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The isolation and identification of apolipoprotein C-I in hormone-refractory prostate cancer using surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry 被引量:3
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作者 Kaori Yamamoto-Ishikawa Hiroyoshi Suzuki +7 位作者 Masahiko Nezu Naoto Kamiya Takashi Imamoto Akira Komiya Kazuyuki Sogawa Takeshi Tomonaga Fumlo Nomur Tomohiko Ichikawa 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2009年第3期299-307,共9页
Androgens play a central role in prostate cancer pathogenesis, and hence most of the patients respond to androgen deprivation therapies. However, patients tend to relapse with aggressive prostate cancer, which has bee... Androgens play a central role in prostate cancer pathogenesis, and hence most of the patients respond to androgen deprivation therapies. However, patients tend to relapse with aggressive prostate cancer, which has been termed as hormone refractory. To identify the proteins that mediate progression to the hormone-refractory state, we used protein-chip technology for mass profiling of patients' sera. This study included 16 patients with metastatic hormone-refractory prostate cancer who were initially treated with androgen deprivation therapy. Serum samples were collected from each patient at five time points: point A, pre-treatment; point B, at the nadir of the prostate- specific antigen (PSA) level; point C, PSA failure; point D, the early hormone-refractory phase; and point E, the late hormone-refractory phase. Using surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry, we performed protein mass profiling of the patients' sera and identified a 6 640-Da peak that increased with disease progression. Target proteins were partially purified, and by amino acid sequencing the peak was identified as a fragment of apolipoprotein C-I (ApoC-I). Serum ApoC-I protein levels increased with disease progression. On immunohistochemical analysis, the ApoC-i protein was found localized to the cytoplasm of the hormone-refractory cancer cells. In this study, we showed an increase in serum ApoC-I protein levels in prostate cancer patients during their progression to the hormone-refractory state, which suggests that ApoC-I protein is related to progression of prostate cancer. However, as the exact role of ApoC-I in prostate cancer pathogenesis is unclear, further research is required. 展开更多
关键词 apolipoprotein C-I hormonal therapy PROGNOSIS prostate cancer surface-enhanced laser desorption/ionization time-offlight mass spectrometry
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Two-dimensional gel electrophoresis and surface-enhanced laser desorption ionization-time of flight-mass spectrometry for detection of protein expression profiles in the hippocampus following closed brain injury 被引量:2
