A New Evaluation Method for Antibiotic-Resistant Bacterial Groups in Environment

In the present manuscript it was presented whether spreading of antibiotic resistant bacterial groups in environment could be monitored by our newly developed method by enumerating antibiotic resistant bacterial groups in various biological wastes and composts. Although the numbers were not so high, diverse kinds of colistin resistant bacteria (25 mg·L-1) were included in row cattle feces (1.78 × 104 MPN g-1) and cattle feces manure (>3.84 × 104 MPN g-1). Compost originated from leftover food (>44.8 × 104 MPN g-1) and shochu lee (>320 × 104 MPN g-1) included higher numbers of chlortetracycline resistant Pseudomonas sp., (25 mg·L-1), and row cattle feces included higher numbers of chlortetracycline resistant Enterobacteriacea (15.7 × 104 MPN g-1), which mostly consisted from Pantoea sp. or Xenorhobdus doucetiae. Numbers of multi drug resistant bacteria, resistant to 25 mg·L-1 of ciprofloxacin, streptomycin, chloramphenicol, and ampicillin, were the highest in row cattle feces (>143.6 × 104 MPN g-1), followed by cattle feces manure (4.19 × 104 MPN g-1), and shochu lee (0.36 × 104 MPN g-1), which included diverse kinds of bacterial group. The present results indicated that higher numbers of multi drug resistant bacteria were typically found in row cattle feces, and the method was found suitable to enumerate and identify them. These results suggested that the method might become their environmental risk evaluation method.

3种养殖模式水体中细菌多样性研究

采用16SrDNA克隆文库技术,对位于武汉市少潭河水库养殖基地3种养殖模式[根据放养鱼所占比例,草鱼75%、鲢15%、鳙6%、异育银鲫4%,为模式1(MSH1);草鱼75%、鲢15%、鳙3%、匙吻鲟3%、异育银鲫4%,为模式2(MSH2);草鱼75%、鲢15%、匙吻鲟6%、异育银鲫4%,为模式3(MSH3)]水体中细菌多样性进行研究。系统发育分析结果表明:3种养殖模式中细菌的16SrDNA克隆文库的序列总共分布于10个门,分别是变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、蓝藻细菌门(Cyanobacteria)、浮霉菌门(Planctomycetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、梭杆菌门(Fusobacteria)和OP10。对3种养殖模式中细菌的16SrDNA克隆文库的序列多样性分析结果表明,MSH2中细菌克隆文库的多样性指数优于MSH1和MSH3,而MSH3优于MSH1。

拮抗大豆根腐病细菌的Biolog鉴定

为明确2株生防细菌的分类地位,采用传统形态学方法结合Biolog微生物自动分析系统,鉴定了大豆根腐病的2株生防细菌。结果表明,菌株B021a与塔式弧菌相似度值为0.634,可能性是86%,遗传距离为4.00。菌株B04b与海藻巴斯德菌相似度值为0.610,可能性是75%,遗传距离为2.77。综合形态学和Biolog鉴定结果,认为菌株B021a是塔式弧菌,菌株B04b是海藻巴斯德菌。

反硝化除磷系统的驯化及反硝化聚磷菌的筛选

利用城市河道底泥,通过厌氧/缺氧/好氧(A2O)工艺驯化反硝化除磷系统,采用BTB培养基、异染粒及PHB(聚β-羟基丁酸)染色等方法,从反硝化除磷系统中分离筛选出反硝化聚磷菌,并通过16S rDNA序列测定分析其遗传背景。在该试验条件下,反硝化除磷系统的氮磷的去除率超过80%。从反硝化除磷系统中分离筛选出DPB-A511、DPB-A9和DPB-A10 3株反硝化聚磷菌,其氮、磷去除率均超过50%。这3株菌中DPB-A511、DPB-A9分别与Dechloromonas aromatica、Candidatus accumulibacter phosphatis的相似性均达到97%,DPB-A10与Bacillus pumilus的相似性达到99%。

