simulation is conducted for comparing the performances of the MLE, Restricted Maximum Likelihood Estimator (RMLE), Ridge Type Logistic Estimator(LRE), Liu Type Logistic Estimator(LLE), and SRMLE for the logistic regression model by using Scalar Mean Squared Error (SMSE). 展开更多
关键词 LOGISTIC Regression MULTICOLLINEARITY Stochastic restricted maximum likelihood ESTIMATOR SCALAR Mean Squared Error
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MTDFREML法估计大白母猪繁殖性状的遗传参数 被引量:10
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作者 何俊 施启顺 +2 位作者 张达军 唐凡 柳小春 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期61-64,共4页
运用多性状非求导约束最大似然法(multiple traits derivative free restricted maximum likelihood,MTDFREML),对湖南正虹种猪场和益阳市农科所种猪场(益农种猪场)大白母猪1998-2004年的共7 736胎次的繁殖性状育种记录进行遗传参数估... 运用多性状非求导约束最大似然法(multiple traits derivative free restricted maximum likelihood,MTDFREML),对湖南正虹种猪场和益阳市农科所种猪场(益农种猪场)大白母猪1998-2004年的共7 736胎次的繁殖性状育种记录进行遗传参数估计.2个猪场繁殖母猪的总产仔数(TNB)、产活仔数(NBA)、初生窝重(LWB)和21日龄窝重(LW21)的遗传力分别为0.23,0.18,0.21,0.27,母体遗传效应占表型方差百分率为0.09~0.15,窝效应占表型方差百分率为0.08~0.38.繁殖性状间遗传相关为0.37~0.78,永久环境相关为0.80~0.93,表型相关为0.32~0.88. 展开更多
关键词 大白母猪 繁殖性状 多性状非求导约束最大似然法 遗传力 遗传相关
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阿拉善绒山羊繁殖性状加性效应和母体效应的方差分量估计
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作者 李宁 吴铁成 +4 位作者 赵术明 王涛 朱莉仙 赵生国 刘斌 《家畜生态学报》 北大核心 2024年第4期8-14,共7页
为了运用ASreml软件结合约束最大似然法(REML)估计阿拉善绒山羊初生重、出生窝重、断乳重、断乳窝重、产羔数和妊娠期的遗传参数,本研究收集了阿拉善绒山羊种羊场2017-2022年繁殖性状记录6517条,拟合了8种不同的单性状动物模型,通过LRT... 为了运用ASreml软件结合约束最大似然法(REML)估计阿拉善绒山羊初生重、出生窝重、断乳重、断乳窝重、产羔数和妊娠期的遗传参数,本研究收集了阿拉善绒山羊种羊场2017-2022年繁殖性状记录6517条,拟合了8种不同的单性状动物模型,通过LRT检验挑选出最佳模型,使用单性状模型对繁殖性状进行方差组分和遗传力估计,利用双性状模型分析繁殖性状之间的表型相关和遗传相关。结果显示:阿拉善白绒山羊初生重、出生窝重、断乳重、断乳窝重、产羔数和妊娠期的遗传力估计值分别为0.15±0.04、0.16±0.02、0.20±0.06、0.12±0.03、0.14±0.03和0.32±0.05。遗传相关系数的范围为-0.49~0.73,其中产羔数与出生窝重的遗传相关系数最高为0.73,与初生重遗传相关系数最低为-0.49。表型相关的范围为-0.50~0.65,其中断乳窝重与出生窝重的表型相关系数最高0.65,产羔数和初生重的表型相关系数最小-0.50。研究发现,阿拉善绒山羊繁殖性状属于低遗传力性状且不仅受群别、胎次等非遗传因素的影响,而且所有的性状均受到母体效应的影响;产羔数与其他繁殖性状之间具有较高的相关性表明基于产羔数的选择是有效的,可以提高母羊的整体繁殖性能,因此在实际生产过程中可通过提高饲养管理及营养水平来改善阿拉善绒山羊的繁殖性能。 展开更多
关键词 阿拉善绒山羊 繁殖性状 动物模型 约束最大似然法
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顾及RMLE的GNSS时序噪声特性及环境负载修正
5
作者 孙喜文 鲁铁定 +1 位作者 贺小星 黄佳慧 《导航定位学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期21-27,42,共8页