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作者 Qingming Shu Zhiqiang Li +3 位作者 Shuwang Yang Lingzhi Li Xiao Bai Yongliang Zhang 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2010年第23期1795-1801,共7页
Gene expression profile changes in brain regions following traumatic brain injury at the gene level cannot sufficiently elucidate gene expression time, expression amount, protein post-translational processing or modif... Gene expression profile changes in brain regions following traumatic brain injury at the gene level cannot sufficiently elucidate gene expression time, expression amount, protein post-translational processing or modification. Therefore, it is necessary to quantitatively analyze the gene expression profile using proteomic techniques. In the present study, we established a rat model of closed brain injury using Marmarou's weight-drop device, and investigated hippocampal differential protein expression using two-dimensional gel electrophoresis and surface-enhanced laser desorption ionization-time of flight-mass spectrometry. A total of 364 protein peaks were detected on weak cation exchange-2 protein chips, including 37 differential protein peaks. 345 protein peaks were detected on immobilized metal affinity capture arrays-Cu, including 12 differential protein peaks Further examination of these differential proteins revealed that glucose-regulated protein and proteasome subunit alpha type 3 expression were significantly upregulated post-injury. These results indicate that brain injury can alter protein expression in the hippocampus, and that glucose-regulated protein and proteasome subunit alpha type 3 are closely associated with the occurrence and development of traumatic brain injury. 展开更多
关键词 surface-enhanced laser desorption ionization-time of flight-mass spectrometry two-dimensional gel electrophoresis HIPPOCAMPUS PROTEOMICS brain injury neural regeneration
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应用SELDI-TOF-MS技术初步建立结直肠癌区域淋巴转移分类树模型 被引量:5
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作者 高春芳 范乃军 +2 位作者 王秀丽 李冬晖 赵光 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期121-125,共5页
目的寻找血清中与结直肠癌淋巴结转移相关的特异性生物标志物。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)检测结直肠癌患者血清的蛋白质谱,利用配套软件进行蛋白质峰值鉴定、聚类并建立分类树模型。70例伴区域淋巴... 目的寻找血清中与结直肠癌淋巴结转移相关的特异性生物标志物。方法应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)检测结直肠癌患者血清的蛋白质谱,利用配套软件进行蛋白质峰值鉴定、聚类并建立分类树模型。70例伴区域淋巴结转移的结直肠癌患者和75例年龄、性别匹配,无区域淋巴结转移的结直肠癌患者作为训练组,通过软件分析得到分类树模型,以35例伴区域淋巴结转移的结直肠癌患者和30例年龄、性别匹配,无区域淋巴结转移的结直肠癌患者作为测试组进行独立样本的双盲验证。结果共识别出46种组间差异蛋白,其中由质荷比(M/Z)为3104、3781、5867、7970、9290五种蛋白构成的分类树模型可以有效鉴别结直肠癌患者伴或不伴区域淋巴结转移,灵敏度和特异度分别为94.3%(66/70)和100.0%(75/75),经双盲验证其灵敏度、特异度、阳性预测值分别为91.4%(32/35)、96.7%(29/30)、97.0%(32/33)。结论所建立的分类树模型可以准确鉴别结直肠癌患者伴或不伴区域淋巴结转移,对结直肠癌的术前筛查有重要价值。 展开更多
关键词 光谱法 质量 表面增强激光解吸离子化飞行时间 结直肠肿瘤 生物学标记 蛋白质组学 淋巴转移
