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Small hairpin RNA against Bcl-2 increases MTX-induced apoptosis in Raji cells 被引量:1
1
作者 Baoying Fang Dongmei He Yuan Zhang Li Chen 《The Chinese-German Journal of Clinical Oncology》 CAS 2009年第12期709-712,共4页
Objective:The aim of this study was to study the effect of Bcl-2 small hairpin RNA(shRNA) enhancing methotrexate(MTX)-induced apoptosis of Raji cells.Methods:Expression plasmid with Bcl-2 shRNA was transfected into Ra... Objective:The aim of this study was to study the effect of Bcl-2 small hairpin RNA(shRNA) enhancing methotrexate(MTX)-induced apoptosis of Raji cells.Methods:Expression plasmid with Bcl-2 shRNA was transfected into Raji cells by Lipofectmine 2000 and then treated with MTX.At 48 h of transfection,the expression level of Bcl-2 mRNA and protein was evaluated by RT-PCR and immunofluorescence.MTT assay was used to analyze cell proliferation at 24,48 and 72 h.Apoptosis was detected by Giemsa staining and flow cytometric cell cycle analysis.Results:After transfection with Bcl-2 shRNA,the expression levels of Bcl-2 mRNA and protein in Raji cells decreased(P < 0.05).Using Giemsa staining,cells transfected with Bcl-2 shRNA combined with MTX at 48 h displayed changes of apoptosis.MTX significantly inhibited the growth of cells after transfected with Bcl-2 shRNA(P < 0.05).Apoptotic rates of the Raji cells treated with Bcl-2 shRNA combined with MTX significantly increased(P < 0.05),compared with either control shRNA/MTX combination or MTX-treatment cells alone.Conclusion:Our results suggest the shRNA against Bcl-2 mRNA could increase MTX-induced apoptosis of Raji cells. 展开更多
关键词 BCL-2 small hairpin rna (shrna Raji cells APOPTOSIS methotrexate (MTX)
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Inhibition of hepatitis B virus surface antigen expression by small hairpin RNA in vitro 被引量:8
2
作者 Zheng-GangYang ZhiChen QinNi NingXu Jun-BinShao Hang-PingYao 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2005年第4期498-502,共5页
AIM: To explore the anti-hepatitis B virus effect of RNA interference (RNAi) using small hairpin RNA (shRNA)expression vector.METHODS: Hepatitis B virus surface antigen green fluorescent protein (HBs-GFP) fusion vecto... AIM: To explore the anti-hepatitis B virus effect of RNA interference (RNAi) using small hairpin RNA (shRNA)expression vector.METHODS: Hepatitis B virus surface antigen green fluorescent protein (HBs-GFP) fusion vector and shRNA