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金针菇种质资源的SRAP分析 被引量:27
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作者 朱坚 高巍 +4 位作者 林伯德 孙淑静 郑昭 杨洁 谢宝贵 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第2期154-158,共5页
应用SRAP对金针菇种质资源进行评价.选用多态性好的7对SRAP引物对30个来源不同、各具代表性的供试菌株进行PCR,共获得92条重复性良好的DNA条带,其中多态性条带79条,占85.9%;用SPSS软件计算相似系数和进行平均法聚类分析,白色菌株之间遗... 应用SRAP对金针菇种质资源进行评价.选用多态性好的7对SRAP引物对30个来源不同、各具代表性的供试菌株进行PCR,共获得92条重复性良好的DNA条带,其中多态性条带79条,占85.9%;用SPSS软件计算相似系数和进行平均法聚类分析,白色菌株之间遗传差距较小,黄色菌株之间遗传差距大,30个供试菌株可分为14类.本研究还表明,SRAP具有高效、稳定、重复性好的特点,可应用于遗传连锁群构建、品种鉴别及分子标记辅助育种等研究. 展开更多
关键词 金针菇 SRAP标记 遗传相似性 聚类分析 种质资源
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浙江2个地产白沙枇杷种质资源亲缘关系鉴定 被引量:2
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作者 陈方永 王引 +2 位作者 倪海枝 张启 颜帮国 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期739-746,共8页
在综合观察浙江2个白沙枇杷(黄岩软条白沙和兰溪白沙)种质形态特征的基础上,对两者进行倍性、气孔检测和基于分子标记的亲缘关系研究。结果表明:黄岩软条白沙单果质量是兰溪白沙的1.38倍,而兰溪白沙的种子数、果皮厚度、果实硬度分别是... 在综合观察浙江2个白沙枇杷(黄岩软条白沙和兰溪白沙)种质形态特征的基础上,对两者进行倍性、气孔检测和基于分子标记的亲缘关系研究。结果表明:黄岩软条白沙单果质量是兰溪白沙的1.38倍,而兰溪白沙的种子数、果皮厚度、果实硬度分别是黄岩软条白沙的1.36倍、1.096倍、1.22倍;流式细胞仪倍性检测表明,两者均为二倍体;气孔检测表明,两者的气孔密度和面积大小差异显著,黄岩软条白沙气孔面积比兰溪白沙大43.4%,气孔密度比兰溪白沙小17.35%;基于简单序列重复标记的遗传聚类分析表明,黄岩软条白沙的遗传相似系数为0.40,兰溪白沙为0.45。由此可见,2个品种在成熟期的差异主要受种性和地域因素的影响,可认为是不同的栽培种质。 展开更多
关键词 白沙枇杷 同类种质 亲缘关系 差异
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一组水稻种质资源的遗传相似性及群体结构分析 被引量:1
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作者 肖宇龙 雷建国 +3 位作者 余传元 Quirino D.Dela Cruz Jonalyn M.Cstillo Dindo A.Tabanao 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期886-892,共7页
育种的成功基于试验材料中具有可利用的遗传变异,了解种质资源的群体机构及遗传变异范围是作物遗传改良的先决条件。本试验通过利用每3 Mb bin均匀分布于水稻染色体的156个SSR标记子,分析了一组(184个)用于干旱适应性研究的水稻种质资... 育种的成功基于试验材料中具有可利用的遗传变异,了解种质资源的群体机构及遗传变异范围是作物遗传改良的先决条件。本试验通过利用每3 Mb bin均匀分布于水稻染色体的156个SSR标记子,分析了一组(184个)用于干旱适应性研究的水稻种质资源的遗传相似性及群体结构。结果显示,水稻中确实存在着可供利用的遗传多样性,但也存在着普遍的遗传相似性,如国际水稻所的IR品种及菲律宾国家水稻所的PR及BP水稻品种。通过利用Structure中的混合模型对该184个水稻品种在K=3和K=7时的分析表明,群体结构普遍存在于相同类型或亚种的水稻品种中,籼稻及粳稻品种具有相对明显的群体结构,同一亲本的衍生后代具有显著的遗传相似性和群体结构,不同的群体均存在一定程度的遗传混合。对该组干旱适应性水稻种质资源的遗传相似性及群体结构的研究为今后的抗旱性基因的联合作图,也为合理选择亲本进行水稻抗旱性改良提供了有价值的遗传信息。 展开更多