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SELDI-TOF-MS筛查乳腺癌患者血清特异性蛋白的探讨 被引量:6
4
作者 刘彩刚 路平 +5 位作者 赵祥 顾劲松 刘金龙 庞葵 朱晓宣 张瑞山 《中国肿瘤临床》 CAS CSCD 北大核心 2007年第13期728-730,共3页
目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白。方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量。结果... 目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术寻找乳腺癌患者血清特异性蛋白。方法:应用弱阳离子蛋白质芯片(WCX2)及SELDI-TOF-MS技术检测12例正常人、10例乳腺良性病患者和22例乳腺癌患者血清中蛋白的相对含量。结果:三组样本质荷比在2000~30000Da间3939.314Da与3960.478Da的2个蛋白峰有显著差异。结论:SELDI-TOF-MS技术对乳腺癌早期诊断和特异性肿瘤标记物的筛选等方面具有一定价值,值得推广。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 弱阳离子蛋白质芯片 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱
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SELDI-TOF-MS技术筛选鼻咽癌血清肿瘤标志物 被引量:4
5
作者 陈慧菁 倪晓雷 +4 位作者 叶韵斌 李建成 徐鹭英 刘枋 潘建基 《肿瘤防治研究》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期384-388,共5页
目的筛选鼻咽癌患者血清蛋白差异表达并建立诊断模型,分析不同临床特征患者的血清蛋白质谱差异。方法应用SELDI技术分析102例鼻咽癌患者及118例健康对照的血清样本,Bio-marker Wizard和Biomarker Pattern软件分析两组之间的差异,建立分... 目的筛选鼻咽癌患者血清蛋白差异表达并建立诊断模型,分析不同临床特征患者的血清蛋白质谱差异。方法应用SELDI技术分析102例鼻咽癌患者及118例健康对照的血清样本,Bio-marker Wizard和Biomarker Pattern软件分析两组之间的差异,建立分类树诊断模型并进行盲筛验证;进一步分析鼻咽癌不同临床分型及EB病毒感染状态对患者血清蛋白质表达谱的影响。结果发现鼻咽癌与健康对照之间有25个血清蛋白质谱峰差异有统计学意义(P<0.01),13个蛋白峰表达下调,12个蛋白峰表达上调。经Biomarker Pattern软件建立分类树模型,盲法验证其敏感度为97.56%,特异性为88.89%,准确率达92.63%;上行型和下行型鼻咽癌之间发现M/Z为10286Da、7569Da及8149Da的3个血清蛋白质峰差异有统计学意义(P<0.05);EB阳性和EB阴性鼻咽癌间M/Z为9354Da及4596Da的2个血清蛋白质峰差异有统计学意义(P<0.05)。结论 SELDI-TOF-MS技术可筛选出鼻咽癌差异性蛋白并建立鼻咽癌诊断的分类树模型,有望成为鼻咽癌早期诊断的辅助指标;并且用SEDLI技术可以发现一些与鼻咽癌临床特征相关的血清蛋白差异峰。 展开更多
关键词 鼻咽癌 蛋白质组学 表面加强激光解析电离化飞行时间质谱
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SELDI-TOF-MS技术筛查预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的生物标志物 被引量:3
6
作者 郑弘宇 陈慧菁 +3 位作者 吴凡 黄伟炜 陈强 叶韵斌 《中国肿瘤生物治疗杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期368-373,共6页
目的:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)比较乳腺癌曲妥珠单抗治疗耐药患者与非耐药患者血清蛋白质谱的差异,筛选预测乳腺癌... 目的:应用表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)比较乳腺癌曲妥珠单抗治疗耐药患者与非耐药患者血清蛋白质谱的差异,筛选预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的标志蛋白。方法:选择福建省肿瘤医院2008年1月至2009年10月曲妥珠单抗治疗的乳腺癌患者35例,以临床界定标准将患者分为耐药组(11例)和非耐药组(24例)。应用SELDI-TOF-MS技术检测两组患者外周血蛋白质表达谱的差异,以差异蛋白峰值比1.5为耐药的蛋白界定标准,以此标准判定患者耐药与否。分析该蛋白界定标准评判曲妥珠单抗耐药的灵敏度、特异度以及阳性预测值、阴性预测值。结果:以临床界定标准评判的曲妥珠单抗耐药的发生与患者年龄、分期、腋窝淋巴结转移和ER/PR双阴无关。临床耐药组和非耐药组患者外周血蛋白质表达谱比较显示,耐药患者的蛋白质峰7971Da、9284Da显著降低(P<0.05)。以蛋白界定标准评判患者曲妥单抗耐药与非耐药,7971Da评判时的灵敏度为81.82%(9/11)、特异度为83.33%(20/24)、阳性预测值为69.23%(9/13)、阴性预测值为90.91%(20/22);以9284Da评判时的灵敏度为72.73%(8/11)、特异度为79.17%(19/24)、阳性预测值为61.54%(8/13)、阴性预测值为86.36%(19/22)。结论:应用SELDI-TOF-MS技术检测的差异蛋白质峰7971Da、9284Da似可作为预测乳腺癌患者曲妥珠单抗耐药的生物标志物。 展开更多
关键词 表面加强激光解析电离化飞行时间质谱技术 乳腺肿瘤 曲妥珠单抗 耐药 生物标志物
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应用SELDI-TOF-MS技术初步建立结直肠癌分类树模型 被引量:4
7
作者 范乃军 高春芳 +3 位作者 王秀丽 盛新华 李冬晖 郑国宝 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2009年第1期53-58,共6页