针对环境负载易对全球卫星导航系统(GNSS)站坐标时序修正前后噪声模型特性及其站速度造成影响的问题,提出一种顾及约束最大似然估计(RMLE)的GNSS时序噪声特性及环境负载修正方法:选用206个连续13a的GNSS站时间序列,采用改进的贝叶斯信... 针对环境负载易对全球卫星导航系统(GNSS)站坐标时序修正前后噪声模型特性及其站速度造成影响的问题,提出一种顾及约束最大似然估计(RMLE)的GNSS时序噪声特性及环境负载修正方法:选用206个连续13a的GNSS站时间序列,采用改进的贝叶斯信息模型估计准则,利用约束最大似然估计(RMLE)方法探讨和分析大气压负载、非海洋潮汐负荷、积雪负载及土壤水负载等环境负载对GNSS时序修正前后噪声模型特性及其站速度的影响。结果表明:经环境负载修正后,GNSS时序中的噪声主要表现为闪烁噪声+白噪声(FNWN)与幂律噪声+白噪声(PLWN),北(N)、东(E)、天(U)3个分量上噪声模型修正前后分别有约19.9%、36.5%、40.8%的噪声模型发生变化,N、E、U分量上分别有96.6%、84.5%、88.3%的测站速度不确定度减小,对垂直速度估计的最大影响可达0.5mm/a;证明环境负载修正能够提高速度估值的精度。 展开更多
关键词 时间序列 环境负载 约束最大似然估计(RMLE) 随机噪声特性分析
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ML法和REML法方差组分估计效率的Monte Carlo模拟研究 被引量:3
6
作者 王勇强 张沅 +1 位作者 张勤 张胜利 《黄牛杂志》 1998年第3期9-12,共4页
采用MonteCarlo模拟方法,研究了家系数目,家系大小,性状遗传力大小等3个因素在不同组合下,ML法和REML法方差组分估计的准确性。结果表明,在不考虑除均值之外其它固定效应的情况下,ML法的效率高于REML法。
关键词 ML法 reml 方差组分估计 最大似然法
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功能作图的混合效应模型开发
7
作者 王子健 叶梅霞 +1 位作者 张涵 邬荣领 《北京林业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期163-172,共10页
【目的】以大肠杆菌菌株丰度和功能作图模型为研究基础,通过在功能作图模型中引入群体的固定效应和个体间亲缘关系造成的随机效应,探究混合效应对功能作图模型性能的影响。【方法】本研究在功能定位框架基础上,使用大肠杆菌动态培养的... 【目的】以大肠杆菌菌株丰度和功能作图模型为研究基础,通过在功能作图模型中引入群体的固定效应和个体间亲缘关系造成的随机效应,探究混合效应对功能作图模型性能的影响。【方法】本研究在功能定位框架基础上,使用大肠杆菌动态培养的生长数据作为实际案例,将亚群和SNP基因型作为固定效应的来源,将固定效应因素融入定位模型,提出了Q矩阵模型的扩展;在保留使用方差–协方差模型对随机残差建模的前提下,使用Legendre模型对随机效应建模,开展了固定效应加一般性的随机效应的混合效应模型分析(模型1);利用限制性似然估计的方法推导其方差–协方差参数、随机效应和固定效应,开展了固定效应和亲缘关系造成随机效应的混合模型(模型2)分析;利用Zwald检验法推导各标记位点p值的计算方法。【结果】(1)2种模型中,95%的标记呈现出p值与期望值相吻合的特点,p值分布在QQ图中的上翘结果满意。(2)模型2相比模型1检测到了更多的SNP位点,表明模型2对亲缘关系造成的随机效应解释性更强。(3)计算机模拟结果显示:样本量较小、遗传力较低时,模型假阳性率为4.77%;当样本量为800,遗传力为1%时,模型对QTL的发现率可超过70%;或当样本量为400,遗传力超过1.5%时,QTL发现率也可超过70%。【结论】本研究提出的在功能作图模型中引入固定效应和亲缘关系造成的随机效应的混合模型的方法较好地完善了功能定位理论,对固定效应中的协变量因素具有较好的校正功能,可有效剖分随机效应与剩余残差;为后续完善功能定位,开发固定效应加亲缘关系(Q+K)模型的软件包奠定了良好基础。 展开更多
关键词 功能作图 关联分析 混合效应 限制性最大似然估计 数量性状位点
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REML法和Bayesian法对小样本不平衡单因素随机效应模型方差成分估计的模拟比较分析 被引量:4
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作者 董沾健 赵耐青 林燧恒 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2009年第1期35-37,40,共4页
目的比较限制性极大似然估计(REML)法和贝叶斯法(Bayesian)对小样本不平衡单因素随机效应模型方差成分估计的偏差和精密度,同时考虑在样本量的大小、单位的数量和单位内相关系数(ICC)的大小不同的情况下对方差成分估计的精确程度的影响... 目的比较限制性极大似然估计(REML)法和贝叶斯法(Bayesian)对小样本不平衡单因素随机效应模型方差成分估计的偏差和精密度,同时考虑在样本量的大小、单位的数量和单位内相关系数(ICC)的大小不同的情况下对方差成分估计的精确程度的影响。方法通过计算机模拟7组不同设计的数据集,用SAS软件MIXED模块进行方差成分估计。结果不同的设计中,REML法估计比Bayesian法估计更加接近真值,但Bayesian法对组间方差的区间估计更加精密。对于两种方法而言,样本和单位数量的增加,估计结果更加准确。组内方差的估计,比组间方差的估计更准确和精密。结论对小样本不平衡结构数据,当ICC为小或中等时,REML估计比Bayesian估计的偏差和均方误差要小,推荐使用。但是Bayesian法的区间估计比REML法的区间估计更加精密。 展开更多
