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高通量计算系统的构建原理、支撑技术及云服务应用立项报告
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作者 徐志伟 李晓维 +2 位作者 吴承勇 黄铠 宫云战 《科技创新导报》 2016年第9期165-166,共2页
该报告研究新兴战略性应用(如物联网、三网融合、云计算等)的后端高通量处理的新原理、新方法和核心技术。主要研究内容包括由控制或数据驱动转向请求驱动的新原理、大规模可扩展微处理芯片的新结构及其相关核心技术,高通量低能耗的新... 该报告研究新兴战略性应用(如物联网、三网融合、云计算等)的后端高通量处理的新原理、新方法和核心技术。主要研究内容包括由控制或数据驱动转向请求驱动的新原理、大规模可扩展微处理芯片的新结构及其相关核心技术,高通量低能耗的新型计算机体系结构、支撑其高效能执行的新型运行时管理系统和新的软件支持环境,虚拟化资源能力的部署、调度、管理和优化技术,为按需聚合、智能协同的高通量应用提供可保障的系统能力;同时研究各个阶段的可靠性设计和验证的新机制,包括硬件级的芯片和系统的可靠性机制,软件级的容错、缺陷调试和程序分析验证等,以及高通量亿级并行系统的测试程序、健壮性、性能自动推演和性能瓶颈自动发现等技术。通过该研究,提出并实现有助于解决重大科学问题的高通量计算系统的创新结构和设计方案。 展开更多
关键词 高通量 计算系统 构建 云服务 应用
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基于收方参与的移动自组网TCP增强的路由协议
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作者 林志伟 许力 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2005年第3期515-517,共3页
移动自组网多跳、动态拓扑的特性,使得路由信息易老化,源节点在路由失败后不能及时启动路由发现,造成TCP有效吞吐率随移动速度增加而下降。在DSR路由协议的基础上,提出一种新的基于接收方参与启动路由发现的新路由协议RP DSR,它通过接... 移动自组网多跳、动态拓扑的特性,使得路由信息易老化,源节点在路由失败后不能及时启动路由发现,造成TCP有效吞吐率随移动速度增加而下降。在DSR路由协议的基础上,提出一种新的基于接收方参与启动路由发现的新路由协议RP DSR,它通过接收方的ACK确认包启动路由发现,主动为发送方提供最新的路由信息,从而提高了自组网的TCP的性能。仿真结果表明,在节点快速移动环境中,RP DSR协议的TCP性能明显优于DSR协议。 展开更多
关键词 移动自组网 传输控制协议 路由协议 吞吐率
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Multi-slots Wideband Cooperative Spectrum Sensing Based on Weighed Data Fusion in Cognitive Radio
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作者 Xin Liu Xiu-Hua Li +1 位作者 Rong-Fei Fan Xue-Zhi Tan 《Journal of Harbin Institute of Technology(New Series)》 EI CAS 2013年第1期1-7,共7页
In order to avoid the interference to the primary user(PU), in this paper Cognitive Radio (CR) periodically senses the presence of PU, and during one period, CR can sense all the sub-channels based on weighed data fus... In order to avoid the interference to the primary user(PU), in this paper Cognitive Radio (CR) periodically senses the presence of PU, and during one period, CR can sense all the sub-channels based on weighed data fusion and then use all the idle channels decided by the coordinator. The local sensing time of CR is divided into multi-slots in which CR can sense