关键词 水稻 种质资源 遗传相似性 群体结构
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冬凌草二萜类成分的化学指纹图谱研究及评价 被引量:7
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作者 陈随清 宋君 崔璨 《植物科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期519-527,共9页
为了建立冬凌草(Rabdosia rubescens)二萜类成分的HPLC指纹图谱,并通过指纹图谱对来自不同产地和不同类型的冬凌草进行评价,本研究以10批太行山产冬凌草HPLC色谱图为参照,建立了冬凌草二萜类成分的指纹图谱,色谱条件为,色谱柱:phenomsil... 为了建立冬凌草(Rabdosia rubescens)二萜类成分的HPLC指纹图谱,并通过指纹图谱对来自不同产地和不同类型的冬凌草进行评价,本研究以10批太行山产冬凌草HPLC色谱图为参照,建立了冬凌草二萜类成分的指纹图谱,色谱条件为,色谱柱:phenomsil C18(250×4.6 mm,5μm)柱;流动相:甲醇∶0.5%磷酸水溶液梯度洗脱;柱温:30℃;检测波长:238 nm;流速:0.8 mL/min。通过化学成分指纹图谱相似度分析以及主成分分析方法,综合评价不同产地冬凌草样品质量的差异。结果表明冬凌草种质资源出现多种分化,不同地区冬凌草二萜类成分差异明显;不同变异类型冬凌草二萜类成分也发生了变化,但没有明显规律性。 展开更多
关键词 冬凌草 种质资源 二萜类成分 高效液相色谱 化学指纹图谱 相似度分析 主成分分析
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世界蚕豆种质资源遗传多样性和相似性的ISSR分析 被引量:24
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作者 王海飞 关建平 +2 位作者 孙雪莲 马钰 宗绪晓 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期1056-1062,共7页
【目的】分析国内外蚕豆种质资源的遗传多样性,探索其遗传相似性和遗传结构,为世界蚕豆资源的综合评价和优良种质资源的发掘利用提供依据。【方法】利用ISSR标记技术,对来自世界35个国家的383份蚕豆资源的遗传相似性进行分析。【结果】... 【目的】分析国内外蚕豆种质资源的遗传多样性,探索其遗传相似性和遗传结构,为世界蚕豆资源的综合评价和优良种质资源的发掘利用提供依据。【方法】利用ISSR标记技术,对来自世界35个国家的383份蚕豆资源的遗传相似性进行分析。【结果】筛选出的11条ISSR引物共扩增出229条条带,其中多态性条带212条(占93%)。不同地理来源蚕豆资源群的基因多样性指数在0.16—0.28,平均为0.22;遗传丰富度变化范围为104—193,平均为158.5。中国春播区蚕豆资源群遗传多样性最高(H=0.28,NA=193),最低的是美洲资源群体(H=0.16,NA=104)。非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类结果表明,中国春播区和秋播区蚕豆资源明显不同;中国蚕豆资源群体与国外资源群间的遗传相似性较远,明显与国外资源相分离;北非和欧洲的蚕豆资源遗传相似性较近。亚洲、欧洲、非洲及中国的蚕豆资源群之间具有明显的地域分布规律。【结论】中国春播区蚕豆资源遗传变异丰富,遗传多样性较高;美洲蚕豆资源遗传基础相对狭窄。蚕豆资源群体遗传多样性差异和遗传相似性与其地理来源、生长习性和生态分布密切相关。 展开更多
关键词 蚕豆(VciafabaL.) 种质资源 ISSR标记 遗传多样性 遗传相似性
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19种野生牧草种质资源18SrRNA基因的多态性 被引量:2
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作者 武玉祥 田兵 +3 位作者 王啸 陈彬 冉雪琴 王嘉福 《贵州农业科学》 CAS 北大核心 2014年第2期12-17,共6页