目的:分析结直肠癌期患者血清蛋白质组变化,初步建立结直肠癌期分类树模型.方法:将335例血清样本(其中结直肠癌患者169例,健康人166例)随机分为训练组和测试组,将血清样本加至IMAC30-Cu2+蛋白芯片,利用SELDI-TOF-MS得到血清蛋白质谱,利... 目的:分析结直肠癌期患者血清蛋白质组变化,初步建立结直肠癌期分类树模型.方法:将335例血清样本(其中结直肠癌患者169例,健康人166例)随机分为训练组和测试组,将血清样本加至IMAC30-Cu2+蛋白芯片,利用SELDI-TOF-MS得到血清蛋白质谱,利用Biomarker Wizard软件进行蛋白峰值鉴定和聚类.利用Biomarker Pattern以训练组建立由1个差异蛋白组成的结直肠癌期分类树模型,以测试组进行独立样本的双盲验证.另外,应用电化学发光免疫测定法检测测试组血清样本CEA.结果:软件识别了59个质峰,其中由质荷比为5765的蛋白构成的分类树模型可以有效鉴别结直肠癌患者与正常人,灵敏度和特异度分别是98.81%及100.00%,经双盲验证其灵敏度,特异度及阳性预测值分别是97.65%,98.80%及98.81%.CEA的灵敏度及特异度低于SELDI分类树模型(P<0.05).结论:SELDI-TOF-MS检测得到的血清蛋白质组分类树模型可以准确的鉴别结直肠癌患者与正常人,对结直肠癌的筛查有重要的意义. 展开更多
关键词 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪 结直肠癌 血清生物标志物 蛋白质组学 蛋白质微阵列分析
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应用SELDI-TOF-MS技术建立肝癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型 被引量:9
8
作者 刘池波 潘春琴 孙灵芬 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2006年第23期2354-2357,共4页
目的:建立肝癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型.方法:用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)及WCX2蛋白芯片获得新发肝癌、肝硬化患者和正常人血清的蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析,建立肝癌的筛选模型.结果:... 目的:建立肝癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型.方法:用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)及WCX2蛋白芯片获得新发肝癌、肝硬化患者和正常人血清的蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析,建立肝癌的筛选模型.结果:肝癌患者与健康对照组血清蛋白质指纹图谱之间有5个标志蛋白(4477,8943,5181, 8617,13 761 Da)在肝癌患者血清中高表达,肝癌患者与肝硬化患者血清蛋白质指纹图谱之间2个标志蛋白(4477,13 761 Da)在肝癌患者血清中高表达,1个标志蛋白(4097 Da)在肝癌患者血清中低表达.SELDI-TOF-MS技术的特异性(60/60,100%);敏感度(18/20,90%).分析系统筛选出4477,8943,13 761,4097 Da标志蛋白建立的肝癌诊断模型.结论:建立的血清蛋白质指纹图谱模型能够区分肝癌与非肝癌患者,SELDI-TOF-MS在肝癌的诊断及肿瘤特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面具有一定价值. 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离飞行时间质谱 蛋白芯片 肝癌
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SELDI-TOF-MS技术筛选NSCLC血清肿瘤标志物 被引量:4
9
作者 叶韵斌 陈玲 +4 位作者 佘志廉 陈慧菁 蔡丹 柳硕岩 陈强 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2009年第11期1174-1179,共6页
目的分析非小细胞肺癌(NSCLC)血清蛋白表达谱的改变,筛选并建立NSCLC血清蛋白的差异表达谱。方法应用表面增强激光解析电离化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS,简称SELDI-TOF或SELDI)技术,分析100例NSCLC患者和100例正常对照血清,获得蛋白表... 目的分析非小细胞肺癌(NSCLC)血清蛋白表达谱的改变,筛选并建立NSCLC血清蛋白的差异表达谱。方法应用表面增强激光解析电离化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS,简称SELDI-TOF或SELDI)技术,分析100例NSCLC患者和100例正常对照血清,获得蛋白表达图谱。用Biomarker Pattern(BPS)软件分析NSCLC差异蛋白并初步建立诊断模型。通过盲筛进一步验证诊断模型。结果发现NSCLC患者血清与正常人有16个显著差异的蛋白波峰,显著高表达8个(P<0.001)。显著低表达8个(P<0.001)。经BPS软件分析,建立分类树模型,其诊断的灵敏度为100%,特异度为100%。100例样本盲筛验证结果显示,其灵敏度为96.15%,特异度为95.83%。无吸烟史患者较有吸烟史患者血清中显著高表达蛋白质波峰有3个(P<0.05)。鳞癌患者较腺癌患者血清中显著高表达蛋白质波峰有2个(P<0.01)。不同病理分期患者之间未发现差异蛋白峰。结论SELDI-TOF-MS技术可筛选出NSCLC差异性蛋白并建立NSCLC诊断的分类树模型,有望成为NSCLC早期诊断的辅助指标。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离化飞行时间质谱(蛋白指纹图谱技术) 肿瘤 非小细胞肺癌 蛋白质组学
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应用SELDI-TOF-MS技术分析胆管恶性肿瘤患者外周血清蛋白的差异表达 被引量:4