关键词 不平衡单因素随机效应模型 方差成分 限制性极大似然 贝叶斯
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Estimation and Testing for the Parameters of AR(p)-ARCH(q) under Ordered Restriction
9
作者 王德辉 宋立新 +1 位作者 史宁中 李荣华 《Northeastern Mathematical Journal》 CSCD 2004年第4期379-382,共4页
Suppose that the time series Xt satisfieswhere α0≥δ>0,αi≥0 for i=1,2,…,q;βi,i=1,…,p, are real numbers; p and q are the order of the model. The sequence {ξt};(0,1) and is independent of {hs,s≤t} for fixed ... Suppose that the time series Xt satisfieswhere α0≥δ>0,αi≥0 for i=1,2,…,q;βi,i=1,…,p, are real numbers; p and q are the order of the model. The sequence {ξt};(0,1) and is independent of {hs,s≤t} for fixed t. The above model is usually written as AR(p)-ARCH(q).We consider stationary series AR(p)-ARCH(q) model and assume the stationary field is θ0. We express this statement asH1:α1≥α2…≥αq,β1≥β2≥…≥βp and we consider an order restricted testing problem, which is to testH0:α1=α2=…=αq,β1=β2=…=βpagainst H1-H0. We derive the likelihood ratio (LR) test statistic and its asymptotic distri- 展开更多
关键词 AR(p)-ARCH(q) model ordered restriction maximum likelihood estimator asymptotic properties quadratic program
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Estimation and Testing for the Parameters of AR(p)-ARCH(q) under Ordered Restriction
10
作者 王德辉 宋立新 史宁中 《Northeastern Mathematical Journal》 CSCD 2005年第4期475-491,共17页
In this paper, we study a stationary AR(p)-ARCH(q) model with parameter vectors α and β. We propose a method for computing the maximum likelihood estimator (MLE) of parameters under the nonnegative restriction... In this paper, we study a stationary AR(p)-ARCH(q) model with parameter vectors α and β. We propose a method for computing the maximum likelihood estimator (MLE) of parameters under the nonnegative restriction. A similar method is also proposed for the case that the parameters are restricted by a simple order: α1≥α2≥…≥αq and β1≥β2≥…≥βp. The strong consistency of the above two estimators is discussed. Furthermore, we consider the problem of testing homogeneity of parameters against the simple order restriction. We give the likelihood ratio (LR) test statistic for the testing problem and derive its asymptotic null distribution. 展开更多
关键词 AR(p)-ARCH(q) model ordered restriction maximum likelihood estimator asymptotic properties quadratic program
