Mutation Surveyor在插入/缺失杂合子突变分析中的应用

结合实例简述了Mutation Surveyor软件在碱基替换和插入/缺失突变,尤其是插入/缺失杂合子突变研究中的应用。以浙江省余杭湖羊场和屠宰场144头湖羊为试验材料,采用PCR-SSCP和测序的方法检测干扰素刺激基因(ISG15)基因5'侧翼区序列,并利用Mutation Surveyor软件分析其遗传多态性。PCR-SSCP检测结果显示ISG15基因5'侧翼区PCR-SSCP带型非常复杂,无法直接判定个体的基因型。利用Mutation Survey-or软件分析发现湖羊ISG15基因5'侧翼区存在152 C/T,158 dupC和239 C/T 3种突变。其中152 C/T C等位基因频率为0.83,为低度多态的分子标记;158 dupC等位基因频率为0.5125,239 C/T C等位基因频率为0.7675,均为中度多态的分子标记。除239 C/T外,152 C/T和158 dupC均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。试验结果显示Mutation Surveyor软件在分析插入/缺失杂合子突变的测序结果时有较大优势,可用于碱基替换和插入/缺失SNPs的通量筛选和分析。

比较T7E1和Surveyor核酸内切酶对于点突变的检测效率

目的:比较T7E1和Surveyor核酸内切酶对于CRISPR-Cas9引起的点突变的错配剪切活性。方法:利用野生型和点突变的基因组DNA为模板,PCR扩增出突变位置的基因片段,用不同比例的野生型和点突变的PCR产物进行DNA杂交,分别用T7E1和Surveyor核酸内切酶对杂交后的产物进行切割,琼脂糖凝胶电泳分析结果。结果:当5%点突变DNA与95%野生型DNA杂交时,T7E1核酸内切酶剪切杂交产物的比例为9.5%,Surveyor核酸内切酶为3.2%;当点突变DNA与野生型DNA等比例杂交时,T7E1核酸内切酶剪切杂交产物的比例为45.6%,Surveyor核酸内切酶为26.4%;且T7E1和Surveyor核酸内切酶均能检测5%的突变DNA。结论:T7E1核酸内切酶检测点突变的效率高于Surveyor。

Sun Surveyor软件在“地球运动”教学中的应用初探

普通高中地理课程标准（2017年版）于近期发布,作为选择性必修1＂自然地理基础＂中的难点之一——地球运动,对学生具有一定的能力要求,但纯粹的理论学习无法引导学生内化抽象知识。基于Sun Surveyor软件的地理课堂,便于协助学生理解昼夜长短变化和太阳高度的相关知识,进而有利于培养学生的地理推理能力和地理空间知觉能力。

面向地理实践力培养的Sun Surveyor手机软件的应用研究——以“地球的运动”为例

信息技术的应用和发展对改变学生的学和教师的教具有重要作用。从地理实践力的培养要求出发,以"观察、使用工具和实践想法"三个角度为切入点,借助Sun Surveyor并结合地球运动进行案例设计。希望能为地理教师运用信息技术进行教学提供思路,以期更好地落实地理实践力的培养。

Sun Surveyor辅助“地球运动”教学浅探

随着手机、平板电脑的普及,数字化的教学资源从电脑软件扩展到了移动端的应用程序。Sun Surveyor是一款适用于辅助＂地球运动＂教学的应用程序。文章在重点剖析＂地球运动＂的高考题考点、难点的基础上,结合多个版本高中地理教材,归纳了＂地球运动＂是由两个视角、两个变量组成的动态规律,总结出在教学中存在教材缺少动态的生活化素材、教师亟需更合适的辅助教学资源、学生空间想象力达不到要求等问题,展开叙述了Sun Surveyor的教学优势,并配上具体的应用策略,充分证实了Sun Surveyor在辅助＂地球运动＂教学的实用性。

