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金针菇tps1基因序列分析及不同温度下tps1、tps2基因定量表达研究
被引量:
1
1
作者
刘建辉
张俊玲
+2 位作者
李亮
尚晓冬
谭琦
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第16期173-177,182,共6页
研究探讨金针菇海藻糖合成相关酶基因及其功能,为进一步揭示其生长发育过程中的变化规律奠定基础。本研究对金针菇6-磷酸海藻糖合成酶基因tps1的序列进行分析,并以金针菇孢子单核体菌株Dan3为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术比较了tps...
研究探讨金针菇海藻糖合成相关酶基因及其功能,为进一步揭示其生长发育过程中的变化规律奠定基础。本研究对金针菇6-磷酸海藻糖合成酶基因tps1的序列进行分析,并以金针菇孢子单核体菌株Dan3为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术比较了tps1、tps2基因在不同温度变化下金针菇中的相对表达量差异。结果表明,金针菇tps1基因c DNA序列包含1455 bp的ORF,编码1个由484个氨基酸残基组成的蛋白质;对其起始密码子上游2000 bp调控区域进行分析,发现具有典型的热激反应元件(HSE,C4T)和压力反应元件(STRE,AG4)等调控元件;实时荧光定量PCR结果显示,相对于对照组21℃处理,37℃高温及4℃低温处理2 h后,tps1、tps2基因相对表达量均有显著(p<0.05)升高。说明tps1、tps2基因在转录水平上受到温度调控。
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关键词
金针菇
温度
tpst1
tps2
实时荧光定量PCR
生物信息学
下载PDF
职称材料
香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表达特性分析
被引量:
1
2
作者
王安邦
吴琼
+6 位作者
舒海燕
许桂莺
苗红霞
柯建浩
贾彩虹
邢文婷
许奕
《中国南方果树》
北大核心
2016年第6期19-24,共6页
在获得MaTPS2基因全长序列的基础上,采用同源序列比对、聚类分析、实时定量PCR等技术初步探讨香蕉MaTPS2基因的功能。从香蕉A基因组中获得一条3 277bp MaTPS2全长序列,包含一个完整的开放阅读框1 344bp,编码蛋白含447个氨基酸。其氨基...
在获得MaTPS2基因全长序列的基础上,采用同源序列比对、聚类分析、实时定量PCR等技术初步探讨香蕉MaTPS2基因的功能。从香蕉A基因组中获得一条3 277bp MaTPS2全长序列,包含一个完整的开放阅读框1 344bp,编码蛋白含447个氨基酸。其氨基酸理化性质分析表明,MaTPS2蛋白属于不稳定疏水性蛋白,具有一个结构域GT1-TPS。通过与已知植物的TPS氨基酸同源序列比对,同源性达77.95%。系统发育树进化关系分析表明,MaTPS2编码的氨基酸序列与银杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)邻近,说明二者的亲缘关系较近。器官特异性分析表明,MaTPS2在香蕉植株的根、球茎、假茎、叶、花各器官中均有表达,其中在球茎、假茎和叶中表达量较多,在果实中表达量较低。在ABA、干旱、盐害和枯萎病菌胁迫处理下,MaTPS2表达量升高,在ACC胁迫处理下,MaTPS2表达量显著下降,而低温胁迫条件下,MaTPS2表达不响应。由此推导,MaTPS2可能参与调控香蕉抗旱、抗病机制。植物生长调节剂ACC和ABA胁迫处理说明MaTPS2的表达可能受激素蛋白间接调控。
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关键词
香蕉
海藻糖-6-磷酸合成酶基因(
tps2
)
生物信息学
qPCR
表达分析
胁迫
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职称材料
酿酒酵母TPS2基因敲除菌的构建及其对细胞抗逆性的影响
被引量:
3
3
作者
焦宏亮
王梦飞
+3 位作者
朱红
张婷婷
周华
蔡恒
《生物加工过程》
CAS
2021年第6期634-641,共8页
构建一株酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)TPS2基因缺失的突变菌株并研究其对酵母细胞抗逆性的影响。以酵母模式菌BY4741中的TPS2基因为研究对象,利用Cre/LoxP系统和同源的重组技术将TPS2基因与G418抗性基因(kan^(r))相替换,成功构建...