any sub-channel. Through reasonably allocating the sensing slots and users by mathematic optimization, the proposed algorithm can improve the total throughput of CR. The optimization problem of the proposed scheme which seeks to maximize the throughput subject to the constraint of the detected performance of each sub-channel is proposed in order to choose the optimum local sense time and the number of the cooperative CRs. The simulation results indicate that the proposed scheme can obtain higher throughput than the conventional single-channel sense, and there are the optimum local sense time and the number of cooperative CRs to make the throughput reach maximum. 展开更多
关键词 cognitive radio energy detection cooperative detection weighed data fusion thoughput
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WiMAX Mesh网络中一种集中式QoS调度算法 被引量:3
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作者 伸桂林 张新有 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2012年第11期4269-4272,共4页
针对WiMAX Mesh网络集中式下资源的调度和分配,分析了现有调度算法的研究进展与优缺点,结合标准对Mesh模式的QoS定义,提出了一种WiMAX Mesh网络集中式下基于分组的QoS调度算法。通过区分数据流的优先级方式对不同业务数据流进行分组,并... 针对WiMAX Mesh网络集中式下资源的调度和分配,分析了现有调度算法的研究进展与优缺点,结合标准对Mesh模式的QoS定义,提出了一种WiMAX Mesh网络集中式下基于分组的QoS调度算法。通过区分数据流的优先级方式对不同业务数据流进行分组,并计算组内流节点的权值,保证同种业务流间高传输要求和低传输节点的公平性。仿真结果表明,与HRF和LRC算法相比,该算法对于分类业务的时延和网络吞吐量具有明显的优势,实现了区分业务的QoS保障。 展开更多
关键词 WIMAX MESH 集中式调度 QOS 分组调度 时延 吞吐量
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最优组合预测方法在内河港口吞吐量预测中的应用 被引量:3
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作者 黄勇 高捷 《水道港口》 2006年第6期401-404,共4页
港口吞吐量的预测是港口规划过程中最为基础也最为关键的一步,只有对港口吞吐量做出准确、稳定的预测,才能做出科学合理的港口发展规划。由于内河港吞吐量历史数据有限,文中采用GM(1,1)和Verhulst模型的最优组合模型对港口吞吐量进行预... 港口吞吐量的预测是港口规划过程中最为基础也最为关键的一步,只有对港口吞吐量做出准确、稳定的预测,才能做出科学合理的港口发展规划。由于内河港吞吐量历史数据有限,文中采用GM(1,1)和Verhulst模型的最优组合模型对港口吞吐量进行预测。该组合模型充分利用GM(1,1)模型“少数据,短期预测准确”的优点,又针对GM(1,1)预测量的无限增大趋势,引入了Verhulst模型进行组合修正,进而提高预测值的准确、稳健性。 展开更多
关键词 GM(1 1)模型 VERHULST模型 组合预测模型 内河港口吞吐量预测
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葱兰夜蛾幼虫肠道细菌群落结构与多样性分析 被引量:1
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作者 蔡泱莲 黄宽官 +1 位作者 黄俊浩 吴鸿 《浙江林业科技》 2019年第2期7-14,共8页
