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HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-献血者血清学与分子生物学特征分析 被引量:1
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作者 景媛媛 范云 +3 位作者 郭燕 张文娟 段勇 冯娜 《中国输血杂志》 CAS 2024年第4期412-416,共5页
目的 了解西安地区无偿献血人群HBsAg ELISA检测结果与HBV DNA检测结果不一致的标本相关血清学标志物的分布情况。方法 收集2022年11月1日—2023年4月30日陕西省血液中心HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-(ELISA+/NAT-)标本共计71份,对其采用... 目的 了解西安地区无偿献血人群HBsAg ELISA检测结果与HBV DNA检测结果不一致的标本相关血清学标志物的分布情况。方法 收集2022年11月1日—2023年4月30日陕西省血液中心HBsAg ELISA+/HBV DNA NAT-(ELISA+/NAT-)标本共计71份,对其采用电化学发光法检测乙肝血清学标志物,同时复检巢式PCR扩增HBV S区和C区基因片段。结果 双ELISA+/NAT-标本(n=30)巢式PCR检测阳性率远高于单ELISA+/NAT-标本(n=41)(60%vs 24.40%,P<0.05)。前者献血者100%为初次献血者,血清抗-HBc阳性率100%,血清学模式以1、4、5此3项阳性(80%)为主;后者献血者中31.7%为重复献血者,血清抗-HBc阳性率仅为19.51%,血清学模式以单2项阳性(43.90%)和全阴(36.58%)为主。结论 单ELISA+结果存在较多假阳性,导致不必要的血液报废;而NAT-标本可能存在低水平的HBV DNA,产生漏检风险。建议针对单HBsAg ELISA+/NAT-献血者,采用多套系统多种方法追溯检测,提高献血者HBV筛查的准确度,减少不必要的血液浪费。 展开更多
关键词 乙型肝炎表面抗原 无偿献血者 巢式PCR HBV dna
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新型超声快速处理活检标本保存不同年限对DNA质量的影响
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作者 石晨曦 朱卫东 +3 位作者 李三恩 李秀明 师逢 丁亚云 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第13期2655-2660,共6页
背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探... 背景:新型超声组织处理技术越来越多地被用来进行分子生物学分析,研究新型超声处理不同存储年限组织DNA的质量,对进一步分子检测的标本质控具有重要意义。目的:探讨新型超声处理活检标本存储不同年限对DNA质量的影响,以期为分子检测探索最佳的标本存储时间。方法:收集40例乳腺穿刺小活检组织,采用超声技术制作石蜡标本,按照存储年限分为4组:<1年组、1-3年组、>3-5年组及>5年组,每组10例,对石蜡标本进行切片,每张切片厚3μm,切片10-15张,提取DNA后通过Nanophotometer N60超微量分光光度计和Qubit 4.0荧光计检测DNA的质量浓度,记录A_(260)/A_(280)比值判定DNA的纯度,利用全自动毛细管电泳核酸分析仪(Qsep 100)检测DNA片段完整性,以评估DNA片段的质量。结果与结论:4组样本A_(260)/A_(280)均值在1.8-2.0之间,达到纯度要求,无明显差异。4组样本的DNA质量浓度(Qubit浓度)均值分别为30.39,14.33,2.52,1.95 ng/μL;DNA的平均N/Q比值分别为6.48,14.18,24.56,29.86;DNA质量数均值分别为5.64,1.76,1.24,0.80;大片段占比均值分别为56.08%,17.72%,12.68%,7.90%。PCR检测内控基因Ct均值分别为15.32,17.09,18.39,21.24。与<1年组相比,其余3组DNA浓度显著降低,N/Q比值显著增加,DNA质量数和大片段占比均值显著降低,Ct值升高,差异有显著性意义(P<0.05)。实验结果表明,对于新型超声处理活检标本,应优先选择存储<1年的样本进行日常分子检测,储存3年内的样本可满足二代测序等检测要求,5年内样本仅可尝试进行PCR等检测,存储超过5年的样本不建议进行后续分子检测。 展开更多
关键词 超声处理 存储年限 dna质量 片段完整性 降解程度 二代测序
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基于中医证候与精液质量相关参数构建精子DNA碎片预测模型与验证
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作者 周超 庾广聿 +4 位作者 阳绍华 高磊磊 金珍 蒋月园 李欢 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第13期2661-2668,共8页