核酸内切酶Surveyor酶切法快速检测MTB对吡嗪酰胺耐药性方法的建立及评估

目的建立应用核酸内切酶Surveyor酶切法快速检测MTB对吡嗪酰胺(pyrazinamide,PZA)耐药性的方法,并对其临床价值进行评估。方法选取来自武汉市肺科医院的耐多药(MDR)MTB菌株91株作为研究对象。分别以上游引物∶下游引物为2∶5的比例扩增所有菌株,同时以上游引物∶下游引物为5∶2的比例扩增结核分枝杆菌标准株H37Rv,然后将PCR产物以1∶1的比例混合杂交,应用核酸内切酶Surveyor酶切反应产物后进行电泳。以杂交条带能够被核酸内切酶Surveyor酶切割作为判定pncA基因及其启动子序列存在基因突变的依据。以BACTEC MGIT 960检测MTB对PZA耐药性方法和MTB的pncA基因及其启动子区基因序列测定法作为对照,评价核酸内切酶Surveyor酶切法的应用价值。结果以BACTEC MGIT 960法检测PZA耐药性作为对照,核酸内切酶Surveyor酶切法检测PZA耐药的敏感度为100.0%(29/29),特异度为87.1%(54/62),准确度为91.2%(83/91)。以MTB的pncA基因及其启动子区的基因测序结果作为对照,核酸内切酶Surveyor酶切法检测MTB对PZA耐药的敏感度为100.0%(37/37),特异度为100.0%(54/54),准确度为100.0%(91/91)。结论核酸内切酶Surveyor酶切法检测pncA基因及其启动子区突变的性能与基因测序高度一致,可以为没有基因测序条件的地区检测MTB对PZA耐药性提供一种新的思路。

配管专业在Quantity Surveyor项目合同管理中的应用研究

Quantity Surveyor(工料测量)在全球范围内,大型工程合同中熟练运用,例如:LNG、造船业、海洋工程等,本文主要研究配管专业在Quantity Surveyor(简称QS)项目合同管理中的应用,以及需要严格执行的过程,关注的合同条款,如何提高工作效率等。

SURVEYOR酶法检测结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药基因突变的探讨

目的探讨SURVEYOR酶法在结核分枝杆菌耐药基因突变检测中的应用。方法结核分枝杆菌临床分离株60株,经测序证实有embB基因突变的乙胺丁醇耐药株45株,无基因突变的15株,采用SURVEYOR酶法进行检测。经PCR扩增,杂交形成异源双链,SURVEYOR酶切,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳的带形来判断有无突变存在。结果 45株耐药株均检出了存在突变,15株敏感株均无突变发现。SURVEYOR酶法与测序法的结果完全相符。结论 SURVEYOR酶法检测结核分枝杆菌乙胺丁醇耐药基因突变简便、稳定,灵敏度和特异性高,是结核分枝杆菌耐药基因检测较好方法。

基于Sun Surveyor软件的“地球运动”教学探索

Sun Surveyor(太阳测量师)是一款天文类软件,可用于Android和iOS系统,具有谷歌地图搜索、扩增实境、3D罗盘、通过星历表模式对太阳和月亮进行定位、对星体运动轨迹进行追踪等功能。高中地理'地球运动'部分的内容过于抽象,如果学生空间方位感、想象力不强,学习起来会很吃力。笔者发现,将Sun Surveyor应用于'地球运动'教学,可以轻松地突破教学难点。一、Sun

“一带一路”视域下中国造价工程师职业标准国际化路径研究和实践——以坦桑尼亚为例

职业教育标准国际化是构成职业教育国际化的核心要素。结合中非职业教育联盟牵头开展的坦桑尼亚造价工程行业岗位职业教育标准国际化项目为例,探索职业教育标准国际化的路径研究和实践。通过组建多元开发主体,调研坦桑尼亚国别及职业教育现状,调查造价工程师职业领域需求,完成造价工程师职业能力点梳理、专业教学标准编制、专业核心课程教学目标和任务制定的整套标准开发工作,并结合实践总结工作开展过程中遇到的问题,提出进一步完善坦桑尼亚造价工程岗位职业标准体系、加强专业英语翻译工作、配套开发全套职业教育资源等建设性建议。