expression vectors were constructed and cotransfected transiently into HepG2 cells. mRNAs extracted from HepG2 cells were detected by real-time PCR. Fluorescence of HBs-GFP protein was detected by fluorescence-activated cell sorting (FACS). The effective shRNA expression vector was transfected into HepG2.2.15 cells. HBsAg and HBeAg in HepG2.2.15 cells were analyzed by radioimmunoassay (RIA) method.RESULTS: FACS revealed that shRNA targeting at HBsAg reduced the GFP signal by 56% compared to the control.Real-time PCR showed that HBs-GFP mRNA extracted from HepG2 cells cotransfected with pAVU6+27 and HBs-GFP expression plasmids decreased by 90% compared to the empty vector control. The expressions of HBsAg and HBeAg were also inhibited by 43% and 64%, respectively.CONCLUSION: RNAi using shRNA expression vector can inhibit the expression of HBsAg, providing a fresh approach to screening the efficient small interfering RNAs (siRNAs). 展开更多
关键词 Hepatitis B Surface Antigens small hairpin rna rna interference Gene expression
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单纯疱疹Ⅱ型病毒UL29基因shRNA表达载体的干扰效应 被引量:7
3
作者 黄畅 潘晓瑜 +1 位作者 袁俊杰 吕延成 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2014年第5期691-694,共4页
目的:应用RNA干扰技术,针对单纯疱疹Ⅱ型病毒(HSV-2)UL29基因构建短发夹RNA重组表达载体,观察其对HSV-2的干扰效应。方法:针对HSV-2 UL29基因筛选出4条拟干扰靶位点序列,分别设计、合成4组靶向UL29基因shRNA的基因真核表达载体。通过脂... 目的:应用RNA干扰技术,针对单纯疱疹Ⅱ型病毒(HSV-2)UL29基因构建短发夹RNA重组表达载体,观察其对HSV-2的干扰效应。方法:针对HSV-2 UL29基因筛选出4条拟干扰靶位点序列,分别设计、合成4组靶向UL29基因shRNA的基因真核表达载体。通过脂质体转染到HEK293细胞。再将HSV-2接种到HEK293细胞中。采用终点滴定法检测病毒滴度,RT-PCR检测shRNA对转录水平的影响,Western-blot检测shRNA对蛋白质表达水平的影响。结果:终点滴定法结果显示UL29shRNA各组均可不同程度降低病毒感染滴度,与空白组(未转染重组表达载体)比较差异显著(P<0.01)。RT-PCR结果显示,与空白组比较,4组抑制率分别为28.80%、59.95%、66.08%、36.27%,差异均具有显著性(P<0.05),shRNANC(不针对任何基因的序列)与空白组相比差异无显著性,其中以UL29shRNA1461组效果为最佳。Western-blot检测表明UL29shRNA各组ICP8蛋白表达水平比阴性对照组明显降低。结论:UL29shRNA能有效干扰HSV-2UL29基因的表达,抑制HSV-2在HEK293细胞中的复制。 展开更多
关键词 疱疹病毒2型 rna干扰 shrna UL29基因
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慢病毒介导shRNA靶向ZNF217抑制胶质瘤细胞生长、迁移和侵袭 被引量:5
4
作者 罗起胜 黄海能 +7 位作者 邓元央 黄华东 符黄德 罗琨祥 李传玉 覃成箭 韦展亮 栗学玉 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第7期1024-1027,1033,共5页