背景:中医证候与精液质量相关参数相结合,共同预测精子DNA碎片指数(DNA fragmentation index,DFI)异常增高的发生并绘制列线图,能显著提高临床的实操性与应用效能,为临床全面评估精液质量,采取积极干预措施以改善临床结局及制定个体化... 背景:中医证候与精液质量相关参数相结合,共同预测精子DNA碎片指数(DNA fragmentation index,DFI)异常增高的发生并绘制列线图,能显著提高临床的实操性与应用效能,为临床全面评估精液质量,采取积极干预措施以改善临床结局及制定个体化医疗方案提供依据。目的:探讨基于中医证候与精液质量相关参数构建精子DNA碎片的预测模型与验证。方法:回顾性分析2019年7月至2021年7月在广西壮族自治区南溪山医院中医男科接受中医证候诊断及精子DNA碎片率检查的不育患者共420例,据《人类精液检查与处理实验室手册》(第6版),将其中137例精子DFI>30%患者纳入精子DFI异常增高组,将283例精子DFI≤30%作为对照组;首先采用单因素分析筛选精子DFI异常增高的影响因素,然后采用套索算法(LASSO)校正因子共线性问题并筛选出最佳匹配因子后,将其纳入多因素向前逐步Logistic回归找出其独立影响因素并绘制列线图,最后采用受试者工作曲线、校准曲线、临床决策曲线、临床影响曲线对该预测模型进行区分度与准确度及临床应用效能验证。结果与结论:①单因素分析结果显示,年龄、体质量指数、前向运动率、精子总活率、精子浓度、精子形态学、肾阳虚衰证、湿热下注证、肾精不足证为引发精子DFI异常增高的影响因子(P<0.05);②通过LASSO回归进一步筛选出的最佳匹配因素为年龄、体质量指数、精子总活率、精子浓度、精子形态学、肾阳虚衰证、湿热下注证、肾精不足证(P<0.05);③多因素向前逐步Logistic回归结果显示年龄、体质量指数、精子浓度、精子总活率、湿热下注证、肾阳虚衰证共6项为引发精子DFI异常增高的独立影响因素;④受试者工作曲线显示,模型组曲线下面积为0.760(0.713,0.806),验证组曲线下面积为0.745(0.714,0.776),说明该预测模型具有较好的区分度;⑤校准曲线平均绝对误差0.040,Hosmer-Lemeshow检验P>0.05,表明该模型预测发生精子DFI异常增高的概率与实际发生精子DFI异常增高的概率无显著统计学差异,证实该模型具有较好的准确度;⑥临床决策曲线与临床影响曲线显示,模型组与验证组分别在阈概率值为0.08-0.84与0.09-0.78时具有临床最大净获益,且在该阈概率范围内具有较好的临床应用效能;⑦结果表明,年龄、体质量指数、精子浓度、精子总活率、湿热下注证、肾阳虚衰证为引发精子DFI异常增高的独立影响因素,通过其构建的临床预测模型列线图具有较好的临床预测价值与临床应用效能,可为临床全面评估精液质量、预后与干预及个体化医疗服务提供依据。 展开更多
关键词 精子dna碎片 精子dna完整性 中医证候 精子dna碎片指数 预测模型
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FTA-环介导等温扩增技术直接提取变异链球菌DNA的效果评价 被引量:1
4
作者 王玥晖 尚进 +4 位作者 杨晨 符冬格 曹灿 张晓东 王敬夫 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第5期1043-1049,共7页
背景:变异链球菌是龋病的重要病原菌,及时检测变异链球菌水平对龋病的早发现、早治疗有重要意义。目的:建立并评价FTA-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术直接提取变异链球菌DNA的应用效果。方法:①制备... 背景:变异链球菌是龋病的重要病原菌,及时检测变异链球菌水平对龋病的早发现、早治疗有重要意义。目的:建立并评价FTA-环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技术直接提取变异链球菌DNA的应用效果。方法:①制备含有ATCC标准菌株变异链球菌的菌悬液,接种于脑心浸出液培养基,充分混匀后按10倍梯度稀释成7种浓度(4.2×10^(7),4.2×10^(6),4.2×10^(5),4.2×10^(4),4.2×10^(3),4.2×10^(2),4.2×10 CFU/mL),每个稀释级做2个平行对照,并增加无菌水作为空白对照;②分别采用FTA卡、常规煮沸法、试剂盒提取及裂解液提取4种方法直接提取菌株DNA,通过LAMP技术进行扩增,并进行特异性试验,比较4种提取方法的差异。结果与结论:①4种方法提取的DNA均满足LAMP扩增的要求;②特异性试验结果显示,只有变异链球菌才可特异扩增出靶基因;③裂解液提取法最低检测限为4.2×10^(3) CFU/mL,FTA卡提取法最低检测限为4.2×10^(4) CFU/mL,试剂盒提取法和常规煮沸法最低检测限分别为4.2×10^(6) CFU/mL和4.2×10^(7) CFU/mL;④4种提取方法其他方面的比较显示,试剂盒提取法的实验成本、步骤数和时间都是最高;其他3种方法步骤数一致,其中FTA卡所需仪器设备最少,常规煮沸法单次成本最低,裂解液提取法所需时间最少;FTA卡和裂解液提取法仅需少量菌即可提取成功,后者在时间方面优于FTA卡,但相较于FTA卡其单次成本高,所需设备多;⑤结果说明,该研究建立的FTA-LAMP技术具有操作简便、特异性强、灵敏度高、结果可视化等优势,有望为高效提取检测变异链球菌提供新途径。 展开更多
关键词 变异链球菌 环介导等温扩增 FTA卡 dna 可视化
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基于活产建立体外受精-胚胎移植精子DNA碎片指数的参考阈值及子代短期安全性
5
作者 周超 王淑娴 +2 位作者 于春梅 庾广聿 蒋月园 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2025年第1期111-119,共9页
