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A Study of the Impact of the Dissemination of Ancient Chinese Primer Classic in the United States
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作者 RONG Jianting REN Xiaofei 《Cultural and Religious Studies》 2023年第3期136-141,共6页
Carrying the roots of Chinese civilization to its origins,the Chinese Primer classic has received considerable attention in the international community’s cultural diffusion.The spread of the Chinese Primer class stud... Carrying the roots of Chinese civilization to its origins,the Chinese Primer classic has received considerable attention in the international community’s cultural diffusion.The spread of the Chinese Primer class studies in the United States,aided by missionaries such as E.C.Bridgeman,Samuel Wells Williams,and William Alexander Parsons Martin,sinologists such as Witter Bynner and David Hinton,has been characterized by unidirectionality,permeability,and pluralism. 展开更多
关键词 AMERICA missionaries sinologists the Chinese primer classic
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笋用林3种竹笋夜蛾多重PCR鉴定技术的建立与应用
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作者 耿显胜 赵誉霞 +3 位作者 贾小琦 彭嫔嫔 张威 舒金平 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第10期86-93,共8页
【目的】建立鉴定竹笋夜蛾物种的多重PCR技术,用于浙江省笋用竹的3种竹笋夜蛾幼虫的物种鉴定。【方法】针对COI基因的变异区设计物种特异性多重PCR引物;优化影响多重PCR反应的参数,建立鉴定竹笋夜蛾的多重PCR技术;采用标准DNA模板评价多... 【目的】建立鉴定竹笋夜蛾物种的多重PCR技术,用于浙江省笋用竹的3种竹笋夜蛾幼虫的物种鉴定。【方法】针对COI基因的变异区设计物种特异性多重PCR引物;优化影响多重PCR反应的参数,建立鉴定竹笋夜蛾的多重PCR技术;采用标准DNA模板评价多重PCR技术的敏感性和特异性;利用多重PCR技术对林间采集的竹笋夜蛾幼虫进行物种鉴定。【结果】针对3种竹笋夜蛾COI基因的变异区设计了3条物种特异性多重PCR引物,与通用引物LCO1490配合使用,扩增竹笋基夜蛾、竹笋禾夜蛾和笋秀夜蛾COI基因片段,大小分别为290、390和590 bp。优化后的多重PCR鉴定技术的反应体系为:2×HotStart Taq PCR预混试剂10μL,10μmol·L^(-1)的引物LCO1490、JYE290、HYE390和QTYE590各0.5μL,DNA模板1μL,加ddH2O补足20μL。优化后的多重PCR鉴定技术的反应条件为:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,59℃退火30 s,72℃延伸30 s;72℃下延伸10 min,循环数为35。多重PCR鉴定技术对笋秀夜蛾的最低检出限为0.01 ng·μL^(-1),对竹笋禾夜蛾和竹笋基夜蛾的最低检出限低于0.001 ng·μL^(-1)。林间样品鉴定结果表明,所有38份DNA都能扩增出明显的特异性条带,鉴定成功率100%;经测序验证,本研究的技术鉴定的物种与经COI基因序列鉴定的物种一致。【结论】研究建立了浙江省笋用竹的夜蛾的多重PCR鉴定技术,能够快速高效鉴定浙江省笋用林内竹笋夜蛾幼虫的物种,该技术具有鉴定周期短、灵敏度高、特异性强、准确度高等优点。 展开更多
关键词 雷竹 夜蛾 引物 多重PCR DNA条形码
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国产飞机蒙皮底漆工艺适应性研究
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作者 步明升 汪威 +7 位作者 薛玉华 阮润琦 张岩 张彪 崔少波 刘顺崎 刘超 郭年华 《合成材料老化与应用》 CAS 2024年第1期12-15,共4页