为明确葱兰夜蛾Brithys crini(Fabricius,1775)幼虫肠道细菌的群落结构和多样性,利用IonS5TMXL高通量测序平台对肠道细菌16S rDNA基因V3-V4变异区进行测序,应用Cutadapt、Uparse等软件整理、统计样品序列数和OUT数,分析肠道细菌的物种... 为明确葱兰夜蛾Brithys crini(Fabricius,1775)幼虫肠道细菌的群落结构和多样性,利用IonS5TMXL高通量测序平台对肠道细菌16S rDNA基因V3-V4变异区进行测序,应用Cutadapt、Uparse等软件整理、统计样品序列数和OUT数,分析肠道细菌的物种组成、丰度和多样性。4个虫体肠道样本测序拼接后,共得273 453条序列和在97%相似度下平均每个样本可聚类为512个OTU数目,总共注释到23门57纲86目168科347属,优势菌群为变形菌门Proteobacteria和厚壁菌门Firmicute。葱兰夜蛾肠道细菌Simpson指数、Shannon指数和Chao1指数分别为0.93~0.98,5.67~6.82和439.57~584.12。结果表明葱兰夜蛾幼虫肠道细菌多样性比较丰富,个体间微生物群落结构和多样性有差异。 展开更多
关键词 葱兰夜蛾 幼虫 肠道细菌 多样性 16S RDNA 高通量
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高通量靶向Panel测序新型突变对癫痫遗传多样性的临床价值 被引量:1
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作者 孙立 邓哲治 +8 位作者 孟祥福 姚婕 曾汉兵 彭刘亮 刘玲 陈剑明 李龙毓 黄海威 邓杏飞 《广东医学》 CAS 2020年第2期156-161,共6页
目的采用高通量靶向Panel测序检测癫痫相关突变及通过千人基因组数据集对比发掘癫痫相关新型突变位点,探索癫痫遗传多样性的临床价值。方法共纳入癫痫病例169例,原发性癫痫69例,继发性癫痫100例,使用高通量靶向Panel测序检测癫痫相关突... 目的采用高通量靶向Panel测序检测癫痫相关突变及通过千人基因组数据集对比发掘癫痫相关新型突变位点,探索癫痫遗传多样性的临床价值。方法共纳入癫痫病例169例,原发性癫痫69例,继发性癫痫100例,使用高通量靶向Panel测序检测癫痫相关突变。测序结果通过与千人基因组328个样本的数据集进行比较,按照(1)千人基因组对照数据集——全癫痫患者(原发+继发);(2)千人基因组对照数据集——原发癫痫;(3)千人基因组对照数据集——继发癫痫的分组查找差异,按照哈温平衡检验(HWE_P>0.05)、χ~2检验(P<0.05)筛选并按照突变的病例比例(≥10%)排序,结果与HGMD、ClinVar数据库比较,确定为新型突变。结果在癫痫患者组中发现新型突变13个;在原发性癫痫组中发现新型突变11个,其中4个为原发性癫痫患者特有位点;在继发性癫痫组中发现新型突变18个,8个为继发性癫痫患者特有位点。通过对突变基因的功能分析,得到了原发性和继发性癫痫特有的遗传致病位点和遗传易感性位点。结论高通量靶向Panel测序检测到的新型移码突变有效地揭示了不同癫痫类型的遗传多样性。 展开更多
关键词 癫痫 基因检测 高通量测序 靶向测序 新型突变 移码突变
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基于高通量测序Survey评估测定雷竹基因组大小
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作者 杨杰芳 甘然 +2 位作者 曾庆南 程平 王海霞 《竹子学报》 2021年第2期37-41,共5页
为研究雷竹基因组信息,基于高通量测序,利用Illumina测序平台对雷竹基因组进行了分析,采用K-mer法预测雷竹基因组大、杂合度和重复序列等基因组特征,结果表明:雷竹基因组大小约为1913 Mb,修正后为1897 Mb,杂合率为1.7%,重复序列比例为69... 为研究雷竹基因组信息,基于高通量测序,利用Illumina测序平台对雷竹基因组进行了分析,采用K-mer法预测雷竹基因组大、杂合度和重复序列等基因组特征,结果表明:雷竹基因组大小约为1913 Mb,修正后为1897 Mb,杂合率为1.7%,重复序列比例为69.38%。 展开更多
关键词 雷竹 高通量测序 K-mer分析 基因组大小 杂合度
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以太型局域网吞吐率指标的检测
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作者 尹肖栋 平乾 《电脑知识与技术》 2009年第6期4166-4167,共2页
