期刊文献+
共找到7篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
Phylogenetic Diversity of Microorganisms from Chemocline of the Meromictic Soda Lake Doroninskoe(Zabaikalie,Russia) 被引量:1
1
作者 Evgeniya MATYUGINA Natalia BELKOVA 《Acta Geologica Sinica(English Edition)》 SCIE CAS CSCD 2014年第S1期153-154,共2页
1 Introduction Many soda and salt lakes are characterized by the formation of the meromictic conditions under which a part of the water column is not involved in the annual process of mixing(Mac Intyre,Melack,1982).Th... 1 Introduction Many soda and salt lakes are characterized by the formation of the meromictic conditions under which a part of the water column is not involved in the annual process of mixing(Mac Intyre,Melack,1982).This creates an 展开更多
关键词 Diversity soda Lake Meromixis Lake Doroninskoe 16S r RNA gene Phylogeny.
下载PDF
无乳链球菌sodA基因的克隆、序列分析及原核表达载体构建 被引量:3
2
作者 王松艳 蔡双虎 +2 位作者 鲁义善 简纪常 吴灶和 《广东海洋大学学报》 CAS 2016年第3期15-19,共5页
无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是引起我国南方罗非鱼链球菌病的主要病原之一,SodA是无乳链球菌重要的毒力因子之一。根据链球菌sod A基因保守区设计引物,采用PCR扩增sod A基因部分序列,反向PCR和巢式PCR扩增其侧翼序列,成功获... 无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)是引起我国南方罗非鱼链球菌病的主要病原之一,SodA是无乳链球菌重要的毒力因子之一。根据链球菌sod A基因保守区设计引物,采用PCR扩增sod A基因部分序列,反向PCR和巢式PCR扩增其侧翼序列,成功获得无乳链球菌sod A基因。无乳链球菌sod A基因序列全长为699 bp,含开放阅读框609 bp,可编码202个氨基酸,演绎的SodA蛋白主要由α螺旋和不规则卷曲构成。BLAST分析表明,该蛋白氨基酸序列与犬链球菌(S.canis)及副乳房链球菌(S.parauberis)相应蛋白的氨基酸序列相似性分别高达80%和79%。将sodA基因克隆至原核表达载体pET28a上成功构建了重组质粒p ET28a-sod A,导入Escherichia coli BL21(DE3),诱导表达的重组蛋白质分子质量约为24 ku,主要以包涵体形式存在于表达菌中。 展开更多
关键词 无乳链球菌 soda基因 克隆 原核表达
下载PDF
羊源多杀性巴氏杆菌sodA基因的克隆、表达及其生物信息学分析 被引量:4
3
作者 安琪 黄海峰 +10 位作者 张振兴 李宝宝 张萌萌 郑义盈 王成强 章泸尹 杨小健 曹瑞勇 聂鑫 杜丽 王凤阳 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2018年第8期2067-2075,共9页
为了解羊源多杀性巴氏杆菌超氧化物歧化酶(SOD)的生物学功能,本试验对该菌sodA基因进行克隆及原核表达,并对克隆的sodA基因进行遗传进化树分析,对其表达的SOD蛋白进行生物信息学分析。参照GenBank中多杀性巴氏杆菌HN06株基因组中sodA基... 为了解羊源多杀性巴氏杆菌超氧化物歧化酶(SOD)的生物学功能,本试验对该菌sodA基因进行克隆及原核表达,并对克隆的sodA基因进行遗传进化树分析,对其表达的SOD蛋白进行生物信息学分析。参照GenBank中多杀性巴氏杆菌HN06株基因组中sodA基因序列信息设计引物进行PCR扩增,将产物与pET-28a(+)载体相连,构建pET-28a(+)-sodA重组质粒,将该质粒转化E.coli DH5α感受态细胞进行克隆,再转化E.coli BL21(DE3)感受态细胞进行表达,经IPTG诱导后对表达蛋白进行SDS-PAGE和Western blotting鉴定分析。结果显示,本试验成功扩增出大小为645bp的目的片段,并表达出大小约28ku的目的蛋白。遗传进化树分析表明,该基因与HN07(GenBank登录号:CP007040.1)和Pm70(GenBank登录号:AE004439.1)株亲缘关系较近,重组蛋白生物信息学分析显示,该融合蛋白为稳定的酸性亲水可溶性蛋白,分子式为C1085H1651N293O309S9,分子质量为24 032.36u,理论等电点为6.19,消光系数为45 170,不稳定系数为26.87(<40),在哺乳动物网织红细胞的半衰期预计为30h,疏水指数为82.15,总平均疏水性(GRAVY)为-0.282,二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。以上研究结果为后续深入研究多杀性巴氏杆菌在羊体内的存活机制及研发预防巴氏杆菌病的疫苗提供了参考。 展开更多
关键词 多杀性巴氏杆菌 soda基因 克隆 原核表达 遗传进化树分析 生物信息学分析
