24个常用STR基因座的突变观察与分析

【目的】观察24个常用STR基因座等位基因突变的现象及特点。【方法】对5084例肯定亲权关系的案例进行分析,筛选等位基因突变事件,确定突变等位基因的来源,统计各STR基因座的突变率,分析突变的规律及其特点。【结果】在24个STR基因座中共观察到172个突变事件,STR基因座的突变率介于0～0.492%。每个突变案例的突变基因座数目为1～3个。突变模式符合逐步突变模式,最多突变步数为四步。父系突变与母系突变比例为3.55:1。【结论】STR基因座等位基因突变现象较为常见。当出现STR基因座突变时,应结合突变的STR基因座信息计算PI值。

广州汉族人群12个Y-STR基因座多态性及法医学应用研究

目的研究广州地区汉族人群12个Y-STR基因座的等位基因频率分布、单倍型遗传多样性及其法医学应用价值。方法采用PowerPlexYSystem荧光标记复合扩增系统检测401例广州汉族无关个体的12个Y-STR基因座,并用3100遗传分析仪进行基因分型。结果获得了广州地区汉族无关男性个体的12个Y-STR基因座的频率分布资料,观察到398个单倍型,其基因多样性为0.99997;检测13种动物血样,在特异性区域均无扩增产物;55个父系样本,未观察到突变基因;同一男性个体的不同组织基因分型相同且女性DNA成分不影响Y-STR的扩增分型。结论该12个Y-STR基因座检测系统具有很高的识别能力,在群体遗传学研究及法医学混合检材的个人识别和父系亲缘关系鉴定中有重要应用价值。

应用6个STR基因座进行奶牛亲子鉴定

运用PCR技术用BM 2 1 1 3、BM 1 86 2、BMc 70 1、BM 2 934、TGLA 1 2 2、BM 72 0共 6个STR (短串联重复序列 )基因座对 7头奶牛DNA进行扩增 ,扩增产物分两组混合后经聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染检测 ,扩增片段互不干扰。采用已确定母女关系的 2头奶牛血液样本和 5个嫌疑父亲的精液样本 ,对一头母本已知的奶牛在嫌疑父本中找出父本 ,并计算父权概率为 99 993%。结果证明 。

华南地区汉族群体15个STR基因座的遗传多态性调查

【目的】调查获得华南地区汉族群体遗传多态性参数,并与以往相关文献报道的群体资料进行统计比较。同时评估PowerPlex誖16体系应用于华南汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值。【方法】应用PowerPlex誖16荧光标记复合扩增系统检测4786名华南地区汉族无关个体15个STR基因座的多态性,统计计算群体遗传学参数,并将获得的等位基因频率与文献报道的群体资料进行统计比较。【结果】15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P﹥0.05),共检出241个等位基因,频率在0.0001～0.5458;共1043种基因型。在13个基因座上检出共60个等位基因阶梯以外的等位基因。15个基因座的杂合度观察值(Ho)在0.6030～0.9076之间,多态信息含量(PIC)在0.5428～0.9044之间,累计个人识别率(TDP)达0.9999999999999999971,三联体累计非父排除概率(CPE)达到0.99999981,单亲鉴定累计亲权排除概率(CPE*)为0.9543。本文调查结果与以往文献报道的人群等位基因频率资料有不同程度的差异。【结论】15个STR基因座在华南汉族人群中有较高的多态性,PowerPlex誖16荧光标记复合扩增系统对华南汉族人群的个体识别及亲子鉴定具有很高的应用价值。本文调查获得的群体遗传学数据可为法医学个人识别和亲子鉴定提供结果评估的依据。

广西融水苗族群体中9个短串联重复序列的遗传多态性

目的:了解广西融水苗族人群9个短串联重复序列(STR)D3S1358、vWA、FGA、D8S1179、D21S11、D18S51、D5S818、DO3S317、D7S820遗传多态性分布情况。方法:用枸橼酸钠抗凝法采集融水苗族个体的血样,酚-氯仿抽提法提取DNA,荧光标记复合扩增基因座,用ABI Prismr(?)3100型遗传分析仪对扩增产物进行检测。结果:9个STR位点共检测出97种等位基因、297 种基因型,基因型的分布符合Hardy-Weinberg平衡定律,平均杂合度0.786,累积个人识别力0.999 999 999 97,累积非父排除率0.999 998,多态信息总量0.999 998 89。结论:苗族群体的9个STR位点具有高度多态性和遗传稳定性,可作为广西苗族的民族遗传学研究和法医学鉴定的基础数据。