为了验证国产飞机蒙皮底漆的工艺适应性,从壶装寿命、基材适用性、固化性能、底漆相容性以及面漆相容性等方面对该底漆展开了工艺研究。经过验证,国产飞机蒙皮底漆工艺性能够很好地适应现有民机材料施工要求。试验结果可以为该底漆的涂... 为了验证国产飞机蒙皮底漆的工艺适应性,从壶装寿命、基材适用性、固化性能、底漆相容性以及面漆相容性等方面对该底漆展开了工艺研究。经过验证,国产飞机蒙皮底漆工艺性能够很好地适应现有民机材料施工要求。试验结果可以为该底漆的涂装工艺提供施工技术指导,具有重要的工程实践意义。 展开更多
关键词 蒙皮底漆 适应性 工艺研究 附着力 国产
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基于转录组测序的浙江楠EST-SSR分子标记开发
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作者 郑永杰 廖枝锋 +3 位作者 刘新亮 张月婷 涂白连 伍艳芳 《南方林业科学》 2024年第5期8-12,共5页
浙江楠是我国重要的珍稀濒危植物,开展浙江楠SSR位点分布特征及分子标记开发,可为浙江楠的资源评价和保护利用提供科学依据。研究基于高通量测序技术获得浙江楠转录组数据,利用生物信息学方法分析浙江楠转录组SSR位点,开发浙江楠SSR分... 浙江楠是我国重要的珍稀濒危植物,开展浙江楠SSR位点分布特征及分子标记开发,可为浙江楠的资源评价和保护利用提供科学依据。研究基于高通量测序技术获得浙江楠转录组数据,利用生物信息学方法分析浙江楠转录组SSR位点,开发浙江楠SSR分子标记。结果表明,在浙江楠转录组中共获得116 582个SSR位点,SSR的发生频率为42.38%,平均距离为1.56 kb。浙江楠SSR位点以单核苷酸(63.42%)和二核苷酸重复(25.58%)为主,核苷酸优势基元优势重复基元排前三位的是A/T、AG/CT、AT/AT;SSR重复基元以10~20次重复为主,占总数的64.3%;SSR序列长度在10~646 bp之间,超过20 bp的SSR位点占SSR总数的29.05%,表明浙江楠转录组SSR位点具有较高的多态性。挑选96对SSR引物进行多态性检测,72对引物能够扩增出条带,扩增成功率为75%,最终开发到35对引物在浙江楠可检测到较高的遗传变异,丰富了楠属现有SSR分子标记。 展开更多
关键词 浙江楠 SSR重复类型 引物开发 转录组 遗传多样性
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应用PRIMER软件进行浮游植物群落结构的多元统计分析 被引量:30
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作者 吴荣军 李瑞香 +2 位作者 朱明远 郑家声 郑有飞 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期316-321,共6页
根据青岛近海进行的一次添加营养盐的围隔实验数据,采用专业软件PRIMER中的多元统计分析方法,进行了浮游植物群落结构的变化研究。结果表明,虽然由于本实验中浮游植物的生长受到Si的限制,硅藻类群不占明显的优势,使得优势种随时间的变... 根据青岛近海进行的一次添加营养盐的围隔实验数据,采用专业软件PRIMER中的多元统计分析方法,进行了浮游植物群落结构的变化研究。结果表明,虽然由于本实验中浮游植物的生长受到Si的限制,硅藻类群不占明显的优势,使得优势种随时间的变化不明显,没有出现明显的群落演替,但用PRIMER软件的聚类分析(Clustering)和多维尺度转换排序(MDS)分析表明,添加营养盐后浮游植物群落结构有较明显的变化,同时,PRIMER软件的相异系数(ANOSIM)分析也表明,在同时添加N、P的围隔内,浮游植物群落结构变化较只添加P的围隔中的变化显著。这显示了PRIMER软件在分析浮游植物群落结构变化和评价水域富营养化中的应用前景。 展开更多
关键词 primer 浮游植物 群落结构 多元统计
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燕麦全基因组SSR位点鉴定及多态性标记开发 被引量:1
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作者 陈凯凌 武涛 +4 位作者 徐逸群 高佳 张美俊 李欣 贾举庆 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期120-129,共10页
【目的】了解燕麦基因组SSR位点分布情况并开发燕麦全基因组SSR标记,为燕麦皮裸基因克隆、遗传图谱构建、群体多样性分析等提供科学的参考依据。【方法】利用已公布的“三分三”裸燕麦参考基因组,通过TBtools软件对燕麦全基因组的SSR位... 【目的】了解燕麦基因组SSR位点分布情况并开发燕麦全基因组SSR标记,为燕麦皮裸基因克隆、遗传图谱构建、群体多样性分析等提供科学的参考依据。【方法】利用已公布的“三分三”裸燕麦参考基因组,通过TBtools软件对燕麦全基因组的SSR位点进行检索并利用EXCEL和SPSS软件对检索数据分析其分布特征。根据检索结果设计引物,在构建的F_(2)遗传群体中小规模进行非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳验证,并克隆测序其有效性与真实性。【结果】在燕麦基因组中,SSR数量众多,类型丰富。全基因组共检索到828138个SSR位点,SSR平均密度为78.16个/Mb,平均距离为12.90 kb。单、双、三核苷酸重复类型占主导优势。基元重复次数主要集中在5次和6次,A/T、AG/CT和AAC/GTT重复基元为优势基元。燕麦基因组SSR位点呈现中度多态性,长度变化范围为11-1587 bp。并由此开发设计52对多态性引物在试验材料中进行扩增验证,在构建的遗传群体中均具有多态性。【结论】在“三分三”裸燕麦参考基因组中开发SSR引物有效可行,可以用于后续进一步试验研究。 展开更多