10
作者 陈军周 周宁新 +3 位作者 刘博 周丁华 肖雪媛 何大澄 《中国普外基础与临床杂志》 CAS 2008年第2期88-91,共4页
目的应用蛋白质组学技术分析胆管恶性肿瘤患者外周血清中差异表达的蛋白质,初步探讨其对胆管恶性肿瘤早期诊断的意义。方法应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,对58例胆管恶性肿瘤患者及58例对照者(38例健康体检者... 目的应用蛋白质组学技术分析胆管恶性肿瘤患者外周血清中差异表达的蛋白质,初步探讨其对胆管恶性肿瘤早期诊断的意义。方法应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,对58例胆管恶性肿瘤患者及58例对照者(38例健康体检者及20例胆囊结石患者)外周血清蛋白质进行检测,应用Ci-phergen蛋白质芯片软件对蛋白质谱进行分析。结果与对照组外周血清蛋白质谱相比,胆管恶性肿瘤患者外周血清中相对分子质量为5.900×103、9.080×103及11.863×103的3个蛋白质点呈明显高表达(P<10-5);相对分子质量为6.959×103、14.000×103、14.129×103、14.302×103、17.557×103、17.690×103及28.552×103的7个蛋白质点呈明显低表达(P<10-5),其中相对分子质量为11.863×103的蛋白质点在胆管恶性肿瘤组外周血的平均峰值约为对照组的8倍。有黄疸与无黄疸的胆管癌患者的外周血清中上述10个蛋白质点未见差异表达,但检测出另外3个差异表达的蛋白质点,其相对分子质量分别为7.255×103、12.364×103和15.873×103,并均在伴黄疸患者外周血清中呈高表达(P<10-5)。相对分子质量为5.900×103的蛋白质点在Ⅱ期胆管癌患者的表达明显高于Ⅲ、Ⅳ期患者(P<10-5),另9个蛋白质点在胆管癌不同临床分期中的表达差异均无统计学意义。结论胆管恶性肿瘤患者外周血清蛋白质表达与对照组相比有明显变化,相对分子质量为11.863×103的蛋白质点具有作为胆管恶性肿瘤早期诊断的生物学标志物潜力。 展开更多
关键词 胆管恶性肿瘤 肿瘤标志物 蛋白质组学 表面加强激光解吸电离飞行时间质谱
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SELDI-TOF-MS技术在口腔黏膜癌前病变和口腔鳞癌的唾液诊断模型中的应用 被引量:4
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作者 平飞云 孙钢 何虹 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期203-208,共6页
目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志... 目的:分析唾液中蛋白质组对口腔鳞癌患者的动态变化的意义,对口腔鳞癌和癌前病变的相关诊断模型的建立进行初步探索。方法:按标准提取唾液标本,采用SELDI-TOF-MS技术,对17例口腔鳞癌患者、7例区域性转移患者、8例白斑患者和15例健康志愿者的唾液蛋白质指纹图谱进行比较,并采用整合性生物信息学方法建立诊断模型。结果:得到唾液诊断模型Ⅰ,为原发性口腔鳞癌患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5797、2902、3883和4951的4个蛋白质峰。其中5797、2902和3883在原发性口腔鳞癌患者唾液中低表达。4951在原发性口腔鳞癌患者唾液中高表达。敏感性为93.33%,特异性为88.24%,总准确率为90.63%。唾液诊断模型Ⅱ,为OSCC区域性转移患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为5446、4934、4968、3296、4800和2901的6个蛋白质峰。其中5446、4934和3296在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中高表达。4968、4800和2901在口腔鳞癌区域性转移患者唾液中低表达,敏感性为100.00%,特异性为85.71%,总准确率为95.45%。唾液诊断模型Ⅲ,为白斑患者与正常人的诊断模型:质荷比分别为9515、2230、2238、5694和2646的5个蛋白质峰。其中9515和5694在白斑患者唾液中高表达。2230、2238和2646在白斑患者唾液中低表达,敏感性为93.33%,特异性为85.71%,总准确率为86.96%。结论:结合SELDI-TOF-MS和生物信息学方法,唾液对肿瘤的诊断意义将进一步发挥其价值。本研究根据口腔粘膜上皮癌前病变、癌变、转移的唾液蛋白质组的变化,初步建立了3个早期诊断模型。 展开更多
关键词 口腔肿瘤 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 唾液 蛋白质组
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应用SELDI-TOF-MS筛选激素耐药型肾病综合征患儿尿液生物标志物 被引量:2
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作者 阳梅 刘文君 +3 位作者 郭渠莲 陈军红 施翰 黄媚贤 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期183-186,共4页
目的应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术筛选激素耐药型肾病综合征(SRNS)患儿尿液生物标志物。方法激素敏感型肾病综合征(SSNS)组32例,SRNS组9例,正常对照组45例,应用金芯片检测各组尿液标本。结果SRNS... 目的应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术筛选激素耐药型肾病综合征(SRNS)患儿尿液生物标志物。方法激素敏感型肾病综合征(SSNS)组32例,SRNS组9例,正常对照组45例,应用金芯片检测各组尿液标本。结果SRNS有差异明显的生物标志物4个,相对分子量分别为6703、7212、11820、14356,其中7212、11820、14356差异表达蛋白质在SRNS呈高表达,在SSNS呈低表达,6703差异表达蛋白质在SSNS高表达,在SRNS低表达。4个蛋白质峰[6703、7212、11820、14356质荷比(m/z)]组合构建的诊断模型鉴别SRNS和SSNS,灵敏度为88.89%,特异度93.75%。结论SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术是一种无创、快速、简便易行、用量少和高通量分析方法,能直接筛选出SRNS患儿尿液中的生物标志物,具有较好的临床应用价值。 展开更多