目的探讨癌基因ZNF217对胶质瘤U251细胞迁移、侵袭以及增值的影响以及相应的分子机制。方法构建shRNAZNF217慢病毒干扰载体,在将其包装成成熟的慢病毒后感染胶质瘤U251细胞。Western blot检测ZNF217干扰效率。利用transwell、Boyden、MT... 目的探讨癌基因ZNF217对胶质瘤U251细胞迁移、侵袭以及增值的影响以及相应的分子机制。方法构建shRNAZNF217慢病毒干扰载体,在将其包装成成熟的慢病毒后感染胶质瘤U251细胞。Western blot检测ZNF217干扰效率。利用transwell、Boyden、MTT和流式细胞仪分别检测细胞迁移、侵袭、增殖以及细胞周期能力的改变。western blot检测相应基因表达改变。结果与对照细胞相比,ZNF217基因在慢病毒shRNA-ZNF217作用下,其表达水平在胶质瘤U251细胞中显著下调。Transwell和Boyden结果显示,在抑制ZNF217表达后细胞迁移和侵袭能力也明显下降。此外,MTT和流式细胞仪分析结果表明,细胞的增值和周期转化能力也明显降低。机制分析显示,在抑制ZNF271表达后,磷酸化的PI3K/AKT以及癌基因C-Myc和间质标志物N-Cadherin活性减低,而上皮标志物E-Cadherin活性增高。结论 ZNF217在胶质瘤中通过激活PI3K/AKT上调CMyc基因以及调控上皮向间质转化相关基因(Epithelial–mesenchymal transition EMT)从而促进细胞生长、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 ZNF217 胶质瘤 shrna
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tRNA^(val)-shRNA表达框在筛选HBV C基因小干扰RNA靶位中的应用 被引量:6
5
作者 潘修成 陈智 +3 位作者 倪勤 羊正纲 徐宁 金晗英 《浙江大学学报(医学版)》 CAS CSCD 2006年第2期154-160,共7页
目的:以tRNAval-shRNA表达框技术筛选高效的HBV C基因siRNA靶位。方法:针对HBV C基因序列设定5个siRNA靶位,以一步重叠延伸PCR技术生成含tRNAval启动子的shRNA表达框(SEC),分别与HBV C基因与EGFP融合表达质粒(pC-EGFP)共转染AD 293细胞... 目的:以tRNAval-shRNA表达框技术筛选高效的HBV C基因siRNA靶位。方法:针对HBV C基因序列设定5个siRNA靶位,以一步重叠延伸PCR技术生成含tRNAval启动子的shRNA表达框(SEC),分别与HBV C基因与EGFP融合表达质粒(pC-EGFP)共转染AD 293细胞,转染后48 h,流式细胞术检测融合基因荧光表达情况,半定量RT-PCR法检测HBV-C基因mRNA表达水平。以筛选的shRNA表达框转染hepG 2.2.15细胞,72 h后放免法检测细胞培养上清HbsA g、HbeA g水平,RT-PCR检测细胞HBV pgRNA水平。结果:共转染shRNA表达框能有效抑制融合表达质粒(pC-GFP)荧光强度和HBV C mRNA表达,其中SEC-492 i抑制效率最佳,而SEC-282 i相对较差。选定的492 i表达框(SEC-492 i)及282 ishRNA表达框(SEC-282 i),均呈剂量依赖性抑制hepG 2.2.15细胞HbeA g分泌和HBV pgRNA水平,其中SEC-492 i抑制HbeA g和HBV pgRNA水平明显优于SEC-282 i。结论:在选定的5个siRNA靶位中,以492 i靶位RNA i效率最高。tRNAval-shRNA表达框技术可用于抗HBV高效siRNA靶位的筛选,有进一步推广应用价值。 展开更多
关键词 肝炎病毒 乙型 基因 shrna表达框 小干扰rna 筛选 HBV C基因
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靶向 survivin 基因的 shRNA 慢病毒载体的构建及其对膀胱癌 EJ 细胞凋亡的影响 被引量:3
6
作者 陶燕 付生军 +3 位作者 洪梅 王志平 马宝良 卢建中 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期239-245,共7页
目的:构建survivin基因特异性shRNA慢病毒干扰载体,转染膀胱癌EJ细胞,研究survivin基因在膀胱癌细胞株中的表达抑制情况,观察survivin shRNA慢病毒载体对EJ细胞凋亡的影响.方法:以survivin基因为靶标设计shRNA干扰序列,克隆至p SIH1-H1-... 目的:构建survivin基因特异性shRNA慢病毒干扰载体,转染膀胱癌EJ细胞,研究survivin基因在膀胱癌细胞株中的表达抑制情况,观察survivin shRNA慢病毒载体对EJ细胞凋亡的影响.方法:以survivin基因为靶标设计shRNA干扰序列,克隆至p SIH1-H1-cop GFP慢病毒载体.干扰载体鉴定正确后转染膀胱癌细胞株EJ细胞,荧光显微镜下观察GFP表达情况,实时荧光定量PCR检测survivin基因mRNA含量变化,Western blotting法检测survivin蛋白表达,Annexin V-FITC/PI双染法检测EJ细胞凋亡情况.结果:PCR扩增鉴定、DNA测序证实survivin慢病毒干扰载体构建成功;EJ细胞经干扰载体处理后,EJ细胞survivin基因mRNA水平下调了73.33%,蛋白表达受到显著抑制,EJ细胞凋亡率达到24.39%.结论:成功构建了靶向survivin基因的shRNA重组慢病毒干扰载体,可以显著降低转染细胞survivin基因的表达水平,并有效提高膀胱癌细胞凋亡率. 展开更多
关键词 载体构建 SURVIVIN 短发卡状rna(shrna) 膀胱癌 细胞凋亡
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靶向X基因shRNA特异抑制HBV基因表达和复制 被引量:5
7
作者 孟忠吉 柯昌征 +3 位作者 汤守兵 陈悦 陆蒙吉 杨东亮 《郧阳医学院学报》 CAS 2008年第6期481-485,共5页