关键词 燕麦 皮裸 SSR标记 引物开发 多态性
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淡水鱼类环境DNA宏条形码引物的筛选及其在千岛湖的应用 被引量:1
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作者 周严 童璐 +4 位作者 胡文静 李志力 郝雷 刘其根 胡忠军 《湖泊科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第1期187-199,共13页
基于环境DNA(eDNA)技术的鱼类多样性监测方法因具有灵敏度高、对目标生物无伤害以及成本低等特点,近年来在国内外得到了广泛应用。eDNA方法的有效性往往取决于宏条形码引物的选择,尽管目前已经有一些鱼类环境DNA宏条形码引物,但较少有... 基于环境DNA(eDNA)技术的鱼类多样性监测方法因具有灵敏度高、对目标生物无伤害以及成本低等特点,近年来在国内外得到了广泛应用。eDNA方法的有效性往往取决于宏条形码引物的选择,尽管目前已经有一些鱼类环境DNA宏条形码引物,但较少有研究综合评估这些引物的检出效果。本研究评估了来自COI、Cytb、12S rRNA和16S rRNA基因的29对鱼类e DNA宏条形码引物(包括本研究设计的2对和从国内外文献中引用的27对引物),首先基于计算机模拟PCR(in silico PCR)进行了初步分析,随后通过高通量测序对其中效果较好的17对引物开展了更进一步的验证,结果显示:计算机模拟PCR结果良好的引物在进行高通量测序时并非全部表现良好,表明引物的筛选不能仅仅依靠计算机模拟PCR;具有更长扩增片段长度的宏条形码引物并没有获得理想中更好的扩增效果,表现效果好的引物大多是扩增片段长度处于200~300 bp之间的引物;相对于COI和Cytb而言,12S rRNA引物与16S rRNA引物均具有良好的扩增效果,适宜作为鱼类环境DNA宏条形码而用于鱼类多样性研究;同时,鉴于当前的鱼类DNA条形码数据库尚不完备以及不同引物的特性不同,使用多对引物将大大增加物种的检出概率和e DNA研究的可信性。本研究展示了eDNA在评估生物多样性方面的潜力,有助于将来的鱼类eDNA研究,从而为鱼类多样性的保护提供参考。 展开更多
关键词 EDNA DNA宏条形码 生物多样性 计算机模拟PCR 引物 千岛湖
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基于环境DNA的长江中华鲟分布特征探究 被引量:2
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作者 周权 杜浩 +2 位作者 王洁 邵芸 闫振广 《环境工程技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期71-78,共8页
中华鲟(Acipenser sinensis)是我国长江流域的旗舰物种,在长江十年禁渔的大背景下,研究中华鲟无损化检测技术具有重要意义。环境DNA(eDNA)技术是一种环境友好型生物监测技术,可以在不直接观察或捕获生物体的情况下对物种进行检测。从文... 中华鲟(Acipenser sinensis)是我国长江流域的旗舰物种,在长江十年禁渔的大背景下,研究中华鲟无损化检测技术具有重要意义。环境DNA(eDNA)技术是一种环境友好型生物监测技术,可以在不直接观察或捕获生物体的情况下对物种进行检测。从文献中筛选出可以用于检测中华鲟eDNA的特异性引物,于2020年9月在长江中下游选取4个中华鲟常出现的区域,进行各断面立体式采样;提取16个点位的e DNA,使用筛选得到的引物对中华鲟进行eDNA的检测,以探究中华鲟的分布特征。结果显示,成功筛选到1组可以检测中华鲟eDNA的引物,使用该引物成功检测到包括中华鲟在内的长江4种鲟类的eDNA,共计测得约300万条鲟类序列。依据测序结果分析不同断面检测到的中华鲟eDNA的差异,发现宜昌江段断面的中华鲟eDNA最多,洞庭湖口断面最少,且表层和底层水体的中华鲟eDNA检出也有显著差异。筛选得到的引物可以用于中华鲟eDNA的检测,中华鲟e DNA的检测结果与中华鲟的历史调查和洄游特征较为吻合。不同水深条件中华鲟eDNA的检出量有显著差异,表明在今后的调查中采用混合或者立体采样可以更加全面地进行中华鲟eDNA的检测。 展开更多
关键词 中华鲟 特异性引物 环境DNA 操作分类单元 长江
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多元统计软件PRIMER在张网渔具种类选择性研究中的运用 被引量:4
