蕨麻猪产仔性状全基因组关联分析

本研究旨在挖掘影响蕨麻猪总产仔数(Total number born,TNB)和产活仔数(Number born alive,NBA)的候选基因,为蕨麻猪高繁殖力基因组选育提供参考数据。采集140头蕨麻猪耳组织样品,提取DNA,利用50K液相芯片进行SNPs检测。分别采用广义线性模型和混合线性模型对140头蕨麻猪个体的SNPs与TNB和NBA进行全基因组关联分析(Genome-wide association studies,GWAS),筛选影响该群体繁殖性状的候选基因。结果显示:针对TNB和NBA等2个性状,广义线性模型分别检测到14个和1个显著的SNPs位点。混合线性模型检测到TNB有2个显著的SNPs位点;未检测到显著影响NBA的SNP。筛选ZCCHC24、ENSSSCG00000046125和TENM1作为影响TNB的重要候选基因,ZCCHC24作为影响NBA的重要候选基因。

猪产仔数的候选基因或QTLs的研究进展

猪的繁殖性状是一个重要的经济性状,是反映猪场水平和经济效应的重要指标。猪的繁殖性状由一系列主基因或数量性状位点(QTL s)控制,而产仔数是猪繁殖性状中重要的性状。本文综述了控制猪产仔数的候选基因或QTL s的研究进展。

利用紧缩线性模型和贝叶斯模型对猪总产仔数和产活仔数性状的全基因组关联研究

全基因组关联分析策略已逐渐成为家畜重要经济性状研究的强有力工具。文章使用猪60K SNP芯片对一个具多胎繁殖性状记录的商业母猪群(n=820)进行分型检测,共计57 814个SNP通过设定质控标准。主成分分析显示群体内不存在显著的群体分层现象,而后分别运用两种统计模型Compressed Mixed Linear Model(GAPIT程序包)、Bayes CPi(GenSel软件)进行第1和第2胎次总产仔数和产活仔数性状的全基因组关联分析。从两种分析方法所得结果中各取最显著的50个SNP位点进行比较:对于第1胎次总产仔数,两种方法分析结果存在31个重合SNP位点,对于第1胎次产活仔数,有20个重合SNP位点;且两种统计分析结果中最显著的SNP位点都在另一方法中得到验证。与第1胎次总产仔数显著关联的SNP位于1、2、3、7、13、16和18号染色体,与第1胎次产活仔数显著关联的SNP位于1、3、4、13和16号染色体上的11个区域内。在1、3、13和16染色体上共有5个区域同时与这两个性状显著关联。与第2胎次总产仔数和产活仔数显著关联的区域主要位于7、10、12、13、14和16号染色体的6个重叠区域内。

猪雌激素受体基因PvuⅡ酶切片段多态性与产仔性能的关系

研究了雌激素受体(ESR)基因对苏钟猪和二花脸猪繁殖性能的影响。记录 93头母猪 660多窝产仔数用以分析雌激素受体基因型对总产仔数、产活仔数的影响。结果表明,雌激素受体基因A和B等位基因的频率,苏钟猪分别为 0. 536 6和 0. 463 4,二花脸猪分别为 0. 307 7和 0. 692 3;二花脸猪各雌激素受体基因型间头胎总产仔数和产活仔数差异显著(P<0. 05);苏钟猪头胎总产仔数AA基因型与AB、BB基因型之间差异显著(P<0. 05);二花脸猪经产总产仔数和产活仔数AB基因型与BB基因型之间差异显著(P<0. 05)。

中国生育水平的空间与社会趋同研究——基于“五普”和“六普”微观数据的比较分析

本研究以2010年中国第六次人口普查微观数据为基础,采用35岁妇女平均曾生子女数作为终生生育率的估计指标对当前中国的生育水平进行分析。研究发现,当前中国妇女的终生生育率为1.52,通过教育部9岁学龄儿童人数估算的妇女终生生育率也介于1.5~1.6之间,因此,当前中国已经处于低生育水平国家行列。不同省(自治区、直辖市)、民族、文化教育程度、职业、城乡、农业户籍和非农业户籍、流动人口与户籍人口的生育水平有趋同的发展态势。