关键词 表面增强激光解吸电离化飞行时间质谱 尿蛋白质组学 肾病综合征 尿 激素
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SELDI-TOF-MS联合LCM技术筛选大肠癌肝转移早期诊断标志蛋白 被引量:3
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作者 赵渊博 王云海 阿不都外力·吾守尔 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2012年第4期296-303,共8页
目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱蛋白质芯片(SELDI-TOF-MS)联合激光显微切割(LCM)技术筛选大肠癌及其肝转移标志蛋白.方法:采用LCM技术获取24例大肠癌肝转移患者正常大肠、原发灶及肝转移灶癌细胞;应用SELDI-TOF-MS技术对其... 目的:应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱蛋白质芯片(SELDI-TOF-MS)联合激光显微切割(LCM)技术筛选大肠癌及其肝转移标志蛋白.方法:采用LCM技术获取24例大肠癌肝转移患者正常大肠、原发灶及肝转移灶癌细胞;应用SELDI-TOF-MS技术对其行蛋白质谱分析;采用Biomarker Wizard软件分析差异蛋白;通过查询蛋白库对特定分子质量所对应的标志蛋白进行初步确定.结果:比较3组细胞间的SELDI质谱图,发现大肠癌原发灶与正常大肠两组间存在15个标志蛋白,12个表达上调,3个表达下调;大肠癌肝转移灶与原发灶两组间存在9个标志蛋白,5个表达上调,4个表达下调.其中质荷比4676.63Da,11740.87Da,21063.59Da和22783.36Da,蛋白峰差异性最明显(P<0.01).通过查询ExPasy蛋白库筛选出20个差异蛋白,包括整合膜蛋白2C、DNA修复蛋白RAD51同系物4、细胞周期检查点蛋白RAD1、人附睾蛋白4、着丝粒蛋白R、Pleckstrin同源结构域家族成员3等.其中细胞凋亡调节Bax蛋白γ亚型、蛋白质S100A11(Protein S100-A11)、Raf激酶抑制蛋白(RKIP)和热休克蛋白27(HSP-27)在正常大肠、原发灶及肝转移灶癌细胞中均呈差异性表达,并且差异性最明显(P<0.01).结论:SELDI蛋白质芯片联合LCM技术有可能筛选出敏感性高、特异性强的大肠癌标志蛋白,筛选出的差异蛋白可能是大肠癌及其肝转移特异性生物标志物. 展开更多
关键词 seldi-tof-ms 激光捕获显微切割 大肠癌 肝转移 蛋白质组学
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小分子差异蛋白在HBV相关性肝病患者血清中的SELDI-TOF-MS筛选 被引量:2
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作者 宁秋悦 吴继周 +5 位作者 李国坚 臧宁 胡蝶飞 吴健林 陈茂伟 万裴琦 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2011年第2期143-150,共8页
目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝病患者血清中小分子差异蛋白在HBV感染后病情发展过程中的意义.方法:采用蛋白芯片及表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface-enhanced laserdesorption/ionization time-of-flight massspectromet... 目的:探讨乙型肝炎病毒(HBV)相关性肝病患者血清中小分子差异蛋白在HBV感染后病情发展过程中的意义.方法:采用蛋白芯片及表面增强激光解析电离飞行时间质谱(surface-enhanced laserdesorption/ionization time-of-flight massspectrometry,SELDI-TOF-MS)技术对已用乙腈去除高丰度蛋白的正常对照(NC)、乙型肝炎病毒携带者(ASCs)、慢性乙型肝炎(CHB)、肝硬化(LC)及原发性肝细胞癌(HCC)患者术前血清进行检测,筛选各自的血清小分子差异表达蛋白,并分别建立诊断模型.在蛋白数据库expasy寻找相关差异蛋白信息,对差异蛋白峰的可能结构及功能进行评价.结果:与NC组比,ASCs组有63个蛋白质波峰的强度值存在统计学差异(P<0.05),其中29个上调,34个下调;CHB组有57个,其中21个上调,36个下调;LC组有68个,其中33个上调,35个下调;HCC组有74个,其中28个上调,46个下调;通过对比分析,发现在4个病例组表达均为上调的m/z为15889.8,蛋白峰强度值在NC<ASC<CHB<LC组,HCC组较CHB和LC组低;11742.2蛋白峰强度值在NC<ASC<CHB<LC组和NC<ASC<CHB<HCC组,在LC和HCC组最高,用此蛋白峰诊断HBV感染相关性LC的灵敏度和特异度分别为90%和86.67%,诊断HCC的灵敏度和特异度分别为93.33%和83.33%.结论:成功去除高丰度蛋白和应用SELDI-T O F-M S技术筛选H B V感染相关性肝病患者血清中小分子差异蛋白,m/z为8709.7、13759.8、14004.0、15361.89、16072.3、2746.8、3449.1、3941.06、4098.3、9445.5的10个蛋白峰可能与HBV感染有关;m/z为15889.8的蛋白峰可能成为H B V感染后进展为LC早期诊断的标志物,而m/z为11742.2的蛋白峰也许是HBV相关性LC或HCC的一个重要标志. 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒携带者 慢性乙型病毒性肝炎 肝炎肝硬化 原发性肝细胞癌 低丰度蛋白 表面加强激光解吸电离一飞行时间质谱