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作者 李超 张秀梅 +1 位作者 陈平 李文涛 《中国海洋大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期37-46,共10页
本文根据2014年秋季青岛斋堂岛海域双桩竖杆张网的网囊网目选择性试验数据,运用PRIMER软件中的相似性分析、非参数多维标度分析和相似性百分比分析模块分析了张网渔具种类选择性。试验采用平行作业法,以传统网具(2a=16mm的菱形目网囊)... 本文根据2014年秋季青岛斋堂岛海域双桩竖杆张网的网囊网目选择性试验数据,运用PRIMER软件中的相似性分析、非参数多维标度分析和相似性百分比分析模块分析了张网渔具种类选择性。试验采用平行作业法,以传统网具(2a=16mm的菱形目网囊)作为对照网,设计了网目尺寸(2a)为30和35mm的菱形目网囊(以30D和35D表示)和网目尺寸(2a)为20、30和35mm的方形目网囊(以20S、30S和35S表示),进行选择性实验。研究显示:(1)35D、30S和35S渔获组成与对照网存在显著性差异,其余各网之间差异不显著。(2)改良后的试验网具能有效释放舒氏海龙;除20S组外,其余各试验网对方氏云鳚亦有较好的释放效果。(3)方形目网囊较相同尺寸的菱形目网囊具有更好的种类选择性;对相同网目形状的试验网囊进行比较,种类选择性随网目尺寸的增大而增大。(4)综合分析不同网具的渔获物组成和规格,在斋堂岛海域秋季小黄鱼、带鱼渔汛期,推荐使用30mm方形目网囊;方氏云鳚渔汛期,推荐使用20mm方形目网囊进行捕捞作业。研究结果表明,运用多元统计软件PRIMER进行张网渔具种类选择性分析虽然存在待完善之处,但该方法为本领域研究提供了有益参考。 展开更多
关键词 primer 多元统计分析 张网 菱形目网囊 方形目网囊 种类选择性
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适于多物种的通用尾巴序列设计及通用体系的建立
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作者 孙擘 王蕊 +3 位作者 霍永学 葛建镕 匡猛 王凤格 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期94-102,共9页
【目的】荧光毛细管电泳由于其检测通量高、分辨率高等优点,被广泛应用于个体鉴定、品种鉴定、物种鉴定等多种应用场景中。尾巴序列为荧光毛细管电泳平台的广泛应用提供了高效的解决方案。为解决已有尾巴序列无法满足多物种使用需求,本... 【目的】荧光毛细管电泳由于其检测通量高、分辨率高等优点,被广泛应用于个体鉴定、品种鉴定、物种鉴定等多种应用场景中。尾巴序列为荧光毛细管电泳平台的广泛应用提供了高效的解决方案。为解决已有尾巴序列无法满足多物种使用需求,本研究基于编码转译技术开发高效的通用尾巴序列(universal tailed-sequence,UTS)设计工具。基于此工具设计通用尾巴序列,构建适合多作物的通用型PCR体系和程序,提高荧光电泳通量和灵活性。【方法】基于编码转译技术开发高效的通用尾巴序列设计工具,并对3755个常用汉字进行编码转译,并设置序列GC含量、发卡结构及同源引物二聚体退火温度等筛选条件得到符合条件的UTS。使用BLAST工具对通用尾巴序列设计工具生成的UTS在多种生物基因组上进行同源性评估,并在玉米、番茄、辣椒、西瓜等作物上进行实验评估,构建物种通用型实验体系及程序。【结果】通过设计工具编码转译并筛选共得到7436833个高质量的候选UTS,占所有字组的52.74%。挑选6个UTS在20个作物基因组上的BLAST结果显示其与M13相比具有更好的特异性。通过对通用引物扩增程序进行优化,使通用引物在多个物种上的扩增成功率达到或超过95%,并具有较强的稳定性。【结论】利用编码转译技术开发通用尾巴序列,并为其搭配物种通用型扩增体系和程序,提供一种通量高、成本低的荧光电泳通用检测方法。 展开更多
关键词 PCR 荧光电泳 通用引物 引物设计
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DNA Extraction and ISSR Primer Screening of Camellia chekiangoleosa 被引量:8
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作者 谢云 李纪元 +2 位作者 范正琪 朱高浦 周兴文 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2011年第6期825-828,共4页
