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大豆粒形性状QTL的精细定位 被引量:13
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作者 牛远 谢芳腾 +5 位作者 布素红 谢尚潜 韩世凤 耿青 刘兵 章元明 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第4期609-616,共8页
在溧水中子黄豆×南农493-1衍生的504个F2:6家系中选择Satt331~Satt592目标区间7个杂合单株和168个重组单株,衍生成356株RHL-F2个体(群体Ⅰ)和168个重组体家系(群体Ⅱ)。群体Ⅱ来自142个F2:6家系,若每个F2:6家系只保留1个重组家系... 在溧水中子黄豆×南农493-1衍生的504个F2:6家系中选择Satt331~Satt592目标区间7个杂合单株和168个重组单株,衍生成356株RHL-F2个体(群体Ⅰ)和168个重组体家系(群体Ⅱ)。群体Ⅱ来自142个F2:6家系,若每个F2:6家系只保留1个重组家系则构成群体Ⅲ。采用lasso和复合区间作图(CIM)法检测3个群体粒形性状2种指标的QTL。结果表明,lasso法检测到的粒长关联标记是O19和S21/Satt331,而CIM检测到的QTL区间是S21~S22和O23~O19;lasso法检测到的粒宽关联标记是O19/O21,而CIM检测到的QTL区间是O23~O19/O19~O21;长宽比与S21~S22关联是由于粒长QTL引起的,与O23~O19/O19~O21关联是由于粒长和粒宽QTL引起的。将原Satt331~Satt592目标区间的粒长QTL剖分为与标记S21~S22和O23~O19/O19~O21关联的2个多效性QTL。根据大豆基因注释数据库,Glyma10g35240和Glyma10g34980可能是控制粒形性状发育的候选基因。 展开更多
关键词 大豆 粒形 数量性状基因座 精细定位 候选基因
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大豆粒形性状主效QTL、环境互作和上位性检测 被引量:7
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作者 梁慧珍 余永亮 +6 位作者 杨红旗 张海洋 董薇 杜华 崔暐文 刘学义 方宣钧 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第24期5081-5088,共8页
【目的】定位大豆粒形性状的主效QTL、环境互作和QTL间上位性。【方法】以栽培大豆晋豆23为母本,半野生大豆灰布支黑豆(ZDD2315)为父本所衍生的447个RIL构建的SSR遗传图谱及混合线性模型分析方法,对3年大豆粒形性状进行主效QTL、环境互... 【目的】定位大豆粒形性状的主效QTL、环境互作和QTL间上位性。【方法】以栽培大豆晋豆23为母本,半野生大豆灰布支黑豆(ZDD2315)为父本所衍生的447个RIL构建的SSR遗传图谱及混合线性模型分析方法,对3年大豆粒形性状进行主效QTL、环境互作和QTL间上位性检测。【结果】共检测到7个与粒长、粒宽、粒厚以及长宽比、长厚比和宽厚比相关的QTL,分别位于D2、C2、J_2和O连锁群上,其中粒长、长厚比和宽厚比均表现为遗传正效应,说明增加其等位基因来源于母本晋豆23。同时,检测到3对影响粒宽和宽厚比的加性×加性上位性互作效应及其与环境互作的QTL。【结论】主效QTL对粒形性状遗传产生的影响最大,上位性次之,环境互作最小,说明加性效应、加性×加性上位性互作是大豆粒形性状的重要遗传基础。 展开更多
关键词 大豆 粒形 QTL与环境互作 上位性 混合线性模型
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大豆籽粒大小与形状性状的QTL定位 被引量:4
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作者 陈强 闫龙 +4 位作者 邓莹莹 肖二宁 刘兵强 杨春燕 张孟臣 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1309-1318,共10页
大豆籽粒大小和粒形性状不仅与产量和外观品质紧密相关,还对机械化播种有着一定的影响。本研究采用大粒栽培品种冀豆12与小粒半野生地方品种黑豆(ZDD03651)杂交衍生的包含188个重组自交系的F6:8和F6:9群体为材料,对粒长、粒宽、粒... 大豆籽粒大小和粒形性状不仅与产量和外观品质紧密相关,还对机械化播种有着一定的影响。本研究采用大粒栽培品种冀豆12与小粒半野生地方品种黑豆(ZDD03651)杂交衍生的包含188个重组自交系的F6:8和F6:9群体为材料,对粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比和宽厚比的遗传结构进行分析,并分别以Win QTLCart 2.5、QTLNetwork2.1和Ici Mapping 4.1 3种模型对以上性状的加性效应QTL,QE互作效应及上位性互作效应进行检测。6个性状的广义遗传率介于64.01%~79.57%,遗传力较高,且除粒厚外的其他性状受环境影响显著。共定位到加性效应QTL 38个,单个QTL的贡献率介于2.21%~10.71%之间,分布在12条染色体的17个标记区间内,且12个染色体区段至少与2种性状相关。两种及以上模型同时检测到的QTL有24个,3种模型均能检测到的QTL共8个,分别为qSL-17-1、qSL-18-1、qSW-6-1、qST-2-1、qST-6-1、qSLT-2-2、qSWT-2-1和qSWT-20-1。检测到7对上位性互作QTL,分别涉及粒长、粒宽、长宽比、长厚比和宽厚比,互作效应贡献率介于0.78%~6.20%之间。QE互作效应贡献率均较低,介于0.0005%~0.3900%之间。以多种模型同时检测结果准确性较高,可为分子标记辅助育种工作提供可靠理论基础。 展开更多
关键词 大豆 粒形 QTL 上位性互作
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利用Bayes分层广义线性模型剖析大豆籽粒性状的遗传基础 被引量:4
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作者 闫宁 谢尚潜 +6 位作者 耿青春 徐宇 李广军 刘兵 汪霞 李其刚 章元明 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期258-268,共11页
以溧水中子黄豆(P1)和南农493-1(P2)组合的504个正反交F2:3~F2:7家系群体为材料, 调查大豆粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比、宽厚比和百粒重性状在2007—2011年的表型观测值, 扫描F2群体SSR分子标记信息, 用Bayes分层广义线性... 以溧水中子黄豆(P1)和南农493-1(P2)组合的504个正反交F2:3~F2:7家系群体为材料, 调查大豆粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比、宽厚比和百粒重性状在2007—2011年的表型观测值, 扫描F2群体SSR分子标记信息, 用Bayes分层广义线性模型方法检测了上述性状的主效QTL、QTL′环境(QE)互作、QTL′细胞质(QC)互作和QTL′QTL(QQ)互作。共检测到89个主效QTL、33对QE、20对QC和35对QQ互作。上述7个性状的主效QTL分别有7、10、10、19、19、17和7个; QQ互作分别有1、10、6、0、6、9和3对, 没有检测到显性′显性互作; QE互作分别有5、7、6、3、6、2和4对; QC互作分别有2、1、3、8、4、2和0对。主效、QQ互作、QC互作和QE互作QTL的总贡献率分别为12.42%~61.79%、0~23.21%、0.35%~1.51%和0~14.16%, 表明主效QTL贡献最大, QQ互作次之, QE互作最小。各类QTL都有一因多效现象, 同一基因座可通过不同方式影响性状表达。这些结果揭示了大豆粒形性状的遗传基础, 为标记辅助育种提供了参考信息。 展开更多