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Quadratic Loss of Isotonic Normal Means under Simultaneous Order Restrictions
11
作者 马艳萍 史宁中 《Northeastern Mathematical Journal》 CSCD 2002年第3期245-253,共9页
For two normal populations with unknown means μ and unknown variances σ2, assume that there are simple order restrictions among the means and variances: μ1 < μ2 and σ12 >σ22 > 0. This case is said to be... For two normal populations with unknown means μ and unknown variances σ2, assume that there are simple order restrictions among the means and variances: μ1 < μ2 and σ12 >σ22 > 0. This case is said to be simultaneous order restriction by Shi (Maximum likelihood estimation of means and variances from normal populations under simultaneous order restrictions, J. Multivariate Anal., 50(1994), 282-293.) and an iterative algorithm of computing the order restricted maximum likelihood estimates of μi and σi2 was given in that paper. This paper shows that the restricted maximum likelihood estimate of μi has smaller mean square loss than the usual estimate xi under some conditions. 展开更多
关键词 isotonic regression mean square loss restricted maximum likelihood estimate
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Maximum Likelihood Estimation of Ratios of Means and Standard Deviations from Normal Populations with Different Sample Numbers under Semi-Order Restriction
12
作者 史海芳 李树有 姬永刚 《Journal of Mathematical Research and Exposition》 CSCD 北大核心 2008年第4期1031-1036,共6页
For two normal populations with unknown means μi and variances σi2 > 0, i = 1,2, assume that there is a semi-order restriction between ratios of means and standard deviations and sample numbers of two normal popu... For two normal populations with unknown means μi and variances σi2 > 0, i = 1,2, assume that there is a semi-order restriction between ratios of means and standard deviations and sample numbers of two normal populations are different. A procedure of obtaining the maximum likelihood estimators of μi’s and σi’s under the semi-order restrictions is proposed. For i = 3 case, some connected results and simulations are given. 展开更多
关键词 semi-order restriction maximum likelihood estimator likelihood function PAVA algorithm.
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不同牙鲆群体遗传力和育种值分析 被引量:9
13