[Objective] The aim was to screen out simple methods of DNA extraction and effective ISSR primers suitable to all germplasm materials of Camellia chekiangoleosa.[Method] The modified CTAB method was used in the extrac... [Objective] The aim was to screen out simple methods of DNA extraction and effective ISSR primers suitable to all germplasm materials of Camellia chekiangoleosa.[Method] The modified CTAB method was used in the extraction of the genomic DNA,50 ISSR primers from other Camellia plants were used in the ISSR-PCR amplification for 20 germplasm materials from 10 populations in Fujian,Zhejiang,Jiangxi and Anhui Province.[Result] Pure DNA could be obtained rapidly by using the improved CTAB method,and the 20 selected effective primers had rich polymorphism,clear bands and good repeatability.337 DNA bands were obtained,of which 281 bands were polymorphic,accounting for 83.4% of the total amplified bands.And 16.85 bands could be amplified with a primer,averagely.[Conclusion] The selected 20 primers could be effectively applied to ISSR analysis of the germplasm resources of C.chekiangoleosa in Zhejiang. 展开更多
关键词 Camellia chekiangoleosa ISSR marker primer screening
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利用软件Primer Premier 5.0进行PCR引物设计的研究 被引量:49
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作者 任亮 朱宝芹 +4 位作者 张轶博 王海燕 李尘远 苏玉虹 巴彩凤 《锦州医学院学报》 2004年第6期43-46,共4页
目的 运用PrimerPremier 5 0软件设计PCR引物 ,并且检验所设计引物的PCR扩增效率和特异性。方法 运用PrimerPremier 5 0软件设计 16对猪和犬的PCR扩增引物 ,通过PCR扩增后进行琼脂糖凝胶电泳检测实验结果。结果 在所设计的 16对引... 目的 运用PrimerPremier 5 0软件设计PCR引物 ,并且检验所设计引物的PCR扩增效率和特异性。方法 运用PrimerPremier 5 0软件设计 16对猪和犬的PCR扩增引物 ,通过PCR扩增后进行琼脂糖凝胶电泳检测实验结果。结果 在所设计的 16对引物中有 8对PCR扩增特异性好且效率高 ,成功率 5 0 %。但是 ,其中早期设计引物 12对只有 4对成功 ,后期设计引物 4对全部成功。结论 从引物设计的过程中可以看到一种趋势 -后期引物设计的成功率远远高于早期。这表明我们在引物设计方面正在逐步成熟 。 展开更多
关键词 PCR引物设计 软件primer Premier 5.0 PCR
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Designing Primers for H5 and H7 Subtypes of Avian Influenza Virus and Multiplex RT-PCR Amplification 被引量:5
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作者 张文慧 郭华 +2 位作者 王伟利 刘明 钱爱东 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2008年第1期15-17,共3页
[Objective] The research aimed to design primers that are suitable for detecting H5 and H7 subtypes of avian influenza virus (AIV) ; [Method] DNAStar was used to analyze the homology of the sequences of H5 and H7 su... [Objective] The research aimed to design primers that are suitable for detecting H5 and H7 subtypes of avian influenza virus (AIV) ; [Method] DNAStar was used to analyze the homology of the sequences of H5 and H7 subtypes of AIV accessed in GenBank, and design primers( by Primer Premier 5.0) on high homologous region of these sequences, and then amplified by RT-PCR. [Result] The multiplex RT-PCR amplification, agarose gel electrophoresis and sequencing results showed that the self-designed primers are successful for detecting AIV. [Conclusion] It is feasible to rapidly diagnose AIV through this method. 展开更多