利用BIOLOG系统对不同种类细菌鉴定的研究

为完善细菌鉴定工作,本试验通过利用B IOLOG细菌自动微生物分析系统(简称B I-OLOG系统)对13株大肠杆菌、15株巴氏杆菌和7株金黄色葡萄球菌进行了鉴定,并与传统方法[1]包括形态学观察、革兰氏染色、生化实验等的鉴定结果进行了比对。实验结果表明,与传统方法相比B IOLOG系统具有准确、快捷、简便的优点,同时也有一定的局限性,从而为B IOLOG系统的更好使用提供了实验依据。

儿童中枢神经系统感染脑脊液病原菌分布及耐药性分析

目的了解中枢神经系统感染患儿脑脊液病原菌的构成及耐药情况,为临床医师合理使用抗菌药物提供依据。方法选择郑州大学附属儿童医院2015年1月1日至2017年12月31日收治的5 681份中枢神经系统感染患儿的脑脊液标本为研究对象,对所有标本进行病原菌鉴定和药物敏感性试验,分析病原菌的分布及耐药情况。结果 5 681份脑脊液标本中,共分离出病原菌146株(2.57%),其中革兰阳性菌119株(81.51%),革兰阴性菌25株(17.12%),真菌2株(1.37%)。位居前5位的病原菌依次是表皮葡萄球菌29株(19.86%)、肺炎链球菌27株(18.49%)、屎肠球菌16株(10.96%)、大肠埃希菌12株(8.22%)、B群无乳链球菌9株(6.16%)。中枢神经系统感染患儿脑脊液标本病原菌检出科室位居前3位的依次是神经内科(31.51%)、神经外科(20.55%)、新生儿诊疗中心(19.86%)。出生0~28 d、出生29 d至1岁、1~5岁、6~13岁患儿脑脊液中位居第1位的病原菌分别为大肠埃希菌(23.08%)、肺炎链球菌(25.45%)、表皮葡萄球菌(29.55%)、表皮葡萄球菌(35.71%)。表皮葡萄球菌对氨苄西林、青霉素的耐药率均为100.00%,对呋喃妥因、替考拉宁、利奈唑胺、万古霉素的敏感率均为100.00%;肺炎链球菌对克林霉素、红霉素的耐药率均为100.00%,对左氧氟沙星、莫西沙星、利福平、万古霉素、利奈唑胺、美罗培南、左旋氧氟沙星的敏感率均为100.00%;大肠埃希菌对氨苄西林、哌拉西林的耐药率均为100.00%,对亚胺培南、哌拉西林他唑巴坦、美罗培南、阿米卡星、氯霉素的敏感率均为100.00%。结论儿童中枢神经系统感染患儿脑脊液病原菌以革兰阳性菌为主。临床医师应根据菌株特点和药物敏感性试验结果,合理选用抗菌药物。

泌尿系统感染的病原菌检验及分析

目的探讨泌尿系统感染患者的病原菌分布情况,并分析其对抗生素的耐药性。方法随机抽取我院2014年3月—2016年3月收治的泌尿系统感染患者2 508例作为研究对象,通过采集其尿液标本行病原菌培养、分离、鉴别检验与耐药实验,判断其病原菌的分布情况及其对常用抗生素的耐药性。结果 2 508份尿标本中,共分离得到病原菌1 081株,检出率为43.10%。其中,革兰阴性菌、革兰阳性菌、真菌分别占63.37%、25.25%、11.38%。对其进行耐药性检测发现革兰氏细菌对多数临床常用药有耐药性,而真菌对常用抗生素有良好敏感性。结论造成泌尿系统感染的病原菌以革兰阴性菌为主,但其对常见抗生素多有较高的耐药性,做好病原菌检验及药敏培养工作,可以为临床合理用药提供指导和依据。