作者 刘峰 陈松林 +4 位作者 王磊 田永胜 刘寿堂 孙德强 邓寒 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期691-697,共7页
以牙鲆(Paralichthys olivaceus)抗病群体(RS)、RS(♂)与从日本引进的日本群体(♀)交配建立的群体(RJ)、日本群体(♂)与RS(♀)交配建立的群体(JR)、以及韩国群体(KS)为基础群体,通过随机交配建立牙鲆家系,研究了4个群体作为亲本的育种... 以牙鲆(Paralichthys olivaceus)抗病群体(RS)、RS(♂)与从日本引进的日本群体(♀)交配建立的群体(RJ)、日本群体(♂)与RS(♀)交配建立的群体(JR)、以及韩国群体(KS)为基础群体,通过随机交配建立牙鲆家系,研究了4个群体作为亲本的育种性能。待所建立的家系生长至19月龄左右时,测量家系生长性状,包括全长和体质量,测量所得数据用SPSS及DMU软件中的REML算法和BLUP方法进行分析。结果显示,从表型参数可以看出KS(♂)×RJ(♀)杂交后代表现出明显的生长优势。19月龄牙鲆全长和体质量的遗传力分别为0.301、0.295,都属于中等遗传力。因此,牙鲆群体具有较好的遗传改良潜力。全长、体质量育种值与其表型值的相关系数分别为0.838和0.827,且呈极显著相关(P<0.01),表明个体育种值的预测结果具有较高的准确性。对父母本分别进行育种值比较可知,父本中KS的育种值最高,母本中RJ的育种值最高,因此选用KS(♂)和RJ(♀)杂交可培育出生长迅速的牙鲆新品种。本研究通过比较4个资源群体牙鲆生长性状的育种性能,并以此作为筛选优良亲本群体的重要依据,旨在为牙鲆新品种的成功选育奠定理论基础,同时为牙鲆的进一步遗传改良提供重要的科学依据。 展开更多
关键词 牙鲆 遗传力 育种值 约束极大似然法(BLUP) 最佳线性无偏预测(REM)
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九孔鲍(Haliotis diversicolor supertexta)耐低盐与生长性状的遗传参数评估 被引量:13
14
作者 蒋湘 刘建勇 赖志服 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期104-109,542,共6页
采用不平衡巢式设计方法和人工授精技术,1个雄九孔鲍(Haliotis diversicolor supertexta)配3个雌九孔鲍,建立12个半同胞家系和36个全同胞家系,各家系养殖240d后统计每个家系生长性状,并分别从所建立36家系中随机选取40个稚鲍,在盐度16... 采用不平衡巢式设计方法和人工授精技术,1个雄九孔鲍(Haliotis diversicolor supertexta)配3个雌九孔鲍,建立12个半同胞家系和36个全同胞家系,各家系养殖240d后统计每个家系生长性状,并分别从所建立36家系中随机选取40个稚鲍,在盐度16下进行耐盐实验,48h后统计各个家系的存活率,应用约束最大似然法(Restricted Maximum Likelihood Method,REML)估算九孔鲍体重,壳宽,壳长与耐低盐性状的遗传参数。结果表明,九孔鲍稚鲍在240日龄时,壳长、壳宽和体重遗传力为中等遗传力,估计值分别为0.18±0.04,0.13±0.06,0.18±0.15;耐低盐性状遗传力较低,估计值为0.056±0.022,48h家系的平均存活率为0.44±0.23。壳长,壳宽,体重与耐低盐性状的表型相关与遗传相关系数分别为?0.04—?0.156和?0.03—0.14,呈负相关关系,检验不显著。结果证明,对九孔鲍生长性状与耐低盐性状进行改良时,可采用复合育种技术,以加快育种进程。 展开更多
关键词 九孔鲍 生长性状 性状遗传力 遗传参数估计 数量性状 参数评估 半同胞家系 存活率 低盐 全同胞家系
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滑动邻域克里金插值法的改进 被引量:12
15
作者 牛文杰 朱大培 陈其明 《计算机辅助设计与图形学学报》 EI CSCD 北大核心 2001年第8期752-756,共5页
在分析了原滑动邻域克里金插值法存在的不足之后 ,提出了在插值过程中利用多元逐步回归方法确定待插点邻域内区域化变量的漂移次数 ,利用三角网格剖分后的节点数据结构 ,快速搜索局部邻域内的已知点 ,变异函数参数的求取采用受限最大似... 在分析了原滑动邻域克里金插值法存在的不足之后 ,提出了在插值过程中利用多元逐步回归方法确定待插点邻域内区域化变量的漂移次数 ,利用三角网格剖分后的节点数据结构 ,快速搜索局部邻域内的已知点 ,变异函数参数的求取采用受限最大似然法的改进方法 .应用实例的效果表明 ,改进的滑动邻域克里金插值法优于原方法 . 展开更多
关键词 滑动邻域克里金插值 科学计算可视化 三角网格剖分 计算机图形学
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正态总体均值与标准差比在树序约束下的最大似然估计 被引量:3
16
作者 李树有 史宁中 赵世舜 《吉林大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期893-897,共5页
考虑3个正态总体均值和方差都是未知参数及所取的3个正态总体样本数不等时,均值和标准差的比在树序约束下的极大似然估计.根据PAVA算法的思想,给出了均值和标准差的比在树序约束下的极大似然估计的计算方法.