关键词 Avian influenza virus primer Premier 5.0 DNAStar Multiplex RT-PCR amplification
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广西道地药材肉桂及阴香的DNA分子鉴定研究 被引量:2
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作者 李立 吴桂凡 +3 位作者 罗轶 李丽莉 凌婕 马双成 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期191-196,203,共7页
建立一种能够准确鉴别肉桂及阴香的特异性聚合酶链式反应方法,以保障肉桂用药的安全性和有效性。通过对比分析肉桂及阴香的psbA-trnH序列差异找到特异性单核苷酸多态性位点,设计特异性引物,通过优化退火温度、循环次数,评估不同聚合酶... 建立一种能够准确鉴别肉桂及阴香的特异性聚合酶链式反应方法,以保障肉桂用药的安全性和有效性。通过对比分析肉桂及阴香的psbA-trnH序列差异找到特异性单核苷酸多态性位点,设计特异性引物,通过优化退火温度、循环次数,评估不同聚合酶种类和不同基因扩增仪等扩增条件对不同来源的肉桂及阴香进行特异性扩增,根据特异性扩增条带进行鉴别。结果表明退火温度为54℃,循环次数为35次时,肉桂经肉桂特异性引物扩增后在100~200 bp处出现特异性条带,阴香无条带;退火温度为56℃,循环次数为40次时,阴香经阴香引物扩增后在200~300 bp处出现特异性条带,肉桂无条带。该研究所建立的特异性PCR方法可以快速准确鉴别出肉桂及阴香,为控制肉桂的质量安全提供参考。 展开更多
关键词 肉桂 阴香 特异性聚合酶链式反应 特异性引物 质量安全
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利用MPprimer设计引物并优化扩增条件以提高多重PCR效率的实验研究 被引量:27
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作者 王稳 屈武斌 +3 位作者 申志勇 任长虹 刘虎岐 张成岗 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2010年第3期342-346,共5页
多重PCR技术广泛应用于多个研究领域,其中引物设计及扩增条件是提高多重PCR实验效率的关键因素.为探讨优化多重PCR实验的方法,以小鼠5个看家基因为研究对象,使用实验室新近开发的MPprimer程序设计多重PCR引物,并通过改变多种反应条件来... 多重PCR技术广泛应用于多个研究领域,其中引物设计及扩增条件是提高多重PCR实验效率的关键因素.为探讨优化多重PCR实验的方法,以小鼠5个看家基因为研究对象,使用实验室新近开发的MPprimer程序设计多重PCR引物,并通过改变多种反应条件来优化多重PCR实验.结果表明,MPprimer程序能够设计出理想的多重PCR引物,并且通过对退火温度及延伸时间进行优化,可显著提高多重PCR实验效率,对于提高基因表达的规模化检测能力具有积极的促进作用. 展开更多
关键词 PCR 多重PCR 引物设计 MPprimer
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Screening of SSR Core Primers for Purity Identification of Pepper(Capsicum) Hybrids 被引量:2
16
作者 管俊娇 黄清梅 +3 位作者 张鹏 马芙蓉 张惠 张建华 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2015年第10期2155-2158,2230,共5页