从养殖贝类和大菱鲆分离的海洋发光弧菌的分类地位分析

海洋发光弧菌是海水养殖中重要的条件致病菌。从福建省晋江市附近水产养殖场花蛤、牡蛎软组织及波罗地海大菱鲆肠道内含物中分离得到16株发光细菌,采用ARDRA(amplified ribosomal DNA restriction analysis)、16S rDNA序列测定、Biolog碳源代谢分析及药敏试验等方法对这些菌株的分类地位进行了分析。结果表明:基于ARDRA分析指纹图谱,16株发光菌分属于3个OTUs(Operational Taxonomic Unit,OTU);对菌落和细胞形态、ARDRA指纹图谱及来源不同的5个菌株进行16S rDNA序列测定和系统发育分析,结果显示这些菌株均属于Vibrio属,分别与Vibrio campbellii,V.orientalis,V.fischeri及V.azureus等亲缘关系最近,表明ARDRA方法存在一定的局限性,难以区分同一属内的近缘种;Biolog碳源代谢分析无法将海洋细菌鉴定至种的水平,但可将亲缘关系较近的菌株划分至同一群体;5株菌的药敏试验结果显示各株菌均对复方新诺明和庆大霉素等敏感,且亲缘关系较近的菌株也具有相似的药物敏感性。四种方法相结合可将细菌区分为属内分类地位相一致的不同群体,为后续更精确的在生理生化方面鉴定细菌提供参考,同时为海水养殖中防治潜在的由发光弧菌引发的病害提供有益的帮助。

全自动细菌分析系统检测耐甲氧西林葡萄球菌的初步评价

采用琼脂筛选法、纸片扩散法和仪器法平行进行葡萄球菌苯唑西林敏感性的测定 ,同时进行微生物敏感性试验。结果显示 :MRS的分离率为 5 4.4% ,琼脂筛选法和仪器法两法对MRS检测的符合率为 96 .7%。MRS对万古霉素最敏感 ,敏感率 10 0 % ;呋喃妥因次之 (耐药率 0 .0 2 4% )。VITEK32型细菌分析系统可准确检测MRS。认为MRS以万古霉素治疗效果最佳 。

高原地区两种微生物鉴定系统对临床常见病原菌鉴定的一致性分析

目的比较MicroTyper MS微生物快速鉴定基质辅助激光解析飞行时间质谱和VITEK 2Compact全自动微生物分析系统对细菌的鉴定能力。方法950株临床分离的菌株,均采用MicroTyper MS和VITEK 2 Compact同时进行鉴定,以VITEK 2 Compact的结果为准,分析MicroTyper MS与VITEK 2Compact结果的一致性。结果同时鉴定950株细菌,与VITEK 2 Compact鉴定结果相比,MicroTyper MS可将841株(88.5%)鉴定至种,可将899株(94.6%)鉴定至属。鉴定不一致51株(5.4%)。MicroTyper MS与VITEK 2 Compact相比,鉴定至种的一致率为88.5%,鉴定至属的一致率为94.6%。695株革兰阴性细菌中,MicroTyper MS可将611株(87.9%)鉴定至种,可将649株(93.4%)鉴定至属。鉴定不一致46株(6.6%)。247株革兰阳性球菌中,MicroTyper MS可将222株(89.9%)鉴定至种,可将242株(98.0%)鉴定至属。鉴定不一致5株(2.0%)。8株酵母菌中,MicroTyper MS可将8株(100.0%)鉴定至种,鉴定不一致0株。结论MicroTyper MS与VITEK 2 Compact对临床常见细菌的鉴定结果具有较高的一致性,但MicroTyper MS相对VITEK 2 Compact来说具有耗时短、成本低等优点,提高了鉴定效率,为临床诊疗带来了便利。