目的:研究针对HBV X基因小发夹RNA(shRNA)对HBV基因表达和复制的抑制作用。方法:利用分子克隆方法构建了4个HBV X基因特异性shRNA的表达质粒pshHBx1-4,与HBV复制性质粒共转染HepG2细胞,Northern和Southern印迹法检测HBV的mRNA和病毒复... 目的:研究针对HBV X基因小发夹RNA(shRNA)对HBV基因表达和复制的抑制作用。方法:利用分子克隆方法构建了4个HBV X基因特异性shRNA的表达质粒pshHBx1-4,与HBV复制性质粒共转染HepG2细胞,Northern和Southern印迹法检测HBV的mRNA和病毒复制中间体,化学发光微粒免疫分析方法检测细胞培养上清中的HBsAg和HBeAg,免疫荧光染色分析细胞HBcAg的表达水平。结果:共转染pshHBx1-4显著抑制HBV mRNA表达、降低细胞培养上清中HBsAg和HBeAg的水平和细胞内HBcAg的表达水平、并有效抑制HBV的病毒复制中间体的合成。结论:HBV X基因特异性的shRNA可以有效抑制HBV的基因表达和病毒复制,有可能发展成为新的抗HBV制剂。 展开更多
关键词 rna干扰 小干扰性rna 发夹状rna 乙型肝炎病毒 基因治疗
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应用shRNA技术研究NDRG2在人胃癌细胞SGC7901增殖中的作用 被引量:4
8
作者 裴德宁 张翊 +1 位作者 饶春明 王军志 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期1021-1025,共5页
目的:构建针对人 N-myc 下游调节基因2(NDRG2)的短发夹 RNA(shRNA)表达载体 pSNAV-shRNA,观察其在SGC7901细胞中对 NDRG2的抑制作用以及 NDRG2被抑制后细胞增殖能力的变化。方法:PCR 扩增针对 NDRG2的 shRNA 表达框架,构建 pSNAV-shRNA... 目的:构建针对人 N-myc 下游调节基因2(NDRG2)的短发夹 RNA(shRNA)表达载体 pSNAV-shRNA,观察其在SGC7901细胞中对 NDRG2的抑制作用以及 NDRG2被抑制后细胞增殖能力的变化。方法:PCR 扩增针对 NDRG2的 shRNA 表达框架,构建 pSNAV-shRNA 质粒,转染 SGC7901细胞,通过 RT-PCR,免疫印迹试验检测其对 NDRG2表达的影响;通过细胞周期分析,软琼脂集落形成试验检测细胞增殖能力的变化。结果:将构建好的 pSNAV-shRNA 质粒转染 SGC7901细胞后,NDRG2的表达受到明显的抑制,细胞周期 G1期阻滞,集落形成能力降低。结论:构建的 pSNAV-shRNA 质粒能够有效抑制NDRG2在 SGC7901细胞中的表达,降低 SGC7901细胞的增殖能力。 展开更多
关键词 rna干扰 短发夹rna(shrna) 人N-myc下游调节基因2(NDRG2) 胃肿瘤
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串联表达Fas shRNA腺病毒载体的构建 被引量:2
9
作者 刘明社 赵中夫 +4 位作者 王兰 张国英 张芸 杨慧 封江南 《中国药物与临床》 CAS 2006年第11期826-830,共5页
目的利用串联表达质粒pEGFP6-1-siFas1+siFas2和BDAdeno-X系统构建腺病毒表达Fas-shRNA载体。方法双酶切pEGFP6-1-siFas1+siFas2串联表达质粒和pShuttle2质粒,T4DNA连接酶连接胶回收片段,转化感受态Escherichiacoli(E.coli)DH5α菌株,... 目的利用串联表达质粒pEGFP6-1-siFas1+siFas2和BDAdeno-X系统构建腺病毒表达Fas-shRNA载体。方法双酶切pEGFP6-1-siFas1+siFas2串联表达质粒和pShuttle2质粒,T4DNA连接酶连接胶回收片段,转化感受态Escherichiacoli(E.coli)DH5α菌株,挑取单克隆菌落LB(Luria-Bertani)培养基中扩增培养;小量质粒试剂盒提取pShuttle2-siFas1+siFas2质粒,酶切鉴定;双酶切pShuttle2-siFas1+siFas2质粒,T4DNA连接酶连接酶切产物和腺病毒BDAdeno-XViralDNA。回收连接产物,SwaI酶切去除未重组的腺病毒质粒,再回收酶切产物,转化感受态E.coliDH5α;聚合酶链反应(PCR)筛选鉴定阳性克隆;提取pAdeno-siFas1+siFas2质粒,进一步酶切鉴定;重组腺病毒pAdeno-siFas1+siFas2质粒线性化,经脂质体转染HEK293A细胞;收细胞进行裂解收病毒。结果构建表达2个Fas-shRNA的串联重组腺病毒载体pAdeno-siFas1+siFas2,经酶切鉴定和PCR分析,重组腺病毒质粒构建正确;经HEK293A细胞包装成功。结论成功构建表达2个Fas-shRNA的串联重组腺病毒载体pAdeno-siFas1+siFas2,为进一步转染细胞和感染小鼠抑制Fas基因表达奠定了基础。 展开更多
关键词 抗原 CD95 shrna(Short hairpin rna) 腺病毒科
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PCR扩增的shRNA表达盒快速筛选PRRSV有效siRNA序列 被引量:3
10
作者 贺云霞 华荣虹 +4 位作者 周艳君 安同庆 仇华吉 王云峰 童光志 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期376-380,共5页