下载PDF
发病罗非鱼苗沃氏葡萄球菌的分离与鉴定 被引量:6
4
作者 李晓陀 陈秦 +5 位作者 廖承红 郭桂英 李祥 贾晓琳 郑继平 俞集楠 《热带生物学报》 2013年第1期7-10,24,共5页
为检测发病罗非鱼苗中可能存在的潜在病原感染,保证投放鱼苗的健康安全,对海口市发病罗非鱼苗进行了菌种分离。结果发现,在发病鱼苗中存在葡萄球菌,经16S rRNA基因序列测定,显示该菌与沃氏葡萄球菌和巴斯德葡萄球菌高度相似,后经超氧(化... 为检测发病罗非鱼苗中可能存在的潜在病原感染,保证投放鱼苗的健康安全,对海口市发病罗非鱼苗进行了菌种分离。结果发现,在发病鱼苗中存在葡萄球菌,经16S rRNA基因序列测定,显示该菌与沃氏葡萄球菌和巴斯德葡萄球菌高度相似,后经超氧(化)物歧化酶sodA基因PCR分析,确认为沃氏葡萄球菌。 展开更多
关键词 罗非鱼 沃氏葡萄球菌 16S RRNA soda
下载PDF
凝固酶阴性葡萄球菌超氧化物歧化酶基因研究
5
作者 刘妮妮 姜美娟 +2 位作者 王华强 栾晓红 梁冰 《实用医药杂志》 2010年第4期360-362,共3页
目的研究凝固酶阴性的葡萄球菌(CoNS)超氧化物歧化酶(sodA)基因在不同菌种中的表达,寻找相关的特异基因序列。方法对116株CoNS标本进行菌种鉴定,采用聚合酶链反应进行sodA基因及icaD基因片段扩增,选取有代表性的菌株经克隆后测序并进行... 目的研究凝固酶阴性的葡萄球菌(CoNS)超氧化物歧化酶(sodA)基因在不同菌种中的表达,寻找相关的特异基因序列。方法对116株CoNS标本进行菌种鉴定,采用聚合酶链反应进行sodA基因及icaD基因片段扩增,选取有代表性的菌株经克隆后测序并进行分析。结果CoNS的DNA序列分析未发现与致病性相关的序列差异。结论sodA基因不适合作为致病性与非致病性CoNS鉴别的生物标记,但可以作为鉴定CoNS的一个基因标记。 展开更多
关键词 凝固酶阴性的葡萄球菌 超氧化物歧化酶(soda)基因 生物标记
下载PDF
Vertical Distribution of Bacteria in Doroninskoe Lake(Zabaikalie,Russia):Paradigm of Dominance
6
作者 Natalia BELKOVA Evgeniya MATYUGINA 《Acta Geologica Sinica(English Edition)》 SCIE CAS CSCD 2014年第S1期53-55,共3页
1 Introduction Prokaryotes are key organisms in aquatic ecosystems as they play animportant role in the biogeochemical cycling of elements.Investigations on the relationships betweenthe diversity of microbial communit... 1 Introduction Prokaryotes are key organisms in aquatic ecosystems as they play animportant role in the biogeochemical cycling of elements.Investigations on the relationships betweenthe diversity of microbial community and environmentalfactors offer useful information that bothleads to understanding of the process of element 展开更多
关键词 soda Lake Doroninskoe Bacterial Diversity 16S rRNA gene High-Throughput AmpliconSequencing
下载PDF
溶血曼氏杆菌微滴式数字PCR定量检测方法的建立及应用
7
作者 王金凤 高雅欣 +5 位作者 姜彦芬 孙晓霞 刘立兵 刘岳林 袁万哲 王建昌 《中国口岸科学技术》 2023年第1期74-81,共8页
基于溶血曼氏杆菌(Mannheimia haemolytica,M.haemolytica)单拷贝基因sodA,通过优化反应条件和体系,建立了溶血曼氏杆菌ddPCR(droplet digital polymerase chain reaction,ddPCR)定量检测方法。结果显示,所建立的溶血曼氏杆菌ddPCR方法... 基于溶血曼氏杆菌(Mannheimia haemolytica,M.haemolytica)单拷贝基因sodA,通过优化反应条件和体系,建立了溶血曼氏杆菌ddPCR(droplet digital polymerase chain reaction,ddPCR)定量检测方法。结果显示,所建立的溶血曼氏杆菌ddPCR方法特异性好;检出限(limit of detection,LOD)和定量值(limit of quantification,LOQ)均为170 CFU/m L,3个平行检测的变异系数均小于25%,重复性良好。针对系列稀释的溶血曼氏杆菌纯菌液,ddPCR法能够实现对溶血曼氏杆菌的准确定量,与平板计数结果偏差小于4%。运用所建立的ddPCR方法对15份牛鼻拭子样品进行检测,结果在10份样品中检出溶血曼氏杆菌,含量在3.07×10^(2)~9.52×10^(4)CFU/mL之间。本研究所建立的ddPCR方法适用于临床鼻拭子样品中溶血曼氏杆菌的精准定量分析,可为牛群中溶血曼氏杆菌的监测和治疗提供有效的技术支持。 展开更多
关键词 溶血曼氏杆菌 单拷贝基因soda 微滴式数字PCR 平板计数 定量检测
原文传递
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部