[Objective] This study aimed to screen a set of SSR core primers suitable for purity identification of pepper (Capsicum) hybrids. [Method] DNA fingerprint of 100 pepper hybrids was analyzed using 17 SSR primers. [Re... [Objective] This study aimed to screen a set of SSR core primers suitable for purity identification of pepper (Capsicum) hybrids. [Method] DNA fingerprint of 100 pepper hybrids was analyzed using 17 SSR primers. [Result] According to the polymorphism and heterozygosity, Hpms1-214, Es395 and Hpmsl-5 were determined as three preferred core primers for purity identification of pepper hybrids. By using these three preferred core primers, 97 pepper hybrids (accounting for 97%) had heterozygous band pattern with at least one primer. Es330, Es363, Epms923, Es120 and Es64 were determined as candidate core primers for purity identification of pepper hybrids. Specific primers of 14 varieties were obtained, which could be used to further screen parent-complementary primers of each pepper hybrid. [Con- clusion] This study laid the foundation for constructing standard DNA fingerprints for purity identification of pepper hybrids. 展开更多
关键词 PEPPER SSR HYBRID Purity identification Core primers
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Primer Screening on Germplasm Resources of Mallotus oblongiolus by ISSR Molecular Marker 被引量:7
17
作者 李娟玲 刘国民 +1 位作者 宫庆龙 翟丽艳 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2009年第6期40-43,46,共5页
[ Objective] To provide effective primers for the rapid and accurate ISSR analysis of the germplasm materials of Mallotus oblongiolus (Miq.) Muello-Arg.. [Method] The modified CTAB method was used in the extraction ... [ Objective] To provide effective primers for the rapid and accurate ISSR analysis of the germplasm materials of Mallotus oblongiolus (Miq.) Muello-Arg.. [Method] The modified CTAB method was used in the extraction of the genomic DNA. 99 ISSR primers were used in the ISSR-PCR amplification for 20 germplasm materials from 10 populations in Hainan Island, so that some primers, which were suitable to all gerplasm materials of M. oblongiolu, could be selected. [ Result] 15 effective primers with characteristics of rich polymorphism, clear bands, and good repeatability were selected from 99 test primers. The 15 primers selected were used in the ISSR-PCR amplification for 66 germplasm materials of M. oblongiolus. From all of which the abundant and distinct DNA fingerprintings could be obtained. 286 DNA bands were obtained, and of which 231 bands were polymorphic, which amounted to 80.77% of the total bands amplified. And 19.1 bands could be obtained with each primer, averagely. [ Conclusion] The 15 primers selected could be effectively applied to ISSR analysis of the germplasm resources of M. oblongiolus. 展开更多