母猪断奶后发情刺激和分娩前体况对发情率和总产仔数的影响

为研究断奶后不同时间公猪、光照刺激以及体况对母猪发情率和总产仔数的影响,选取同一批次断奶的二元母猪560头,随机分为4组,分别给予不同时间的公猪和光照刺激。结果显示,分别接受长时间公猪(12 min)和光照(16 h)刺激,发情率和总产仔数会极显著高于其他处理组(P<0.01)。此外,试验选取同一批次并处于第三胎的母猪116头,根据其分娩期上产床时的P 2点背膘厚,分为12～14 mm、15～18mm和19～21mm3组,跟踪记录断奶后7天内发情的数量和下一胎总产仔数。结果显示,背膘厚处于15～18 mm的母猪发情率和总产仔数高于其他组,并存在极显著差异(P<0.01)。研究表明,长时间的公猪和光照刺激以及控制母猪背膘厚在15～18 mm范围内,能极大的发挥母猪的繁殖性能,提高生产成绩。

猪骨调素基因多态性对产仔性状的影响1

本文研究了骨调素基因对苏钟猪和二花脸猪繁殖性能的影响。93头母猪660多窝产仔数记录被用来分析骨调素基因型与总产仔数和产活仔数的关系。结果表明,二花脸猪经产总产仔数基因型158/142和170/152、168/140之间差异显著(P<0.05),产活仔数基因型158/142和170/152之间差异显著(P<0.05)。苏钟猪头胎产活仔数基因型164/168和140/152、142/168、152/170之间差异显著(P<0.05),经产总产仔数基因型152/170和130/142之间差异显著(P<0.05)。

抑制素α亚基基因5'UTR区在苏淮猪中的多态性分析

[目的]探究抑制素α亚基基因(INHA)5'UTR区多态性与苏淮猪产仔数相关性,为苏淮猪的分子选育工作提供理论依据。[方法]选取189头健康苏淮母猪,通过PCR扩增和测序对INHA基因5'UTR区基因多态性进行了检测,同时利用生物信息学方法分析该序列特征,最后通过群体遗传学和生物信息学分析了不同基因型对苏淮猪产仔数的影响。[结果]在苏淮猪INHA基因5'UTR调控区-42G>A处发现一个SNP位点,对其进行多态性分析,存在3种基因型,分别为GG、GA、AA,且基因型分布不符合哈代温伯格定律(P<0.01)。G等位基因为优势等位基因,GG型为优势基因型,GG型苏淮猪的平均总产仔数比AA型多0.63头(P<0.05)。[结论]INHA基因5'UTR区多态性可用于苏淮猪繁殖性状的分子标记辅助选择,加速育种进程。

利用关联组估计中国大白、长白及杜洛克猪繁殖性状的遗传参数

本研究旨在分析大白、长白及杜洛克3个品种猪在不同联合遗传评估组中总产仔数的遗传参数,为将来全国猪联合遗传评估奠定基础。利用DMU软件的DMU4过程计算74个国家生猪核心育种场间的关联率,根据联合遗传评估组内各场相互存在关联且每个场的平均关联率在3%以上原则,每个品种筛选出3个联合遗传评估组（组1、组2和组3）。利用DMU软件和动物模型估计3个联合遗传评估组中大白、长白及杜洛克猪总产仔数（TNB）性状的加性遗传、永久环境效应方差,分析时同时考虑管理组的固定效应,其中大白猪在组1、2和3中的繁殖记录数分别为61 161、19 974和18 002条;长白猪分别为28 239、11 918和3 064条;杜洛克猪分别为7 174、6 512和2 417条。结果表明,场间关联总体情况较差（平均关联率为0.20%）,全国范围的联合遗传评估条件还不满足,但可根据本研究结果进行局部联合遗传评估。永久环境效应估计值的变化为0.05~0.11,不同组及不同品种的总产仔数遗传力估计值约为0.10,在文献推荐范围之内。结果提示,组1中各品种猪的遗传力估计结果要优于其他联合遗传评估组,因此将来进行全国猪联合遗传评估时,可参考组1中各品种的TNB遗传力估计结果。