组织工程化肌腱修复喙锁韧带术后的短串联重复位点检测

目的 用短串联重复位点检测方法 ,评价组织工程化肌腱临床应用修复喙锁韧带损伤的效果。方法 1999年 9月采用人胚肌腱细胞与材料体外复合培养 ,构建组织工程化肌腱 ,修复喙锁韧带损伤。术后 6个月 ,行内固定取出术时 ,钳取微量组织作组织学观察 ,并提取 DNA,检测 D3S175 4及 Cyar0 4基因座。结果 患者术后功能恢复良好 ,无局部及全身免疫排斥反应 ,D3S175 4及 Cyar0 4基因座电泳分型中含有非自体的等位基因 ,证实植入的组织工程化肌腱存活。

广西金秀瑶族15个STR基因座遗传多态性

目的：了解广西金秀瑶族群体15个STR基因座的遗传多态性。方法：Chelex-100法提取样本DNA，荧光标记复合扩增基因座，ABIPrism3100型遗传分析仪对扩增产物进行检测。结果：15个位点共检测出113种等位基因，基因频率分布在0．0029～0．5514；366种基因型，频率分布在0．0054～0．3657之间；符合Hardy-Weinberg平衡定律；杂合度（H）分布在0．5718～0．9286，个人识别力（DP）分布在0．7241～0．9601，累积个人识别力TDP为〉0．9999999999，非父排除率（EP）在0．3658～0．8783，累积非父排除率CEP为0．999999998，多态信息量PIC分布在0．4953～0．8428。结论：广西金秀瑶族15个STR基因座除TPOX基因座外，其它基因座均属于高度多态性遗传标记。

亲子鉴定中常用10个STR基因座突变的观察和分析

目的对本中心日常检案进行STR基因座突变率进行统计,以供同行参考。方法用PowerplexTM16system试剂盒检测360例亲子鉴定案例,用SinofilerTMsystem试剂盒检测159例亲子鉴定案例,观测和分析两个试剂盒在亲子鉴定中的基因突变率。结果 360例亲子鉴定中观察到13例均为1个STR基因座发生突变;159例亲子鉴定中观察到5例均为1个STR基因座发生突变。结论本研究中观察到STR基因座突变率为2.32%。

广西金秀瑶族9个DNA短串联基因座遗传多态性

目的：了解广西金秀瑶族群体9个STR基因座（D5S818、D7S820、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11、FGA、vWA）的遗传多态性。方法：枸橼酸钠抗凝的广西金秀瑶族无相关健康个体血样175例。先用Chelex-100方法提取DNA，然后用AmpFlRSTR．Identifiler^TMkit荧光标记复合PCR扩增技术进行9个STR基因座复合扩增，用ABI3100型遗传分析仪对扩增产物进行电泳，并用Gene Scan Analysis3．7和Genetyper3．7软件对扩增结果进行分析。结果：广西金秀瑶族9个位点中共检测出100种等位基因，基因频率分布在0．0029～0．3943之间；302种基因型，频率分布在0．0054～0．3657之间。9个位点的基因型分布均符合Hardy—Weinberg平衡定律。9个STR基因座的杂合度分布在0．7371～0．9286之间，个体识别力（DP）分布在0．8952～0．9674之间，累积个体识别力TDP为〉0．999999999，非父排除率（EP）在0．6538～0．8783之间，累积非父排除率CEP为0．9999984，多态信息量PIC分布在0．7153～0．8645之间。结论：广西金秀瑶族9个STR基因座均属于高度多态性遗传标记，具有较高的应用价值。

广西金秀瑶族12个STR基因座遗传多态性

目的:了解广西金秀瑶族群体12个STR基因座的遗传多态性。方法:对175例瑶族男女抽取外周血,采用Chelex-100法提取DNA,荧光标记复合扩增基因座,ABIPrism(3100型遗传分析仪对扩增产物进行检测。结果:12个位点(D2S1338、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11、FGA、vWA)共检测出94种等位基因,基因频率分布在0.0029～0.3943;322种基因型;符合Hardy-Weinberg平衡定律;观察杂合度(HO)分布在0.7371～0.9029,个人识别力(DP)分布在0.8753～0.9601,累积个人识别力(TDP)为>0.999999999,非父排除率(EP)在0.6046～0.8519,累积非父排除率(CEP)为0.999999974,多态信息量(PIC)分布在0.6788～0.8428。结论:广西金秀瑶族12个STR基因座均属于高度多态性遗传标记。