有效siRNA的筛选是RNAi研究的关键点之一。本研究选取猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的核衣壳蛋白(N)作为靶基因,使用http://www.ambion.com的靶位点筛选和设计工具,选取4个siRNA序列(siRNA95、siRNA179、siRNA218和siRNA294),利用一步... 有效siRNA的筛选是RNAi研究的关键点之一。本研究选取猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的核衣壳蛋白(N)作为靶基因,使用http://www.ambion.com的靶位点筛选和设计工具,选取4个siRNA序列(siRNA95、siRNA179、siRNA218和siRNA294),利用一步PCR法产生包含U6启动子的短发夹RNA表达盒技术快速筛选高效siRNA,PCR法制备的shRNA表达盒(PCR-shRNA95、PCR-shRNA179、PCR-shRNA218和PCR-shRNA294)分别与表达N-EGFP融合蛋白的重组质粒pEN-ORF7共转染至293T细胞,48 h后荧光显微镜下检测细胞表达EGFP阳性率,筛选有效siRNA片段,将筛选的PCR-shRNA179的PCR产物转染N-EGFP融合蛋白稳定表达293T细胞系和PRRSV感染的Marc-145细胞,结果表明PCR-shRNA179可明显减少N蛋白的表达、有效减轻PRRSV引起的细胞病变及减少感染PRRSV的Marc-145细胞中的N蛋白阳性细胞。本研究证明一步PCR扩增shRNA表达盒法可用于筛选特异性基因表达抑制的siRNA。 展开更多
关键词 rna干扰 SIrna 短发夹rna(shrna) 猪繁殖与呼吸综合征病毒
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载体介导的shRNA抑制猪瘟病毒在PK-15细胞中增殖特性的研究 被引量:5
11
作者 冶贵生 张彦明 徐浩 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第5期500-505,共6页
利用生物学软件分析猪瘟病毒NS3基因,设计针对NS3基因不同位置的干扰序列,化学合成这些序列,然后退火连接为双链干扰片段,再定向克隆到干扰载体中,将酶切和序列测定鉴定正确的重组载体命名为pGene-NS3-1、pGene-NS3-2、pGene-NS3-3、pGe... 利用生物学软件分析猪瘟病毒NS3基因,设计针对NS3基因不同位置的干扰序列,化学合成这些序列,然后退火连接为双链干扰片段,再定向克隆到干扰载体中,将酶切和序列测定鉴定正确的重组载体命名为pGene-NS3-1、pGene-NS3-2、pGene-NS3-3、pGene-NS3-Negative。重组干扰载体经纯化后转染PK-15细胞,并进行G418抗性筛选。克隆细胞扩大培养后,接种猪瘟病毒Shimen株,收集细胞分别进行实时定量PCR和ELISA光吸收度分析。Real-time PCR分析表明,与对照细胞比较,pGene-NS3-1、pGene-NS3-2、pGene-NS3-3转录产生的shRNA分子均在一定程度上沉默了病毒的基因,抑制率约为63%、46%、49%。ELISA检测结果表明,转染pGene-NS3-1、pGene-NS3-2、pGene-NS3-3重组载体的PK-15细胞均在不同程度上抑制了猪瘟病毒粒子的增殖。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 rnaI NS3基因 shrna PK-15细胞
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大鼠STAT3基因靶向shRNA真核表达载体的构建及鉴定 被引量:2
12
作者 张五星 周伟 +5 位作者 赵学伟 丁晓然 周喆 张智敏 周焕芝 石炳毅 《山东医药》 CAS 北大核心 2010年第17期13-15,共3页
目的针对大鼠信号转导子及转录激活子3(STAT3)基因序列,构建特异性短发夹状RNA(shRNA)真核表达载体。方法根据STAT3基因序列及shRNA设计原则,设计4条干扰效果最佳的shRNA,化学合成4对引物,通过PCR扩增获得dsDNA模板,采用DNA重组技术与pG... 目的针对大鼠信号转导子及转录激活子3(STAT3)基因序列,构建特异性短发夹状RNA(shRNA)真核表达载体。方法根据STAT3基因序列及shRNA设计原则,设计4条干扰效果最佳的shRNA,化学合成4对引物,通过PCR扩增获得dsDNA模板,采用DNA重组技术与pGCsi-U6/Hygro/GFP空载体连接,转化DH5a感受态细胞经诱导表达筛选阳性克隆子,抽提重组质粒,进行DNA测序鉴定。结果转化大肠杆菌涂布平板长出阳性菌落,测序结果与所设计的STAT3 shRNA转录模板序列一致。结论所设计的shRNA编码序列被正确地插入到质粒骨架中,成功构建了STAT3基因的shRNA表达载体。 展开更多
关键词 信号转导子及转录激活子3 短发夹rna 质粒 rna干扰
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Skp2 shRNA表达质粒的构建及其对肺癌细胞生长的影响 被引量:3
13
作者 李胜 梅同华 +1 位作者 黎联 张明川 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第13期1275-1278,共4页