吞吐率是以太型局域网性能中最重要一项测试指标,利用实际的检测项目,结合最新颁布的国家标准,对这项指标进行检测。利用所测数据判断网络吞吐率是否达到千兆.验证数据包大小变化时引起的吞吐率变化,并将局域网中存在的问题进行分... 吞吐率是以太型局域网性能中最重要一项测试指标,利用实际的检测项目,结合最新颁布的国家标准,对这项指标进行检测。利用所测数据判断网络吞吐率是否达到千兆.验证数据包大小变化时引起的吞吐率变化,并将局域网中存在的问题进行分析和解决,最后总结出吞吐率指标测试的关键要素,为以后的相关测试提供参考。 展开更多
关键词 以太型局域网 吞吐率 验证 瓶颈 检测
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表面等离子体共振成像系统相位提取 被引量:10
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作者 王弋嘉 张崇磊 +2 位作者 王蓉 朱思伟 袁小聪 《光学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第5期229-233,共5页
表面等离子体共振(SPR)生物传感器应用于生物大分子结合反应的实时测量时,为满足高通量检测的要求,SPR传感器应具有宽场成像检测的能力。建立了适用于以马赫-曾德尔结构为基础的差分干涉SPR成像系统,该结构能够有效降低环境噪声,并对其... 表面等离子体共振(SPR)生物传感器应用于生物大分子结合反应的实时测量时,为满足高通量检测的要求,SPR传感器应具有宽场成像检测的能力。建立了适用于以马赫-曾德尔结构为基础的差分干涉SPR成像系统,该结构能够有效降低环境噪声,并对其提取相差的算法进行研究。在信号光与参考光合束之后,通过沃拉斯顿棱镜将p光与s光分开,经透镜聚焦后进入CCD,通过互相关运算使两光斑对准,相位从p光与s光干涉光强的若干变化周期中提取,同时通过取平均减小噪声影响,进行点对点相减得到相变值,并以此方法进行扫描得到相变图。系统通过时间轴提取相位信息,不损失空间分辨率,每10秒探测1次数据,空间分辨率为31.25μm×20.83μm,折射率分辨率为10-5 RIU。 展开更多
关键词 传感器 表面等离子体共振 相差 成像 高通量
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急性肝衰竭小鼠肠道微生态的变化 被引量:6
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作者 胡亚欣 余蕾 +1 位作者 刘华士苟 程明亮 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期291-296,共6页
目的探讨急性肝衰竭小鼠肠道微生态菌群的变化情况,寻找特征性差异菌,为急性肝衰竭肠道微生态紊乱的诊治提供依据。方法BALB/c无特殊病原级雄鼠30只(空白组5只,模型组25只),D-氨基半乳糖制备小鼠急性肝衰竭模型。提取小鼠下消化... 目的探讨急性肝衰竭小鼠肠道微生态菌群的变化情况,寻找特征性差异菌,为急性肝衰竭肠道微生态紊乱的诊治提供依据。方法BALB/c无特殊病原级雄鼠30只(空白组5只,模型组25只),D-氨基半乳糖制备小鼠急性肝衰竭模型。提取小鼠下消化道不同节段(回肠、结肠)内容物及粪便的微生物DNA,进行PCR扩增,对16SV3-V4区进行高通量测序,用生物信息学分析技术对测序结果进行OTU聚类、物种注释、α多样性分析、LEfSe(LDA Effect Size)分析,最终找到模型组特征性差异菌。两组间计量资料采用t检验。结果两组小鼠,共存活10只,其中模型组病死率为80%。与对照组比较,α多样性分析显示急性肝衰竭小鼠回肠中细菌丰度和多样性增加;结肠中细菌丰度减低但多样性增加;粪便中细菌多样性降低,丰度差异无统计学意义。在最佳分类水平上,回肠梭菌科丰度减少(44.95%±19.28%与7.51%±16.57%,t=3.293),而结肠理研菌科(1.08%±1.01%与4.18%±2.39%,t=-2.669)、S24-7(4.75%±4.87%与22.77%±13.05%,t=-2.890)、F16(0.24%±0.28%与2.19%±1.61%,t=-2.656)等丰度增加,P值均〈0.05。LEfSe(LDA Effect Size)分析显示两组在葡萄球菌科、S24-7方面差异有统计学意义,其中S24-7可定义为特征性差异菌群。结论急性肝衰竭小鼠肠道微生态紊乱,回肠菌群过度生长。急性肝衰竭与S24-7过度生长相关。 展开更多
关键词 肝功能衰竭 急性 细菌 肠道微生态 S24-7 高通量测序
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金属材料疲劳裂纹扩展机制及模型的研究进展 被引量:46
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作者 吴圣川 李存海 +1 位作者 张文 康国政 《固体力学学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期489-538,共50页