关键词 半序约束 树序约束 最大似然估计 似然函数 PAVA算法
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锥序约束下两个指数总体均值的估计 被引量:3
17
作者 赵世舜 王德辉 宋立新 《吉林大学自然科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第3期1-6,共6页
讨论样本容量相等时 ,在锥序约束 a1λ1≤λ2 ≤a2 λ1条件下 ,两个指数总体均值 λi( i=1 ,2 )的估计量 .证明约束极大似然估计 λi 具有比经典极大似然估计 Xi 更小的均方误差 ,并且讨论 λi 对 Xi的功效 e( λi,Xi) ,i=1... 讨论样本容量相等时 ,在锥序约束 a1λ1≤λ2 ≤a2 λ1条件下 ,两个指数总体均值 λi( i=1 ,2 )的估计量 .证明约束极大似然估计 λi 具有比经典极大似然估计 Xi 更小的均方误差 ,并且讨论 λi 对 Xi的功效 e( λi,Xi) ,i=1 ,2 . 展开更多
关键词 锥序约束 均方误差 功效 约束极大似然估计 样本均值
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数据非随机缺失机制的混合效应模式混合模型分析与应用 被引量:5
18
作者 季家超 王刚 +1 位作者 张潇雅 刘桂芬 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2013年第2期221-225,共5页
目的阐明混合效应模式混合模型原理,实现数据非随机缺失机制医学纵向资料的模型分析。方法采用限制极大似然法进行参数估计,拟合含非随机缺失数据高血压随访资料的混合效应模式混合模型,利用SAS9.2完成模型参数估计与检验等。结果在混... 目的阐明混合效应模式混合模型原理,实现数据非随机缺失机制医学纵向资料的模型分析。方法采用限制极大似然法进行参数估计,拟合含非随机缺失数据高血压随访资料的混合效应模式混合模型,利用SAS9.2完成模型参数估计与检验等。结果在混合效应模式混合模型(组间模型和组内模型)中得到四种缺失模式下的参数估计值及可信区间后,根据各缺失模式概率,求得参数总估计值。结论混合效应模式混合模型是分析数据非随机缺失机制资料的最佳选择。 展开更多
关键词 数据缺失 非随机缺失 混合效应模式混合模型 限制极大似然估计
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用随机回归模型估计SD-Ⅱ系猪体重的遗传和表型协方差函数 被引量:3
19
作者 刘文忠 周忠孝 张沅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第2期119-123,共5页
用6个世代的686头SD-Ⅱ系猪的生长记录估计作为经度数据的体重的遗传和表型协方差函数。配合将年龄的勒让德多项式作为自变量的随机回归模型,用平均信息约束最大似然(AIREML)法估计回归系数间的协方差,从而得到加性遗传和永久环境协... 用6个世代的686头SD-Ⅱ系猪的生长记录估计作为经度数据的体重的遗传和表型协方差函数。配合将年龄的勒让德多项式作为自变量的随机回归模型,用平均信息约束最大似然(AIREML)法估计回归系数间的协方差,从而得到加性遗传和永久环境协方差函数的系数。结果表明,协方差函数可以反映出体重在连续的年龄尺度上的遗传和表型变异。当多项式的配合阶数k=3,即降阶配合时,便可充分描述SD-Ⅱ系猪体重的生长变化。降价配合涉及的参数较少,同时可以缓和协方差估值间的差异。 展开更多
关键词 SD-Ⅱ系猪 协方差函数 经度数据 约束最大似然法 随机回归模型 体重 遗传 表型
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考力代羊生长性状的协方差函数估计 被引量:4
20
作者 李秀丽 刘宝凤 +4 位作者 乔利英 杨菊凤 张善芝 徐相亭 刘文忠 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2015年第1期167-171,共5页
试验旨在模拟考力代羊生长过程中的遗传和表型变异,为其选种提供一定的依据。用1 269只考力代羊的3 332个生长发育记录,配合自变量为年龄的勒让德多项式的随机回归模型(RRM),其中个体加性遗传效应配合5阶,母体永久环境效应配合2~5阶,... 试验旨在模拟考力代羊生长过程中的遗传和表型变异,为其选种提供一定的依据。用1 269只考力代羊的3 332个生长发育记录,配合自变量为年龄的勒让德多项式的随机回归模型(RRM),其中个体加性遗传效应配合5阶,母体永久环境效应配合2~5阶,对数约束最大似然值和信息标准用来检测最佳配合阶数。用平均信息约束最大似然(AIREML)法来估计体重的遗传、环境和表型协方差函数,结果表明,母体永久环境效应配合4阶时,协方差图更符合考力代羊的生长变化情况,涉及的参数也较少,且羔羊在6月龄前后表现出较大的遗传和表型变异。这些结果提示随机回归模型在有限的数据下能够充分描述考力代羊体重在连续时间轴上的增长变化情况。 展开更多
关键词 考力代羊 经度数据 协方差函数 随机回归模型 平均信息约束似然法
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