构建一株酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)TPS2基因缺失的突变菌株并研究其对酵母细胞抗逆性的影响。以酵母模式菌BY4741中的TPS2基因为研究对象,利用Cre/LoxP系统和同源的重组技术将TPS2基因与G418抗性基因(kan^(r))相替换,成功构建TPS2基因敲除菌TPS2Δ。在不同应激条件下的表型试验结果显示:TPS2Δ在高温、氧化胁迫及高盐条件下表现出敏感性,尤其在高温条件下更为敏感;在正常条件下,TPS2Δ胞内ROS含量明显高于BY4741;TPS2Δ在高温条件下的海藻糖含量低于BY4741。总之,TPS2基因的缺失降低了海藻糖的合成,导致细胞在应激环境的适应调节能力减弱。
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关键词
酿酒酵母
基因敲除
tps2
抗逆性
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职称材料
题名
金针菇tps1基因序列分析及不同温度下tps1、tps2基因定量表达研究
被引量:
1
1
作者
刘建辉
张俊玲
李亮
尚晓冬
谭琦
机构
上海海洋大学食品学院
上海市农业科学院食用菌研究所、上海市农业遗传育种重点开放实验室、农业部南方食用菌资源利用重点实验室、国家食用菌工程技术研究中心
出处
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2015年第16期173-177,182,共6页
基金
国家科技支撑项目(2013BAD16B02)
上海市科技人才计划项目(13XD1424700)
文摘
研究探讨金针菇海藻糖合成相关酶基因及其功能,为进一步揭示其生长发育过程中的变化规律奠定基础。本研究对金针菇6-磷酸海藻糖合成酶基因tps1的序列进行分析,并以金针菇孢子单核体菌株Dan3为实验材料,采用实时荧光定量PCR技术比较了tps1、tps2基因在不同温度变化下金针菇中的相对表达量差异。结果表明,金针菇tps1基因c DNA序列包含1455 bp的ORF,编码1个由484个氨基酸残基组成的蛋白质;对其起始密码子上游2000 bp调控区域进行分析,发现具有典型的热激反应元件(HSE,C4T)和压力反应元件(STRE,AG4)等调控元件;实时荧光定量PCR结果显示,相对于对照组21℃处理,37℃高温及4℃低温处理2 h后,tps1、tps2基因相对表达量均有显著(p<0.05)升高。说明tps1、tps2基因在转录水平上受到温度调控。
关键词
金针菇
温度
tpst1
tps2
实时荧光定量PCR
生物信息学
Keywords
Flammulina velutipes
temperature variations
tps1
gene
tps2 gene
real-time PCR
bioinformatics
分类号
TS201.3 [轻工技术与工程—食品科学]
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职称材料
题名
香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表达特性分析
被引量:
1
2
作者
王安邦
吴琼
舒海燕
许桂莺
苗红霞
柯建浩
贾彩虹
邢文婷
许奕
机构
中国热带农业科学院海口实验站
华中农业大学
中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所
海南省林业科学研究所
出处
《中国南方果树》
北大核心
2016年第6期19-24,共6页
基金
农业部重点实验室开放式课题(RRI-KLOF1403)
"十二五"农村领域国家科技计划(2011AA10020605)
+2 种基金
现代农业产业技术体系建设专项(CARS-32)
海南省重点项目(ZDXM2015045)
海南省香蕉遗传改良重点实验室和海口市香蕉品种研究重点实验室资助
文摘
在获得MaTPS2基因全长序列的基础上,采用同源序列比对、聚类分析、实时定量PCR等技术初步探讨香蕉MaTPS2基因的功能。从香蕉A基因组中获得一条3 277bp MaTPS2全长序列,包含一个完整的开放阅读框1 344bp,编码蛋白含447个氨基酸。其氨基酸理化性质分析表明,MaTPS2蛋白属于不稳定疏水性蛋白,具有一个结构域GT1-TPS。通过与已知植物的TPS氨基酸同源序列比对,同源性达77.95%。系统发育树进化关系分析表明,MaTPS2编码的氨基酸序列与银杏TPS氨基酸序列(AAX16014.1)邻近,说明二者的亲缘关系较近。器官特异性分析表明,MaTPS2在香蕉植株的根、球茎、假茎、叶、花各器官中均有表达,其中在球茎、假茎和叶中表达量较多,在果实中表达量较低。在ABA、干旱、盐害和枯萎病菌胁迫处理下,MaTPS2表达量升高,在ACC胁迫处理下,MaTPS2表达量显著下降,而低温胁迫条件下,MaTPS2表达不响应。由此推导,MaTPS2可能参与调控香蕉抗旱、抗病机制。植物生长调节剂ACC和ABA胁迫处理说明MaTPS2的表达可能受激素蛋白间接调控。
关键词
香蕉
海藻糖-6-磷酸合成酶基因(
tps2
)
生物信息学
qPCR
表达分析
胁迫
Keywords
banana
trehalose-6-phosphate synthase
gene
(
tps2
)
bioinformatics
qPCR
expression analysis
分类号
S668.1 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
酿酒酵母TPS2基因敲除菌的构建及其对细胞抗逆性的影响
被引量:
3
3
作者
焦宏亮
王梦飞
朱红
张婷婷
周华
蔡恒
机构
南京工业大学生物与制药工程学院
出处
《生物加工过程》
CAS
2021年第6期634-641,共8页
文摘
构建一株酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)TPS2基因缺失的突变菌株并研究其对酵母细胞抗逆性的影响。以酵母模式菌BY4741中的TPS2基因为研究对象,利用Cre/LoxP系统和同源的重组技术将TPS2基因与G418抗性基因(kan^(r))相替换,成功构建TPS2基因敲除菌TPS2Δ。在不同应激条件下的表型试验结果显示:TPS2Δ在高温、氧化胁迫及高盐条件下表现出敏感性,尤其在高温条件下更为敏感;在正常条件下,TPS2Δ胞内ROS含量明显高于BY4741;TPS2Δ在高温条件下的海藻糖含量低于BY4741。总之,TPS2基因的缺失降低了海藻糖的合成,导致细胞在应激环境的适应调节能力减弱。
关键词
酿酒酵母
基因敲除
tps2
抗逆性
Keywords
Saccharomyces cerevisiae
gene
knockout
tps2
stress resistance
分类号
Q934.1 [生物学—微生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
金针菇tps1基因序列分析及不同温度下tps1、tps2基因定量表达研究
刘建辉
张俊玲
李亮
尚晓冬
谭琦
《食品工业科技》
CAS
CSCD
北大核心
2015
1
下载PDF
职称材料
2
香蕉海藻糖-6-磷酸合成酶基因MaTPS2克隆及表达特性分析
王安邦
吴琼
舒海燕
许桂莺
苗红霞
柯建浩
贾彩虹
邢文婷
许奕
《中国南方果树》
北大核心
2016
1
下载PDF
职称材料
3
酿酒酵母TPS2基因敲除菌的构建及其对细胞抗逆性的影响
焦宏亮
王梦飞
朱红
张婷婷
周华
蔡恒
《生物加工过程》
CAS
2021
3
下载PDF
职称材料
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