关键词 大豆 籽粒大小和形状 上位性 主效QTL QTL×环境互作 QTL×细胞质互作 Bayes分层广义线性模型
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普通菜豆籽粒大小与形状的QTL定位 被引量:1
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作者 耿庆河 王兰芬 +1 位作者 武晶 王述民 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期1149-1160,共12页
普通菜豆是世界上最重要的食用豆类作物之一,其籽粒大小和形状与产量及外观品质密切相关。本研究以来自安第斯基因库的大粒品种龙270709和来自中美基因库的小粒品种F5910配置杂交组合,获得的F2分离群体分别在哈尔滨大田与北京昌平温室种... 普通菜豆是世界上最重要的食用豆类作物之一,其籽粒大小和形状与产量及外观品质密切相关。本研究以来自安第斯基因库的大粒品种龙270709和来自中美基因库的小粒品种F5910配置杂交组合,获得的F2分离群体分别在哈尔滨大田与北京昌平温室种植,对百粒重、粒长、粒宽、粒厚、长宽比和长厚比6个籽粒性状进行了相关性分析和QTL定位。相关性分析表明,百粒重与粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比5个衡量籽粒大小和形状的性状均显著正相关。利用基于完备区间作图方法的Ici Mapping 4.1进行QTL定位,哈尔滨环境下定位到38个与百粒重、粒长、粒宽、粒厚、长宽比、长厚比相关的QTL,表型贡献率介于2.39%~17.37%之间,分布在除第1染色体外的其余10条染色体上;北京昌平环境下定位到21个上述性状的QTL,表型贡献率介于5.92%~22.53%之间,分布在第1、第3、第6、第7、第8、第9和第11染色体上。其中,百粒重QTLSW7与SW7’,SW6.1与SW6’,粒长QTLSL6.1与SL6.1’,粒厚QTLSH11与SH11’在2个环境下的标记区间重叠或者重合,SW7、SW6.1、SL6.1、SW6’和SL6.1’的表型贡献率在10%以上。 展开更多
关键词 普通菜豆 籽粒大小 粒形 数量性状位点(QTL)
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Genome-wide Association Analyses Reveal the Genetic Basis of Stigma Exsertion in Rice 被引量:19
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作者 Hao Zhou Pingbo Li WeiboXie Saddam Hussain Yibo Li Duo Xia Hu Zhao Shengyuan Sun Junxiao Chen Hong Ye Jun Hou Da Zhao Guanjun Gao Qinglu Zhang Gongwei Wang Xingming Lian Jinghua Xiao Sibin Yu Xianghua Li Yuqing He 《Molecular Plant》 SCIE CAS CSCD 2017年第4期634-644,共11页
Stigma exsertion, a key determinant of the rice mating system, greatly contributes to the application of heterosis in rice. Although a few quantitative trait loci associated with stigma exsertion have been fine map- p... Stigma exsertion, a key determinant of the rice mating system, greatly contributes to the application of heterosis in rice. Although a few quantitative trait loci associated with stigma exsertion have been fine map- ped or cloned, the underlying genetic architecture remains unclear. We performed a genome-wide associ- ation study on stigma exsertion and related floral traits using 6.5 million SNPs characterized in 533 diverse accessions of Oryza sativa. We identified 23 genomic loci that are significantly associated with stigma exsertion and related traits, three of which are co-localized with three major grain size genes GS3, GW5, and GW2. Further analyses indicated that these three genes affected the stigma exsertion by controlling the size and shape of the spikelet and stigma. Combinations of GS3 and GW5 largely defined the levels of stigma exsertion and related traits. Selections of these two genes resulted in specific distributions of floral traits among subpopulations of O. sativa. The low stigma exsertion combination gw5GS3 existed in half of the cultivated rice varieties; therefore, introducing the GW5gs3 combination into male sterile lines is of high potential for improving the seed production of hybrid rice. 展开更多
关键词 stigma exsertion GWAS hybrid seed production floral traits grain shape RICE
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