泌尿系统微生物检验病原菌结果分析

目的分析泌尿系统微生物检验结果中的病原菌分布情况。方法选取2015年5月至2016年5月在医院接受治疗的90例泌尿系统感染患者作为研究对象，患者均给予实验室微生物检验，并应用统计学分析病原菌检验的结果。结果培养得到90株病原菌，其中有革兰阳性菌20株，所占比例为22．22％，主要为粪肠球菌和鸟肠球菌；革兰阴性菌56株，所占比例为62．22％，主要为大肠埃希杆菌；假丝酵母菌属有14株，所占比例为15，56％，主要为假丝酵母菌。革兰阴性菌所占比例明显高于革兰阳性菌、假丝酵母菌属。结论泌尿系统感染主要的病原菌是革兰阴性菌，临床治疗中根据病原菌检测结果和药敏实验，根据每个患者的具体情况选择合适抗菌药物进行治疗，并有效预防二重感染和耐药菌的产生。

铁细菌对供水系统金属管材腐蚀行为的影响

铁细菌(iron bacteria,IB)是供水系统中影响金属管材腐蚀的主要微生物。从实际运行供水管道中提取IB,选用304不锈钢、316不锈钢、Q235碳钢和球墨铸铁,采用电化学分析、表面分析等方法,研究IB对上述管材腐蚀行为的影响。结果表明,IB体系中304不锈钢、316不锈钢的腐蚀速率在试验周期内随时间增加逐渐增大,Q235碳钢、球墨铸铁腐蚀速率则先快速增大后逐渐减小。IB体系中304不锈钢、316不锈钢表面产生较薄腐蚀层,球墨铸铁表面存在大量腐蚀产物和IB,Q235碳钢表面发现少量产物。球墨铸铁和Q235碳钢的腐蚀产物主要为磁铁矿、针铁矿、镁铁氧化物,但这些腐蚀产物在304不锈钢、316不锈钢表面未检出。IB对4种管材的腐蚀作用排序为:球墨铸铁>Q235碳钢>304不锈钢>316不锈钢。

炼化污水生化处理系统常见问题分析及对策

随着国家对环境污染物排放的严格管控,对污水生化处理系统的高效性及稳定性要求越来越高。针对COD、氨氮、总氮三大主要水质指标,从污染物负荷、操作参数、有毒有害物质等方面,系统分析了炼化污水生化处理系统出水水质恶化、污泥性能变差等常见问题,并针对具体问题提出相应解决对策,为炼化污水生化处理系统的稳定运行提供技术指导。

多功能显微图像分析系统在细菌快速鉴定与药敏试验中的作用

目的直接利用细菌培养瓶中的菌液进行鉴定与药敏试验。方法利用多功能显微图像分析系统对显示阳性的样本进行细菌计数,抽取适量培养液并调整细菌浓度后作细菌鉴定及药敏试验,结果为二级报告。结果葡萄球菌、肠杆菌科细菌、铜绿假单胞菌三类细菌的鉴定、药敏试验与传统方法比较,菌属鉴定平均符合率97.9%,药敏试验平均符合率96.0%。结论二级报告鉴定和药敏试验与传统方法结果基本一致,但报告结果时间快于传统方法。

2016—2021年某医院泌尿系细菌感染及影响分析

目的分析2016—2021年某医院脊髓损伤(spinal cord injury,SCI)住院患者泌尿系感染及影响因素。方法选取2016—2021年入住该院接受治疗的3000例SCI患者,采用药敏试验法分析尿液样本中病原菌耐药性,分析SCI患者临床资料和病原菌耐药性的差异。结果3000例SCI患者,发生院内泌尿系统感染的占29.17%,共分离1168株菌株,革兰阴性菌中主要病原菌为大肠埃希菌(41.18%)、肺炎克雷伯菌(12.41%)、变形杆菌属(6.34%)、铜绿假单胞菌(4.02%),对阿莫西林、环丙沙星、舒巴坦、复方磺胺、庆大霉素等有较高耐药性,对阿米卡星、头孢他啶、氨曲南等有较高敏感性;革兰阳性菌中主要病原菌为屎肠球菌(8.73%)和粪肠球菌(6.93%),屎肠球菌对青霉素、环丙沙星和呋喃妥因呈高耐药性,粪肠球菌对四环素呈高耐药性,两种菌株对万古霉素和替考拉宁均为100.00%敏感;年龄≥60岁、完全性损伤、应用抗生素药物、住院期间发生压疮、侵入性操作等均为SCI患者住院期间发生泌尿系感染的危险因素。结论SCI患者住院期间发生泌尿系感染比例较高,临床中应及时留取尿样本送检并针对性选择抗菌药物,同时对并发泌尿系细菌感染危险因素进行防控。