为了开发牧草资源,对贵州部分野生草本植物种质资源的遗传多样性进行研究。根据模式植物拟南芥18SrRNA基因序列设计特异性引物,对贵州大学农场试验田自然生长的19种野生草本植物的18SrRNA基因序列进行扩增、测序、构建进化树。结果表明... 为了开发牧草资源,对贵州部分野生草本植物种质资源的遗传多样性进行研究。根据模式植物拟南芥18SrRNA基因序列设计特异性引物,对贵州大学农场试验田自然生长的19种野生草本植物的18SrRNA基因序列进行扩增、测序、构建进化树。结果表明:将获得的1 000bp左右的DNA片段测序进行同源比对,共找到2 280个碱基变异位点,分布在8个区段。据各样本18SrRNA基因的遗传距离构建进化树推测,菊科、苋科和藜科之间存在较近的遗传相似性,豆科中三叶草属与豌豆属之间有较近的遗传距离。 展开更多
关键词 野生植物 种质资源 遗传多样性 遗传相似性
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藜豆种质资源遗传多样性的ISSR分子标记分析 被引量:2
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作者 张凤银 戴希刚 潘磊 《江汉大学学报(自然科学版)》 2013年第6期100-104,共5页
利用ISSR标记构建了9份藜豆种质的指纹图谱,并对其遗传多样性进行评价。结果表明,从35条引物中筛选出8条重复性好的多态性引物进行PCR扩增,共扩增出64条带,其中多态性条带50条,多态性比例为78.1%。应用其中3条多态性ISSR引物(UB... 利用ISSR标记构建了9份藜豆种质的指纹图谱,并对其遗传多样性进行评价。结果表明,从35条引物中筛选出8条重复性好的多态性引物进行PCR扩增,共扩增出64条带,其中多态性条带50条,多态性比例为78.1%。应用其中3条多态性ISSR引物(UBC889、UBC812、UBC825)的12条特异性条带,可以有效区分供试的9份藜豆种质资源。藜豆种质问的遗传相似系数变化范围在0.47~0.97之间。利用UPGMA聚类分析,在相似性系数为0.73处可将9个藜豆种质资源划分为3个类群,其亲缘关系与种质地理来源之间存在一定关联性。 展开更多
关键词 藜豆 种质资源 遗传多样性 ISSR 相似系数 聚类分析
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名贵茶花种质资源的RAPD分析 被引量:9
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作者 张景荣 刘军 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期683-687,共5页
采用RAPD方法构建了国内外23个茶花品种的指纹图谱。从100个随机引物中筛选出的20个有效引物共产生136条DNA片段,遗传多态性带120条占总数88.2%。遗传相似性分析表明,各基因型间的Nei’s相似系数分布在0.438 6~0.893 6之间,平均相... 采用RAPD方法构建了国内外23个茶花品种的指纹图谱。从100个随机引物中筛选出的20个有效引物共产生136条DNA片段,遗传多态性带120条占总数88.2%。遗传相似性分析表明,各基因型间的Nei’s相似系数分布在0.438 6~0.893 6之间,平均相似性系数为0.766 8。通过非加权算术平均数聚类(UPGMA)法,绘制了它们的遗传关系树状图,23个品种可划分为3个类群。研究结果表明,RAPD技术可用于茶花品种的鉴别以及种质资源遗传多态性的研究。 展开更多
关键词 茶花 RAPD 品种资源 遗传相似
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利用RAPD技术评估金针菇种质资源 被引量:17
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作者 詹才新 朱兰宝 杨新美 《食用菌学报》 1997年第1期1-7,共7页