背景:精子DNA碎片指数与受精、胚胎发育潜能、胚胎植入、流产及子代安全性等存在显著的相关性。然而,其临床参考值受多种因素的影响,导致临床意义极其有限,该研究以活产为结局,通过倾向评分匹配校正其他混杂因素后,构建精子DNA碎片指数... 背景:精子DNA碎片指数与受精、胚胎发育潜能、胚胎植入、流产及子代安全性等存在显著的相关性。然而,其临床参考值受多种因素的影响,导致临床意义极其有限,该研究以活产为结局,通过倾向评分匹配校正其他混杂因素后,构建精子DNA碎片指数与活产的最佳临床截断值,并对其进行内外部验证,具有较好的预测价值及临床应用效能。目的:探讨基于活产建立体外受精-胚胎移植精子DNA碎片指数的参考阈值及子代短期安全性。方法:选取2019年5月至2021年5月于常州市妇幼保健院接受体外受精-胚胎移植患者1921例,以倾向匹配容差0.02为标准,1∶1进行倾向评分匹配,结果活产组与非活产组各成功匹配540例,以此建立模型组;通过选取同时期广西壮族自治区南溪山医院接受体外受精-胚胎移植患者135例作为外部验证组;采用受试者工作曲线探求精子DNA碎片指数对活产的临床最佳截断值,分别采用限制性立方样条曲线、标准曲线、临床决策曲线、临床影响曲线及内外部验证等方法,对该截断值的准确性及临床应用效能进行评估。结果与结论:(1)非活产组精子DNA碎片指数显著高于活产组且与活产存在显著的负相关性(r=-0.444,P<0.001);(2)受试者工作曲线结果显示,DNA碎片指数对活产的最佳截断值为24.33%,曲线下面积为0.775(0.746,0.804),特异度为72.60%,敏感度为78.90%,准确度为75.70%;(3)限制性立方样条曲线拟合Logistic回归结果显示,当精子DNA碎片指数大于24.57%时,临床非活产的风险呈趋势性增涨;(4)Logistic回归概率分析结果显示,精子DNA碎片指数为活产的危险因素[OR(95%CI)=0.916(0.904,0.928),P<0.001],且当精子DNA碎片指数大于27.78%时,临床活产发生的概率将小于50%,随着精子DNA碎片指数每增高1个单位,活产的概率下降8.4%;(5)内外部对该临床截断值的验证均显示,该截点具有一定的临床预测价值及准确性;(6)临床决策曲线与临床影响曲线显示,以该临床截断值建立的预测模型在阈概率为0.22-0.73时具有临床最大净获益值,且在该阈概率范围内损失与获益的比值始终小于1,证实该预测模型具有较好的临床应用效能;(7)精子DNA碎片指数与子代短期安全性分析结果显示,精子DNA碎片指数与出生儿早产、体质量、畸形、性别差异无显著性;(8)结果表明,精子DNA碎片指数对体外受精-胚胎移植活产的最佳临床截断值为24.33%,以此建立的临床预测模型具有较好的区分度、准确度与临床应用效能,精子DNA碎片指数对子代短期安全性影响并不显著,但仍需大样本及长期的追踪评估。 展开更多
关键词 精子dna碎片指数 活产 体外受精-胚胎移植 子代安全性 最佳截断值
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基于多靶点粪便FIT-DNA联合检测技术的结直肠癌早筛应用研究
6
作者 王杰 侯明星 +4 位作者 程海东 刘永强 苗杰 李淑雯 陈璐 《肿瘤防治研究》 CAS 2024年第7期578-582,共5页
目的评价多靶点粪便FIT-DNA联合检测技术在结直肠癌早期筛查中的效果并进一步分析其应用前景。方法选取内蒙古医科大学附属医院就诊人群,每位受试者分别行血清肿瘤标志物检测、多靶点粪便FIT-DNA联合检测、肠镜检查,以接受多靶点粪便FIT... 目的评价多靶点粪便FIT-DNA联合检测技术在结直肠癌早期筛查中的效果并进一步分析其应用前景。方法选取内蒙古医科大学附属医院就诊人群,每位受试者分别行血清肿瘤标志物检测、多靶点粪便FIT-DNA联合检测、肠镜检查,以接受多靶点粪便FIT-DNA联合检测人群为实验组,以接受肠镜检查及血清肿瘤标志物检测人群为对照组,以病理结果为金标准,评价新型粪便分子检测技术对于结直肠癌筛查的效果,对筛出的阳性人群给予及时干预。结果共分析了115例患者。血清肿瘤标志物检测敏感度63.2%(43/68),特异度74.5%(35/47);肠镜检查敏感度97.1%(66/68),特异度80.7%(38/47);而多靶点粪便FIT-DNA联合检测敏感度89.7%(61/68),特异度87.2%(41/47)。多靶点粪便FIT-DNA联合检测敏感度、特异度等均优于血清肿瘤标志物检测,敏感度虽低于肠镜检查,但相较肠镜检查操作简单,可居家自测。 展开更多
关键词 多靶点粪便FIt-dna联合检测 血清肿瘤标志物 结直肠癌 早筛 肠镜检查
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某社区体检人群多靶点粪便FIT-DNA筛查结直肠癌的效果分析
7
作者 陆艳红 张晗 +2 位作者 赵燕萍 谢秋霞 张超彦 《健康体检与管理》 2024年第1期19-22,93,共5页
目的:分析2019年5月至2020年11月北京市东高地社区35~74岁体检人群结直肠癌筛查结果,为结直肠癌早期筛查模式提供一些参考。方法:采用多靶点粪便FIT-DNA联合检测技术检查,阳性人群全结肠镜检查。结果:1963人完成检测,FIT-DNA阳性率14.0%... 目的:分析2019年5月至2020年11月北京市东高地社区35~74岁体检人群结直肠癌筛查结果,为结直肠癌早期筛查模式提供一些参考。方法:采用多靶点粪便FIT-DNA联合检测技术检查,阳性人群全结肠镜检查。结果:1963人完成检测,FIT-DNA阳性率14.0%(275/1963),随年龄增长呈增高趋势(χ2=17.990,P=0.000);70~74岁男性阳性率(27.5%)高于同龄女性(15.3%),其他年龄组无性别差异(P<0.000);高血压、糖尿病、经常吸烟、经常饮酒、低学历人群的FIT-DNA阳性率均增高(P<0.05)。肠镜总参与率9.48%(186/1963),FIT-DNA阳性肠镜参检率61.8%(170/275),检出结直肠癌和癌前病变33.9%(63/186);FIT-DNA和肠镜结果的阳性符合率达92.10%,其中肠癌与高级别病变阳性符合率达100%;75.9%(1489/1963)的人同时进行了FIT-DNA及iFOB检查,前者高于后者(χ2=39.78,P<0.001),前者是后者的2.18倍(OR=2.177,95%CI 1.70~22.784)。结论:FIT-DNA可明显提高肠镜检查的参与率,有利于提高肠癌及癌前病变检出率,可以作为社区人群早期筛查结直肠癌一种有效手段。 展开更多