Goldeneye^(TM) DNA ID System 20A试剂盒确证实验

目的:测试GoldeneyeTMDNA ID System20A试剂盒的技术性能指标,评估其法医学应用价值。方法:参照美国DNA分析方法专家组(TWGDAM)制定的确证指南,利用9947A、007标准品,100个拐卖儿童建库血样,日常案件各类检材制定测试方案,从方法学验证、灵敏度测试、混合样本测试、批量样本测试、DNA提取方法适应性测试、各类常见检材的测试、稳定性测试等7个方面进行测试。结果:Gold-eneyeTMDNA ID System 20A试剂盒灵敏度较高,对各类案件检材和DNA提取方法具有较好的适应性,具有直接扩增能力和检测混合DNA样本检测能力。结论:GoldeneyeTMDNAID System 20A试剂盒可用于法庭科学的检案与建库。

17个Y-STR基因座在亲子鉴定中的应用研究

本研究探讨AmpFlSTR YfilerTM复合扩增系统中的17个Y-STR基因座在法医学亲子鉴定案检实际工作中的非父排除能力,以及在中国人群中的基因突变情况。采用业已经Reliagene Y-PLEXTM6和本实验室建立的"9个短片段长度Y-STR复合扩增系统"检测的36对非父子和84对真父子,用YfilerTM试剂盒进行PCR复合扩增,PCR产物用ABI3100基因测序仪基因扫描方法检测和分析;统计每一非父子对中排除亲子关系的Y-STR基因座的个数,观察真父子对中Y-STR基因座基因突变情况;并与以往采用Reliagene Y-PLEXTM6系统和"9个短片段长度Y-STR复合扩增系统"的检测结果进行对比。结果表明:YfilerTM系统检测36对非父子,其中1对非父子不能排除,其余35对均有3个以上Y-STR基因座可以排除亲子关系;有3个以上Y-STR排除的非父子对占97.22%(35/36),高于Y-PLEXTM6系统的92.11%(35/38)和"9个短片段长度Y-STR复合扩增系统"的91.67%(33/36);除1例Y-STR不能排除的非父子对外,其余的35对平均每一非父子对有11.3个Y-STR基因座可以排除亲子关系。YfilerTM系统检测84对真父子,观察到DYS437、DYS439、DYS635、DYS389Ⅱ和DYS19等5个基因座各出现1次基因突变事件,均表现为相差1个核心序列,每一基因座每次减数分裂的平均突变率为3.50×10-3;Y-STR基因突变案例占检测案例的5.95%(5/84),高于Y-PLEXTM6系统的2.15%(2/93)和"9个短片段长度Y-STR复合扩增系统"(0/84)。结论:YfilerTM系统检测的Y-STR基因座较多,在亲子鉴定实践中具有较高的非父排除能力,但该系统的基因突变问题不容忽视。

福州地区汉族群体15个STR基因座遗传多态性研究

目的调查福建福州地区汉族群体遗传15个STR基因座多态性参数，同时评估AmpFlmSTR IdentifilerTM体系应用于该地区汉族人群进行法医学个体识别及亲子鉴定的价值。方法应用AmpFlmSTR IdentifilerTM体系荧光标记复合扩增系统检测350名福建福州地区汉族无关个体15个STR基因座的多态性，统计计算群体遗传学参数。结果15个STR基因座的基因型分布均符合Hardy—Weinberg平衡（P〉0．05），发现4个稀有等位基因。15个STR遗传标记均具有高度多态性，杂合度0．12～0．405，匹配概率0．032～0．225，个体识别力0．775～0．968，多态性信息含量0．55—0．86，非父排除率0．285～0．761。结论15个STR基因座在福建福州地区有较高的多态性。通过这份样本实验和等位基因频率总结，得到了福建福州人群更多法医学亲权鉴定和个人识别等位基因多样性的客观数据。

STR分型技术在马亲子鉴定中的应用

利用STR分型技术进行马亲子鉴定。取VHL20、HTG4、AHT4、HMS7、HTG6、HMS6、AHT5、ASB2、HTG7、HMS3、HMS2共11个STR(短串联重复序列)基因座,运用PCR技术对争议小马、嫌疑母马以及无关对照马的DNA进行扩增,扩增产物经遗传分析仪检测,用GeneMap-per片段分析软件对检测结果进行分析。结果表明,争议小马与嫌疑母马无亲子关系,STR基因分型技术能够准确、快速地进行马亲子鉴定,所用的STR位点具有较高的鉴别效率。