CRISPR/Cas9基因编辑系统中两种gRNA活性检测方法比较

目的:比较CRISPR/Cas9系统中gRNA活性检测的两种方法,即利用Surveyor/T7E1核酸酶检测方法或利用Cas9蛋白的体外检测方法。方法:一方面构建表达Cas9和特异gRNA的质粒,转染NIH3T3细胞,然后提取DNA,利用T7E1核酸内切酶检测gRNA介导Cas9切割靶DNA并产生indel突变的效率;另一方面,设计引物并利用PCR扩增出gRNA的DNA模板片段,通过体外转录获得gRNA,利用Cas9蛋白及gRNA进行体外反应检测切割效率。结果:利用Cas9蛋白体外酶切可以检测到较高的gRNA活性,然而通过T7E1核酸酶方法检测gRNA在细胞中活性整体偏低,且在不同基因之间差异较大。结论:细胞Surveyor/T7E1法与Cas9蛋白体外酶切法检测到的gRNA活性不完全一致,体外活性检测法不能替代。

应用于铁路道轨密贴检测的光纤位移传感器的研究

介绍了一种应用于铁路道轨密贴检测的光纤位移传感器的结构和基本原理 ,建立了系统的数学模型 ,给出了系统实验的结果。实验和测试的结果与数学模型的结论相一致 。

光纤陀螺测斜仪设计和实验

为满足复杂油田环境中精确高效井眼测量需要,研制出具有自主知识产权的新型光纤陀螺测斜仪。利用小型三轴光纤陀螺、石英挠性加速度计和DSP+FPGA架构导航计算机构建核心硬件平台,设计动态环境捷联解算算法和电缆速度辅助卡尔曼滤波器误差控制算法,实现井斜角和方位角的动态测量。现场实验结果表明,井斜角误差优于0.1°,方位角误差优于1°。

改良骨盆倾斜度测量器和其它测量法的比较研究

目的:开发研究改良骨盆倾斜度测量器。方法:采用改良骨盆倾斜度测量器结构的原理和测量方法与其它测量方法进行比较性研究。结果:该测量器有成本低、可量化、操作简单、可普及的优势。结论:目前改良骨盆倾斜度测量器在临床上有推广和使用价值。

职业认证制度下测绘工程专业实践教学体系构建

为了满足职业认证制度对高校测绘工程专业人才的培养要求,从测绘工程专业实际出发,以注册测绘师执业能力为主线,明确专业培养目标,强化学生在工程项目中的实践技能训练,开展创新创业教育,构建职业认证制度下的测绘工程专业实践教学体系。

月球探测工程中的月球环境问题

文章介绍了月球环境和国外两个典型月球探测器的环境试验。在月球环境对探测器的影响分析基础上,根据我国月球探测工程的需求,提出了有关环境问题研究的一些考虑。

注册测绘师制度实施有关问题研究

注册测绘师制度的实施有利于规范测绘行为,保证测绘成果质量,意义重大。本文针对注册测绘师制度推进过程中遇到的现实问题进行了调查研究。通过问卷和实地访谈,对注册测绘师签字文件种类,测绘资质单位需配备注册测绘师数量,注册测绘师事务所可行性,注册测绘师制度与现行管理项目关系,注册测绘师考试等相关问题进行了研究和思考,并提出了相关的对策建议,供有关方面在推进注册测绘师制度实施时参考。

三种检测内源性基因修饰方法比较

为获得准确的突变信息,除直接测序外,实验初步确定了3种人工核酸酶生物学活性检测方法。利用Surveyor nuclease、T7E1(T7 Endonuclease 1)和HRM(High resolution melt),均以变性退火突变型和野生型DNA序列形成扭曲的双螺旋DNA(distorted duplex DNA)为基础的3种人工核酸酶生物学活性检测方法,确定目标位点是否发生突变。实验成功检测出作用于绵羊MNST基因第一外显子的CRISPR/Cas9和第三外显子的TALEN目标位点发生突变,并对3种检测方法的结果和特点进行了分析比较,得出3种检测方法的优缺点,为实验室分析确定细胞利用非同源末端连接修复DNA双链断裂结果提供参考。

注册测绘师考试对“控制测量学”教学改革的启示

注册测绘师考试是我国目前开始实行的注册测绘师制度的一个基本程序,考试大纲中包含了控制测量学的教学内容。作为一个行业的认证考试,考试制度和考试大纲对于测绘工程专业教学具有重要的启示。本文探讨了注册测绘师考试对"控制测量学"的课程体系、教学内容、教学方法和教学手段进行改革的几点启示。