关键词 社区 体检人群 多靶点粪便FIt-dna 结直肠癌 癌前病变
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Development and validation of a circulating tumor DNA-based optimization-prediction model for short-term postoperative recurrence of endometrial cancer
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作者 Yuan Liu Xiao-Ning Lu +3 位作者 Hui-Ming Guo Chan Bao Juan Zhang Yu-Ni Jin 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2024年第18期3385-3394,共10页
BACKGROUND Endometrial cancer(EC)is a common gynecological malignancy that typically requires prompt surgical intervention;however,the advantage of surgical management is limited by the high postoperative recurrence r... BACKGROUND Endometrial cancer(EC)is a common gynecological malignancy that typically requires prompt surgical intervention;however,the advantage of surgical management is limited by the high postoperative recurrence rates and adverse outcomes.Previous studies have highlighted the prognostic potential of circulating tumor DNA(ctDNA)monitoring for minimal residual disease in patients with EC.AIM To develop and validate an optimized ctDNA-based model for predicting shortterm postoperative EC recurrence.METHODS We retrospectively analyzed 294 EC patients treated surgically from 2015-2019 to devise a short-term recurrence prediction model,which was validated on 143 EC patients operated between 2020 and 2021.Prognostic factors were identified using univariate Cox,Lasso,and multivariate Cox regressions.A nomogram was created to predict the 1,1.5,and 2-year recurrence-free survival(RFS).Model performance was assessed via receiver operating characteristic(ROC),calibration,and decision curve analyses(DCA),leading to a recurrence risk stratification system.RESULTS Based on the regression analysis and the nomogram created,patients with postoperative ctDNA-negativity,postoperative carcinoembryonic antigen 125(CA125)levels of<19 U/mL,and grade G1 tumors had improved RFS after surgery.The nomogram’s efficacy for recurrence prediction was confirmed through ROC analysis,calibration curves,and DCA methods,highlighting its high accuracy and clinical utility.Furthermore,using the nomogram,the patients were successfully classified into three risk subgroups.CONCLUSION The nomogram accurately predicted RFS after EC surgery at 1,1.5,and 2 years.This model will help clinicians personalize treatments,stratify risks,and enhance clinical outcomes for patients with EC. 展开更多