不同来源大白猪总产仔数近交衰退评估

旨在评估两个不同来源大白猪群体经过近8个世代的选育后总产仔数(total number of piglets born,TNB)近交衰退的程度。本研究对1937头大白猪使用GeneSeek GGP Porcine HD芯片进行分型,其中1039头来自加系大白猪和898头来自法系大白猪,且两品系均有表型记录和系谱记录,系谱共由3086头大白猪组成。分别使用系谱、SNP和ROH进行个体近交系数估计,并将近交系数作为协变量利用动物模型对总产仔数进行近交衰退评估。为了精准定位导致总产仔数衰退的基因组片段,又进一步对每条染色体以及显著染色体分段计算近交系数并估计其效应,检测是否能引起总产仔数发生近交衰退现象。对于加系群体,FROH、FGRM和FPED估计的近交系数均值分别为0.124、0.042和0.013,其中FROH和FPED相关最高,相关系数为0.358;对于法系群体,FROH、FGRM和FPED均值分别为0.123、0.052和0.007,其中FROH和FGRM相关最高,相关系数为0.371。利用3种不同计算方法所得近交系数用于估计近交衰退时,加系群体的总产仔数均检测到显著的近交衰退,而且当FROH、FGRM和FPED每增加10%时,总产仔数分别减少0.571、0.341和0.823头;但法系群体仅有FROH估计的总产仔数检测到显著近交衰退,FROH每增加10%时,总产仔数减少0.690头。为了锁定相关的染色体和基因组区段,首先利用ROH估计每条染色体近交系数并进行近交衰退分析发现,加系群体中检测到第6、7、8和13号染色体产生了显著近的总产仔数交衰退,而法系群体未检测到与近交衰退相关的染色体。然后,又将与加系总产仔数近交衰退显著相关的4条染色体平均分为2、4、6、8个片段进行近交衰退检测,其中平均分成8段后的染色片段的长度范围为15.1~25.8 Mb。在第6、7和8号染色体分别检测到1、2和3个与总产仔数相关的近交衰退染色体片段。这些区域注释到了CUL7、MAPK14和PPARD基因与胎盘发育相关,AREG和EREG基因与卵母细胞成熟有关。本研究利用3种近交系数计算方法对两个不同来源的大白猪总产仔数进行近交衰退评估,在加系大白猪中3种估计方法都能检测到近交衰退的现象,而法系群体中只有FROH才能检测到。而且通过ROH方法进一步确定了能引起加系大白猪总产仔数衰退的4条染色体和6个特定的染色体区段,还注释到了与繁殖相关的候选基因。这为揭示近交衰退的遗传机制提供了新的研究手段,也为基因组选种选配提供了参考依据。

分娩季节和胎次对岔路黑猪产仔性能的影响

为了研究分娩季节和胎次对岔路黑猪产仔性能的影响,文章对岔路黑猪的产仔记录进行了统计分析,结果显示,分娩胎次对岔路黑猪产仔性能具有显著影响,总产仔数和产活仔数都在第3胎时最高;分娩季节也对岔路黑猪产仔性能具有显著影响,岔路黑猪在夏季分娩时总产仔数和产活仔数最高,同时岔路黑猪在夏季分娩时的死胎数也最高。