裂纹的萌生、扩展和断裂行为及其与材料本身和外部因素的关联一直是工程与科学领域的重要研究课题.论文总结了影响金属材料疲劳裂纹扩展的多种因素,综述了高周疲劳裂纹扩展的唯象模型和理论模型,以及低周和超高周疲劳裂纹扩展模型的最... 裂纹的萌生、扩展和断裂行为及其与材料本身和外部因素的关联一直是工程与科学领域的重要研究课题.论文总结了影响金属材料疲劳裂纹扩展的多种因素,综述了高周疲劳裂纹扩展的唯象模型和理论模型,以及低周和超高周疲劳裂纹扩展模型的最新进展(包括基于能量的和考虑概率的).综合前述模型优缺点,提出了一种基于单轴拉伸性能的新型疲劳裂纹扩展模型(iLAPS).分析表明,新模型iLAPS与多种常用材料的疲劳裂纹扩展试验数据吻合较好,并且能够准确地给出不同应力比下的裂纹扩展速率曲线.最后,对先进材料抗疲劳开裂性能的高通量表征及运维技术进行了展望. 展开更多
关键词 裂纹闭合 低周疲劳 高周疲劳 超高周疲劳 单轴拉伸 高通量表征
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基于高通量测序的两种典型忽地笑栽培土壤根际真菌群落多样性 被引量:13
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作者 全妙华 佘朝文 +2 位作者 陈东明 胡朝暾 赵丽娟 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第10期2105-2111,共7页
【背景】忽地笑为传统中药材,可用于治疗老年性痴呆症、重症肌无力等疾病,具有重要的药用价值。腐殖土(壤土)适宜忽地笑的生长与栽培,黄棕壤(粘性土)对其生长不利。根际微生物可促进或抑制植物生长,直接影响药用植物产量和有效成分含量... 【背景】忽地笑为传统中药材,可用于治疗老年性痴呆症、重症肌无力等疾病,具有重要的药用价值。腐殖土(壤土)适宜忽地笑的生长与栽培,黄棕壤(粘性土)对其生长不利。根际微生物可促进或抑制植物生长,直接影响药用植物产量和有效成分含量的变化,因此近年来对药用植物与根际微生物关系的研究得到了高度重视。【目的】通过2种栽培土壤根际真菌的群落结构及多样性研究,旨在探讨根际真菌对忽地笑生长发育的影响。【方法】提取土壤总DNA,采用高通量测序及生物信息统计分析等方法进行研究。【结果】腐殖土和黄棕壤分别获得真菌ITS1序列42 130和30 176条;腐殖土和黄棕壤根际真菌类群分别划分为6门25纲61目123科208属和5门20纲48目85科138属,最优势门类均为子囊菌Ascomycota (相对丰度>70%),但主要优势属及多样性指数等存在较大差异,其中腐殖土的主要优势类群有Ascomycota_unclassified、Fusarium、Zopfiella、Chaetomiaceae_unclassified、Ceratobasidium、Mortierella等,而黄棕壤的主要优势类群为Sordariomycetes_unclassified、 Fusarium、 Acremonium、 Rhizoctonia、Nectriaceae_unclassified、Hymenoscyphus等;通过SPSS统计软件分析表明,腐殖土的Ascomycota_unclassified、Zopfiella、Ceratobasidium、Mortierella等优势类群与忽地笑鳞茎中石蒜碱含量之间呈极显著正相关性。【结论】适宜栽培忽地笑的腐殖土根际真菌的遗传多样性比黄棕壤更丰富;腐殖土根际主要优势类群Ascomycota_unclassified、Zopfiella、Ceratobasidium等可能有利于忽地笑生长发育及其石蒜碱等生物碱积累。 展开更多
关键词 中药材 根际土壤 真菌 高通量测序 遗传多样性
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基于高通量测序技术研究成年大熊猫肠道菌群 被引量:19
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作者 何永果 晋蕾 +8 位作者 李果 李才武 李蓓 李伟 张亚辉 胡正泉 黄炎 张和民 邹立扣 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期771-777,共7页