关键词 Circulating tumor dna Endometrial cancer Short-term recurrence Predictive model Prospective validation
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Peripheral mitochondrial DNA as a neuroinflammatory biomarker for major depressive disorder
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作者 Jinmei Ye Cong Duan +5 位作者 Jiaxin Han Jinrong Chen Ning Sun Yuan Li Tifei Yuan Daihui Peng 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS 2025年第6期1541-1554,共14页
In the pathogenesis of major depressive disorder, chronic stress-related neuroinflammation hinders favorable prognosis and antidepressant response. Mitochondrial DNA may be an inflammatory trigger, after its release f... In the pathogenesis of major depressive disorder, chronic stress-related neuroinflammation hinders favorable prognosis and antidepressant response. Mitochondrial DNA may be an inflammatory trigger, after its release from stress-induced dysfunctional central nervous system mitochondria into peripheral circulation. This evidence supports the potential use of peripheral mitochondrial DNA as a neuroinflammatory biomarker for the diagnosis and treatment of major depressive disorder. Herein, we critically review the neuroinflammation theory in major depressive disorder, providing compelling evidence that mitochondrial DNA release acts as a critical biological substrate, and that it constitutes the neuroinflammatory disease pathway. After its release, mitochondrial DNA can be carried in the exosomes and transported to extracellular spaces in the central nervous system and peripheral circulation. Detectable exosomes render encaged mitochondrial DNA relatively stable. This mitochondrial DNA in peripheral circulation can thus be directly detected in clinical practice. These characteristics illustrate the potential for mitochondrial DNA to serve as an innovative clinical biomarker and molecular treatment target for major depressive disorder. This review also highlights the future potential value of clinical applications combining mitochondrial DNA with a panel of other biomarkers, to improve diagnostic precision in major depressive disorder. 展开更多
关键词 BIOMARKER cytokine EXOSOMES INFLAMMASOME major depressive disorder MICROGLIA mitochondrial dna mitochondrial dysfunction NEUROINFLAMMATION Toll-like receptor
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利用水稻C_0t-1DNA和基因组DNA对栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻基因组的比较分析 被引量:13
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作者 蓝伟侦 何光存 +1 位作者 吴士筠 覃瑞 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1083-1090,共8页