分娩前饲喂包被氯化钙对母猪产程和死胎的影响

本试验旨在研究分娩前饲喂包被氯化钙对母猪产程和死胎的影响。选取913头妊娠109 d丹系长×大和大×长二元杂交母猪,根据体况和胎次接近的原则分成3组。对照组于妊娠109 d至分娩当天每天饲喂基础饲粮,试验Ⅰ组和试验Ⅱ组在基础饲粮的基础上分别额外饲喂25和50 g/d包被氯化钙。饲养试验从妊娠109 d到分娩当天。试验过程中每天进行粪便评分,于分娩当天记录试验母猪产程、产仔数和死胎数,并采集尿液和血液分别用于测定尿液pH和血清钙离子浓度。结果表明:1)总产仔数和分娩前饲喂包被氯化钙对母猪死胎数无显著交互作用(P>0.05);试验Ⅰ组和试验Ⅱ组死胎数分别为0.31和0.28头,显著低于对照组的0.44头(P<0.05),但试验Ⅰ组和试验Ⅱ组无显著差异(P>0.05)。2)试验Ⅰ组母猪产程相较于对照组显著缩短(P<0.05),而试验Ⅱ组产程相较于对照组无显著差异(P>0.05);3组母猪胎盘排出时间之间无显著差异(P>0.05)。3)3组母猪妊娠109 d和分娩当天尿液pH之间无显著差异(P>0.05);妊娠110 d到妊娠113 d,对照组和试验Ⅰ组尿液pH无显著差异(P>0.05),试验Ⅱ组尿液pH显著低于对照组和试验Ⅰ组(P<0.05)。与对照组相比,试验组母猪血清钙离子浓度显著提高(P<0.05),妊娠112 d和分娩当天粪便评分显著降低(P<0.05);3组母猪便秘率之间无显著差异(P>0.05)。综上所述,母猪妊娠109 d至分娩前饲喂25 g/d包被氯化钙可显著缩短产程,减少死胎,而且该效果不受母猪总产仔数的影响,该调控效果与其提高血液钙离子浓度有关。

采用深部输精与常规输精研究不同剂量和有效精子数对经产母猪繁殖力的影响

为探讨不同输精剂量与不同有效精子数对经产母猪繁殖力的影响,使用深部输精和常规输精作为主要配种方式。将发情母猪随机分为2组,A组为深部输精组(n=60),B组为常规输精组(n=60)。对A、B组内母猪分别用不同的输精剂量(Ⅰ:30亿/80 mL、Ⅱ:15亿/80 mL、Ⅲ:15亿/40 mL;n=20)进行输精。结果表明:与常规输精相比,深部输精组的受胎率和分娩率分别为93.33%和88.33%,略高于常规输精组的86.67%和83.33%,但差异不显著(P>0.05);但深部输精可显著提高经产母猪的产仔数和产活仔数,分别提高1.07头和1.15头。无论是深部输精还是常规输精,15亿/80 mL的输精量,均可获得与30亿/80 mL输精量一致的产仔效果,这一结果可以使优秀种公猪的利用率提高1倍,降低了最新国标《GB23238-2009》中对外种猪输精剂量的要求,建议扩大实验并推广使用。

广东省水性疾病与末梢水菌落总数合格率的相关性研究

目的了解城市末梢水菌落总数合格率与水性疾病发病的相关性。方法于2008—2010年,选择广东省广州市(中心六区)、深圳市(中心四区)、佛山市(禅城区)三市中心城区范围末梢水监测点80个,每月监测一次菌落总数指标。同时,收集水性疾病发病情况。结果共检测末梢水水样2 222件,菌落总数合格2 077件,合格率为93.47%。末梢水菌落总数4—10月合格率相对较低,其中,8—9月最低。共报告可能经水传播的传染病53 695例,发病数从高到低依次排列为其他感染性腹泻(77.34%)、细菌性痢疾(13.8%)、病毒性肝炎(7.65%)、伤寒(0.86%)、副伤寒(0.35%)、阿米巴痢疾(0.02%)。广州市末梢水菌落总数合格率与伤寒、副伤寒发病数呈负相关(P<0.01),广州市、深圳市末梢水菌落总数合格率与细菌性、阿米巴痢疾发病数均呈负相关(P<0.05)。结论末梢水菌落总数合格率与水性疾病的发生有一定的负相关关系。