染色体STR遗传标记在亲缘鉴定中的应用

目的 :探讨染色体STR遗传标记在亲缘关系鉴定中的应用。方法 :用Profilerplus及Cofiler试剂盒检测 4 6 8例亲缘鉴定案 ,对其中STR基因座不符合遗传规律者 ,增加HLA等血型基因和“PowerPlex1 6 TM 体系试剂检测。必要时还增加Y STR ,X STR基因座检测和HLA等位基因测序。结果 :4 0 8例亲缘个体的亲权概率W >0 .95 ,其中 35 0例亲缘个体的W >0 .9995 ;6 0例无关个体的W <0 .8,其中 4 8例W <0 .2 7。经 χ2 检验 ,有亲缘关系的个体和无亲缘关系的个体间全相同和全不同的基因座数差异均有统计学意义 (P <0 .0 0 1 ) ;半相同的基因座数差异无统计学意义 (P >0 .0 5 )。结论 :染色体STR遗传标记用于鉴定亲缘关系时 ,当两个体不同基因座个数≤ 1个 ,或全相同基因座数≥ 6个时 。

短串联重复序列PCR及其应用

STR(short tandem repeat)基因座广泛分布于各种真核生物基因组中,是高度多态性标记的丰富来源,并可用PCR反应来检测。扩增区域重复序列重复次数的差异导致STR基因座的等位基因不同的分型,可区别不同的基因型。本文介绍了短串联重复序列PCR的基本原理和分析方法,并简要介绍了短串联重复序列PCR在亲缘关系鉴定、种群遗传结构分析、基因图谱以及基因诊断等方面的应用。

应用STR基因座及mtDNA D-Loop区遗传标记联合进行中国德昌水牛单亲亲权鉴定

为了研究短串联重复序列(STR)基因座在亲权鉴定中的亲子关系相对概率及mtDNA D-Loop区遗传标记在单亲亲权鉴定中的应用,试验采用PCR技术扩增3头水牛BM2934、BM1862、ETH225、BM1818、INRA035、BM2113、CSRM60、TGLA227共8个STR基因座DNA,STR扩增产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳检测并计算单亲亲权指数(PI)和亲子关系相对概率(RCP),同时扩增3头水牛mtDNA D-Loop区基因片段并进行测序分析。结果表明:2头嫌疑后代中c1与母水牛m亲子关系概率为99.960 6%,两者mtDNA D-Loop区基因序列一致率为100%;微卫星基因座与mtDNA D-Loop区遗传标记检测结果一致,嫌疑后代c1为母水牛m的后代。说明STR基因座与mtDNA D-Loop区遗传标记均可用于单亲亲权鉴定,两种方法相结合提高了亲权鉴定的稳定性、准确性、灵敏度,鉴定范围更广,样品要求更低。

马鞍山地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性调查

目的:调查292名马鞍山地区汉族无关个体15个STR基因座的等位基因类型及其频率。方法:用硅珠法提取DNA,采用AmpFISTR Identifiler荧光标记复合扩增系统进行复合扩增;扩增产物用ABI3130xl型遗传分析仪检测,得到STR分型结果后统计15个基因座的基因频率。结果:15个STR基因座,累计个人识别率达0.999 999 999 999 999 985,累计非父排除率为0.999 998 96。结论:该系统在马鞍山地区汉族人群中具有高度多态性,适用于法医学亲权鉴定、个体识别以及DNA数据库的建立。

利用STR位点进行牛亲子鉴定的研究

为利用STR分型技术进行牛亲子鉴定,运用PCR技术用TGLA227、BM2113、TGLA53、ETH10、SPS115、TGLA126、TGLA122、INRA23、ETH3、ETH225、BM1824共11个STR(短串联重复序列)基因座对争议小牛、1号嫌疑母牛、2号嫌疑母牛的DNA进行扩增,扩增产物经遗传分析仪检测,检测结果用GeneMapper片段分析软件分析。鉴定结果可以排除1号母牛与争议小牛间具有亲子关系,不排除争议小牛与2号母牛间具有亲子关系。结果表明:STR基因分型技术能够准确、快速地进行牛亲子鉴定,该研究所用的STR位点具有较高的鉴别效率。