目的研究中高度重复序列在稻属不同物种基因组进化中的作用。方法用栽培稻C0t-1DNA和基因组DNA(gDNA)作为探针,分别对栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻进行荧光原位杂交(FISH)和比较基因组杂交(CGH)。结果C0t-1DNA覆盖栽培稻、药用野生... 目的研究中高度重复序列在稻属不同物种基因组进化中的作用。方法用栽培稻C0t-1DNA和基因组DNA(gDNA)作为探针,分别对栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻进行荧光原位杂交(FISH)和比较基因组杂交(CGH)。结果C0t-1DNA覆盖栽培稻、药用野生稻和疣粒野生稻基因组比例(%)和大小(Mb)分别为47.10±0.16,38.61±0.13,44.38±0.13和212.33±1.21,269.42±0.89以及532.56±1.68。栽培稻gDNA在药用野生稻和疣粒野生稻基因组中的覆盖率约为91.0%和93.6%,含量分别约为634Mb和1123Mb,各有365Mb和591Mb不属于源自栽培稻基因组的中高度重复序列,未被栽培稻gDNA所覆盖的部分,分别为64Mb和78Mb左右。此外,以C0t-1DNA的组成为依据,对这3个种核型进行了同源性聚类。结论稻属中度和高度重复序列和功能基因一样,在不同种中也存在着高度同源性和保守性,并在进化过程中得以保存下来。药用野生稻和疣粒野生稻基因组增大的重要原因之一,可能是基因组中度和高度重复序列加倍的结果,药用野生稻这种序列扩增相对疣粒野生稻要缓和得多。另外,这两个野生种在长期进化过程中,由于存在加倍、重排和基因选择性丢失等现象,形成了具有自己种的特异性的基因组成分。 展开更多
关键词 C0t-1 dna CGH 核型 药用野生稻 疣粒野生稻
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甘蓝rDNA及C_0t-1 DNA荧光原位杂交及其核型分析 被引量:8
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作者 王太霞 吴春红 +1 位作者 黄进勇 魏文辉 《武汉大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期230-234,共5页
为了探索一种高效可靠的芸薹属植物核型分析方法,本文以甘蓝品种黑叶小平头为实验材料,从其基因组DNA中分离出C0t-1 DNA并用生物素标记作探针,对有丝分裂中期相染色体进行原位杂交,每对染色体上均显示出了特定的荧光原位杂交带型.将植物... 为了探索一种高效可靠的芸薹属植物核型分析方法,本文以甘蓝品种黑叶小平头为实验材料,从其基因组DNA中分离出C0t-1 DNA并用生物素标记作探针,对有丝分裂中期相染色体进行原位杂交,每对染色体上均显示出了特定的荧光原位杂交带型.将植物25S和5S rDNA分别用地高辛和生物素标记作探针,单色荧光原位杂交结果显示黑叶小平头2对染色体具有25S rDNA基因座,1对染色体具有5S rDNA基因座.生物素标记的C0t-1 DNA与地高辛标记的25S rDNA等量混合作探针,双色荧光原位杂交证实了C0t-1 DNA与25S rDNA二者具有一致的染色体位置特征,表明基于rDNA及C0t-1 DNA荧光原位杂交的核型分析技术,优于目前普遍采用的只基于rDNA荧光原位杂交的核型分析方法.结合已报道的rDNA染色体定位结果,及C0t-1 DNA荧光原位杂交带型与染色体形态,更准确地构建了甘蓝的核型. 展开更多
关键词 甘蓝 Rdna C0t-1 dna 荧光原位杂交 核型分析
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T-2毒素对大鼠心肝肾及外周血淋巴细胞DNA损伤的实验观察 被引量:10
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作者 卜黎明 刘宁 +1 位作者 程绍辉 孙殿军 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期332-334,共3页
目的 探求 T- 2毒素在体内的毒作用靶器官以及对 T- 2毒素中毒的敏感监测方法和生物标志。方法 采用单细胞凝胶电泳 (SCGE)技术及动物实验。结果 在所测的器官中 ,以大鼠肝脏对 T- 2毒素最为敏感 ,其次为外周血淋巴细胞 (PBL )。结... 目的 探求 T- 2毒素在体内的毒作用靶器官以及对 T- 2毒素中毒的敏感监测方法和生物标志。方法 采用单细胞凝胶电泳 (SCGE)技术及动物实验。结果 在所测的器官中 ,以大鼠肝脏对 T- 2毒素最为敏感 ,其次为外周血淋巴细胞 (PBL )。结论 外周血淋巴细胞的 DNA损伤可以作为机体 T- 展开更多
关键词 t-2毒素 dna损伤 单细胞凝胶电泳 SCGE 外周血淋巴细胞 PBL KBD 早期诊断
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基于EST-SSR标记的甘薯种质资源DNA指纹图谱构建 被引量:17
13
作者 罗忠霞 房伯平 +7 位作者 李茹 王章英 黄立飞 陈景益 张雄坚 李育军 陈新亮 黄实辉 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期810-814,共5页