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SELDI-TOF-MS筛选微小病变型肾病综合征尿液生物标志物 被引量:1
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作者 林青 郑健 +1 位作者 陈蓉艳 艾斯 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第17期1842-1846,共5页
目的探讨应用优化的表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)进行微小病变型肾病综合征(minimal-changed nephrotic syndrome,MCNS)大鼠尿液... 目的探讨应用优化的表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱(surface enhanced laser desorption/ionizationtime of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)进行微小病变型肾病综合征(minimal-changed nephrotic syndrome,MCNS)大鼠尿液生物标志物筛选的意义。方法 SD大鼠30只随机分为正常对照组(n=10)、模型对照组(n=10)和强的松治疗组(n=10)。除正常对照组外,其余大鼠经尾静脉一次性注射阿霉素5.5mg/kg复制MCNS模型,造模10d后分别予以强的松和蒸馏水灌胃治疗。21d后收集大鼠尿液,经弱阳离子交换芯片CM10捕获蛋白质,应用SELDI-TOF-MS获取3组大鼠的尿液蛋白质指纹图谱,采用Biomarker wizard软件比对分析差异蛋白。结果优化实验条件后获得较理想的尿液蛋白质指纹图谱,质控峰强度的平均CV值为18.0%(7.50%~35.89%)。在模型对照组与正常对照组之间检测到不同质荷比处有33个具统计学意义的差异蛋白峰(P<0.05),其中21个蛋白表达上调,12个蛋白表达下调。在正常对照组、模型对照组与强的松治疗组之间有6个蛋白质表达存在差异(P<0.05),这些差异蛋白峰在模型对照组中高表达,而在强的松治疗组中蛋白表达下调,峰强度接近正常对照组。结论通过优化实验条件并实行质量控制,SELDI-TOF-MS可为MCNS大鼠尿液生物标志物的筛选提供一个可行的检测途径。所获得的差异性蛋白峰对MCNS的早期诊断、治疗监测和寻找药物治疗的靶目标具有重要的意义。 展开更多
关键词 表面增强激光解析电离-飞行时间-质谱 微小病变型肾病综合征 尿液 生物标志物 质控
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基于SELDI-TOF-MS的冷却滩羊肉微生物差异蛋白分析 被引量:2
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作者 胡倩倩 杨波 +2 位作者 罗瑞明 尤丽琴 李子欣 《肉类研究》 北大核心 2018年第2期33-39,共7页
以托盘密封包装的冷鲜滩羊肉为研究对象,基于组合蛋白芯片与表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)平台对滩羊肉表面微生物蛋白进行分析,区... 以托盘密封包装的冷鲜滩羊肉为研究对象,基于组合蛋白芯片与表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)平台对滩羊肉表面微生物蛋白进行分析,区分不同贮藏时间生物样本之间的差异。通过正交矫正偏最小二乘法判别分析判断模型第一主成分的得分值(VIP阈值>1),并结合学生氏t检验的P值(阈值<0.05)寻找差异性表达蛋白。结果表明:应用Biomarker Wizard软件分析找出差异蛋白峰132个,其中75个差异蛋白峰可根据质荷比经Swiss-Prot数据库检索出对应的蛋白质,其余57个差异蛋白峰对应的为未知蛋白;从上述差异蛋白中未找到酶类的差异蛋白,但是找到了可能和滩羊肉菌体有关联的19个菌体蛋白。SELDI-TOF-MS技术能够用于检测冷鲜滩羊肉不同贮藏阶段基因表达的各种蛋白质,从而发现大量具有价值的蛋白质标志分子。 展开更多
关键词 滩羊肉 微生物 表面增强激光解吸电离飞行时间质谱 差异蛋白
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SELDI-TOF-MS技术用于结直肠癌诊断意义的分析 被引量:1
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作者 林榕波 范南峰 +3 位作者 陈慧菁 陈小红 林娇 叶韵斌 《福建医科大学学报》 2012年第1期51-54,共4页
目的探讨SELDI蛋白芯片技术在结直肠癌患者中的诊断价值。方法应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪和CM10芯片检测结直肠癌患者和构成比相似的对照组外周血清,筛选出结直肠癌特异蛋白峰并初步建立诊断模型。通过盲筛进一步验证诊断... 目的探讨SELDI蛋白芯片技术在结直肠癌患者中的诊断价值。方法应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪和CM10芯片检测结直肠癌患者和构成比相似的对照组外周血清,筛选出结直肠癌特异蛋白峰并初步建立诊断模型。通过盲筛进一步验证诊断模型。同时收集上述结直肠癌患者根治术后7d的55例血清,观察手术前后有无差异蛋白峰。结果筛选出的特异蛋白峰质荷比为3 413,4 101,4 191,4 306,4 366,6 453,6 645,8 586,8 709,13 786,13 996,5 647,7 993和15 960Da,初步建立诊断模型。利用该模型对结直肠癌进行盲法验证,诊断的准确率为91.11%,灵敏度为88.89%,特异度为93.33%。根治术前后未发现差异蛋白峰。结论 SELDI技术可以筛选出结直肠癌患者血清特异蛋白并建立诊断分类树模型,有望成为结直肠癌早期诊断的辅助指标。 展开更多
关键词 结直肠癌 肿瘤标志物 表面加强激光解析电离飞行时间质谱
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SELDI-TOF-MS技术在预测肿瘤化疗敏感性中的应用 被引量:1
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作者 傅文凡 赵健 《医学综述》 2010年第3期369-371,共3页