本文利用20个10核苷酸的随机引物对来源不同而具有代表性的16个金针菇菌株进行了RAPD分析研究。结果表明:所测试的20个随机引物中有6个引物的扩增产物DNA片断表现出明显的多态性,对所有供测试的金针菇菌株总共扩增出84条具重复性的DNA片... 本文利用20个10核苷酸的随机引物对来源不同而具有代表性的16个金针菇菌株进行了RAPD分析研究。结果表明:所测试的20个随机引物中有6个引物的扩增产物DNA片断表现出明显的多态性,对所有供测试的金针菇菌株总共扩增出84条具重复性的DNA片断;同时也显示供试的16个金针菇菌株两两间的遗传相似性变化较大(相似系数从0.0592到0.8000)。另外,采用系统聚类法中的类平均法,对供试的16个菌株两两间的相似系数进行聚类,可将它们分为四大类,各大类的类间和类内菌株的遗传变异程度较大,其中以Ⅳ类内各菌株间的最高(平均相似系数为0.4353),Ⅰ类和Ⅱ类间各菌株间的最低(平均相似系数为0.6812)。但是,从整个被测试的16个金针菇菌株来看,它们之间的遗传变异并不丰富(总平均相似系数为0.5292)。同时,将RAPD技术应用于不同菌株间遗传差异的研究,具有反应迅速、不受外界环境条件影响、能从DNA分子水平上揭示菌株间的遗传差异等优点。因此,RAPD分析技术是一种快速准确评估食用菌种质资源的有效方法。 展开更多
关键词 金针菇 RAPD分析 种质资源
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基于SSR分子标记的广西德保县和隆林县野生古茶树聚类分析 被引量:15
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作者 彭靖茹 李朝昌 +5 位作者 檀业维 温立香 张芬 叶靖平 黄寿辉 邓慧群 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期1-7,共7页
【目的】对广西德保县和隆林县野生古茶树及其他省份名优栽培种茶树进行聚类分析,为野生古茶树种质资源保护、良种选育及创新利用提供理论参考。【方法】利用筛选出的15对SSR引物对9份广西德保县和隆林县的野生古茶树种质和15份名优栽... 【目的】对广西德保县和隆林县野生古茶树及其他省份名优栽培种茶树进行聚类分析,为野生古茶树种质资源保护、良种选育及创新利用提供理论参考。【方法】利用筛选出的15对SSR引物对9份广西德保县和隆林县的野生古茶树种质和15份名优栽培种茶树种质进行聚类分析,并计算遗传相似系数。【结果】筛选出的15对引物从德保04和德保05未扩增出任何条带,但从其余22份茶树样品中共扩增出183条谱带,其中CS1引物扩增出多态性谱带最多,为19条,最少为CS13引物,仅7条,平均每对引物扩增出多态谱带12.26条,多态率为96.17%。22份茶树种质资源可聚为两大类群,其中德保县和隆林县的野生古茶树聚在Ⅰ类群,栽培种茶树聚在Ⅱ类群。根据遗传相似系数,也可获得上述相同的分类结果。茶树品种间的遗传相似系数为0.48~0.84,平均遗传相似系数为0.67,其中,野生古茶树种质资源间的遗传相似系数为0.68~0.84;栽培种茶树间的遗传相似系数为0.62~0.84;野生古茶树与栽培种茶树的遗传相似系数为0.48~0.77。仅德保06与其他野生古茶树(隆林42和德保01)遗传相似系数小于0.70;栽培种茶树与野生古茶树相比,仅黄观音与野生古茶树(德保01和德保G02)遗传相似系数大于0.70。【结论】广西德保县和隆林县的野生古茶树种质起源相近,与我国其他各省份的名优栽培种茶树亲缘关系较远,存在相远近亲和相近远亲共存现象,进一步证实广西德保县野生古茶树为五柱茶系的厚轴茶,推测桂西北山区广泛分布山茶属原始种系。 展开更多
关键词 野生古茶树 SSR分子标记 聚类分析 遗传相似系数 广西
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HPLC分析不同种质的黄连 被引量:5
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作者 刘芳 张浩 +1 位作者 青琳森 武勇 《华西药学杂志》 CAS CSCD 2015年第3期341-344,共4页
目的比较不同种质黄连的HPLC特征,有效区别黄连、西藏黄连、云南黄连、日本黄连等种质。方法对8种不同种质黄连样品进行HPLC指纹图谱分析及相似度评价,并测定其中7种小檗碱型生物碱的含量。结果不同种质黄连的HPLC图谱差异明显,表明黄... 目的比较不同种质黄连的HPLC特征,有效区别黄连、西藏黄连、云南黄连、日本黄连等种质。方法对8种不同种质黄连样品进行HPLC指纹图谱分析及相似度评价,并测定其中7种小檗碱型生物碱的含量。结果不同种质黄连的HPLC图谱差异明显,表明黄连具有丰富的种质多样性。结论 HPLC比较法较全面地反映了不同种质黄连的差异,可用于药材的质量控制,可为黄连属植物的分类提供依据。 展开更多
关键词 黄连 不同种质 高效液相色谱法 比较 指纹图谱 相似度 生物碱 质量控制
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