采用EST-SSR标记构建了国家种质广州甘薯圃中52份甘薯种质资源的DNA指纹图谱。利用52份供试资源,从早期筛选出的342对候选多态性引物中筛选出16对核心引物,16对引物在52份资源中共扩增出159个等位位点,每对引物的等位位点数为5~19个不... 采用EST-SSR标记构建了国家种质广州甘薯圃中52份甘薯种质资源的DNA指纹图谱。利用52份供试资源,从早期筛选出的342对候选多态性引物中筛选出16对核心引物,16对引物在52份资源中共扩增出159个等位位点,每对引物的等位位点数为5~19个不等,平均为9.94个,多态性信息含量变化范围为0.6235~0.9593,平均为0.7991。选择带型清晰、重复性好、易于统计且能将52份资源完全区分开的2对引物组合构建供试资源的DNA指纹图谱。NTSYS软件聚类分析表明,EST-SSR标记能正确反映出不同资源间的亲缘关系,为构建甘薯大型DNA指纹图谱数据库奠定了基础。 展开更多
关键词 甘薯 种质资源 ESt-SSR dna指纹图谱
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利用药用野生稻C基因组C_0t-1 DNA比较分析宽叶野生稻CCDD基因组 被引量:4
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作者 吴绮 覃瑞 +1 位作者 李刚 刘虹 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期589-592,599,共5页
以来源于C基因组的药用野生稻的中高度重复序列C0t-1DNA为探针,在不同的洗脱严谨度下,通过荧光原位杂交对宽叶野生稻(CCDD)基因组进行了分析。结果发现,随着洗脱严谨度的调整,杂交信号呈现出较高的特异性,主要分布在着丝粒、近着丝粒及... 以来源于C基因组的药用野生稻的中高度重复序列C0t-1DNA为探针,在不同的洗脱严谨度下,通过荧光原位杂交对宽叶野生稻(CCDD)基因组进行了分析。结果发现,随着洗脱严谨度的调整,杂交信号呈现出较高的特异性,主要分布在着丝粒、近着丝粒及端粒区域。本文以宽叶野生稻的核型分析为基础,比较其与二倍体药用野生稻基因组的异同,从而进一步探讨野生稻的进化起源机制。 展开更多
关键词 C0t-1dna 荧光原位杂交 洗脱严谨度 宽叶野生稻
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T-2毒素致DNA损伤研究 被引量:8
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作者 刘宁 任志鸿 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 1998年第2期72-74,共3页
新生肉鸡鸡雏经口给予不同剂量的T-2毒素,一周后处死,常规酚抽提法提取肝、心、肾、肌肉及软骨组织的DNA,1.8%琼脂糖凝胶电泳观察。结果显示,T-2毒素可致多种组织DNA损伤,但程度不同。大剂量以细小碎片为主,降低... 新生肉鸡鸡雏经口给予不同剂量的T-2毒素,一周后处死,常规酚抽提法提取肝、心、肾、肌肉及软骨组织的DNA,1.8%琼脂糖凝胶电泳观察。结果显示,T-2毒素可致多种组织DNA损伤,但程度不同。大剂量以细小碎片为主,降低剂量,大碎片增多,且可见有规则的断裂带发生。对实验结果,做了扼要讨论。 展开更多
关键词 t-2毒素 dna损伤 琼脂糖凝胶电泳
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土壤细菌DNA提取及多样性分析的T-RFLP方法 被引量:14
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作者 葛芸英 陈松 +1 位作者 胡兰 涂政 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期131-136,共6页
获得高质量的土壤总DNA是土壤细菌生态学的关键步骤之一。实验通过综合应用两个试剂盒(Soilmaster kit和DNA IQ^(TM)系统)的优点进行土壤样品总DNA的提取,结果证明该方法是一种快速、有效、灵敏、稳定的土壤DNA提取方法。另外尝试将16S ... 获得高质量的土壤总DNA是土壤细菌生态学的关键步骤之一。实验通过综合应用两个试剂盒(Soilmaster kit和DNA IQ^(TM)系统)的优点进行土壤样品总DNA的提取,结果证明该方法是一种快速、有效、灵敏、稳定的土壤DNA提取方法。另外尝试将16S rDNA序列和T-RFLP(Terminal restriction fragment length polymorphism)技术引入土壤细菌DNA群落多样性的研究中,证明T-RFLP是一种有力的土壤细菌多样性分析工具。 展开更多
关键词 土壤细菌 多样性分析 dna提取 t-RFLP分析
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T-DNA插入产生的水稻白化苗突变的遗传分析 被引量:9
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作者 张泽民 朱海涛 +6 位作者 王江 高菊 陈兆贵 刘芳 宛新杉 张景六 张桂权 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期1-5,共5页
在筛选和鉴定水稻T-DNA(含Basta抗性基因Bar)插入纯合体的过程中,观察到1个白化苗的突变体.对该突变体进行遗传分析表明,分离群体出现绿苗和白化苗2种类型,其分离比率为3∶1,符合1对基因的显性遗传.Basta抗性检测、PCR分子检测及Souther... 在筛选和鉴定水稻T-DNA(含Basta抗性基因Bar)插入纯合体的过程中,观察到1个白化苗的突变体.对该突变体进行遗传分析表明,分离群体出现绿苗和白化苗2种类型,其分离比率为3∶1,符合1对基因的显性遗传.Basta抗性检测、PCR分子检测及Southern杂交证实,该突变体是由单一T-DNA插入所引起的,白化苗性状与T-DNA共分离.该突变材料可用于插入座位的基因克隆. 展开更多