表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术是新一代蛋白质组研究技术,它使用特殊的增强表面直接捕获待测样本中的蛋白质分子,能够快速、敏感地发现并鉴定蛋白,提供一个高通量和高灵敏度的检测平台。最初主要应用于疾病早期诊断相关的蛋... 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术是新一代蛋白质组研究技术,它使用特殊的增强表面直接捕获待测样本中的蛋白质分子,能够快速、敏感地发现并鉴定蛋白,提供一个高通量和高灵敏度的检测平台。最初主要应用于疾病早期诊断相关的蛋白质标志物。目前在预测肿瘤化疗敏感性方面的应用也逐渐增多。本文除对表面增强激光解析离子化飞行时间质谱技术做详尽的介绍外,重点阐述其在预测肿瘤化疗敏感性方面的应用,并对其优缺点和发展前景进行评估。 展开更多
关键词 表面增强激光解析离子化飞行时间质谱 化疗敏感性 肿瘤
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应用SELDI-TOF-MS技术筛选卵巢癌淋巴结定向高转移特性细胞株差异表达蛋白
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作者 冠潇 黎丹戎 +3 位作者 王琪 李力 阮和云 张玮 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2008年第11期1155-1160,共6页
背景与目的:人卵巢浆液性乳头状腺癌细胞株SKOV3及其在裸鼠体内建立的淋巴结定向高转移亚克隆第二代SKOV3-pm2、第三代SKOV3-pm3细胞株,为卵巢癌转移分子机制的研究提供了细胞模型。本研究应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片分析筛选卵... 背景与目的:人卵巢浆液性乳头状腺癌细胞株SKOV3及其在裸鼠体内建立的淋巴结定向高转移亚克隆第二代SKOV3-pm2、第三代SKOV3-pm3细胞株,为卵巢癌转移分子机制的研究提供了细胞模型。本研究应用飞行时间质谱技术结合蛋白芯片分析筛选卵巢癌淋巴结定向高转移与非定向转移细胞株之间的蛋白质表达差异。方法:采用动物实验测定SKOV3、SKOV3-pm2和SKOV3-pm3三种细胞株的淋巴结转移率。应用表面增强激光解吸离子化-飞行时间质谱(surface-enhanced laser desorption and ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术检测各细胞株提取的胞浆总蛋白和分泌蛋白,每种细胞分别采用CM-10型弱阳离子交换芯片和IMAC-3型固定金属亲和芯片检测。应用Ciphergen Protein Software3.2.0软件和Biomarker Wizard软件对采集3组细胞的蛋白峰进行比较,峰强度相差0.5倍以上者定义为差异蛋白。结果:动物实验显示,细胞株SKOV3及高转移亚克隆SKOV3-pm2、SKOV3-pm3的淋巴结转移率分别为20%、90%和100%,前者与后二者之间的差异有统计学意义(P<0.05)。获得CM-10和IMAC3两种蛋白芯片上SKOV3、SKOV3-pm2、SKOV3-pm3细胞株蛋白质谱图谱,对比发现:质荷比(m/z)为6971、7475、9089、9453、10103、11655的胞浆蛋白及质荷比(m/z)为4746的分泌蛋白在上述三种细胞株中存在不同程度差异表达。结论:应用SELDI-TOF-MS技术结合固定金属亲和芯片和弱阳离子交换芯片,可有效筛选卵巢癌淋巴结定向高转移特性细胞株中的特异性表达蛋白;寻找到的差异蛋白与淋巴结定向高转移潜能密切相关。 展开更多
关键词 卵巢肿瘤 SKOV3细胞株 SKOV3一pm2细胞株 SKOV3-pm3细胞株 蛋白芯片 差异蛋白 表面增强激光 解吸离子化:飞行时间质谱
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应用SELDI-TOF-MS筛选神经系统先天畸形胎儿羊水诊断标志物
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作者 刘村 徐虹霞 +6 位作者 何远流 马喆 邓碧平 陶国伟 展新凤 刘韶平 曲迅 《生物医学工程与临床》 CAS 2011年第6期573-578,共6页
目的分析神经系统先天畸形胎儿羊水和神经系统正常胎儿羊水的蛋白质表达差异。方法选择8例神经系统畸形胎儿羊水,其中男性4例,女性4例;孕妇年龄21~32岁,平均年龄24.9岁;孕周19~34周,平均孕周23.1周。30例经超声检查神经系统正常胎儿... 目的分析神经系统先天畸形胎儿羊水和神经系统正常胎儿羊水的蛋白质表达差异。方法选择8例神经系统畸形胎儿羊水,其中男性4例,女性4例;孕妇年龄21~32岁,平均年龄24.9岁;孕周19~34周,平均孕周23.1周。30例经超声检查神经系统正常胎儿羊水作为对照组,其中男性15例,女性15例;孕妇年龄22~29岁,平均年龄25.1岁;孕周19~22周,平均孕周21.2周。运用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)蛋白质芯片技术检测神经系统先天畸形胎儿羊水和神经系统正常胎儿羊水蛋白质表达图谱。胎儿羊水用WCX2(弱阳离子交换)芯片检测,采用PBSⅡC型蛋白质芯片阅读机读取数据,Protein-Chip software 3.1软件采集数据,Biomarker Wizard软件分析两组羊水的蛋白质差异。结果 SELDI-TOF-MS技术检测发现神经系统先天畸形胎儿羊水和神经系统正常胎儿羊水的蛋白质存在差异表达,共有9个蛋白质水平发生变化,其中质/荷比4 967.526、5 258.056、11 717.010的差异蛋白质在神经系统异常组表达下调,2 540.415、3 107.119、3 396.759、4 590.965、5 589.200、6 429.417的差异蛋白质在神经系统异常组表达上调。结论神经系统先天畸形胎儿羊水和神经系统正常胎儿羊水之间的蛋白质谱有差异蛋白质表达,检测到9个代表性的差异蛋白质很可能是神经系统疾病胎儿的羊水特异性生物标志物。 展开更多
关键词 胎儿 羊水 神经系统先天畸形 蛋白质组学 表面增强激光解吸离子化蛋白质芯片
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