选取6只成年健康大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)、1只成年亚健康大熊猫,基于高通量测序技术,测定其肠道内细菌及真菌组成,研究性别和健康状况对成年大熊猫肠道微生物的影响,分析不同年龄段大熊猫肠道菌群的差异.结果表明,在门水平,成... 选取6只成年健康大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)、1只成年亚健康大熊猫,基于高通量测序技术,测定其肠道内细菌及真菌组成,研究性别和健康状况对成年大熊猫肠道微生物的影响,分析不同年龄段大熊猫肠道菌群的差异.结果表明,在门水平,成年大熊猫肠道内细菌主要为Proteobacteria和Firmicutes,真菌主要为Ascomycota和Basidiomycota.在属水平,成年大熊猫肠道细菌为Escherichia、Streptococcus、Clostridium及Leuconostoc,真菌为Humicola.雌性和雄性大熊猫肠道菌群没有显著性差异(P>0.05),健康大熊猫肠道细菌Esherichia、Clostridium(53.33%、1.10%)的含量比亚健康大熊猫(2.48%、0.00%)高,Streptococcus(22.88%)的含量比亚健康大熊猫(48.15%)低,健康大熊猫肠道真菌的多样性高于亚健康大熊猫.与文献比较发现,大熊猫肠道内菌群多样性为成年>老年>亚成体,随年龄增长,成年时Streptococcus(22.88%)、Leuconostoc(2.97%)和Clostridium(1.10%)的含量升高,Shigella(6.25%)和Citrobater(2.50%)的含量降低,老年时Weissella(16.67%)的含量升高,Leuconostoc(2.97%)和Clostridium(1.10%)的含量降低.本研究结果表明身体健康状况和年龄对大熊猫肠道微生物菌群结构组成有影响,成年大熊猫性别对肠道菌群没有影响. 展开更多
关键词 高通量测序 成年大熊猫 肠道微生物 性别 健康状况 年龄
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果糖与蔗糖摄入对大鼠肠道菌群结构的影响
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作者 宋歌 孙学谦 +4 位作者 王勇 庞邵杰 方微 彭文婷 綦文涛 《营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期284-292,共9页
目的探索相同剂量下果糖和蔗糖对大鼠生理生化指标和肠道菌群的影响,为促进糖类健康消费提供参考。方法36只健康成年雄性SD大鼠被随机分成3组:(1)对照组(Control):饲喂正常日粮;(2)果糖组(Fru):饲喂日粮中添加了13.2%果糖;(3)蔗糖组(Sa... 目的探索相同剂量下果糖和蔗糖对大鼠生理生化指标和肠道菌群的影响,为促进糖类健康消费提供参考。方法36只健康成年雄性SD大鼠被随机分成3组:(1)对照组(Control):饲喂正常日粮;(2)果糖组(Fru):饲喂日粮中添加了13.2%果糖;(3)蔗糖组(Sac):饲喂日粮中添加了13.2%蔗糖;实验持续20w。实验期间测定大鼠空腹血糖,OGTT变化,实验结束时收集血清和结肠内容物,对大鼠血液生化指标及肠道菌群结构进行分析。结果添加果糖导致大鼠血清中胰岛素和超氧化物歧化酶降低,脂肪酶、丙二醛和游离脂肪酸升高,但提高了肠道中丁酸的含量(P<0.05);添加蔗糖导致结肠中乳酸菌相对丰度降低;果糖和蔗糖的添加均引起了大鼠结肠菌群物种丰富度下降,蔗糖组中乳酸菌相对丰度降低(P<0.05)。结论在大鼠日粮中适量添加果糖,不会对糖代谢和脂代谢的主要脏器胰腺和肝脏造成明显伤害,但仍对大鼠血清中相关酶类及肠道菌群产生了一定影响。 展开更多
关键词 蔗糖 果糖 肠道菌群高通量测序 短链脂肪酸
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神经母细胞瘤候选致病基因的研究进展
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作者 靳燕 赵强 《中华小儿外科杂志》 CSCD 北大核心 2019年第1期80-84,共5页
本综述阐述了神经母细胞瘤候选致病基因的研究进展,并对这些基因的功能进行归类总结。同时也回顾了目前用于寻找该病致病或易感基因的各种方法,分析了其优缺点,并创新性地提出靶向捕获的二代测序技术是寻找神经母细胞瘤潜在致病突变基... 本综述阐述了神经母细胞瘤候选致病基因的研究进展,并对这些基因的功能进行归类总结。同时也回顾了目前用于寻找该病致病或易感基因的各种方法,分析了其优缺点,并创新性地提出靶向捕获的二代测序技术是寻找神经母细胞瘤潜在致病突变基因的关键方法,或许可以为治疗干预措施提供潜在的新靶点。 展开更多
关键词 神经母细胞瘤 基因 高通量核苷酸测序
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建设中的上海港罗泾码头
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作者 洪国镇 《上海建设科技》 1996年第1期21-22,24,共3页
介绍了罗泾码头的总体规划、一期工程情况及采用的新技术、新工艺、新设备和与国际接轨的现代监理制度的实施经验。
关键词 码头 总体规划 吞吐量 监理制度
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