关键词 水稻 白化苗突变体 T—dna插入 遗传分析
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用SCGE法观察砷、氟、黄绿青霉素和T-2毒素引起的SGC-7901细胞基因组DNA损伤 被引量:4
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作者 姜树林 青雪梅 孙殿军 《中国地方病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第4期289-291,共3页
目的 观察砷、氟、黄绿青霉素和 T-2毒素对 SGC-790 1细胞基因组 DNA的损伤作用及特点。方法 染毒剂量 10μmol/ L ,染毒后 4h应用单细胞凝胶电泳技术结合“彗星图像分析系统”检测 DNA损伤。结果 Na As O2 组尾长明显大于对照组 ;N... 目的 观察砷、氟、黄绿青霉素和 T-2毒素对 SGC-790 1细胞基因组 DNA的损伤作用及特点。方法 染毒剂量 10μmol/ L ,染毒后 4h应用单细胞凝胶电泳技术结合“彗星图像分析系统”检测 DNA损伤。结果 Na As O2 组尾长明显大于对照组 ;Na F组拖尾率显著高于对照组 ;CIT组总拖尾率、尾长和尾动量均高于对照组 ;而 T-2毒素组各指标均高于对照组。结论  Na As O2 、Na F、CIT和 T-2毒素均可引起 DNA损伤 ,但各有特点 ,说明它们引起 展开更多
关键词 SCGE法 黄绿青霉素 t-2毒素 SGC-79O1细胞基因 dna损伤 公共卫生学
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结核分枝杆菌Ag85A/ESAT-6嵌合型质粒DNA疫苗和抗结核药物联合治疗小鼠耐药结核病的效果研究 被引量:9
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作者 梁艳 吴雪琼 +5 位作者 张俊仙 阳幼荣 王兰 李洪敏 李忠明 史迎昌 《中国防痨杂志》 CAS 2007年第5期382-385,共4页
目的研究结核分枝杆菌Ag85A/ESAT-6嵌合型质粒DNA疫苗和抗结核药物联合治疗小鼠耐药结核病的效果。方法用结核分枝杆菌高耐利福平低耐异烟肼临床分离株HB240尾静脉注射BALB/c小鼠1个月后,将小鼠随机分成2组,第1组用利福平(RFP)、异烟肼(... 目的研究结核分枝杆菌Ag85A/ESAT-6嵌合型质粒DNA疫苗和抗结核药物联合治疗小鼠耐药结核病的效果。方法用结核分枝杆菌高耐利福平低耐异烟肼临床分离株HB240尾静脉注射BALB/c小鼠1个月后,将小鼠随机分成2组,第1组用利福平(RFP)、异烟肼(INH)治疗12周,第2组用RFP、INH和结核分枝杆菌Ag85A/ESAT-6嵌合型质粒DNA疫苗(免疫5次)联合治疗12周;治疗结束后4和8周,分别取肺、肝和脾观察病理改变、称取质量、作菌落计数。结果治疗结束后4和8周,第2组小鼠体质量均超过第1组,但无显著性差异(P>0.05)。治疗结束后4周,第2组肺、脾脏指数(0.017,0.011)均略低于第1组(0.020,0.012)(P>0.05);治疗结束后8周,第2组肺、肝脏指数(0.021,0.047)均略低于第1组(0.022,0.048)(P>0.05);而第2组脾脏指数(0.008)显著低于第1组(0.012)(P<0.05)。治疗结束后4周,第2组有4例脾脏未见明显病变,第1组仅1例脾脏未见明显病变;治疗结束后8周,第2组有1例肺门淋巴结肿大,而第1组有3例;第2组有5例脾脏未见明显病变,第1组仅2例脾脏未见明显病变。治疗结束后4周,第2组肺菌落计数和脾菌落计数比第1组显著减少,分别减少70%和80%。结论DNA疫苗和抗结核药物联合治疗小鼠耐药结核病疗效高于单纯化疗。 展开更多
关键词 dna疫苗 分枝杆菌 结核
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日本血吸虫DNA多价疫苗SjGST-FABP/pcDNA3的构建及其保护性免疫研究 被引量:11
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作者 李建国 张阳德 +1 位作者 李罗丝 向秋 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第14期1709-1712,1716,共5页
目的构建日本血吸虫DNA多价疫苗SjGST-FABP/pcDNA3,用以免疫小鼠,观察其在小鼠抗血吸虫感染中的免疫保护作用。方法根据质粒pGEX-4T-1中SjGST-ORF和SjFABP基因序列,利用基因重组、PCR等技术将SjGST和SjFABP编码基因拼接在一起,得到融合... 目的构建日本血吸虫DNA多价疫苗SjGST-FABP/pcDNA3,用以免疫小鼠,观察其在小鼠抗血吸虫感染中的免疫保护作用。方法根据质粒pGEX-4T-1中SjGST-ORF和SjFABP基因序列,利用基因重组、PCR等技术将SjGST和SjFABP编码基因拼接在一起,得到融合基因SjGST-FABP,将融合基因SjGST-FABP定向克隆到pcDNA3多克隆位点上,转化大肠杆菌,经质粒扩增和DNA序列测定后,进行小鼠动物免疫和日本血吸虫尾蚴攻击感染及免疫保护性评价。结果成功构建了日本血吸虫DNA多价疫苗SjGST-FABP/pcDNA3。免疫小鼠获得42.39%的减虫率和56.09%肝减卵率(P<0.05)。结论日本血吸虫DNA多价疫苗SjGST-FABP/pcDNA3可诱导部分抗血吸虫尾蚴攻击感染的免疫保护效果,具有疫苗研究与开发价值。 展开更多
关键词 日本血吸虫 GST 脂肪酸结合蛋白 多价dna疫苗
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