关键词 Mallotus oblongiolius Miq. Muell. - Arg. ISSR marker primer screening
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基于环境DNA技术的红鳍笛鲷生物量评估方法研究
18
作者 辛益 邢晓东 +4 位作者 郭禹 秦传新 于刚 马振华 王兴强 《海洋渔业》 CSCD 北大核心 2024年第3期275-285,共11页
环境DNA可以定量评估水生生物丰度,但其准确性因引物与构建模式差异而有所不同。以岩礁性鱼类红鳍笛鲷(Lutjanus erythropterus)为对象,采用室内实验和实时荧光定量PCR(qPCR)的方法对红鳍笛鲷引物和探针进行设计与开发,建立DNA浓度与生... 环境DNA可以定量评估水生生物丰度,但其准确性因引物与构建模式差异而有所不同。以岩礁性鱼类红鳍笛鲷(Lutjanus erythropterus)为对象,采用室内实验和实时荧光定量PCR(qPCR)的方法对红鳍笛鲷引物和探针进行设计与开发,建立DNA浓度与生物量间的关系,解析环境DNA(eDNA)持久性和衰减的过程,初步探究了eDNA技术对红鳍笛鲷生物量评估的可行性。结果显示,当引物退火温度为60℃时,引物扩增效果最好;红鳍笛鲷eDNA浓度与生物量间呈显著正相关(R^(2)=0.93);移出红鳍笛鲷后的20 d内,eDNA衰减浓度与时间呈显著负相关(R^(2)=0.98)。对红鳍笛鲷增殖放流前后的水环境检测结果表明,放流后水体内红鳍笛鲷eDNA浓度显著增加,表明本研究所设计的引物在检测红鳍笛鲷生物量方面的可行性,可为应用eDNA技术开展红鳍笛鲷生物量的准确评估提供理论基础。 展开更多
关键词 红鳍笛鲷 环境DNA 特异性引物 生物量评估
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大型多元统计软件PRIMER的方法原理及其在底栖群落生态学中的应用 被引量:231
19
作者 周红 张志南 《青岛海洋大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2003年第1期58-64,共7页
本文阐述大型多元统计分析软件 PRIMER的原理及其在底栖生态学中的应用。PRIMER是处理生态和环境多元数据的重要数值分析工具 ,本文从实用的角度对其中包括的技术方法和相应的子程序如 :等级聚类 (CLUSTER)、非度量多维标度 (MDS)、主... 本文阐述大型多元统计分析软件 PRIMER的原理及其在底栖生态学中的应用。PRIMER是处理生态和环境多元数据的重要数值分析工具 ,本文从实用的角度对其中包括的技术方法和相应的子程序如 :等级聚类 (CLUSTER)、非度量多维标度 (MDS)、主分量分析 (PCA)、相似性分析检验(ANOSIM)、相似性百分比分析 (SIMPER)、生物 -环境连接的逐步分析和相关检验 (BIOENV/BVSTEP)等作了较为系统的介绍。 展开更多
关键词 底栖群落 生态学 多元统计分析 丰度 生物量 空间分析
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扩增子测序技术在牡蛎GⅡ型诺如病毒基因多样性研究中的评估
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作者 赵璐 董蕾 +2 位作者 喻勇新 靳淼 王永杰 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2024年第16期299-305,共7页
牡蛎中诺如病毒基因多样的研究对病毒的流行传播和疫情防控具有十分重要的意义,二代测序技术(next generation sequencing, NGS)的扩增子测序具有高通量、高准确性等优势,被广泛应用于基因组学、转录组学和表观基因组学等领域。为评估... 牡蛎中诺如病毒基因多样的研究对病毒的流行传播和疫情防控具有十分重要的意义,二代测序技术(next generation sequencing, NGS)的扩增子测序具有高通量、高准确性等优势,被广泛应用于基因组学、转录组学和表观基因组学等领域。为评估扩增子测序技术对牡蛎中诺如病毒多样性研究的可行性,采用经典的巢式反转录PCR(reverse transcription-PCR, RT-PCR)方法对人为污染诺如病毒的牡蛎样品进行检测并将产物进行扩增子测序,对病毒基因型覆盖度和灵敏度进行分析。结果显示,在覆盖度方面,扩增子测序技术能够检测出人为添加到牡蛎中的6种GⅡ型诺如病毒,覆盖率达到100%;在灵敏度方面,对人为污染有不同数量诺如病毒的牡蛎进行检测及测序分析,证实扩增子测序的灵敏性较高,低于50个病毒粒子也能检测出。综上,扩增子测序技术提高了牡蛎中诺如病毒检测的准确性以及基因型的丰富度。 展开更多
关键词 诺如病毒 贝类 扩增子测序 引物评估 多样性
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