目的构建Skp2基因的RNAi真核表达质粒,观察其对SPC-A-1肺癌细胞内Skp2基因表达及细胞生长的影响。方法根据GenBank中Skp2cDNA序列设计针对Skp2基因的shRNA序列,合成序列并克隆入pGenSil-1质粒中,构建Skp2 pshRNA重组质粒。脂质体介导重... 目的构建Skp2基因的RNAi真核表达质粒,观察其对SPC-A-1肺癌细胞内Skp2基因表达及细胞生长的影响。方法根据GenBank中Skp2cDNA序列设计针对Skp2基因的shRNA序列,合成序列并克隆入pGenSil-1质粒中,构建Skp2 pshRNA重组质粒。脂质体介导重组质粒转染SPC-A-1肺癌细胞。RT-PCR检测肺癌细胞Skp2 mRNA的表达,Western blot检测Skp2蛋白表达。MTT检测各组细胞生长情况,流式细胞仪检测细胞周期改变。结果重组质粒经酶切鉴定和测序,证实表达干扰质粒构建成功。转染重组质粒的肺癌细胞Skp2 mRNA和蛋白的表达明显下降(P<0.05),细胞生长增殖受到抑制,阻滞在G0/G1期的细胞比例增加,而进入S期的细胞比例明显下降(P<0.05)。结论构建的Skp2 shRNA表达质粒能有效下调Skp2基因的mRNA及蛋白的表达、抑制细胞的生长增殖。 展开更多
关键词 SKP2基因 rna干扰 短发夹rna 肺癌细胞
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靶向猪瘟病毒NS3基因shRNA干扰载体的构建与鉴定 被引量:3
14
作者 冶贵生 张彦明 +1 位作者 徐浩 郭抗抗 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2007年第3期7-10,共4页
利用RNA干扰在线生物学软件分析猪瘟病毒NS3基因,设计针对NS3基因不同位置的小发卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)干扰序列(其结构特征为正链(19nt)-环(9nt)-负链(19nt))。化学合成这些序列,并退火连接为双链干扰片段,将双链干扰片段定... 利用RNA干扰在线生物学软件分析猪瘟病毒NS3基因,设计针对NS3基因不同位置的小发卡RNA(short hairpin RNA,shRNA)干扰序列(其结构特征为正链(19nt)-环(9nt)-负链(19nt))。化学合成这些序列,并退火连接为双链干扰片段,将双链干扰片段定向克隆到干扰载体中,构建重组载体pGene-NS3-1,pGene-NS3-2和pGene-NS3-3,转化DH5α大肠杆菌感受态细胞,对转化产物进行kan+筛选,碱裂解法提取重组质粒,将酶切鉴定为阳性的质粒测序。结果显示,双链干扰片段克隆方向正确,序列中未出现核苷酸的插入,缺失等突变现象。表明靶向猪瘟病毒NS3基因shRNA干扰载体构建成功。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 NS3基因 rna干扰 小发卡rna
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携带CIP2A shRNA重组腺相关病毒载体的构建及其鉴定 被引量:2
15
作者 杨雪 宋涛 +3 位作者 陶杰 孙昊 杨威 刘青光 《西安交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2015年第6期743-748,共6页
目的构建携带CIP2AshRNA重组腺相关病毒载体,制备靶向性沉默CIP2A表达的高浓度重组腺相关病毒。方法设计合成CIP2AshRNA,退火形成双链与pDC316-EGFP-U6质粒BamHⅠ和HindⅢ双酶切产物相连接构建形成质粒pDC316-EGFP-CIP2AshRNA,以鉴定正... 目的构建携带CIP2AshRNA重组腺相关病毒载体,制备靶向性沉默CIP2A表达的高浓度重组腺相关病毒。方法设计合成CIP2AshRNA,退火形成双链与pDC316-EGFP-U6质粒BamHⅠ和HindⅢ双酶切产物相连接构建形成质粒pDC316-EGFP-CIP2AshRNA,以鉴定正确的pDC316-EGFP-CIP2AshRNA克隆为模板PCR扩增EGFPCIP2AshRNA片段,EcoRⅠ和SalⅠ双酶切PCR扩增产物及pSNAV2.0质粒后进行连接形成重组质粒pSNAV2.0-EGFP-CIP2AshRNA,建立载体细胞株BHK/CIP2A-shRNA,采用AAV MaxTM包装系统大规模制备rAAV2-EGFPCIP2AshRNA并对其纯化及滴度测定。将rAAV2-EGFP-CIP2AshRNA感染肝癌细胞HepG2,利用空载病毒载体rAAV2-EGFP作对照,采用Real-time PCR及Western blot方法检测CIP2AshRNA基因沉默效果。结果携带编码CIP2AshRNA腺相关病毒载体质粒pSNAV2.0-EGFP-CIP2AshRNA经双酶切及测序鉴定,质粒构建正确;将重组质粒与辅助病毒HSV1-rc/ΔUL2共转染包装细胞BHK-21,成功制备重组腺相关病毒rAAV2-CIP2AshRNA,经测定纯化所得rAVV2病毒滴度为0.25×1012v.g./mL。筛选MOI值为1×105感染肝癌细胞HepG2,CIP2A mRNA及蛋白表达水平分别于感染后24h和48h与对照细胞相比出现明显下降。结论成功制备高滴度携带CIP2AshRNA重组腺相关病毒载体rAAV2-CIP2AshRNA。 展开更多
关键词 CIP2A rna干扰 重组腺相关病毒 短发卡rna
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shRNA干扰VEGF的表达对宫颈癌SiHa细胞凋亡的影响 被引量:7
16
作者 魏星 邢丽娜 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2011年第5期385-388,共4页