宫颈癌根治术后泌尿系统感染患者的病原菌分布及耐药性分析

目的分析宫颈癌根治术后泌尿道感染患者的病原菌分布及耐药性,为医院感染预防控制工作提供客观依据。方法选取2013年3月-2016年8月314例行宫颈癌根治术患者为研究对象,对其术后泌尿系统感染病原菌分布及耐药性进行观察和分析。结果 314例行宫颈癌根治术患者中112例发生尿道感染,感染率为35.7%;共检出202株病原菌,其中革兰阴性菌、革兰阳性菌、真菌分别占61.0%、33.6%和5.4%,主要病原菌为大肠埃希菌、粪肠球菌、肺炎克雷伯菌、阴沟肠杆菌,分别占31.7%、15.3%、14.4%、10.9%;革兰阴性菌中大肠埃希菌对氨苄西林、左氧氟沙星、四环素、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶、环丙沙星等耐药率较高,均>85.0%,肺炎克雷伯菌对氨苄西林、呋喃妥因的耐药率较高,均>60.0%,阴沟肠杆菌对氨苄西林、阿莫西林、头孢唑林等耐药率均为100.0%;未检出耐亚胺培南革兰阴性菌;革兰阳性菌中粪肠球菌对红霉素、四环素、利福平、氯霉素的耐药率较高,均>50.0%,表皮葡萄球菌对青霉素G、左氧氟沙星、庆大霉素的耐药率较高,均>75.0%,屎肠球菌对左氧氟沙星、呋喃妥因、氨苄西林、四环素等耐药率较高,均>75.0%,未检出耐万古霉素革兰阳性菌。结论宫颈癌根治术后泌尿系统感染的病原菌分布和耐药性均具有一定的特征,临床医师应对其给予高度重视、密切监控和有效干预,以提高医院感染预防控制效果。

我院2013年度头孢菌素类抗生素使用情况分析

【目的】评价我院2013年度头孢菌素类抗生素的使用情况。【方法】通过查询医院药品管理信息系统,统计头孢菌素类抗生素的用药频度、药品限定日费用等信息,并结合我院病原菌株分布、微生物耐药等情况,对头孢菌素类临床使用情况进行综合分析。【结果】2013年度头孢菌素类共使用了13个品种,以第三代头孢菌素的使用金额构成比最高,达到81.81%。我院病原菌分布以革兰氏阴性杆菌为主,占所有检出菌株的63.15%,针对检出率最高的大肠埃希菌,常用的第二、三代头孢菌素中头孢呋辛、头孢他啶、头孢噻肟的耐药率分别为57.8%、49.1%和57.8%,耐药情况较为突出。【结论】我院头孢菌素的使用情况基本合理,对于部分头孢菌素耐药率较高,建议临床使用前应适当参考我院现有的抗生素药敏试验结果,并加大细菌耐药性监测力度,从而适当控制部分耐药率较高的头孢菌素用药频度,以促进临床用药更加合理有效。