目的利用RNA干扰技术抑制S iHa细胞中血管内皮生长因子(VEGF)的基因表达,探讨其对肿瘤细胞凋亡的诱导作用。方法设计针对VEGF的两种短发夹RNA(shRNA),分别构建PGPU6/GFP/Neo-VEGF重组质粒表达载体,命名为pv1、pv2。利用脂质体将质粒转... 目的利用RNA干扰技术抑制S iHa细胞中血管内皮生长因子(VEGF)的基因表达,探讨其对肿瘤细胞凋亡的诱导作用。方法设计针对VEGF的两种短发夹RNA(shRNA),分别构建PGPU6/GFP/Neo-VEGF重组质粒表达载体,命名为pv1、pv2。利用脂质体将质粒转染入人宫颈癌S iHa细胞,采用RT-PCR方法检测VEGF mRNA的变化情况。筛选出抑制率较高的质粒进行下一步实验;转染后,用流式细胞术检测细胞凋亡。结果 pv1、pv2对VEGF mRNA均有显著的抑制作用,抑制率分别为(82.17±4.45)%和(64.55±3.80)%,显著高于阴性对照组的(7.63±4.13)%(P<0.05)。pv1转染组的细胞凋亡率为(47.85±4.65)%,明显高于阴性对照组的(17.76±2.12)%和空白对照组的(19.66±3.74)%(P<0.01)。结论 RNA干扰技术可以有效沉默人宫颈癌细胞株S iHa中VEGF mRNA的表达,并可诱导宫颈癌细胞凋亡。 展开更多
关键词 短发夹rna VEGF 宫颈癌 SIHA细胞 凋亡
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S1P2受体shRNA腺病毒载体的构建及筛选 被引量:2
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作者 闾宏伟 陈淑华 +3 位作者 阳国平 朱晒红 邓昊 邢晓为 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2009年第5期513-516,共4页
目的为探讨S1P2受体介导血管内皮细胞衰老的机制,构建和筛选特异性S1P2受体shRNA腺病毒载体。方法设计并合成4对靶向S1P2受体的单链寡核苷酸(ssoligo),经变性退火为双链寡核苷酸(dsoligo)插入穿梭质粒pRNAT-H1.1/Shuttle载体,测序正确... 目的为探讨S1P2受体介导血管内皮细胞衰老的机制,构建和筛选特异性S1P2受体shRNA腺病毒载体。方法设计并合成4对靶向S1P2受体的单链寡核苷酸(ssoligo),经变性退火为双链寡核苷酸(dsoligo)插入穿梭质粒pRNAT-H1.1/Shuttle载体,测序正确后经脂质体介导转染人肺动脉内皮细胞(HPAEC),通过RT-PCR方法筛选对S1P2受体基因沉默效果最佳的穿梭质粒pRNAT-H1.1/Shuttle-shRNA,提取质粒DNA,经双酶切,回收S1P2受体基因沉默效果最佳的shRNA片段,亚克隆到腺病毒表达载体(pAdeno-X),筛选出正确重组子,转染HEK293A细胞,收集重组的腺病毒,测定病毒滴度,通过Westernblot方法检测S1P2受体沉默效果。结果测序结果证实所构建的pRNAT-H1.1/Shuttle-shRNA质粒正确,并从4对dsoligos筛选出对S1P2受体沉默效果最佳的穿梭质粒pRNAT-H1.1/Shuttle-shRNA,经亚克隆到腺病毒表达载体。转染人肺动脉内皮细胞后,Western印迹检测显示构建的腺病毒载体pAdeno-shRNA对S1P2受体蛋白的沉默有明显效果。结论成功地构建和筛选出介导特异性shRNA-S1P2的重组腺病毒。 展开更多
关键词 重组腺病毒 S1P2受体 短发夹rna 人肺动脉内皮细胞
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shRNA抑制人RPE细胞HIF-1α基因表达对VEGF及PEDF表达的影响 被引量:7
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作者 吕明良 曾水清 +2 位作者 肖青 李敏 夏辉 《眼科研究》 CSCD 北大核心 2007年第9期688-691,共4页
目的利用小发卡环RNA(shRNA)使缺氧培养条件下的人视网膜色素上皮(RPE)细胞缺氧诱导因子1α(HIF-1α)基因沉默,观察对血管内皮生长因子(VEGF)及色素上皮衍生因子(PEDF)的影响。方法体外转录法合成对HIF-1αmRNA序列的两个靶点的shRNA,... 目的利用小发卡环RNA(shRNA)使缺氧培养条件下的人视网膜色素上皮(RPE)细胞缺氧诱导因子1α(HIF-1α)基因沉默,观察对血管内皮生长因子(VEGF)及色素上皮衍生因子(PEDF)的影响。方法体外转录法合成对HIF-1αmRNA序列的两个靶点的shRNA,对缺氧(150μmol/L CoCl2模拟)培养条件下人RPE细胞的HIF-1α进行干扰,使用RT-PCR检测HIF-1α、VEGF和PEDF mRNA的表达及Western印迹分析检测HIF-1α、VEGF和PEDF蛋白水平。结果HIF-1αmRNA的两种shRNA均能有效地抑制RPE细胞在缺氧条件下HIF-1α的表达,同时也有效地抑制VEGFmRNA和蛋白表达,并促进PEDF蛋白表达,但对PEDF mRNA的表达无影响。结论HIF-1αmRNA的shRNA能有效地使缺氧条件下RPE细胞HIF-1α基因沉默,进而有效地抑制缺氧对VEGF的上调作用,同时也促进PEDF表达。揭示了HIF-1与缺氧条件下PEDF翻译后的下调机制有关,是促进视网膜新生血管形成最为关键的细胞因子之一。 展开更多
关键词 shrna 缺氧诱导因子-1Α 血管内皮生长因子 色素上皮衍生因子 缺氧