全自动细菌生化鉴定分析系统与细菌微量生化鉴定阳性菌的结果分析

目的:关于全自动细菌生化鉴定分析系统和细菌微量生化鉴定革兰氏阳性菌的结果分析。方法:调查时间为2020年1月~2020年3月,选择105株细菌作为调查对象,其中链球菌10株,葡萄球菌45株,李斯特氏菌50株,对所有菌株均选择采用全自动细菌生化鉴定分析系统进行鉴定,同时采用细菌微量生化管鉴定系统进行鉴定,对两种不同的鉴定结果进行对照和分析。结果:经过检验可得全自动细菌生化鉴定分析系统对链球菌的检出率为99.07%(8/10),对葡萄球菌检出率为98.95%(44/45),对李斯特氏菌检出率为91.95%(47/50),通过细菌微量生化鉴定阳性菌检验方法进行检验,检出率分别为链球菌99.07%(8/10)、葡萄球菌97.89%(43/45)、李斯特氏菌94.25%(45/50),P<0.05,差异存在统计学意义。结论:通过全自动细菌生化鉴定分析系统和细菌微量生化鉴定方法对革兰氏阳性菌进行细菌鉴定均属于高效快速、准确度高、操作方便的鉴定方案,可以在进行鉴定的过程中根据相关菌落的特点和生化试验等进行恰当的选择。

具有Ⅲ型分泌系统的Pseudomonas moraviensis FP1761植物益生功能及其全基因组分析

本研究从节瓜根际分离到一株具有防病促生功能的荧光类假单胞菌FP1761。该菌株对部分植物病原真菌和细菌具有拮抗能力,能够解钾、解有机磷和无机磷,可产生氨、蛋白酶、嗜铁素、吲哚乙酸。生物测定表明菌株FP1761可显著促进小麦生长。生理生化、平均核苷酸相似度、16S rDNA和多基因分析将FP1761鉴定为摩拉维亚假单胞菌(Pseudomonas moraviensis)。菌株FP1761基因组草图全长6.12 Mb,(G+C)含量为59.9%,共编码5467个基因序列。将该菌株与种内3个代表性菌株进行泛基因组和核心基因组分析,共产生4357个共有基因,菌株FP1761特有基因327个。利用antiSMASH对菌株次生代谢基因簇进行预测,发现其含有8个潜在的次生代谢产物基因簇。其中两个基因簇与嗜铁素pyoverdine合成相关,未见聚酮类合成基因。基因组分析发现,该菌株具有与病原性假单胞菌相似的Ⅲ型分泌系统,但丢失了效应蛋白调控因子hrpS和转运相关的hrpH和hrpK1基因。对全基因组扫描,菌株FP1761仅保留了病原性假单胞菌的保守效应蛋白AvrE和HopAA1-1。FP1761是目前已发现的唯一具有Ⅲ型分泌系统的摩拉维亚假单胞菌。本研究表明摩拉维亚假单胞菌FP1761具有潜在的植物防病促生功能,但其Ⅲ型分泌系统与植物益生互作机制有待进一步解析。

VITEK 2 Compact系统的应用及鉴定结果分析

目的探讨VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统对本实验室鉴定的包括食源性、肠道致病性及其他来源微生物如肠球菌属、葡萄球菌属、链球菌属、李斯特菌属、埃希菌属、志贺菌属、沙门菌属、变形杆菌属、耶尔森菌属、枸橼酸杆菌属、肠杆菌属、弧菌属、气单胞菌属、弯曲菌属、假单胞菌属、需氧芽胞杆菌属、酵母菌属在内的17菌属87株菌的准确性。方法按照VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统仪器说明书中的标准操作流程进行。选择国家标准常规方法作为参照,以验证VITEK 2 Compact全自动微生物分析检测方法的符合性。结果从本试验结果来看VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统仪对本实验室87株微生物的鉴定结果的总体符合率为97.0%(98/101)。结论 VITEK 2 Compact全自动微生物分析系统仪对实验室常见87株微生物鉴定结果较好,但对弧菌的鉴定还应结合生物学特性进行综合评定。