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shRNA干扰BAMBI对非小细胞肺癌生长、侵袭和迁移的调控作用 被引量:6
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作者 王学中 刘志广 刘平 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第16期1970-1975,共6页
目的:探究shRNA干扰骨形成蛋白和激活素的穿膜抑制剂(BAMBI)对非小细胞肺癌A549细胞生长、侵袭和迁移的影响及其潜在的分子机制。方法:构建shRNA BAMBI质粒和shRNA scramble载体。将构建好的质粒转染A549细胞后,实时定量PCR(qRT-PCR)和... 目的:探究shRNA干扰骨形成蛋白和激活素的穿膜抑制剂(BAMBI)对非小细胞肺癌A549细胞生长、侵袭和迁移的影响及其潜在的分子机制。方法:构建shRNA BAMBI质粒和shRNA scramble载体。将构建好的质粒转染A549细胞后,实时定量PCR(qRT-PCR)和蛋白质印迹检测转染效果;细胞计数试剂盒8(CCK-8)检测细胞增殖;流式细胞术检测细胞凋亡情况;划痕实验检测细胞迁移能力;体外侵袭实验检测细胞侵袭能力;蛋白质印迹检测Ki67、Bax、cl-caspase-3、血管内皮生长因子(VEGF)和基质金属蛋白酶9(MMP-9)的表达;蛋白质印迹检测TGF-β、Smad2和磷酸化Smad2的表达。构建移植瘤裸鼠,检测肿瘤体积、细胞凋亡和VEGF的表达水平。结果:转染后shRNA BAMBI组细胞中BAMBI的mRNA和蛋白水平均明显低于Scramble组。与Scramble组相比,shRNA BAMBI组细胞增殖倍数显著降低;凋亡细胞比率显著增加;划痕愈合率显著降低;侵袭细胞数目显著减少;Ki67、VEGF、MMP-9的蛋白表达水平显著降低,Bax的表达水平显著增加;TGF-β的表达水平和p-Smad2/Smad2的比值均显著升高。动物实验结果显示,与Scramble组相比,shRNA BAMBI组肿瘤体积明显减少,细胞凋亡比率显著增加,VEGF的表达水平显著降低。结论: shRNA干扰BAMBI抑制非小细胞肺癌增殖、侵袭和迁移并诱导细胞凋亡,其作用机制可能与TGF-β/Smad2信号通路的激活相关。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 短发夹rna 骨形成蛋白和激活素的穿膜抑制剂 增殖 侵袭 迁移
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UL27、UL29基因shRNA表达载体的构建及对HSV-2的干扰效应研究 被引量:2
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作者 吕延成 潘晓瑜 +1 位作者 黄畅 丁娟 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期202-209,共8页
探讨Ⅱ型单纯疱疹病毒(Herpes simplex virus type 2,HSV-2)UL27、UL29基因联合靶向siRNA对HSV-2复制的影响。构建UL27、UL29基因的siRNA的重组表达载体并转染293细胞,通过实时荧光定量PCR技术和蛋白质印迹方法检测UL27、UL29基因的表达... 探讨Ⅱ型单纯疱疹病毒(Herpes simplex virus type 2,HSV-2)UL27、UL29基因联合靶向siRNA对HSV-2复制的影响。构建UL27、UL29基因的siRNA的重组表达载体并转染293细胞,通过实时荧光定量PCR技术和蛋白质印迹方法检测UL27、UL29基因的表达,终点滴定法检测细胞上清液中的各组病毒滴度,MTT法检测细胞的存活率。结果显示:(1)成功构建短发夹RNA(shRNA)重组表达载体。(2)转染后48 h,与空白组(空载体)相比,UL27 shRNA75组对UL27基因mRNA的抑制率为75.17%(P<0.05),UL29 shRNA1461组对UL29基因mRNA抑制率为66.08%,具有显著性差异(P<0.05)。UL27 shRNA75联合UL29 shRNA1461联合干扰组对UL27基因抑制率约为91.28%,UL29基因表达抑制率约为80.40%,与空白组比较具有显著性差异(P<0.05)。(3)终点滴定法结果显示单干扰组和联合干扰组可不同程度降低上清液中的病毒感染滴度,与空白组比较差异性显著(P<0.01)。(4)Western blot检测目的基因蛋白,单干扰组与联合干扰组可不同程度降低目的基因蛋白的表达,其中UL27shRNA75+UL29 shRNA1461联合干扰组能显著抑制相应的蛋白表达水平,蛋白表达量明显减少,与单干扰组相比具有显著差异(P<0.05)。(5)经MTT法检测,UL27 shRNA75、UL29 shRNA1461、UL27 shRNA75+UL29 shRNA1461联合干扰组的细胞存活率明显提高,差异有显著意义(P<0.05)。构建的pGPU6/GFP/Neo-UL27、pGPU6/GFP/Neo-UL29重组表达载体,能在体外细胞水平上不同程度的干扰HSV-2 UL27、UL29基因表达,UL27、UL29联合干扰效率更高,抑制HSV-2在HEK293细胞中复制。 展开更多
关键词 rna干扰 短发夹rna Ⅱ型单纯疱疹病毒 UL27基因 UL29基因
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